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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1023 | supercontig | LSalAtl2s1023:177971..188369 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000151 >EMLSAP00000000151 ID=EMLSAP00000000151|Name=EMLSAP00000000151|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=857bp
MDTSNSAMICFILGVILIDLSDGILKSTCTLNKDPGTCAKNITQYYFNKD
LKSCESFTWGGCEGNKNRFDTVLECNDVCQPSSKELSDNHPELSQKKKTQ
ESSDEDYDYYNLNFIQENKNEEVARNISDRDGSICGLPVEIGNCTKHSPR
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QCTLPPKNPSCHELRSKFFYNPKKNKCVKRLHCKDNPNGYXXIKDMLKAM
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YYEKDTGACHSFIYSGCGGNTNRFDSQRDCERICSPYFVEKEEERVEFHN
QKESKRY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1023:177971..188369+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000151-695998 ID=EMLSAT00000000151-695998|Name=EMLSAT00000000151|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10399bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1023:177971..188369+ (Lepeophtheirus salmonis)
CGGTAGTGTTCCAGAATCTTCATGGTACAATAGAGAATAGAGTCTCCTCT
TCTTTAGTCAGCTAGAAAGTAAACAACTGGGCACGGTGCCAGGTTAGGGC
TGTTTCTCAACAATCAATTTGTAAGTGATGATATAAGACTGTTCTTGAAA
TAATAACTTAGAAACGAACTTCTAAATCACTTAATTCAAAATGACTTCAT
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TGATACCGTACTGGAATGCAATGACGTTTGTCAACCCTCTTCAAAGGAAC
TATGTAATTCAATGATTTAAAAACTGATAAAATGATTTAATATTACACTA
TGGTTTCCTTGTGCATAATGCCATTTTGCCAACTAACCACTTTGTCCAGC
GGACACATAGTCCAAAAATTACATTAACCCATTACATAATTATTTGGAAC
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ATAAGATAATTATACTTTAAAAAAATTGCAAAAGATCCCTAGAACCCAGA
TAGAAGGCGGTTAATTAATTAACTATCGCCAGAATCAGCAGTATTTAGTT
GTAAGAAATGATTGGCGGACATATTTTTCATTAAATTATTGGATTAAAAA
TTGAAATAACTTATTCTGATAGGTTCATGTTGTTTTTATATATGCAAAAT
TTTAAGAAAAAATATCATAATCTCTAGTATAAATGCCATTATTTGCGATA
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ATTTGGCCTTCCCCTTACATATTAGACTTTTGTAACGTTTTAATTGAATT
GCAGATCTATTAATGGGAAGGCCATTGTTGCTTCTCAAGCTTTTGCTAGC
TGATTCTCTCAAAAATTGATGGAAAACGGGTGAATATGAAGGAAAATTAT
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TAATTATTACAATTTTTGGCAAATAATAAAAGATTTTATCAAGTAAAATT
GAAGTAACATAAATGTAATAATAATTACATAGTTTTGCATAAAAATCATC
ATATAATATATTTATTTGGAAAAGTATAAAATTAAGGAACATTTGGCAAA
ATGGTAATTGGCAAGAAGGCTTTAACCCAAGTGTCCCAGCAACAATTATT
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AAAAAATGAAAACATCCAACAATATCAACGTATTTCTTAAGACTTTAGGA
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ATATCACTTTTTGTGAAAAGTAAAAAATTCGAATAAAGTTCGAATGCGTT
TCTTTTTATAAAAAAATATAGTATAAACAAAAGTTTGAAAAATTTCTATG
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ATACAGCTTGTTGGTAGAAGTATTAAATTTAGTTGAGTTAAACGATGATC
AAATATTTTAATAAAATGTTGCCTTTTTGCATATCTGTCTGTTCATCTGG
GTATCACAGCCAATGAGCAGTTATTGATAGCTACAAAAATTTGCAAATAC
GTTTTTTTACTTAGTTCAACAAAAAAAGTTCCAAATTGGMTGACTTTAAC
