EMLSAT00000000130, EMLSAT00000000130-695977 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000130
Unique NameEMLSAT00000000130-695977
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1020supercontigLSalAtl2s1020:61235..93850 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000130 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000130EMLSAG00000000130-682896Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000000564EMLSAE00000000564-709492Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000565EMLSAE00000000565-709493Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000566EMLSAE00000000566-709494Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000567EMLSAE00000000567-709495Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771031auto771031Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000130EMLSAP00000000130Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000130

>EMLSAP00000000130 ID=EMLSAP00000000130|Name=EMLSAP00000000130|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=298bp
SKKRNNNVGWTLYGTNGTKGDDPDKIYLWSEDEKNSKSCFFWLRSSQQSK
KALERGSSKRSSAKSASYPPSLVTSSSPQSSTHPTGPIEKTPSCSSISSG
EEQSRVSNYSDSTMSIKSVFSTLSFKNRFRNNSIGEESMTSNSTMDKQEL
SAVNIGLYWRTPSPEQTSGKISISIMSCSDLPRRDYGGAVDCYVHLSVLK
DRGRSLRGRNPPLSLSDWSTKTIRHSSNPVFDQTFTLDIPEVDFKSIRLK
FTAYDVDRNTKTSEIGSSLILLRDIKLLTNNIMDQRINTTSFLAQKKQ
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1020:61235..93850-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000130-695977 ID=EMLSAT00000000130-695977|Name=EMLSAT00000000130|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32616bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1020:61235..93850- (Lepeophtheirus salmonis)
TCAAAGAAACGGAACAACAATGTGGGATGGACTCTCTATGGAACTAATGG AACAAAGGGCGATGATCCTGATAAAATATATCTATGGAGTGAGGATGAGA AGAATAGCAAATCGTGTTTTTTTTGGCTACGTAGTAGCCAACAAAGTAAG AAAGCGCTTGAAAGAGGAAGTAGTAAGAGATCTTCAGCCAAATCGGCCTC ATATCCTCCTTCTCTTGTGACTTCTTCTTCTCCTCAAAGCTCCACACATC CAACAGGTTACTTTTAACTCTATGTTAATAATAAATTTCAAATCAAATTC CTAGTTATAAACTATTTTTTTTTACATTAAAACTCATGGATTATATTCTA TGCTTGTGTATTGTCTGTGATTGATTTTATATATATACATATCAAAAACT TATATACGAACAATAGTCCCATTCATCATACGTAACAATGATTTCAACTC ATTTTCTTTAAAGGGCCCATTGAAAAGACCCCAAGTTGCTCCTCAATATC AAGTGGAGAGGAACAATCTCGAGTCTCAAACTACTCAGACTCAACTATGT CCATCAAAAGTGTTTTCTCTACATTGAGCTTTAAAAATCGATTTCGAAAC AATAGCATTGGAGAGGAATCCATGACTTCAAACTCCACTATGGACAAACA GGAGCTTAGTGCAGTTAATATCGGCCTCTATTGGAGAACTCCGTCCCCTG