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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1010 | supercontig | LSalAtl2s1010:102531..140454 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000081 >EMLSAP00000000081 ID=EMLSAP00000000081|Name=EMLSAP00000000081|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=596bp
MMKTIVTGFTFAICFITSQVISQSPTAYELPTDAEAILAAPLSTSFTCDG QPYGYYADVDNNCQVFHVCLPIEDNLGQIIETAQYSFICGNTTVFDQNTL TCNYPENSIACLDSPSLYGAVEFGKIPPPNLSFIQQNQLLSKMFKAVAST LAFAALFVATQVSSQSPSAYQLPADAELILDSPVSTSFSCDGQAYGYYAD VDNNCQIFHICLPIEDDAGQIIETAQYSFVCGNTTMFDQQTLTCNHPEDA FPCNEAPSLYGAVEFGRIPENNSSNKTNIYPKMFKAVVSTLAFAALFVAT QVSSQSPSAYQLPADAEFLLDSPISTTFSCDGQSYGXYADVDNNCQIFHI CLPIEDDAGQIIETAQYSFVCGNTTMFDQQTLTCNHPEDAFPCNEAPSLY GAVEFGRIPENKVLQLSVHHLICEFSVHPTKPSISKMFKAIASXLAFAAL FVAXQVSSQSPSAYQLPADAEFTLDSQVSTSFSCDGQAYGYYADVDNNCQ VNTHTSTIIKISSNKTNIYPKMFKAVVSTLAFATLFVANQVSSQSPSAYQ LPADAEFTLDSQVSTSFSCDGQAYGYYADVDNNXQVNTHXSTIIKM back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1010:102531..140454+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000081-695928 ID=EMLSAT00000000081-695928|Name=EMLSAT00000000081|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=37924bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1010:102531..140454+ (Lepeophtheirus salmonis) GTAAGGATTAAAATGTCAATTGGGGAAACACTATAAAAACCCTTTGATAC
ATCTGACATCTCATTCAGTTGCAATTCGTCACTAAGTAGATATTGAAAAA
TAAATAATAGATCAAAATGATGAAGACCATTGTAACAGGATTTACATTTG
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ATTCACTTGTGATGGACAACCCTACGGATACTACGCTGACGTGGATAACA
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ATTTATAAATATATTTTTTATTTTTTTTTCATTTCAGACCTTGACTTGCA
ATTATCCTGAGAATTCAATTGCTTGCCTTGATTCACCTTCTCTCTATGGA
GCTGTTGAATTTGGAAAGATTCCTCCTCCAAGTGCTTAAATCAGCTGTTT
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GACATCCTACCTGCGACAGCTCAATGAAAAACTAATTTTTCATCTTCTTC
TTATCTTCACTTTGTTACTCTACTTTTTTCTATATATGATATGTACATAT
ATGTAAGTATGACCGAATCCGAATATAAGAAATTCAGATATAATAATCAG
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TTAGTACAAACTTCACTCAAACTCAATAGTCTGACTAAAGAAATTAAAAT
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AAATTGTGGTTTTTATATACTTCGGATATAACGAAAATCCGGATATATTA
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TTATACTTATTAATAGATATTAGATTATGCGTTAAATACACATTAATCGA
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AAGTTTTTTATGAGCCCACTCACAAATAACTACTCAATACTTATATCAAT
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GAGAAAAAAAAAGTTGGGATGAGTATTTTAGTCTTTAGATCGGTCACTAA
TAAAACCAAACAAAATCCATTAAACATAGCAGCGTTTAAATTTAATTCAA
GTATTATAATATACTAAAAATACTCCCGAATTGTAATATACATCAAGGAG
CTCTTTATAAAGTTCACTCTCTTCATGTTCGTTACTATATGTTCAGCCTG
