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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s100 | supercontig | LSalAtl2s100:612541..623936 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000073 >EMLSAP00000000073 ID=EMLSAP00000000073|Name=EMLSAP00000000073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=818bp
MSNLKKISEDEKEDRSKLWTGPNTTMXNMXSCKDFYMPERFLEIKEEIES
LEIRPDDLFLISYPKAGSTWSQEMVWQLKEGTNFVDCKRNLAQRIPFLEL
ESLVLRGPESTIKSVEAVKNKSSPRIIKSHLLTPFLPKDLFNKSKVIYIM
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LEIQKLDNVLLLCYEDMKKDLIKEMKKKKFEIDLESDNRNPNKVDKKGLF
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ISYPKAGSTWCQEMVWQLKEGTNFEGGKRNLGERIPFLELESLYLRESDF
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LELESLYLRESDFPQKSVEDVKNKSSPRIIKSHLLTPFLPKDLLKVAKVI
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HLSFTKFQKNSAVNLDSDIGNKVNKNGHFIRKGIVGDWKNYFSSELSDRF
DGKTKSFFESEGLQFQYE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s100:612541..623936+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000073-695920 ID=EMLSAT00000000073-695920|Name=EMLSAT00000000073|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=11396bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s100:612541..623936+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAAATATCTTTCCCTTCCCGAACACTCTGAAAAAACGAAAATGCATAATT
TGAAGCCCGGCGTGTATTTTGTAGGAAAATAAATAAACAGAAAATCGTTT
GTTAATGGAACTTCTATGGAAGTAATCAGTGTAAATTACAATCAGTATGA
GTAACTTGAAAAAGATTAGTGAGGATGAGAAAGAGGATCGATCGAAATTA
TGGACAGGACCCAACACTACCATGGMGAATATGGMGTCTTGCAAAGACTT
TTACATGCCTGAGAGATTTCTAGAAATTAAGGAGGAGATTGAAAGTTTAG
AAATAAGGCCGGATGATTTGTTTCTCATCAGTTATCCAAAGGCCGGATCT
ACTTGGAGTCAAGTAAGTTGTCTGAATTATTTCAAATGAATGAGTATAAA
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AATTTTGTGGATTGTAAACGAAACCTCGCTCAAAGAATTCCATTTCTTGA
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ACACCATTCTTACCCAAAGATCTTTTTAATAAGTCAAAAGTAATTTATAT
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TTTTAAAAAATCATCAGTATACTGGTTCCTTTGATGAATATGCAGAATTA
TTTATTCAAGGCAAGGTCGCCTACGGATCCTACTGGGAGCACTTGAAGGT
ATTTATTTTCTAGGCATTATACATATCTTAACATTGTRTGTTAACATATA
GTTTGGATTGGAAATACAAAAGTTGGACAATGTTCTCTTGTTATGTTATG
AGGACATGAAGAAAGATCTCATTAAGGAAATGAAGAAAGTACTGGATTTT