AACAAACTTCGGGCAAAATATCAATTTCCATTATGGTAAGTAATACATCA TACTTAAATGTCATATATTGTTGAGATTTGATTGGGGTTTGAAGTATCAT GAGAAGAGATACACTCTTTTGTTATCAGCTTTTGTAGATCACAATTAATT ATTTAGATGACACGTGTAAATACTCTTTTAAGTGATAGCTCAATGTTTTA ATGGACCTTTCATACAATTGTGAGGAATTAATTCAATGATACTTTAATTA ATTATTCTATATTTTAAATGTCTGCATTAAGAGTTAAAACCTCAGTTTGT TTCATTTTTAACAATGAATTATTTTAAGGCAATTTAGAATGACAGAATTT CAAAAACTCGCATAGCAGTTTTTTTTAATTATTATTTTATCGACACCTTC CTTTAGAGAGACGAACACTGAAAAGATTTAAATCAATTAATTAATATTAA TGAATTTGAACTTCATTTACATACAACTCTAGTACTAAAATAACTGCCTT CATGTATAACTCATTAAAAAAACAACAATTGAATTTTAATATTTGTAACT TGATCTTTCAATAAAATACATTATAAATTACTCCACACATACATTAATTT ATAAAAATCCTTTCTTTGATGGTAACTTTTATTTATTTCAAAAAAAAGAA GTTAAGATAATATTTCAAGAAGGTATTTTAATGTTTGGATTTATTACAAA ATTTGAAGGGGGCTTAGGTCAAGTGCTCCTCTTTTTTAAAATCAAAAGAA AGAAGGAAGGAAAGGCAAATGAAAATAAGTTGTGTGAGAGAACTTTATGA AGGTTGCGTATATTTTTGGTATTTGATTTACCTACAATTAATTTTATATC AATAATTGTACATTGATTTTGTCAAATATTGATATTATTGTTTTCTAGTC GTAAGTGATCCCGTATTTAATCCTTTTCAGTATATTGTTTTTAATGTTCT ATCTAGTTAGATCTTCTATTATCTTTGCTACAAGTATAAAAAGGGGTTTT GATTTTCTTTTTCGCTCTCTGCATCTCCTACTGAGTGTATAAACAGATGT CAATATGTGCTTAATGGCGCAAATAGTGTAAAAACATCAAGATAAGCACA TCTGTTGCATGATATGTACTTGGACGGATGATATGATTTAGATAAAAATG AGATTTTTTAACGATTTTTTATAAAATATGTATAATTAATTAATTGAAAT GTCGGGAATTAGTAACTTTAATTTTTTCATAAAATACAAATTGATTTGAT CCTGCATATCTACGTAATAGGCATAAGAGTATCTTAATGTAACTTCCTTT GTATCGAAAAGTGTATGGATCTAGTATTGCACCCCTATGCAGAGGTACTA TTATTCAATATACACTATCTATTAGAGAGAAAATACAGATTTGTGTTACA ATAAGAGTATGAATTAATATTGATTAGAGAGAGTCTCATTTTCGAAACGC ATTTATATCCATAAATTTCTAATCACCTTAACCCCTTCTCATTTATCATT ACGTAAAAAAAATATTATTTTTTTCCCTATTTCCAGAGCTGCTCTGATCT TCCTCGAAGAGACTACGGAGGTGCAGTTGATTGCTACGTACACTTATCTG TTCTTAAAGATAGGGGAAGATCGCTTAGAGGACGGAATCCTCCTCTTTCC TTATCCGATTGGAGTACAAAAACCATTCGACATTCCTCCAATCCTGTCTT TGATCAAACTTTTACACTTGACATACCTGAAGTGGATTTTAAGGTAAGAT TTTTAGGTGCATCTTGTCGATGAACAACATATAAGTTTAAATATTCTTTA TAAATGCTTAAAGTTAGGGGATAAAGAGAGGGTCTCTTATGAAAACGAAT TTTAATAAAGCAACCGAAATAGTCAATGTAGGATTTAGAAAATATGAGAA AGTATTTTGCCTTCAGAAATTAATTATCTTCTATATTGACTAATAGCTAG TCTCTTTACCAGCTTTTTTTCTTCCTTTTTTTATTGACAATGATGGAACT ATACCTACTTGTTAAGGTCATAACGATATATGTGAGACAAAGAATGTATA CATTGATGAAATATCTATCATAATACATAATTTTTTAGTTACAATTCGTA AATACGATTTTAATATTAAGTGATATTGAATAATTGACGTCATAATAGTC CTTTTGATGGAGTAATAAGTGATATCATGTGTACTAGGACAGTGAAGTAC GTATCTACAAAAATCCATCATTTGTCATACAAAACAACAAGTTTATCGTT TGATCTGTATGTGGTCCTCACCCAAAACGCATAAGACATGTCCTGGCAGA