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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s102 | supercontig | LSalAtl2s102:916783..945859 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000212 >EMLSAP00000000212 ID=EMLSAP00000000212|Name=EMLSAP00000000212|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=147bp
MTYIAIKNKQEICYHVSGFSKCCDISKYWKLNEIGLTLKIPLSIEDQCTQ RIFEFSLRRPENGAIEGGILGNFIKWNFTKFVVNKEEVPVFRFAPTLDSI LKVEEEIKKAFEEKLPKFLMTSSTTSFVFKVVANGTTQWYIKRWTLL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s102:916783..945859- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000212-696059 ID=EMLSAT00000000212-696059|Name=EMLSAT00000000212|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=29077bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s102:916783..945859- (Lepeophtheirus salmonis) ATGACATACATTGCGATCAAAAACAAGCAAGAAATTTGTTACCATGTTTC
AGGATTTAGTAAATGCTGTGATATTTCAAAATACTGGAAGTTAAATGAAA
TAGGTCTTACTTTGAAAATTCCACTGTCGATTGAAGATCAGTGTACTCAA
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GTTGAATAACTTAAATTGGCATATAAGTCCAAAGATAATAACATGCCTTA
CCATGGAGTATTGAAAGAAAGCTCAATGTCTATGAGGTTTTTGAAATGTA
TTTGATGGGTCAATACTCTCATAGACGAAGAATTCGCATAACTTTTCCTT
GATGGTATGTCCTAAACTTCAATAAGATCTTTTAAATCTTTCATACCGTT
TGGATTTTTTAAGATAGCTCTTGTTGCCCACATTTCGAAAATGTAATTAA
AATTTGTGTTTCTGTGGATCAGAGGAATATTTTGTAATTTTTTTTAAAAG
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AATTTGTCTTTACAATTTCTTCGTGACTCCACAGTTACTGTTGAGGACAT
GTATGTCGACGACATTTTTACATAGGCAAATAATGAAAGGGAGGTTGATC
AACTTGTTGATGATTTAATTAGACCATTTGGTTAAGTAGGGCCCTTCTCG
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GCTTGTCGAGGTGTACTGCTCGAAGAGTTTGTCAAATCAAATATGGGGAT
GAAGCGKCCCCCGTTGTTATATCTGCCGTCATATAAACGGGAGATTTCTG
GGGGAGTGGTAAACCAGGATGACAAGATTGAATTAGATAGAGAGAAAAAG
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GAGAGAATATTGAAAGTTCAGCAAGGGATATCTAAATGGAAAATTAAATA
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GGGGGGAAGGAGTATGTTAGAGATAGTGTTRTTAGAACCTTCAAGGGGGT
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GGAAAACTTCAAAGGTAATTCCGTATCAATTAAAAACTCTATTTGATTAA
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AATTATTTAAGCGTGTAAATTTGATAATACAGAATACCTTTAACAATAAA
GTTCAAATATACTATCCCAAGCTATGGCTACAAGCTTTACAGGGTTATAA
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ACATCGTCATAATCCTTCCATCAAAGGAAAATTAATACATAGAAATTCGA
ATTTAAAATCAGAGTTTAGGTGCATTAACTCTGCATCACTAAAAATGCAA
TTCTTTTTTTTAAGAATGTTAAGCTATAATTTTTTAAAACGCTTTCATCA
AAGGTTTATCAAGTGACTCATCAAAAGACTACAAAAGATAAAAACTGGAT
ACAGAAATGAGAAAGCAGCCCTGAAATTATATGAATTTAGTATTTATCCC
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GTCCAAATTCTGAAAGAATTCCAACCTTGGCTATCGAACATAAGACATAT
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TTATTACTAAATTTTCACAGTTGCCTTTTCAAGGTTGCTTCAAACTAAAA