ATGAAATGGGATGAGTTGAGTGAAGAAAAACTACAAAAACNNTAATGAAC
ACCTCTCATTCAATCAATTTCAGAAGAAATTTGAGATCGATCTAGAATCA
GATAATCGAAATCCAAACAAAGTAGACAAAAAGGGACTTTTTATTCGTAA
AGGAATAGTTGGAGATTGGAAGRATTACTTCTCAGGAGAGTTGAGTGATA
GATTTGATGAAAAGACAAGAAACTTTTTTGAGTCAGAAGGTCTTCAAATT
CAATATGAATAGTTTTTGAACTGTTGAATTAGTCAAAAGTTTTATTATTT
ACTTTCATATTATGTACATATTTTTTTAAATTTCATATAACTCATCCACG
AAAAAATATTGTGTTTTTAAATAGTCAATCTTAATATAGACTTTTAATTG
AATAGCATAATTACGCTTTTATTCTTGAAATTTATATCCTATTATCAAGA
TATGTTTGATAATGATCATTGTTGTTGAAAAGATTTTTTCAATGGGAGAT
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ATCTGACTTTTGAAAGTTCTTTGATATTTTTGATCTTGAATGATGAATTG
TTAATAATCTTTGATGTCTATTTCTTTCATCCGGTGTTATTTTAGCTTCT
TTAGTAGTTGATGCGACACTTCTTTCCACATTTTGGGAATGGACTGGATG
TCTGGTAAATCCAAAAGTTCTCCTTCAATGCTCTTCAGAAATTCTTCTTT
TTTAATATCAAAAGTTAAAGGAGGTTCCGTTAAAAAACTATTTGGAATCG
ATGATAAATCAACTTTTGCATTGAAGTTTAAGTAATCAGTTGTGCGAATA
TATTGCATAACTGATTCAGTTTTTCTTTTTTCTCTGTCTTTCATAATTAT
ATTGACTGCTGTCCTTCTGGTATTTTTGTCCGAGTCAAATAAAGCGCCTA
AAAGTATAGCCTCTGGATGTGCACCAAATGAGTTAATTTTGAATGAATTT
GCAACTACATCTCGTTCCTCTTATGAAAGGTGCTGACGTCCTTNTGCAAT
GCAAAGAAATAGTGCTGAGAAGCATATCTAACGTGATGATTCTTTTTAAT
GTTTACGAATGTTGGTCCATAAATATTAAGAATGATCACTACCATTCTTT
TAAGTTCTTCTGATGGATTTCTGGTTTGGATATAGAGTCTNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTGGACAGTTCCTGGATGTTTTTT
TTAGGAAAGGCTTGAATTGAATGTGGTCCATTTTGAACATTTGTGCAAAT
TTCTAAAATGTACTTTTGATCCCTACTGAGTTTGTTTTTAAAAGTGTCAT
CGACGTTTGGAACGCATCCTTTGATGGCTTCATATTTTAATGGATCCGTT
AGGTATGAAATTTTGATATAAACATTCCTAATTCTCCTCTCAATGTGTTG
GGTCCTGTTGATCTTCCATGATAAAATTCAAANTTGAACATTTGTGCAAA
TTTCTAAAATGTACTTTTGATCCCTACTGAGTTTGTTTTTAAAAGTGTCA
TCGACGTTTGGAACGCATCCTTTGATGGCTTCATATTTTAATGGATCCGT
TAGGTATGAAAATTTTGATATAAACATTCCTAATTCTCCTCTCAATGTGT
TGGGTCCTGTTGATCTTCCATGATAAAATTCAAATAGTTTTTTGAAGAGT
AATTCATTAAAATGGAGTATTCAAATAATCCATTGTAAAGGAGTGTCTAA
TTTTTGCTCAAGAAGCCTAATTTTGCCACCTTTGTACCCTGTATTTACAT
TAAAAAATAGTTGTTTATAGTTCAATAACTTATAGAATGAAGAGATTGAT
TTTATAAAACAAAGGATATAATCATAACTACCCAATGCGTAGGTATGTTC
TTTGTTCTTCGAAGTACTCAATAATTAATAATGACACTGGTAAGACTAAA
CAACCCTACGGGCAATACTGTTACTTTCTTTGCAAGTAAAATTGCAATGA
TTTTATAGGCAATAAACATTTTACACCAATGCCCATTTCGGGTGCCTAAG
AAACGCAAATTCTGTTGTGTCTTTACCAATGTCAAGGTCTCAACTACAAA
CTCAATTTGATATATGTTAAAAAAGCCAATAGTTTCTTAACTTTCACAAA
