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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1069 | supercontig | LSalAtl2s1069:6983..104826 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000444 >EMLSAP00000000444 ID=EMLSAP00000000444|Name=EMLSAP00000000444|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1110bp
NKLSNQPSSSTSTKQNWKSTSNKEDPNTLTPNETPSTSRRRPSFEMAXAA ALAAFRGENAVNTLDQAEASSTNNNSNATNNNNEGSVQPSTSSNNDASAE DVPRKGFNEAEAASMASSSAEDNRCKVCFKTLQETEFFRSNWTCSICIRR RANREKGKGPTNSYLKAQQQQVDKKKQDEYTSVQPFVKAAKTISLDEEAP NQKGPSGGGGLAVPVNNARRHSTGNAVADAINAVAAAAAQKGKVDTKISS KLMVKDGSTKMIRRPSSAALTAGIVHPKGPQQXLQXQPQQQQRSSGRQIY NNPGVVVTNHDEDKGQVKGALHKKSSLSARSMLAHAQSDSQLAPHHHMKR RSSVAILATGSLPHREGKPVLGRTISDKSMRVDTSVLLGSNNNRENCTRK SELSAPSSNFRRHSGGTIGQEAVQRERRRKSSLQRSQSSEESSEDLNIGY MPYFSGSVARLHDDENTSFTVGSSTSSISQDIARELDLLAIRGKEERRSS FESAVSDSAALGVNHHEVKRGPDVELHDEGAXRRYCSLERSKHRQNSSSI TKGGADHVRIVVDDYGDHNIRNDPSMQNTATITLYQTPHDPYGFGLRVVG APFQNSRKNELVVARVLWLCPGGPAQRAGIQVGDKILKWGGTSLNSISID RVPQIIEQCQDTKVTLIVASGSSGSEEINTSNEGNGSRRRLPVLPSSSRR SSSTTQLMNNPPPQRSNIDYGQIQMTILYDNKQLNVTLWSAENLQGIESS TGYSLPKPYATVRLCVFGRNRIFTTEVDSGNQHPVWSANHVFTNVEENDF MASELEIMVWNYSNSQNHECLGKLVLESASLLNVNNQVQWYPLQNPNGYG RYDTHQSVQNKQSQQQQQISIHTDDYSSVRQDQSSMDLEFIPPVSSVQSS YTTRNPNIYSSNSSSCLYRKPYHIASPPKIPYTFPSRKSSSSILGSDILS NYYNTNSPSSSFHLNTHQRVSIQSRSCPQSRRTSAEYSQGSMTMISSRSS ALLNDAISYSNLYSSIGSLRRRGSSNSSSKESLKTSQRRNNSACLLPVSS GRLHGRRKSDCGNRSIPIDTLGLDPKVRRNSSLDRGGDQDPYSGGSYNYD NNSRRNSRLY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1069:6983..104826+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000444-696291 ID=EMLSAT00000000444-696291|Name=EMLSAT00000000444|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=97844bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1069:6983..104826+ (Lepeophtheirus salmonis) AACAAATTGTCTAATCAACCTTCATCATCAACGTCCACAAAACAAAATTG
GAAATCCACGAGTAACAAGGAAGATCCAAATACCTTAACTCCTAATGAAA
CTCCCTCGTACGTTGCTATTAAAATAAATTATTTTTTGATGATTTTATTG
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AAAATTTCAAACACCTTATGAAAATATGAAATATGTATAATTAGGCCATT
CATTTTTGTTTGTATCAAATTGCAGGAAATCACGTGTACAGTGTACAATG
CAATTTATTTTATGTTAAGACACCTTCAGTGCAGGCGAATGTTAATGTAT
TCTATTATGTATTATAATATTGAACTTGCTCATTATATGAAATCTATTAG
