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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1037 | supercontig | LSalAtl2s1037:112468..132413 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000251 >EMLSAP00000000251 ID=EMLSAP00000000251|Name=EMLSAP00000000251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=760bp
MIRIPKISYNSSYILLLFTLQYVISVASMCGFPGAPAHSTVKFNTKAVRK GTVAKYTCDRGFELLGPTRRLCGENGTWIPQGIPFCVLNVAAGKAPMQXS VANGGXPQKAIDGSTSKFFDASTCTKTEVERSPWWYVNLLEPYMVQLVRV XFGESCCENDTPATIVIRVGNNRPDLGINPVCNRFIGKIEEGRPLFLPCN PPMPGAFVSLHFESPIGVSFSICETFVYTDQALPIERCPSFRDQPPGSTA TYNGKCYIFYNQQPENFERALSFCESRGGSLVDESNPALQGFLSWELWRR HKGDANGQYWNGAVRDREDSNNWKWINGKQVSVSFWNLPGGVENCARFDG TKGWLWSDTNCALRLNYICQHSPTTCGKPEQPPDSSLSSSGYNIGDIINY SCDVGNLLVGPSSRKCLSTGFYSEFPPICRFIQCGXPAEIPNSLITLQNR SFVFDSKIKYECKRGYILAGRXILTCDVDGRRXGPPPHCEPVYCQEPPPT RQGGVTLSTNSTRFGTVATYYCVNPRLQLNGGKSLYCREDGSWEGTVPRC IMAPIVTRKEDNFLERLPMPSNDRPIPFMSKYPPIKKRMEPRPLESNTLS GPMSNEIPDSANVIASRNPNVNLLNPIKVNKESLNANINWGGIIALAVFG GFVFVAAIVTTIVILIRSYGGIEKRHSRGESPQSSSTPHTQSNRSSSRPT HHHHHVHGQHRRQCRKSTSSSSRDSHPHFSSSSDCLSDETDSFKDILKKT LEDNKYRLVK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1037:112468..132413+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000251-696098 ID=EMLSAT00000000251-696098|Name=EMLSAT00000000251|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19946bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1037:112468..132413+ (Lepeophtheirus salmonis) TTTCAGTTGGTTTAAATCCTCTTTTAGTGAACCAGTGAAAATATATAATA
TCCATGATATGGTGACAGAAAAGTTTTGATACGTTCTAAGAGAAAATCAT
AATTTTTAATTCATTTGTAATTAGTAGAAAAATAAGATTATTTAGACATT
TATCAACACAATGATCCGTATACCAAAGATATCCTATAATTCCTCATATA
TACTTCTTCTCTTCACGCTTCAATATGTCATTTCAGGTAAGAATATATAT
TGAGTGTATGAATATTTAGATACATTTAAATGAGTCTATGGTATCAAAAT
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TGTAGTGTTGGATTAGTCCTAATCAGTCTCTCCCCCCTNCCCCCTTGCAG
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ATAACTGTGCCCTTGAGTCCAACGGTCGTAGGTATCTTTATAGCTAATCT
TCACTCATAGTTAGGAGTCTGAGCTCTCTTCATCATTAATATATCCACCC
TTAGCGGCAGMGATGGGMTCAAGGMGGATGCAGATTGCTTTGTATCCCCA
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TCATGGCTGMTGGAGACCCAAAAGTGTCAAAGAAGAGTTCAAAACATCTC
AAAAGACTAATTCAAAAAAGTTTTGCAACAGAAGAGATGTATTTATTTCA
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GCTCTTTGGACAGTCTGATGTGAAACTCCGAGTTCTCTGGTATGGGTCCT
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TTTTCTCGACTTGTACTTAAGCTAGAGATCTCAAGTATTTCCGTAACTAA
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CTTAATTAATTATTGAATTAGTAAGTGTTCAAATTTAAATGGACTAACTG
GTGTAAAAACGAAGAAAATATTAAATGACAGATAGAAAGTATACTAATAA
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ACAACTTTTATTAGAATCGGACTGATAAGACTGCAGACTTTTTAGGTTTT
TTATTCGGATCCAACACTTTCTGTTAGTGATATAATGAAAATAGAAATTG
