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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1029 | supercontig | LSalAtl2s1029:201095..215176 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000196 >EMLSAP00000000196 ID=EMLSAP00000000196|Name=EMLSAP00000000196|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=224bp
MSYPPPAEPINGNGAPPQGGYGYPPQTSSYPPSGASSGHHPTPPTHETSV
RVSTDPTPGTHVTQIQLDIGYFKTIPGIIKIVELVLGVLCMILASPARTF
GYIYSGNKYGIYLYGEGQNHWFLFVVVTSFIITLLWTFFYFLQLRESIKN
NLPFSWLKLEYFYTLITTILYIIAFIVILEGFGYCPGATTCDTRIAAGSF
AIFNSIAYGIGTFLLHQEYRSQQM back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1029:201095..215176+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000196-696043 ID=EMLSAT00000000196-696043|Name=EMLSAT00000000196|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=14082bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1029:201095..215176+ (Lepeophtheirus salmonis)
TAGAAAAACGCATGTGTCTATTATATTTTTCTAGGCGTGCTTGCTTGATT
TAACGTAAAGTAATATCATATTTGCTATTCATGTTACTTGTAAAAGTGTG
TGGAATAAGTGAAGAGGTTCAACTTACGTACTTACATATATAAGAGACTC
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TTTGAATAATTCAATTATAATTTATTGAATTATTATTATTACATATATAT
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GAGTGTTTTTTAAGAAGAATAAGTTTTTTTGCAGTGATTGAAGGTGAGTC
AGATCTTTAAACTTCTTTTAGAAAAAAACCCTCCCTTTAAGGGCTATTTT
CTGTACATGTGTATTGTGTACCAATGTTGCTGCTCTAGGCAAATTAATTG
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AAAAGGTAAATACTCATAATAATTCTATATTGTTCTATGAGCCCTTTTTG
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AACAAGGCTACTTGTAGCTTTTATAAGAGAGATACATATTATATAGTAGC
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CGTAACTAGTGTCTATATTTTAAACTTGATAAAATGAAATGAAAATTCGA
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TAGAATTAAAGTTAGTTTAATGAAAAAACAGATAAAGGTACACAAACAGA
AATAAATTTAATTGAAATTACTTATGGATAAAGTATTTTGATAAGTTACT
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TGATATATATGTGTATATATATAAACTCTTCTAAAAACACTTGATTATCA
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NNNNNNNNNNTAAATCAAATGAACTCGGACATGGTAGATATCAGAGAAAG
ATTTATTCAATATACATTAATGAACATTATTTGTGACTTTAGCCGCCATT
GGTGTCAAGCTTAACTAGCCTACCGCTCCTTGAGGCGGATTCATTTTCCA
GGCGCTTGCAATTGTGTGGTGGMTGACCGCCAGCTGCTTGGCKGTGTCCG
AGATGTCATTGCGGCGCAAATCAAAGTTGCAATCTCCAACCTATTTGGTT
TCATTTTTGTCCAGAGGTGAGATATATTTGGTTATATTCTTTTACAATAT
GTGTTGCTGAGACCAAATAGAAAACGCATTTCCAATTTTCAAACAAAATT
GCTTTGTATGCTTTAGGACACTCTAATGTACATATGAGGATGTTATTTTT
ATTACAATTTACACCTCTCAACAATTTCTTCAAAAGTGTAGTGTTTTTGG
TATCTAGCTCATTCTTCCCGGCCGTGGGACTATTCTTCATTTAATTAGTA
AGGAGTTACTCATAACTTGATCAAAGCTAATTTGAGTTAAACCAATCACC
CTTCAGTACTAATAAGGGAAATAATATTTAAAAAGATATACACCAGGATG
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GTTATATGATTTTACGGATAGAAAATGAATTACTGCAATAGACAAGAAAN
CATTTGCACTAAAAAAAAATACATCCACTTTAGTTACTAGCTATTAGTGG
ATAKTATCATTTRATTTTTACCAATTAATATTTCTTATATATTGTATGTA
TATTTTATTAGTGATAGAACGTTGGGCATTTGTCTGATCTAATCTACGAT