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AAAATTGCCAAATCAAAGTTGGCAAAAGAAACAATACTTTTTTGCACAGA
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TATATTGTTATGATGTTAAGATTTATAATCTTATATCCAGAATGCATTTT
TATCTGGCAAACTAAAGTTTGATGAAAATAAAGAGAAAAAGTTAAAAATT
TATTCAGATACTCACAGATATTTCATTTAAGTATCAGTTTATATTTATTA
AATTTATATGCAAATGCATTTTTAGACAAATTTCTACAAATTTTATTTAT
ATACGAATACTCTATTTGAAATCTCTTTTTTTATTTTTTTTTCACATAAA
TGAGATAAATAGTAATTTTTACCCATTCTTGTTGCCCATAACATTTTGAT
TTTGAATAAATTTTGAAAACGGGTTTTTGTGCTGTTTTTTTTTTTTTTTA
ATTTATAACTCAATCCCTACCTAGTCTATTTGATCTCCAAATAACAATTT
ACAAAATGAAAAGATAACACTATAAACTAACACACCAACTCTATTACATA
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ATATGGTTAGTAAATTAATAAATTTTCTACAACTACAAAGTTTAGGTTTA
CTATTGTATAATGGGATTAAGCAGACTTTACCGTGTCATTATTGGAAAAC
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ATATTTAGGAAGAGAGCACCTTAGCCGGATCTATACGTTATATTACATCA
GCAACAATCAGCTCTAACAAGTGAGGAAGGGGAGAAGGAAATAATCAAGG
GCATTGGCAAGAATTACTCCGATGTCAATCCTAAATTCTACTCTTAGTCC
AACAAGGAGTTACCATTATATATCCGAAACAAATCTGAGCTATAAACAGA
AGTTCCCTCCTCAGGAGTGAAATATCAATCACAAAGCTGAGAAAATTAAT
AATATTCATTCTTTCAAATTACCTATTCAAAAAAAGCAGAGCAGCTAAAA
AATACACAAGATTTACAATACTAATCATTCATAATTATTTGGTATAACAG
TAACGGTTAAAATACGTCAAATATGTAAAATGTTTAACTTTTTAACGTGT
ACAAGCTATTTGTAGTGCGAAAAGGATTTTTTTCAAACGCAATTTTATCA
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GGATTTTAATTTATTTTATTNAATAGAATAMCCACCAGGCTCCATAGCAG
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GCTGTCAGTCAATTGCACCCAAACAATAAATCCATCGGATTAAGATCCGG
CGAGTTTGGAAGCCAAAAATCCAGCAAAATTTAAAAATGTCTTGAATCTA
TTGGTTACTTATCTTTTAGGCGTGACAGGGACACAAGACCTGCTTCCGCA
TGTAAAGTTTGTTATTGGCAACCATGTCGATCCCAGGATTCACTTTGGTC
TCCAGCACGTTTAGGTAGGCATCAGTGTTGACCATGAGGCCTTGGGTAAA
CACTTGAGGATACCTTGTTTAGATGACGTACGTACATCCTCTGGTAAAAG
GCCAATCCCTGTTGTTATGGTAGKTGAACTTCTAGTCTAGGGGAAAAATT
TCTCTTTCGAGAAAAAACAGGGATGTCTCGATAAATTGTGTGCTTGACGT
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GTCTAGATCTACTTCTTTCTCATCTTATATAGATTTTTGTGAATGTAGAG
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AATTAATTATATTAAATTTGTTTTGTTTTTTGAAAAAATTTAAGATCTTA
ATTCCAAGGTTTAATTTTACAGTCAAACTAAAGCTGAAATAAAAATAAGC
AAGTCTCAATTTTATCGCATGTTGCGAAGTGTAAAAATGTCGGATCAACA
