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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1066 | supercontig | LSalAtl2s1066:207309..229768 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000416 >EMLSAP00000000416 ID=EMLSAP00000000416|Name=EMLSAP00000000416|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=179bp
MSHLLGGQIGLDDFIFAHRKEKIDDESLVGCRHYEVARKLKEIPKGKTFV LRLVEPLKAGFCNVGPKNSYGSNKKGYGTGKQTLRFKSNGSAQVEEIDDS RTLAENKINEVLEVFMGINDLELASQIWELAVCSRNTMDFAEAIDNSSLE PFGFTDDFIIELWGIVTDAKSGRLKKAKH back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1066:207309..229768+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000416-696263 ID=EMLSAT00000000416-696263|Name=EMLSAT00000000416|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22460bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1066:207309..229768+ (Lepeophtheirus salmonis) TCAGATCTTATTTTGTACATTAAATACCTACAAAATCGACATGTCGCATC
TTCTCGGTGGTCAAATCGGTCTGGATGATTTCATTTTTGCGCATCGTAAA
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GTGTCGTTTTCGAAAGTTTGATTAAAATCTTCCTACCTTCACGATCAGCT
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ATTACAACTTTTCAAGATTAGCTGAAAATGAACATAGAAGCTGTAAATAT
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AAATATTGGACTGTAAGTAAAAATGTAGAAGAAAAAAATTGAATTTTCTC
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TATAACAGAACGGTATATATYTATTAATTGGCAGGGCCGGCGGMTTCGTA
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GTGTCATATAGTTTTTATTGAGTAAAACTCGTCGATTTGCTCCACGAGCT
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CGTCACTAAAGATCAATAGCTTATAGTATGCGCACTGTAGAGCTCTAACA
GAAGAGTTGCGACAACAGCCAACCGCCTGAGGTCTGCTAATTTGTCTGCT
TTCGTTAATTTTGCCCCAAAACTTTACAGCTTATGACGTTTATTGAAATA
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AAAACTTGGGAGAAAAGTGACCGATAATACGTACAGCCTATCACTTCAAA
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ATATTACTATATTCCATGGTCGAGTTATTTTTGTATAAGCTCTAATTTGT
CTCCGAATCATATGGACTATGACAATGATGTAGGACTCCATTGAGGGTTT
GAGCTATTTTCGTATAAATTCGGACTCTCAGAAATCATATGGCCTATAGA
AGAGCTGTAGTACTGTATTCAGCTCGAACCATGTTGTATGAACTCGGAAT
CGTCTTGGAAACATATGATCTACAGGATAACTTTGACACTATACTCCAAG
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AAACGTCATGAAGAAGATGATTAAGACCTAGCTGGACAAGCACTACACAG
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GGGCATTTTGAAAAAACAACAACATGTATATACAATCAATCTCTTACAAA
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GAGTTATAATTGTAAATTCGTGATAGACTTGTTCTAGAATTTMGGATCGA
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TTCCTTCATCTCATAGATCCTTCAAGTCAATCTAATAAAACGTCATGTCT
AGTGTTGATCCTTATTTATTCGGTCCAGCTTTAGAACCGGTGCCTTTAAA
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GAAAACGTCGATGGTATAATAGGATATATGAGATATGTTTTAATATCATT
GGACATATCTTGCACAGAATGTTCCTATTTTCATAATAATGCAATATAAT
ACGAATAAGTTTATGATTTTAATTAGCTATATAGTTTTATATTATGTAAC