ATAATACTTATCAACTAATAATTTTCGTCGTAAATTGATTAGCTACCCAA
TTAATTTACCAAAAATCTAATTCAAATTCAATCATTGCCAATCATAATTA
TCATTAAAAGGGAATTTATTAATTATGTTCCATACCATTTGTTGATTGTA
ATTTATACCAACAGCTTGTACAAAATCTCAACTTCAACAAATCATACAAA
TACATTTATGTCGCTAACAATTACACGTTTTGTATTAGTTGTAGCTTGTA
CAAGTTGCTACCAAAAAATAAGATGAAGAATTTACAAAACATTGGGTAAA
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TAATTGATATCAAGTGCATATAAATATCTAGGAACTCAAATGTTGGCCAC
ATTCGAGATCCACTGCTTCTTCACTAAACTGTACGGGTCTGTATCAAGAG
CATGAACGAACTAAAAAAATATATATTATTCACAAGGAGTATATATACTA
TGTTATTTTTTATTAAATAATATTATCATTCCGGGAGTTGTATTATTTTG
CCAAAAGACAGCTCCACTATCTTTCGCTTTGTTTACAAACGAATAAATGT
AAACAACTCTTATGTATTAGTTTGTGTTTGGTAATCTAAGTTTTCCATGA
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GTTTCGCTACGTTAATGCGAAACACAAAAAACACACAGGACATGAAAGAT
TTTGGGTAGTTACTCTGCTGTAAAAAAAATCTTCAACATTTTCATATTTT
GGAGAGGTTATTTAAATTTAATGAAATTTTCTATAATCATATACTTACTA
CGGAAGTCTCCCCTCCCCATACAATTTTTATAGGGAAATATAGTTCTAAT
GTTGATAACATTATGAATATGTAACTATTTATTATAGACAGTTTAATTCA
GCAAGTTAGTTTATTACTAATGTTGTTTCCGTATCCTGCAATTATATAAT
GCTAGAAAGGTTAAAAGTCCAAAAAGAGTTAAAAAGATTAAGTTACATGA
TATGATTAACTGTATTATTTTTTCATTTTATTATAATAATATAAAAAATG
TCAGCAAATTACTTATAATAAGGAAAAAAATATAAATATTTTTGATTAAA
TTCAATATTATTGAACGAATTCATTACTCCTCAATAACTTCCAGAGAGTG
ATATTTTAGAAGTAACCAATCGTCATATCTAAAGGTAATTGATTCATCAT
ATTATGTACATTGTATACATACAGTATAGGTTGTAATATCATAGGGTATG
TGATCAGAACACAAACGACATTAAACATAATACATCAAATGATAATCATA
TTTGCGTATGTTTTTCTAGGACGATGATCATAATTGAGAGCTCAGCTGTT
TGTCTCCTCTACGGGGGAAGGACAAGAGAGTACATTGTTCATGATTAGTT
AATTACTTGTTTGTACGATGTTTAATTGTGTAGTAAGTAGGTATTTGAAC
AAAAGATATATATTACCAATGCTGAAAGGCGTCCAGTCGTCATCCTTCGA
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TACAAGCACATATAGGCTATGGCTGCCTAGGCTTTTWTGTATCTGATGAT
TCTCCCTCCAAAATTATATAACAGGCAGCTAATGTATTATTTATTAAGTG
AATAGTACCAACGGCGTTACTAACAAACATACAAAATTGTTGTCCGATGT
CAATTTCTTAGATTATTAGATTCTTAGATCAATCAGCATTCTGAAAATTG
ATTGGTAGACATTGAATTAGCTCTTTTTCAGTTGTAAACAATCATTATAG
TTCCAGACTTGGGAAAAATGGGATAACTATCAATTTTGGGCCTTTTTTTG
GTTTCTTTTTGAAGGAAAGGTTGTAAGGGTGATTTTGTCAGCTCTAAGGC
CCATAACTATAGCCCCCTCTAGACTACAACTTTTATTCATGTAGATTTTC
AGTACTTATATCTACATAATGTATGGACGAGTATATAATTATTTGAGTTA
ATATCGTTTTAAAGACAATTTGAGTTTTGAAAGAGTACAAGTCTTAATTA
CTAATTTTCTTAATCTTGGTTTATGTTTGTCAGGCGGGGTAAATATTAGA
AAAATATCTGCAATTTTATCGAGTTCATATCTTGGATCTTCATTTCTTTC
ATCAAGGAAAAAAGGAAATACATTGATCATAAAGAACATTTGTCTTCTTC
CTATACTTATTTTTCTTGTATTACAGATGTCGTATCCACCTCCMGCAGAG
CCAATCAATGGAAACGGAGCCCCTCCACAAGGAGGCTATGGATATCCACC
ACAAACTTCTAGCTATCCTCCTAGTGGAGCATCATCAGGTCATCATCCCA
CGCCTCCTACGCATGAAACAAGTGTACGAGTCTCAACAGATCCTACTCCT
GGTACACATGTTACACAAATTCAATTAGATATTGGTTACTTTAAAACCAT
ACCTGGAATTATCAAAATCGTGGAATTAGTGAGTAGATTATAGCTTTATT
TTCATTGCATATGTATGTAAAGAGACTGTTCAAATGTATTAAAGTGGTTA
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TTATCAAATTACAAATTGTTATCCAATACCCCATCGGATTGAGTTTGTAA
CTATTTATATTGGCTAKGACAAAAKTCTTAAATTGAGTTTTAAAATTTTT
AAGTAAGTTCATAAATTAATTATTATTTGATACATGGATGTTTGAGATGT
TCTAATATGGTCGCAGTAAACAAAAGAGAATTCCATTAGATTGTATGGAC
