EMLSAT00000000205, EMLSAT00000000205-696052 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000205
Unique NameEMLSAT00000000205-696052
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s102supercontigLSalAtl2s102:1465388..1483126 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000205 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000205EMLSAG00000000205-682971Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000000947EMLSAE00000000947-709875Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000948EMLSAE00000000948-709876Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000949EMLSAE00000000949-709877Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000950EMLSAE00000000950-709878Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000951EMLSAE00000000951-709879Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000952EMLSAE00000000952-709880Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000000953EMLSAE00000000953-709881Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto780769auto780769Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000205EMLSAP00000000205Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000205

>EMLSAP00000000205 ID=EMLSAP00000000205|Name=EMLSAP00000000205|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=298bp
SSRQEVQEYSRLQEPPFHGIIELNLIFDEVNEYLTVNVVKAKRIKGMDIN
GLSDSYCKVTLVQPGEKVFTPQCTKTVAKSINPHYNAMLQFKGVNQAVIQ
TGGLSIHILDEDLPGDHLLAESTFPIMRMLPQMHKKFQISLDKPDLKDTI
DGLILTSNVGRVEISLAFYSKAGTLRVGILRCFDLPKMEEDGNTNPYVQT
QLFPGSKHSRHKTTVKWRTSNPEYHEQFVYLTSTAELPKQSLHITIWDKE
KSKPEEYIGGIILGLNAKGNRLQHWTEMVKNPNQAHVKTHHLSANFLD
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mRNA from alignment at LSalAtl2s102:1465388..1483126+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000205-696052 ID=EMLSAT00000000205-696052|Name=EMLSAT00000000205|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17739bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s102:1465388..1483126+ (Lepeophtheirus salmonis)
TCTAGCCGACAAGAAGTGCAAGAGTATAGTCGTTTACAAGAACCACCTTT CCATGGAATCATTGAACTGAATTTAATATTCGATGAGGTCAATGAGTATC TTACAGTGAATGTTGTCAAAGCTAAGGTATGAGTTTTGTTTATAAAACAT GGTCGTGCTGAACAAATATATAGCAAAAGTGTATACGTGTAGGGAATAAG GGAAAGGGCCTTTTCATTTTTGGCAAATGAAACAATATTTGAGCAATCCA TAGACATCAACGTGAGGATGAAAACGCTTGTACATAAAAGCTAGTCATAT ATATCTAGCATCTGTTCATATTTACTTAGAAAAGTTTCAGCCATTTTGGA CACGCAGTTGTTATGTTACAATCGTTTGAGTGAGTTGATGTAATTGTTAA TGTAAAAAAAAATTGATTTTTTATTTTATTCGTCAACATAGTCTCCTTGA AACTCAACACACTTCTCCAAGAAAAGTTTGAAACAGAATGGATTACAGAG ATATGAGCATTGTTGGAGAAGTGTGTAGAGCTACAAAGACACTATCTTGT AAAAAAAAAATCAAACAAAAAATATCATCAACTCACTCAAATGACTTTTA CGTAATCACTGCACGTCCAAAATGACTGAAACTTTGGCAAGTAACGGAAT ATTTGAACATCAATTAAGAAAAAGTTTTATAATTCAAAAATAAGCTATAA AAAACCAGAATTAAAATAAATATAGTCGAATTAAAGGTGAAGGTTTTTAT AAGAATGAAGAATATGTTGTTTAATAAAAAAATTGTCAAATTTTCAAGGT TTTGTTCAAAATGATCTAATTTAATAAAAAAAAAGTCTAAAAGTTTCAAA TTTTAAAAGATATTATCAAAAAGCGTCAAATTTAATAAACGTTTGTCAAA TTAGAAACAATATATACATTCCAAAATTATTTGGTTACAATTTTTTTTTG TTAAATATGACTTCCTTAAAAAAAAATCCTGAACTTCAGAAAACAATCTA