TGGTGAATTATCATAAAGGCAATCTTGAATATAGATAACAAAGGATAATA
TCAATAAAGTCTAGAGCAATGACATATTTTATGTGTCATAAACAAATTAT
TATTTTAAAGCACCGAAGCAGAACAATATCTACTGTAGATATACAGACCA
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TTAAAAAATGATTAAAAAAAAAAATACATTGTCAAGCTAACCGTCACTAT
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AGCATTGTATTAAAATAGCTGGAATTAATTGAGATACTCAAGAATGTTAA
TTACATATATTTAATATATTTCATTTGATTTATGAAATTTAATTTGCCCC
TTGATATGACGGTTCAATTTTTATTGTGATGATGAGTTTTTGGGAATTTA
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GCTTTATTTTGTCAAAAAAAAATGAACATTGTTTTAATTTTCCGACGTAA
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TTTGCTTTGGCCGTATTGGTACTGAAGAAGATTTCGAATTTTCTCCTTTT
TTCCTTCCATTATGGAACGCTGTAACACGGAATTGTCTTCACTAAACTCT
ATATAAACTTTTTTTAAGTGCACATAGGCTTTTTTGATGCAATTTATGAA
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GTCTCATAGTTGGTATTTATAGAGCATGAAATGAACAAATTTCAATAAAT
CTTGAGGAAATTTATCAAATGGCTTTAAAAATAAAAATACCAAACATTCT
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AGTAATATCTACAAAAAAAAACCAAAAAAAACCCTCTAAAAATGACTATT
ATTGTAGAGTTAATTTTTCTTTTGTACTATTACGCAGGAAAAGGTAGGTT
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TTGTCTACTCTATGACACTCAAATTGGATATCAATTTAATAACATATTTT
AAATACATTTTAATGTATAAAATATGAAACTTGGCTATTTAGGGTCCTAA
AATGTCATATATTAACAATGTTGATATAATGAAATAACGATTTTTAGGTA
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ACATGTTCTCTTTGAAATTTCAGAAAACTTTGATAATTATAGAAATATAT
TTAATGACATGGATTTCATAAGAACTTTCATGGACGGTTACAGATGAATT
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TAAAAGAATTGCTATTTCCAAATTGATTTAATCATTTCTACTAGTTATTA
ATTCACAAACTTTGAAAATGATGAAATTGCTTTGATCCCTAGTTTATTCT
ATATAAATTTCTTTTTGTTTCCGCTTTGTATATATGTTTGTATTTCTAAG
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GTGTCGTTGTTGTATAATTTTCATAGTGTTTGATTTAAATCTTTCTTGCA
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ATTTTTTGTTGTTGGTATGTGTATGCAAATTTCGATCTTTTACCTATGTT
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AAATTTAGACGCCAATCACCAATAATTTATTAGTTATTTTTTATATGAGA
TAAATGTTTTCGTGGACTTTAATTGGTATTATTTTGTGAGAGTATAATTA
AAATTTACATTTAGTTAGAAGTTAATCATATTAGCAGGTATATGATCAAG
TTACTATATTGTCATGGTATATTTAAATTGGAGTATTTTAGGACCTCAAT
ATGTTCAATCAAATTTATGTTATTGTTTAAAGATGTTGACATATAATGTA
CATATTCTTTGAACACATAATTATGGACTGCTTATACTAATTATAATTAA
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AAAAGGATAATTTTTTCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATATACTCGTATAGTGATGAAAATCGGGTG
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CTAAGCTGTTGTCGTTATTATTTAATTCTTGAGAAATTGTTTTCTACTAC
ATATAATTATATTCAAAACCATTTGTGTGTTGCACATAATGACGGACAAA
CCTTACAGATTTCTTGCAGAGTTATAATTGTAAGTCCGTGTTGGATTCAG
ATCGATATCCGAGCGGTTCTCGTCTATGTTCTTGTTTATTTCTCCCCCTC
CCTTGTCATAGCTGCTTGTGGATGAACTAATGAAAAAACACATACAGGTC
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GATCCCATTTTAAACTTACGTGGCATCCTCTGGAAATCCCTCATTTAATT
