EMLSAT00000000466, EMLSAT00000000466-696313 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000466
Unique NameEMLSAT00000000466-696313
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s106supercontigLSalAtl2s106:760685..779495 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000466 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000466EMLSAG00000000466-683232Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002053EMLSAE00000002053-710981Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002054EMLSAE00000002054-710982Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002055EMLSAE00000002055-710983Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002056EMLSAE00000002056-710984Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002057EMLSAE00000002057-710985Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002058EMLSAE00000002058-710986Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002059EMLSAE00000002059-710987Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002060EMLSAE00000002060-710988Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779608auto779608Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000466EMLSAP00000000466Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000466

>EMLSAP00000000466 ID=EMLSAP00000000466|Name=EMLSAP00000000466|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=572bp
LSTQDLEVDDDVEGIINRYQSGDESSEKDPESNTMSKGSTTGGGGVPLPK
GPGSKTISAPTSPLKEKKAGFFGKVTSFSQVVSAKVEQARDAAGNIRVPG
MAREKSYTLLVIDDANTDWSKYFRGRRIRGEYDIRVEQGEFKEISVSAET
NSGVNASFAGAKGVRTFKPDFLLVRQNIRDANEDFRNIIIALQYGGIPSI
NSLESIYNFQNSTDQYPCVLKVGHAHNGVGKVRIDNASGFQEMAGLVSVA
NSYCSVECFIDAKYDLHVQKIGNSYKAFMRKSLGGNWKTNVGQSILEETP
ILDKHKTWIDAVSEMFNGLAVCSLEAXVGKDGKEHIIEINDSATLLMGES
QEEDRRNIADLVFKSMEEKCLSKDEDEKTTAVSNKEDESSVVRPPSAASS
TSAKPNKPLSRKTSTVGSSSFSTSSTNIPSGSGGTSSKPAAVTRXASMAA
TTKAPPAKPPRPPPAAITAASIDKPNVGPSSTAISGTNTPSSQRKRHDSQ
VASESSSVSGISSASSSAIKKAVPEGKKDEGSGAGPGGVAGEGGGPTTTG
PEGEDTMKNLRKTFAGIFGELS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s106:760685..779495-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000466-696313 ID=EMLSAT00000000466-696313|Name=EMLSAT00000000466|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18811bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s106:760685..779495- (Lepeophtheirus salmonis)