ACAAAAAAAAAATATTTGTTCGATCTCCTCGACGCTGTAGAGACTGTTGG
AATCTCCTTCTGACCTTCCTACAACATCAAGTAGAACCAAACTTATTTAG
CAACAATATGACTGATTTTGGACCTACTTACCTGTGATTCCACTCCAGCC
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TTCTGCCGTACCTCTCATCCAAGTTTGAAGTCGCTCTTAGTTCCCATCAT
AACAGTCCTCAAGAGTTGTCAATCTGTTCGSGAGCGTGTACAAGGGCAAG
TTTTGGGATCCCACTCTCTATATCAAGTTCAAATAATATTAAAGACAAAT
TATTATTTTATATCAAAATATTTTCGTAGATATTAATTTCTTTACCTTTC
TTTCCCTCAATGTAATTTATTACAGTATCAAAAGTAATTAAAAACATTAA
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ATAAGAGGGAGGAGAGAAGCTTAATTTGATCTTATATTTTTATATTTAAG
AGGGGAAAATTACCGATTAATCTTTCTTTAACTATAAGTCAATAAAACGA
TAGCAGCATGATATACTATTTTATTTTATATATGCACTCTACATTAAAAA
GTTGGTACACAAAACTTGCAATAGCACATGGATTACATAAAATCTGGATA
AACTATTTACTATTAAAGTAATGTAACCTATATATTATAATTAGTACTGT
TTTGTATAAATACGTTATTCCATTATATTGTTAATTAGTTATATGAAAAT
ATATCATTTTTATAGAAAGTATTTATTTTTCGAAACCTCCAAGATAATAT
AATCAGAACTTTTTCACATAAATTTCTGACATTAAACATGAAAATTCTTA
ATAATAGGTTTTTCATTAAGAGCGCTTCAAGTTCTTTTATTCATAAAATA
TAAAGAGTTAAAAACTTTTGCAAATTTATTCTTTTAGTACAAATTATAAA
AATAAACAATTATCCATAAAAATTGATTTCTCTAATGTGACCATCACGAG
AACGTTTACAAAAGTGTAATTACTGAACCCAATTTTATACTACTTTTTCC
AATAAATATTGCATTTGATATTTTTTCTACGTTCTTCAAACGTAAACTGC
TTTTTAGTTTAGACCAATGACTGGATGCGACTCCAAATAAAATTATATAA
AAGTGTTAAATTGCACAATCGAGGAGGCCAATCCAGTGGGTTATTTCTCA
AAGTAACACGCTCACCAAGTTTGCTTTGCTGTGTGACAAGTGGCACCGTT
TTGTTGAAGCCACAAGTTTGCCAAGTCCATACCTTACAACAAAATAAAAC
TTGCCTTAATTTGGCCTGTTTATATATATTAATGTATCTCTCAGATATAC
AGGGTTGCATTTACAGATGATTCTTTGTGCAGTAGCGCAATCCCGAGAAA
TTTCACCGAGTCCTCTATTCGTGAGATCTGTTCCAAATCGTTAATCCGGA
ATACATATGTGTTGTTGTAATTGTGCTTATCCATTCCAGGGTTGGGTATT
TTGCCATATTTATAATTATCTATTTAATTTAATTTTAGGGATTTTTTTTT
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TTCCAAATAACTTTTATAGGACAATTTTGGTAACCATTTTTTCTTCTAAT
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TATTACCTGGATATTATAAAGATCAATCCTCTTCCGAAGATTAAATACTT
TCCACTTACTCAACTTCTGATAAATCTAGGAACAAGCAGGATCTTAATTA
TGCATGTGAATTTCAACCGTATCCCACTCTAGGCCCAGAATATTAATACT
TGTTTATACCCTGCAGGTACTTATAACTGAGCTTTTGATTGGTGATCCAT
GATCCTGATCCTATGGGGAAAATTGATGTCTTATATTTGTTCAACTACAG
GCCAGATATATATCACAAATTGGTAAATTAACTCAACAGCACTTATCTCC
TCTTGATTAATTGGACCTCCGAGTTAGCTTCTATATTTCAAACAACATCG
TCTGGATATAGATCCAAGATATTACTTAAGTCTGGAAGTTTTATTCCAAA