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ATTCGAAGGATTCATTTAAAGTATGAAAACCTACCTACAATGTAAAAACA
CCTCATTTTACCTTTTTTTTTCTATATCTAAACTCACTATTTCTTATAAC
TCCCCCACATATACATATATGTGTTCATAAAACAGTTGTTTCAACTCAGA
TACATTCATTCATATCGAAGATTTGCTGTTTTTTCAATGAATTATACTGA
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GACTGATTAGGTTCATTCTTATTAACACCTACATTCACATTATATTTACT
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ATTTCTTATACCTAGATGAAATAGTAATATATGTTGCTATTTGTCAATTT
GTTATAAAACTTCATTTTTATTTATACATATTTTTATTTTATTAAGGTTC
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GTCATTAATAATAACTGTAAATGTATAAATACATATGTTTAAAAATTTAT
TGAAATTACTATATTATGTAGATAATCTTCAATAATTATCAGAGCATAAA
ATTTTTGTTTATGATCTTGCATTCTTTGATTCATTCCATGAATATTTTTT
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AATTAGGGATTTAAAATTTGTTTAAATCTTCGTGAGTGTAAATAAAAATA
AAAGTATAAGTTGGCAACTTTGATAGACGACATATCTGCTGACAGAGATA
CCAATAACAATAGTTAGTGATGTAAATCGTGTTTATTTTTTATTTGGCTC
GTTGTGTTGGAATCGGTAATATGACGAATGAATTTTCTTTTTCTGAGGTC
TTTTCATTATTATCTAACTCCTTAGTAGTGAACTTCCTTTCCTAATACAT
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AATTGAGTAATTAGTTTTGACAGTCGAGGTTAAGAGTGGATGAGAAATCA
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GGAAGGGAAAAAAGGGACGCAAATTAATTGATGATTTGGTAATCACGTTA
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ATATAATGTTTCCATATTTCCACCTTTCGTACTGACATAAATTTGATCTG
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CAAAGAAGTAGGGTCTGGATCGGTCACATAGAAGAAAACGATCTTGATCG
GTCTCAACAAAATTAACAAAATCAGTCTTGATCTGTATCATTTAAAATTG
GGATTAATTGCTAATGGTATCATGAGTGTTTCAAAATTGGGACCACCAGT
ACAATGACGTTATACAAAATTTAAACTGTTTTCACAAACTCCATATTCAG
GAAATGAAGCAATTTTAGGACTTATAGTAAAGTATAGAATTTTTTTTTTT
TATGTATACAAAAAMACAAAAAAATTRCRTTTTTTAAATCTATTTATCTT
TTTAGATATTATGTATAAWATAAATACAATTCTGTCACACGTTTTGAAAT
GTAACCAAAAAGTTAAAATTCGAAAACGATTAAATTTTATTTACAGTTTG
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AATAACTTTTGTATCTCAAGGATTATGTAATATGTATTACAAATATGAAT
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ATTTTTAAAGCAACATGAAATGGTGTTAAAGAAACTATACATTGACATTA
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ATTTTGAAATGTTGATATTTTGAAAATCATAAAAGAACGCCATTTTCTAC
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GTGGTATTTTACAACAAAATGCCCATAAAATTCAGCTGCCAATTGTCAAT
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GTACATATTTATATAAAATGGTTTGGTGAAGCACTCTGTGGAAATACGAC
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TTTTTATCCATTTCACTTGGAAAATATTCGAATGGGTTNNNNNNNNNNNN
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AATCTACCATTTAGTTGGTTAAAATTGGTAAGCAGTGTGTATATATATTG
TGTTATGGGAGCAGTGAAATTTTTCCTGAAGGTTATATGTTTTCTACATA
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GTTACACCCTAATGATACGTAAAAAGTTGATCAATATGCAATGGGCATTA
AATTTGGCTTAGATGTTCTAAAACCTTAGAAGTATGCATGAAAAGTACAG
CTTATTGTTCATAAATTTATGTTATTTCACTGCCACCTATTGTTTTGTTA
ACATGAGTCATCGCATAAGATTTATTATTTTATTTGCAGGAGTATTTTTA
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