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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s104 | supercontig | LSalAtl2s104:881623..937686 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000351 >EMLSAP00000000351 ID=EMLSAP00000000351|Name=EMLSAP00000000351|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1069bp
MPEHREAHDFNIPEPPSSRLTNEDFRKLMMTPRASGSSSCAXPSSSTSAS GSASASSSSSTLNKGKREKVPSEVSERRKKKKSYYAKLKKAEDDKMAELA AKYRDRAAERRDGGTNPNAQAAXXANTNTDETPSNTASSGYRAVAPDVKS SYDAAERRRQMIQESKFLGGDMEHTHLVKGLDFALLQKVRSEIVNREIET EEVVQPEDEEEVEENEEKKETTGDPITDLIHTCKTSMAKGLCRNLFKPEV PERNDFFIPGRMAYIIDLEEEFAESDIPTTSIRSKVXCXANVDQQTTLST NDIVINKLTQILSYLRAGSRNKKKKKDRLKEEKMAIESGKKGLNEDIYQD IGEYDPQVKNDNRRDHYREKVKDRKEDRKSNRYKDDKRHSSRWDDRERKP RNYFDKTEKEEKEPEEGFSKNDKELKKMTKLLGNKKGPVGRWDFDTQEXY ADYXGRKXAMPKAAFQYGVKMAEGRKTRGKVGAKNERAKFDKEWNKIXAI IDKRNNDEDGIMFCLRSSDAISTTDSSRHGDGIDLPSPASSTVESETSDY PRSTPSPRDHDSGIGSLEEFSDSKDTDQGLGDELIDELSSSGKEACINNN NNNESADVLRKVRVALEKLPEGRGPLSSSNCLKSSSLKKRLPHNISISCS NNKCNSEKSEPAKKLKLEITEMGNQGKITEYLSEMKHFTALRKEKLDRVL NLKTEIESSSSLLQTVVKKEELSIHTTAEDYFQSTTPELLSESSVDSSER NLKTTPPDEEKPPPIVVESHQFEVPKAVIRFPSKSVNMIQCRWESCGQEL ESCGKLIDHLKTRHASLQMKEEVQKYKCLWEGCKVFGKTSCSKSWLEKHI ISHGGNKPFQCIVDGCKQRFSTQSLLERHVNSHFKSTSLPNPHGNVVRKI CETSSSSSSSVYHSASGSSSGSSTPKVVSKVMKKAGRKLKYRKTIFSARL FDLFDIGIMAQLQEKLAAIETNSCCKVDQDRITLSGSVIAKKRDESGKVM FLMRWTPINLLDDEWVDKAXVSSYKTIRICSLPESSKYTLSESLFHQNNT PSLRFKRKFNPLRMKETLS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s104:881623..937686+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000351-696198 ID=EMLSAT00000000351-696198|Name=EMLSAT00000000351|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=56064bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s104:881623..937686+ (Lepeophtheirus salmonis) TTCCCCCTGTCCAAATTAATATTATGATTGAATAACATCAGGGATAAATA
AAGAAGTCTTTTAAAAACCAAAGCAAGCATTAAAATCATTGAATTGATTA
GTTAATTATCTCAACTCTCAAGGAGCCATATTACTTTTAAAATGCCCGAA
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ATTCACACATGCAAAACCAGTATGGCCAAAGGCCTTTGTAGAAATCTTTT
TAAACCAGAAGTCCCAGAACGAAATGACTTTTTTATTCCTGGTCGAATGG
CATATATTATTGATTTGGAAGAGGAATTTGCAGAGTCGGACATACCGACT
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AAAATTTTGACAACGAAGCACAGTTTATGTTTTTCTTTGTGTAACTTAGA
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ATGAATAGAGAAGGAAGTAATGATGAATTTATATATACATTTTTTGGCCA
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CCTTTCATTTTATTACTCATTGTTATTACTTATTTGAGACTATATCAAAG
TGATTTTAATTTTTAATAAGTGATAATTAAATTAAAAGTATTCTTGACTC
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TAGTCTGACGACAGTTGACGTAATCTTAAAAAAACAAAACAAATGCGATT
