EMLSAT00000000360, EMLSAT00000000360-696207 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000360
Unique NameEMLSAT00000000360-696207
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1053supercontigLSalAtl2s1053:14639..41953 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000360 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000360EMLSAG00000000360-683126Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000001664EMLSAE00000001664-710592Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001665EMLSAE00000001665-710593Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001666EMLSAE00000001666-710594Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001667EMLSAE00000001667-710595Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001668EMLSAE00000001668-710596Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000001669EMLSAE00000001669-710597Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769158auto769158Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000360EMLSAP00000000360Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000360

>EMLSAP00000000360 ID=EMLSAP00000000360|Name=EMLSAP00000000360|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=740bp
MSREELLKSYLFSSTQDGNIHVEDFLWTGSGDSDLPLEDFDITSSMVDGI
SNPDDSNFINYLPTTLTVTRVSTVVSTIHHPHYSHQGGQSEQGNDLDKID
PTPTYPMAGNTYASHIGFQNNSLSSSNEKLPNEKYLVRTVVLSNMTVIRR
DIEKFKKDMEIKLEKAFRKAYARKRKRMKRNEDFHLVRRVRQVSSDPDNE
SSFQRTRIKIHNIRSSLPEPEIEMLYTVYEDDKPVLAQTAVETLLDNVDD
EDAEEYLGFPLITKAEPYIQRLKVDPNSTLAHGSSSWMIASIILCLLFLL
ALLLLLLLLTWNRCKDDNEHAAKHKRLVSSPLTSQASTLKDRRKTQLKQS
SSSLEKAGFNLSRPKSKASIVRVSDNENEFXFDERPKSPSVKSSPPTSIK
QQAGAIETAYIERTPQTTYDDCATSTGSLNIKVDRAESPILADLSSNETP
EMKQRNRRPKHLIKKHKSKRVSPVDRNSAFPSSTPDRAGWLGPLSDLLEE
DGDEEYGSHSPGRNSNSSNLSSSTTTTTSSSSLKVGWRKEKRTKSKEKQS
VTVYSQEDISAPQRVGAAPDTNQREDDEDQTRAISAKSHLFRKGKVESRL
SNLGKPNKTRPWSASESRPPPAGDPTFYMRQRHWEGLIAGKKHLHRGQLL
PGSTSSEDDEGTYSKINPPPTCWSECSSPRKQVRIQEEPIESISNEVDKS
GQLIQAIKDELQKFQRPKSPNLTGISVINDPELVQRESSS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1053:14639..41953+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000360-696207 ID=EMLSAT00000000360-696207|Name=EMLSAT00000000360|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27315bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1053:14639..41953+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAGTCGAGAAGAACTCTTAAAATCCTATCTTTTTTCATCAACTCAGGA TGGAAACATTCACGTTGAAGACTTTTTATGGACAGGATCAGGTATATTAT TTAATACAAATGTTTTCAAATAATTATAATAACTAAATTCTTCGTTGAGA GTTTGTTACATATTATAATTATTATTAAGTTTCCCCCCCCCCTCTATCAA AATCATTTAATAATATCCAGTCAAAAAATTGAAAAGATGGTGAGAAAATT GGATAAAAAGTKCCTCCAAGTGAAATAAAGTTTCGAGTCATAACTTTTGA GTCCTAGTCAACTCTTGACCCTTTAATTTTTTTATTGAGTTTGAGTCRAT AGATTTCNNNNNNNCCTCATCTCAAGTACATTATAAATATTTATCTGTTA