TCCACTATATTTATTTATTATACAACGGACTAGCCTTTCAATGGCGGCTA
TAAACATGAGAGGAAAAGAAGAGTAACCTTGTCTCAGCTCCTTCTCAATA
AGATTTTGATCACTCCTCACCCTAAGTGCAAAAGTGCACTTACCAGATAC
AAAAACTTTTGAAGGAACCTCTTCACAGCATGAAGAATACAATTATGAGA
AATAGAGTCAAAAGCTTTTTTGAAGTCGATCCCTATGACAGCCCCAAACT
TGTTCCTTGATTTAACTGAATCAATCACAGCTTGAATATTTGTTAAAATA
TCTTAAATGCTTCTGTCCTTTAAAAATCATTTCTGTGTTATTACAATTTT
TTAATTTAAGAAAGGCTGCATTTCCTCTCCCAAAATTCCAGATAAAACCA
TATAAGTTTCTTTAAGAACCGTTATATGTCTCCAGTTCTTAAAATTATTC
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ATTTTACCAATATTTTCCATAGCTTTACCGACGTGCAAGAGATAAGGTAC
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GAAAATTTAACCATTAAGTGTGTACAATTTCTTGTAATTTTCTGTGAAAA
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TTTCTTAATAGTAGAGTCGTTGATAATTAAACCTTCATTGGAAGACACTT
TATTCTTTTAATTTGATCATTTGCCACAATAMCCTTCTCTGCCATATCAG
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ATTTATTTTATTGATTTCCCTTTGATTCCTTATGTAACCTAAAGTACATA
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CCTCTTGAAGTTAAACTGATAAAATCTTATTATTACCCAGATTTGATTTT
ATATCATGTGAAATCACTTCTAGAAAAAATTCAGTTATACACATTAGCGA
TCTTTTTTCTAACAATGTAAAACCGGCAGATCAAGTTATTTAGGAAAATA
TTTATATGAATAACAACATTTAAAAACTAGCAAACATTAATTAAAGAGTA
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ATAGTGTGTTCTACATTAATAAGGGTTTTCTTTTTTTTTTTCATTGTAAA
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ATTTCGTCATCCTTCCTTAGTAAGTGACTTTGTTCTTGATTTCCCACATC
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ACTTCCATTCCTTAGACCCTTTAGCCTTTTATTATTGAATACGTTTGTTT
TAGCTTAGTTCACAATCGATCCATAATTCCGAAAAATAGAATTGATTTCT
CATTTATTCACAACTTCATTAGGCGAAAGAATAGTAAAATTTTTCTCAAA
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AAAGTGTTCAAGATAGCTACGGTATAGGGTATTCCTATGTTTTTACTTCA
TTGATCCGCATATTAAAATGTATATGATTGTAAATAAGAGTAGATTATAA
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AAAATTTTCATAAAGNNNNNAAGAACATTATCAATATTCCTAATGGAATA
AATTATCATTATTGCTCATTATTCAATTTTTTTAAACGTAAATATAAATA
ATTTTTCAGTTCATTTAAATCTCTTCTTATTTTTCTTCTCATTTTACAAT
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TTATATAATTATAACTGTATTTGTATTTATAGATATGAGCCACAAAACTC
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ATTGATAACTAAATTTGAATGGATATATTGATAATAAAGTTAATATTAAT
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AGGACTTTACTCCAGCATTAAAAAAAAAAATAACCCATGAATGTCTTTTT