ATGTAAAGATAAAAGAAACCGAAAACAAACTTTCTAATATAGACAATTTG AAAAATGTTTGTGAGTAGAGGAGCTTAGTTATCATGACATTTTATTAGAT GAGCTGTAAGCAGTCATGACAGGAAGGAAATAAACCAAAATCTTACTCCA TATATAGCGAGGACATATAGGCTATCGATATTGCTCATCAATTCTAGTCC GAGTTCAGTAAAGACAAACACTTAAAAGTCATGAGGAGGAAACCCTTATT GTTACTATCCATCTTTCATGAGCACACTTTTATTAAAGTTATTACTTTAT ACCAAGATGTTCCCTTCTGAGGAATTAAATAATAATGATAGAAGTTTCGG AAAATAAAAAAAGCTTTCCATATTTCTAACTAAAAAAATCCGTTCCCGCT TTCTAGGACTCAGAAGCCTAGACTGATATTTTGCATATATTGAGTGAGTT TAAAAAAAAAACCTTTCAACAATAATCCGGTTGTTTTTTTTTGGTTTTTT TAATCTAAGAATCATGCGTTTTTATAATTTTTACACTATGTATTCAAGAT AAATCAGACTTGGACCCTTTTTCTGTTCATTTTTAAGAATAAAGTTATGT GGGAACAATAAAAACTAATGTTTCCCACAACATGGCAAAAAATCCAGTAA AGTCAAAGCTTGTCAATATAAGTTTATTAGAGGGAGTACTCTGCATTAGT CGAAGTTATTAAGTGTTGATTAAATTTGGTTTAAAAATGTAGATATGTCC GAGTACTCCTTTTTTTTAAATATGATGTGCTGGGCTTCAGTTACACACGT TCGTTGCAAAACCTAAAAAAAGTCGCATTCTTTTTTTTTTTGAAGGCAAA GGCAGCTAGAATGAATTTTCTCAAAATTGAGTGGGGATTAAATTTATATT AATTTTAAAATTAAGGTCCATTTCTATCAAGGTTAATAGAAATACAGGGT TATGCCTTCATATAATCGGGCTTACCAGAACTTTCAATTTGATCTACCTC ACCAACTGCTGGGCAAGACATACAGATATGACGTCAAAAAAGTATAAAGC AGTACTCTAACAGTAAAAGTCAAGGAAGGTAATATATGGTTACTGTTGTT AAAAGTTATACTCTTTGACGCCGCTATTAAAAAGTGTGGTGTAAGTGGAG CATTAGTCGGAAAAACGTTATGGTATAACCTTGTAATATCATAACAAACT TGCATTTCTATCAACAAGTCATTCTTATTTAATCTTTGTGTGTGCTGCAA ATTGCACTTAAAGTAGCCTAAATTGATTATGATAATTAAAAAATCATACA TTGACGGATTTTATTTGAAAGACTATATGAGGGCCAATATAAGTCTTAAA TCAAACAAAGGTTCTAAACTATAATTCAAATTCTTGGGTATTGACCTAAA TAAAATTCAAATTTTGCTAAAGTATTTACGAAAAAATATAATAAATGAAA GGCTATATAGAAAATTGCACTCTAACGCAACCCAGAATACCTATTTCACA CACGACAATTTGTAAGTGGTGTTCTGTGAGATTTTTCATAAAAGGTAATC AATTTATATAGTAATTGATAATTGTACAAACAAAATTAGATCCATAATTT TTTGAGGTATATCTATTTAATTTTAGGCACCCTCAAATATAATAATAATA ATACTCATAATCAAGAAATAAATTAATTATATTTGAAAAAAAAATAGTAA TCAGAAATAATAAAAATGAACCACAAAATGAGTGCCGTTCATTTTTCCCT TGTTCATCGTTCATTTATTCAAAAATGATAGGAAATCGTGAACGCCGTTC ATTTTTCTGATCAATCTCCATGCCTGAGATAAATAGATGAGTATATCTTA GATTGAAGCAAGCTTCATTGTATTTCTATTAACCTTGGATTGAAGGACTT TTTAGAGGTACACACAATTTAATCAGTTTCTAAGTTTCAAATAAGAAATA TTTCTTATCATATTGGAGTTTCTTGATGCTTATATGTAAGTTCTTTAGAG AAAAATTAAAAGAAAGTAATGAAATAATCTTCTCTGAAATTCATAAGCAA ATTCACAAATGTTTTTTATATACGAAATAGGTTGCGTGCATATGAATTAC AACAAATATGTTGCGGCTTTTTGTCAATAGATTTCATTAATTATTTCTTT TTTATGCTTCAATGACTATGAGTACGAAGTCAATTTCAATTTTTGGTCCT TTAATATTAAACTTATCATGTAAATTTTTGTAATTTTATAACAAATTGTA TATATACTTACTTAATTTCATAATTATACATTTTTAAAAGATTGGGAAAT GTGGTTACTTTTTCAATTCACTCATCCTGCATGAGCAAGTCAATAAAAAT