AGGAGGTGAATTAAATAAAGGCCATTTATACACTATTAAGCCTATTTGTA
ATGAATATATAAATATAAAATGTAATTGAAATATGTATTATTTCTTCAAA
TAAGGAAATATGAAATGGGCGTTGCTGTTTTTTTAGTAGTTCGCTTTTAT
AACCACGGATAGCTTCTTTGTTTTCATGTAATATTGTTTTTTTTTTTTTA
TAATACTCTTTAGAATCACAATTTTATACAATCAACAAAATTAATATAAT
TAGGAAATGATACATAGAATGCGTTGTAACAATTAGGTACTGTGGAGGTG
AAAATCCCTCCAAAAATGAATAAAGAAAAATACTCTCCACGCTTAACTAA
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GTCACTCCAAAGAGACTCCTCTTTCGAAGAGACCTCAAAACACTCGAGAA
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ACATGTTCCTCATAGAATGCATAAGGTAATAAAAGTTCTTGACACGGGCT
ACGTTCGCCGTTTATCTATTCCAGGAGAGGAAATTGTCCCTAACTACGAA
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CTCATGGGCAGAGGCAGGGAGGATAAGATAAGAAAAGCAAAAAGAAGACA
AGAGGCTCAAAGGATTTATCTGCGGAGTCACAGGTGACATCAGGAGAAGG
AAATACTTGATAAAATAAAAACACATCAATGCAGCCCCCTTGGTATAGGG
GGGAAAGTTGAGACAGTAAGATCCGAGCTAACCAAATTAGGCAAAAAACG
AGACATCTGTGTTGATCCTTTGACCTTAAAAAATATGCAACCGTCAATTT
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TTGTGCCCCTGGGGAGGATGATGTCATCAATAATGAAAATACTACTAATG
AAAATTCTGATGAGGTCGACAGGTTTACTTGTGGAATCAGTAGAGACAAA
GAGGACAAACTAGATCCTAATAGAACTTAAATAACCAAAGAATACAATCC
AAAATATACGGAAAGAGAAACAAAAATAAAACATCAAATCTTACAACTGG
GACATCAAGCCTGGCTGAAATAACGCTTAACAGAAGAAAACTTCCAGAAA
TCAGACAAGAATAGATACGTTCTTTGAAACGGCGGMTGAAGMTATGATTG
GCTCACCACAAAAWCCTAAAAAATCAACWGCACCRACATCAATATACAGC
ACTTCAGAGCATCCAACTCTAAACTTAATTTGAGAACATCTCAAATAGCC
ATGATAACAGAACCTTATCTCATCAAAGGCACTACAAATCCTACACTTAA
GGGGAGGTACAATTCACAGTAAATTGGGGTCAAACCCAAGAGCTTGCATA
CAAACGGCCGACCACTTAAATGTGTGGTTTGTTCCTTAATTCTCCGATAG
GGATGTTTGCATAGTTTGCTTAAAGGTTGATGAGKCCATCCTCTATCTTT
GTGTAGCATATCTTGATCAACTCCTATCAGTTGACAACAAGATGTTGTTG
AGCAATATTAAATACTGTAATTGCCATCATAAACCAATTCTCRTAGCCAT
GAACTCCAACTCTCACAATCCTATCTGAGGGTATAAAAACGTTGACTCAT
GGGGTCTTGAGAACATCATTGAAGAAAATATCCTTATTAATTAAAAAAAA
ATTGCAATGAACCGACTTATGTAACTCAGCGAGCCTGCTCTATAAAGAAC
ATTACTATCATGAATCAGCATGCCTATGATATATAAGATATTAATTGTTG
GCATGTAGATCTTTGCCATCAATGTCGGKCCACCGATTTATCGTTTTCAA
TTTTGGCAAATACAAGCTACTAACCGATCAACCAAGGAACCTTAGGAAAA
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ATACGTCCCTGCGCCAGCAGTATTGACCATTGTACTGAATCAATCTACAT
GATTATAAAGAATGCGATAGATATTGCCTGGTTAATTACAATAACTTTAA
AAGCTAAAGCAGTGGGAATAATGGTGGAATAAACGTCTTGCTAGATTGAG
CCATAAGTTTAGAAAACTTTAGCAAAGCAAAATCGATCTTCTCACTGAGA
AGAGTATCTGATCGCCAAAAATGAATATTGCACAGTAATCAGAAAAGAGC
AAAAATACTCCTTAAGGTAATTATTGTAGTAGCACAGGAGGCCCAAAAGA
CATTGCAAGTCTTATTAGAATTCAAAAACCAATCTCTGAATCAATTGGCT
TGTCAATAGAGCAGGATACACTCAATCGCCAACCGAATATCTTGAAATAC
ACTTGGAGACCCATTTCCCATTATGCAAAATCAGTTCAAAATGTAAACCC
ATTGCAATTCACCGCCTTTGATATTGTTTTCATGGACAACGACAAAGTAC
GAGAATCATTGAGGTTCTTCGGGCTTACAAAAGCTGACGATCAGATGAAC
TAATGACAACTATCCTACATCAGGTAGGAGATAACACTATTCAGTAAATT