TAAAAACAATAAAATGATTAAAAATTCAAAAATGTACTTCTTTTGAATTT TGGAAATTAATCTATAAAAATTAAGGCAGAAACCAAATTAATATTTCAAA AGCTTCAATGATATACTTTTATTTTTTTGTTTTTTCAAAATACATAATAC AAAAAAATGTATTTTATAGAAAATACAAGATCAAAAATATGATATTTTTT ACAAAATTTACTAGTTTTCTCAAAAAGTCTCAAATTTGAAACATTTTTAA CTATTTGCTTAATTTTTTGTATTTATTTGTCTGTGTTTTAAAAAAATCTT GAGTTTTAAAAAAATAACTTTAAAAGACCTACAATAATAAAAAATTCGGA AATAATTACTTTAAATGAAGTCAGGCATAAAATGAATGTGCTAAATATTA TGGGTATATAAAACGTACCTTTTACAAAATATTTTTTTCATAATAATTGA AAAGTTGACAAACTTAAGTGGATAGAAAGGCAATCAAAAAAAAATTTCCT AAAAAATGTAGATGTCACTGTTACATAAAAGAAAATGATAGCCTAATAAA TATTCTGTCTAGTGTTTCCAATTTGATATTGTATTAATATTCAGGCAAAG TGGAAGTTGTTTCTTTCATAAATTCTTCTTCTCTTCGCCAATGCATACCA AATTAGATTTCTAAAAATATAATCAGGCTATTTTTATATAATTTTTTGCT AGAAGGCAAAGTGATAAAAATATCATTTTTATGAATGTCTTCTTATAAGA TATTAATTTTTATGCTGTGAAAAAAATATGTACTTGAATGAATCAATGAT GAACAAATATACAAGTAGACAAGGTAAATCCTGAATAACTTTAACGACTA ATTATGAGACTTGTAGAGGTTATGTGATAAAAAAAGTAATACTTACAGCA AGCTAAATGTGTTAACTGTCGAACTTAAAAGCAGGTTTTCTGAGTATCTT GTCGTTTCAGCACGGAAAGAATCAGGGGAATTTTCTCCATCAAAGCTCGC CACGCAGGATACTCCACACAGGAGATAATATCCTTCTTCAAATATCCAGA GTCTACAGTTTATCACATATTAAGGCATTTGAGGAGGAGGGAAAGAATGA GAGAGTAGCTCATTCAACTAGATCTGATACTAAAACTCATCCAGACATGT CAATCGCTAGGCTAGCCAAGGACTGCAACGTGAGCAAAGAAACCATCACA AAAAGGACATAAGTATTGACTTGGGTTACTTGTCCAGGGCTATAGCCTCA ATGCATCTGCTAACAGAGCAGAATAAGGCTGGCAGAATGAGMAAAACAAG ATTCTTATTAACCAAATGATGAGCAAAGGTAGTCACGTGCATTTTTTTAA AACAAGACAATATTCAATATTGACGCCAATCATAACCGTAGAAACGATAA ATGGATGTGTCTGCACCCTGATGGGATCCTACCAGTCATGAAAACAAAGA ATCCGGCTTCTGTTATGGTCCTGGCGGTCATCAGGAAGGAGGGACAAGAG ATACCTCACAATTCTTCCAAAAGGGTAGAAGGTGGCCAAGGAGGTATACA AGAACGTTCTAAGGATGTAGTCTACCCATAGATGAATGCAGTAAATGATG GGAAACCATTTACATATGTACATATTCCAGTACGACTTAGCACCTACTCA TCCGACCGAGATTGTACACGAGTTCATGGGACAAAATGTGCAGGATTTTT GGCATCCATTCTATTGGCTAYCCAATAYTCCAGAACCCAATACTTGTGAT TTTTACTAGTGAGGCATGAAGGAACTGCTCGTCTGCAAGAATATTCGATG CTCAGTTATGCCTTAAATGCCTACGTCGTCAATAGAAATGAAATACCTGT 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CACAGACTTCTTTATGGAGTATATCTTTCTATTTTCAAAAATAATTTTGG TTGGTTGTAACCATGGCTTCTAGCCTAGACCTTAAGGCAAGACAGCACTA ATTGATGATGGCCTCGAACTGGCAACCCATTGCTACTCTACACAGGCCCA GTCGGCATCCAAATGTTGGTAAGGGATAGTACAGGCTTTTTTCTAACAGT CGAGGGAGGAACAGTCTGTGGTGGAGAGTGTACTATTTGCCCATTATGCA AAACCAACCCAACAATTTCTGGTGTTTTGGTTTCTGGTTGGTCTTGGTTG CTATTGAAAGCAGTTACCAAAGTTATCTACATAAGAAGCCTCCCACAAAT CCTTCATATATCTCCTCACAGTCCAATCACTGATGTTGATAGCCATGACA TGTTCCTTCATCAACTTGGGTAGACTCCTGGTGTTTGTAATAGCGCTGTA CTCCATGATTCCGATTTAGTGGTGTTTACCGCTGCTATGGCACATTTGAA AGTTCTGACCTGAAGCCACCATGATTTTAATCTTGTTAAAAAGACTCCAA CCTTCATGATCTCGTCGACATCCCTAGGGCCTGTAGGAAATCAGACATCC TTTGCATTTACGCCGTCATGCTGACAAATGTTTATTTTTGAAAGTTTTTT TATTGTTATTAGCCTGAATAATATCTGTTTTTAATTGCACAACATAATAT TTTATAATCTTCCTCCTAAAGTAATCTAGATTGATTTAAAGCCATGGCCT TGATTTTACCTCGCACACTGTAGGAGGTTATATGTAAAACTATATTATAT ACTAAAAAAAAAAATTGATGAGGTAATTTCATCATGAAATATAGGAAAAT GTGAATTCAATGGCTTATAATGTTTTAAAGGACTTAAGCTTCGAAATTTT AATTAAATTCATTTTGATAGTATTCAAAGTATTTGATAAAAATTTACTAT 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