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GTTGGGTAAATTTCTCTGGAAGTRGGGGAGCAGGKTGGTATTGAAAATTT
CGATGTGTATGSCTGCCGTGAGCCTATAATCTTCTGTGAACCAAATCAGG
GACGTCATTCAGGACATCTGCATTAATGACGGCCTTATTTCTGATGCCGT
CCTTCCTCTCTTTTTTTAAGTTAGAGCTTTAAGATTGGAGATGGCCTTAC
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AAAATTCAAAAAGCAGCAGATGCTTGAGATATATGGCTACCTTTAACATT
ACAGACAGTTTTAATTTCCTCTCACAAATCTCTCATTTTAATATAATACA
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TATAGGTCTGAGAAGTATAAAATACCGTCCACAGTTCTTTTATTTTTATT
ATTATTATTCATCAAACCTGTTGTTGACCTTTTGCCATTTCATTCAAATA
TATATATATAATTCATATGAAATATTTTATATTTTTTGCACAACACATTT
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AATGAACAAAGACTATATTTAGAGGCAAAATGTTATTTATGTAGACATAT
ATTTGGATAAAGGTGTCAGTAACACTCTGAAACATAGGCACTACGAAGTA
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TACATACAGATTGCTTCATAGTTCTAAATTTACCACTAGTCCATTTGCAC
ACACCAAGCAGTTGAGCGCCTCCTGGACCACCATTCACGTCGTCAGTAAG
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GTTTAAGAAAAAAACGAAGGCCAACCCCCACAAGTCTTTGAGGGTCCATG
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AATGAAAAAAAAAACCATACCCTCCGTTGCAAGACTCCTTTTAATGATAA
TTTTGAACTCTTTTTTGACACTTTTGGCCTGCCTACAGCTCTGATGGCAA
TCCCTTCGACTTCAAATCTTGGGTTTATGTATATGAGAAGGCTTGCATGT
CCGTCATCCAAACATGGATGCGCTCAAAGTCACTGATGGCCAGCTCTGCT
ACCCTATGTCGGAAGACTGCATCTGTAGTAGGTACCAGGCATTCCACTTC
CGCCTATAAGACATCATTGCACTAAGGATGGCTAGATTAATTATTAAGAG
CACTCTGACATACATCTATTGCTTGTATTAATTTTGTTGAAATTCTATAG
TTAATTAATAAATTATATCTTGTTGAAGTTTAAAATTGTAATTGTTCACA
TTTTAAATGACCACTCAGTTTGGTGATTTGAGTAGAACTTTTGACCTAAT
AAACTTCTGACCAATTCAAGAATCCACCTATAATCATCCAAATTCAAAAT
GAAAACTGCAAATTTTAAACACTTACTAATCAAGTATGTTATCAACAAAC
TGTGGGATGACTCTATGTCTCATAAAGGTGGACAATAAATGTAAAAAGGT
TTGTTATCCCAGTGGATTATTCGAGTTGGAAAAGACAGAATATAAGTCGG
AAAATATCACTAACTTATGMCCGACACAAAAAAAATTTGAAAGGCCTATT
GAAAAAATATAATCAGTTAGAAAATTTCAAAACAAAATAGCACCGACCCT
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ATCGAGTTCTCAAAAAAGTTATGGATCTACTATTTTACAATATTAAAATT
GGTTTTTTTTAAAATTAGTTCTGTTATTTATTTTACTTTTGTTTTTTGTA
GCAGAGTCCCTAAAAGACTTTTCATATCCTTTTTTAGCTTGACTTTTATT
TTCCCCATCAAGAAGCAGTATAAAGCTAAAACACGAAAAAAGTAGCGTCA
CACTTAGCAAATTAAAGAACGGATTGACTTGAAGCCCGGGAATTTTCAGC
CCATCTGTTACAGCTGTTATTCTTCTTCTTTCATTCTTAAGGAGAGAACA
TCTAAAAATAAAGTGTAATACGTGTCTCTGTGCTCAGGGTTGACGGAGAG
TGGAAATGAGAAGCTGTTTGTGAGTTTTAAGTTGGAATCCATGTAGAATT
GAGGATTCACATCGGAGTAGTTCCTGGATGTGGCTTTGCTTGATGTAAGG
CGGACTTGTGTTTATTTTAGTGATGTGCAACGAGAAAAACTATTAAATTG
GTACACAAGTTTTATACAGAAAATAAAAAAAGACGCCAAAACACGGCTCA
TGGGCATTAAAAGCAGAGTATTATTACTCGGAACTCGTCAAAACATGGTA
TCATTTTTTCTTTTTTGAGCCCATTAAATCATGTAAATCTTCATAGACTT
ACTTCTTTTCCTTGAAAAATTTAGAATTCATGTTTTCCGGCAAGTAGAAA
TTTGTTTACTTTTCCGTATTGTGACCTCATAATCCCAGTTCGTTTTAAAA
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ATATAATGACTTAATTGTCTATTTTTTTATATATTATCATTAATATGTAT
