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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1036 | supercontig | LSalAtl2s1036:40790..53126 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000244 >EMLSAP00000000244 ID=EMLSAP00000000244|Name=EMLSAP00000000244|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=546bp
MAYDSDYEGMDYILGNMVGSQGRAQWKVVFLAFIADIAGGXPLLLHMFSA YEPDHRCSIPVCNDLNSTDWMEFAIPKNTKSSNFLKKDSTYDSCHAFKVI DEEGDCEMSNFNISQMETCSAWVYDKSDFPYTLTTRNDLVCNSEAKRRLL STFMMLGLMIGSLLGGKFGDWIGRKKTCFIAISIITPTVMVGGYSPNYEI YAALRLLTCICLPVIWVCIHSLTFELFGIRGRERFLAVKDLFYPTYVIML GSLSYFFRNYEELHLVCGCLCLISLIMYFFIPESVRWEIVNNQYDSARKT LLSIAKQNGKTLTKEDENKIDRILHRIHDEIQDSDNKGKHSILDMFKKSQ IKMTLVLLANWITVNVGSYTLTLEATKLSGNVWLNFVLSSVIEIPGSIMI FFCLSMFGRRFNLFMYQSIVGISCITLAFTPKTWTTTVLVIYLIGKIGSG ATFLMVWLLPVELYPTNLRAQALGTLSTIARIFGMSASFVPTLAKVWKPL PLFIIGVPSLIAGLMAYFLPETAKKELPQTLLKSSSSKPKEDTTKV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1036:40790..53126+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000244-696091 ID=EMLSAT00000000244-696091|Name=EMLSAT00000000244|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12337bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1036:40790..53126+ (Lepeophtheirus salmonis) GATTTAATAGAATTTTTTTAGTGTTAGTGAAGAATGAAAACTTAGTTGAA
TATAACTTCAATTGTGTTACAACCGTTTCCCTCATCAAGAAGATATTATA
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TCCGATTACGAAGGAATGGACTATATTCTTGGCAATATGGTTGGTAGTCA
AGGTCGTGCTCAATGGAAAGTGGTATTTTTAGCGTTTATTGCAGATATAG
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CACAGATGTAGTATTCCCGTTTGTAATGATCTCAACAGCACGGACTGGAT
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GGCACTAGGTACATTATCCACCATTGCAAGGATATTTGGAATGAGCGCCT
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CCAAGCTTGTGCTAGACTAATGGTGGTCAGCACTATAATATATACAGTTT
TGAGATGAGCCATTCTTCTTCCTTTCAATCACTCACTACTCCGTCTATAT
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AATTCATTTAGGTTTATCATTATTGAGGTTAATCAATCTCAATGAGCAAT
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TATCTTATTAACTCTATGTAAAGAACGTGAATAACAATTAAAGAGGATGT
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ACTAATAGTGTTGAATGGTTATAAAGTACTACAGTCCTATCAGGCCGGCT
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ATTTTCTAAAAAAAAGAGGATTCAACATTCTTGTCATAAATAAATAAACC
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AGGGAAGCTATTTGCTAGCATTGAAAGTTTGTATATGTTATTAAATAAAG
ATAGTTACTAAGCATGTTAAAAGATTCCCCCACCCCCAAAAAAAGATATG
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CTTTAATTCCATAGTTATGACATTTTTACATACAATATCACATAGATCTT
CAGCTTCATAAAATTTGTTAATGATACTAAAATATAAAATACTTAAAAAA
TGATAGAAANNNNNNNNNNNNNAAATATTTTGTCCTGTTAAAGGAGAGTA
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GTTTTTGCAATTTTTTTTTTTAAATTCTAAAAATTACAATTTTTTGGCAA
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NNNNNNNNNNNTATTAAATTCTAAATATAAATATTTTTTGAAAAAAAAAT
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ACAATTTTTTTGATCCTGTCCAAAAAAAATATTAATTAGCAAAAATTTCT
TAATTTTTGGGGGCTACAACCCCTCTAGCCTACTCCTTATAGACGCCCCT
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AAAAAAGTTCATTTACAGTTTTATGTTTGGCGAAGCCAGTTGTATGTGTC
AGCGTTCCAAAATGGACGTAAAAAAAGGTAATAAGGTAGAGCTAGCGGCA
CAAAAATGTGTGCTGTTTATGGACCCAATACAGTATCGAATGCAAGACCA
AAGCGGTGGATCCAGCGATTGGGTTATTTTATTCTCAAAATAAAGTGAAA
AAGCCCTCAGAACTTTTTACTTACCTATTATATTTAAATGAGCACTTGGT
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ATGCTTTGAAAAAGGATAACCTTCAATTGCAAAGTGAGATTGATTTCTAT
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TCTGGAACTTCCATCATCTGCACCGGGTCCTCCGGGTTCTTACCCACACC
ATTTACATCATCATCCACTCGTCGCTGTTCATCCCCAACAACTCGATCTT
TCCGTTAATCCAGTGTCTAGTCATGAAGACTTTAAACGGATTTACTCTGG
AGGTCCACATGAACTGAAAGTTCAACCCAATATGAAGTGAGTTAATATTT
CGCTATTTCTTATGTAGATGGGGTCTGGGGAACAGAAAAAAATATTATTG
TAATCAGCTCAATTTTGCAGCTATTCCACAAAAAGAGGATGCGTTGTAAC
AGTCTAAGTGAGTGAGAAATTAAGAAAATAGACTCAACAACTATTTTTGA
AGGATAAATAATTAGACTTTTGTATGTGTTGAATGAAATAAAGAAGAATA
TGATATAATCCATGAATCTAGATTTATTTTATAGGTAACTGATCGCCCCT
GGTTATGGTTATTAAGAGATTTCTTTTCTTATATATATATAAGATTAGAT
AAGAATTAAAAATACGAAGGCAATAGCAACCCTTGTTGCAATTGTCCTTG
CATTATAATATCTCAAAATTTATTTTCAATGAGTGTATTTTGAATTTTAA
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TTTACCACAATAGAATGAAAAACTGACTGTTCTATTACAAAAGTATTGTT
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CAAAGACAAGTTCACAAAAATTATTGATTTATTCTCCCTTAATAGTTTGC
ATTATCACTCTGTGGCTGMAGATTTTTCGATGTTTGAGAAAAAAAGACCT
GTAATCAAGAGTATAACATTAGTAATATATTTGATGTATCTATTAAAATG
AATCGATCAGAATTGAATATTTATGATAATAATCTAATATCAGTTTTGTA
TTTTAAGTACTGAGGACTACAAAAAGCATCMGGAGCTATCGGGTTTCTCT
GCAAACAGTGTAATGAGTGGAGCCAATGGGCGTGAGCATTTAGACATTAA
AATTCTATCAAATGAGATCGATAATCATAAAAMGTGA back to top
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