CTCTCGACTCAGGATCTGGAGGTCGATGATGATGTTGAAGGTATCATAAA CAGGTAACTTGTTTTATGTGTTTTTAACTCGTTTTTTCTTTTCTTTCTCT CCCGTTTTTCCCTTCTTTTTTTGTAACATTATATTTTGCTGTATTTCTAT TTTTTTGCGATTTTTTTTTTGGTTTTATTCTTACCCTTAACATAAATACA AATATACTCCCTTCCTGGTCAAAAAGACTTTCTTCAGACTCCATAAATTC AAACTATGATGACCGTTTGGATAAAAACGAAGAGTCCCAACCAAGCTCTG GAAGGAAACAAAGGTATTTATGACTCTACCCTATTGTTTTCTGGTATTGG TGGTCTGGTAAGTTTATTCATAATGTAAGAACAATGGATTACTTTCTTGT CTTTTGCCTTCATTGAAGGGCTCTTATTCTTCAATCAGAGTTGATATTAA CCGTAATTCCAAAGAGGGAAACAGAGTTTGGATCATTTGATGGGTGTTGT CACATTCTTATTTTCTTTCTGTCTTCCCTTCTTTTCATGCCGTCACAAAC ATTTGTGCTTTGGGAGGTGACAAAAGAGTCATTCTAGGGGAGCGTAAAAA CATATTTATAGGTTTTGGACTCGCATACACGCGAGTCCAACAATATTACT TGAAGATGGGTCCTTGAATGGAACAATCTGACAACGTTGTGTGGACAATG TCAACATAAATATATATCAATATTCTTAACAGATTAGAATGAAGCAGATT CCTCCCTTGTGTGGATATAAAACATTGACAGCCCTAATAAAATAAATAAT GAATCGTTAATCTATAATTAACGTAATTTGCCAACTAACACGATTTTGGT TTGATCAAAGATGGTCGGGGAGGTTTTTTTTACATTTCTAATTTAATTTA TATATACTATACACTCCTGGAACCACGATAAAATTTCAATAGAAGGGTGT TGGTTGAGTTATCTCGAATCAATCAATTTTTGTATAAGTTCTTAATTTGC CAATTGACAACTTTAGGGATGCTCAGATCAATGTTATCTCGTTTTTGGTA GCCATGATACCACCAAATAAACATATTAGAAAACTTGTTCAATATTATAC GTACCTTTCATGTGCCTAGTATTGTTTTAATGGTTATTTGTGGGGTTACT ATTAATATTAGAACTGGGTGTCAGAGTTATTCAAAGTTAGGTGTTTATAT TATTAGGGTCATTGTACGTGTCTCAAACTTTACTTTAATTAAGTAGTTTC TAAAAATAAAAATAAATATTGTATTGAAAATTTAAAAATGGAATCTCTCT TAATTATTTTGTTATAGCTCTAATTTTAACATAGATAAGGCTTTAAGAGA ACAAAAAGCACAGGCTTCTATAAAAAATATATTATAGAAATAATCAATAA TAATAGGAAAGAGGCTTTCAAGGGAAGTCTGTAGAAATAACAGTTGCGAA GCTCGACGTTATAATTATAACATAAAAATCTTTTAAGTTTTCTTTTCTTG TAGTTAAAAACACTATTATTTTAAATAATGTATAATTGTGTACTTTAAAG ACCACAACTAGAAATTCACTACATTATTCTATTTTAAAAACCCTCTGACA CTCTTGGACAAGAATAATCAAACACGTGACAACATGCCCCACTTCTACTT CTCATCCTGTTTTGCAAAAATGTCTATATTGTGCAAAAATAAATCAATCT TTAGAATGAAATATATCAAAAACTGGACAAGATAAGAAAACATTATTTAT GACAAGGGTTTTAAGTTCTAAGCATTTTTTTTGTCTGCAAGTTTTTTTCA GTCCAGACTCTGAACAATCTCTTTAAATTTTCCAAAAGTGTTATGATTAT TCTTTCATGCTTACGGAGATAACATCTCAGTATAAATGGTAACCATGAGT ATGTGTGTGTGCTTATGAAGGATAGAGCGTAACGCTGAGGTTGTGTTAGG GAGTTATTAGTAGGTTTGTACGCACATTAGGTATGTAGAAAACCCCCGGA AAGTTATCATGGTAACCCTCATAATTTGAAAAATGTTATAAAGAAGAACA GCTTAGCTGTTATGACGTTTCTTTAGATCAGGTACAAGCTATTGTGTGTT GAAGGAAATAAAAACAAGTTCCACTTTGTATCAATCAAAGTTATAAGCAT GAATTACTCTGTTTTTGATTCTCGATTCTACTCTGACTCGAACAAAATCT CAAACWTTAGCCTCTCCTAAGCGTTATTCTCCGTCATTCATAAGCACACA GACACTTACATGTACTTACATGTTCTCTCCTCAAGAATGAGAGAATAATT GTAGCAGCTTTAGAAAAATAAACACTCTAGAGGTTGTCAACAACAACAAA ACTCGCACGCTAAAGATGTTCAGGATTTACAAATCTTTTTATAAGTACAG GTTCCTGTTGGACTCAGAATAGAATTGAGGATCAAAAATGGAGTAATTTC TTGATAGGGATTCGGTGTGTGACCTGTATTTATTTTCTTCTTCTCGTTGC TACTTGCAACTAATCAAACGCCGTGACAGCTTTCCTACTCTCCTGCAAGT ATTACTCGTATTGTCGTCAGAGTTATCATGTTTATTTATTTGTTTTACAT AGGGAAAAGCTTATGATTTAGTATCCTATTCATATTTTCATTGCCAAAGA TCCTATGTAATTGATGAAAGGTTCATCCTATGGGTGGTGGAATTGGGCTA CGAAATTAAATAAAGATACTCTTTAATTTAACTGATTAAATATGGATAAT