TCAAACTCCCAAATACCAAAATATTTTTTATTTATATTCATTTTTTTGCT
CTATAAAAATAATTTAATTTACAATGAAGAAGTATAAAATTTATATTACA
AATGTTCATATATGTGTATTGTACATAATTCCGTGTACTATAATTTGTTG
AAAAAAATTAAACGAAGGAAGAAAAATTGCAACGCGCTTTATATTACTCT
ACAATATATTTCTTTGATAAAGTCCACAAGTGTAGTAAAAAACCTCGTCT
TTTAATAAACAAAGCGATTTTTTTTATAAAATAAAAAATGTTTTTTTACA
CTCATTACATTACAAAAAAAATTATTGTGCATGTAACATCACTTTTGGAG
AAGTTTTAGAACTAACCGGAAGTGTTGACCGGAAGTAGCCTTTCGAAGGT
TTGCTGCAGGGGAAAAATATTGCAGGACATTCTTACCCATACCCATAAAA
ATTGGTATGGTAAGACACACTCTAATGTAGAGGCAGSMACATTAAATTTT
ACACGAGTCAGCACATAAACCAACTAAAAGGGAGATACATTGGATCCTTG
TTTTTTTTCTTCAATAGTTCGGCGTTACTGATAGACAAAAAAAAAAGTAA
AAATAACAGTTGAAAACAAAATATATCTTACATTATTATGATAGCAAGAT
GAAAACGATGCAAGGAATACTCTTAAGTGAATATTTATAGGGGAGTAAGT
TTATTTAAATTAACAGCTTGGATTTTTTAAAAATATATTTTATTTTTATT
TTTATACAATACCTTTTAAATGAAGTTATTTATAAAATATATTGAACTCA
AAGACATGATAATAAATTCTTAAAGCAGTACATTAAATTTTTCACATTAT
TTAAAGGAGAATCATGGGAAATTATTTTATTTAAATTCAAATGTGGTTAA
ACATTTTAAGTTAGCGCTGTGTCCTATTGTTAATACGAATTAATGACTAA
AAATACGATTAGAGCCCATCATTGTATAATTTTATTCCTTGATACAAAGT
TTCCGCTCTCTAGAAGCTGCAAATTTTGAGTTTGATTGGAAATAGAAAGT
TTCGTGAACGAACTAACATATTCTATATATATACAGAAAATTATGAATTG
TATATCATGAGTTTTCACTTATTCTAATTTGACACTTCATTTAGTTTGTA
AACATAAATATGCACAATAATTTTAGATTCTGGAACATCTACACTTTTAA
CATTTTGATGCAAACTACGTATTCATAAATTTTTTAAATTAAAAAAAACC
CCAAAAATTATAGTTATAATTTTTTTTGTTCTGAATTAAAAATGTAGATT
CCTATTTTTTGCCTCAATATTATTTAGCTACTTATACGAAAAATATTATT
AAATCAATCTAGATAGCAGATATTTAATAAGATAAAGATAATTAAACCAT
CTGTAGCTACTCCTCAAAAGATCAATTAATAAAAATTTCATGACTATGAA
CCCCACATCTAACAAACCCTCGTAATATTTACAATAATAAATAACACATT
AATTATATTGCCCCACCCACTCCAAACACTCTGAAAAATGGAGAATGCAT
AATTTCAAACTGGGCGTGTATTTTGTAGGAAAATAAACAGAGAAAGACTT
GTGTATGGAACTTGTTTGGGGAAAATCATTTGGAATCAGGATGAGTAACA
TGTACAAGATTAGTGAGYATGAAATAGAAGCTCGGTCAAAATTATGGACA
GGAACCAACACAGCCATGGTGAATATGGTGTCTTGNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNAAAGACTTTTACATGCCTGAGAGATTTCTAGAAATTAAGGAGG
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CCAAAGGCCGGATCCACTTGGTGTCAAGTAAGTTATCTGAATCATTTATA
ATGAATGATTAAAAGTCCAACACTTTCAAAATTAGGAAATGGTGTGGCAA
TTAAAGGAAGGGACAAATTTTGAGGGTGGTAAACGAAACCTAGGTGAAAG
AATTCCGTTTCTTGAATTGGAGTCTCTCTACTTACGTGAATCTGATTTCC
CTCAAAAAAGTGTAGAAGATGTTAAAAATAAATCCAGTCCTCGTATTATC
AAATCTCACCTTCTGACACCATTCTTACCCAAAGACCTTTTGAAAGTGGC
