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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1041 | supercontig | LSalAtl2s1041:19329..29949 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000269 >EMLSAP00000000269 ID=EMLSAP00000000269|Name=EMLSAP00000000269|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=492bp
MPKTKYPPQGGEKHLCFTLFCTMLLSVISAVAIIYSIVIIYIPSKTVLES
TIALDSKMCTTLSNDRNLSGIDTCAGWSSCEEWCLSKSNKECSHVWAAAR
NLGTEIDWTDCDIIYDNEEESLDTFVNHRYTNGNTGDKNRCIRFNNIQIS
CEAGICKNITAVYKCDFQSKLLDLSAKGDPTLGQDGICQDQEFCFDLRKR
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TRDCVNGTWLEDNYNGGKVNYSQLVNEYSFRREIFEHRAHHIEYEPDITF
LNRTKLKINIEGCVNTLSKECTDFYENYGKDGRNYTSRAIYPCYYDPFDP
DFVVINFDPDKTLMLLILFSAVPGGILILSCTYMCGCSRFIHVADDGHMR
LMCCGKYVTEIGNVPIWNPPSPRSKKVVKDEQELILVENNIA back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1041:19329..29949- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000269-696116 ID=EMLSAT00000000269-696116|Name=EMLSAT00000000269|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10621bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1041:19329..29949- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGCCCAAGACCAAGTATCCTCCTCAGGGTGGAGAAAAACATCTTTGCTT
CACCCTATTTTGCACCATGCTTCTAAGCGTCATCTCCGCAGTCGCCATTA
TCTACTCCATTGTTATTATTTACATACCCTCCAAAACAGTGCTAGAGTCC
ACCATTGCACTCGACTCTAAAATGTGTACCACGCTTTCAAATGATCGGAA
TCTCTCTGGGATAGATACTTGCGCTGGATGGTCCTCCTGTGAGGAATGGT
GTCTAAGTAAGGTTTGTGGTTTTATTTATTATGTATTCCTTAGTCAAACT
AAAAATATTTAAGAGGCTTCCTCACTCAAGTCAAGCAAATGATATTTTAT
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CCCATGCAAACATTTGAGGTCATTCTCTTTAATCTAAAACTTTGGTCTTT
CATTAACAGCAGTCATCTCTGATTTCAAATAAAAGCGAGCTTGGCTTCAA
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CGAACTTATTACCAAACTGACAAAAATCAATATTGGACAGAGTCGTATAT
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AAATATTCTGTTTTGGTAAAAATCTATATGGCCTTCATTGAGTCCAGATC
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GGAACTTCCAGAATATTCGTAGATCACTCTCGTTTATTGGATGTATTGGC
TAGCAATGTCTGTTATATTGAATAATTATTTATATTTCGAAATTAAATTG
AGAAATAGTTGTTTGGAAAATAGAACAATAATCTTGTAACTTGAGATCGT
TTACAAAGTTTTGATAAAATATTAAACTTGGGCTTTTATTTTTCTGTTCT
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ATTCACGTAACTTCGATCATAAAGTAGAATAACAATGACTTGGGATTGGA
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GATCACTCTATTAATATATAGCAAACTCATTCTATTAATTAATTATTCTC