ATTTCCTAATATAAGTTTAACTCAATTATATATATAATCCACTATAATCT
TGTTCATCACTTACTATTTAACTTTTTTTGTAACGAGTTTGATCGGGTTA
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TTGTTCAAGATAATAAACGGTTGATTTAATCTGACAATAATAAATTGATC
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ATATATTTAATTACTTCTTTTTGGCAGAATAGAGAGGAGTAAAATATATT
ACCTCAATATTTCAAAAGCATTTATAAAAGGCCTTAAAAAATTGAATGAT
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TATGAGGAATAAGTTTGTAATCCCGTTTTGATAGGGTTGATTAAAGCATG
TAAAATAAGGGAAGCTAAAATGATTTCATAATTTTATATTAAAAAAACAT
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GCAGATTTATGTTTTTGTCAGGTAACGCTCTGAGGAATTAAGCTTTCCAA
CAAAATAACGAAATGAAGATCACGTTATCTATATTTGGAGAGCAAAACTA
TTTTTGTCGGTCCTGGGCGTCGAGTATTCTTGAAAAGGACTGCATAACTA
ATGGTCCAAACTCCATGAATTCACTCTTTTAATAGAATATAAAAGGCGAA
TCCATCAAAAAGAAAAAAAGTTTGAAATTGACAAAAAATGATCTAGTGAC
GTCACAGATAGCATCACAAAAGTGACATCCTGCCTTGGGAAAAGGATACA
TTCCCAAGCTAAAAGTCACGTTTCAATTAAAAAAAAAAAGATTTATGGTA
ATTTTCCCARCCCCACCGATAAAATACTGCTATAGTACGGGTATACAGGG
TGATTCATTGAAATCGGAACACTAACTAATTCAATTATGAATGAAGCTGG
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GTCGAGAAAATAGCACAAGAACTTAAAACAACTATTAATTTAAAAAGTAA
ATATCTTCAAAAGAAATTCCATAATTATTACTTTCCTACGACTTGTCTCC
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CAAGTTATATATAAAATTACTTGACAAAAACTATTTGTAAATAAAAATAA
ACAGCCAACTTTAAAGAAAATATAATGAGGAAATCTACCAATAAAGGCCT
CCCTATTTTGAGCCTTAATTACCCCTGCAGTGTCTGTCATCCAAACACAG
AGCCGCTCAAAATCACTGTCAGCCAGCATTGGGGCATTTGTGATTAAGAG
AGCTCAAACACACATCAATTTATAGCATTAATTTTGTTGAAATTCTTTTG
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TTTTAATATATATTACTTGGTAAATCATACAAGTATAAATAAAAATTATG
TCTCTTAATGTCTAACTTATAAACTTATCAGATTAAATTTTATTTTATTG
TACACAATTTATTCTATATTAAAGAACTTTGTTTTCATATTGTTAATACA
TATATCTTTATTTAATAAATAGGACGAGGAATACATTCTAATTTACTAAA
TGTCCGTTTCAATTCTACAAATGATTGTCAAAAGAGGGAAAAGTTATCTT
TTCAATCAAATAATATTATTAATTTGATTTATTTTAGGGCTATATCTCTC
TCGTTTCTATTAATCACATTGAGTACTTTTTTTTTTGTCTGTTGTATATT
CTATGTAATATGTAGTTTTCTTTATTTTTGCAATTTGTAGAGCGACGTCA
CACAAGTTCTATTATTTATTTACTTTCATGTTTTACTAATATATCTTATA
CGTCTTTCAGTGGCATCTATGTGTGGATTCCCCGGAGCACCCGCTCATAG
CACAGTCAAGTTTAATACAAAAGCAGTACGAAAAGGAACCGTTGCTAAAT
ACACTTGTGATAGGGGCTTTGAGCTACTTGGCCCCACAAGGAGGCTCTGT
GGAGAAAATGGCACATGGATACCTCAAGGAATTCCTTTTTGTGGTAAATA
TGTTTTTAGTTATTCTTGATATAGTAAAAGGGGCGATAGAATTGCAGTAA
ATATGACCTACCGGCGGMATCCTATTATAAAAAAGGGGAAATGACATACT
AACCTCGAACATTTGAAGGTAGGCGAAGAGAAGCTTAACTGCTTAGAGGC
TATGAGAGAAAGGAAATAAACACAAGTTGCACTCTGTAATATCTAGGGAG
GAGATAGACAAGAAGGACTGTGATGTCAATCCTCACTTCTACTCTGAGCC
CAAAATGGATTTATCCTTAAAACTCCTCACAAAAAATCTTCCGTATATCT
CATCGTCATTCACAAGAATGAACAAAATATAGAGAGACCTAACAGCTGTA
AGATTAGAGAGTGAAAAATGGTTTAAACGATTCTCAGAGTCTTAACATCC
CCATCTAAAAGAAGTATTCTCCCCTACATTTTGTATAAATTGTTTTTAAA
TTTCCCAATATTTTCCTTTTGATAATACAAATGTAATTGTAAAAGGTTCT