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ATAAATAAATGACCACCAAGGGGATTTGTGGCCGACAATAATGACATTAG
AAATATATAATTTTTCAAATTAATAAGTAATATTGCAATTAAGCTTGCTT
CCTTCTTGGAAAGTTATTTGAATACAAACTCTTTCCATTTGCATGCAGGC
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AAGTTCCATTATTCAAAAGATGAAAAAAAAATTGCAATCGATCAATAAAT
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GCACCATTAACTTTGATAACGAATATCTTAGAATTAAATTTCTAAGGGAC
AATAAGTGGGAATTCTTAGAGCTAGTCATAATATTTATTGGTGCTGCTCC
TAAGCGAGGAGTTAAATTTAAGATACTTGATGCAATGTACAATACCCTGT
TGGCTCTCAAAAGTCTTCAAAGAGTATTTAAATCTAGATGTTCATATCTG
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TTTTTATAGTAAGAATATACATAAAAGATAGATTAATGCATCTAAGGCCT
CTGACTCTCCTTTCAAATACCTTTATTTTATGAAGTCATTAATAAAATAC
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TGTCGAGTAAGTTTGACATTCGAAAGGCGGATGCTGAGTTCTTTAAAAGT
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AGAATACTTTTGCACAGATAAGACAATAAATTTTATAAAAAATATGGAGC
TTTTTCATGTATTTTTAAGCTGATCCAGCATCATGGAATATTAGGAATGA
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AAATGATGAAGAAATAATATGACAGTGATAGTCTGGGAGTATATAAGAGA
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CGGGCCTTCTTTCTGTTTCTTTTTGCAGGATACAATAAAGGTAACGAGGT
GCACTCTATGTATTTTATCTAAATTGACAAAATACCTCAAGTTTAAAGTA
AAAAGTGTTTGGCCAGAATTTATTTATTTATATATATATATATATGTCAA
TCCTAGCTATGAATAGCTAAAAATATTGTTAGGACTGAAGGACCGACGTT
ATCAATCATCAGGACGATTGAATAGTAAAAAAGATCGGTTTGATAAAAAA
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AATATTTCTTCATTAATAAATATAAAGTGGAGAACATACACACTTCTTGT
CGGAACTTTTCATGATTCTGTGATGAAAAAACCTATTTTTTATAAAGAAA
ATTCTATTTTAAAATCACTCTCTGTGGAGCATGCAACTAACCTTTAAAGT
AGTATATTATAGAAATTATGAGCGAAAAACACAATGGCGTATTATAGTGT
AATATTTTATCAACAAAATTTTTTTAGCAGATAATCATCCGGAATTAAGT
CAAAAGAAGAAAACTCAGGGTTGGTATATATTGTAGTAAAATACATGTTT
ACGAAAAAGGTTAGTTCTTCTTCTCCATTTACAGAAAGCAGTGATGAGGA
TTACGATTATTACAATCTTAATTTCATTCAAGAAAACAAGAATGAAGAAG
TAGCGAGAAATATTTCTGATAGAGATGGATCAATTTGTGGCCTCCCCGTT
GAAATTGGCAATTGTACTAAACACAGCCCACGGTTTTTCTACAATATGCA
ATCTGGAAGTTGTCAATTCTTTATTTGGAAAGGATGTGTCAAGAATGAAA
ACAACTTTATTTCAATAAAAAAATGTTTAGACAAGTGTCACGGAGTAGTT
AAAAAAGAATCCTCAATTACTCAAGTAGAGATTGATCATTTAATGGACAA
TCCTTTGCCATTAGAACAAGTTTATAAATTTATTATTTATCAACTTTTTA
TTTTAATTTAATAATTTTTAGAGCATATATTAAGTTTATTTTGAAAATAT
GAATTGTAAAGTTTTATGTCTATGGGATGACGAGCAAATATTTTATTGGC
ATGATAATTTGTAAGAATTATTTGAAATTTTATTTATCATCTTATTTCGT
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CTAATTATATACAAATGTTATGATTTAAGACCAATTTTGTTGATTTTATT
GGTTATCTTGTCTTTTGAATAACATTCAAACAGCAACAAATAATGAGCTA
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TGCAGTACTATATTTCAGGGGGGGGAGAGGATTTAGTTTTTGGAATTTTT
TTTTTTTTAAATTTGAAAAATTTAATTTTTTGAAAAAAAATTTCAAATAT
TAAATTTTTCGCAGAAAAATTTCTAAAATCCATAACTATTCATACCAAAT
TCAAAAAGATATAGTTATTTGCAAACATCTTAACCTGTTTAGAAAAAATA
GAAATTTTTTTTGTAAAAAAAATTCTAAAATTCCATTTCAAATATTAAAT
TGCTTCAAAAAATTTCAAAAATTAAATTTTTCAGAGAAAAACTTCTAAAA
