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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1020 | supercontig | LSalAtl2s1020:61235..93850 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000130 >EMLSAP00000000130 ID=EMLSAP00000000130|Name=EMLSAP00000000130|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=298bp
SKKRNNNVGWTLYGTNGTKGDDPDKIYLWSEDEKNSKSCFFWLRSSQQSK KALERGSSKRSSAKSASYPPSLVTSSSPQSSTHPTGPIEKTPSCSSISSG EEQSRVSNYSDSTMSIKSVFSTLSFKNRFRNNSIGEESMTSNSTMDKQEL SAVNIGLYWRTPSPEQTSGKISISIMSCSDLPRRDYGGAVDCYVHLSVLK DRGRSLRGRNPPLSLSDWSTKTIRHSSNPVFDQTFTLDIPEVDFKSIRLK FTAYDVDRNTKTSEIGSSLILLRDIKLLTNNIMDQRINTTSFLAQKKQ back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1020:61235..93850- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000130-695977 ID=EMLSAT00000000130-695977|Name=EMLSAT00000000130|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=32616bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1020:61235..93850- (Lepeophtheirus salmonis) TCAAAGAAACGGAACAACAATGTGGGATGGACTCTCTATGGAACTAATGG
AACAAAGGGCGATGATCCTGATAAAATATATCTATGGAGTGAGGATGAGA
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TTTCTTATCATATTGGAGTTTCTTGATGCTTATATGTAAGTTCTTTAGAG
AAAAATTAAAAGAAAGTAATGAAATAATCTTCTCTGAAATTCATAAGCAA
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TATATACTTACTTAATTTCATAATTATACATTTTTAAAAGATTGGGAAAT
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ATTAAATAATAATATCATACAAGGAGTTGTATTATTTTGACACAAGACAG
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GCATCATAAATCCAGTTCGGCCATAATGTTGATATTTTCTCAGGTGGCTC
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TTATATTTATCTACGTATTTATTTAATATTATCAAAATAATTAATAATAA
AAGTTATTTTAATTCCTTTAGACATTCAGTACTTGATTGTAATAATTCAA
TTACATCTTTTATTTCATAACTATTCTGTACTTAAAGTAAAATTGAAAAA
ATAGCCAAGTTGTCGGTTAAAAGAGGAAGTGGAAAAAAAGCGCAGATTTC
ATGTATAGTGCTTCTTTACTCCTTGATACGGCCATTCTAGTTAAATGACT
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TAACGTTTCATTAAAGCAGCTGCAACGATCGAGGATGGGGACTATGAAAT
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TGTAACTGAATATAGTAGAAAAGGAAGTTCTCTACTCAAGAATTAAATCA
TAATTCATTCCTTTAATTACTAATTAAAAAGTAAGCGAGCAAGTTAAATA
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GTAGAACCATCACTTTCTTATTGTTGAAAAGCTACATTTAATCATATTCA
ATTATTTATATTGAGATCCGCCTCTCTTGATAACCTCGTCCACACGGCAT
CAGAAGCTTTTGGCAGGTCCAAGCGACCTCGTGCAGATCCTGCCTTGTCA
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GATGGATGGAGGCTCATAAGGTCTAAAAAGTGTAGGGTGTCTTGGCCCCA
AAATGTCCTCACTTTTGGAACCCGGATTTTTGAGCTGAAACCAATCAATT
TCTATCTCTGGAAGTGGGTCAAGCATGAAGCCTGTGCTAAGTATAATTCT
TCTGTGGAGCCTTCGAAGAAGTCCATTACACAAAAATGGCGAAGTATGAT
CTGCTTGAGGTCGCCCGACCTGCCAAAGCTTCTGGCGTCATGGGCCGAAG
TTATCAAGAAAGGCGGATTTCATTATAAATAATTAATCTCATTAAATGAC