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AAAGTTTGTATTGCGCTATTTTTAAGAAGTTTATAATTTTTTATTTATAG
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AGAATTAGTCTCATTTTTAGCGTTAAAAAAAGTAAAATAGTGTTCTGTTC
ACAAATCTACAAATGATATATGTACCCGTATCCCTATCTTCCATTTTTAT
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ATGTTGTCTTTAGTGTTGGATCATTCTAAGAAAAACTGAAAATATATTTT
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ATCTCAACACGTTCCCGTAGTTTGAATTAGTAATGAGACGATTACTCGTA
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AATTGACCATTTCTTCCTATCCTTGATTTTTGTTCAAGATATTTTCGTAG
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GTTGTCGTAGTAATAGACGCTCATTGCATTCAAAATGACAATCAATATTA
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TATTGAGTCAAGTTTAAGTTATTCAACATTGAGTCCAGTGGAGTTGGAGT
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TTAATTAGTCCTGGCTAAAAGAAGATTTTTTGCCTATTTTTAGTATAAAC
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CTCTTTATAGTTATAATTTTTACCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAA
ACTCATCATCATCATCATATAACAAGCAGCTGATGTTAACAAAGGTCATA
ATTCAGGTGTCTCGTTCCTCCATTCTTCTCCTGGTCTTATAAAAAAAAAC
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AAGGTGAGGATCTCCCAGAATGTCATAACAGCTAGGACCGTCACTAAGTC
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TCCTTTTACTTGTCAGTCTCATTTTGACATTTTCAAATACACTTAATTAA
GTTACTATTTTCTTTAATCTAAATTTTAAAAAAAGAGTTTGTAATCATAT
AAAATTTGAAAATAAGGGCCTCCCCTTTCTCCACCAAAATTTGTATAAAA
GGCAGCTGATATTAATAAGGGTCTTATTTGAGTAATATCATATGTCTCGC
TTCGCCTTCTCTTGGCGCTCTTATACAAATCACATCTCTAGGTATCGGGA
AAGAAAAATATGTTTTAAGGTCAACATCTGAGCAACATCACTATTAGTAG
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AGTTCAGTCCTGCATACTAGTATTAAAAAAATTATAAAGTTCGGTCCTTG
ATGACGTCAATCAACTTTATTAATTCATTTTTTTACCAGTTCTATTGTTG
ACAGTCCTAAAAATCGGTTTTAAGTCTAGACTGGACCAGATAAATATGGA
CAGGCAGAACAGAGATCACTTCCTACAGGGATGATACTAGGATTTTTCTT
TACAGGGTTAGCTGAATATTTTTTTTTCAAATTTTCCAATAAACATTTTT
TTTAAATAATAAAAGGCCTTTTTAAGAAATAATTTGCTTCATTTTTGATC
GAAATATTTTTTTATTAGAAAGTATGTTAATTTAATTAACTTTTTTCTTT
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ATATTCGATATATTCTAAAAAGTCATTTTTTCTGGAAAAAGGATATTTTA
TTTCCCTTTTCAAGGGGCGTTCATTTTTTAGGGCACTACAAAAATTCCGT
GTGACATCCTWTTTTTTCCSKCRCTGATWCTCMTGGGGGGGGGGGGGGAG
GATCATCCTCGCATCCCCTACTCTGACTCCAACATACAATTTAATTATAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCTGTACAAATTTTCC
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AACAAACATGGAAAGGACTTTTTTATCGTTCAATGAGGGATAGTTTTAGA
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GTTTTCCAAGTAATATTTCGAGCCATAGTTTGAGTAATTTTTTGAGAATG
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ATTCAGCACTTGTTTCAACTATTGGACTAGGAGTACACTCAACTCTTTAT