AAAAGTTATTTATATAATGCGAAACCCTAAGGACGTTTGTGTTTCATATT
ATAATCATGAAAAAATACTCATAAGTCATGAGTATACTGGTTCCTTTGAA
GAATATGCAGAATTATTTATTCAAGGCAAACTCCTCTACGGATCCTACTG
GGATCACTTGAAGGTATTTGTTTTCCATGCATTTTACATTTTACTTTATC
TGTTAACATATAGTTTGGATTGGAAATACAAAAGTTGGACAATGTTCTCT
TGTTATGTTATGAAGACATGAAGAAAGATCTCATTAAAGAAATGAAGAAA
GTACTGGATTTTATGGAATGGGATGAATTGAGTGAAGAGAAATTGCAAAT
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ACCTAGATACAGATTTTGGATATAAGGTCAAAGTAGACAAAAATGGANCA
GTTTATTCGTAAAGGAATAGTCGGAGATTGGAAAAATTACTTTTCATCAG
AGTTGAGTGATCGATTTGATGGAAAAACAAAAAGCTTTTTCGAATCRGAA
GGTCTTCAATTTCAATATGAATAGATTTCATTTTTTTTCTGTTGAATTAC
TCAACGTTTTGATTATTTATTTTCTTATTATGTACGTATATTTCACTATG
ACGTAAGTAATTCACAAAATATAACATATTTTCAATGTTTTTAAGGGAGG
TGGAAGTTATACATATATCCTAATTTGAAATATATGCTCTGTAAGCATAA
AGTATATGCATTTTTAAACTATAATTTAGTGCATGGATGTTCATCCTGAG
GCCTGCAGAACAAATCATAGCCTTCCAACTTGGTTTATGATGCTTAATGT
TCCCTCAAGTTATATTATTTTATATATATTACATTTATAATTCATATACT
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TTATTTGTTTCATAGAGACATCGGATTGTTCGTGAAAGTCAGAGTTCTAA
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CTTTTTGAAAACCTATATCATAGCGTAATCCAAACAAATCGAAACCGTAT
ATAACAAGATATTGTTGTATTATTTTGTTGATTTTTTTTATAAAATATTA
TTCACGTTTATTAGTTTAAGTAATAAAGTCCTATTTTTTTAAGCTATTTG
TGAAGACGCCCTGTGGGCGATAGGTTATGTAATGAGAAATAGGGGAAAGA
GAAAGACTTGTGCTGCCGATGACTAAGGTTGATAATTTTGGTAAGAATAC
AAAAGCGTGSGAGGAGAAGGGAAGCCATACTTATGGTATCATTGATTAAA
TTATAAACATCTTCTTCTATCAAGAACGTTATCATTCCCACCTTTATTAT
TCAATATTTATATAATACTAGATGCTGATAGTCGATAGAGAACTGAATAA
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TTATCGATATAAATGTGCCTTTAGTCCCCTGTCTATAATTAAAAGCCACT
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GTTAATTATGAATACATCAAGTCAGACTTTAACTTTGATCTCATAAAGAT
GCTTATTGCATGTAATATAACTTTATCAATTGCTAATCATCCTACGTTTA
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ATCATTAATTAATAGGGATGTTGATAATGACGTCATTTTATCATTGATGC
ATCGTCCAAATACTTGGAAAATGAATTACCTTACTTGGGAAAGGATTCTC
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GAACCATATTTGGGTAAAGGGAGCAATGTTACAACAGATAATTTCTTTAC
GTCATTGTCTCTTGCAAATGAACTTCAGAAAAATAGGACGACTATTTTAG
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ACATTATTAAGGGGAAAAAAATAATAATTATGAGCTCTGCTCACAAAAGT
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ATTTTGGATTTTGCTGGTATAAATGCTGTTATCTTGTACAGAGAAGTGAC