TGGAAACATTATACAGCGATTCTTAGTACAAGCTACATACCCCACAACTG
GAAATAAATTAAGTCTTCTTTGTCCGGTTGCTAAATCCGCGTAAAGATGA
CTACAGCTTGGCAAAATCATTCAGACCATTACTTTGTTTAGCTTCTTTCT
TAAAGGTCTTGAGATAATCGTTCAATGGAGAGTTGAAGAACTAATTCCAA
TATTCTCCTCACAACATCCCTATACAAAGGGATTATCAACATAAACGGCT
TTTTCACAGGTTACAGATATAATTGAGAAATCAAGGTAGTAAAATCAACG
TACACTCACGGTCCGCTTTGATTGTACTGGGACATTTAACTGTATTCAAT
TCAACTCAGCGAAATGAGCAATGGGAAAAATGGGAATACCAGATAGTATC
AGATCTTGGTACAAAGAACTCCTTAAAAGGTAAACAGTGACACCTGAACT
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GTGTGCTTTCACCTATGATATGGAACATGATCATAGACACACATTGGAAT
ATTTTATAATAACGCAGTCAAAACTGTTGGCTATGCTGATGACATCCTTC
GACTAATGAGTAGAAAGCATCCGCATACCTTCGTTAGCAAAATGCAAGAA
GCGATCAATACTGTTTGAAAATGGGAAAGAATGAATGGTTTTATTTTTAA
CCCAGACAAAACTAAATCAGTTATTTACTCAAAGACATATAAACTGTGAT
CTAAATACTTCCCATGACTAGAAATGGGCGGGGAACTCATAAATTTTTCA
TCACAAACGAAATAACTTGGTGTTTTATTTGATCAAGGACTAACTTGGAC
GGAACACCTCAAAGAAAAAACTGCTAAATGCAGTCGTCTGTGGAACATGG
CCAAAGTAGCGATTTGTCAAAAGTGGGGTTAGACCTCAGACAAAGTTTTA
TGGCTCAATGAAGCGATGATTAAACCCATAATTTCCTACAAAAGCCTTAA
ATCGGGCCATGCTATTATAGCAAACAAAAAGAGAAAGAAATATTCATTGA
ATGGTGCAGAGGTCACAATGACATCACAAGTAATGAATTGGCGGGTTACC
TTGCAAAGGAGGAATCTCTTTTACTGTAGTGACACCCGTTGTGTGGTGGT
GTTCTTCACTTTTATGTTTATTATTATTTTTTTTATGGCAATTGCAGACA
GTAAATAAAATTTTTCCTTAAAAATATTGCCCCGATGAATACAGCTTCTA
TCTGACCACTTTTTAAATAAACTATTCCTCATATGTCTCATTTTTAATTA
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TTATATTTAGAACGCCTTATATGTACGTATTTATAGATGATTGTCGTAAT
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TTAATGAGTTTATATGAATAAAGGAAATGTCATGCTATGCTATTTCTAAT
AATATATGCAATTTTCATTACAATAATGAAAGAATAATTAAATACTTGTG
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AATTATTCAATATTTTTTATCGTAATTTTGTGGCCAGTTGGTAGTTGGTT
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ACATACCTATAAAGAGCTACCCAGGCTACCCAGAATTGCTCAGACAATGG
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GAAAAAAATATTTTGCACTAATTTTTTTAATAAAAATAGATATAAGAATT
TATGGAATTAGAAAGAGAAACACAAACCTTTCAAGTTTTCTTTGATACGC
ACAAAAAACAAAAGAATTATGATGAATAATGTGACCCAAAAAATAATCCT
TGATAACTGGTTTATTTTTGAAAATATTACGAAAAATAAAGTTCTGAAAA
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TATTCTACAAATTGAATATTTCACTAAAATCTATTTTTTTGCACATGAAA
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GTATTTGAAATGCACGTCATTTTTGATTTCTAATTCAACCACTTACCTAG
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CCCCTTATTCCCATTGAAAATAGAGAATCCAATCTTATCCAGACTAAGTT
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GGTGGATTGCAAAAAGTGAAGACAATCTGTCATATATTCCAGGACTGTGT
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GGTGGCTTAAGACGAGTTTAAATTAACCAAAATAAAAACAGACTTTTAAT
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TTTTATTTACAAGTTAAATAATACAGATGAGAAAATCTTACATCTGAGCA