TTTACCAATATTTTCAATATGGTGATTAAATATTGTATGTACGATATATA
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ATGAGAGTTTATTCAAAAATTCAATAGCTTATTCCCATTATTTATGAATA
GTGTTTTTTTGGCATAAATTTTAAATAAACTCACTTTACCTATAAACTGA
AAGNAACCATATTAAATGCTTCTTCCATTTGAATATGTTTTCCCCATAAT
GTGACCGACTTTTTAATTTACATTTTTATTGAATTATTTCCCATAAATCC
AATATACCAAAGCGTAAGTTTTAAATTGTTTTAAATGATTTTTTCAGAGT
AATTGGACTTGTTCAATATGCATACGACGAAGAGCAAATCGAGAAAAGGG
TAAAGGGCCTACAAACAGTTACCTTAAGGCTCAACAACAACAAGTGGATA
AAAAAAAGCAAGATGAGTATACATCTGTTCAACCATTTGTGAAGGCCGCA
AAAACAATTTCATTGGACGAGGAAGCGCCAAATCAAAAGGGACCTAGTGG
TGGKGGTGGCCTTGCAGTACCAGTAAATAATGCTCGCCGACATAGCACTG
GGAATGCTGTGGCAGATGCTATTAATGCCGTGGCTGCAGCTGCAGCACAA
AAAGGAAAAGTCGACACAAAAATATCTTCAAAGCTAATGGTGAAAGACGG
ATCAACGAAAATGATTCGTCGTCCCTCTTCTGCTGCACTAACAGCAGGAA
TTGTTCATCCCAAAGGCCCTCAGCAAMAATTACAACAMCAGCCGCAGCAA
CAGCAAAGATCAAGTGGAAGACAAATATATAATAATCCTGGTGTAGTTGT
AACTAACCACGATGAAGATAAAGGCCAAGTGAAAGGAGCTTTACATAAGA
AATCCTCATTAAGCGCTAGATCCATGTTGGCTCATGCACAAAGTGACTCT
CAGCTAGCTCCACATCATCATATGAAGCGACGATCATCAGTAGCAATTTT
AGCAACTGGTTCTCTTCCACATAGAGAGGGTAAGCCAGTCTTGGGAAGAA
CCATTTCTGATAAGAGTATGAGAGTTGATACGAGTGTACTCCTTGGATCC
AATAATAATCGGGAAAACTGTACTCGAAAGTCGGAATTAAGTGCTCCTTC
TTCAAATTTTCGACGACATAGTGGAGGTACTATTGGGCAAGAGGCTGTAC
AACGAGAGAGACGTAGAAAGTCTTCTTTACAACGGTCACAAAGTTCTGAA
GAGTCTAGTGAAGACCTTAATATTGGATATATGCCATACTTCTCTGGGTC
GGTTGCACGGCTTCATGATGATGAAAATACTTCATGTAAGTAAAATTATT
TAAATATATTTTTACTGAAATATACTAAATTATAATACAATCCATTTGAA
TTCGGTCTCTTTAACTCTTTGTCAATTAATTGGGATATTATTCGCCCCGA
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TTTTTCAATTTGCTCCTAAAAAATTGAAAATGATTATATGTAGTAATTTA
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CTTTGTTTTTCCTTTCTATTTCTTGGATCAAAAGCTACAAAATTATAATA
TTGAAGCTATTATTTTAATTGATATATACGAGAAAATAATGAGACAAATT
TAAATAAAACTAATTAGCAAAAACGTTTAACTCTTTATCAAGTACTTAAA
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AAAAAAGAAGAGGGAAATAGTTCTTTGTTTAAATTGTTCTCTTGGCGTAT
AAGAAAAATTGTATAGCACCATTTATCATATATTTTCCTTGTTATATTGA
TTATATATTTATCAGAAATACTATTTTCGGTTTAATTCTCTACGTATATG
TATATAAGCATATATCGATTATAGGTCTGTATCCTAGATAAAAATATTGT
ATACTTATTTTTATCAGCTACATCCATAAATATCACCTATGTATGTATTG
ATATATACAATTCAGAAAATAAAGGTTGGTCTAAGAAAGTATTTAATATG