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TTTTCCCAATTTATCTGGACCACCCTGTAATATACGTTTGCCAAATAAAA
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AAAATGGAAGGAAAATAAGAGGGGAAAAGAATTTGAAGTTGAATGGATTA
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GTATCTCTTACACGTAGTGTTGATCGGTTAAAAAAAACTAAAAATACTGC
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GACTTGGATCTTATTTTCTTCTATACCATAGTTGGTATAGAAGAAACAGA
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AAGGGATATTATATTAAGTAATTTATGAGTATTTTTCAATAAATTTATTT
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CTACATTATGTACATGACACCTCTTTCCCTTATAATCTCTTTAGTTACTA
CTAACTACGTCATTTGAGTAGTTGCAGTTTTACCATCATTCATAACTTCT
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GGMCTTCCCCCCCCCCACTGTTTCTTTTGAAGAAAAGGTTGCGTGATACT
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TTTATAAAAGTTATAACTTGTATAAACAAATTACACAAGTTTAGTTGGAA
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CTTTTCAGTTAGATTTATTCAAACTACGTAGTTATTATGTTTATAAAAAT
CATCTAAAGGTGGGCAATTGAACTTTATAATGTGTTACAAAATATTGATA
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TAGTGTAATTGGGCCTTAAAACATTTTAAAGATTGTATATTTTTCAAAAT
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TTATCTTATCTGTCAAAAACAAACTAAAATGCTGAGATGTGTACCGACAT
AATAAAGGAATAAATTTGAGAATCGAACTATTATAGAATTTTTCATGAGA
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AGAACTTTCTTTAGATGGTTGACAAATATCCTTTAGAATATATATAAATA
TTTTCTGTTGATAAAAAGGATATTCGAACGTTACTTATAGTGGCAAGTAT
TTTTTAACGTTGAGTTACACTTACATCCTACATATAATCTTAAACAATTC
TTGAGGGGATTGTTCCATATTTATATGTGTTTTTCTACATTAATTCTTGA
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TGTTCATATTACATATATATGTGGTGGCTGATGGTACTTCCTTCCTTCCT
TCTTTCATTCATCCTTCCATTGTTTGTTACTTGACTTGACATTGAGTGAT
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AGTTTTTGTTTATTGAGGAGGAGCTTTTTAAACTTAGGAAGGCCGAGCTC
ATAAATTTGATAAGGGATCATCTCATCGATTGTGGCTCTGATTTTAAGTC
TTATCAATTTGAGGACGTACCGGAGTCGTTGAAGCAGTCAACCCGTCATT
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GCAGTCACGCTTCTTTAAATTTTTGTGTCGTGGATGTGAAGTGTCTTATG
AGGATGACATTTTGCTCAGTTCCTTTCTGATCTTTATAACCTCGACAAGG
TCATGCCCCTTGGAAGATGTATGGAATCCATCGATATTCATTCTGTTGTG
ATGGAACCTCGTGCTTCCGCTTCTGTTTGTATGTCGGAGTAGAACGACGG
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AAAAATTTAATGAATTATATATGCGAGTATATACAAGACATCGGTCAATA
AGTCTATATAGCCTATATAGGAAAAAAAAAAAAATCCCTAAATTCATTTT
ATTTATCAATATAATCTCCTTTTAGAACAATACAATTATTCTAACGTTTC
TCCAGCTTTTCGATATTGAACGATTTATCGAGACTTTCAAAATATACTTC
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TCTTTTTAAGTTTTGGGAAGAGCCAGTAGTTGCTTGGGCCAGATCTGGAA
AATACGGTAAGTTCAGTAGCAATTCGAATCCAAATTCGACCAATTTTGTG
TTTGTCTTTATTTACTTGTGACAGGGTGCATGGTCTTGGTGAAACAGCAC
CTTTTTTTTTTCTTCAAATGAGGTATATTCTAGGTAATTTCGGCCTTCAA