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AACAAGTGAGAGAGGAGGGGAACGAGGGCAGTAGGTCAAATGTATAAGTG
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CGAAATGAATCAAATTAATCCACATGGAAAGATGTAGCTCATTGGACAAC
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GCCTCGGKCGTTCCTCGAAAAAGAAATATACTTAATGTGTATGTATTTGC
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ATATCATTTCCCTCAGTTAAGACCTGTCTTAATAACAGCTGCCTTTTTTA
TGATTTTGAAGGAAGAAGAGGAATTACACTGCTATAAAGAGAAGAATTTT
CTACACTTAAAATAGTGTTCGTGTAGGGAGAATAATTTAATTACATTTAA
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TAAATACACGTCTGGATTTGGTGGCAGTAGCTTTTTAGAACATTACTTAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AAAAGGTGCTCATGAATGTTAGAGAGTAATGKTGATGAATATTTTGGTAG
ATATAAGTGTAAGTTGTACTCATATAAAGATTGAGGATCGAAAACGGAGT
AAATCCGCCTATTTCCTTGCATGATACATGATATTTTCTTCCTCTCATGA
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TTAATTGTCCAAAGCTGCTATGATTATTCTTTGTTTCTTGAAGAGAGAAA
AATAAGTATACAGTATTCATTTATGCACACAATGATAAAGAGTAACACGG
ATAATTTCTTGTGGAGTTCCTTGCTGGACTCGGAGTATAATTGGAGGATT
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TGTGTTAATTTCTCTCATGTTATTCTGTTATCCTGCAATACATTCTTCAG
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AAGCTAGTCATATCTATATAGCATCTATCAAAGATGAGTTGAATTCAGCT
CCCCGGAATTGCACTGTTCTAAATCGTGGTACACATACACAGAATCCAAC
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AACTCACTCCAACGACTGTTACATAGTTACTGCCCGTCTAAAATGGCTGA
AACTTTTGTGAGTATCTGTCAACAGATGCTAAATAGATGTGATTAGTTTT
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TCCCTCGTATTTCCGTAGCTGTAACGCTACATTGTCTCCTCTAATCTTCA
ATGTATTCCCCTCTGCCGTCTACAATGGCACCAGTCGCCACCTGAAGGCT
TGATACGTTTTTCTTATATATTCTTTCGACATATCATCCAGGTGTTAGTT
TACATTGGCCTTCATGGCCATGATATTTTCGTCCCTCAGGGTACATACCC
TGGACTGCACACGTGACCAGTAGTCCAAAGGGTTGACGTTGGGTTGAGCA
TCTTTGGCAGAGTGGGCCGTCTTTTTTCAGGACCACATTATCATCCGGAA
AGTTCGTCCGAACCCGCAAGAGGAAGTGATCTCTAGATGTTATCTCCTGC
ATCAAAAAGTGCGTGGATCTTCACGTGAGGGTCACGTTCTGGCGCCATTT
TCTCTATAACTTCAAAAAGATAAACAAATTAAATTTCTAAACAGTGTTAT
GAAGTGTTCAACGTGGCTATCTTTATTTATGTACGCCTCTTACAAACTCA
CCATAACCTCTCAATTTGATCCTAGTGTTCTAATTTCAGCGTTGTACCTT
ATATAAGTACAAGTTGCAACCCAAAAATGAGTAGAAATATTTAAAGTGAA
GAATTTACGTTAGAACTTGTGATTTGTATTGTGTCGGTTCTAATTTCTTT
GGTCCGGTATAAGACTGGACTCAAGGACCGGCCCATAAATAATTCTGAAT
AATATTTATTCATAAGGAAGGAACAATTCTATGATGTCACGAGGGATTGA
GTTTTCCTTATTTTCTTTTTTTTTAAGAACTGCAAAGTAAGACTGGACTA
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GTAAGATGTCTGGTTAGTCCCCCTCTCCAAAGTGCCCCACACAGCAAAGT
CCAGCGGGTTCAAATCCGGCGAAGATGATGGCCACATTTCAGCCATGTTG
TCGGCGCAGAACTTCTGGCATTTGGTCGATGTGTGTGAGGGTGTAACATA
TTGGGTCCACAAATAGTTGTCGTCTGGGTATGTGGCTTTGAGCCATAGCA
GTATGGTGGKCCTCAGCATCTTGTAGTGGGCCTTCTAGCCGATTTTCTTC
CCAGCCTTAAAAAGGAAGTGAGGCATCTTCTTGCTGTCGGACGCCAAGTT
