spt transcription factor family member, maker-scaffold1007_size71567-snap-gene-0.6 (gene) Tigriopus kingsejongensis
|
Overview
Associated RNAi Experiments
Nothing found Homology
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000012152 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s875:75846:78817:1 gene:EMLSAG00000012152 transcript:EMLSAT00000012152 description:"maker-LSalAtl2s875-augustus-gene-0.8") HSP 1 Score: 574.318 bits (1479), Expect = 0.000e+0 Identity = 374/669 (55.90%), Postives = 449/669 (67.12%), Query Frame = 0
Query: 410 SGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNT----VNEQQCNTVTD----TVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCN----TVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCN------------TVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD----TVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQ---------------------------QCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVP----------------------------------------------------RQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQES----RQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVP----RQECRNVP------------RQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
+ A Q CRTVNEQ CSTV EQ+CST+ +QQCSTV EQ C TV E CST++E QCR V QQC+T EQQCNT VNE+QC+TV + TVNEQQC+TV EQQC TVTDTVNEQ C+TV EQQC TV++TVNE+ C+TVNEQQCN TV EQQCSTVNEQ C TVTDTVNE+ C+TVNEQVCN TV EQQC+T+ EQQC T+NEQQC T NEQQC+TV +TVN+Q C+TVNEQQC T+ + TVNEQVCNTV + + EQ C+ V EQ+C+ V D TVNE+QC+++ EQ CE+ +++Q+C+T+ EQQC TV +QQC+TV + QC TVNEQ+CE+ QCR++PRQQC N PRQQC+NV R++C +VP RQ+CNNVPRQEC NVPRQQC+NVPRQ+CQ + R+V Q C ++PRQ C NVPRQ+ RQ C+NVPR+QCQNVPRQV QEC+N+PRQQCQNVPRQVQR+ECNN+PRQ CQNVP RQECRNVP RQEC N+PRQ+C NVPRQV RQEC+ VPRQEC+N+PRQQC VPR +C NV RQV R+EC
Sbjct: 160 TSSAPAVQTCRTVNEQVCSTVNEQQCSTINDQQCSTVNEQSCFTVNERQCSTLSEQQCRTVSDQQCSTTTEQQCNTVTDVVNEEQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVSEQQCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCNTVTDTVSEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCSTINEQQCSTLNEQQCTTFNEQQCSTVIDTVNDQQCSTVNEQQCTTINEQQCSTVNEQVCNTVTDIVNEQQCSIVNEQQCNVVTD----TVNEEQCTTIQEQKCETQYMVQYEQQCSTITEQQCITVSDQQCTTVSDTQCVTVNEQICEEVCDTQSSYGAPSGEYGAPSGFGGGCRTQCRSIPRQQCSNAPRQQCSNVPRQQCNTVPRQSCQNVPRRVEEQICNNIPRQICNNVPRQVQRQECRNVPRQSCENVPRQVSRQECNNVPRQECQNVPRQQCSNVPRQQCQNIARQVPRQECXSVPRQQCQNVPRQQCQTVPRQSCQNVPREQCQNVPRQVKTQECQNIPRQQCQNVPRQVQREECNNVPRQSCQNVPRTVQRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQECQNVPRQVQRQECSNVPRQECQNIPRQQCSNVPRLQCQNVPRQVQREEC 824 HSP 2 Score: 561.222 bits (1445), Expect = 0.000e+0 Identity = 377/683 (55.20%), Postives = 443/683 (64.86%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCST------------VNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNT----------------------------VQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNT---IQ-EQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEF-------------------KQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTV------------NEQVC--------------------------------------------EQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVARE----ECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNV------------PRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ----VPRQEC 951
+Q+C T+N+QQCSTV EQ C TV E+QCST+ EQQC TV + CST VNE QC V QQC TVNEQQC+TV+EQQCNTVTDTVNEQQC+TV EQQC TVTDTVNEQ C+TV EQQC TV++TV+E+ C+TVNEQ CNTV EQQCSTVNEQ C TVTDTVNE+ C+TVNEQ C+T+ EQQC+T V EQQC T+NEQQC+TVNEQ CNTVT+ VNEQ C+ VNEQQC VTDTVNE+ C T+ C T +Q EQ C+T+ EQ+C TV DQQCTTV++ QC +VNEQ+CE T+ + +C ++ QQC+ QQCS V QQCNTV EQ+C Q+C+NVPRQQC NVPRQQC N+AR+ EC SVPRQQC NVPRQ+C VPRQ C NVPR++CQ VPR+V+ Q C NIPRQ C NVPRQ R+EC NVPRQ CQNVPR V RQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQEC N+PRQECQNV PRQEC+N+PRQ+C+N+PR QC NVPRQV R+EC +VP Q+CRNVPRQ+C TVPRQ C+N+ RQ +PRQ+C
Sbjct: 182 EQQCSTINDQQCSTVNEQSCFTVNERQCSTLSEQQCRTVSDQQCSTTTEQQCNTVTDVVNEEQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVSEQQCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCNTVTDTVSEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCSTINEQQCSTLNEQQCTTFNEQQCSTVIDTVNDQQCSTVNEQQCTTINEQQCSTVNEQVCNTVTDIVNEQQCSIVNEQQCNVVTDTVNEEQCTTIQEQKCETQYMVQYEQQCSTITEQQCITVSDQQCTTVSDTQCVTVNEQICEEVCDTQSSYGAPSGEYGAPSGFGGGCRTQCRSIPRQQCSNAPRQQCSNVPRQQCNTVPRQSCQNVPRRVEEQICNNIPRQICNNVPRQVQRQECRNVPRQSCENVPRQVSRQECNNVPRQECQNVPRQQCSNVPRQQCQNIARQVPRQECXSVPRQQCQNVPRQQCQTVPRQSCQNVPREQCQNVPRQVKTQECQNIPRQQCQNVPRQVQREECNNVPRQSCQNVPRTVQRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQECQNVPRQVQRQECSNVPRQECQNIPRQQCSNVPRLQCQNVPRQVQREECTSVPFQQCRNVPRQECTTVPRQTCSNIPRQQCRSIPRQQC 864 HSP 3 Score: 494.582 bits (1272), Expect = 4.544e-161 Identity = 352/676 (52.07%), Postives = 416/676 (61.54%), Query Frame = 0
Query: 415 AQQECRTVNEQQCST------------VQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVC----STVNEPQCRNVPRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQC--------QTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTV----NEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCET----------------------------VTDT----VNEQVCNTVCNTIQEQV-------------------CNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVARE------------ECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESR--------------------QECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQEC----------------------------RNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQ------------VARQECNTVPRQECRNVPRQQC 931
++Q+CRTV++QQCST V E++CSTV EQQC+TV EQQCSTV E C TVNE QC V QQCNTV NEQQC+TVNEQQCNTVTDTV+EQQC+TV EQ C TVTDTVNEQ C+TV EQ C TV++TVNE+ C+TVNEQQC+T+ EQQCST+NEQQC TV DTVN++ C+TVNEQ C T+ EQQC+TV EQ C TV NEQQC+ VNEQQCN VT+TVNE+ C T+ EQ+CET V+DT VNEQ+C VC+T C ++ Q+CS QQC+ V QQC++V Q C++ R +Q CN + Q CN V Q Q+C V Q C V QV Q+C NVPRQ+CQNVPRQQC+NV R+ EC SVPRQQC NVPRQ+C VPRQ C NVPR++CQ VPR+V+ Q C NIPRQ C NVPRQ R QECRNVPRQQCQNVPRQV RQECRNVPRQ+CQNVPRQVQRQEC+N+PRQECQN+PRQ+C RNVPRQEC +PRQ C+N+PRQ V RQ+C++VPRQ+C NVPRQ C
Sbjct: 213 SEQQCRTVSDQQCSTTTEQQCNTVTDVVNEEQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVSEQQCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCNTVTDTVSEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQQCSTINEQQCSTLNEQQCTTFNEQQCSTVIDTVNDQQCSTVNEQQCTTINEQQCSTVNEQVCNTVTDIVNEQQCSIVNEQQCNVVTDTVNEEQCTTIQEQKCETQYMVQYEQQCSTITEQQCITVSDQQCTTVSDTQCVTVNEQICEEVCDTQSSYGAPSGEYGAPSGFGGGCRTQCRSIPRQQCSNAPRQQCSNVPRQQCNTVPRQSCQNVPRRVEEQICNNIPRQICNNVPRQVQRQECRNVPRQSCENVPRQVSRQECNNVPRQECQNVPRQQCSNVPRQQCQNIARQVPRQECXSVPRQQCQNVPRQQCQTVPRQSCQNVPREQCQNVPRQVKTQECQNIPRQQCQNVPRQVQREECNNVPRQSCQNVPRTVQRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQECQNVPRQVQRQECSNVPRQECQNIPRQQCSNVPRLQCQNVPRQVQREECTSVPFQQCRNVPRQECTTVPRQTCSNIPRQQCRSIPRQQCNNVPRQQCSSVPRQQCSNVPRQVC 888 HSP 4 Score: 262.307 bits (669), Expect = 1.665e-74 Identity = 225/535 (42.06%), Postives = 276/535 (51.59%), Query Frame = 0
Query: 421 TVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTV----NEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQ------------------------------------TVSETVNEEVCNTVN-----------------------------------EQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTV------------------------QEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETV----TDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQ----QCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNV------------AREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRR------------VEEQVCSNIPRQVCN 820
TVNEQQCSTV EQ+CST+ EQQCST+ EQQC+T E CSTV N+ QC V QQC T+NEQQC+TVNEQ CNTVTD VNEQQC+ V EQQC VTDTVNE+ C T+QEQ+C+ TV+E + EEVC+T + QQC+ V QQC+TV Q CQ V V E++CN + Q+CN V Q+CN V Q+CQ V QQC+ V QQC + V Q C +V QQC+ V TV Q C V + V V+ QEC + QQC V Q +C++V Q C++ RT +QEC V QQC V Q Q+C V Q+C V QV Q+C NVPRQ+CQN+PRQQC+NV REEC SVP QQC NVPRQEC VPRQ C+N+PRQ+C+ +PR+ V Q CSN+PRQVC+
Sbjct: 355 TVNEQQCSTVNEQQCSTINEQQCSTLNEQQCTTFNEQQCSTVIDTVNDQQCSTVNEQQCTTINEQQCSTVNEQVCNTVTDIVNEQQCSIVNEQQCNVVTDTVNEEQCTTIQEQKCETQYMVQYEQQCSTITEQQCITVSDQQCTTVSDTQCVTVNEQICEEVCDTQSSYGAPSGEYGAPSGFGGGCRTQCRSIPRQQCSNAPRQQCSNVPRQQCNTVPRQSCQNVPRRVEEQICNNIPRQICNNVPRQVQRQECRNVPRQSCENVPRQVSRQECNNVPRQECQNVPRQQCSNVPRQQCQNIARQVPRQECXSVPRQQCQNVPRQQCQTVPRQSCQNVPREQCQNVPRQVKTQECQNIPRQQCQNVPRQVQREECNNVPRQSCQNVPRTVQRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQECQNVPRQVQRQECSNVPRQECQNIPRQQCSNVPRLQCQNVPRQVQREECTSVPFQQCRNVPRQECTTVPRQTCSNIPRQQCRSIPRQQCNNVPRQQCSSVPRQQCSNVPRQVCS 889 HSP 5 Score: 200.675 bits (509), Expect = 1.648e-53 Identity = 172/423 (40.66%), Postives = 218/423 (51.54%), Query Frame = 0
Query: 399 YGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV-----------CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTT----VNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRV 806
Y Q + + + Q+C TV++ QC TV EQ C V C T + + C ++ QC N PRQQC+ V QQCNTV Q C V V EQ CN + Q C V V Q C V Q C+ V V+ + CN V Q+C V QQCS V QQCQ + V Q C +V QQC V QQCQTV Q C V +QC V V Q C + QQC+ V V + CN V + V TVQ QEC V QQC V Q+C +V Q C++ R +QEC+ V Q+C + QQCS V QC V QV ++C +VP QQC+NVPRQ+C V R+ C ++PRQQC ++PRQ+CNNVPRQQC++VPRQ+C VPR+V
Sbjct: 477 YEQQCSTITEQQCITVSDQQCTTVSDTQCVTVNEQICEEV----CDTQSSYGAPSGEYGAPSGFGGGCRTQCRSIPRQQCSNAPRQQCSNVPRQQCNTVPRQSCQNVPRRVEEQICNNIPRQICNNVPRQVQRQECRNVPRQSCENVPRQVSRQECNNVPRQECQNVPRQQCSNVPRQQCQNIA--------RQVPRQECXSVPRQQCQNVPRQQCQTVPRQSCQNVPREQCQNVPRQVKTQECQNIPRQQCQNVPRQVQREECNNVPRQSCQNVPRTVQRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQECQNVPRQVQRQECSNVPRQECQNIPRQQCSNVPRLQCQNVPRQVQREECTSVPFQQCRNVPRQECTTVPRQTCSNIPRQQCRSIPRQQCNNVPRQQCSSVPRQQCSNVPRQV 887 HSP 6 Score: 183.341 bits (464), Expect = 7.298e-48 Identity = 160/396 (40.40%), Postives = 208/396 (52.53%), Query Frame = 0
Query: 394 EAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGA-QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCST----VQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECN 784
+ Q +YG + SG+GG + +CR++ QQCS Q+CS V QQC+TV Q C V+E +C+ + C NVPRQ V Q+C V Q C V V+ Q+CN V Q+CQ V Q C+ V QQCQ ++ V + C +V QQC V QQC TV Q CQ V + V V Q C + QQC V Q V ++CN V Q C V TV Q C V QQC+ V V Q C V + V VQ QECS V Q+C + QQCS+V C++ R ++EC +V QQC V Q+C+TV Q C+ N+PRQQC+++PRQQCNNV R++C SVPRQQC+NVPRQ C+
Sbjct: 518 DTQSSYGAPSGEYGAPSGFGGGCRTQCRSIPRQQCSNAPRQQCSNVPRQQCNTVPRQSCQNVPRRVEEQICNNIPRQICNNVPRQ----VQRQECRNVPRQSCENVPRQVSRQECNNVPRQECQNVP----RQQCSNVPRQQCQNIARQVPRQECXSVPRQQCQNVPRQQCQTVPRQSCQNVPREQCQNVPRQVKTQECQNIPRQQCQNVPRQ----VQREECNNVPRQSCQNVPRTVQRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQECQNVPRQVQRQECSNVPRQECQNIPRQQCSNVPRLQCQNVPRQVQREECTSVPFQQCRNVPRQECTTVPRQTCS------------NIPRQQCRSIPRQQCNNVPRQQCSSVPRQQCSNVPRQVCS 889 HSP 7 Score: 77.7962 bits (190), Expect = 9.011e-15 Identity = 85/235 (36.17%), Postives = 102/235 (43.40%), Query Frame = 0
Query: 417 QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV----CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVN--------------------------------EQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVN 615
QEC +V QQC V Q+C TV Q C V +QC V V C + QC+NVPRQ V ++CN V Q C V TV Q+C V QQCQ V V Q C V Q+CQ V V + C+ V Q+C + QQCS V QCQ V V E C +V Q CN V QQC++V QQC V Q C+ N
Sbjct: 662 QECXSVPRQQCQNVPRQQCQTVPRQSCQNVPREQCQNVPRQVKTQECQNIPRQQCQNVPRQ----VQREECNNVPRQSCQNVPRTVQRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQECQNVPRQVQRQECSNVPRQECQNIPRQQCSNVPRLQCQNVPRQVQREECTSVPFQQCRNVPRQECTTVPRQTCSNIPRQQCRSIPRQQCNNVPRQQCSSVPRQQCSNVPRQVCSFTN 892
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000001618 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1284:138:3143:-1 gene:EMLSAG00000001618 transcript:EMLSAT00000001618 description:"maker-LSalAtl2s1284-snap-gene-0.9") HSP 1 Score: 567.77 bits (1462), Expect = 0.000e+0 Identity = 368/600 (61.33%), Postives = 426/600 (71.00%), Query Frame = 0
Query: 405 AVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTVTD----TVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQ------------EQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD----TVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQC--------NTVNEQVCEQQCRNVP-----------------------RQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQV--------PRQECRNV--------PRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQ 929
A A S +Q C TVNEQQCSTV +Q+CSTV EQ CSTV E+QCSTV E CSTVN+ QC QQCNTV NE+QC+TVNEQQC TV + TVNEQ+CNTV + +C TVTDTVNEQ C+TV EQ+C TV++TV+E+ C+TV EQ+CNTV EQQCSTVNEQ C TVTDTVNE+ C+TVNEQVCNTV EQQC+T+ EQQC TVNE+QC TVNEQQC TVT+TVNEQ C TVNEQQC TV + TVNEQVCN +T+ EQ C+TV EQ+C T+ D TVNEQQC++V EQ CE+ +++Q+C+TVNEQQC TV EQQCSTV EQQC +TVNEQVCE+ C N R QC++VPRQQC+NV PRQQC+NVPRQ+C+NVPRQ C+N PRQ CQ VPRRVEEQVC+ IPRQVC NVPRQ RQECRNVPRQ CQNVPRQV PRQEC NV PRQQC NVPRQVQR EC+++PRQ CQNVPRQ+C+ VPRQ C N+PR+QC NVPRQV RQECN VPRQ+C+NVPRQ
Sbjct: 237 APAAQSCRTVNEQVCSTVNEQQCSTVNKQQCSTVNEQSCSTVNERQCSTVNERQCSTVNDQQCSTTSEQQCNTVTDTVNEEQCSTVNEQQCTTVNEQKCSTVNEQECNTVTDTECNTVTDTVNEQQCSTVNEQECNTVTDTVSEQQCSTVTEQECNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVXDTVNEQQCSTVNEQQCSTINEQQCSTVNEEQCTTVNEQQCRTVTDTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQVCNXXXDTVNEQQCSTVNEQQCETITD----TVNEQQCNTVQEQKCETQYMVKYEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQVCEEVCDNQSSYGAPAGGAYGAPSSSYGAGGGCRSQCRSVPRQQCSNV--------PRQQCSNVPRQQCSNVPRQSCSNAPRQSCQNVPRRVEEQVCNTIPRQVCXNVPRQVQRQECRNVPRQSCQNVPRQVSRQECNNXPRQECNNVPRQQCSNIPRQQCSNVPRQVQRXECSSVPRQSCQNVPRQQCQTVPRQNCQNVPREQCQNVPRQVQRQECNNVPRQQCQNVPRQ 824 HSP 2 Score: 452.21 bits (1162), Expect = 1.433e-145 Identity = 310/554 (55.96%), Postives = 367/554 (66.25%), Query Frame = 0
Query: 449 QQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQ--------VCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVP----RQQCNNV------------AREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIP-----------------------RQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
Q C TV E VCSTVNE QC V +QQC+TVNEQ C+TVNE+QC+TV NE+QC+TV +QQC T + EQQC TV++TVNEE C+TVNEQQC TV EQ+CSTVNEQ+C TVTDT V +TVNEQ C+TV EQ+CNTV + TV+EQQC+TV EQ+CNTVT+TVNEQ C+TVNEQ C TVTDTVNEQ VCNTV +T+ EQ C+TV EQ+CST+ +QQC+TVNE+QC++VNEQ C + T T +Q+C TVNEQQC TV EQQC+TV EQ CN + V EQQC V QQC+ + QQCN V ++C +V QQC V Q+C+ V QQC V Q+C V +V E+VC N R C +VPRQ+ C NVPRQQC NVPRQ VPRQ C N PRQ CQNVPR+V+ Q CN IPRQ C NVPRQ V RQEC N+PRQ C NVPRQV+RQECN PRQEC NVPRQQC +PRQ+C+NV RQV R EC
Sbjct: 241 QSCRTVNEQVCSTVNEQQCSTVNKQQCSTVNEQSCSTVNERQCSTV----NERQCSTVNDQQCSTTS------------EQQCNTVTDTVNEEQCSTVNEQQCTTVNEQKCSTVNEQECNTVTDTECNTVTDTVNEQQCSTVNEQECNTVTD----TVSEQQCSTVTEQECNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVXDTVNEQQCSTVNEQQCSTINEQQCSTVNEEQCTTVNEQQCRTVTDTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQVCNXXXDTVNEQQCSTVNEQQCETITDTVNEQQCNTVQEQKCETQYMVKYEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQVCEEVCDNQSSYGAPAGGAYGAPSSSYGAGGGCRSQCRSVPRQQ----CSNVPRQQCSNVPRQQCSNVPRQSCSNAPRQSCQNVPRRVEEQVCNTIPRQVCXNVPRQ----VQRQECRNVPRQSCQNVPRQVSRQECNNXPRQECNNVPRQQCSNIPRQQCSNVPRQVQRXEC 766 HSP 3 Score: 380.178 bits (975), Expect = 2.803e-118 Identity = 280/568 (49.30%), Postives = 328/568 (57.75%), Query Frame = 0