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CAATAATATTCAGATATCCTGTGAGGCTGGGATTTGTAAAAATATTACTG
CCGTCTATAAATGCGATTTCCAATCCAAACTTCTTGATCTCAGTGCAAAA
GGAGATCCAACTTTGGGCCAAGATGGTGTTTGTAATTGTAACCGCTGTGA
TATGGATGTCTCTCTCTCGCCTCACATAACTCCTAAGGCTCCTATAACCT
CTCTCATAGAGCATTGCCCTCTAGAAATTATTAACTGTACTTCCGTCCCA
GATAGTTTAAAAAAATGAGTCTCAACGACTCGCCTGCTCTGATGTCAAAT
GTTCATCTTGCAAGCAGGTGCGTATGTATTCCCTATTAAATGGCGCAAAA
ACAGAAAAAGACAATAGGCCATGATATTCCACGCCCCATCTTGAGCTATT
ACGAAGCCCCTATGCCAAACAGACTGTGCAAGGTCCAAATTTCAATCTGA
AAATATTATATTTTGAAGAAAAAAAAATTCCCTTTTTCATGAAAAAAAAT
ATTAATATCCTTTTTTTTTTGCAAACAAAATTATTTTTTGCAGCCTTTTT
AATAAAATTTATTATAATATTTATCAAATAAAGTTTTTTAGAAAAAGTTT
TTCTTATTTACCTCGAACAAACTATTTATAATTTCTTATTTTTCAATCAA
GCACAAGGCCTATTAGAAGGTTTGTAGTGATCTGAGATCGGCACTTCTCC
CACTTAATGGCATTAATATGTATGTGACGTCATTTTAATATAACTACTTT
CCACCATCTTATATATTTGTTCCACCGACGCCCAATTCCCCATTCCTTTC
CTCATTGTTATTAAATATTTTTTCTGCCCCCAGATTTGCCAAGATCAGGA
ATTCTGCTTTGATCTCCGGAAACGTCGGGATCCCACCATCATCGGCACCG
ATATTTACCGAAATCCCGTGAAACGATACTATACCTGCGAACACGGATAT
TGTTCAGAGATCTATGACTTGAAATGTGAAAGGAGATGTGATGACCTTCA
GTTCAACACCACAGGTAAAAATTCCTTCATCTTTAATGGAGAGAAAATCA
TCATGGCCTATTGTCGAAAAAGATCCACAGCTAAAATATCCAAAGTAGAA
GGGCAGACAGGAAAAAACACACTGATTGTGGCCTGTACCAATATATCCAT
TGGTAAGTGACTTTATTTTTGTTATTAAGTATCTATATAGAAACATCGAT
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TTCAAATGTTGATTTTTCAAGACATTTTACAAATAGATACTATTATACAT
AACTACAAAATTTGCTTATTTAATCAGAATGTATTGTTAGGTGACTGAGA
CGTTTATTATGGCATCTTCCTCATAACCAATAATAATACATCGTTATCTT
ACTTTAAAATTGACATTATATTTTTCTCCATATGTTGGTCAGATGGAGTT
TTATATTCAGATATAAGTAAATATTTCAAATAAAATAAACGTGTTTAATT
TTTTTTCTTTAATTGGTCAGATGGAATTGCTTGGAATTAATATATTGTAA
ACATTTAAGTATTACAATTACTCCATCCGACCAAATAATTCTCTTTTGAG
GTTAATATACAAATGTATTTAAACTTATGCGTTATGGAAGTCAAATATCA
GTTCTACACGGGTTATGGTATAACCTTATATTTCTATTAACCTTGAATTA
TCTATTTTGATCTCCCTGAAAAAGTGACCTTTGCCCAAAAATTCAATAGC
ACTCAAGGTATAATTCATAACTGCAAAATAACGCAGATAACCTTAGTCTT
GGTAAAAAAAAAAAAAATATTTAATAAGWAGGCATCCATTGCTTACCAAG
AGCATATCGCTTGTCCTACTAATGATTGACTTCCACCATGCTTTTTAATA
GTAAAGTCCTAGAGTATATTTGTTACCAAGAGTAGTTATATATCGTCTTT
CTTGACTGTTACTGTTAGAGTACCATCAAATAGAAAATTCTAGCAAGTCC
AATTACATGATGGTCTAACCTAGTACTTCTATTAACCTTGTTGGTGACAA
AGTTGGAGTGAGGTTTACTCTTTATGACGTCATTTGCCAGTGGCCTCATC
ATCAATCAATCTTGACCACCGAGGATCCAATATTTCCATAAGATTAATAA
ATGCTTTAATTGTGCATAAACAAGAATAATGACGAACTAAGTAAAGAGCT