TCTATAGCTATTCATAAAAAAATTCAAAAATTTATAGGTACTCACAAAAA
TCTAAAACTGTTCAGAAAAAAAAGAAATTTTTTCGTAAAAAAATTTATAT
ATCTCAATTTCAAATTTATTTTTCGAATATGAAATTTTCCTCCAAAAAAT
GTAATATATAAAATTTTATTTTTGGAATTTTACTCCACAAAATTAAATTT
TTGTGAACAGCTGTGGACTTTTGAAACTTTTTCCGAAAATTATATATATA
TATATATGATCTGGCGGATTTTCCTGATAAATATAACATTAAAAATATAA
AGATAGAGAGGTTTTGAGTCTAACATATTAAATTAACTGATATTTTGCTC
CAAGTTCCTATTATAACCATGTTTTAACTAGACATGAATTGGCCATATAA
AAAATATGTTAAGAAAATTTATATTTCAACTTAACTATTAAAATTATTTT
TCCTTTTGTAGGTAACTTCTCAATGCACTTTACCCCCAAAAAATCCATCT
TGTCATGAACTTAGAAGCAAATTTTTTTATAATCCAAAGAAGAATAAGTG
TGTAAAGCGATTGCATTGCAAAGACAATCCAAACGGCTATGANNTCATTA
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GTTACATCAAAAAAAAAAAAAACTTTTCCTACAGAATATATTTCCAAATA
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CCTATTGGTAAATATGTCGGTCTGTTCTTGGAGCCGGTCCTTAGCTGTCA
ATCCTTGTAACTTTTCCTAAGTCTGTCAATGGTTTATTAAGACAAATAAG
ATATATCTAAGAGAATTTAATANNGTAAAAAAAATTACCTGTTTTCATTA
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TTTTTGGATATAAAAGACTTATATCGGCCCTGATATGACCTTCCAACCAT
GAAATCTATCAATGTCTCATTATTTTATTGTGACAATCATTTTAGTCTAC
TTTAAGTTCAATTTGCTACATATCTAAAGGATTAATCACAATAGCTTGTA
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CTCAATTTGTACTTATTTTTTTTTTTTTTCGTCCTAAATATTTCTTTAAA
AAGGTGAGGGGTTTTCATAAAGCCATTCACCTTTTTAAGGAAATGATTTT
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TTTTGATTTAACAAGTGACGATTTTATTAGACAAGGTTAGCATATTCAGT
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ATGAAGGTCTAATGSCTGSCATATTTTGCTATTGATATTTGCCACCAAAA
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CCAAAACTCCTAATTATTGTATTATAAATAGATACAATTTTAAAGTCATC
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TCATTGCAAAGTGAAACCGGGCCCTGTGAGGAAAGCGTAGTACAATATTT
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ATACAGAACTCGTATAATGATGTATGAATTTATATCTTTAAGATATAAAA
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CAATATATTAATCGAAAAACTTTTACAAGTACAGAGCGAGAAGATAGTAG
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CAATATATTAACAAGAAAACTTTCTCAAGTCCAGAACAAGAAGATAGCGG
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CAAGTCTAGAACAAGAAGATAGCACTAATGGCAATCCCTTTCAACCAAGT
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GGTTTTATTACAATGCTAATTCTACAAAATGCGAGTCTTTTTATTTTGGA
GGATGCTTCGATAATGGAAATCACTTTAAGGAATTAGAGTCTTGTATTAA
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GCATGTTATGTTAATATAAATTGGATTATTACAGAGCTGTATAGAGCCTC
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GATACTGGTGCATGCCATTCTTTCATATATAGTGGTTGTGGAGGKAATAC
AAATCGATTTGACTCTCAAAGAGATTGTGAGAGAATATGTAGTCCTTACT
TTGTGGAAAAGGAAGAGGAGAGGGTGGAATTTCATAATCAAAAAGAATCA
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ATTAAGATCCAATAATGCGTCTTACTTATTGCACTGTTGATCTTCAAATC
TATGTCTAGATATAGATGTTGTATAATATTTTAACAATGTGTTTTATTGA
TTTTGATTTGATTAAATAAATCATGACAAGGAAAAAAGTCTAATTCCAA back to top
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