Query: 543 CNTVNEQQCNTVQEQQCSTVN----------------------------------------EQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQC------------QTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD--------TVNEQVCNTV--------CNTIQEQVCNTVQ----EQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVC--------EQQCRNVPRQQCQNVP------------------------RQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQV-------------------------------PRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQES----RQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNV------------PRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQ--------ECNNVARQVPRQEC 951
C TVNEQ C+TV EQQCSTVN EQQC TVTDTVNEE C+TVNEQ C TV EQ+C+TV EQ+C TVNEQQC+TVNEQ+CNTVT+TV+EQ C+TV EQ+C TVTD TVNEQVCNTV C+T+ EQVCNTV EQ+CSTV +QQC+T+NEQQCS+VNE+ C + + + +TVNEQQC TV EQQC+TV EQQC TVNEQVC EQQC V QQC+ + QQC+ V ++C +V QQC+ V Q+C V QQC+ V Q C++V R V Q CSN+PRQ C+NVPRQ+ RQ C N PRQ CQNVPR+V Q C +PRQ C NVPRQVQRQEC N+PRQ CQNV PRQEC NVPRQ+C+NIPRQQC+NVPRQV R EC++VPRQ C+NVPRQQCQTVPRQ +C NV RQV RQEC
Sbjct: 243 CRTVNEQVCSTVNEQQCSTVNKQQCSTVNEQSCSTVNERQCSTVNERQCSTVNDQQCSTTSEQQCNTVTDTVNEEQCSTVNEQQCTTVNEQKCSTVNEQECNTVTDTECNTVTDTVNEQQCSTVNEQECNTVTDTVSEQQCSTVTEQECNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVTDTVNEQQCSTVNEQVCNTVXDTVNEQQCSTVNEQQCSTINEQQCSTVNEEQCTTVNEQQCRTVTDTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQVCNXXXDTVNEQQCSTVNEQQCETITDTVNEQQCNTVQEQKCETQYMVKYEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQVCEEVCDNQSSYGAPAGGAYGAPSSSYGAGGGCRSQCRSVPRQQCSNVPRQQCSNVPRQQCSNVPRQSCSNAPRQSCQNVPRRVEEQVCNTIPRQVCXNVPRQVQRQECRNVPRQSCQNVPRQVSRQECNNXPRQECNNVPRQQCSNIPRQQCSNVPRQVQRXECSSVPRQSCQNVPRQQCQTVPRQNCQNVPREQCQNVPRQVQRQEC 810
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000005550 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s297:531386:534570:-1 gene:EMLSAG00000005550 transcript:EMLSAT00000005550 description:"maker-LSalAtl2s297-snap-gene-4.60") HSP 1 Score: 566.614 bits (1459), Expect = 0.000e+0 Identity = 354/594 (59.60%), Postives = 421/594 (70.88%), Query Frame = 0
Query: 419 CRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTV----NEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----------------CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQ-------------------------QCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNT----VQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNN------------VAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
C TVNEQ+C T+ EQKCSTV E++CSTV EQ+CST E C+TV NE +C V Q+C+TVNEQ+C+ VNEQ+C TVTDTVNEQ+C+TV EQ +TVTDTVNEQ CNTV EQ+C+TV+ETVNEE C+TVNEQQC+TV EQ+C TVNEQ+C +T+NE+ C TV + TV EQQC TV EQQC+TV+EQ+CNTVNEQ+C TVT+TVNEQ C+TVNEQ+CETVTDTVNEQ CNTV C T+ EQ C TV E+ C V DQ QC V QQC ++ Q C++ R ++ C + Q CN VQ Q+C+ V QQC V Q+ QQCRNVPRQQCQNVPRQ+C N V R+EC+SVPRQQC NVP+QEC VPRQQC NVPRQ+CQ VPR+V Q C N+PRQ C NVPRQ RQEC+NVPRQQCQNVPRQ +QEC+NVPRQQCQNVPRQVQ+QEC N+PRQ+CQNVPRQ V +QEC N+PR++C NVPRQV RQEC VPRQ+C+NVPRQQCQ VPRQ+C NV RQV ++EC
Sbjct: 83 CNTVNEQKCDTLNEQKCSTVNERKCSTVNEQKCSTTTERECNTVSETVNEQKCSTVNEQKCSTVNEQKCSNVNEQKCRTVTDTVNEQKCDTVNEQNSRTVTDTVNEQKCNTVNEQKCETVTETVNEEKCSTVNEQQCSTVNEQKCDTVNEQKC----NTINEQKCETVTD----TVNEQQCTTVNEQQCKTVSEQKCNTVNEQECETVTDTVNEQQCDTVNEQKCETVTDTVNEQQCNTVQEKKCEVQYMVRYEEQCTTVNEQECRTVNEEVCEEVCDQAPIPSYGSPSSYGASGAAAGGGCSKQCRNVPRQQCQNIPRQSCQNVPRRVEEEVCENIPRQVCNNVPRQVQRQECNNVPRQQCQNVPRQIQRQQCRNVPRQQCQNVPRQECQNVPRQQCQNVPRQVQRQECKSVPRQQCQNVPKQECKTVPRQQCQNVPRQQCQNVPRQVPRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQXQKQECKNVPRQQCQNVPRQVQKQECKNVPRQQCQNVPRQ----VQKQECKNVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQQCQNVPRQQCQNVPRQVQKEEC 664 HSP 2 Score: 246.128 bits (627), Expect = 1.450e-68 Identity = 205/478 (42.89%), Postives = 253/478 (52.93%), Query Frame = 0
Query: 620 NTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCN----------------------------TVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVC----------------------------------------ESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVC--------EQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVP----RQQCNNVPRQEC----NNVPRQQCNNVPRQECQ-QVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVP---------------------RQQCQNVPRQ----VPRQECRNV------------PRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQ------------NVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRN--------VPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
N V V EQVC T NEQ+C V+ E+VCNTV C+T+ EQ C+ TV EQ+CSTV +Q+C+TVNEQ+CS+VNEQ C E+ T T +++C+TVNEQQC+TV EQ+C TV EQ+CNT+NEQ C EQQC V QQC+ V Q+CN V +EC +V QQC+ V Q+C + V QQCN V ++C+ Q R EEQ C+ + Q C V + + C P +QC+NVPRQ +PRQ C+NV PRQ C NVPRQVQRQECNN+PRQ+CQ NVPRQ+C+NVPRQEC N+PRQQC NVPRQV RQEC +VPRQ+C+N VPRQQCQ VPRQ+C NV RQVPRQEC
Sbjct: 56 NPVCSIVIEQVCTTKNEQKCSPVS----EEVCNTVNEQKCDTLNEQKCSTVNERKCSTVNEQKCSTTTERECNTVSETVNEQKCSTVNEQKCSTVNEQKCSNVNEQKCRTVTDTVNEQKCDTVNEQNSRTVTDTVNEQKCNTVNEQKCETVTETVNEEKCSTVNEQQCSTVNEQKCDTVNEQKCNTINEQKCETVTDTVNEQQCTTVNEQQCKTVSEQKCNTVNEQECETVTDTVNEQQCDTVNEQKCETVTDTVNEQQCNTVQEKKCEVQYMVRYEEQ-CTTVNEQECRTVNEEVCEEVCDQAPIPSYGSPSSYGASGAAAGGGCSKQCRNVPRQQCQNIPRQSCQNVPRRVEEEVCENIPRQVCNNVPRQVQRQECNNVPRQQCQNVPRQIQRQQCRNVPRQQCQNVPRQECQNVPRQQCQNVPRQVQRQECKSVPRQQCQNVPKQECKTVPRQQCQNVPRQQCQNVPRQVPRQEC 528 HSP 3 Score: 154.066 bits (388), Expect = 1.775e-38 Identity = 157/383 (40.99%), Postives = 186/383 (48.56%), Query Frame = 0
Query: 417 QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTV----NEPQCRNVPRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNT----VQEQQCNTVQEQQCQTV----NEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQEC 783
++CR V QQC + Q C V + V+E+ C + VC+ V +C NVPRQQC V QQC V QQC V Q+C V QQCQ V V Q C +V QQCQ V +Q+C TV QQC V QQCQ V V + C V Q C VQ Q+C V QQCQ V +Q+C V QQC V V +Q C V QQC+ V V +Q C V + V VQ QEC V QQC V QQC +V Q C++ R K+EC V +QQC V QQC V QQC+NVPRQQCQNVPR+QC V REEC S P+Q C NV RQ C
Sbjct: 378 KQCRNVPRQQCQNIPRQSCQNVPRR----VEEEVCENIPRQVCNNVPRQVQRQECNNVPRQQCQNVPRQIQRQQCRNVPRQQCQNVP----RQECQNVPRQQCQNVPRQVQRQECKSVPRQQCQNVP------------KQECKTVPRQQCQNVPRQQCQNVPRQVPRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQXQKQECKNVPRQQCQNVPRQVQKQECKNVPRQQCQNVPRQVQKQECKNVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQQCQNVPRQQCQNVPRQVQKEECKNVPKQQCQNVPRQQCQNVP------------RQQCQNVPRQQCQNVPREQCETVTREECVSNPQQSCENVERQVC 728
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000001619 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1284:71230:73770:-1 gene:EMLSAG00000001619 transcript:EMLSAT00000001619 description:"maker-LSalAtl2s1284-snap-gene-0.10") HSP 1 Score: 536.184 bits (1380), Expect = 1.248e-180 Identity = 338/526 (64.26%), Postives = 392/526 (74.52%), Query Frame = 0
Query: 497 TVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQC----QTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV--------CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCE------------------------------QQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQV-------------PRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIP------------RQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ----VPRQEC 951
TVNEQQC+TV EQQCQTV NEQ CNTV EQQC TVNE+ C+TVNE+QC TV EQ+CST E +C TVTDTVNEE CNTVNEQ C TV EQ+CNTV EQ+C TVNEQ+CNTVNEQ+C TVT+TVNEQ C+ VNEQ+CETVTDTVNEQ CNTV C+T+ EQ C+TV EQ+C+TV +QQC+TVNEQQCS+VNEQ C + +Q+C TVNEQQC+TV EQQC+TV EQ+CNTVNEQVCE Q+C+NVPRQQC NVPRQQC+NV R++C +VP+QQCNNVPRQ+C+NVP+Q+C NVPRQ C VPRRVEEQVC+NIPRQVCNNVPRQ RQEC+NVPRQQCQNVPRQV RQEC+NVPRQQCQNVPRQVQRQEC N+P RQEC+NVPRQ+C+NVPRQ+C+N+PRQQC NVPRQV RQEC VPRQ+C+NVPRQ+C VPRQ+C+NV RQ VP Q+C
Sbjct: 84 TVNEQQCSTVNEQQCQTV----NEQQCNTVNEQQC----STVNEQKCSTVNEEQCRTVSEQKCSTTTEXECNTVTDTVNEEQCNTVNEQQCQTVNEQKCNTVNEQKCNTVTDTVNEQKCNTVNEQKCETVTDTVNEQKCSNVNEQKCETVTDTVNEQKCNTVNEQQCQTQCSTVNEQQCSTVNEQQCNTVNEQQCSTVNEQQCSTVNEQQCTTVN----EQQCTTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQKCNTVNEQVCEEVCDNQAGYGAPQAGYGGPLSSYGAGGGCRQECKNVPRQQCSNVPRQQCSNVPRQQCSNVPKQQCNNVPRQQCSNVPKQECKNVPRQSCNTVPRRVEEQVCNNIPRQVCNNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQREECKNVPRQQXQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQQCSNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQQCQNVPRQECSNVPRQQCSNVPRQECRNVPSQQC 597 HSP 2 Score: 518.464 bits (1334), Expect = 1.159e-173 Identity = 348/561 (62.03%), Postives = 403/561 (71.84%), Query Frame = 0
Query: 419 CRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCN----TVNEQQCNTVTD----TVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQC----NTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNT--------------IQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQ----ECNNVPRQQ-----CNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECN 940
CRTVNEQQCSTV EQ+C TV EQQC+TV EQQCSTV E CSTVNE QCR V Q+C+T E +CN TVNE+QCNTV + TVNEQ+CNTV EQ+C TVTDTVNEQ CNTV EQ+C+TV++TVNE+ C+ VNEQ+C +TV EQ+C+TVNEQQCQT TVNE+ C+TVNEQ CNTV EQQC+TV EQQC TVNEQQC TVNEQQC TV E TVNEQ C TVNEQ+C +TVNEQVC VC+ + QEC V QQC+ V QQCS+V Q C + KQ+CN V QQC+ V +Q+C V Q CNTV +V EQ C N+PRQ C NVPRQ V R+EC++VPRQQC NVPRQ EC NVPRQQ C NVPRQ+CQ VPR+V+ Q C N+PRQ C NVPRQ RQEC+NVPRQQCQN VPRQ+C NVPRQQCQNVPRQVQRQEC N+PRQ+CQNVPRQEC NVPRQ+C+N+PRQ+C NVP Q+C+ VPRQ+C NVPRQQC+ VPRQ C+
Sbjct: 82 CRTVNEQQCSTVNEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCSTVNEQKCSTVNEEQCRTVSEQKCSTTTEXECNTVTDTVNEEQCNTVNEQQCQTVNEQKCNTVNEQKCNTVTDTVNEQKCNTVNEQKCETVTDTVNEQKCSNVNEQKCETVTDTVNEQKCNTVNEQQCQTQCSTVNEQQCSTVNEQQCNTVNEQQCSTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQKC----NTVNEQVCEEVCDNQAGYGAPQAGYGGPLSSYGAGGGCRQECKNVPRQQCSNVPRQQCSNVPRQQCSNVP----KQQCNNVPRQQCSNVPKQECKNVPRQSCNTVPRRVEEQVCNNIPRQVCNNVPRQ----VQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQREECKNVPRQQXQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQN----VPRQQCSNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQQCQNVPRQECSNVPRQQCSNVPRQECRNVP----SQQCSNVPRQQCSNVPRQQCRNVPRQVCD 622 HSP 3 Score: 363.999 bits (933), Expect = 2.385e-114 Identity = 279/526 (53.04%), Postives = 328/526 (62.36%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVC----STVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQC----NTVQEQQCSTVNEQQCQTVTD------------TVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNE--------------------------------------------------QQCNTV----TETVNEQVCNTVNEQQCETV----TDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTV----QDQQCTTVNEQQCSSVNEQV----CESTTRTEF-KQECNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQ----QCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQV 846
+Q+C TVNEQQCSTV EQKCSTV E+QC TV EQ+CST E C TVNE QC V QQC TVNEQ+CNTVNEQ+CNTVTDTVNEQ+CNTV EQ+C+TVTDTVNEQ C+ V EQ+C+TV++TVNE+ CNTVNEQQC +TV EQQCSTVNEQQC TV + TVNE+ C TVNEQ C TV EQQC+TV EQQC TVNEQ+CNTVNE QQC+ V V +Q CN V QQC V V Q CNTV ++EQVCN + Q C+ V Q Q+C V QQC +V QV C++ R + +QEC V QQC V Q Q+C V QQC V QV Q+C+NVPRQQCQNVPRQQC+NV R++C++VPRQ +C NVPRQ+C NVPRQ+C+NVPRQ+C VPR Q C N+P Q C+NVP RQ+C NVPRQQC+NVPRQV
Sbjct: 103 EQQCNTVNEQQCSTVNEQKCSTVNEEQCRTVSEQKCSTTTEXECNTVTDTVNEEQCNTVNEQQCQTVNEQKCNTVNEQKCNTVTDTVNEQKCNTVNEQKCETVTDTVNEQKCSNVNEQKCETVTDTVNEQKCNTVNEQQCQTQCSTVNEQQCSTVNEQQCNTVNEQQCSTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQQCTTVNEQKCNTVNEQVCEEVCDNQAGYGAPQAGYGGPLSSYGAGGGCRQECKNVPRQQCSNVPRQQCSNVPRQQCSNVPKQQCNNVPRQQCSNVPKQECKNVPRQSCNTVPRRVEEQVCNNIPRQVCNNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQREECKNVPRQQXQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQNVPRQQCSNVPRQQCQNVPRQVQRQECRNVPRQQCQNVPRQECSNVPRQQCSNVPR----QECRNVPSQQCSNVP----RQQCSNVPRQQCRNVPRQV 620
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000005549 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s297:492854:495386:-1 gene:EMLSAG00000005549 transcript:EMLSAT00000005549 description:"snap_masked-LSalAtl2s297-processed-gene-4.34") HSP 1 Score: 383.259 bits (983), Expect = 3.690e-121 Identity = 259/496 (52.22%), Postives = 334/496 (67.34%), Query Frame = 0
Query: 498 VNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNT---IQ-----EQVCNTVQEQECSTVQDQ---------------------------------QCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNT----VQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQ--------QCQNVPRQQCNNVA----REECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPR 936
VNEQQC+TV EQQC TVTDTVNEQ C+ V EQ C TV++TVNE+VC+TVNEQ C+TV EQ CSTVNEQ C TVNE+VC+TV + TV E+QC+TV E+QC VN+++C T E+QC TVTETVNEQ C+ V EQQCETVT+TVNE+VCNTV ++ IQ EQ C+TV +Q+C TV Q QC +V +Q+C V Q C++ R ++ C ++ QQC + VQ Q C +V +QQC TV QV + C+N+P+Q CQN+PRQ CN+V R+EC+SVP+Q+C VP+Q+C VP+Q C NVP+Q+CQ VP++V+ Q C+ + RQ C NVPRQ RQ+C+ VP+QQCQN VP+QEC+NVPRQQCQN+PRQVQ+QEC ++P+Q CQNVPRQ+C VP+Q+C N+P Q C NVP RQ+C +VPRQ+C +VPRQ CQ V R
Sbjct: 72 VNEQQCSTVSEQQCSTVTDTVNEQQCSPVNEQVCNTVTDTVNEQVCSTVNEQVCSTVNEQVCSTVNEQSC----STVNEQVCSTVTD----TVNEEQCSTVNEEQCSXVNKEECTTATEEQCETVTETVNEQQCSIVKEQQCETVTNTVNEEVCNTVQDSKCQIQYMIKYEQQCSTVNQQQCQTVTAQEXRQVCSNQSPRPSYGAPSYYRGSGGAGGGCSTQCRSVPKQECGVVPTQSCQNVPRRVEEEVCQSIPRQQCQSVPRQVQRQNCKSVPKQQCQTVPRQVQRESCKNIPKQLCRNVPTTNCQNIPRQVCNSVPRQVQRQECKSVPQQKCQTVPQQKCQTVPQQNCQNVPKQQCQAVPKQVQRQDCNTVTRQQCQNVPRQVQRQDCKAVPKQQCQN----VPKQECQNVPRQQCQNIPRQVQKQECKSLPKQSCQNVPRQQCTAVPKQQCTNVPSQVCQNVP----RQQCTSVPRQQCTSVPRQSCQNVQR 551 HSP 2 Score: 327.791 bits (839), Expect = 3.142e-100 Identity = 246/491 (50.10%), Postives = 301/491 (61.30%), Query Frame = 0
Query: 554 VQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTV----NEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNT----VQEQQCSTVQEQQCNTVNEQ-----------------------------VCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAR----EECRSVPRQQCNNVPRQ----ECNNVPRQQCNNVPRQ----ECQQVPRRVEEQV----CSNIPRQVCNNVPRQESRQECR------------------------NVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPR----QQCNNVPRQ----VARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ----VPRQEC 951
V EQQCSTV+EQQC TVTDTV NEQ C+ V EQ CNTV + TVNEQ C+TVNEQ C+TV E TVNEQ C+TVNEQ C TVTDTVNE+ C+TV E+ C+ V ++EC+T ++QC TV NEQQCS V EQ CE+ T T ++ CNTV + +C EQQCSTV +QQC TV Q C QCR+VP+Q+C VP Q C NV R E C+S+PRQQC +VPRQ C +VP+QQC VPRQ C+ +P+++ V C NIPRQVCN+VPRQ RQEC+ NVP+QQCQ VP+QV RQ+C V RQQCQNVPRQVQRQ+C +P+Q+CQNVP+QEC+NVPRQ+C NIPR Q+C ++P+Q V RQ+C VP+Q+C NVP Q CQ VPRQ+C +V RQ VPRQ C
Sbjct: 72 VNEQQCSTVSEQQCSTVTDTV--------NEQQCSPVNEQVCNTVTD----TVNEQVCSTVNEQVCSTVNEQVCSTVNEQSCSTVNEQVCSTVTDTVNEEQCSTV----NEEQCSXVNKEECTTATEEQCETVTETVNEQQCSIVKEQQCETVTNTVNEEVCNTVQDSKCQIQYMIKYEQQCSTVNQQQCQTVTAQEXRQVCSNQSPRPSYGAPSYYRGSGGAGGGCSTQCRSVPKQECGVVPTQSCQNVPRRVEEEVCQSIPRQQCQSVPRQVQRQNCKSVPKQQCQTVPRQVQRESCKNIPKQLCRNVPTTNCQNIPRQVCNSVPRQVQRQECKSVPQQKCQTVPQQKCQTVPQQNCQNVPKQQCQAVPKQVQRQDCNTVTRQQCQNVPRQVQRQDCKAVPKQQCQNVPKQECQNVPRQQCQNIPRQVQKQECKSLPKQSCQNVPRQQCTAVPKQQCTNVPSQVCQNVPRQQCTSVPRQQCTSVPRQSC 546 HSP 3 Score: 299.671 bits (766), Expect = 6.483e-90 Identity = 241/516 (46.71%), Postives = 308/516 (59.69%), Query Frame = 0
Query: 422 VNEQQCSTVQEQKCSTV----QEQQCSTVQEQQC----STVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVC------------NTVNEQQCNTVQ------------EQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTV---------QEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVP----RQQCNNVAREECRSVP----RQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPR 884
VNEQQCSTV EQ+CSTV EQQCS V EQ C TV E VCSTVNE C V Q C+TVNEQ C+TVNEQ C+TVTDTVNE+QC+TV E+QC VN++ C T E+QC+TV+ETVNE+ C NTVNE+ CNTVQ EQQCSTVN+QQCQTVT +VC+ + + C+T QC++V +Q+C V Q C V V E+VC ++ QQC++V V Q C +V C T+ Q VQ + C + Q C V C ++ QVC S R +QEC +V +Q+C TV +Q+C TV +Q C+NVP+QQCQ VP RQ CN V R++C++VP RQ C VP+Q+C NVP+Q+C NVPRQ+CQ +PR+V++Q C ++P+Q C NVP RQ+C VP+QQC NVP QV C+NVPRQQC +VP RQ+C ++PRQ CQNV R