GAACGTAAATTTGATTTGTATTTAATACAAAGAAAGTAAATTAGGTAGAA TTGGTAAAAATACTCGAAGAATGTAAACGACTCCTCCACAACTGTCCGAC TCTGTTAACCACTATTAAAACCTTGCGGAATTCCTTTTTGAAGGACTATT TTTCTGCATAATTGATATAACTTAGATTTGAGCACAATGATAATTTTTCA ATTTTTTTAATGAATAATTGGACAATTCAAGAAGCATAGTATATTAATCC AAGGATTCACTTTTCTATGGATTCCCAATCAAAGTATATTTAGTTCTCAT TTGTCATTTTCTACAATTTTTAAAATTATTTTCCATCTTTTGTAAAAATA GAACAAAATCTTGACTATTATTATTTATAGTAGTGGTTAGACACGTTTTT TTCTGGATCTTGTCTTTTTATTTTCAGATATCAAAGTGGGGATGAGTCAT CGGAGAAGGATCCTGAGAGCAATACCATGTCAAAGGGCTCAACGACTGGA GGAGGAGGGGTACCTCTACCTAAAGGTCCTGGAAGTAAAACCATTTCAGC TCCAACATCTCCCTTAAAGGAGAAAAAGGCTGGCTTCTTTGGGAAAGTGA CGTCCTTTTCACAAGTTGTGAGTGCCAAAGTTGAGCAAGCTCGTGATGCT GCAGGAAATATTCGTGTACCGGGAATGGCAAGAGAAAAATCCTATACACT TCTCGTGATTGATGATGCTAACACAGATTGGTAAGTAGAACCTGATGCAT CATAACTCATTCAGACCCACATACCAACACACAGGACATAACCTTGATCT TTCGAAAATCTTTCATTTTGAAAAAATCTCGTCACACACAYCCTGCCAAT ACATTTCTTGAGTGACGTCTGTAGGGGGTGGGCTGGAGGGGCTGTAGCCT CCTGCAAATTAAATCATTTCTTGCTTCTTATTATAAAATTTAATATTTCC AAAAAAAATTATTTTTAATCAATAGGTATAGATTTTTGGAAATTTTTCTC CAAAAAATTTAATATTTGAAATTTTTCAGCAAAAAATTTAATATTTGAAA TTTTTCAGGAAAAAATTTAATATTTGAACTTTTTGAGAATACCTTTGTAT TTTTTTACAAAATATTTAATATTTTAAATTTTATGAATTGTAGATTTTAG AAATTTTTTTCAAAAAAAGTTTTGATTTTTGGATTAAAAAAAAAAAAGTC CAAAACCCAAGCCCTCCCTGTGAGTACTAATACTGATTAAGAAAATAATT ATAGTTGAGTGACGTGTGACGTCCTAAATAAGGTCGCAACAGCTTGTAGA CTTCTTTGTATACTGTACATATTATATACCATATTTACAATCATTAACAG AAAGAACCCCCTCCCCACCCCCTTCCGAGAAAATATTATTTTGCAGACAC CCCTAAACATATATAAAAACAAACAATGATTTTTTCAATAAAATACCTGT AAAGTTAGATGTTAATTTTTCAAAATAAACGTGGTTTGAACACTTTTTTG GATGAGAAAATAGGTACTTTTCAACACTGAAAGGTCATGAGTAGAAATAC ATGCACGGATACAACTGTACAATTTGCTTGTACCTGTAATTATACCCCAG CAGTATTTTTTAAAATACAATTTTTCCCCATCACGCTTAAAAATGCGAGA ATTTTCACATTTCTAGTTATAAGTAAAAAATTAGTATTTGTTTTTGTTTA KTAATTAATTKATATCTTATTTGTAATTGCGTCCGGGAAATATTGAGACA ATTTGGTAAATTTTTTCAAATTTAGGATTTAAAAACTAATGTATCAAACG GGGTTATAGGGTTCAAAGGTGATATAGTCTTAGGAAATTAAATTCTTTTA GGGGCAGTTTCAATATTNGCCACAATATTTTTATAACCAATGCAAAACTA AATTCTTAGCACTGAGTCGTGATATGAATTTTATTTATTGAGAGGAAATT TCTGTTTAATTGCATTTTTTTATGATTCTTTGGTTGTTTTTTTTTGTCAA 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GTTTCATTTACATAAAACTATGTAGATGGAATATTAAAAGCTTATAAATA TACCAAAAGATTCGAAAAACGAAAATAAGCACATGCACCAAAAATAATAA GTAATACATTTTTTATGTCTCGGTTCGTCTTTGTTGATTCCGATTCTAAC GATTAAATAACAGGAACCTCTAGACTAATAAGGGTATACACTTTCACATA CCATCACTCTATTTGTTTGTTTACTTTAGCCAAACTAAAAGAAGTTCCCA GATGTCGTAAATTATCATCAAAATCATTTAAGTTTATTTCCGGCCACCCT TACATTTTTATATTTGGGATCTTCTGTTAAATATTCTAAAAATTATATGT TTATCCTTAATGGAATAGGTCAAAATATTTTCGTGGWCGTCGTATTCGTG GAGAGTATGATATACGTGTTGAGCAAGGAGAATTTAAGGAAATATCAGTT