TTATTTACTTATTAGTGGTTTTTTTTACCCAAGGATAGTGGCGCCATTTT
GGAATTATTAGTAGTTTGTTTTACTTATTTGTTTATCACGGAAACTTTGT
AGATCTGTGTCGTATTGCAGATGTTGATTTTTTTAAACTTTGCTCATATC
CCATTGGTTAATAAACATAATTATAATTCCTAGTAGAGAGCGCTTTTAAA
TTTGAAACTTTTTTTAAAGGATTGGACCAATTTTAAGTCCTATATTAAGG
ACCAATATAACTAGTGAGGTATATCATGTTTATTTTTTAGCTGGCCCGCT
TTTTTGGAATTAGTAGTCTGAAGAATGAGTTTTCTTTTCCTCTCGGCTGT
TCTCATCATTATTTAAGTTCTGAGTATTGAACTTATTTTCCTTCTATATT
CAAAACCAACGTTGCACATTCGTTTGTGTGCATAAAAGAGGGAGAGTAAC
CTTAAAGATTTGATGCAGAGTTTTAATTGTAAGTCCTTATTGCAGTCAGA
TTAAAATTAAGGATCATGATCAGAGTAATTATTACCGTTGTCCTTGTTTA
TTTCCTTCTCCCTTGCCACAGCTGATTGTAACTAAACTAATGAAACTTCT
TGACAGATGCTTTCCTCCTAAATACTCCACAAAGTGTTAGGGTTACCATG
TTTGTTTTTTGTAAGTACAAAATAATTAATTTTGGAGCCTCTTTTTCCGT
CTTTTATTGTGTAAAGAAAGGTTGAGAGATAGAATACAAGAAGTATCATC
ATAATAAGTTATGAATCATGAATAATAAAGAGGTCCCGGAAGGGTCAGAG
GAAAGGATGAGAATAGGGAGAGAGGAAGTACGTGGAGTACATAGTAGGTA
CAGAGTACTTATGTAAATTTGAAAATTAGTTTTACAACATGGATATTTTA
GTATGTAACGAGTTCTAATAATTGGCTATTAAGCTATTTTAAAAACATAC
ATAACTAGTATGTAATGTTTATAAATGCATGCACGAAAAAAAGGAGAAAT
AAAGACAATTATTATATTATATTTTACTAGTTACTAGTAAGACAAGTATT
ATGTATCAATGTATACCATAGAATGATATTTACAACGTACTCGTAATGTA
AAATGAGGTTTCTTATGTAGGATATCTACTCTAGTTATTATGTGAACTAC
ATATTATTATAATGATAGGAACACAGATATAAATAAATATATATATATAT
ATTAGGGTAAACCGATTGTTCCTATGTAGGCACTTGGATTTATATGCCTA
TTACCTCAAATATAACATATCTTGATAGAAACATGTGCAAGGTCTGGCAG
CAAAAAGCGTGGACTCTCGAGCCTCCTGGCCTTTATGACCTCTGTAAGAA
GGTGGGGTGGTGTCTTCGTGTATAAGACAATACCAAGTCTCCCTGTACGC
CCATTTTGATGGTCCTAGCAGCCACGGAGAAGTCGTTGGTGAGTCGATGA
AATCGATTTGGTGGGGGCATCCTTGATTTTTTTTCTCCAATATAGACAAG
AACTCTGGACTCCTCCTTAAATTGTGCACTCTACTTCTTGCTTTCCTGGA
CGGGCCTTCTCCATCATTCATCATCTTGTCCACTTTTGAAAATCAGGCTC
TGTGAGTACTTCACGATGTCCATAATCCTTACCAACTCAACTCCAGCATC
TAGGAGATCTGAAATGTACTGTCTTTTGACTATTTGCTCACTTATGATGA
CTAAATGTGTATTCATTCAAATGGAATGTCTGAAATAGAATGTCAAAAAA
TATTCACTAAACCTTCCTATATTAATGAGAAAATTAACATTGATTAACAG
TCCACGTTTTGGTTAAATCATYGGTGGTCCTGGKCTKCCACTAACCTACA
GAGTCAGGGCACAAAACTTCCACTAGCATGTAATCAACATTTTATCCCAG
GATATTTTTAATTACAAGTGTTCACTAGGCAACCAAATGTCAGCTGAACA
AAAAAAGTTTTGTTTTTATCCCACATCACTAAGTGTCGGAGTAACAACAA
CAAAAAACAGCTCTTTTTTGATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNTCTGTACCGGTGTCAGTGGTGAGAAGACTGCAGAGAATGTTG
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TACAACCAAGAAGTATCAAAATTATGCAGCTACAATATAACTGACCTATC