Sbjct: 72 VNEQQCSTVSEQQCSTVTDTVNEQQCSPVNEQVCNTVTDTVNEQVCSTVNEQVCSTVNEQVCSTVNEQSCSTVNEQVCSTVTDTVNEEQCSTVNEEQC----SXVNKEECTTATEEQCETVTETVNEQQCSIVKEQQCETVTNTVNEEVCNTVQDSKCQIQYMIKYEQQCSTVNQQQCQTVTAQEXRQVCSNQSPRPSYGAPSYYRGSGGAGGGCST----QCRSVPKQECGVVPTQSCQNVPRRVEEEVCQSIPRQQCQSVPRQVQRQNCKSVPKQQCQTVPRQ----VQRESCKNIPKQLCRNVPTTNCQNIPRQVCNSVPRQVQRQECKSVPQQKCQTVPQQKCQTVP------------QQNCQNVPKQQCQAVPKQVQRQDCNTVTRQQCQNVPRQVQRQDCKAVPKQQCQNVPKQECQNVPRQQCQNIPRQVQKQECKSLPKQSCQNVP----RQQCTAVPKQQCTNVPSQV----CQNVPRQQCTSVP----RQQCTSVPRQSCQNVQR 551 HSP 4 Score: 153.68 bits (387), Expect = 6.674e-39 Identity = 166/437 (37.99%), Postives = 206/437 (47.14%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV----CSTVNEPQCRNVPRQQCNT------------VNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNE--------------------QQCNTVQEQQCQTVT-------------------------------------DTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEE------------------------VCNTVNEQV----CNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV--------------------CNTI----QEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEF----KQECNTVNEQQCNTVQ 719
+Q C TVNEQ CSTV EQ CSTV EQ CSTV EQ CSTV ++V CSTVNE QC V +++C T VNEQQC+ V EQQC TVT+TVNE QQC+TV +QQCQTVT +V +Q C V Q CQ V V EEVC ++ QQC +V Q Q C +V +QQCQTV V E VCN+V QV C +V +Q+C TV +Q+CQTV +Q C V +QQC V + V Q CNTV QQC+ V V Q C V C I Q+Q C ++ +Q C V QQCT V +QQC++V QVC++ R + +Q+C +V Q C VQ
Sbjct: 114 EQVCSTVNEQVCSTVNEQVCSTVNEQSCSTVNEQVCSTVTDTVNEEQCSTVNEEQCSXVNKEECTTATEEQCETVTETVNEQQCSIVKEQQCETVTNTVNEEVCNTVQDSKCQIQYMIKYEQQCSTVNQQQCQTVTAQEXRQVCSNQSPRPSYGAPSYYRGSGGAGGGCSTQCRSVPKQECGVVPTQSCQNVPRRVEEEVCQSIPRQQCQSVPRQVQRQNCKSVPKQQCQTVPRQVQRESCKNIPKQLCRNVPTTNCQNIPRQVCNSVPRQVQRQECKSVPQQKCQTVPQQKCQTVPQQNCQNVPKQQCQAVPKQVQRQDCNTVTRQQCQNVPRQVQRQDCKAVPKQQCQNVPKQECQNVPRQQCQNIPRQVQKQECKSLPKQSCQNVPRQQCTAVPKQQCTNVPSQVCQNVPRQQCTSVPRQQCTSVPRQSCQNVQ 550 HSP 5 Score: 95.5153 bits (236), Expect = 2.405e-20 Identity = 116/365 (31.78%), Postives = 170/365 (46.58%), Query Frame = 0
Query: 354 SLNQKLNKPVLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSG---YGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDT----VNEQVCNTV----QEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQ------------VCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVC 695
++N+++ V + C + V Q+ + +A+ R SN + PS G Y QC +V +Q+C V Q C V + V+E VC ++ QC++VPRQ V Q C +V +QQC TV V + C + +Q C+ V T + QVCN+V Q Q+C++V + + C TV +Q+C TV +Q C V +QQCQ V V + CNTV Q C V +QQC V +Q+CQ V QQC + Q V +Q C ++ +Q C+ V V C + QVC V Q+C++V QQCT+V Q C +V VC
Sbjct: 211 TVNEEVCNTVQDSKCQIQYMIKYEQQCSTVNQQQCQTVTAQEXRQVC-SNQSPRPSYGAPSYYRGSGGAGGGCSTQCRSVPKQECGVVPTQSCQNVPRR----VEEEVCQSIPRQQCQSVPRQ----VQRQNCKSVPKQQCQTVPRQVQRESCKNIPKQLCRNVPTTNCQNIPRQVCNSVPRQVQRQECKSVPQ----QKCQTVPQQKCQTVPQQNCQNVPKQQCQAVPKQVQRQDCNTVTRQQCQNVPRQVQRQDCKAVPKQQCQNVPKQECQNVPRQQCQNIPRQ--------VQKQECKSLPKQSCQNVPRQQCTAVPKQQCTNVPSQVCQNVPRQQCTSVPRQQCTSVPRQSCQNVQRVVC 554
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000002358 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s144:217697:238719:-1 gene:EMLSAG00000002358 transcript:EMLSAT00000002358 description:"maker-LSalAtl2s144-snap-gene-3.13") HSP 1 Score: 382.874 bits (982), Expect = 1.869e-117 Identity = 277/626 (44.25%), Postives = 364/626 (58.15%), Query Frame = 0
Query: 413 GGAQ--QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEE--------VCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTV------------TETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVC----ESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQE-----QQCSTVQEQQCNTVN----EQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNN--------VPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQE----SRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPR------------------------QECQNVPRQECRNVP----RQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ----VP----RQEC 951
GG + +C T NEQQCST QEQ+C+T+ EQ+C T E T+ E C +NE QC V QQC TVNEQQC+TVNEQQC T ++V+E+ C T+QEQ+C+T T EQ+C +++ Q C TV + E C TVNEQ C+T+ E+ CS +NEQ C TV DT+NEE C T +QVC+ + E+ C+TV EQQCQ V E+ CNTV+EQQC+ V T NE VCNTV +Q+C TV + V E C T+ EQ+C E ECS +++QC T E++C ++ + C E+ RTEF +EC V E T E + C +V + C V Q+ E+QCR P + C NVPR+QC + R CR+VP ++C VPR+EC V R++C +VP++ CQQVPR Q C +P Q C VPRQ+ SR+EC VP QQCQ VPRQ +P++ C+ VP Q CQ VPRQ RQEC+++PR Q+C N P+Q C++VP Q C IPRQQC+ V +QV Q CN++PR++C VPRQQC TVPR +CN V RQ VP RQEC
Sbjct: 129 GGQECLSQCTTTNEQQCSTTQEQQCTTLNEQKCETRYE----TIYEQQCVPINEEQCGIVNEQQCTTVNEQQCSTVNEQQCTTSYESVSEEVCTTIQEQKCETEYMTKYEQICTSIENQVCSTV--VIPE--CRTVNEQVCSTINEEVCSXINEQVCNTVVDTINEEQCTQTFDNQCTTSFQQVCDEIFEESCSTVNEQQCQQVTEEVCNTVDEQQCSQVFEEQCTTETEEVCTTENETVCNTVKDQECTTVNEEVCEDAGGENCETVFEQLCTQTFETECSNDEEEQCFTKYEEECETIYKDRCSTEYENKCRTEFVEECKNVYEDVQATYGEGEDPPKDCQSVPREACTQVAVPNCRQIAEEQCREKPTRICNNVPREQCTQIPRYNCRNVPSEKCEGNSEPVCQQVPREECREVDREECTDVPKENCQQVPR----QNCQQVPSQQCQTVPRQQCEQVSREECETVPTQQCQQVPRQNCQDIPQETCQQVPSQSCQQVPRQQSRQECSSVPRQQCSQVPQQQCSSVPKQQCSDVTSQQCSNTPQQSCQSVPVQVEGQTCRTIPRQQCSQVQKQVPSQNCNSIPREQCSVVPRQQCNTVPRNQCNXVTRQECTSVPSQKERQEC 742 HSP 2 Score: 154.451 bits (389), Expect = 1.556e-38 Identity = 171/526 (32.51%), Postives = 237/526 (45.06%), Query Frame = 0
Query: 418 ECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQ--------------------QCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQC------------------------NTVNEQQCNTVTDTV----------------------------NEQQCNTVQEQQCQTVT----DTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVN---------------------------------EE--------VCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEV----CNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVT----ETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTI----QEQVCNTV--------QEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVP----RQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQV 802
ECRTVNEQ CST+ E+ CS + EQ QC+T +Q C + E CSTVNE QC+ V + CNTV+EQQC NTV +Q+C TV + V E+QC T E++C+T+ T E C T ++C+ V E V EE +CN V +QC + C V ++C+ ++ V ++V C V+ + C V ++ C V Q CQ V QQC TV QQC V+ ETV Q C V Q C+ + +QV + C + Q C++V +Q+CS+V QQC+ V QQCS+ +Q C+S Q C T+ QQC+ VQ+Q V Q CN++ + QC VPRQQC VPR QCN V R+EC SVP RQ+C ++PRQ+C+ VP+QQC + P++ CQ +
Sbjct: 252 ECRTVNEQVCSTINEEVCSXINEQVCNTVVDTINEEQCTQTFDNQCTTSFQQVCDEIFEESCSTVNEQQCQQVTEEVCNTVDEQQCSQVFEEQCTTETEEVCTTENETVCNTVKDQECTTVNEEVCEDAGGENCETVFEQLCTQTFETECSNDEEEQCFTKYEEECETIYKDRCSTEYENKCRTEFVEECKNVYEDVQATYGEGEDPPKDCQSVPREACTQVAVPNCRQIAEEQCREKPTRICNNVPREQCTQIPRYNCRNVPSEKCEGNSEPVCQQVPREECREVDREECTDVPKENCQQVPRQNCQQVPSQQCQTVPRQQCEQVSREECETVPTQQCQQVPRQNCQDIPQETCQQVPSQSCQQVPRQQSRQECSSVPRQQCSQVPQQQCSSVPKQQCSDVTSQQCSNTPQQSCQSVPVQVEGQTCRTIPRQQCSQVQKQ----VPSQNCNSIPRE----QCSVVPRQQCNTVPRNQCNXVTRQECTSVPSQKERQECFSIPRQQCSTVPKQQCTSNPQENCQPI 769
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000009957 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s64:818502:820523:-1 gene:EMLSAG00000009957 transcript:EMLSAT00000009957 description:"augustus_masked-LSalAtl2s64-processed-gene-8.0") HSP 1 Score: 357.836 bits (917), Expect = 1.391e-113 Identity = 265/521 (50.86%), Postives = 321/521 (61.61%), Query Frame = 0
Query: 471 PRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTV------QEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTV-----------------------NEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQE----SRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQV 946
P + CN V N QC NE +CN QQCNTV +QQC TVN+Q C+TV EQQC TVNE C+TVNEQQC+TV +QQCSTVNE++C +TVNE CNTVN+Q C+TV+E+QC+TV +EQQC TV EQQC+TVNEQQC+T TVN Q C+TVN+Q+C T +TV N + + C +V QQC V QQC +V QV +Q+C V QQC +V Q C T Q C+TV Q QC NVPRQQC++VP+QQC +V R+ CRSVP+Q C +VP+Q+C +VPR+QC NVPRQ+C VPR V Q C+N+P+Q C +VPRQ RQ CRNVP +QC NVPRQ VP+Q+CRNVPRQQC NVPRQ V ++ CNN+PR+ C NVPRQ CRNVP Q CNN+PRQ C +VPRQ C VPRQ CRNVP Q CQ VPRQ CNNV V
Sbjct: 25 PGRNCNIVRSPSNTGQC--FNEPECN--------QQCNTVNKQQC----STVNKQQCSTVNEQQC----STVNENQCSTVNEQQCSTVNKQQCSTVNERKC----NTVNERQCNTVNKQQCSTVKERQCSTVNEQKTVKEQQCSTVKEQQCSTVNEQQCSTTYSTVNSQQCSTVNQQKCSTTYETVCSNGGGYGRYKRSPIFLGQEKKGNRRDGRNYGRGGRGGRGGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATQV--------PRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQVCSTVPRQ----QCSNVPRQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPKQSCRSVPKQQCRSVPREQCANVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPREVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQ----SCRNVPRQSCRNVPEQVCQNVPRQSCNNVCEDV 507 HSP 2 Score: 248.44 bits (633), Expect = 1.041e-72 Identity = 175/371 (47.17%), Postives = 231/371 (62.26%), Query Frame = 0
Query: 646 VNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTR----TEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQ--VCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNN----VAREECRSVPRQQCNNVPRQECNN-----------------------------------------------VPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ----VPRQEC 951
NE CN CNT+ +Q C+TV +Q+CSTV +QQC+TVNE QCS+VNEQ C + + T +++CNTVNE+QCNTV +QQCSTV+E+QC+TVNEQ V EQQC V QQC V QQC+ V ++C +V +Q+C+ C+N VPRQQC NVP Q+C+ V +V Q C N+PRQ C +VPRQ CR PRQ C VPRQ VPRQ+CR+VP+QQC++VPRQ C ++P+Q C++VP+Q+CR+VPR++C N+PRQQC+NVPR V+RQ+C VP+Q+CR+VPRQ C++VPRQ C NV + VPRQ C
Sbjct: 42 FNEPECNQQCNTVNKQQCSTVNKQQCSTVNEQQCSTVNENQCSTVNEQQCSTVNKQQCSTVNERKCNTVNERQCNTVNKQQCSTVKERQCSTVNEQKTVKEQQCSTVKEQQCSTVNEQQCSTTYSTVNSQQCSTVNQQKCSTTYETVCSNGGGYGRYKRSPIFLGQEKKGNRRDGRNYGRGGRGGRGGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATQVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQS----CRTNPRQVCSTVPRQQCSNVPRQQCRSVPKQQCRSVPRQ----SCRSVPKQSCRSVPKQQCRSVPREQCANVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSC 404 HSP 3 Score: 237.269 bits (604), Expect = 8.587e-69 Identity = 225/557 (40.39%), Postives = 277/557 (49.73%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSE--TVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCST----VNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCN-----------------------------------------------TVQEQQCNTVQEQQCQTVN----EQQCNTVNEQQCNTV----TETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVC------------EQQCRNVPRQQCQNVPRQQC----------------NNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECN--------NVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNV 822
V + SCL + F + AE RN N V S G NE +C+ Q+C+TV +QQCSTV +QQCSTV E CSTVNE QC+TVNEQQC+TVN+QQC TVNE++CNTV E+QC +TVN+Q C+TV+E+QC TV+E TV E+ C+TV EQQC+TV EQQCST VN QQC TVN++ C+T E VC+ +V QQC V QQC+ V QQC V QQC +V T QVC+TV QQC V V C ++ Q C +V +Q C +V QQC +V +QC++V Q C + RT +Q+C V +QQC +V Q C +V Q C V E+ C +QQCRNVPRQQC NVPRQ C NNV R+ CR+VP Q CNNVPRQ C NVPRQ C NVP EQVC N+PRQ CNNV
Sbjct: 4 VAIISCLLLN-----------FALAIPHPFAEPGRNC----NIVRSPSNTGQC------FNEPECN----QQCNTVNKQQCSTVNKQQCSTVNEQQCSTVNE--------NQCSTVNEQQCSTVNKQQC----STVNERKCNTVNERQC----NTVNKQQCSTVKERQCSTVNEQKTVKEQQCSTVKEQQCSTVNEQQCSTTYSTVNSQQC----STVNQQKCSTTYETVCSNGGGYGRYKRSPIFLGQEKKGNRRDGRNYGRGGRGGRGGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATQVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQVCSTVPRQQCSNVPRQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPKQSCRSVPKQQCRSVPREQCANVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPREVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCRNVP------------EQVCQNVPRQSCNNV 503 HSP 4 Score: 124.79 bits (312), Expect = 3.528e-30 Identity = 119/301 (39.53%), Postives = 149/301 (49.50%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQ----EQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNE 712
+Q+C V QQC V Q+C V QQC +V Q C T VCSTV QC NVPRQQC +V +QQC +V Q C +V +Q C +V +QQC++V + C V QQC V TV+ + C V +QQC +V Q C +V Q C+ V EE C+ V Q C +V +QQC V QQC V Q C V ++ CN V +VCN V Q C V EQVCN V Q C +V Q C V Q C +V EQVC++ R Q CN V E
Sbjct: 241 RQQCVNVPSQQCRNVATQVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQVCSTVPRQQCSNVPRQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVP----KQSCRSVPKQQCRSVP----REQCANVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRNVP----EEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVP----REVCNNVPRQSCRNVP----------------EQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCRNVPEQVCQNVPR----QSCNNVCE 505 HSP 5 Score: 123.25 bits (308), Expect = 1.318e-29 Identity = 102/239 (42.68%), Postives = 128/239 (53.56%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTV----TDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQC----QTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTV 646
+Q CRT Q CSTV Q+CS V QQC +V +QQC +V C +V + CR+VP+QQC +V +QC V QQC+ V TV+ QQC V +QQC++V +V Q C V E+QC V + C +V +QQC V QQC+ V Q C Q V + V EVCN V Q C V EQ CN V Q C++V Q C V Q C V EQVC V Q C V + V
Sbjct: 277 RQSCRTNPRQVCSTVPRQQCSNVPRQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPKQSCRSVPKQQCRSVPREQCANVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVP----RQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPREVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCRNVP----EQVCQNVPRQSCNNVCEDV 507 HSP 6 Score: 79.7221 bits (195), Expect = 1.303e-15 Identity = 66/160 (41.25%), Postives = 82/160 (51.25%), Query Frame = 0
Query: 415 AQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTV 574
++Q+C V +QQC +V Q C +V Q C V E+QCS V C +V + QCRNVPRQQC V Q C V ++ CN V V CN V Q C+ V EQVCN V Q C++V + C V Q C V EQ C V Q C V + V
Sbjct: 360 SRQQCTNVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPREV----CNNVPRQSCRNVP----EQVCNNVPRQSCRSVP----RQSCRNVPRQSCRNVPEQVCQNVPRQSCNNVCEDV 507 HSP 7 Score: 62.003 bits (149), Expect = 4.390e-10 Identity = 57/142 (40.14%), Postives = 67/142 (47.18%), Query Frame = 0
Query: 405 AVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQ--------ESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETV 538
+V S +Q CR V E+QCS V Q C +V +QQC V QQC+ V + VC+ V C NVPRQ C V EQ CN V Q C +V Q C V Q C+ V EQVC V Q C V E V
Sbjct: 374 SVPRQSCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPREVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVP----RQSCRNVPRQSCRNVP----EQVCQNVPRQSCNNVCEDV 507
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000011865 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s834:189046:195473:-1 gene:EMLSAG00000011865 transcript:EMLSAT00000011865 description:"snap_masked-LSalAtl2s834-processed-gene-2.2") HSP 1 Score: 338.576 bits (867), Expect = 1.778e-100 Identity = 249/611 (40.75%), Postives = 349/611 (57.12%), Query Frame = 0
Query: 417 QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQC----NTVQEQQCQTVTDTVNEQVC----NTVQEQQCQTVSETVNEEVCN----TVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTV----NEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVN----EQVC---EQQCRNVPRQ-----------------------------------------QCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQEC--------NNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQEC----QNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
