EMLSAT00000000479, EMLSAT00000000479-696326 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000479
Unique NameEMLSAT00000000479-696326
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1071supercontigLSalAtl2s1071:64419..95810 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000479 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000479EMLSAG00000000479-683245Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002108EMLSAE00000002108-711036Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002109EMLSAE00000002109-711037Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002110EMLSAE00000002110-711038Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002111EMLSAE00000002111-711039Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002112EMLSAE00000002112-711040Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002113EMLSAE00000002113-711041Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771137auto771137Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000479EMLSAP00000000479Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000479

>EMLSAP00000000479 ID=EMLSAP00000000479|Name=EMLSAP00000000479|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=472bp
MNILRCEVRPGPEFLLRQYEFSKKLKFILYIYYYGDKDCRVFLYGIKVWG
QLKTERASWIVPGASENEVNIHRVDIIPYHDEAAKSLELKLSNYCPDNFE
WSLFQSHTLYRKMHDKYNYTPHWEREAHDMKCLEGLGTVFNELQLGRLVS
RPHHHDHKWRDELFFGDIHTKIKRRTRYRPTALQAHPLLRGHKTHKTCKI
CRKVALANLSNPPRLTQRFFVPVNLEGEWISRRCETRPNSLFLMRRLTFY
PSNRSWEGIYSYFADEKCSNEGSSEIVHGGTNFDFKIKTAHLTPVAQSLA
NQLNHLPSGSCGIAGSWKVGVIQEVTSTGGCKGLGLTIPITELDLLKMES
NLDGSRLLLSLGQTDTDAVLHNHKKEQEGLRPTSYQPPLLQCRMFSDSSN
PNNELFPVMSHLKSNPLRNLVSSSNSLLYPSMTCTCSFLIISCNMFCLLF
YSINITYVIKFPVTNMHCFIKN
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1071:64419..95810+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000479-696326 ID=EMLSAT00000000479-696326|Name=EMLSAT00000000479|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=31392bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1071:64419..95810+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATATCTTAAGGTTATTTTATTCGTTGTGATTAATTACAAATGAATG ATTAATGATTTTTTGCCATATTTAGAATAATTAAGAATGTTATTTAATCA ATATATTAATTAATTTCAAAGTATAAGATATGCACTTTCCTCCTTGATAA AAGGTAGAGCAAAAGTTTGGATAAGTTATGAAGGATGATTGAGTTATACA AAAGNAAAAATATATATATTAATATATTAAAAGAGGCGTTCAAATAAGTT TTTTATAATTTCCATACATGGTAAATAGTTAACTCTGACAATTTGAATAT TGTTTAGGAGTAGAATAGATTAGCTATCATGAAGTGATATTATAATAACT GCAATCAGTCGTTAGAGTATAATTTAGAATTATTAGAAATAAACACAAAT TCAACTCCATATCTAGCAAGATCATATATCTCTAGGAATTAATCCGATGT CGTTCCTCAATTCTACCCTGAGTCAAACAAGGACTTGAACTTATAACTCT CCATCAAATTATGAATGTTACTCTTCATCTTCCACAACATGGTGATTAGT TTATACTCAAACGTTCTATCTTCAAGAATAAAAGAATAGTTATAACTCCT