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TGACGAACTAACATATTTTACATATAAAGAAAATAATACAATTAATAATA
CTTAAGGAGTCTCCAATTAATCTAATTGGATGCTTAATTAAGTTTTTAAA
CTCAAATATATATAATAATTTTATGGTCTGGAATACGGGCTCCCAATTTT
ACTCATACCATATACCCTTATAACATTTTGATACATAAAATATTTCACTA
AATTTTTAAAACTTAAAAAAGCCTCGGAAATGACAAATTTTTATTCATTT
TTTTTCCTTTGTGAATTAAAACAGTACATTCTGTTTTTACGCCTCCAAAT
TATGTAGCTACTTATACGAAAAATATTATTAAATCAACCTAAAAAAGAAA
TATTAAAAGAGTTTTAATAAGACGAAGATACAGATCATTAAATCATCTGT
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TCACCAAACACTCTGAGAAAATTAAACTGCATAATTGCAAGCCGGTCATT
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GGGAGGAGAATCATTTGTAATCACATATCAGTATGAGTAACCTGCACAAG
ATTAGTGAGGATGAAAAAGAAGCTCGATCAAAATTATGGACTGGACCCTG
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GATATTTAGAAATTAAGGAGGAGATTGAAAGTTTAGAAATAAGGTCGGAT
GATTTGTTCCTAATCAGTTATCCAAAGGCCGGATCCACTTGGTGTCAAGT
AAGTTATCTGAATCATTCATAATGAATGATTAAAAGTCCAACACTTTCAA
CATTAGGAAATGGTGTGGCAATTAAAGGAAGGGACAAATTTTGAGGGTGG
TAAACGAAACCTAGGTGAAAGAATTCCGTTTCTTGAATTGGAGTCTCTCT
ACTTACGTGAATCTGATTTCCCTCAAAAAAGTGTAGAAGATGTTAAAAAT
AAATCCAGTCCTCGTATAATCAAATCTCACCTTCTTACACCATTCTTACC
CAAAGACCTTTTGAAAGTGGCAAAAGTTATTTATATTATGCGAAACCCTA
AGGACGTTTGTGTTTCATTTTATCATCATGAAAAGCTTTTAAAAAATCAT
GAGTATACTGGTTCCTTTGAAGAATATGCAGAATTATTTATTCAAGGCAA
GCTTCTCTACGGATCTTACTGGGATCACTTGAAGGTATTTGTTTTCCATA
CATTTTACATTTTACTTTATCTGTTAACATATAGTTTGGATTGGAAATAC
AAAAGTTGGACAATGTTCTCTTGTTATGTTATGAGAACATGAAGAAAGAT
CTCATTAAAGAAATGAAGAAAGTACTGGATTTTATGAAATGGGAGGATTT
GAGTGAAGAAAAATTGCAAATACTCACTGAACACCTCTCATTTACCAAAT
TTCAAAAGAACTCTGCTGTTAATCTAGATTCAGATATTGGAAATAAGGTA
AACAAAAATGGACATTTTATTCGTAAAGGAATTGTTGGAGATTGGAAAAA
TTACTTTTCATCAGAGTTGAGTGATCGATTTGATGGAAAAACAAAAAGCT
TTTTCGAGTCAGAAGGTCTTCAATTTCAATATGAATAGATTCCAACTTTT
TGCTGCTGATTTACTCAACGATTTTATTTTATTTTTCCTATTGTGTACGT
ATTTGTTTATTATGACGTAACTCATACGCAAAATATATTAAGTTTTCAAA
TTCATTTAACAGAGGTGGAAGTTATATATCCTAATTTGCCATATAAGCAC
AGTAAGCATAATGTATTTATATTTTCAAACTATGTTATAGTGCATGGATG
CTCAGCTTGAGGCCCTGAGACCAAATCAAAGGCTTCCAGTTTTCATTAAA
CTGTCTATGAAGACGCATATTGGCGATAGTTTCTTGTTCTGCCTCTGGCA
TCCTCATAACTTGTAATGTAAATCATGTGTATTTTTTAGATTGCCTGTTT
TTTGTAATTGGTACTCCATGTAATACAATAAACTCTAGCATTATTT back to top
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