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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1068 | supercontig | LSalAtl2s1068:12822..21966 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000428 >EMLSAP00000000428 ID=EMLSAP00000000428|Name=EMLSAP00000000428|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=410bp
MAFSLLKNRGTLYTKCLRYFHIGSVIHSASIKELEINIQTDIPGPKSTKL
RNDLLEYQQISSVSLISDSHKSLGNFLVDVDNNTYLDCFMQISSIPLVFM
AXAPSGMXQIFPMMCGTCSNENAMKLCFMKHMSKERGGRTEFTEEELNST
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FDCDSVQTRDKLIQKMLKKGVIIGGCGEKTIRFRPSLIFAPKHAVLVLQK
LEDVLLDISQ back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1068:12822..21966- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000428-696275 ID=EMLSAT00000000428-696275|Name=EMLSAT00000000428|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9145bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1068:12822..21966- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCATTTTCATTATTGAAAAATCGAGGAACATTATATACAAAGTGCTT
GCGTTATTTTCACATTGGATCCGTGATTCATTCAGCCTCAATTAAGGAGC
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TTGGAAAAAATGAAATATCCCAAAATAAATTCTAGTAGAAAGTAAAAATT
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TCCCTGAGAAGAWACGGTCTTTTGGGTCGGTCAAATGGGAAGTACAGTAC
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ATTGAAATGTCGGAGCCGTCAGGCCAAAATCCGTTCCTTTTGATAAATGA
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AATCCCAACTTCTTTCTCGATTATTGTGAAAAAAAATCGCCAATCAGCTT
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TTTGAAATTTCAAAAGACCTACTAAGCATTTAGGGTGTTTATCTCTAAAG
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AACTCTTTCCATTAAAATAGTTAATTTTTATCTACAATATGAAAGGAAGA
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TTGGTTGTTTAGCCCCAAAAATGGCCAATATCCAAATTGTGACGTCGAAT
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GGGATGGAGTACAAAATGGGGTTGACTCATTTTTTCCTTTTTTTTTAAAT
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ATTTTTTGGAATTTGTTTGAATTTTTTTTTCAAAAATTCATACTTATTCC
GAAAAAATTATATACGGTTCTACTTTCTTTTATTGTTAACAGGGTTCCAT
GGTCTACATGTATTAGTGGGGGCTACTTTTTTGTGTGTGTTATCTACGGA
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GTTGATGTGGACAATAACACCTACTTGGATTGCTTTATGCAAATTTCATC
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CATAGTTAGCTATATAATAATTTAAGGAGTTGTATAAAATATTACCTAAA
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GCAGCTGAGTTGTCATGACCTTCTATGAAATTAGCTACAAACAGCTGTTA
GACAAGGAAATCAACACAAATTCCACTCCTTATATAATAAGGATATAATG
TTGGTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATAATAAAAGTCCATTAAGGA
CTTACCCTTATAACTGCGGAGCAAACCGTCAAAAAACAGCAGTACTAATG
ATTACTTCATCCTTAGATGTTCTCTCTTCAAGAATTAAATAAAAATGACG
ACCTCTTTAAAAAACTAAAAAAAGAACTGTTTAGTTGTCAACAAAACAAA
AAACAAAATCATATTTTATGCAACTCTAATATGTCAAGATACCCTCAGTG
CCCCTAACAGTCAATTCAATTTCAATAAAAATGATCACTTGGTCGTAATT
TCACCAGTTCCTTTCAGCTTTTCTTTTGGAGAGCAATTAACAAAAATTAG
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TTTCCGTTCAAGCACTCCAAAATGAAAAGGAAAGCATCAACGTAGCTCGT
TTTTTGTTTAATATCCAAGCCTGACTAATGTTGTTTTTACTAAAGACTGT
GTGAATTGAAAAGATTGATTTATTTGTGTTTTCAGGTTATAATAATCCCG