TCATATTAATAAGCATCAGTGCCACAAAAACATATTTGTTTTCAAGTTAT
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TGTGAAAAATAAATTACGAAAACAAGGTTGTGTGGTACCTTATATTAAAT
GTATTATAGTCCTTCTGGTATACTTGTATTATTGTTATTATAAGATCATT
TTATGTGTACTATGTACAAATATAGAAATTTTTAAATGATAAGTATCAAT
AATTCATGAAAAAATATGGATTTTTGACAGACGAGTTTTTTAGGGAGCAA
AAAGTGTTATGGTGAGTATTGAGTGTTCAGGCAAGTAACAAATATTCAAG
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ATTCAAGCGAATAACAAGTATTCATGCGAGTAACGAGTAAAGCTCGTAAT
TCCTAGAGTATTTTCTATATTTGAAACTCGAAAATACTCATGTTGTAAAA
TTTAAGTCGCGGCACATTACTAGTTTATTTTTTTGATATCCCAGCTGCTT
GTAGTTAATATATTGAAACGTCCTGACAATTAAGCTGTTTTCATCTAAAA
AATTATTAAAATTGTCAGGGTTACCATTTTAATTTTTTTTTAAATGGGGG
GGGGGGGGGGGGTTCACACCAAAAATTCTTATGACTTATATTATAATCTA
CCTAATGATGGTAGATATTTTAAAGTGTAGAAAGAATATCCTAGAAATGT
ATCCACATTTTGATCGAAGTTGAGGTTGAAAATGGGTATACACTGTGTCA
TTTGGTGTACTGAATTACATTAATATATATTTATGTAAAAGGTGACATAA
ATAAGACAATAACCTTAAGTTATATATACACTAAATGTCCTCCACATAAT
ATGATGTAATTGATTGCAGATACCTCTTATCAATAGATTAACTCATTTCT
TAATAAAGAAAAAGACACAATTGAATTCCAAATATTTCCAAACATAGAAA
TAATTGTGATTACAGCATGGTTTAATAAAAGTAACGTAAAACAGGAGGAG
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AAGATATATGCTTGACATTCTACCCATCAGTACGAACAAAAAAAGATCAT
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TCGTTCAGAGTCTACAAACCATCAGTTCATCATTTGATTTGTGAGTTTCC
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TTTTCCAAAACTGACATCAAAACTCTTGGAGAGAGAACATCTACTTTCAA
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TTCTTCAAATTGTCAGGTTCATTTTCGGTTTCTTTTATTTTTACATTAAG
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TTGAATTCAAATGTTGGAACATATAAATAATTACGGATAAAGAAGCAAAT
GACATAGCTGCGGCAGTAAGATTGATATCAGCTAACCAGGACGGATTTTA
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TATTGTTTGATATAGCTAATCCGAATTGGACAAAATTTAGAAATGACTGG
TGTAGGAGTTGAACAAATTCAAAAACTGGGTGTTGTAGTTGGAGTCAAAT
AGTTTCAAAAAGTTGAAGTCGGAGTTATAAAAAAATCTTCCGACTTCATA
ACCTTCTTTTTTATAACTTCAAAAAAGATTATAATATTCTAGTACATCCG
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TATTCAAGTTGTAGTTTATAGAAACAAAAATGTACAAATTGCAACCAAAA
ATGGGACAAATAATTTAAAATGATGAGAGTATTATGTAATATTTGAATAT
TCATTGTGTGTTCGATGTATGAACGAGATAATGTCGGACTTAATTAGCTC
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GTGTATTTTTCAGCTGGCCCGGTTTTTTTTTTTTGAATTGGTAATCTGAA
RAATGAACTTTAATTACCTGAGCTGTTATCATTATTATTTAACTCTTGAG
TGGTAAGCTTCATTCAATTAAATTCAAACCTGATTTTATATTCGTGTGTG
TTCATAAAAGACTTAAACTTGCGGAATTTTAATTGTAAGTCCTTGTCGGA
CTCAGTGTAGAATTGAGAATCGACATCGGAGTAATTCTTGCCTATGTCTT
TATTTATTACCTTCTCCCCCTCCTCTACTCTCATAGGTGATTGTAGCTGA
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CAAAATACACACGATTTGTATCACAAGTAATTAACATTAAACCTAAAATA
AATCTTTCATATTAAAAAGCAAAGTTTGTCTGTTCGTCGACATCTAATAA
CTCTGAGGAATGCCTGGTATTTACGCTAGTTAGTAACAAATTAGTATTTT