AGGATCCAAAAATCCGATATAATAGTTGCTTTTGATTGTTTTTGATCTTC
CAAGTAGTAAATGAATAAAATACATCTGAATCCCAAATACAGAGGCCATG
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CCACTCAACAGATTGCCATTTGATTCTGTAGTGAAGTGGTGAATCCATGT
TTTTTCCATTGTGATGTACTGATGCAGAACCTTCTCCTTATTTCACGTGA
ACATCTCCAAATCATCTTCTCGTTGTTGCTTTTGCTCTGGTGTGGGCAAA
CGCGGCACTCATTTGGAAACGGTTTTTTCATACCCAAATGTTCGTGTATG
ATGGTGTAAACATTACCTTTTGATAACTTCAAAGTGCCAACCATATCTTA
CAACTTCATTTTGCGATTGCCCATGATGATTTTCAGGTTTTTTTTCAATG
TTTTCCGGAATMCCTGCCTCAATTGACCACCAGGACGTTGAGCATCAAAC
GTGTCCGTAGGACCACCTTTGAAATCGACAAACCATCGTTTGATGGATTC
TTTCGATGGAGCAAAGTCCAGGTAACATTTTTTAAGCTAAGCTTGTGCTT
GAACGGTGTTTTTCCACATCAAAAAGAAATGATAAATCAAGACACAAAAT
TGTTTTGAATCCATCGTTTTTAAAAATCACAAAAGTAGCTTCACTTAAAC
TACTGTAACTCGATAAATAATAAACCAAACGTCATGAAATTTTGACAGTA
ACCTTTTTAATGTTTGTACTTCTGAAATAAAATATTGTTCTTCTGTTAGT
GGCGCCATCTGACAGCTAGAACCGGGATTTATTGACCAATGTGTTATATA
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TGAGGATTAACAAGTTTGTCGTTAGTCTTAGTATTCCTTGTATGTGCATA
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TAATATTAAAATCCTACATATTATTTTATGCAATACTNAATACTGTATTA
TTATAAATAATATTTTATTCAATGGGTAGTTAGACATTTGTATTTTTATA
TGATAGCCAAAGCTTCTTCATAAAATAATAAAATAGCCAATATAGATATA
TATATATATATACGACGAGGGATGAACAAGAAATTCTATTCCTGTCCTTA
TTAAATCGGAGCACAAGTAGTGTGTTGTCCAGTCTTAGGACCTATCTTAT
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GCAGAATTATTTACCGATTTTTGTTCAGAAGATATTGCGGACAATAATGA
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GGCGTCCATGGAGGCCCAGGCCTTGTTTACAGAAGTCTTTAAAGCATTTA
TGTTATTGTGTCGTTTTTTGCAGGTCTTGGTCTCCACGTGCGCCTAGATA
GAAAAGTCTAGTGGGTTCAGATCTGGGCTCTTGGCCAAAAGTTTATGTTG
TCCTAGAACCACTCCTGAGCTTTCTTGGAAGCGTGGGCGGGTGCTCCATC
TTGTTAAAAACAGGATTGACCGTAAAAGTTTTCTCATCTGAAAACATTAT
GATGCGTCCAGATGAGCTCTTGATATAATTCAAGATTTTCTTGGCACGCT
CAAGTCTGACTTCTCGCTGACGCTCAGTTAGCAGAAAGCGTTGAGTACGC
CTCAGGGACTTTCCTCCAGCCCTTTTCAATGCTTTCTAAGCATATCCAAA
TTAGTGCAACTCACTTCAATNGAAATTATCTAAAAGTGACGTCACTACGT
CGGCTAAGTCAGCTATCGCCAACCAGAATTCCTTAAAAGATCCTTGTTGC
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GGAAAAGTTGACTAGTTCATACCTTTTTTTTTGTAAAGGTGACATTTTTA
AGAACTATTCATTTATATGATAAATTTTGAACTACTTTTTTGTTTCAGAC
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AAGTTTTTTAAGGATTTATCTATTGTGAAACATTAAGCAGCTTGACAGCA
TATTTTCGTTATAGGACAAATTTATTAAAAGTTTCCTACCAAACACTGTA
TTTGACACAAAATTGTTAAAGGTCCTGAATGTTGTTTCTGAAAAAGACCC
AAGGGAATACAAATATATATTTAAAAGGCATGCTTGACCATATTCATTTT
ATTTTTGGAGTTATTTTGCATTCAAAAACATATAACAGACACATAGGTTT
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GATTTTTTTAGAATTTTTTTTTTGTATTTTGACCCTTTTTATAGGTTTGA
ATCAACTTTAGAGTTAGAAAAAAATCTGTAGTGTATTGCCTGCAAAATTT
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TGCTCAAAAGAAACAG back to top
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