++C T EQ+C T E T EQ C T+QEQQC T+ +++ T E + V Q CNTV + TV+E QC TV DTV+EQQC +TV E++C+T DT+NEQ C T EQQC TV +T + VCN TVNE+QC+T E QC+TV E T DT + C T E T E +CNTV + QCQTV E QC+T + +C T ET++EQ C+T + +C TV DTV E+ C T +T T EQ+C T + TV E+QC++V ++ CEST T+++ TV++++C+ VQ+Q C+T+ EQ C T EQ+C EQ P+ C++VP+Q V ++ CRS+PR+ C+ R EC VP Q CN VPRQEC +VP +V +QV P+Q+C+ VP+Q + C V +++C ++PRQVPR+EC VPRQ+C+++PRQ R+ECN +PR+ C + VPRQEC VPRQ+C+ + +Q +P+QV+++ CN +PRQ + VPR+QCQ VPR+EC +V RQVPR+EC
Sbjct: 234 KQCSTTYEQKCETSYE----TQXEQACQTIQEQQCQTLYDTISETKCETKYDTVQEQVCNTVYQ----TVSETQCGTVYDTVSEQQCSTVYDTVNEKKCETKYDTINEQKCETRYETEYEQQCSTVYDTAYDTVCNTIYDTVNEKQCSTKYETQCNTVYE----TEYDTTYDNKCETQYETEYETSYESECNTVYDNQCQTVYDTIQESQCSTQYDTKCETKYETIHEQQCDTKYDNECTTVYDTVQEKKCETKYDTQCTTEYETTYEQQCRTEYRTEYDTVYEEQCNTVYDEKCESTYETQYE----TVSQEECHQVQDQVCNTIYEQVCETQYETEFEQICDEPEQDTYGSPKAPAIGAGDSYGSPQAPSVDTYGTPQAAPVSNSLDDYGSPKAPACRSVPKQ----VEKQNCRSIPRESCSPTTRTECQQVSKQVPKQVPSQVCNKVPRQECNKVPNQVAKQV----PQQICDQVPKQTPKNVCNQVQKEECYDIPRQVPREECHQVPRQECRDIPRQQAREECNQVPREVCSEIAKQVPRQECTQVPRQDCHQVSKQ----IPKQVSKEVCNQIPRQVSKQVPREQCQQVPREECIDVPRQVPREEC 816 HSP 2 Score: 302.368 bits (773), Expect = 1.354e-87 Identity = 244/667 (36.58%), Postives = 353/667 (52.92%), Query Frame = 0
Query: 421 TVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQC----NTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVC--------NTVNEQQCNTV------------------------QEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVC------------------------------------------NTVNEQ------VCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQV----CNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQ----VCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQ----QCSTVQEQQCNTVNEQ----VCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREEC----RSVPRQQCNNVP----RQECNNVPR----QQCNNVPRQ----ECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQ----QCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVP--------RQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQ----ECNNVAR----QVPRQEC 951
TVNE+QCST E +C+TV E + T + +C T E+ T E +C V QC +T+ E QC+T + +C T +T++EQQC+T + +C TV DTV E+ C T + QC T ET E+ C +TV E+QCNTV Q+Q C+T+ EQ C+T +T E++C N++++ C +V +Q V++Q C+++ + C+ +C V++ V +QV CN V Q+C V + V +QV +C+ + +Q VCN VQ++EC + Q V ++C V Q C R + ++ECN V + C+ + +Q +C+ V Q C+ V++Q V ++ C +PRQ + VPR+QC V REEC R VPR++C+ VP RQ+C NVPR +QC N+PRQ EC VP +V + C N+PRQ C VP+QE+R++C +PRQ +C +PRQV RQEC +VPRQ C+N+P+QV+ Q CN IPR+ C NVP +QEC NVP++ CN +PRQ+CN QV RQEC +PR+ C +P++ CQ VPRQ ECN V R QVPRQ C
Sbjct: 366 TVNEKQCSTKYETQCNTVYETEYDTTYDNKCETQYETEYETSYESECNTVYDNQCQTVYDTIQESQCSTQYDTKCETKYETIHEQQCDTKYDNECTTVYDTVQEKKCETKYDTQCTTEYETTYEQQCRTEYRTEYDTVYEEQCNTVYDEKCESTYETQYETVSQEECHQVQDQVCNTIYEQVCETQYETEFEQICDEPEQDTYGSPKAPAIGAGDSYGSPQAPSVDTYGTPQAAPVSNSLDDYGSPKAPACRSVPKQ----VEKQNCRSIPRESCSPTTRTECQQVSKQVPKQVPSQVCNKVPRQECNKVPNQVAKQVPQQICDQVPKQTPKNVCNQVQKEECYDIPRQ----VPREECHQVPRQECRDIPRQQAREECNQVPREVCSEIAKQVPRQECTQVPRQDCHQVSKQIPKQVSKEVCNQIPRQVSKQVPREQCQQVPREECIDVPRQVPREECSQVPKQVGRQQCTNVPRKVEKEQCKNIPRQTARQECYDVPMQVAREQCQNVPRQECKEVPKQEAREQCSYIPRQVERQECNTLPRQVARQECNSVPRQSCKNLPKQVETQNCNQIPRENCVNVPQQVCNPVTKQECSNVPKEVCNQVPRQECN----QVERQECTQIPRETCSKIPQESCQQVPRQETREECNQVPRSDCSQVPRQAC 1020 HSP 3 Score: 243.432 bits (620), Expect = 3.551e-67 Identity = 210/616 (34.09%), Postives = 315/616 (51.14%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCST----VQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQ------------------------------------------------QCQTVTDTVNEQVCNTVQEQ--------QCQTVSETVNEEV----CNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQ----QCNTVQEQQCQTVNEQQ----CNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQ----QCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTV----QEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQ----QCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQE----SRQECRNVPRQQCQNVPRQ------------VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQC 931
+++C T + QC+T EQ+C T + TV E+QC+TV + C + E Q V +++C+ V +Q CNT+ EQ C T +T EQ C+ ++ C++V V +Q C ++ + +CQ VS+ V ++V CN V Q+CN V Q V +Q C V + VCN V ++ C + Q +C+ V Q+C+ + QQ CN V + C+ + + V Q C V Q C V+ + +QV VCN I QV V ++C V ++C V Q +CS V +QV +Q+C V + V+++QC + Q+C V QV +QC+NVPRQ+C+ VP+Q+ ARE+C +PRQ V RQECN +PRQ +CN+VPRQ C+ +P++VE Q C+ IPR+ C NVP+Q ++QEC NVP++ C VPRQ +PR+ C +P++ CQ VPRQ R+ECN +PR +C VPRQ C VP+Q C+ +P++QC ++P RQ C+ V +QECR++PRQ+C
Sbjct: 469 EKKCETKYDTQCTTEYETTYEQQCRTEYRTEYDTVYEEQCNTVYDEKCESTYETQYETVSQEECHQVQDQVCNTIYEQVCETQYETEFEQICDEPEQDTYGSPKAPAIGAGDSYGSPQAPSVDTYGTPQAAPVSNSLDDYGSPKAPACRSVPKQVEKQNCRSIPRESCSPTTRTECQQVSKQVPKQVPSQVCNKVPRQECNKVPNQVAKQVPQQICDQVPKQTPKNVCNQVQKEECYDIPRQVPREECHQVPRQECRDIPRQQAREECNQVPREVCSEIAKQVPRQECTQVPRQDCHQVSKQIPKQVSKEVCNQIPRQVSKQVPREQCQQVPREECIDVPRQVPREECSQVPKQV--------GRQQCTNVPRK----VEKEQCKNIPRQTARQECYDVPMQVAREQCQNVPRQECKEVPKQE----AREQCSYIPRQ----VERQECNTLPRQVARQECNSVPRQSCKNLPKQVETQNCNQIPRENCVNVPQQVCNPVTKQECSNVPKEVCNQVPRQECNQVERQECTQIPRETCSKIPQESCQQVPRQETREECNQVPRSDCSQVPRQACTQVPKQICSQVPKEQCFDIP----RQSCSQVAKQECRDLPRQKC 1060 HSP 4 Score: 182.956 bits (463), Expect = 1.808e-47 Identity = 172/516 (33.33%), Postives = 256/516 (49.61%), Query Frame = 0
Query: 399 YGQSNNAVAPSS--GYGGAQQ-ECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQ----QCSTVNEQQCQTVTDT----VNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCN----TVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVP--------RQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPR----QVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQEC 887
YG A +S YG + CR+V +Q V++Q C ++ + CS +C V + V V C VPRQ+CN V Q V +Q C+ V + CN VQ+++C + V + C+ V Q+C+ + E CN V + C+ + +Q +C+ V Q C V+ V++EVCN + QV V +QC V ++C V Q V ++C+ V + V Q C V ++QC+ + Q C V + + C V QEC V Q+ +QCS + QV +QECNT+ Q V Q+C++V Q C + +QV Q C +PR+ C NVP +Q+C+NV +E C VPRQ+CN V RQEC +PR+ C+ +P++ CQQV PRQE+R+EC VPR C VPR QVP+Q C VP++QC ++P RQ C+ + +QEC+++PRQ+C
Sbjct: 593 YGTPQAAPVSNSLDDYGSPKAPACRSVPKQ----VEKQNCRSIPRESCSPTTRTECQQVSKQVPKQVPSQVCNKVPRQECNKVPNQVAKQVPQQICDQVPKQTPKNVCNQVQKEECYDIPRQVPREECHQVPRQECRDIPRQQAREECNQVPREVCSEIAKQVPRQECTQVPRQDCHQVSKQIPKQVSKEVCNQIPRQVSKQVPREQCQQVPREECIDVPRQ----VPREECSQVPKQVGRQQCTNVPRKVEKEQCKNIPRQTARQECYDVPMQVAREQCQNVPRQECKEVPKQE----AREQCSYIPRQV--------ERQECNTLPRQ----VARQECNSVPRQSCKNLPKQVETQNCNQIPRENCVNVPQQVCNPVTKQECSNVPKEVCNQVPRQECNQVERQECTQIPRETCSKIPQESCQQV--------------------PRQETREECNQVPRSDCSQVPRQACTQVPKQICSQVPKEQCFDIP----RQSCSQVAKQECRDLPRQKC 1060 HSP 5 Score: 118.242 bits (295), Expect = 3.680e-27 Identity = 124/381 (32.55%), Postives = 193/381 (50.66%), Query Frame = 0
Query: 420 RTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEP----QCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQ----QCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQ----QCQTVSETVNEEVCNTV----NEQQCNTVQEQ----QCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCN 776
R V ++C V Q+C + QQ ++C+ V VCS + + +C VPRQ C+ V++Q V+++ CN + V++Q QC V ++C V V + C+ V +Q QC V V +E C + Q+C V Q QC V Q+C+ V E C+ + QV + Q+CNT+ Q V Q+CN+V Q C + + V Q CN + + C V +QVCN V C+ + ++VCN V QEC+ V+ Q+CT + + CS + ++ C+ R E ++ECN V C+ V Q C+ QV +Q C VP++QC ++PRQ C+ VA++ECR +PRQ+C+
Sbjct: 709 RQVPREECHQVPRQECRDIPRQQ----AREECNQVPREVCSEIAKQVPRQECTQVPRQDCHQVSKQIPKQVSKEVCNQIPRQVSKQVPREQCQQVPREECIDVPRQVPREECSQVPKQVGRQQCTNVPRKVEKEQCKNIPRQTARQECYDVPMQVAREQCQNVPRQECKEVPKQEAREQCSYIPRQV----ERQECNTLPRQ----VARQECNSVPRQSCKNLPKQVETQNCNQIPRENCVNVP----QQVCNPVTKQECSNVPKEVCNQVPRQECNQVERQECTQIPRETCSKIPQESCQQVPRQETREECNQVPRSDCSQVPRQACT------------QVPKQICSQVPKEQCFDIPRQSCSQVAKQECRDLPRQKCS 1061
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000004689 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s245:55693:57885:1 gene:EMLSAG00000004689 transcript:EMLSAT00000004689 description:"maker-LSalAtl2s245-snap-gene-0.5") HSP 1 Score: 308.916 bits (790), Expect = 5.777e-96 Identity = 214/422 (50.71%), Postives = 264/422 (62.56%), Query Frame = 0
Query: 579 CNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNE-----QQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCT-------------------------------------TVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQE----SRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQV 946
C+TVNEQ C+TV EQQC+T E+QC VNE +QC+TVNEQQC TVNEQ C+TVNEQQC TVNEQ C+T +T+ Q C+TV +Q+CST + C+ +V QQC +V Q C + + +Q+C V QQC +V Q C T Q C+T+ Q QC NVP+QQC++VP+QQC +V R+ CRSVPRQ C +VP+Q+C +VPRQQC NVPRQ+C VPR V Q C+N+P+Q C +VPRQ RQ CRNVP +QC NVPRQ VP+Q+CRNVPRQQC NVPRQ V ++ CNN+PRQ C NVPRQ CRNVP Q CNN+PRQ C +VPRQ C VPRQ C+NVP+Q C VPRQ CNNV + V
Sbjct: 33 CSTVNEQQCSTVNEQQCSTTTERQCSNVNEVVNENKQCSTVNEQQC----RTVNEQQCSTVNEQQC----STVNEQQCSTTYSTVNRQQCSTVNQQKCSTTYETVCSNGGYGRYNRSPIFFGKKNKGNSRDGRTYGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATSVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQVCSTIPRQ----QCSNVPKQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRSVPKQQCRSVPRQQCTNVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCXSVPRQXCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPRQVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQ----SCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPRQSCNNVCQDV 438 HSP 2 Score: 308.145 bits (788), Expect = 1.185e-95 Identity = 212/406 (52.22%), Postives = 264/406 (65.02%), Query Frame = 0
Query: 594 QCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNE-QVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECST----VQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEF---------KQECNTVNEQQCN--------TVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRR------------VEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQ------------VARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ 945
QC+TV EQQC TVNEQQC+T E+QC+ V E VNE + C+TVNEQQC TVNEQ C+ T+ EQ C+TV EQ+CST V QQC+TVN+Q+CS+ E VC + + K + N+ + + +V QQC V QQC V V QQC+NVPRQQC++VPRQ C R+ C ++PRQQC+NVP+Q+C +VP+QQC +VPRQ C+ VPR+ V Q C+N+PRQ C+NVPR SRQ+C NVP+QQC +VPRQ VPRQ CRNVP +QC NVPRQ V +Q+C N+PRQ+C NVPRQ CRNVP++ CNN+PRQ CNNVPRQ V RQ C +VPRQ CRNVPRQ C+ VP+Q CNNV RQ
Sbjct: 32 QCSTVNEQQCSTVNEQQCSTTTERQCSNVNEVVNENKQCSTVNEQQCR----TVNEQQCS----TVNEQQCSTVNEQQCSTTYSTVNRQQCSTVNQQKCSTTYETVCSNGGYGRYNRSPIFFGKKNKGNSRDGRTYGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATSVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQVCSTIPRQQCSNVPKQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRSVPKQQCRSVPRQQCTNVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCXSVPRQXCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPRQVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPRQ 429 HSP 3 Score: 288.5 bits (737), Expect = 2.808e-88 Identity = 214/438 (48.86%), Postives = 258/438 (58.90%), Query Frame = 0
Query: 491 CNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQE-QQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCN-----------------------------TVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNI 898
CN TVNEQQC+TV EQQC T T+ V V E +QC TVNE+ C TVNEQQC+TV EQQCSTVNEQQC T TVN + C+TVN+Q C+T E C+ C++V QQC V QQC V +V Q C V QQC +V C T QVC+T+ Q+CS V QQC +V +QQC SV Q C S R Q C +V +QQC +V QQC+ V QQC+ V V QQC NVP+QQC +VPRQ C +V R+ CR+VP +QC+NVPRQ C +VP+QQC NVPRQ+C VPR Q C N+P++VCNNVP RQ C NVPRQ C+NVP QV C NVPRQ C++VPR Q C N+PRQ C+NVP+Q C NVPRQ CNN+
Sbjct: 29 CNIQCSTVNEQQCSTVNEQQCSTTTERQCSNVNEVVNENKQC----STVNEQQCRTVNEQQCSTVNEQQCSTVNEQQCSTTYSTVNRQQCSTVNQQKCSTTYETVCSNGGYGRYNRSPIFFGKKNKGNSRDGRTYGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATSVPRQQCKNVPRQQCRSVPR--------QSCRTNPRQVCSTIPRQQCSNVPKQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPR----QSCRSVPKQQCRSVPRQQCTNVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCXSVPRQXCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPR----QSCRNVPQEVCNNVP----RQVCNNVPRQSCRNVPEQV----CNNVPRQSCRSVPR----QSCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPRQSCNNV 434 HSP 4 Score: 279.641 bits (714), Expect = 4.320e-85 Identity = 202/407 (49.63%), Postives = 245/407 (60.20%), Query Frame = 0
Query: 651 CNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNE-----QQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQC----STVQEQQCNTVNEQVC-------------------------------------------------EQQCRNVPRQQCQN----VPRQQCNNVAREECRSV----------------PRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRR------------VEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVAR----QECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ----VPRQEC 951
CN C+T+ EQ C+TV EQ+CST ++QC+ VNE +QCS+VNEQ C RT +Q+C+TVNEQQC+TV EQQC STV QQC+TVN+Q C QQC NVP QQC+N VPRQQC NV R++CRSV PRQQC+NVP+Q+C +VP+QQC +VPRQ C+ VPR+ V Q C+N+PRQ C+NVPR SRQ+C NVP+QQC +VPRQ VPRQ CRNVP +QC NVPRQ V +Q+C N+PRQ+C NVPRQ CRNVP++ CNN+PRQ CNNVPRQ R Q CN VPRQ CR+VPRQ C+ VPRQ C NV +Q VPRQ C
Sbjct: 29 CNIQCSTVNEQQCSTVNEQQCSTTTERQCSNVNEVVNENKQCSTVNEQQC----RTVNEQQCSTVNEQQCSTVNEQQCSTTYSTVNRQQCSTVNQQKCSTTYETVCSNGGYGRYNRSPIFFGKKNKGNSRDGRTYGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATSVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQVCSTIPRQQCSNVPKQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRSVPKQQCRSVPRQQCTNVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCXSVPRQXCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPRQVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPRQSC 431 HSP 5 Score: 241.891 bits (616), Expect = 4.095e-71 Identity = 192/423 (45.39%), Postives = 230/423 (54.37%), Query Frame = 0
Query: 426 QCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV-----CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDT-----------------------------------------VNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQV 802
QCSTV EQ+CSTV EQQCST E+QCS V E V CSTVNE QCR V QQC+TVNEQQC+TVNEQQC+T TVN QQC+TV +Q+C T +T V Q C V QQC+ V+ +V + C V QQC +V Q C T Q V T+ + C+ V +Q C +V +QQC +V Q C++V Q C +V +QQC +V Q C V QQC V TV+ Q C V +Q C +V Q C +V Q C V E+QCS+V Q C S KQ+C V QQC V Q C V ++ CN V QVC NVPRQ C+NVP Q CNNV R+ CRSVPRQ C NVPRQ C NVP+Q CNNVPRQ C V
Sbjct: 32 QCSTVNEQQCSTVNEQQCSTTTERQCSNVNEVVNENKQCSTVNEQQCRTVNEQQCSTVNEQQCSTVNEQQCSTTYSTVNRQQCSTVNQQKCSTTYETVCSNGGYGRYNRSPIFFGKKNKGNSRDGRTYGRGGRGGCRSVPRQQCVNVPSQQCRNVATSVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQ----VCSTIPRQQCSNVPKQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRSVPKQQCRSVP----RQQCTNVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNV----PKQQCXSVPRQXCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVP----KQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPRQVCN----NVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPRQSCNNV 434 HSP 6 Score: 127.487 bits (319), Expect = 1.901e-31 Identity = 117/299 (39.13%), Postives = 148/299 (49.50%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQC----STVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTV 710
+Q+C V QQC ++V Q+C V QQC +V Q C T VCST+ QC NVP+QQC +V +QQC +V Q C +V Q C +V +QQC++V Q C V QQC V TV+ + C V +QQC +V Q C +V Q C+ V EE C+ V Q C +V +QQC V QQC V Q C V ++ CN V QVCN V Q C V EQVCN V Q C +V Q C V Q C +V +QVC + R Q CN V
Sbjct: 172 RQQCVNVPSQQCRNVATSVPRQQCKNVPRQQCRSVPRQSCRTNPRQVCSTIPRQQCSNVPKQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVP----RQSCRSVPKQQCRSVP----RQQCTNVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCXSVPRQXCRSVPRQSCRNVP----EEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVP----RQVCNNVPRQSCRNVP----------------EQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPR----QSCNNV 434 HSP 7 Score: 127.487 bits (319), Expect = 2.204e-31 Identity = 102/239 (42.68%), Postives = 128/239 (53.56%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSE----TVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTV----TETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTV 646