CCCGAGGACCATTATTTGGGCCGGATGTTTTGTACAGAACACCCCCTTGA
CCTTTTCTGGGGATCCCCCAAGCCAAGGGTCGTTCTGACGACTGTAGACC
TGGTCCACGGTGAAATCTTCTCCTTCACAGCCCTCCTGATTGTCCCCTCG
TCCAAGTCAAACTTGTTAGACAGGCGATTCATGGATTTGTGGGGCTCTCG
TTCATCTTCTTCTTCAGGTCCCCCAGAAACTGAGATTACCTTTTCAAGTT
GTGTCTCCCACTTCCTTCTTTCCTTGAGAGGTATTTTCCATCCTTTTTCA
TCTTGGCCACCTTGAATATGAGGCTCCTGGAGAACCTCAGAATGTCCATA
ATCTCTGCCGTCTCAATTTTGGCATCCAGAATGTCTGAGATCCTCTGCCT
TTTTTGCTTCTTGCTCTGTCTTTATGGAAGGTTTTATAAATTTTTATTCT
TGTTTACTTATGCAAAAAGGACAGTAGATTCGGAATATGTTGGAAAAAAT
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GTTTTTCTTCCGAACCCAGTATATATTGTTGTTCTTCGTCAAAGGCTGTG
AAAAATTTCTAGACATTAATCAATATGTCTCAAAGTTTATGCTTCTTCAT
TTTATATTAAAGTAAACTTTTTCGTACTATGTTTGCCGAACATTTCGAGC
AAAAAAAAAATGAACCAGTTTAATGTATGTACCTTTAAAAAAAATTAAAA
TGAAATAATAACTAACATCAATTAATATTTGATATTAAAATATAGCTGGA
GTCATAAATGAATAAAAGGCTGCCAATTTTAACTTGTAGAATCATATATT
CAGCACTTTAAACTTTAAATCCATAGTTGAGAAACATACCAGGCCTCATT
TTTTCGGGAGAACTATTTTTTTCAATAAATCCATTTTACAGTTTTTATCC
AATACCTCAACAAAAAAAATATATATATATCAATAATTTGCATTGTACTA
TTCAATTCTAATGTAAATTTACCTATGTTCATACTACAGAAAAAGGACTT
GTTTCAATCGTTCCGTTGTTGTAACTGTCCCTGGCTGCGGAAACGGTTGT
AACTAGTGATGGAACGGTTCCAAAAATATCCCCATAACGATGCTTCTAAA
AATTCCCCGATTCCGATTCTTCTGGTTAGAGCGTAATAAGTACACTTGTA
GGTCCAACGCAGGATTAAAAGAAATACAAGGGGATATTATAACGCTTTTA
GGACTTATGTTTGACTTCCACATCGCTTTTTAAGAGTGATGTTATAGAGC
AATACTGTTACTAAGAGTAAGAGTTGACTGTTACTGTTAAAGTAACGCTG
TTATTCTCAATGACGTCAAAAATTCTAGAAAGGCCGATTACATGATGGTC
AAACCTCCTTATATTTAAACTAACCTTGGGTCGAACGATATTACAGTATT
ACGAAAGAGTCTTAGGGGTAAGCTGCTGATACAGTATCATTCACGTTTAG
ACACGTTCGATACGGTCTCATATACAAGATAACATAGTATTATTACTAGA
TATAAGAAGGATCTGAAACATACATATATAAAGGGAGTAGTACTGCTCCT
TGTCAATATATATTTTGTGAAGTGTAGATCCCAAATCGAATCTAATACAC
AAAGTACTTATTTACTTCAAAACTTAAAAGCAAGGGTTTTTTCCAAAGTG
TGTCTTTTGCTTGTGTAGAACACGTTTTTTTTTTTTTCGTTCAATTTGTT
AATTCTCCGTTTTAGAGCATTTGGTTATCATAAATAGTTTAATTACATAC
AATTATAAGACTAAAGTCCTCAATTCACATTCTCATTTCTTGTATCTTAT
GGGAAATATTTCATATTTTTTTGTTCATAACATATAAAAATTATTCATAA
GAATCGAAATTGTAGAATTGATAAGCTGATTCCAGAAAAAAATACCCATT
TCTCAGATTTCGTTTAATCTTCCCATCACTAATAATAAGTAAGTAACATA
AAACAAAATGAAAGTATGCCATCAGCTGTTCATTAAAATGACACGTGTTA
TAACTAAGTAAATAAACGTTATTTACTTAGAATGATTAATTTCAACTTTT
ACAAGTTACAACTTGTACACAACATAGGTATATGGTCATACAATATACAC
GACTCAATATTGACGATTCCACTTGATTGTGCCCCATTGGTTGATGTTCA
ATTATTGTTGATATGATATGACGTATACATTCAGTATCATTTATAATTTG
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GTCAATTGTACCTACTATATATTTGTTTTTAGATGGATTATGACATGAAC
TTTTTCATATGTGACCCGCTTCTCCTCCAGTCTTTTTGATATCGCAAAAA
AATTGATTATAGATAGATTTTCCTTATCTACCTTTATCTACCACATAAAC
AGGCATATGTATTGTATACCCATATTAGAATACCTTCTCTTTGTTCAATA
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