ATGTCTAATCTGCAAGGGTCCGTCACTGTCTGTAGCTTGTTGTTTAAACT AGTTTTTAAAAAATGTCACAAACTGTGACAAATTTTCACCTATACTTTTT ATTAAATAATAATATCATACAAGGAGTTGTATTATTTTGACACAAGACAG CGGCACTGTCTGTTTCTTTGTTTACAAACTAATATAAGTAAATAACACTC ATGCCTTTTTAATTAAAACAGTCGTGTTATGAATGACTTAAGGCAGTGGT TCTCAAACTATGATACGTAAGCTCCCTCGCATGGTACGTAGAGAAAACAG GCATCATAAATCCAGTTCGGCCATAATGTTGATATTTTCTCAGGTGGCTC 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TTGTACTGGTTCTGATTTTGGACTTTTAATTTACATTCCTTGGATAGATG GATGGATGGAGGCTCATAAGGTCTAAAAAGTGTAGGGTGTCTTGGCCCCA AAATGTCCTCACTTTTGGAACCCGGATTTTTGAGCTGAAACCAATCAATT TCTATCTCTGGAAGTGGGTCAAGCATGAAGCCTGTGCTAAGTATAATTCT TCTGTGGAGCCTTCGAAGAAGTCCATTACACAAAAATGGCGAAGTATGAT CTGCTTGAGGTCGCCCGACCTGCCAAAGCTTCTGGCGTCATGGGCCGAAG TTATCAAGAAAGGCGGATTTCATTATAAATAATTAATCTCATTAAATGAC ACTTCAAATAATAAATAATATATGGTTTGTTCGTTATAAGGCTGTAAACA TTTTCCCAATTTATCTGGACCACCCTGTAATATACGTTTGCCAAATAAAA TAAATATTGTTATGGACATACGCGAAATAAATAAATTATTTTGCTTAAGA GGTGAAAAGTGATGTGTCTATGTAGCAAGACAATCTTTTGTTAATTTATC TCTGTCACACATCTTTAAAAAAAAAATTTAATCCTGACCTTCAGTTTGTA CCTACTTTTATATTTCGTACAAGAAAAACGCTTTACACTAATTTAGTTCC CCTCAAAAATTGTATAACATTTTTTCCCCCTCTTTTATTATTATTTTTAT CTCTACAAAACCTCCATTTGTATGTTAATCAAACCAATTATGTATAAAAA ACTTTCTTTTTTCCAAGCATTTATTTTTGTACAGAAAAAACTAAAAAATT AATTCGATAATAAATATCTGATTGTACAAAATAATTACATTTTGTGCATG TATGTTATATATACATACATACAAGATATACAAAAAGAAAGAAAGGAAAT CTACAAAAATAGAAATAATTTTTTTTTTTGTCAGATAAATGTTTTACATA TATATTGTTTGAATAAATAGACCCTAACAGTGAGGTTCTATTACGTCACA AAAATGGAAGGAAAATAAGAGGGGAAAAGAATTTGAAGTTGAATGGATTA TTCTATATATACATTTATATGTATAAATATCTAAATATTTACGCCTATAG CTTCAAGAAAAAACATGATAATAAAGCAGAAGAGGAAGAAATATAAAAGT ATCAAGTACCCTTTTGAAGAGGAAGAAAAAAAAAGGAATTCTTATTCAAG AGCTAATAAAAAAAATATTGATATGAAGTTACTATGTAAGAAAAAGTAAT TATTATTTTTTTGTAGTTATGCAAAGTTACTTCAGTTTGTATAAAAAGTT CCGATCATTCATTACATATCTTATTTTTCCCTTCGTTACCTCTATTAATT GTATCTCTTACACGTAGTGTTGATCGGTTAAAAAAAACTAAAAATACTGC AGCCCTATCATTGGTGTCCCAAAACAATTTATCAGTCCCTGGACTTGTTC TATATCGGACTCTTATGGAAACTACAGCAGCTGAAATTACATAAATACTA CTAAAGAGACTACAAAGGAAAGAGAGGAGACCAGGCAGTTGAAATAAAAA CTAAACGTAAACAAAAAGTATCTATGTGAATTATATTCAGGATTCATGCA ACCTCGATCAAAAATATAGAGTATAAACTTGGACTGTATAAAGGGGGACG GACTTGGATCTTATTTTCTTCTATACCATAGTTGGTATAGAAGAAACAGA AGAAGATGAAAGAAGTATGAATAGTATTATGTAGTTATCTCGTAGTATTG AAGGGATATTATATTAAGTAATTTATGAGTATTTTTCAATAAATTTATTT TAAGTAAGAGAAGATATATCAATTATCATTATGTTAATATTAGGTATATA TTTTTAATAAATGAATTTATACTAAAAACTTAAGAATATTAAACAAAAAT 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