+Q CRT Q CST+ Q+CS V +QQC +V +QQC +V C +V CR+VP+QQC +V QQC V QQC+ V TV+ QQC V +QQC +V Q C +V Q C+ V E V + C +V +QQC V QQC+ V Q C+ V +EVCN V QVCN V Q C V EQ C V Q C +V Q C V + V +QVCN V Q C V V
Sbjct: 208 RQSCRTNPRQVCSTIPRQQCSNVPKQQCRSVPKQQCRSVPRQSCRSVPRQSCRSVPKQQCRSVPRQQCTNVPRQQCSNVPRTVSRQQCTNVPKQQCXSVP----RQXCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVP----QEVCNNVPRQVCNNVPRQSCRNVPEQVCNNVPRQSCRSVPRQSCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPRQSCNNVCQDV 438 HSP 8 Score: 79.7221 bits (195), Expect = 1.072e-15 Identity = 68/167 (40.72%), Postives = 86/167 (51.50%), Query Frame = 0
Query: 415 AQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVT-DTVNEEVCN 580
++Q+C V +QQC +V Q C +V Q C V E+QCS V C +V + QCRNVPRQQC V Q C V ++ CN V V CN V Q C+ V EQVCN V Q C++V + C V Q C V +Q C+ V Q C V D +VCN
Sbjct: 291 SRQQCTNVPKQQCXSVPRQXCRSVPRQSCRNVPEEQCSNVPRQSCRSVPKQQCRNVPRQQCTNVPRQSCRNVPQEVCNNVPRQV----CNNVPRQSCRNVP----EQVCNNVPRQSCRSVP----RQSCRNVPRQSCKNVPQQVCNNVPRQSCNNVCQDVFWCKVCN 445
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Match: EMLSAG00000000220 (supercontig:LSalAtl2s:LSalAtl2s1031:173363:175323:-1 gene:EMLSAG00000000220 transcript:EMLSAT00000000220 description:"maker-LSalAtl2s1031-augustus-gene-1.35") HSP 1 Score: 280.411 bits (716), Expect = 1.349e-83 Identity = 188/491 (38.29%), Postives = 278/491 (56.62%), Query Frame = 0
Query: 486 VNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNE----QQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNE----QQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCE------------QQCRNVPRQQ-CQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIP----RQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
NE C + ++ CN V EQ+C NE CNTV E++C +T E+ C +E+QC T+ +QC VNE+QCQ V DTVNE VC T N Q C TV EQ C TV E QC TV + + C V +++C V++T+ E V T E QC++ E C TV +T E+V +QECSTVQ+++C V E ++C++ ++ C T +K V +++C V E +C + E++C V E +C VP C+ V R++C N R +C VPR +C+ VPR+ VPRQ C P+ CQ+V R++ +VC N P +Q+ +V R+ ++C+ VP++QCQN+P+QVPR + V +++C+ + +++ IP+Q C+NVPR+ C VPRQ C+ +P +C+ +P+QV R+EC VPRQEC+ VP Q CQ VPRQEC V R+V ++ C
Sbjct: 78 FNEPICEESCEKATKKLCNPVDEQECVPR----NETSCNTVYEEKCTDEFKTGTEQECRVFSEEQCKTLFTKQCDRVNEEQCQVVYDTVNENVCETQNTQKCETVNEQDCQTVYENQCSTVYDTETQENCQNVEDKECRMVSKTIEETVYETKYESQCKSAY----ENQCKTVYDTKIEKV----PDQECSTVQEKKCRKVWESTYDKKCATTYDRKCTQKLETSYK----IVQDKKCANVIENKCQXIHEKRCKIVPETICSNPGESNTGYNVLDTTYGVPSGPICKKVSRERCWNEPRTKCTKVPRTKCSFVPRKVAIKVPRQICKQEPKISCQKVARKIPREVCENHPVSKCKQILKDVSRKVPTKKCQKVPKKQCQNIPKQVPRIIPKQVSKKECRPITKRICNPTTRQIPKQSCKNVPRESCSTVPRQSCSQVPETKCSTLPKQVPRKECRNVPRQECKEVPSQSCQNVPRQECKEVPRKVSQKSC 552 HSP 2 Score: 203.756 bits (517), Expect = 4.526e-56 Identity = 164/489 (33.54%), Postives = 249/489 (50.92%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCS----TVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEV--------CNTVNEQQCNTVQ--------EQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETV---------------------NEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVN--------EQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQ------------QCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREEC----RSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQC 839
+QEC NE C+TV E+KC+ T EQ+C E+QC T+ C VNE QC+ V +TVNE C T N Q+C +TVNEQ C TV E QC TV DT ++ C V++++C+ VS+T+ E V C + E QC TV +Q+CSTV E++C+ V ++ ++ C T ++ C E VQ+++C V E +C ++E++C V ET+ + +C V+ ++C T +V T C+ + +V V Q C C V E S +Q+ + +R ++C V ++QC + +Q +C + ++ CN Q+ +Q C+NVPR+ C VPRQ C+ V +C + VPR++C NVPRQEC VP Q C NVPRQEC++VPR+V ++ C +P++VC +VP +++C V R QC
Sbjct: 100 EQECVPRNETSCNTVYEEKCTDEFKTGTEQECRVFSEEQCKTLFTKQCDRVNEEQCQVVY----DTVNENVCETQNTQKC----ETVNEQDCQTVYENQCSTVYDTETQENCQNVEDKECRMVSKTIEETVYETKYESQCKSAYENQCKTVYDTKIEKVPDQECSTVQEKKCRKVWESTYDKKCATTYDRKCTQKLETSYKIVQDKKCANVIENKCQXIHEKRCKIVPETICSNPGESNTGYNVLDTTYGVPSGPICKKVSRERCWNEPRTKCTKVPRTKCSFVPRKVAIKVPRQICKQEPKISCQKVARKIPREVCENHPVSKCKQILKDVSRKVPTKKCQKVPKKQCQNIPKQVPRIIPKQVSKKECRPITKRICNPTTRQIPKQSCKNVPRESCSTVPRQSCSQVPETKCSTLPKQVPRKECRNVPRQECKEVPSQSCQNVPRQECKEVPRKVSQKSCKQVPQEVCIDVP----QEDCHTVTRNQC 576 HSP 3 Score: 176.407 bits (446), Expect = 7.732e-47 Identity = 154/505 (30.50%), Postives = 243/505 (48.12%), Query Frame = 0
Query: 414 GAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVC--------NTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTET-----------------------------------------------------VNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCN----TVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQC------------TTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQN 841
G +QECR +E+QC T+ ++C V E+QC V + TV E+VC T N Q+C TVNEQ C TV E QC+TV DT ++ C V++++C+ V+ T+ E V T E QC++ E C TV + + V +Q+CSTV E++C+ V ++ ++ C T ++ C VQ+++C V E +CQ ++E++C V E C+ E+ V Q+C + C+ V + +VC + C I + V V ++C V +QC V++++C + +++C TTR KQ C V + C+TV Q CS V E +C+T+ +QV PR++C+NVPRQ EC+ VP Q C NVPRQEC VPR+ V ++ C+QVP ++VC ++P++ C+ V +R +C + +C+N
Sbjct: 126 GTEQECRVFSEEQCKTLFTKQCDRVNEEQCQVVYD----TVNENVCETQN--------TQKCETVNEQDCQTVYENQCSTVYDTETQENCQNVEDKECRMVSKTIEETVYETKYESQCKSAYENQ----CKTVYDTKIEKVPDQECSTVQEKKCRKVWESTYDKKCATTYDRKCTQKLETSYKIVQDKKCANVIENKCQXIHEKRCKIVPETICSNPGESNTGYNVLDTTYGVPSGPICKKVSRERCWNEPRTKCTKVPRTKCSFVPRKVAIKVPRQICKQEPKISCQKVARKIPREVCENHPVSKCKQILKDVSRKVPTKKCQKVPKKQCQNIPKQVPRIIPKQVSKKECRPITKRICNPTTRQIPKQSCKNVPRESCSTVPRQSCSQVPETKCSTLPKQV--------PRKECRNVPRQ--------ECKEVPSQSCQNVPRQECKEVPRK----VSQKSCKQVP----QEVCIDVPQEDCHTV----TRNQCTEMIFDKCEN 586 HSP 4 Score: 75.8702 bits (185), Expect = 2.503e-14 Identity = 79/309 (25.57%), Postives = 139/309 (44.98%), Query Frame = 0
Query: 420 RTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQES-----------------VCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNT----VQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD----TVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEF 703
+ V +++C+ V E KC + E++C V E CS ES +C V+ +C N PR +C V +C+ V + V V Q C + CQ V + +VC +C+ + + V+ +V ++C V ++QC + +Q + + V+++ C + +++CN + +Q C V + C TV Q C+ V E +C+T+ + V + C V Q+C+ V V Q C V + ++ C V ++ C V + C TV QC+ + CE+ + F
Sbjct: 292 KIVQDKKCANVIENKCQXIHEKRCKIVPETICSNPGESNTGYNVLDTTYGVPSGPICKKVSRERCWNEPRTKCTKVPRTKCSFVPRK----VAIKVPRQICKQEPKISCQKVARKIPREVCENHPVSKCKQILKDVSRKV----PTKKCQKVPKKQCQNIPKQVPRIIPKQVSKKECRPITKRICNPTTRQIPKQSCKNVPRESCSTVPRQSCSQVPETKCSTLPKQVPRKECRNVPRQECKEVPSQSCQNVPRQECKEVPRKVSQKSCKQVPQEVCIDVPQEDCHTVTRNQCTEMIFDKCENNCQDGF 592
BLAST of spt transcription factor family member vs. SwissProt
Match: gi|400784|sp|Q02752.1|PHPA_PLACH (RecName: Full=Acidic phosphoprotein; AltName: Full=50 kDa antigen; Flags: Precursor) HSP 1 Score: 61.6178 bits (148), Expect = 1.660e-8 Identity = 38/125 (30.40%), Postives = 59/125 (47.20%), Query Frame = 0
Query: 526 VQEQQCQTV----SETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTD----TVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQ 638
+QE+ ++ +ET+NE T+NE T+ E T+NE+ T + T NEE NE T+ E +T+ E T+NE T+NE++ +T E T NE T N+ +
Sbjct: 192 LQEEDALSLMEYDAETLNEGDAETLNEGDAETLNEYDAGTLNEEDAGTTNEAGEGTTNEEGEGAANEYDAETLNEYDADTLNEYDAGTLNEYDAGTLNEEEGSTTNEAGEGTSNEAGEGTANDDE 316
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325321541|ref|XP_023342582.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 573.163 bits (1476), Expect = 0.000e+0 Identity = 391/699 (55.94%), Postives = 470/699 (67.24%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSS-RAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQ----SNNAVA----PSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQC----NTVNEQQCNTV------------------------TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTD----TVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTD----TVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNT----VQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTV----NEQQCSSVNEQVCESTT-----------------------------RTEFKQECNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVQEQQCNTVNEQVC----EQQCRNVPRQQCQNVPRQ----QCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESR----QECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
VLL F + S P +S + + ++KKRSA+ + YG +AV+ S ++EC+TV+EQ+C+TVQEQ+C Q+CSTV EQQC+TVQ CSTVNE QC V QQCNTVNEQ C +TVNEQQCNTV DTVNEQQCNTVQEQQC TV V+E+VCNTVQEQQC+TV+ETVNE+ C+ VNEQQCNTVQ+++CSTVNEQQC TV + TVNE+ CNTVNEQ CN +QEQ+C T E+QC TV EQQCNTV EQ CNTV + TV EQ CNTV EQQC+T+TDT+NEQ C TV C TI EQVCN V EQ C+TVQDQQCTTV NEQQC++VNE+VCE+ R E +QEC +V QQCN V Q+CS V Q C V Q C QQC +VPRQ+C+N+PRQ +C+ V R+ECR+VPRQ CNNVPRQ C+ VPRQ+C +VPRQ+C+QVPRRVEEQVC NIPR+ C NVPRQE R QEC+NVPRQ+C++VPRQ VPRQ+C+ VPRQQCQNVPRQV R+EC N+PRQ+C VPRQECRNVP EC ++PRQQC NVP++V RQEC VPR++CR+VP Q+C TVPRQ+C N+ RQV RQEC
Sbjct: 9 VLLTILCFSLSASFPNNSYEKLLKGIIKKRSAQ-EGGYGNVASLEGSAVSVDLLDDSCTTVYEEECKTVDEQKCNTVQEQQCRATTRQECSTVNEQQCNTVQTQSCSTVNEKQCSTVNEQQCNTVNEQLCKTVTDTVNEQQCNTVQEQQCRPTTRQECTTVNERKCRTRYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQECSVVSEEVCNTVQEQQCRTVTETVNEQQCSIVNEQQCNTVQDEECSTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCNTVNEQQCNIIQEQKCETQYMTKYEEQCSTVQEQQCNTVQEQVCNTVNDEVCNTVQEQECNTVQEQQCQTITDTINEQQCTTVQDQQCLTINEQVCNIVNEQVCNTVQDQQCTTVTDTVNEQQCTTVNEEVCETVYDEVCDGSADSSYGEVAPEEGYGAPSAPACRQEARQECTSVPRQQCNNVPRQVTRQECSNVPRQVCTDVPRQACTSVPRQQCTSVPRQECRNIPRQVQRQECSYVPRQECRNVPRQVCNNVPRQACSTVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCRNIPRETCYNVPRQECRNVPRQECKNVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQQCQNVPRQVSREECFNVPRQQCNFVPRQECRNVPSTECISVPRQQCRNVPKRVPRQECRNVPRRQCRSVPDQECITVPRQQCQNIPRQVQRQEC 706 HSP 2 Score: 390.963 bits (1003), Expect = 7.237e-119 Identity = 297/601 (49.42%), Postives = 359/601 (59.73%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV----CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTD----TVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSE----TVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQC----STVNEQQCQTVTD----TVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQC----NTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQV---------------------CNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQ------------------------QCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQ------------------------------------QCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVP 907
+Q+C TV EQQC+TV +Q+CS V E+ C+TVQEQQC TV E+V CS VNE QC V ++C+TVNEQQCNTV EQQC+TV + TVNEQQCN +QEQ+C+T T E+ C+TVQEQQC TV E TVN+EVCNTV EQ+CNTVQEQQC T+NEQQC TV D T+NE+VCN VNEQVCNTVQ+QQC +TV EQQC TVNE+ C TV ++ C+ ++ +V C +V QQC V V Q C+ V QVC V Q C++V QQCT+V Q+C ++ QV +QEC V Q CN V Q CSTV Q+C +V Q CEQ +CRNVPRQ+C+NVPRQ+C +V R+ECRSVPRQQC VPRQ+C NVPRQ QC N VP+RV Q C N+PR+ C +VP QEC VPRQQCQN+PRQV RQECRNVPRQQCQ +PR+ V RQ+C NIP QEC NVPRQ+C +VP QEC N+PRQ+C NVP
Sbjct: 182 EQQCNTVQEQQCNTVNKQECSVVSEEVCNTVQEQQCRTVTETVNEQQCSIVNEQQCNTVQDEECSTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCNTVNEQQCNIIQEQKCETQYMTKYEEQCSTVQEQQCNTVQEQVCNTVNDEVCNTVQEQECNTVQEQQCQTITDTINEQQCTTVQDQQCLTINEQVCNIVNEQVCNTVQDQQCTTVTDTVNEQQCTTVNEEVCETVYDEVCDGSADSSYGEVAPEEGYGAPSAPACRQEARQECTSVPRQQCNNVPRQVTRQECSNV----PRQVCTDVPRQACTSVPRQQCTSVPRQECRNIPRQVQRQECSYVPRQECRNVPRQVCNNVPRQACSTVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCRNIPRETCYNVPRQECRNVPRQECKNVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQQCQNVPRQVSREECFNVPRQQCNFVPRQECRNVPSTECISVPRQQCRN--------VPKRVPRQECRNVPRRQCRSVP----DQECITVPRQQCQNIPRQVQRQECRNVPRQQCQIIPREQCQNVPRQQCINIPSQECFNVPRQQCSSVPDQECFNVPRQECKNVP 766 HSP 3 Score: 116.701 bits (291), Expect = 7.010e-23 Identity = 131/364 (35.99%), Postives = 173/364 (47.53%), Query Frame = 0
Query: 392 SAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGG---------AQQECRTVNEQQCSTV----QEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQ----QCNTVNEQQCNTVNEQQCNTV----TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTV------------SETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNE----QQCNTV----TETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTV 710
A +YG+ VAP GYG A+QEC +V QQC+ V Q+CS V Q C+ V Q C++V C++V +CRN+PRQ +C+ V Q+C V Q CN V TV Q+C +V QQC+ V V EQVC + + C V + V + C +V Q+C +V QQC TV QQCQ V V+ E C V Q CN V Q+C V +C +V QQC V + Q+C V +V +Q C TV QQC+ + V Q C V C I + C V Q+C + Q+C V QQCSSV +Q C + R QEC V
Sbjct: 410 DGSADSSYGE----VAPEEGYGAPSAPACRQEARQECTSVPRQQCNNVPRQVTRQECSNVPRQVCTDVPRQACTSVPRQQCTSVPRQECRNIPRQVQRQECSYVPRQECRNVPRQVCNNVPRQACSTVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCRNIPRETCYNVPRQECRNVPRQECKNVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQQCQNVPRQVSREECFNVPRQQCNFVPRQECRNVPSTECISVPRQQCRNVPKRVPRQECRNVPRRQCRSVPDQECITVPRQQCQNIPRQVQRQECRNVPRQQCQIIPREQCQNVPRQQCINIPSQECFNVPRQQCSSVPDQECFNVPR----QECKNV 765 HSP 4 Score: 77.0258 bits (188), Expect = 1.508e-10 Identity = 82/215 (38.14%), Postives = 108/215 (50.23%), Query Frame = 0
Query: 412 YGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTV----NEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCN--------TVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTV 614
Y +QECR V Q+C V Q+C +V Q+C +V QQC TV C V + +C NVPRQQCN V Q+C +V QQC V V Q+C V +QC++V D Q C TV QQCQ + V + C V QQC + +QC V QQC + + C V Q C++V +Q+C V Q+C+ V QQC V
Sbjct: 567 YNVPRQECRNVPRQECKNVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQQCQNVPRQVSREECFNVPRQQCNFVPRQECRNVPSTECISVPRQQCRNVPKRVPRQECRNVPRRQCRSVPD----QECITVPRQQCQNIPRQVQRQECRNVPRQQCQIIPREQCQNVPRQQCINIPS----QECFNVPRQQCSSVPDQECFNVPRQECKNVPRQQCQQV 773
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325321537|ref|XP_023342580.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 567 bits (1460), Expect = 0.000e+0 Identity = 387/702 (55.13%), Postives = 465/702 (66.24%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGA------------QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQC----NTVNEQQCNTV------------------------TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTD----TVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTD----TVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNT----VQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTV----NEQQCSSVNEQVCESTT-----------------------------RTEFKQECNTVNEQQCNTV----QEQQCSTVQEQQCNTVNEQVC----EQQCRNVPRQQCQNVPRQ----QCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESR----QECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
VLL F + S P +S +++KKRSA+ + YG +VA G + ++EC+TV+EQ+C+TVQEQ+C Q+CSTV EQQC+TVQ CSTVNE QC V QQCNTVNEQ C +TVNEQQCNTV DTVNEQQCNTVQEQQC TV VNE++CNTVQEQQC+TV+ETVNE+ C+ VNEQQC TVQ+++CSTVNEQQC TV + TVNE+ CNTVNEQ CN +QEQ+C T E+QC TV EQQCNTV EQ CNTV + TV EQ CNTV EQQC+T+TDT+NEQ C TV C TI EQVCN V EQ C+TVQDQQCTTV NEQQC++VNE+VCE+ R E +QEC +V QQCN V Q+CS V Q C V Q C QQC +VPRQ+C+N+PRQ +C+ V R+ C +VPRQ CNNVPRQ C+ VPRQ+C +VPRQ+C+QVPRRVEEQVC NIPR+ C NVPRQE R QEC++VPRQ+C++VPRQ VPRQ+C+ VPRQQCQNVPRQV R+EC N+PRQ+C VPRQECRNVP EC ++PRQQC NVP++V RQEC VPRQ+CR+VP Q+C VPRQ+C N+ RQV RQEC