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GCAGGGCANNNNNNNNNCAAGTCTTAATGAAACAGGAACTCGAAAACATT
GGCCTGAGCTTTCAAGGTATCATTTGAATGGACTGGAGTTCAATGTACCT
GTCGGCACCAATCCTCACTTTTGGTTCAAAGAAGATGGGGGAATTACACT
GCTATTGCTTTAAAAGAAACCAAAGGTTATGATGCTGGCGGAAAACTTGG
ATTTTTAAATAAGTTGGAGACATTAACTCGCGGTGCCCCCCCCCCCCCGG
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TTTTCTTCCGCGGGTAGCACGGTAGGCCTTTACTTTGTAAGTAAGGATAT
TTATTTTGTAAAGGGCGTATGAATTTATAGTTAGGCCATTGTTTATGGTC
ACGCAGACTCCGAGGAGATGCCCTCACAGAACGTTATAGGCCTATGAATA
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TACCCAAGGATATTTTTAATGTACTGGCTCTTTCCCTTGYTAGCCAATAA
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TAAAAGTTGCACAAGTAACTTAAAGACAATACTCAACCTCTTACTTTAAA
ACTAAAGCAACCTAGTTAAATGCTTTCCATATTGTCTAGATTAAACATGT
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TTATTCTTTCATACACCATTTTATTACTTAATACTTATTAAATTTTCATA
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AATGAGGATTATAATGCTACTGGTGTTCTTATTTAGAACATACTTTTAAA
CTATGTAACTTTGGCCACTTTTTAGAACTATCTAAATTGGTAGAGAATTG
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AACCTCTTGAGAAAAATTGCTCATATATAAAAACTTACGGGAACTCTAGA
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AAATATTTGGAGATGACATACCATTTTTGAGGGGATTATTTAAAGATAAT
GTGGCTTATATAGAAGGTAAAACTTTATTGGAGAGTACCTTCTGATGTAA
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AATAAGTTTTTTTTTTGTATATAAATGTATTTCATTTTAGGATATTTTAT
TAACTTTTTGTATAAATAATGTTTTTATGTTGTAACATTGGAGCTTATAT
ATTTTTTTATATGCTTGTCAAAAAATGACATTTTGATGTAGTTATAGTTT
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AAACTAAAACATGGTTTATTCAAATTTTGATTAACCAGATTAACAAAGAC
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ATGCATACTTTTGATCACATTATACTAAACCAAGAATATTTTTAAAATCT
AAATAAAAAAACAATTAATAACAATATATGTAATTTATGATTTCGAGGAA
TAAAATTAATTAATATTTTAAACCATATATGTTAGGGTGAAGTTAGTTCC
CAAAAAATTCTTAAATTTTGACAGATAATTTTTAACTTATTTGGCATTGC
ATAAGGACCTAAGATCCATGCAATTTTATTGACTTGTATTAATATTTGCC
TTGACAGAAGGATAATAAAATTTTTGAAAAAGTTTAAAAAAAAACTATGC
AACAAAAATGTCAAACAGCATGATTAAATTAGGGAGAACGTGATTTGTAG
AATAAAGAAATTACAGTTCAAAACCAACTTGTGATATGCTTCAATACTAT
AACTAGCTCTATTTTTATTCAGTATGTCCTCCTTTAGAAGTATTAACAGT
CTTGGCACGTCGGCGAACAGATTGGGAGCCCTAGACTACAGAACCAATGG
CGTATCACGCTGGCATGATGTAACTTGGAGAAATCGATTTTTAGATAGAT
GTACGGCAGACATTTTTCTTCAAAAGAACCCAACTGCAAAGTCTACGTGG
TTAAATTCAAGTCTGGAGGAGGGGCACATAAAGGCAGACCAAGAGCCAGC
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ATGAACTTACTGATGTTGTAAGCAGTCCAGATGGAGATGCCAACAGTCTA
TACAGCTTTCGTGGCACTCACATGAGGGCGGAGAAGATTGAAGAAGCGTT
TACTTTGATGTTGGTCTTTCATTTTTTTTACATTAACAGACAAGGGATAA
TAATATAGCCAGTTATGTATTTACCCCTGTTTATCTCTTAGTCAAACGGA
TTATGGCAAAAGTTAAGGATCGATTTTGATGAAACTTGGTACAAAGTTTA
TATATGTTCACAGTAAATTTTGTGATGTCAAAATTATACAAAATGTTAAC