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TTGTAGTTTGCACTGTCTTAGAGAAGAATGTATGTCACACCTCTCATCCA
AATTTGGATTCGCTCCAAGCTGCTATCATAGCTGCGTGGTACTCCATGAA
CACGGGCTTCATTGCAAAGAAGCTGCCAATCTATTCGCCGGCGTGTCAAG
GCTGTTATTGTTTGTGAAAAAGGACATATTGAATCAAGTTAAACATTGAA
TACAAATACATCACAAATTTATTTCTTGTTGTGCTTTCTTGAGTCAATAA
AAATCCCCTAGTTTATTCATTATTTGCAAGTTTTGAGTTCTAACTCTGTA
GTTGTCTTACAATTGGGAATTTGGTAAACTTGCATAAAATGTTCCTATTT
GAGTTAGCCATTGCAAGAGCTTTAACTTTAAAGCAAATATGACTGGATCT
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TCGAGACCCCTTCCAATTTGGTTGATTATTGCATACGTGTTTCTATCACA
AAGTGTCCCGATTGAGAGAATAGGTAAGAAAATCCATGAAAAATTTAAAA
ATATGGGGTGTTTGATGCTCTCTAATCAAATGATATTGATACAATTTGTT
GTGCGTACATATAAGACCCTTTTCTTCTAAAAGATCCCACATATACATAA
CATACATTGAAGGAAATAATATCATATATATTCCTCTACCCGTAATACAG
AATTCCTTACATTCCTGGCTACAAGCAGGCAACATCTAAATATATATGCA
CGTGACACGATATTTAACTAATACTTCTAACATAAAAATTGGTATTTTTG
TCGGCTACGGTCTTTCTTGTCTTTTGTAATCTAGAATCGATCGGAGKGAT
CGATTCTAGTAGTATAGATATAAAAATCTGCACTATATTTTTTGTCAGCT
GTCGATGTTTCTGTTTCTTCTTACCTAATCAGGGTTCTGAACATTAATTG
GTCGAATTAGATTAAGTTCTTGTTAAGCAACTGGGAGTAATTATTAAATG
ATAATTCCATAGTTGGTAAAAATTTCTTACTACTACTAACTAGTGTTGGA
TCGGTACTAGGACTCCATTCCTAATCAGTCATTTTTTGCTTCCTTTTGGG
TCATTTTTCTAATTGGTCCGGTCTTTTTTTCCATTATCCAATGTGTAGGT
TCTTAATCATAGGTCTCTAATTGAACTAATAAGGATGTAAATCCTAATTT
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TATCTATTGTATATCTAAACCTTTTCTATGAAAAAAGAAGGACACATAAT
TAAATTTAACTCAGTTAATTACGCCACATGTTTTGAAATGTTGGGCTAGT
ATTCATTTCATAGTTTTATTTCATACAGAAACCTTCCGGTCATGCCTGGA
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TCCAATTTGACTATTTTCTTTTTGGATTAAACCTGACTACTACATATGTT
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TATATTTTTTATATTTTAGACCGGGAGTCAAATATGATGATCACGAGGGA
CTGTGTGAATGGAACATGGTTAGAAGACAATTACAACGGAGGAAAAGTGA
ACTACTCTCAACTCGTGAATGAGTACTCTTTCAGAAGAGAAATTTTTGAG
CATCGTGCACATCACATTGAGTATGAGCCAGACATTACGTTCCTCAATCG
AACCAAATTAAAAATCAACATTGAGGGCTGTGTCAATACTCTGAGTAAAG
AGTGCACGGACTTTTACGAAAACTATGGGAAGGATGGTCGTAATTACACA
TCAAGAGCCATTTACCCCTGCTACTATGACCCATTTGATCCGGACTTTGT
TGTGATTAACTTTGATCCGGATAAAACTCTCATGCTTCTCATACTCTTCT
CTGCTGTTCCGGGAGGGATCTTGATTCTGAGCTGTACATACATGTGCGGA
TGCTCTAGATTCATTCATGTCGCAGATGATGGTCACATGCGACTGATGTG
TTGTGGAAAGTATGTCACAGAGATTGGGAATGTTCCCATTTGGAACCCTC
CTTCACCTCGTTCAAAAAAAGTCGTTAAGGATGAACAGGAGCTGATTTTA
GTTGAGAACAATATTGCTTGA back to top
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