Sbjct: 9 VLLTIFCFSLSASFPNNSYEKLLKIIKKRSAQ-EGGYG----SVASLEGSAVSVDLLDDSCTTVYEEECKTVDEQKCNTVQEQQCRATTRQECSTVNEQQCNTVQTQSCSTVNEQQCSTVNEQQCNTVNEQLCKTVTDTVNEQQCNTVQEQQCRPTTRQECTTVNERKCRTRYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQECSVVNEEICNTVQEQQCRTVTETVNEQQCSIVNEQQCTTVQDEECSTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCNTVNEQQCNIIQEQKCETQYMTKYEEQCSTVQEQQCNTVQEQVCNTVNDEVCNTVQEQECNTVQEQQCQTITDTINEQQCTTVQDQQCLTINEQVCNIVNEQVCNTVQDQQCTTVTDTVNEQQCTTVNEEVCETVYDEVCDGSADSSYGEVAPEEGYGAPSAPACRQEARQECTSVPRQQCNNVPRQVTRQECSNVPRQVCADVPRQACTSVPRQQCTSVPRQECRNIPRQVQRQECSYVPRQVCSNVPRQVCNNVPRQACSTVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCRNIPRETCFNVPRQECRNVPRQECKSVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQQCQNVPRQVSREECFNVPRQQCNFVPRQECRNVPSTECISVPRQQCRNVPKRVPRQECRNVPRQQCRSVPDQECTNVPRQKCQNIPRQVQRQEC 705 HSP 2 Score: 206.838 bits (525), Expect = 5.919e-52 Identity = 186/465 (40.00%), Postives = 238/465 (51.18%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV----CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNE-----------------------------QVCNTVQEQQCQTVSETVNEE--------VCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQV--------------------CESTTRTEF----------------KQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQ--------NVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCN--------NVPRQECNNVP 787
+Q+C TV EQ C+TV ++ C+TVQEQ+C+TVQEQQC T+ +++ C+TV + QC + Q CN VNEQ CNTV +QQC TVTDTVNEQQC TV E+ C+TV D V + Q C +V QQC V V + VC V Q C +V QQC++V Q+C+ + V + C+ V QVC+ V Q CN V Q C TV Q+C +V QQC V V EQVC + + C V V C ++ Q C +V QEC +V QQC TV QQC +V QV C + TE +QEC V QQC +V +Q+C+ V Q+C + QV Q+CRNVPRQQCQ NVPRQQC N+ +EC +VPRQQC+ NVPRQEC NVP
Sbjct: 301 EQQCNTVQEQVCNTVNDEVCNTVQEQECNTVQEQQCQTITDTINEQQCTTVQDQQCLTINEQVCNIVNEQVCNTVQDQQCTTVTDTVNEQQCTTVNEEVCETVYDEVCDGSADSSYGEVAPEEGYGAPSAPACRQEARQECTSVPRQQCNNVPRQVTRQECSNVPRQVCADVPRQACTSVPRQQCTSVPRQECRNIPRQVQRQECSYVPRQVCSNVPRQVCNNVPRQACSTVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCRNIPRETCFNVPRQECRNVPRQECKSVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQQCQNVPRQVSREECFNVPRQQCNFVPRQECRNVPSTECISVPRQQCRNVPKRVPRQECRNVPRQQCRSVPDQECTNVPRQKCQNIPRQVQRQECRNVPRQQCQIIPREQCQNVPRQQCINIPSQECFNVPRQQCSSVPDQECFNVPRQECKNVP 765 HSP 3 Score: 112.849 bits (281), Expect = 9.152e-22 Identity = 129/364 (35.44%), Postives = 173/364 (47.53%), Query Frame = 0
Query: 392 SAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGG---------AQQECRTVNEQQCSTV----QEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQ----QCNTVNEQQCNTVNEQQCNTV----TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTV------------SETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNE----QQCNTV----TETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTV 710
A +YG+ VAP GYG A+QEC +V QQC+ V Q+CS V Q C+ V Q C++V C++V +CRN+PRQ +C+ V Q C+ V Q CN V TV Q+C +V QQC+ V V EQVC + + C V ++V + C +V Q+C +V QQC TV QQCQ V V+ E C V Q CN V Q+C V +C +V QQC V + Q+C V +V +Q C V Q+C+ + V Q C V C I + C V Q+C + Q+C V QQCSSV +Q C + R QEC V
Sbjct: 409 DGSADSSYGE----VAPEEGYGAPSAPACRQEARQECTSVPRQQCNNVPRQVTRQECSNVPRQVCADVPRQACTSVPRQQCTSVPRQECRNIPRQVQRQECSYVPRQVCSNVPRQVCNNVPRQACSTVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCRNIPRETCFNVPRQECRNVPRQECKSVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQQCQNVPRQVSREECFNVPRQQCNFVPRQECRNVPSTECISVPRQQCRNVPKRVPRQECRNVPRQQCRSVPDQECTNVPRQKCQNIPRQVQRQECRNVPRQQCQIIPREQCQNVPRQQCINIPSQECFNVPRQQCSSVPDQECFNVPR----QECKNV 764
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325260807|ref|XP_023330051.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 561.992 bits (1447), Expect = 0.000e+0 Identity = 393/727 (54.06%), Postives = 472/727 (64.92%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSSRA-VFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQE-CRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQ--------QCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQC----------------------------------------------------QNVPRQQCNNVAREECR------------SVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCS--------NIPRQVCNNVPRQES----------------------------------------RQECRNVPRQQCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQ--------CQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
+LA L ++S P +S +F+R+++KRSA+ YGQ+ A + SS YGGAQQ+ C TV EQ+C+TV EQ+C+TVQEQQC Q+CSTV E C+TV + +C V QQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQC+ T Q CNTV EQ+C+T +TVNE+ CNTV EQQCNTV +Q+C+TVNEQ QC+TVTDTVNE+ CNTVNEQ CNTVQE++C+TV EQQC TV EQQC+TVNE+QCNTV NEQ CNT+ EQ+CET T E+ C+TV CNT+QEQVCNTV E+ C+TVQ+Q+C TV EQQC +V + V E T +Q+C+TVNEQ CNTV EQ C+TVQEQQC TV + V EQQC V Q C + VPRQ+C NV R++CR +VPRQ+C NVPRQ CNNVPRQQC NVPRQ+C VPR+V+ Q CS N+PRQVCNNVPRQ RQECR+VPRQQCQNVPRQ VPRQECR+VPRQQ CQNVPRQV R+EC+N+PRQ+C NVPRQECRNVP++EC ++PRQQC NV RQVA++EC +PRQ+CR+VP Q+C TVPRQ+C NV RQV RQEC
Sbjct: 9 AVLAVSLISCSLSAPNASYGNLFKRIIQKRSAQLP-GYGQA--AASASSSYGGAQQDSCTTVYEQECNTVNEQQCNTVQEQQCRATTRQECSTVNEQQCNTVQKQECSTVNEQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCRPTT----RQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQECNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCNTVNEQQCNTVQEEECSTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEEQCNTV----NEQQCNTIQEQKCETQYMTKYEEQCSTVQEQQCNTVQEQVCNTVNEEVCNTVQEQECNTVQEQQCRTVTDTVNEEKCTTVQEQQCSTVNEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVQDTVNEQQCDTVNEQVCNTVYDEVCDSAQPTYGGSGGSGGSGGFGGFGGDARGAGSASSGYGAAAAPACRQVPRQECTNVPRQQCRNVPRQVPRQECSNVPRQECKNVPRQACNNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSNVPRQECRNVPRQVCNNVPRQACSNVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCNNIPREVCNNVPRQECRSVPRQQCQNVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQECQNVPRQVNREECSNVPRQQCNNVPRQECRNVPKEECRSVPRQQCQNVSRQVAKEECRNIPRQQCRSVPDQECSTVPRQQCQNVPRQVARQEC 724 HSP 2 Score: 312.768 bits (800), Expect = 2.128e-89 Identity = 253/540 (46.85%), Postives = 309/540 (57.22%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCST----VQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTD----TVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQE----------------------------------------------------QQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTV----NEQQCNTV----TETVNEQVCNTVNEQQCETV----TDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNV------------PRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQES----RQECRNVPRQQCQNVPRQ------------VPRQECRNVP 855
+++C TVNEQQC+T+QEQKC T E+QCSTVQEQQC+TVQE VC+TVNE + CNTV EQ+CNTV EQQC TVTDTVNE++C TVQEQQC TV + TVNEQVCNTVQEQQC+TV +TVNE+ C+TVNEQ CNTV + Q+C+ V QQC+ V V + C+ V Q C V Q CN V QQC V QQCN V Q+C+ V V QVCN V Q C V +V Q C V ++EQVCN + + C+ V Q+C +V QQC +V +QEC +V Q+C +V QQC TV Q+C V QV ++C NVPRQQC NVPRQ+C NV +EECRSVPRQQC NV PRQ+C +VP Q+C+ VPRQ+CQ VPR+V Q C N+PRQ C NVPR++ RQ+CRNVP Q+C+NVPRQ VPRQEC+NVP
Sbjct: 265 EEQCNTVNEQQCNTIQEQKCETQYMTKYEEQCSTVQEQQCNTVQEQVCNTVNE--------EVCNTVQEQECNTVQEQQCRTVTDTVNEEKCTTVQEQQCSTVNEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVQDTVNEQQCDTVNEQVCNTVYDEVCDSAQPTYGGSGGSGGSGGFGGFGGDARGAGSASSGYGAAAAPACRQVPRQECTNVPRQQCRNVPRQVPRQECSNVPRQECKNVPRQACNNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSNVPRQECRNVPRQVCNNVPRQACSNVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCNNIPREVCNNVPRQECRSVPRQQCQNV------------PRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQECQNVPRQVNREECSNVPRQQCNNVPRQECRNVPKEECRSVPRQQCQNVSRQVAKEECRNIPRQQCRSVPDQECSTVPRQQCQNVPRQVARQECKNVPRQQCQNVPREQCQSVPRQQCRNVPSQECKNVPRQQCRSVPDQECSSVPRQECKNVP 784 HSP 3 Score: 260.381 bits (664), Expect = 1.596e-70 Identity = 223/512 (43.55%), Postives = 280/512 (54.69%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV----CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNE------------------------------------------------QVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQC--------NTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVP 863
+Q+C TV EQ C+TV E+ C+TVQEQ+C+TVQEQQC TV ++V C+TV E QC V Q CNTVNEQ CNTV EQQC TV DTVNEQQC+TV EQ C TV D V + Q C V QQC+ V V + C+ V Q+C N V QQC+ V QQC V V + C+ V Q C V Q CN V Q C V Q+C +V QQC V V EQVCN + + VCN V C ++ Q C V QEC +V Q+C +V QQC +V Q C++ R ++EC+ V QQCN V Q+C V +++C +V Q C+ R V +++C+N+PRQQC +V +EC +VPRQQC NVPRQ V RQ+C NVPRQ+CQ VPR + C ++PRQ C NVP QEC+NVPRQQC R VP QEC +VPRQ+C+NVP
Sbjct: 301 EQQCNTVQEQVCNTVNEEVCNTVQEQECNTVQEQQCRTVTDTVNEEKCTTVQEQQCSTVNEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVQDTVNEQQCDTVNEQVCNTVYDEVCDSAQPTYGGSGGSGGSGGFGGFGGDARGAGSASSGYGAAAAPACRQVPRQECTNVPRQQCRNVPRQVPRQECSNVPRQECKNVPRQACNNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSNVPRQECRNVPRQVCNNVPRQACSNVPRQECRSVPRQQCEQVPRRVEEQVCNNIPRE------------VCNNVPRQECRSVPRQQCQNVPRQECRSVPRQECRSVPRQQCQTVPRQECQNVPRQVNREECSNVPRQQCNNVPRQECRNVPKEECRSVPRQQCQNVSRQVAKEECRNIPRQQCRSVPDQECSTVPRQQCQNVPRQ----VARQECKNVPRQQCQNVPR----EQCQSVPRQQCRNVP----SQECKNVPRQQC----RSVPDQECSSVPRQECKNVP 784
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325260934|ref|XP_023330248.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like isoform X1 [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 528.865 bits (1361), Expect = 5.866e-173 Identity = 361/686 (52.62%), Postives = 451/686 (65.74%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQ--------QCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQC----TTVNEQQCSSVNEQVCESTT-----------------------------------------RTEFKQECNTVNEQQC----NTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCE----QQCRNVPRQQCQNVPRQ----QCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVP--------RQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESR----QECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQ----ECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQ----VARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVAR----QVPRQEC 951
V+ F ++ S P V L+K + G + ++ +Q C TVNEQQCSTVQEQ+C Q+C+T+ EQQC+TVQ CSTVNE QQC+TVNEQ+CNTVNEQQC TVTDTVN+QQCNTVQEQQC+ T Q CNTV EQ+C+T +TVNE+ CNTV EQQCNTV +Q+C+TVNEQ QC+TVTDTVNE+ C+TVNEQ CNTVQEQQC+ + EQ+C TV EQ+C+T+NEQQCNTV E T+NEQ CNTV E++C+T+TDTVNEQ C TV C+TI EQVCNTV EQ C+TVQ+QQC TVNEQQCS+VNEQVC++ R +QEC +V +QQC +V Q+C+ V +QQC +V +Q C+ QQC NVPRQQC NVPRQ +C+ V R+ECR+VPRQQC NVPRQEC +VPRQQC NVP RQ+CQ VPR++ CS+ P+Q C NVPRQ+ R +ECR+VPRQQC+NVPRQV R++CRNVPRQQC++VP Q EC+ +PR++CQNVPRQ EC+NVPRQ+C +PR+QC +VPRQ + Q+C VPR++C +VP QQC TVPR+ C NV R QVP ++C
Sbjct: 9 VVFVLFCFSESESSPTVDLLVKGALVKGALIKGALIKGALQGGQSRNNCITVYKQRCSTVNEQQCSTVQEQQCRPTTRQECNTINEQQCNTVQNQQCSTVNE--------QQCSTVNEQKCNTVNEQQCKTVTDTVNQQQCNTVQEQQCRPTT----RQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQKCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSTVNEQQCNTVQEQQCSIINEQECNTVQEQKCSTINEQQCNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERKCQTITDTVNEQKCTTVSEQRCSTINEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQQCSTVNEQVCKTIYDEVCDSAQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVPRQQCRNVPRQVAREQCRNVPRQQCRSVPDQ----ECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVPREQCQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVPDQQCSTVPRKSCRNVPRQQCQQVPSRQC 678 HSP 2 Score: 113.62 bits (283), Expect = 4.187e-22 Identity = 121/347 (34.87%), Postives = 178/347 (51.30%), Query Frame = 0
Query: 395 AQRNYGQSNNAVAPSSG---------YGGAQQ-ECRTVNEQQCSTVQEQKCS----TVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTV----TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQ 719
AQ +YG + V + G YG A CR V Q+C++V +Q+C+ +V Q+C+ V +QQC +V + C V QC NVPRQQCN V Q+C+ V Q+C V V Q+C +V QQC+ V +Q C +V QQCQ V ++ C++ +QQC V QQC V +++C++V + C V Q V +QC V QQC++V +Q+C+TV ++C V V Q C V QQC+TV EQ C ++ Q C ++ Q+C V +QC +V +QQCS+V + C + R Q+C V +QC+ Q
Sbjct: 360 AQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVP----KQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVP----RQQCRNVPRQ----VAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVP---REQ-----CQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVPDQQCSTVPRKSCRNVPR----QQCQQVPSRQCSAAQ 682
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325260939|ref|XP_023330255.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like isoform X2 [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 526.168 bits (1354), Expect = 4.440e-172 Identity = 357/675 (52.89%), Postives = 441/675 (65.33%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQ--------QCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQC--------NTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQD----QQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQE-------------------------CNTVNEQQCNTVQEQQCS----TVQEQQCNTVNEQVC----EQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVARE------------ECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVP--------RQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESR----QECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQC----------------QNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQ----VARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECN 940
V+ F ++ S P V L+K + G + ++ +Q C TVNEQQCSTVQEQ+C Q+C+T+ EQQC+TVQ CSTVNE QQC+TVNEQ+CNTVNEQQC TVTDTVN+QQCNTVQEQQC+ T Q CNTV EQ+C+T +TVNE+ CNTV EQQCNTV +Q+C+TVNEQ QC+TVTDTVNE+ C+TVNEQ CNTVQEQQC NTVQEQ+C T+NEQQCNTV E++C T+T+TVNEQ C TV+EQ+C T+NEQVCNTV EQVCNTVQEQ+C TV D QQC+TVNEQ C ++ ++VC+S + + C V Q+C +V +QQC+ +V Q+CN V +Q C +Q C+NVPRQQC NVPRQQCNNV R+ ECR+VPRQQC NVPRQEC +VPRQQC NVP RQ+CQ VPR++ CS+ P+Q C NVPRQ+ R +ECR+VPRQQC+NVPRQV R++CRNVPRQQC QNVPRQVQRQEC N+PRQ+CQ VPR++C++VPRQ+C +IP QQC NVPR+ V Q+C+TVPR+ CRNVPRQQCQ VP ++C+
Sbjct: 9 VVFVLFCFSESESSPTVDLLVKGALVKGALIKGALIKGALQGGQSRNNCITVYKQRCSTVNEQQCSTVQEQQCRPTTRQECNTINEQQCNTVQNQQCSTVNE--------QQCSTVNEQKCNTVNEQQCKTVTDTVNQQQCNTVQEQQCRPTT----RQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQKCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSTVNEQQCNTVQEQQCSIINEQQCNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERKCQTITDTVNEQKCTTVSEQRC----STINEQVCNTV----NEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQQCSTVNEQVCKTIYDEVCDSAQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVPRQQCRNVPRQVAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVPREQCQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVPDQQCSTVPRKSCRNVPRQQCQQVPSRQCS 663 HSP 2 Score: 478.789 bits (1231), Expect = 9.455e-154 Identity = 319/562 (56.76%), Postives = 386/562 (68.68%), Query Frame = 0
Query: 467 CRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVT----DTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD----TVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQD----QQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQC----STVQEQQCNTVNEQVCE-------------------------------------------------QQCRNVPRQQC----QNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVP----RQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
C V +Q+C+TVNEQQC+TV EQQC T +T+NEQQCNTVQ QQC TVNEQ C+TV EQ+C TV+E + V +TVN+QQCNTVQEQQC Q+C TV + E +TVNEQ CNTVQEQQCNTV +Q+C TVNEQ CNTV EQQC TVT+TVNEQ C+TVNEQQC TV + +NEQ CNTV C+TI EQ CNTVQE++C T+ D Q+CTTV+EQ+CS++NEQVC NTVNEQ CNTVQEQQC TV EQQC+TVNEQVC+ Q+C +VP+QQC ++VPRQ+CNNV +++CRSVP+Q C NVPRQ+C NVPRQQCNNVP RQEC VPR Q C N+PRQ C NVP RQECR+VPRQQC+N VP+Q+CR+VPRQQCQNVPRQ+ R EC++ P+Q+C+NVPRQ+CRNVP++EC ++PRQQC NVPRQVAR++C VPRQ+CR+VP Q+C TVPR++C NV RQV RQEC