ATTGAAGTTAATTTTCAATGAGTTCTAATATATTAAAAGTAATTACCACA CCCAAACCAAATTTTTATTTAATACGACACCACTATAACATGTTGAGTTT TGGGCAATGTGTCCTCTTAATCCCAGCATAGAATTACGCAATTTGATGAA ACACACACTCAAAAATTCATCCTCGGACCTATAGACACACGACAAACTTT GCTGCATTAATATAGATTCATTAATATTTCTAAATGCATGAGGGAGGGGC CACTATTAATCATAAATTTGAATGGTCAAATTTAATTTTCAATCCACCAG CCACTAATTCATTTGGCATTTCTTTTGCGATTTAAGCTTTAACATAGTCC TCATTCCTTTAGCACTTGAAGTATTTCGGAATTAGAGTAGTATCTTTGTA ACCATCCTTTTCTTCATTGTTGAAGTAGAAGTTACATCGTAGAGTAAACT CATTTTTACGTAAAATTAATTACGAAAACAATTTTTAAATCACAAGTTTC AATAATTCTTTAAAATATATGATTTTTTTTTTGTCAGACGAGTTTTTTAG GGAGCAAAAGTGTTAGGGTAGTAACGGGTATTTAGGGGAGTAACGAGTAA AGCTCGTAATTCCTAGAATATTTTGTTAGAAACTCGAAAATACTCATGCA GCAAAATGAGCTCGCGGTACATCACTAATATTTATCTATAAAAATATAAT TCTTGACAATAATGCGAGTCAAAAGATGAACATAGCGCAAGTAGACAGTT TTATACCTATCAGTTTTCAAGATGATAGTGGTTTTTTTTGGGGTTTTTTT TTCATTGTTATGTCCAGTGATGAGAGTAATATGATTTAAAAATGAACGTG GTAGTTCTGACAATTTGAAGAATATTTGGGAGAAGTGTCGGTCTATATTT ATTAGTTCCAGTCCAGTTTTAGGACCGGTCCTGTTGGTTCTTAGGACTAT CCCTAACTGTACGTCTTGGAATTTCTCATATTAACCTTAATAAGATATAT GAAAAATGCACATATCTTGCAAAAAAATTGTGCATTTTTGATTATATTGT AATATAAAACGAACAAATTTTTGCTTAAATTATTTATTATATTATATAAC AGAATGATTTAAAACAAGGAGGGAATCTCAATAACGTCAAAAGGGATCGA TTTTACCATTTAAAAAAGATAATTTTACATTTTTGAAGGACCGACAAGTG GAATTGGACTGGACTGTGAACCTCAGTCTTATTTAAGGGCAACTCTAAGG GGTCATACATTTATAACGTCCTGTATTTCGGAGTCCACTACATTGAGAAC TAATCACTGTTTCACTGATCAACAAAACCTTTTCACTATGAAGCRGGGGT GTCCGCGRGGGGGGGGGGGGGGCTGTAGCCCCCAAATAAAGGTTTTATCC TAGAATTTTTTTTCGCTTCATAAATTTTTTATGAGAAAATAGAGATTGAT TTTTTTTATGAGGATTTATTTTGTTAAAAAAAGATCCTTTCGACCAAATT ATGCAGCAAGGCTAAAAAAATTACAAAAACCGAGGAGCCCCCTCCAAAAA TATGATCCTGCTGNCCTGATCAGGGGTCTTCAAGATAACCAATATATTTT ATTTGCAAACACATACAAGGGGGTGGATCTAAAAATTAAGGACGTTAAAT CAGAGGGGAGGTATCAAGTTTTAGAAAAACGTGGAGAGGGGAGGGTCAAA ATTGTACTTTTTTCCGGACGTCATAAATGTATGACCCCTAATCATTACAG CCTTGGAACAAAATAATCCCTTTTTCAGGTTTCAACTACAAAGCCTCTCT TTTATTATAGGAGCGCCTTTGGGGGGGGGGAGGGGGTTGTAGGAGCTGTT GCCTCCCCCCCTTTAAATTAAGGATTTATCGAAAAATTACCGTTTGAAAA AKKAAAAAAACAAGACTAATTATTTCTTTTCAAAAAACCAAGGCACCACC AAAAAAAGAAAGTATATTTATATAATCCTGCATTATCATATTTTTCCCAT NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNGACTGGATATGTTTGTCACATGTTTCGTTAGAG TCTCTTTACTATTAGGTACCTACAAAATATGTCATAACACGTTTAATTCA ATTTCAGGGGATTCGGATTTACCGCTAGAGGATTTTGATATTACCTCTTC TATGGTGGATGGRATATCTAACCCTGATGATTCGAATTTCATCAATTATT TACCAACAACTTTAACAGTCACTCGTGTTAGCACCGTAGTTTCCACAATA CATCATCCACATTATAGCCACCAAGGTGGCCAAAGTGAGCAAGGAAACGA TTTGGACAAAATTGATCCAACACCTACTTACCCCATGGCGGGKAACACCT ACGCCTCTCACATTGGTTTTCAGAACAATTCCTTATCATCTTCAAATGAA 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TTCATCGATCCAGTCCTGTCTTGGGACCAGTACTTAGAGTAACATTTCCT AAAAATGTCCATAGGTAGAGTGTATTAAGCTATAGAAAGAATAACAGATA TGCATTAAGAAAATTGCACATATATTGCAAAAAATATTATTAATAAAAAA TACGAACACATTTTTTTAAATTTTTTATTTAATATTAGAATGTTTATATT