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TTGATCTTAGACGCAGATTTTGTAGTGTACCAAGTGTCCATTCTAGTTTG
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ATTGTAATTTAATGCTAATGGATATTTTAAGGTTTTTTTAAAAACTCTAA
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ATTATTCATACTAATTATACAAAGAATTTTCCTTTTTTTCAAAATCTCAA
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GCTATTATAATTTATATAATCAAAACACTATTTAGAGGGTGGATTAACAA
TGTTAAAATCAATTCTTTTAAATATTTCTCCATCTACTTTAAAATTTAAT
GTTGCACAACATGGATGTAAAAAAAATACATTATTGGCTTTAAAATGACA
AAATGTATGATTTGAAATATTGGTATGTTTCAATAAAAAAGCACAAATGT
GTTCATTTGACCTAGATACAAAGCCAATAAAGGTCATTTTTCCTTATACA
AACTTGAGAAATTATACTCACCCTAATATGTATATGTACGTACATCCATT
AAAATGGAAATTAAAGTTAAGTCAATAGTTATAATTACTAAGTAGGACAA
AAATGTAATAATAATTCTTTCTTTATATATATCTTATTTTTCCATATTTT
ACATATTCAGTTTCTTATAAAAAAAAATTCCGTCTATTTCTATTATAAGA
AATCAATTTTGATTTCATTGGAGTAAAAGTGGAAAACATTATATGTGATA
TAACAAAAAAAATATCATTTTCGTTTTTTTTCTTTATCGAAATACTATGT
AAAATATAAATTTATAACCTATGTTAAAATTATAATGTATACATTTTATA
AAAAACTAATTAGATTGCATCTTTGTTTATTAAGTTTTTTATAAGTTCCT
ATTGAATCACAGTTTAATAATCTTTGTGTAATAAAAATTGTAACTGGTCA
TGATAAATCCATTTACTGATTCAAGAAAGAGATGGCTAGTATATCGTCTC
GCTATATCAGTAGTCTTTTCCAACAAGTCGAAAAAAGGTAAAAGAGGGAA
GTAAACATTTTAAGCGTTCGATCCTTTCTAATTTTCAATGTTGAATTTAT
TTATAAGGGAAAATTGGTTGAGGGGATATTTGAAATTGAGGGAGTTACAT
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TCCACATGGAACAAAATTGGGTCGTTCTATCATTTTTTTTAATTCTACGT
AATATACAGACAAAACACATTCATTAATTTTAATTTCGTTACAGCTATAA
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AATTATGTAACTAATTAATAATTAAGGACAAAACAGAAAAACATTGGCAT
TCCACTGGTGACCGAGGACCACCCCTGGGTATCTTATCTGGATTGACAGA
ACTACTAAGGCCTCATAACCAAGGAGAATTGCCTCCCTCCTCCCATCCTT
CAATAGCCCTAATCTTAATCCAGAGGATTATTTTGTCTAGAACCCTTGAG
GAAAATACTAATTGACGTCCTCGCCAGACTAAGGCAAGTCCAGTATGCAC
CATCAAGGAGCACTACACATCCATGCCCAGGGACCTCGTCATCAAAGCTT
TCTTCTGCTTCAAAGGCTATATCGAGGGCGTTTTTGAGGCTGAGGGAAAT
TATATCCTCTAAGCCTCAAAACAGATTCTTTTTTATTAATAATAAAACTA
TCTAAATTATGGATTCTATGTCATTTTTCTAAATAAGAGATAGGGTGCTG
ATTTCATTCCCTTTGTCTTTATNCTTTATAGTCATAGGCCATTTGTGGCA
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TCTTTCATAGGAGAAAATGTCACGAGATATAAAATAAAATATCTTTTTGT
CATACTTTAAAACTATTTTTCATTACTTATTCAGTTTGTTTTGATGGTTT
TTACTTTAAATACAACAATAAAAAGTTTACACAGTATATAAAATATATAT
ATACAGTCTTGTTAAACTGAATTTTTTGTTGAACACGTTCCCAAAACTTT
CGAAAGCTACTAATTGATATTTATATTTTTTGATTTTACAAGTTTAAAAA
AAGTTATCTGGTCGTTTTTGTGAAATCGATTTTCTATTTGGAATTTTCTA
TCTTTTAAATAGCTCAGGAAAAATAAGTTTGAGCTGCAATAAACTCTCCA
TAGTACAATGTTGGAGAAATGCCTATAAAATTTAAGACTGGGACTAAATT
TGTATAAACTGATTCTTAAATTTTAAGGAAAAAATATTTAGTGAGCATTT
TTGTAAGTATTTTCTAGTTAAAATTTTATTTTTACTTTTTTAAAAGTAAC
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TATAGAAATAACCATATTCCTTAAACGTGTCTCCTTCCTATTTAAAAAAG
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