Sbjct: 57 CITVYKQRCSTVNEQQCSTVQEQQCRPTTRQECNTINEQQCNTVQNQQC----STVNEQQCSTVNEQKCNTVNEQQCKTVTDTVNQQQCNTVQEQQCRPTTRQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQKCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSTVNEQQCNTVQEQQCSIINEQQCNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERKCQTITDTVNEQKCTTVSEQRCSTINEQVC------------NTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQQCSTVNEQVCKTIYDEVCDSAQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPR----QECRNVPRQQCQNVP----RQECRSVPRQQCRN----VPKQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVPRQQCRNVPRQVAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQEC 590 HSP 3 Score: 305.834 bits (782), Expect = 3.895e-88 Identity = 263/642 (40.97%), Postives = 329/642 (51.25%), Query Frame = 0
Query: 359 LNKPVLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVC----STVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVT----DTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNT----------------VQEQQCSTVNEQQC--------QTVTDTV------------------------NEEVCNTVNEQVC----NTVQEQQCNTVQEQ---------------------------------------------QCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD------------TVNEQVCNTV----------------CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTR--------TEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVP--------------------RQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQC 839
L K L+ L A+ G S + K+R + Q + V +QEC T+NEQQC+TVQ Q+CSTV EQQCSTV EQ+C+TV E C TVN+ QC V QQC Q+CNTVNEQ+C T DTVNEQQCNTVQEQQC TV +TVNEQVCNTVQEQQC+TV++TVNE+ C+TVNEQQCNT VQEQ+CST+NEQQC QT+TDTV NE+VCNTV EQ C +TV EQQC+TV EQ C+ V Q+C +V +QQC V +V Q CN V +QQC +V V Q CN V C + Q C V QEC +V QQC V +QQC SV Q C++ R + KQ+C V QQC V +++C +V QQC V QV +QCRNVPRQQC++VP RQ+C NV R++C++VPR+QC +VPRQ+C ++P QQC NVPR++C VP +Q CS +PR+ C NVP RQ+C+ VP +QC
Sbjct: 33 LVKGALIKGALIKGALQGGQSRNNCI-TVYKQRCSTV---NEQQCSTVQEQQCRPTTRQECNTINEQQCNTVQNQQCSTVNEQQCSTVNEQKCNTVNEQQCKTVTDTVNQQQCNTVQEQQCRPTTRQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQKCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSTVNEQQCNTVQEQQCSIINEQQCNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERKCQTITDTVNEQKCTTVSEQRCSTINEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQQCSTVNEQVCKTIYDEVCDSAQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVPRQQCRNVPRQVAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVPREQCQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVP----DQQCSTVPRKSCRNVP----RQQCQQVPSRQC 662 HSP 4 Score: 115.161 bits (287), Expect = 1.410e-22 Identity = 121/347 (34.87%), Postives = 178/347 (51.30%), Query Frame = 0
Query: 395 AQRNYGQSNNAVAPSSG---------YGGAQQ-ECRTVNEQQCSTVQEQKCS----TVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTV----TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQ 719
AQ +YG + V + G YG A CR V Q+C++V +Q+C+ +V Q+C+ V +QQC +V + C V QC NVPRQQCN V Q+C+ V Q+C V V Q+C +V QQC+ V +Q C +V QQCQ V ++ C++ +QQC V QQC V +++C++V + C V Q V +QC V QQC++V +Q+C+TV ++C V V Q C V QQC+TV EQ C ++ Q C ++ Q+C V +QC +V +QQCS+V + C + R Q+C V +QC+ Q
Sbjct: 344 AQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVP----KQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVP----RQQCRNVPRQ----VAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVP---REQ-----CQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVPDQQCSTVPRKSCRNVPR----QQCQQVPSRQCSAAQ 666
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325260944|ref|XP_023330263.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like isoform X3 [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 525.783 bits (1353), Expect = 5.563e-172 Identity = 357/675 (52.89%), Postives = 441/675 (65.33%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQ--------QCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQC--------NTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQD----QQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQE-------------------------CNTVNEQQCNTVQEQQCS----TVQEQQCNTVNEQVC----EQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVARE------------ECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVP--------RQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESR----QECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQC----------------QNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQ----VARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECN 940
V+ F ++ S P V L+K + G + ++ +Q C TVNEQQCSTVQEQ+C Q+C+T+ EQQC+TVQ CSTVNE QQC+TVNEQ+CNTVNEQQC TVTDTVN+QQCNTVQEQQC+ T Q CNTV EQ+C+T +TVNE+ CNTV EQQCNTV +Q+C+TVNEQ QC+TVTDTVNE+ C+TVNEQ CNTVQEQQC NTVQEQ+C T+NEQQCNTV E++C T+T+TVNEQ C TV+EQ+C T+NEQVCNTV EQVCNTVQEQ+C TV D QQC+TVNEQ C ++ ++VC+S + + C V Q+C +V +QQC+ +V Q+CN V +Q C +Q C+NVPRQQC NVPRQQCNNV R+ ECR+VPRQQC NVPRQEC +VPRQQC NVP RQ+CQ VPR++ CS+ P+Q C NVPRQ+ R +ECR+VPRQQC+NVPRQV R++CRNVPRQQC QNVPRQVQRQEC N+PRQ+CQ VPR++C++VPRQ+C +IP QQC NVPR+ V Q+C+TVPR+ CRNVPRQQCQ VP ++C+
Sbjct: 9 VVFVLFCFSESESSPTVDLLVKGALVKGALIKGALIKGALQGGQSRNNCITVYKQRCSTVNEQQCSTVQEQQCRPTTRQECNTINEQQCNTVQNQQCSTVNE--------QQCSTVNEQKCNTVNEQQCKTVTDTVNQQQCNTVQEQQCRPTT----RQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQKCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSTVNEQQCNTVQEQQCSIINEQECNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERKCQTITDTVNEQKCTTVSEQRC----STINEQVCNTV----NEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQQCSTVNEQVCKTIYDEVCDSAQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVPRQQCRNVPRQVAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVPREQCQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVPDQQCSTVPRKSCRNVPRQQCQQVPSRQCS 663 HSP 2 Score: 471.47 bits (1212), Expect = 4.901e-151 Identity = 314/562 (55.87%), Postives = 385/562 (68.51%), Query Frame = 0
Query: 483 CNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVT----DTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQT----VNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTV----CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQEC----------------NTVNEQQCNTVQEQQC----STVQEQQCNTVNEQVCE-------------------------------------------------QQCRNVPRQQC----QNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVP----RQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQVPRQEC 951
C TV +Q+C+TV NEQQC+TVQEQQC+ T +T+NEQ CNTVQ QQC +TVNEQQC+TV EQ+C+TVNEQQC+TVTDTVN++ CNTV EQ C Q+CNTV EQ+C+T VNEQQCNTV EQQCNTV + TVNEQVCNTV EQQC TVTDTVNEQ C+TV CNT+QEQ C+ + EQEC+TVQ+Q+C+T+NEQQC++V E+ C++ T T +Q+C NTVNEQ CNTVQEQQC TV EQQC+TVNEQVC+ Q+C +VP+QQC ++VPRQ+CNNV +++CRSVP+Q C NVPRQ+C NVPRQQCNNVP RQEC VPR Q C N+PRQ C NVP RQECR+VPRQQC+N VP+Q+CR+VPRQQCQNVPRQ+ R EC++ P+Q+C+NVPRQ+CRNVP++EC ++PRQQC NVPRQVAR++C VPRQ+CR+VP Q+C TVPR++C NV RQV RQEC
Sbjct: 57 CITVYKQRCSTV----NEQQCSTVQEQQCRPTTRQECNTINEQQCNTVQNQQC------------STVNEQQCSTVNEQKCNTVNEQQCKTVTDTVNQQQCNTVQEQQCRPTTRQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQKCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSTVNEQQCNTVQEQQCSIINEQECNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERKCQTITDTVNEQKCTTVSEQRCSTINEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQQCSTVNEQVCKTIYDEVCDSAQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPR----QECRNVPRQQCQNVP----RQECRSVPRQQCRN----VPKQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVPRQQCRNVPRQVAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQEC 590 HSP 3 Score: 305.449 bits (781), Expect = 4.589e-88 Identity = 263/642 (40.97%), Postives = 329/642 (51.25%), Query Frame = 0
Query: 359 LNKPVLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVC----STVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVT----DTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNT----------------VQEQQCSTVNEQQC--------QTVTDTV------------------------NEEVCNTVNEQVC----NTVQEQQCNTVQEQ---------------------------------------------QCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD------------TVNEQVCNTV----------------CNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTR--------TEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVP--------------------RQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQC 839
L K L+ L A+ G S + K+R + Q + V +QEC T+NEQQC+TVQ Q+CSTV EQQCSTV EQ+C+TV E C TVN+ QC V QQC Q+CNTVNEQ+C T DTVNEQQCNTVQEQQC TV +TVNEQVCNTVQEQQC+TV++TVNE+ C+TVNEQQCNT VQEQ+CST+NEQQC QT+TDTV NE+VCNTV EQ C +TV EQQC+TV EQ C+ V Q+C +V +QQC V +V Q CN V +QQC +V V Q CN V C + Q C V QEC +V QQC V +QQC SV Q C++ R + KQ+C V QQC V +++C +V QQC V QV +QCRNVPRQQC++VP RQ+C NV R++C++VPR+QC +VPRQ+C ++P QQC NVPR++C VP +Q CS +PR+ C NVP RQ+C+ VP +QC
Sbjct: 33 LVKGALIKGALIKGALQGGQSRNNCI-TVYKQRCSTV---NEQQCSTVQEQQCRPTTRQECNTINEQQCNTVQNQQCSTVNEQQCSTVNEQKCNTVNEQQCKTVTDTVNQQQCNTVQEQQCRPTTRQECNTVNEQKCETKYDTVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQKCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSTVNEQQCNTVQEQQCSIINEQECNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERKCQTITDTVNEQKCTTVSEQRCSTINEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTVTDTVNEQQCSTVNEQVCKTIYDEVCDSAQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVPRQQCRNVPRQVAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVPREQCQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVP----DQQCSTVPRKSCRNVP----RQQCQQVPSRQC 662 HSP 4 Score: 115.161 bits (287), Expect = 1.422e-22 Identity = 121/347 (34.87%), Postives = 178/347 (51.30%), Query Frame = 0
Query: 395 AQRNYGQSNNAVAPSSG---------YGGAQQ-ECRTVNEQQCSTVQEQKCS----TVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTV----TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQ 719
AQ +YG + V + G YG A CR V Q+C++V +Q+C+ +V Q+C+ V +QQC +V + C V QC NVPRQQCN V Q+C+ V Q+C V V Q+C +V QQC+ V +Q C +V QQCQ V ++ C++ +QQC V QQC V +++C++V + C V Q V +QC V QQC++V +Q+C+TV ++C V V Q C V QQC+TV EQ C ++ Q C ++ Q+C V +QC +V +QQCS+V + C + R Q+C V +QC+ Q
Sbjct: 344 AQPSYGGDDPFVGDARGSGSKSVSALYGAASAPACRQVARQECTSVPKQQCTIVPRSVPRQECNNVPKQQCRSVPKQSCKNVPRQQCTNVPRQQCNNVPRQVQRQECSIVPRQECRNVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVP----KQQCRSVPRQQCQNVPRQISRNECSSAPKQQCKNVPRQQCRNVPKEECRSVP----RQQCRNVPRQ----VAREQCRNVPRQQCRSVPDQECSTVPREKCQNVPRQVQRQECKNVPRQQCQTVP---REQ-----CQSVPRQKCISIPSQQCRNVPREQCLSVPDQQCSTVPRKSCRNVPR----QQCQQVPSRQCSAAQ 666
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325321533|ref|XP_023342578.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 503.056 bits (1294), Expect = 4.101e-163 Identity = 345/653 (52.83%), Postives = 425/653 (65.08%), Query Frame = 0
Query: 363 VLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQE-CRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQ--------QCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQC--------NTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQD----QQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTR-------TEFKQECNTVNEQQ------------CNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQ------------ECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRR----VEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQV----PRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ----VPRQEC 951
V++ F ++ S P V ++K + A+ S+ AQ+ CR V +Q+C+ V E+KCST+QE+QCS+ Q+C+TV E CS + QC + QQC VNEQQC VNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQC+ T Q CNTV EQ+C+T ETVNE+ CNTV EQQCNTV +Q+C+TVNEQ QC+TVTDTVNE+ C+ VNEQ CNTVQEQQC NTVQEQ+C T+NEQQCNTV E+QC +T+TVNEQ C TVNEQ+C TVNEQVCNTV EQVCNTVQEQ+C T+ D QQC+TVNEQ C +V E+VC+S T +F E C V +Q+C+ V +QQC TV V Q+C NVP+QQC++VP+Q C +V R++C +VPRQQC NVPRQ EC VPRQQC NVPRQEC+ VPR+ V +Q C IPRQ C NVPRQ SR +C +VPRQQC NVP+QV P ECR+VPR+QC+NVPRQV ++C+NVPRQ+CR+VP +EC +PR+QC NVPRQV RQEC VP Q+C+NVPR+QC +VPRQ+C NV Q VPRQ+C
Sbjct: 9 VVIVLFCFSESESFPTVDLLVKGAIIKGALIKG---------ALIKSTLDNQAQEPICRIVYKQRCTQVNEEKCSTIQEEQCSSGTRQECTTVNEQQCSILLNQQCNIINEQQCTDVNEQQCTIVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCRPTT----RQECNTVNEQKCETKYETVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQECNTVNEQVCSTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSIVNEQQCNTVQEQQCSIINEQQCNTVQEQKCSTINEQQCNTVQERQCQIITDTVNEQKCTTVNEQRC----LTVNEQVCNTV----NEQVCNTVQEQQCRTITDIVNEQQCSTVNEQVCKTVFEEVCDSETAGNSYGGTDDFGGEARAAGSSSVSELYGAASAPACRQVAKQECTNVPKQQCRTVPRSVLRQECNNVPKQQCRSVPKQSCRSVPRQQCINVPRQQCYNVPRQVQRQECSDVPKQECRTVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRTIPRQKCQNVPRQVSRNDCSSVPRQQCSNVPKQVCQNVPSTECRSVPREQCKNVPRQV--------ASEQCRNVPRQQCRSVPDKECTTVPREQCQNVPRQVQRQECRNVPSQQCQNVPRRQCSSVPRQQCLNVPSQQCQNVPRQQC 632 HSP 2 Score: 489.189 bits (1258), Expect = 8.142e-158 Identity = 343/668 (51.35%), Postives = 428/668 (64.07%), Query Frame = 0
Query: 347 DLNVHESSLNQKLNKPVLLASCLFMQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVC----STVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVT----DTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQC----NTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECST-------------------------------VQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVC--------EQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQ----ECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQES----RQECRNVPRQ----QCQNVPRQ----VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQ----VARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVA 943
DL V + + L K L+ S L QA P+ R V+++ + + E + + G +QEC TVNEQQCS + Q+C+ + EQQC+ V EQQC+ V E C TVNE QC V QQC Q+CNTVNEQ+C T +TVNEQQCNTVQEQQC TV +TVNEQVC+TVQEQQC+TV++TVNE+ C+ VNEQQCNTVQEQQCS +NEQQC +TV E+ C+T+NEQ CNTVQE+QC +TV EQ+C TVNEQ+C TVNEQ CN TVNEQVCNTV EQQC T+TD VNEQ C+TV EQVC TV E+ C + C V +Q+C++V +Q C + R+ +QECN V +QQC +V +Q C +V QQC V Q C Q+C +VP+Q+C+ VPRQQC NV R+ECRSVPRQQC NVP+Q+C +PRQ+C NVPRQ +C VPR Q CSN+P+QVC NVP E R++C+NVPRQ QC+NVPRQ VP +EC VPR+QCQNVPRQVQRQEC N+P Q+CQNVPR++C +VPRQ+C N+P QQC NVPRQ V EC +VPRQ C+NVPR+QC VP ++C+ A
Sbjct: 26 DLLVKGAIIKGALIKGALIKSTLDNQAQE-PIC-RIVYKQRCTQVNEEK-------CSTIQEEQCSSGTRQECTTVNEQQCSILLNQQCNIINEQQCTDVNEQQCTIVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCRPTTRQECNTVNEQKCETKYETVNEQQCNTVQEQQCNTVNKQECNTVNEQVCSTVQEQQCRTVTDTVNEQKCSIVNEQQCNTVQEQQCSIINEQQC----NTVQEQKCSTINEQQCNTVQERQCQIITDTVNEQKCTTVNEQRCLTVNEQVCN----TVNEQVCNTVQEQQCRTITDIVNEQQCSTV----NEQVCKTVFEEVCDSETAGNSYGGTDDFGGEARAAGSSSVSELYGAASAPACRQVAKQECTNVPKQQCRTVPRSVLRQECNNVPKQQCRSVPKQSCRSVPRQQCINVPRQQCYNVPRQVQRQECSDVPKQECRTVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRTIPRQKCQNVPRQVSRNDCSSVPR----QQCSNVPKQVCQNVPSTECRSVPREQCKNVPRQVASEQCRNVPRQQCRSVPDKECTTVPREQCQNVPRQVQRQECRNVPSQQCQNVPRRQCSSVPRQQCLNVPSQQCQNVPRQQCTNVPWNECVSVPRQVCKNVPRRQCHPVPSRQCSADA 668 HSP 3 Score: 120.553 bits (301), Expect = 3.146e-24 Identity = 142/420 (33.81%), Postives = 194/420 (46.19%), Query Frame = 0
Query: 416 QQECRTVNEQQCSTVQE------------QKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVP----RQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDT-----------------------------------VNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSE--------------------------------TVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTD----TVNEEVCNTVNEQV----CNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD----TVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEF------------KQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQE 728