CCCCTCTGTAACAATAATACATTTTCTTCCTCCAAAATCGTATAACTGAC
AAATTATATTAACAAGCGTTAATAACCTTAGTTATTCATGAGTGGACACA
CCCTCTTGGCTACACTTTATACTTAGATATTCTCACCTCTATAACAAAAA
AAGAAGAATAAGAGCTTCGATAAATAAATTGTTCCTATGTCACTTTTCAT
TTTCTTTTTTTAAAAGCATAATTGTATTTCATATTTTCTACAACTCCAGT
GGTAAGTGTAAGCTAGCATATGTGTCCGAAAAATAAACGAAATGGTACTT
ATTTATCTCCAATAATAAGGTTATAACATTTTGAGTGAATGTCGGTATAT
GTAAAGGGTTTAGTAAAATAAATTTCTTATTTTGACAACAGATGGCTTGA
GTAATGTGTATCGACATTGTATAAGTGCCATGGGTTTACAGTGGATGGAG
TTAAAAAGATAAGTTTTCGCGCTAAAAAATTTTGTCACCCAGTTGTGAGA
TTGTTGTACCCAGTATTGTTTGAGCAGTCACCAGCAATGAGAAAGTAAGA
CATATCTGACAGTTTTTCTTCAGAGTCTGAGAGTAACCTAAGCACTCTTT
TGATTGCAAAGAGGATACACATTAATAGAAGAAAATCCATTGAAAATATT
GAATTTCTTTGTACTACACCTTTTATTTTATAAATGTTATAAATATATTA
TCCATTATTAAAAATTATGTTCAGATATTTGATTCATGGATACACTTGAC
GGGTATTTTGAACCTATAAGAACAAATGGCTCAAGTTTTGATCTAATGGT
AAAAAATTTATATTCTAGAAATCAAATTTTGTATTTTCCGCCATATATTG
TGACGGAAAAACTAATATTTCAAATTTTTTCTAAGAATAATTATTTTTAA
TAATCGTCAATACCTATGAAATAGTTAGTCTTTATAAAATGAAGAGGGAT
TATCTTCTCCGTATTATAGAGTGAATTGGACTTCTTTCATCTTCATAAGA
TAAATCAATTATATAAAAAAATAATGTAATGGGAAGCCTCTAAAACCCAC
ATCTTCAAGCTCAATTATTTTGGTACCAATAAATCCCTTTGTCGAAACCC
TGTTTTCAAAAATTGGAGAAGTTGATAAAAGCTCTTCAAAATATTTGTGC
ACAAACAATGTCATTTAAAGAGTGAAGAAATGCAAATACTGTTAATTCAC
ATTTCTTTACAAGGAAAAAGTCAAATAAATGGATTTCATATAATCCTCAA
TTTAAAATTGTGGCCATTGACATTGATTTAGAAGGAAAATTGATTTTGAC
TAAAACTATAACATTGAAAGGCACATGTTTTTATTGAAGCCTTTTGTTAT
ATGTATAGACAGTGATGTAGATCCTGTAATTTTTTATTTGGTCTCTTATT
TTTTTTTGGAATTGGTAATCTGAAGAATAAGTTTTCTTTTTCTTAGCCTT
TCTCTTTTTTATTTAATTCCTGTGTAGTGAATATCCTATCCTAAATAGAT
TCCCTTATAATCAAAATCTGATTGCACATTCGTGTGTCCTCATAAATGAA
GGAGCCACAAATCCTCAGGGGCACCCTGAGGATTTGTGGCAGAGTTATAA
TTGTAAGTCCTTATTGGACTTAGGGTAGAATTGGGCATCGATATACGAGT
AATTTTAGCAAATGCCCTTGTTTATTTCCTTCTCTCCTTCCTCCCTGGTC
CCAACTGCTGATTCTAGCTGGGTTAGTGAAACGCAATGATCATTATTCTT
TCTCTCCAAATTGACAGGGTTACCATGTTGATTTTCGGTTTCTTTTTTAA
TATTCACATTGTACCAATTCCGAAAAAACAGGGCAGCTAAAAAATTCACT
GGATTTACATGCCTGATTATTGTCATCTTCACAAGAGGAATAAACATTCC
TGGAAAAAAATATAACATCCATTGAAAATATTGAATTCCAATTTACTCCA
CCTAATATAATCATTTGAGTCCTCCCATTTTTCCCCCTCTGAATTCCTTT
TGAATCCAAGATTGGTATATTACTTATGCTCATAACCATTTTCATATAAT
ATTCCTTGATTTATTGTGTATCCTTGTCAGCAGCATATAACATCCTATTT
CTTCATTTCTTTTGACTATGATTCTATTATTAAAAGATCGAAAATATACA
AATGTAATAGGATGTATCAAATTTTCAAAGTACTAACTAATCAAATAATA
CTATTTTACCTCTGAAGAAACATTTGGCTCATCGCAAAGTTGATTGTTAA
CACAAAATCAAGCTGGAGTGATATTTTTTTGCAAAAGTGAGTTTGGATTA
TATTTATATTGTTGTGCAAATCATTATCAATTTCTATGGAGAAATTATTC
TTGTTAACCCTTTGGATGTGCCGGAAAGTGCACTTAAAGTAGTCAAAATT
GATCGTCACAACATACAAAATTGATGGATTTTGTTTGAAAGATCATATCG
AAGCCAACATAAGTAACTTCAATCAAATAATGATAGTAAACTAGAGTCAA
AACTTTAGAGTATAACAACTCATCCACGAAATTTGAATAATAACCCTATA
ATTGACCCAAATATGCCTTTAAAATATGGAGCTAAAATGTCTATAGTATA
TATATTAAAAAATAATAATTGATATAATTTTGTTTATTTTTAAAGTTTTA
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