AAAAAAGTAATTAAAAACCCCTTCAAACACGTCACGAGAGATTCATTTGA GCTTTCTTTTAGACCAACAATAAAACTGAACTATAAATAAGTATAAATTG ATTGAGAGCCCTGTTATTGCATGATTACTTGTAAGCTTAAACTTTTTAAT ACACATATATCAGGGGGGCTTAGTTTTTAAATTTTTCAAAAATTAAAATT TTTAAAATTTGTTTCGTCCAAGGATTAACCTTCTCTATTAAGAAATCCTT GTCTTTTCAAATTTTTATTCCGTCTTGAAATACTCCCCGATCTCAATTTG AAATTTTCGTATTTCCAATAAAAAAAAATTCTTCCAAATTGCTAATTTTT TCTTTGTTAATACTAAAAATGTAAACTTCTTCTTGGAATGGGGGATAGAG CCCCTCCAGCCCCCTCCTTCTGCAAACAACCTTATATATAAACTTGTAAA TAAATATTACAAAAAAATTAAAAAGTGATCATAAATTTCCAAGCAACAGC TGATATGAAATATCAGCACTCTCATGTTAAACATCATCCCTTTATATATA GAAGGGATTTTCCATGGAATGTACTGAATTGCAGTTCTTGATCCTAGATG AGGACCACAACTATACTACACAAGGGTTCATTTGAAAGGGGAAATCGACC GTGAGGTTAATTGATTATAAGTTTTCAACCCTAAAAAAATCCAGATCGTA TTTTATACATTTTTTAAAGACAATATATGAATAAAAATTCATATTTAACA ACATTATTTTCTCATTTTCCAGCTTATATACAACGCCTGAAAGTGGATCC GAATTCCACTCTTGCCCATGGAAGTTCGTCATGGATGATTGCCTCAATTA TTTTATGCCTTTTATTCCTTTTGGCCTTACTGCTTCTACTTCTCCTCCTT ACATGGAATAGATGCAAGGATGACAACGAACATGCTGCTAAACATAAAAG ACTTGTAAGCAGTCCACTGACAAGTCAGGCTTCCACATTAAAGGATAGAA GAAAAACGCAGCTTAAACAAAGTTCGTCCTCTGTAAGTCTCCCCCTTTTA TACATAAATATACTTGTATTTCCTCCAAAAAAATATTAACAATTTCACTA CCTCACAATTTTGTTTATTCAATAATCCCAACCAAGACTTTTTCCTTCAA AGTCAAAGAAAGCATGTAGACCATTATTTACCCTTGTTCAGTTTACCTTG TCTACATACATACATATATGTGTGTAGAAGCTAGCATAATATAAGAAAGG GTATTTTTGTTCTAAAATGTTGCTCATTTGACAATAAAAAATATACTTAA TTTATTAAATCGATAAATGATTACACTCCTTCTATTACATGTTGATATCT GGGTCATTCCATATCTGATATCCCCATTATTACTAGTCAGATGGGTTGCC AGTATGCCGAATTGTAGCTGCTTAATGTTTAACTACGGCCCACTAATCCT TCTCACATCAAGTAGTATGTTTTAGTAAAATTGTCACAAATCATCAAAGG GTAGAACGTGCATAATCCGTACAAAAAAAATTTTTAAATATTTGAAGTCA TCAAGTATTTTCTGAGACTCTAACAGCAAAAGTGTCCACAGTGTTGAGCT GGAGGGGCTGTAGCCCTCCCCAAATCATGGAATTTTGAAAGATTATTTTT TATTGCCCTTTATTGGCGTGCATTTAAACATTTACAAGCTTATTATAATA TAACAGAATATACTCGAAAAATAATTCATTAAAAAATGTAGACAAACGAA AATTAAAAAGAACATTTATAAAATATGGTCAAGAGTATTTAAAATAAAAA AAATAGAAATAACATCGATTGGATGATGAACAAAAAAAAAAAAAGAGTTT CAATCTTCAATAAAATATTCCCATAAAGATTAGCAATATGTAAAATTCCA TCGAGTTTGTCTTCTTTTACTGTTTCTAATTCATAGACTATATATTGCGT TTTGATAATGATTGCATTGTTTATTGAGTAATGTACTAATAATTTTAATA AGGTCCCCATAAATTTTAAATAAAGATTTACATTCCCACAAAATATATAA ATAATTTTAAATGCAGGAATTTTGAAAAGTTATCGCTTTGGAAAAAAAAA ACTAATGAGAAAACGGAAAAAAACAAATATATATAATCCTGCGGATGCAC CTAAACAGGGTCTGCAGATTGGCCTTTTTTGAAGCAGTTTGGCGTTTAAA AAAATCGGCATTTTTGTATAGCTGGCCTAGATTAGAAATAAAATATATAT TTAATATTATTGTTATATGAAGCTGATTTTCATGAAATTTAATTTAATAG GTTATGTGGCCCATTAAAATACTTCAAGTGACAATGTGGCCCAAGGTATT AAGAGTTGAACATCATTGGATTGGGTCAAAATAGACATATAGTACTACAA TTAATCTATCTGACCATGGAAATATCTGGCAGGCAATAGGGCATATGAGC AAACTAGAAGGACAATTTTATCCACAAGGTACTGTGATAGGTTGTTCCTT GTTGTTTATAAAAAAATAGCCCATATTGAGAATTATTTTCAAAGTTATGC ATAAAATACACTTATATCTTCTGGTTTATTAAAGAAAGTTTATCTACATG AAAACCAGACACAGGGTGCATTGCTGAGAAGTCTACAGAGACCGTTAGTA 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