+Q+C T+NEQQC+TVQE QKC+TV EQ+C TV EQ C+TV E VC+TV E QCR + QQC+TVNEQ C TV E+ C++ T V +Q+C V +QQC+TV +V Q CN V +QQC++V + V ++ C TV QQC V Q+C +V QQC+ V T+ + C V QV C++V QQC+ V +Q CQ V +C +V +QC V V + C V QQC +V D TV + C V +Q Q C V Q+C V +QC++V QQC +V Q C++ R + +Q C V +QC+ V +QCS E
Sbjct: 250 EQKCSTINEQQCNTVQERQCQIITDTVNEQKCTTVNEQRCLTVNEQVCNTVNEQVCNTVQEQQCRTITDIVNEQQCSTVNEQVCKTVFEEVCDSETAGNSYGGTDDFGGEARAAGSSSVSELYGAASAPACRQVAKQECTNVPKQQCRTVPRSVLRQECNNVPKQQCRSVPKQSCRSVPRQQCINVPRQQCYNVPRQVQRQECSDVPKQECRTVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVPKQQCRTIPRQKCQNVPRQVSRNDCSSVPRQQCSNVPKQVCQNVPSTECRSVPREQCKNVPRQVASEQCRNVPRQQCRSVPDKECTTVPREQCQNVPRQVQRQECRNVPSQQCQNVPRRQCSSVPRQQCLNVPSQQCQNVPRQQCTNVPWNECVSVPRQVCKNVPRRQCHPVPSRQCSADAE 669 HSP 4 Score: 100.138 bits (248), Expect = 6.745e-18 Identity = 120/360 (33.33%), Postives = 175/360 (48.61%), Query Frame = 0
Query: 381 RAVFQRLLKKRSAE----AQRNYGQSNNAVAPSS---GYGGAQQ-ECRTVNEQQCSTVQEQKCSTV----QEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTV----NEQQCNTVNEQQCNTV----TDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQE 720
+ VF+ + +A ++G A SS YG A CR V +Q+C+ V +Q+C TV Q+C+ V +QQC +V + C +V QC NVPRQQC V Q+C+ V +Q+C TV V Q+C +V QQC+ V +Q C T+ Q+CQ V V+ C++V QQC+ V +Q C V +C++V + V V + C V QQC +V +++C TV +QC V Q V Q C V QQC+ V C+++ Q C V Q+C V QQCT V +C SV QVC++ R ++C+ V +QC+ E
Sbjct: 334 KTVFEEVCDSETAGNSYGGTDDFGGEARAAGSSSVSELYGAASAPACRQVAKQECTNVPKQQCRTVPRSVLRQECNNVPKQQCRSVPKQSCRSVPRQQCINVPRQQCYNVPRQVQRQECSDVPKQECRTVPRQQCQNVPRQECRSVPRQQCRNVP----KQQCRTIPRQKCQNVPRQVSRNDCSSVPRQQCSNVPKQVCQNVPSTECRSVPREQCKNVPRQVASEQCRNVPRQQCRSVPDKECTTVPREQCQNVPRQ--------VQRQECRNVPSQQCQNVP--------RRQCSSVPRQQCLNVPSQQCQNVPRQQCTNVPWNECVSVPRQVCKNVPR----RQCHPVPSRQCSADAE 669
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325274155|ref|XP_023321727.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 379.022 bits (972), Expect = 1.890e-114 Identity = 265/654 (40.52%), Postives = 353/654 (53.98%), Query Frame = 0
Query: 412 YGGAQ-QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVT----DTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNE----QQCNTVNEQQCNTVTET----------------VNEQVCNTVNEQQCETVTDT------------VNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEF-------------------KQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPR--------QQCNNVAREECRSVPRQ----------------------------------------QCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQEC----QQVPRRVEEQVCSNIPRQV--------CNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQ----VQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVARQ 945
YG Q QEC T E QCST EQ+C+T +Q+C T E +C T E CST E QC QQC T + QC T E +C T T EQQC T + QC+T +T EQ C T EQ+C+T ET E+ C T E Q T E++C T Q +T +T E+ C T +Q C T ++QC T E+QC+T E QQC T EQ+C T ET E C T E +CET +T EQ C T T EQ C T EQ+C T +QQC T EQQC + E+VCE + KQEC V +Q+C V +Q C V +Q+C +QV +Q+C+NVP+Q+C+ VP+ Q CN V++EEC +PRQ QC NVP+QEC+ VPRQ+C+NVPRQEC + VP++V ++VC++IPRQV C NVP++ +QEC NVP+Q+C+NVP+QVP++EC VP+Q+C+NVP+Q V ++EC IPR+ C+ VPRQ C+NVP+QEC ++PRQ C VP+Q EC+ VP+QECRNVPRQ+CQ VP+Q+C+ V ++
Sbjct: 107 YGCQQDQECSTSYEDQCSTTYEQQCATKYDQKCETKYEDKCETRYEDQCSTSYENQCETKYEQQCKTEYDNQCETKYESKCETKYADECHTEYEQQCETKYDTQCETKYETTYEQQCETKYEQECETKYETTYEQQCETKYETQYETKYEKKCET----QYETQYETKYEDKCETKYDQECETKYDEQCETKYEKQCETKYETQYEQQCETKYEQECETKYETEYDTQCRTEYKTEYSTTYEDKCETKYEDKCETKYETQYDTIYEDQCETKYEQQCETKYETTYEQKCETKYEQQCETKYEQQCQTKYEQQCETKYEEVCEQALPSYGYGAPASGYGAPKPACKKVPKQECKNVPKQECQNVPKQDCKNVPKQECRNEPKQVPKQECKNVPKQECRKVPKKVAKQVPKQVCNKVSKEECTKIPRQVPKQVPQEVCEQVSKQVPKQECHNVPKQECHNVPKQVPKEQCQNVPKQECHKVPRQECHNVPRQECTKVAKNVPKKVGKEVCTDIPRQVSKQVPKEECQNVPKKIPKQECHNVPKQECRNVPKQVPKEECHQVPKQECKNVPKQKCERVPKEECKQIPRESCKKVPRQSCQNVPKQECKSVPRQSCTKVPKQ----ECSKVPKQECRNVPRQECQNVPKQQCSKVPKE 752 HSP 2 Score: 331.643 bits (849), Expect = 8.428e-97 Identity = 236/634 (37.22%), Postives = 330/634 (52.05%), Query Frame = 0
Query: 417 QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSE------------TVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVC--------------------NTVQEQQCNTVQEQQCQT--------VNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTD----TVNEQVCNTVCNTIQEQV-------------------CNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTV---------------------------------QE-----------QQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPRQQCQTVPRQECNNVA 943
Q+C T E +C T E +CST E QC T EQQC T ++ C T E +C +C+T EQQC T + QC T +T EQQC T EQ+C+T +T EQ C T E Q +T E T E+ C T +Q+C T ++QC T E+QC+T +T E+ C T EQ C +T E +C T E +C+T + E QC T EQQC T ET EQ C T EQQCET + T EQ C T + EQ C V +QEC V Q+C V +Q C +V +Q C + + KQEC V +Q+C V QE Q+C V +Q+C+ V +QV ++QC+NVP+Q+C VPRQ+C+NV R+EC V + V ++ C ++PRQ VP++ECQ VP+++ +Q C N+P+Q C NVP+Q ++EC VP+Q+C+N VP+Q+C VP+++C+ +PR+ C +PRQ CQNVP+QEC++VPRQ C +P+Q+C+ VP+ QEC VPRQEC+NVP+QQC VP++ C++
Sbjct: 137 QKCETKYEDKCETRYEDQCSTSYENQCETKYEQQCKTEYDNQCETKYESKCETKYADECHTEYEQQCETKYDTQCETKYETTYEQQCETKYEQECETKYETTYEQQCETKYETQYETKYEKKCETQYETQYETKYEDKCETKYDQECETKYDEQCETKYEKQCETKYETQYEQQCETKYEQECETKYETEYDTQCRTEYKTEYSTTYEDKCETKYEDKCETKYETQYDTIYEDQCETKYEQQCETKYETTYEQKCETKYEQQCETKYEQQCQTKYEQQCETKYEEVCEQALPSYGYGAPASGYGAPKPACKKVPKQECKNVPKQECQNVPKQDCKNVPKQECRNEPKQVPKQECKNVPKQECRKVPKKVAKQVPKQVCNKVSKEECTKIPRQVPKQVPQEVCEQVSKQVPKQECHNVPKQECHNVPKQVPKEQCQNVPKQECHKVPRQECHNVPRQECTKVAKNVPKKVGKEVCTDIPRQVSKQVPKEECQNVPKKIPKQECHNVPKQECRNVPKQVPKEECHQVPKQECKN----VPKQKCERVPKEECKQIPRES----CKKVPRQSCQNVPKQECKSVPRQSCTKVPKQECSKVPK----QECRNVPRQECQNVPKQQCSKVPKENCSSFY 758 HSP 3 Score: 123.25 bits (308), Expect = 4.765e-25 Identity = 111/337 (32.94%), Postives = 177/337 (52.52%), Query Frame = 0
Query: 402 SNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQC----STVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQC----QTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQC----NTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTV 726
S AP+SGYG + C+ V +Q+C V +Q+C V +Q C V +Q+C V + C V + +CR VP++ V +Q CN V++++C + V +Q V ++ C+ V+ V +Q C+ V +Q+C V + V +E C V +Q+C+ V Q+C V Q+C + V V +EVC + QV V +++C + +Q+C V +Q+C V +Q V +Q C V +Q+CE V +Q+ C + Q C V +QEC +V Q CT V +Q+CS V +Q C + R QEC V +QQC+ V ++ CS+
Sbjct: 429 SYGYGAPASGYGAPKPACKKVPKQECKNVPKQECQNVPKQDCKNVPKQECRNEPKQVPKQECKNVPKQECRKVPKKVAKQVPKQVCNKVSKEECTKIPRQVPKQ----VPQEVCEQVSKQVPKQECHNVPKQECHNVPKQVPKEQCQNVPKQECHKVPRQECHNVPRQECTKVAKNVPKKVGKEVCTDIPRQVSKQVPKEECQNVPKKIPKQECHNVPKQECRNVPKQVPKEECHQVPKQECKNVPKQKCERVPKEECKQIPRESCKKVPRQSCQNVPKQECKSVPRQSCTKVPKQECSKVPKQECRNVPR----QECQNVPKQQCSKVPKENCSSF 757
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325269714|ref|XP_023349859.1| (mucin-19-like [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 388.652 bits (997), Expect = 1.025e-111 Identity = 288/720 (40.00%), Postives = 385/720 (53.47%), Query Frame = 0
Query: 358 KLNKPVLLASCLF--MQAMSGPMSSRAVFQRLLKKRSAEAQRNYGQSNNAVAPSS-------GYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCS-TVQEQQCSTVQEQQCSTVQESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCN----------------TVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTE----TVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSV---NEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVC-------------------------EQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVP-------------------------------RQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRVEEQVCSNIPRQVCNNVPRQESR----QECRNVPRQQCQNVPRQ------------VPRQECRNVPRQQCQNVPRQVQRQECNNIPRQECQNVPRQEC----RNVPRQECNNIPRQQCNNVPRQ----VARQECNTVPR-----QECRNVPR----QQCQTVPRQECNNVA----RQVPRQEC 951
+ P+L +S F +QA S AV L S A YG SN+ S GG QEC QC+TVQEQ CS + C+TV E++C T E+V Q C+ QC TVNEQQC TV NEQ+C TV EQQC T T E C TV E++C+T T EE C+TV EQQC+TV EQQCSTVNEQQC TV DTV+E C + +E+ C T EQ+C TV EQ C+TV Q+C+TV EQQC+TVT+ TV+E+VC VNE+ C DTVNEQ VC TI+E+ C +QECSTVQD QC +V E++C++V + E +E + C+TV+ ++C T E++C TV +++C+T E VC EQ C+ +P C+NVP+ C +A E+CR VP+++C VP R +C V RQ+CN VP + C PR Q CS +PRQ C+ +PRQ+ R Q+C V RQ+C +VPR+ VP+Q+C NVPR++C +VPRQV C +P ++C +VPRQEC R VPRQEC+ +P++QC++VPRQ V RQ C +VPR Q+C+ VPR QQC+ +PRQ+C+ A + VPR++C
Sbjct: 46 SYDTPILPSSNSFTSIQAGDSYGSPGAV---LGTPSSVLALPTYGASNDCTVERSTIDTGDCAQGG--QECT----NQCATVQEQDCSGSSATPSCTTVNEEKCETRYETVF------------EQVCSPSAAPQCTTVNEQQCTTV----NEQECKTVNEQQCSTTYATATENECRTVNEEKCETEYMTKYEEQCSTVTEQQCSTVNEQQCSTVNEQQCNTVYDTVSETECGSTSEKKCETKYEQKCEQVFEQQCQQVSEQQCQTVNEQACKTVYSQECSTVQEQQCSTVTDQACQTVSEEVCEDVNEEVC----DTVNEQ----VCETIEEKSCQPTYKQECSTVQDLQCESVPEEKCTTVQEEECEDVEEEDCSEGETVCDTVDTEECFTKYEEECETVYKERCSTEYELVCTTEYTENCQPAYGPGFTEGEGEGEVEQDCQTIPVNNCRNVPKPNCRQIADEQCRQVPKKECGRVPVQNCRQTEAGCSTVTKPVCKQVDREVCETIQRNDCRPVSRQECNQVPDESCISTPR----QQCSTVPRQQCSTLPRQQCRTVPNQQCSPVSRQECTSVPREQCQQVPQQQCSTVPQQQCSNVPREECSSVPRQV----CEQVPTEQCSSVPRQECRPVERQVPRQECSTVPKEQCSSVPRQQCSSVPRQSCISVPRSEGSGQDCKQVPRQQETQQCRNIPRQQCSQSASPQCKSVPREKC 724 HSP 2 Score: 117.087 bits (292), Expect = 9.436e-23 Identity = 123/389 (31.62%), Postives = 169/389 (43.44%), Query Frame = 0
Query: 417 QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQESV-------------CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTV----NEQVCNTVQEQQCQTVSET----VNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVC----------------NTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECR 768
+EC T E++C TV +++CST E C+T + C C T+ CRNVP+ C + ++QC V +++C V Q C E C TVT V + +VC T+Q C+ VS V +E C + QQC+TV QQCST+ QQC+TV + + C+ V+ Q C +TV +QQC+ V ++C +V Q C V +QC++V Q C V Q V QECSTV +QC++V QQCSSV Q C S R+E Q C V Q QQCRN+PRQQC QC +V RE+C+
Sbjct: 401 EECFTKYEEECETVYKERCSTEYELVCTTEYTENCQPAYGPGFTEGEGEGEVEQDCQTIPVNNCRNVPKPNCRQIADEQCRQVPKKECGRVP----VQNCRQT-EAGCSTVTKPVCKQVDREVCETIQRNDCRPVSRQECNQVPDESCISTPRQQCSTVPRQQCSTLPRQQCRTVPN----QQCSPVSRQECTSVPREQCQQVPQQQCSTVPQQQCSNVPREECSSVPRQVCEQVPTEQCSSVP----RQECRPVERQ----------------------------VPRQECSTVPKEQCSSVPRQQCSSVPRQSCISVPRSEGSG-----------------------QDCKQVPRQQETQQCRNIPRQQCSQSASPQCKSVPREKCQ 725
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Match: gi|1325273034|ref|XP_023321151.1| (axoneme-associated protein mst101(2)-like [Eurytemora affinis]) HSP 1 Score: 269.626 bits (688), Expect = 2.091e-76 Identity = 216/540 (40.00%), Postives = 299/540 (55.37%), Query Frame = 0
Query: 459 CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTET----VNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCE-----QQCRNVPRQQCQNVPRQQCNNVAREECRSVPRQQCNNVPRQECNNVPRQQCNNVPRQECQQVPRRV----EEQVCSNIPRQVCNNVPRQESRQECRNVPRQQCQNVPRQVPRQECRNVPRQQCQNVP----RQVQRQECNNIPRQECQNVPRQECRNVPRQE------------------------CNNIPRQQC----NNVPRQVARQECNTVPRQECRNVPR--------QQCQTVPRQECNNVARQ 945
C T+ E +C + PRQQC +V + T EQQCNTV D +QCNTV + T D V +VCNTV Q+C N V ++C ++Q Q +V EQ+C++V EE C+TV EQ C + EQ C+T +Q+C+T ++C+TV EQ C+TVTET V Q C V ++C + V C +Q+ V T Q +ECSTV DQQC+T E+ CS+V +Q +C TV ++QC+ V ++QCSTV +++C T Q C Q+C + PR+ C+ VP ++C + RE CR VPRQ+C +V RQ C VPR++CN VPRQEC+QVPR + CS I R VC VPR + R E Q V VP+Q+C + P+Q CQ VP +QVQRQECN I RQ+C+ VPRQ+C RQ CN++P+Q C ++V +QV R+EC V RQ+CR+VPR Q+C+TV ++C+ V+RQ
Sbjct: 36 CQTIWEEKCWDEPRQQCTSVQKPFTTTTTEQQCNTVLD----KQCNTVYD----TKVDQVPREVCNTVSMQEC------------NQVPREKCKSIQVPQIKSVPEQKCKSVP----EEKCSTVQEQECKNIVEQDCDTKYDQECRTEYSEKCDTVQEQVCDTVTETQVELVTRQKCALVPVEECHDAPEQV--------CQQVQKPVTKTKQVEECSTVYDQQCSTKQEESCSTVTDQ------------QCKTVTDRQCSMVTDRQCSTVYKKECRTTTVQECTSVKGVQKCWDEPREVCEQVPSEKCWDEPREVCREVPRQECKDVQRQNCVQVPREECNQVPRQECRQVPRSYTTTESAEECSTITRPVCRPVPRNQCRDE--------QQQVSTLVPKQKCYSKPKQVCQQVPNQVCKQVQRQECNPINRQKCELVPRQKCHTETRQACTTEYKDITNYVSEQSCSTVQDNVCNSVPKQVCSTVTDSVSKQVPREECKNVSRQDCRDVPRQRTEYRTEQECRTVSERQCSKVSRQ 523 HSP 2 Score: 121.324 bits (303), Expect = 6.625e-25 Identity = 137/384 (35.68%), Postives = 185/384 (48.18%), Query Frame = 0
Query: 417 QECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQ----------------CSTVQEQQCSTVQESV--------CSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTD----TVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVN-----EQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEV----CNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTV----TDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQC----NTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNT----VCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCNTVNEQVCEQQCRNVPRQQC 751
QECRT ++C TVQEQ C TV E Q C EQ C VQ+ V CSTV + QC + C+TV +QQC TV ++QC+ VTD TV +++C T Q+C +V +VC V ++C V EV C V Q C V ++C+ V Q+C+ V T T + E C+T+ VC V QC Q+Q V +Q+C + +Q C N V + V Q CN +N Q+CE V Q C+T C T + + N V EQ CSTVQD C +V +Q CS+V + V + R +EC V+ Q C V Q+ EQ+C TV+ E+QC V RQQC
Sbjct: 154 QECRTEYSEKCDTVQEQVCDTVTETQVELVTRQKCALVPVEECHDAPEQVCQQVQKPVTKTKQVEECSTVYDQQCSTKQEESCSTVTDQQCKTVTDRQCSMVTDRQCSTVYKKECRTTTVQECTSVKGVQKCWDEPREVCEQVPSEKCWDEPREVCREVPRQECKDVQRQNCVQVPREECNQVPRQECRQVPRSYTTTESAEECSTITRPVCRPVPRNQCRDEQQQVSTLVPKQKCYSKPKQVCQQVPNQVCKQVQRQECNPINRQKCELVP----RQKCHTETRQACTTEYKDITNYVSEQSCSTVQDNVCNSVPKQVCSTVTDSVSKQVPR----EECKNVSRQDCRDVPRQRTEYRTEQECRTVS----ERQCSKVSRQQC 525 HSP 3 Score: 112.849 bits (281), Expect = 3.522e-22 Identity = 113/343 (32.94%), Postives = 169/343 (49.27%), Query Frame = 0
Query: 399 YGQSNNAVAPSSGYGGAQQECRTVNEQQCSTVQEQKCSTVQEQQCSTVQEQQCSTVQ---------ESVCSTVNEPQCRNVPRQQCNTVNEQQCNTVNEQQCNTVTDTVNEQQCNTVQEQQCQTVTDTVNEQVCNTVQEQQCQTVSETVNEEVCNTVNEQQCNTVQEQQCSTVNEQQCQTVTDTVNEEVCNTVNEQVCNTVQEQQCNTVQEQQCQTVNEQQCNTVNEQQCNTVTETVNEQVCNTVNEQQCETVTDTVNEQVCNTVCNTIQEQVCNTVQEQECSTVQDQQCTTVNEQQCSSVNEQVCESTTRTEFKQECNTVNEQQCNTVQEQQCSTVQEQQCN 732
Y Q + S Q+C+TV ++QCS V +++CSTV +++C T Q+C++V+ VC V +C + PR+ C V Q+C V Q C V ++CN V Q+C+ V + T ++C T++ VC V QC Q+Q + V +Q+C + ++VC V QVC VQ Q+CN + Q+C+ V Q+C+T Q C T + + N V+EQ C TV D VCN++ +QVC+TV + V ++C V+ Q C V Q RTE++ EQ+C TV E+QCS V QQCN
Sbjct: 224 YDQQCSTKQEESCSTVTDQQCKTVTDRQCSMVTDRQCSTVYKKECRTTTVQECTSVKGVQKCWDEPREVCEQVPSEKCWDEPREVCREVPRQECKDVQRQNCVQVP----REECNQVPRQECRQVPRSYT----TTESAEECSTITRP----VCRPVPRNQCRDEQQQVSTLVPKQKCYSKP----KQVCQQVPNQVCKQVQRQECNPINRQKCELVPRQKCHTETRQACTTEYKDIT----NYVSEQSCSTVQD--------NVCNSVPKQVCSTVTDSVSKQVPREECKNVSRQDCRDVPRQ------RTEYR------TEQECRTVSERQCSKVSRQQCN 526 The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of spt transcription factor family member vs. L. salmonis genes
Analysis Date: 2018-04-19 (T. kinsejongensis vs L. Salmonis peptides) Total hits: 25
Pagesback to top
BLAST of spt transcription factor family member vs. SwissProt
Analysis Date: 2018-04-19 (T. kingejongensis peptided Blastp vs. SwissProt) Total hits: 1
BLAST of spt transcription factor family member vs. nr
Analysis Date: 2018-05-15 (T. kingsejongensis proteins Blastp vs. NR) Total hits: 25
Pagesback to topAlignments
The following features are aligned
Analyses
This gene is derived from or has results from the following analyses
Properties
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at scaffold1007_size71567:75..44568- Legend: mRNA Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.>maker-scaffold1007_size71567-snap-gene-0.6 ID=maker-scaffold1007_size71567-snap-gene-0.6|Name=spt transcription factor family member|organism=Tigriopus kingsejongensis|type=gene|length=44494bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold1007_size71567:75..44568- (Tigriopus kingsejongensis)back to top Synonyms
The feature 'spt transcription factor family member' has the following synonyms
Add to Basket
|