AATGTATTAAAATGAGATGATACACTCAATTAGTAGTTTACATGATATAA
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TCCAGACATTTTTTTTATAAACCAGTATAATTTTATGATTTTATTCTAAA
ATAATCCATTTTTATATTCTAAAATATGAAAACACCGAGAAATATATTCA
TAATGATAGCAAATGATTACTTAATATTGTTGCTATTAAAAATAATATTT
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TCCACCTAGTTATGATCTAGGATGTGCCAGAAGAAGAGGTAGTTGGCTGT
GGCACGACAAACCATTGAGAGGAATTGGTTAGGTAGTCAAAGCTCGAGKC
GKTGGAGAGTGCAAGGAAAACTGTAAAGGTCAGTATAGTTGGACAATCTG
ATTGAAATAGAACGATGGTCTTTGTCTCTTCATAAACCTTATTTCTTGTC
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GTAAAACAAATATTAATGTAAATTCCTTTGTCAATGTTTGATTCCATCAA
TTAATTAATTTATTGAATAAATGTAAATACATATTTAATGACGACAGAAA
TGGGTCTAAAAAAAATTATTTAACACTCATGTAATTATCAATTTTATGTA
CATAAGTATGGTTTGCACCAACTCTATGGGAAGGTTTCAGGCCCTCAAAG
ATTTTAGGTGCCTTATATTTCTCTTAACTGTATTATATTTTAAATTTTTT
GCATTTGTAAAACTGTTTTGTCTATTTAACTGTTTTTATTTCATGGTGGG
TATCAGTCCATTTCTGGAGATACTAAATACATTCATAATTAATCAATGGA
CCTTAAAAAGTTGGTTTTACAAATAAAATATAAATCATTAAATTTGTGAT
TTTGACCGTTATTTTCGGTTTATGTACGTTTAAAAAATGTTTAATTTTTA
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TAAAGGGGATAGTCATAAAATTTAAATCATCAATTTTTGATAAAATACTA
TATGTTTACTTAGGATTATCACAGCAAGAATATGCTACATTAGTTATTAT
TTTAATGAAGAAACATATCAAACATAATATGTACACACAAACAATTGGAT
AAATAGAACGACAAGTTTTTTAATTTAAATGTGATTTTGATATTTCTTAT
TTACAATAAGATAATTTGTTGTGTGTTTGCTTGTACAGTCCCATAAAATG
TGAGGATCACTCTCGACATACGAAAGTCAAACAAAAAATTTTAAAGATGC
ATATCTTTTAAATAGTTTTTTTTTTTTTAATCAAATAATTATCTATAATA
TTCCTTTTTACAATGGCTGTTGAATAACTTATAGTTATAAAGTCTATAGA
AAAGAATGTTTTAATTATTTTTTATTAAATTTTTCGAAAAAAATATTTCT
CATCATTTTTGAGCATATGAAAGAAGAAAATATCTCTTTAAAAGAAGATA
AAGGATCTATAAAACCACTTACATAATAAACAAAATGTAATTGAATATAA
ACTTTATTAATTGTAGTTTTATTTATTAAAAAATTTAACAAATTCTTATA
AAGATCCCGTAATAAATAATTCTATATTTCGATTTTTTTATTTCTTGTTT
GTCTGTCAATCCAAAAGTCTTGTCCAACATTAATAATCCATCATGTTGAA
AGATATTATAAATGATAACGAAGAATTAATTGATTAGCACTTCTTCAATT
GGAACCCCTGTCGTTTTTGTTTATTTTTCTTTTAAGTATTTTTAAATCAA
TTTAAAAGAATTTTGCCATTTTTTCCACTTGGACACTTCTACTTTTTTGT
TCCTGGTATTTTTTCCATTTACATTTTTTCCCTTGTCGTTTTTTCCTGAC
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GAAATAGTGTTAACTTTTGAGAAAAATATATTGTGAAACGTTCAAATTTT
AGATTTAATAATCTATTTATTATTATTCTTTAGTAATGATACGACAAATC
TCTTTTGATTGCTTAAAGTCTTGAAACTGAATCATGAATGGATATACTAT
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CTGGGGMCCCGCCTTTAAGACTGTCGGTCCTTGGGACTTTCAATACTGAA
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ATATGGTCCATTTTATTAACCCTCTAGCAGAAACTAAAATATCATCCATG
TGTATAATATTTTTACTAAATCTTCTAGCGAAATTTTTAAAATATTCTAT
ATATATCTATTTTTTAGGATGGTACTTCATTAGTTTCTTAATTATTTACA
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CCAACTATTTCAATCTTCTTTTTTATTGGTGGGATCATTCTTACCAATTG
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