GTACTAATGAACAACAAACTCAATGACGTCACGAAGGATCGATTTTATCT
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CTTTCATAGCATACCCATAAATCTATAGTAACTAACTACTAAAAATTTTA
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CTGTTGACAGTCTCATTAGTTGATAAGTTTATTTATTAAAGCATATTCCA
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ATAGGAATTAAATCGTACCTCATGATCCAACTTTTATGAAGTACCCAATA
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GGGTATGGTCCAGAGGAAGGATAATGCACTAGACTTTCTGCATACAAGCT
GCAAGTAACACCTGATTTATACTTCCTTGACTAACCAATGTAAGATATAT
TTAAGACGAACGATAATGAATTTTTCAGGCTCAGCAAGGATATATGTGTA
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TTCTAGACTGAGAAAACTCACTTATGGCAGCCACTATCGACATAAATTCC
GTTATACGTCCTAGCTGCTAGTCGCACCTTATTTTAATCCCCTTGACTTT
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AATTATCCCTGATTGCAAAAAAATCCACAAGACGTAATGTGTATTAGCTG
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ACAACAACTCTGCCACGGATAGTTGATGAAATCATTGCATTACTGATAGT
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GTTCAACATATTAGGAAAATTTGTCTTCTCTTGATGAGTCATAATCAATT
GTGCTAATCGGGAGCATTTTGGGCTTGCTGAGATATAAGAAACTGTAAAT
GAATATCTTAAACCTGACAATTTAAAAAAAATGTTTCGGAACAGAGCAGC
TKCGCTGTCAGTATGWTTCATTTGKCCAGCCGCAAGTTGCTGTGACGAGG
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TCCTCAATTGTACTCTGAGCCACAGAGGACTTACAATTGTAACTTCACAA
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TTATGATTGCCAACCTAAAAAAAACGGCAGGTTAGAAATTCCCCCTTTTT
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AAACAATGATAATTATTATTTTATCAAATAAGTGGATTTCTTTGAATAAG
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CAGAGAAAATATTATGAAATTATATTATTTTATTTTTATAAATACACCAA
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TTATTAAAGAACTGATAAATAAAAAAGATAGTAGCAATTGTTTTTCTTTT
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TTATAGGACAAGGATACCTACATGTTTATATATAGTTGATTGTAATGATA
TGTCTGTATGTAAGTTCCATCATCATGATGGAGCAAATTGATTGAAATCT
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TGGACTGTGTATTTCCGGTCTCTTTTTGAATCATTAACATTTCGTTGACA
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TTCCCTCACTTTACATGCATAATCATGGACGTAATACATCTTGATCTAAT
CAAGAATTCACTTACATTTAAATATACATTTTTTTATCCCTTGACGATTT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAACATATTTGTCCA
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AGTTTTGAATTATTATGCGTCGAGTATGGAGGTCACCAAGAAAGAAATTA
GTTATATTTTTCATTTTTAATACCTGAATGGGCGAAACACGTCGAAAGCG
AACAAGAAAATTTGCAAAATATACGCTGCACAACGGTAGTTCGAGGTATT
TTTTTTCTCTCGCTCAATCTTGACCTCTAATATGAACAACTCCACCGTTG
GAAACTGGCAATCGAAAAGAAGTGACCAGCATTGGTGGATAAGAGACAAC
AAGACATCATCTAGACAACACTACCCTGCACACATCTTTAATGACTCGCC
AGAAGCTCTAGGAGCTCGGTTGGGAAGTTTTTATGCATCTATTCTAAAGT
CCGACCCTTGTGCCATGTGACTAATACCTGTTCCTGTCTATAGCCCACGC
GCTTGGGGTACATATTTGGCTTTATTAGAGGCCTGTGAAATTGGTTATCC
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TAAATTAGATGATTGTGACACTTTTTGTAAAGCATTGAAATAAAGGGAAA