TGAGAAAATAAAAAATACTTTTCAGATTMCCTACCACAAAAAGCATAGCA CGCGTATAAAGTCATATTTTCCCCAACTATAGCGAAATGGTACTTGTTAT ATTTTTCTTCTTGTTGTCAAATTTGAATAATAGTAGGCAGATTTATTATA GAGAAAGAAAATTTTAATTTATCCATGGATAGTATGCACAATATGCATCT AATTAAAGTCCTTGATTTATATAAATCAATATAAAAATCCTAAGTAATAC CTTTTTTCGAGTTCATAATACAGGTGCATCAAATCATACAAGAGTCAACT CATGAAACTTAATGAAAATAGTTGAAAGGAAAAATACACCCTTTCATTGT TCACTATAAAAAGCTCGACATGTAATTCTTGGTAAAAAATAAGTGACGTC TTCCTTTGTCATATTTCGTCACATTGAGTCTCATTTCTATTTTGTTAAGG AAAAGAAAATTTATTTTTAATCAGAAAAACATTGAAGAAAACTATTTCGC TATAATCGTCATTCAAAAACGAAAACATTTTCACGTAGTTATTACAGACG AAATTAACACTCGTCACAAATCCTCAAACTTGGTTATAAGTGTTGCTTAG TTGATACTTTGTTATTTCTTTATTTGTTTGTTTTTGGGGAAGGAAAGGTT CAGAGATACCATGTAAATTACTGTGTCTGAAGAAAAAATTATGAGACTTT TCATACAGTCAAACTTGTGTTAAGTGGTCAGGCAAGGAAAACTGAAAAAC CAACCACTTACTGCAGGTGACCTCTCAAACCAAGTTTCCTTTTTTGAAAC AATTCTAAACTAAAGTTTGATATAAGAATAAAATAAAGGATAAAACTTTA CGTCTGTACGAAATGGGATAACATTCATTCTTAAATAAAGAGAGAAAGAC AATAATGCAGAACAAACATTCATTTATGTGTATGCAATATACGTAATTAA TTTATTAACTCGTCAAGAGAAGGTTTTAGTCTATAGCCATATTTTTTTTG TACTCAATAGTGTGTGTAAGTTTTAAAAAGTGACCCTTAAAAGAAGATTT ATGAATGAATAGTGTTTTGTGGATCCTTATTTTGGACTGAATACTGCAGT CCCGTCCAGTTGAGTCTTGGAAATGTACAGGACAGTCCAGCATATCTGTC CTAAAACTTATAAAGTCTGATCCTTCAAATCCTTTTGATCCAAATTTGGT TCAGTCCACTATTTATGAGCATTTATAGTAGCTATCTAATCATTTGTGTA ACCCCTGGCCTGAGATTGCAGGGACACGCTTAATATAGTTTGTTTACCTC CACCAACGAAGTTGAACGGAGGTAATGTTGACTTTTTTTTTTTGTTACAG ATCAATTTTAGTAAAACTTTATGGCAAGATTATATAAATTAACAATAAGA GGCCATTAAATTTTGAGAGATTGAGATCAAAACAACACAAAACGTTAGAA ATCAGAATCGACCATAATTTTAAAAAAAAACTGAGATAAAAAAAAAATTA GGGGTCAAAGTTTAAGTTCACAAAATCGTTAAAAGTGCATAGTCGACCAT AATTTGAGTAAATTATTTTAGACGTAGGTTTGTGTTTTAATGAGTGCCGA CTGTTGTGTATGTTGTGAAACTACTGCATGGAAAATGAATTGGAACAATC ACTTAAATGACACGCTTAAATCAGGCTACTCTAAGACGTGGTTTGACATT TTATATCTTCGCAGTAAAGAAATCAAATATTGCATAAATAGTTGATAAAA AAAATGACATGACAAACTTATCAGAATTTAAATACGTACATAAAATCAAT TACAAAGAATTCGCTCTACAATGATTTATTGTCGGTGTGTTTTATCAAAA TGAAATCAAAAAAACAAACACCACATATCATTTAGCAAATAGTTGGAGGA CAAAACAATTTGAGACAACAAACACTTATTTTTCTTATCACCAATGTGTA TGATTGACATATTTTGTGTTCTTCAACTAACAGTTTTTTTTAACTACATA TATTTATGAATCAATTATTAATAGAAAACAATATAACTCATATTTATATT TGAAAGACGTTATAGAAAGCAAATAAATTATTCTAATTTAAATGGTATCC ATAACCCACATTCATAGGTATCAACTAGTTTTGAGACTCGGTACGAGAGA AACTTTTTTTTATGTTTAATTGCAACGGATTTTCTCGTACACTGATTATA TTTTCTATAATATTTTTTGTGTGTGTACGGATCAAGACCAAATATTTCAT TGACACCAGTTTGGACCTAACTTGGAACTTTATAACAAGGATTTTCTGAG TGATCCCCAACAATAGTATTAACATACCGTAATAGAGGATAAGTAAAGGG ATTGCACGTCCCTTCTTCAGTAATAATATAAGAATATGACGTCATACATT TTAATACCAGTCCCCTCCTGAAAATAAATGCAACTTGTAGCACCTCTACA GGGTTAATAATTATAATTTTTTGATAGAAATTAACGATAATTTCTCAAAG AATACAAATATAATCCAACCTTAATTTTGAGAAAACTCATTCTAGCTTGT TTTTTTATTGAGAGACCACATATATTAGTGTTGGTTCGGCTCSAAAAATT