AGTTAATTGCGGCATTAAGCACKCCTGCAAATATTCATCAATTAGTTAAT
AGGCCTGCTATGGGTAAGAATTCKCCTTTGKAAGACATAAGCATATCTTA
TCAGGGCAAGGCGTGGGCTGGAGAAACTGTAGCCTCACCCAAAATTAAGA
CATTTTTGCAAAAAATTTAATTTTTTGAGAGTAACTATGAATTTTTAAAA
TTAAAAAAAAAAATATTTATATATTTCTAGAGAATAGCTTAAAATTTTTT
GAAATTGAAATTTAATTTTTTTACATTTAAAGTGGATTTTTTAAATTTCT
TTAGAAAAAAATTTTGTTAAATTTTTTGAAAAACGTTTTTTTTTTCGAAA
TAAAATTAATTTTTTGATGTTTTAAAAAACCTAAGCCCACAAAAAATATA
ATCCTGGGACACCCCTGCTTATTTATTCAACTTTATTCCAGGATGGTTTC
CCAACGAGGAATGGATTGAGTATATAACCAAAGTTTTTATGGCCGMGGCT
CCTTCTGGCATGGYTCAGATCTTTCCCATGATGTGTGGCACATGTTCGAA
TGAAAATGCTATGAAACTTTGTTTCATGAAACACATGAGTAAGGAAAGAG
GAGGTCGTACAGAGTTTACGGAAGAGGAACTCAATTCTACGATGGCCAAC
TCTCCTCCAGGATCTCCGTCACTATCAATCTTATCTTTTAAAGGAGGATT
TCATGGACGAACTGTGGGACTACTAAGTGTCTCAAATTCCAGACCTATTC
ATGGAGTAGATATTCCTACTCTGAAATGGCCAAAAACGGACTTTCCCAGA
TATAAATATCCTTTGGAAGAAAATGTAGACTTTAACTTTTCAGAAGATAA
AAGATGCCTAGAAAATTTGGAAGAAACTATTCACACTCAGAATAAGCTTA
GTGCTCCTATTGCTGGAATAATCGTTGAACCTATTCAATCCGAGGGAGGA
GATTACCATGGGTCAAAGTTCTTTTTCCAGGTATAAGTGTGTTTCATTTC
TTATACTGAGAATCAATTTTCTTATGACCCTTCTTTCGATTAATTAAACA
TTTTTGGACTTATCTCTTAAACATATATTATGATATTGACAATTTCTATT
TAGACACAACGTAAAAGAACACAAAACACATATTTGATTAAATCATTTTG
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TTAGCCAGGGTTAACTTTTGTCAATTCTTCAGTTTTTAGCTACTTTGTTC
ATCAAGTGAAAAACTTGCTAGCTGGACAAAAGCTTGAACTGAGATATTTA
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TTTAATTATTTAGACCTGCTGTAAATGGCAAATTTATAAAATCCATTTAC
CAGATAGTGCATTTTCGCAAGCTAAATATCTTACATTAGGTGCTAAAATA
TGTTATCTGGTTTGTATTATTTAATATAGTCTATATTTAAAGGATATATA
AGTATTATATTGAATTTATCTTACTATATAAATTTGGAGATTAGAGATAC
CATGTAGTGCCTGTCATTTCCACTCATGTAAGACACCTGACTTTTTAAGT
CTTTAGCTTTTCACACTGAGATATTTCCACTTGCATTACAGATGACTGAT
GCTGCCGGTGTCTTTATTCGCCCGTTTCGGAGATTACATTTGGTTAGCCA
TTAGCAGTTTGAAGATCTTGAGAATTTTTTTTTAGCAGGTTTTTTTTACA
CTGAATAAATTGATAGCACGTTGAAGAATCAATTTTTTGCAGATTTACAG
CTTCAGAATCTCAATATGCGGTTACCCCAAAAAGTTATTAAACTAATTTT
TTCATATTTTGCTGGTTAGTATGTTTTTGCACTGGGTCAACGAGTTAAGG
ACACTCAAATTTTGTTTATGTTTAGCACAAACACTGTCCTCAATATACAC
CCATTTGCTATGATTGAGTTTTGAGGTCAGACGAGGATAGATACAAAAAG
GAGCTTTGACCAATAATAAGTATTTTTATGAAAAAATTTCTGACATTAAA
GACATCCCAAAGCCCTCCCCTTCAATTAGACGTTTTTTATTCGAATTATA
TTTAATTACTTGTAAATTTGCGACACTTTGGTGTTGGTGCAAAGTGTCTC
TGAGATCTCAATGGGGATTTCCTTTGCCATCCTGAAAATGGTTTTAGATA
TTTGAAAACTTTTCTTTTGTAAATACAGAACAATCAAACCGAATAATAAC
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AAAAAACTTYTCATTATTGAATCTACATCCGGTAAATTATAACTATGTAT
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TTCCCTTATCATTGATGAAGTTCAAACCGGTGGTGGTACAACTGGGAAGC
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GGTATGGATTTACATACTTAATATTGGGTGTATTGTGTCAGTCCCATCGT
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CAGATAACCCTGATTGAATTTAGATTAATGACACAAGTCAACAAAAATCA
TATTTTAAATTCCATATTCAATTTCAATAGTACAATACAAACTGATCAGT
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GGGGGAGGGGGGGGGGCTTGGTTTTAGGATTTCATTTTTTTTTTTGGAAA
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GAGAGTTTGAAATTACTTCTAATATTCCGTTATTATAGGGACAAACTGAT
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