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GTTGGTTCTAAAATTATTGGCAGTGAAAATGATTGCGGCAAAATTACTGG
TCACCGTTTTGGATTGTTGTTTTGCAGGAGAAATATATTACATGGTTAAT
GTTCAATGCCCTGTCCTCAGAGAAGGAGGTTTTCGCCCAATATTTGCAGG
GTAAATGGCCCTGTTTATGCGGCCAATTATAGACTTATACAAAAAATTTC
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ATCTATCAATAATAAAATTGTTAAAATTGATTTTTTGCTGCTTTACAAAT
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TTATCCCGTGTTGATGGGTCACATGTTTGTATATCCACATTGGAACCGTT
TCTTTGATGATAATATATTAGTTGTCCCGTCAGCATTAAAGCTAGAATGT
TTGTTCTCAAAATGGAGTATGAATTACATATTATTTTTTATATTCTTCAA
GTAATTAATTATCTTTTATTTCCATATAAAAAATATTGTGATAGACCCTG
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TACAATTATCCAGGAATTAGTATTAGTTATTCAAAAAAATTGAAAACAAA
GCCAATTATTGACCGAATGAGGCCTACAAAATATTTGGCTGTAATAAATC
GGATTAAAAATATATATTGGCCATTCTTGATTTTTGTTCAAAATTGTTTT
ATGCTTACCAACTATATGATTATTATTAAAAAAAAATAATGCTTTTTTGT
TATCAGTTTTGTCAAATGTTGCTTAAAGGAGTAATTATATGAGTACTATT
TATGGTACTTATTAAGTAAGAACGTCGATATTAACGCATACTTAAATATT
TATCTTTACCGAACTATACAAAACAATCAATATTATATTTATAACTATGT
AATACAGCCAAACCTTTAAGTGATTGATGTATATATATTTTTTTTCTTCT
TTTTGTATAAATAATTTACACGGTTTATTCTACAATATYTAAAAGCTGGT
ATTTATTATTTCTTCCTATTTTGAAAATTCAACATGTTAAGGAGTATATT
AGTTTTATAGTCATCTTTGTCAGCACATATATGTCATATATCAAAGTTGA
GAGCAATATTTTTGTTTTTGATCTACACTCACGAAGATTTAGACAATTTT
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AAATGAGGAGCAATACCGGTCTAATTCCTGTCAATACCATCATTGACAGA
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CACGTTCATTTTCAGTTTATTTTATTTTTYCATACCGCCAAGTCATATTT
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GTAAGTATTCAATATTTCATTTAATGAATGTCATAAGTGAAACTTATGCT
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TTTTTGCATTTGTAAAGGCCCTAAATATTCCCGTAAAACAGGATCCAGGT
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GTAATTTAAAGAATATATTATAATATCAATATCTAACCCGAGCAATAAGA
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ATCCGGCTTGTTTAATACCAAAGGGTTACAAAATACTATTCTTCCCTCTG
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AAAAGCTATTTAGATTAACTAAGTATCTAATTAGTGGGATTATGTCAAGT
TACTTTGTTTCCTTAACAATATAATTTATAATTAATTTATCAAAACAAGC
AAATCTGGTAAAAAACGTCATTTATTCTGTGGAGGTAAGACAAAAAACTA
AAAAACATGTGAATAATAGGTTTTACGAAGAGGGGCAGTATTTTTGTCGA
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TTCAAAGGTATTAATTTACCTCTATGTATTTCATGTATTCATTCTTTAGA
AAATTTAGCAGGCTAGAAAAAAATGCACAAACTAGTTTTACCAGTAAATA
TTTTGCATTAATTCATACAAAAATGGAATTCCATTAAATTTTGCATTAAC
ACAGTATGTATGACTAAATATTCAGTTCTTATTTGCCAAATAAAGGAAGA
CAGACAGGGGCTCCAACTACACTTACTTACTTAATGCTTATGTAGACTTG
AATTGTGAGGAAATGAAAGAATTATTAGTAGGGATTTGCTTTTATTTTAC
AGCATACAACAAATTACCGACTGGTTCATTAAAATCTGAACGCTTTGAAT
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AAATTAATTTTTTAAATAAATGTGTGTCATCTGCAAATGTAGTCATCTGT
CATGGGCTCCCAGTGCTGGCTGAAAGTGGCTTTGAGGGCCTTGGTGTTTG
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