CTGGGAAAAATAAGTTTCGTATTTTTCGCTTTATTTCAATGCATTAAAAA
AAGTATTACAATCTTCCAATTTAAGCCAAGTTTGAACCATTCTGTTAGAT
AACTTGTTCCCAACGAGAGTTCTACTTCATGATTCTCATTTCGTCGAAGC
CTTTGTCCATTTAGGCAAAAAACACATACAATTTTCACAGGTCTTTATTG
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TACGGTTGGTGCATAACATCTTCCCATCCGAGATCCTAGAGCTTCTGGTG
ATTCATCTCCTATTCGCCAATGTTGGCTGCTGCTATTCGATATCCAGCTT
CAAATGGTCGAGCTGTTCACAGGCAATGACAGAAATGAGCGTATAGCTAT
TAAGGAACAACTTATATTAAATCATYCCCTGCCGATCCCACCAAACACAC
ATCATTGCCTTCTTGGCCAATTAATTCTGGCTTGGTCACGGTCTGGGCTG
CTTTTTGGCTTTGAACCTAGATCTGTGTCACTGGCGATTGACACAAGTGA
TCCATTGTTCATCGTCAGTTATAATCTGCTTAAGAAATAAATCGATTTTT
TCACATTTCATGAGATTTGTAAAATATTGGTCCTTTGAGACCTCTATTCT
TGACGCACGATAATTCACGACTGAATTAGTCAAGCACAATACTGTCGAAA
ATGTTTTTAGTAATGTACACTAACACCCATACAACGCCTTATTGTATGAT
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GAAATACCTTTTTACCCAACCGAATATATATACAAGGGTTAGTAGTTTGT
ATCAGACAGATAAATTTACCAAAATAAATAAATCTACAATTATTTTATTA
ATCTAAAAAGAAAACGACATTATTTTATTTTTAGCTTTATTTAACAGTCT
AATAATAAAACCTGTTTTTGACACGCTATTAAACATTAAAAAGGTTTATA
AATTTACTTATATTTAATGTGATATATATAAGAGGATAAATTAAATTCGC
AAGAGAAAAGTTGCAGTTCACAGACATAAAAAATTTGTTTTTGTATCATG
TGGATTTCATTATATGATAATTCTAGGTACAGACAAGGCTATATACACAA
ATAATATATGCCACAAAAAATCGTTTAACCTCTAAAAAATTACTTAGAGT
TTTTCCTTGAATGCCTTAGGAAATTACATTTATTTAAATTAAGTAAAAAG
ACTTTAAAAAGAGATTATATTCATTAAGCAATTATGTATACGTTGGGATT
TTGTTTCATACCTTTATTTCGATGTATCGAAATAAAACACAATGATCATT
CTTGAGACGGGTTAGAAAAAATCTATGTATTTAAAAAATGCATGCAAATT
CTAAAAAGATATAATTATAATACTTCCTTTGAATATGGCAGSAAAAGAWA
TTATATAGATGAAGAMTTAGATAMGACAAARATAAGGTAAACACGTATCA
ATGCTCGTACCCTGAGAATATTTCTACGCCATAGGAAAAGAGAGGGAGAA
AAGAAGAGAACATCCAAATCTTTCAGATATACTTTTGAAAACCCCGCAGA
TTAATTCAAAAATCCCGAATGAACTATGAAATAACCCCTACACAACGGTC
GTAGAAGCTCTTATTGACACAATTATATAAAATTTACAATGCAAAAAAAC
TCTGAACTAGTGTTTTTAATTATTTTAAAAGCAAAACCAATGTAGTAACA
CTGCACTTGGAAGTACTTAAAAGTATCTTTTTTCAATTAAAATACTGAAA
AACCTTGAACTGTACGTTTAATTGATTTTTTGGACGGACTGAACTCCTTG
AGATTCTTAGTGCTACGGACTAGGCAGTATTTAAAGGCTACTTTTATTAA
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TTCCATCATTGCCCCCGCTGTGTTTATATCCCAGACATTATATTTTGTAT
TTACTAACACCTACCGGGTGTTCAAAAAGTCTTTGAATGTTATTAACATA
TATAATTTAGAGGTTTCGTATAGACTTTTTATCTCAACATCCATTTAGAA
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