TCAGCAGAAACAAATTCCGGAGTAAATGCAAGTTTTGCCGGAGCAAAAGG AGTCAGGTATTTCCTTCAAGGTACTTATAATAATACTTTATTTATTTTAT TTTTTTCCACAGAACTTTTAAGCCAGATTTTCTTTTGGTAAGACAAAACA TTCGTGATGCTAATGAGGATTTTCGAAATATCATTATTGCACTTCAATAT GGAGGAATTCCCAGCATTAATTCCCTAGAGTCTATCTACAACTTTCAAGT AAATATAGCACCATTTATGAATGTTTATACGTCTTAAATATTAATACATA TATTTTCTTTAGGATAGACCTTGGATTTTTAGCAATATGATTCAAATTCA ACGTCAATTAGGCAAGGAAAATTTTCCTCTCATAAATCAAGTCTTTTATC CAAATCACACGGNTTCTTTATCGAGATATTATTTCACTTCGTTAGATAAC AAAGCCTTCAAACTTATTTTTTAACAACCATTGGAGCTAAATAGCCTAAA ATATTAGACTCCACTCCTCGTGAAATGGACGTAAAAAAANNCGAGATATT ATTTCACTTCGTTAGATAACAAAGCCTTCAAACTTATTTTTTAACAACCA TTGGAGCTAAATAGCCTAAAATATTAGACTCCACTCCTCGTGAAATGGAC GTAAAAAAAACAAGTAAAACANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTACCTT TTCTTCTTAAATATTCTTTTTCTTTTTATAGAATATATAAACCAGTATTT AATATGTTTGAGAAAATAAAGGCAGGCCCACAAGAGCGCGCCTAAATTTA AAATAGAAAATGAGAAAAAAAAAGGGAGAAATGTATGAAAAAAAGGAATA AATATTTATATTTTATAGAAAAAACTATAATAATACTATTTATTAAATAC TTAATAATTAGGATAGACCTTGGATTTTTAGCAATATGATTCAAATTCAA CGTCAATTAGGCAAGGAAAATTTTCCTCTCATAAATCAAGTCTTTTATCC AAATCACACGGACATGGTAAGTTTAACATGATTCTACGATTTATTGACTT ATTTACTAGATTTTAGGGCTTTTCATCGTTATAATTATTATTTAAATTGA TTCATGTCAATTGTGGAAAACACAGCTGTTTGTAACTAATTATGTTATCA TGGAAAATTTATTTACATATTTAATAATATCAATAATTCTTAATAGTGTT TGAATATTTGTCCCACAATAAATTTGAACCAAATCTGTAAACCATGTAGC AACCGTTGTCATCGGTAATTTTGCTGCATACATTTTCGCCTCTGGGGATC TCGCCTCCAAGAGATTTTACTGGATGACGTATTTGCTGCCTATATGTATA ATATTATTTATATTAGTATTTCGAACTTTTCCTTAACTCTTTATTGTTGA 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TACATGAATAAAAAGTTGTCTTCCCTTTGAGGAATTCACCTTGTTAATTA AATTAAAAACGATTCATTCATGAAGGTTAAATAGTTAATTATAGAGAACA ATCAAGTTTACTCAACGCTTTCAGCGAACAAAAATGTTATCACCTAGACA ACTTCATTTAAACTATTATAGTTCTTGTGGTCCTTGTGCCACCACTTAGC TTATAGTTTTGATTCGTACTTATATGTAAATGTTTCTAATTAAATAATAA ATGTGTGTCCTTTTTCAGAATAGTACGGATCAGTATCCCTGTGTTCTCAA GGTTGGCCATGCTCACAATGGAGTTGGAAAAGTTCGCATAGACAATGCTT CTGGATTTCAGGTTTGCATATGGATTTAGAAATGGGATCTTTGCGTTATT TTTGGTTCTTATTTAACTTGTTTAGGAAATGGCTGGRTTAGTTTCAGTCG CTAACTCGTATTGTTCGGTTGAGTGTTTCATTGATGCCAAATATGATCTT CATGTACAAAAAATTGGAAATAGTTATAAGGCTTTTATGTGAGACGCTTA AGTTAAATACATAGTATTTTAATGTTTAGTTTGATATTCATATATATACA GGCGAAAGTCCTTGGGAGGKAATTGGAAGACTAATGTTGGACAATCTATT TTGGAAGAAACTCCTATTTTAGACAAACATAAAACTTGGATTGATGCTGT GTCGGAGATGTTCAATGGATTAGCCGTTTGTTCATTAGAGGCTGKTGTAG GAAAGGATGGAAAGGAGCACATCATTGAGATTAATGACTCTGCAACTCTA CTAATGGGCGAGAGTCAAGAAGAAGACAGAAGAAACATTGCGGATTTAGT CTTTAAATCCATGGAAGAAAAATGTCTAAGCAAGGATGAAGATGAGAAGA CTACAGCAGTCTCTAATAAGGAAGATGAGAGCTCTGTAGTTAGACCACCA 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