GTAAATTCGGTTAGACTCGAAWTATACTATTTATAGTGTTGGATCAGCCC CAGGGGTGAATACAAAAACATATATTATTAAATACGAAATAAATTGAAAT GTGAAAGAAACCCCTTCTGAGCGAGCCATTAGAGGTGTCAAAAGTCTCGA AATCTTAGTCAGTGTAAAAACCGTACCTGAGATAATGTCTTGAAAATATA ATAACTTTGACAGGGACATATCTCCTGAAAGAGATCCCTATAAACTTTCA TAGAGATCCCTAAATAGTATATATTAATAAAGCAAAGTTTGGCTGTCTGC TACTTGATTAAAGAAATAAATAATAACAATGTAGCAACGAGCGTGTCTAG CGTGTCATATATGTAAAAAAAAAGAAAAGAATACAATAAAGGGGAATACA TGTTTGTATTAATAAACAAAGTGGGTGTGCTCTTTGTATCTGTTTTTCCA CACCTAATAACTCCAAGCAATGGGGGGGGGGGGGGTATCCCACAACTAAG TTTATATTTTAATAATAAGGAGGAATAATTAAAATACACTTTTTTTTAAT TTACGCTTTCTATGATTTCTACACAATTTCACATTCCTACAAATCATGTT 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ACTAAACTACTTCTGCAAAACTACACCTCCAGTATATGGTTCTATGTGCT AGATAAAATGACTATTTGTCTAATTTGTTTTCTATAAGCTTAGCGGCTCC TTTGTGAATTCCACTATTACTGTAAGTGGTGTCAAACACCAGGGCAGTAA TCCTATCCGTGAACTTTCAGGTCTCTAATAGATCTATTTATACATTGGCT TKTCATTTTCCTGTTGAGCCGATAATCAGTGGGACTCTCAACAGTTTACT TTCAGAATATCCGAGTTAGCCACACACATATCTGCTAAAAATTCAGTAAT TAATTAATTTGATGTCAGTAGATCATCCTGTTTCAATGAGTTTTTGATGT AGATACAATGAAATTATCTGAGTCAGTCCCTCTGGATTTTAAAATGACGC AAACAAAGATTGTAAATGTGTTGTCAGATAGTCCTAAACGCTCAGAAGTA TGGCATATTCTTCCACACTCCATAATTTCCAACATCTCATAAAACAACTA CCTAATCTAATTTGATAATAACTTAATCCAATAACTACTTGTCTAAATTT TACATTTTTAGTAACAGAAGTCATTCTGATTTTAAAATTGGTATTAGAAA AATTATCGAACATAGGGAATTAAGACTAATATTTTTCAATGAATATTAAT GAGTTGTTTTTGACGCTTTGATGGATACAAAATCATTTATATTTATGATA TATGAATGCATTTGTTTACAATATTTCGTTTCTAGGAACCCAATATGTAT GTAAATAAAATTGTTCTTAAAATGCATGTTAAAAAAATACACTTTTTCCA TTTTCGAGGTTGCCAAGTGTATATCGTCAAGGATATCTATATTAATGAGG AAAAGTGTCTCTGTTTCCCATACAGCATTTTTGAGTATGCGCATAGTATC TTAAAACTGCATGACTACTTGATCTAAGAAACAAAACTATAACAACGAGT TGGTTTAGCTAAAGCTCAGCCCGTCCTACGTCCATTGCAATTGAGCCTTA AGTGAGAATAGCTATATTAATAAAAGCTAGTTCAAAAATGGAGTGCTTAG CATTATGAAAATAGAGAAACAACTTTTTTACAAATTTTCAATTCATTTTT TTATTTTAAGAATATTGTTTCAAAATAAGCAAGGCTTTTTCAAATTATTC ATTGTTTGGACAACAATCAAAAAGTGTATCTTCTGTATTTTTGTTTGTTT ATACTTAATTCTTAAGTAATAGTCTGACAATATATGTAGAAATTTTGAGA CTTATAAATCTTTTTTTAAATTAAAAAATTATCATTGCATTAAGTAGAAG TGTTCAAATTTCTAATTTTTATACAAACCTTCCGTCTAAATAGGTTCAAA TTGTTTATTAATCTACACAAAATAGTTATTTATTAGAAAATGCTTCAATT TAAAATATGTTGACTGTTTTTTAGGTAAAAAACTATTTTTCTCTAAATAA ATATCCAATTTCAAAACTTCAAAGGTTGTACAGAACCTTTAAACATGGAT TAATATAACTTAAACTTTAGATTTTTTGATTTTAAGGAACATTTTTAGAC TATGTTAGGGGCATTTTGAATTTGAATTTGAAAAATTATATTAAATTATT TAGTAAAAAGAAAAAAATCCTTAAATTGGGGGGGACTACGCCCTCTCACC CACATATTGTGAACGCTTCTGACATTTGATTAGTTGTCTGCTGTCGATTT TTCTTCTTATTTTTCATTTATCTGGTTTTTAGTGTTGATTGGTTGAATTA GTTCTTGATAAACTATGAAATATTCATTTGGAAAGAATTGATTGACTACG AAACGGGTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTCGTTAAAGCTTTGAGATTTAAAA AGGTATCCACGTGTGATTGATTTCATCGTTTAATGACGTCGAGTGTCTTG 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