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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1075 | supercontig | LSalAtl2s1075:106490..119819 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000484 >EMLSAP00000000484 ID=EMLSAP00000000484|Name=EMLSAP00000000484|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=473bp
FREAAEKEILDHLLQRSHYDKREKPQASEGILIVNASVIILSIEGSKDAT LTNGRDVEYLLSLSWKDLRLMHATFEDSKPTSSSLSSPSYNKKDPLARLH LNGIYHSKEIWAPGIRLDEGDSSIALRIYGNGTVHWLIRRKKGLNCRGQA SLYPFDEPVCSSTIETSTREDDLSLVWSLESPMILSSNALLPSSILRKML TTECSERMRWNGNDSCLEMKFAMGRDLNYFWSNLFVPDMILVSSSFLTFW LDWRXCLNARIVLLVTVTLNYFIARMPATSSSLSKLEDGDRPTPAIYLWQ AISVLFIYGSVVEFVLAGYIGSKRSDSYRAHSYFSHLPNHHYHCRKRRYG GNTAIGSGVLTIDPEHLEEADQSSINSCNIDQISQCAGPEEPFQRIHSHN HHSHSHHQQGTSTTSFHHVQTSASQNLPIINSSSSGSKFNYIQARKLDRI SRMIFPTLYALLISIYFFKYLYN back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1075:106490..119819+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000484-696331 ID=EMLSAT00000000484-696331|Name=EMLSAT00000000484|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13330bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1075:106490..119819+ (Lepeophtheirus salmonis) TTCCGTGAAGCTGCTGAAAAGGAGATTTTGGATCATCTTTTACAACGATC
TCACTATGATAAGCGCGAAAAGCCACAAGCATCTGAAGGTGCAATGATCT
GTTCATTTATGTACGCCCATGACTTGATCAGTTCTTTTTTCATCCCCATT
AGGTATCCTAATTGTCAATGCCAGTGTTATCATTTTGTCTATTGAGGGCT
CAAAGGATGCAACGCTGGTAAGTTGAGAGATGAGTTAAACATGTTGTTTA
CTGAATAAATTTGATTATATTACATAAATTTAATATTGTAATTTGAGGAA
GGTTTTTTTTCTAATTTAAAATATAATTAAATCATTATATAATTTGCCAT
ATGACACCATCATTTTAAAGTGAATTAGTAATATATTTACATCTCTTTTC
TTATATTTTATAATTCTACTATTCGCTAACTTTAAATCCTCGTTTCTATA
AGTAAATTTATTAAAAAAATTGCAACACCTGATACAACTAACTTCTTTCT
ACTGAGAATTACAGTATCTCAAATGAGTGAGCTTTGAACTTTGATTAAAT
TTTATCAACTAAATACATAATAATCAATAGTTCAAATAGTAAAAGCTTTC
ATAAAAACGGACTGCAACATTACAAAATATTATTCCTCATAAAAATCCGT
TTGCATTTAAACCTAATGTTGACAAAGTTTATTAATTTTGTTTCACAATA
ATATAGTTTTGTTGATGTTTGAGGAAAAAACAAGTCTCCCCCCTCCCCCC
CCAAAAAAAAATAGAATGAATTTACAANATTTATGACTGCTCATTATCAG
CATTCCATCTGTTACAATATCATTTTCCTAGACAAATGGTAGAGACGTGG
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TTTGAAGACTCCAAACCCACTTCTTCTTCTCTATCCTCTCCCTCCTACAA
TAAAAAGGATCCCCTTGCTCGTCTACATCTCAACGGTATTTATCACTCCA
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GCACTCCGTATCTATGGAAATGGAACTGTTCATTGGCTAATCAGGCGGAA
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ATGTGTTCAGGAGAAAGATTGAGCAATTCGTATTTGATGGAATTCTATTA
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GCTCTGTGTGTTACTTATTTTCCATAGTCAAAAAGTTTATTTCATTTACC
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ATTCAAATTTAAAACAAATGACATTAATCATATAAATGTCACCTCGAACA
ATAAAATAAATTACCCAGTATATTTTAAAACTGCTTTTGTATAAGTCCTG
AACTTTAAAGAAAAAAGAGTGTTCAAAATTTCTGAAATACAAAAAAAACA
AAAAAAAAACTTAGCCCACACATTTATTTTTGCCTTAGACCCAGCTCCTG
GTTAGACATATAATTAGGATTGAGAAAATTGTAGAACCCCTCGTAAGTAC
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CTGACAGAAATCACTATAAAAACTATAGTGCTCCGTACTGGCTTCAAAAT
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TTCTATCGATATCAACATATATTTAAAAAAAAAAAAATCATTTATTGAAC
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AAGCTATGTCACTATTTATTCCATTCATATTATTTGAAGGAACAAAACAT
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AAAAATGCTCACGACGGAATGTTCAGAAAGAATGCGTTGGAATGGTAAGT
AAGATTTTATTTTTAGATGTGACAGTCCTAAAATGGCCAATTCCGCTTTA
TTCTAAATTTAAAGGAAAAGTCTAGTATTCTATCAATTATGGTTCTAGGA
AGGAGAATATTATGTTTTAAGCTATGTATTTAAAAAATATATAAATTACA
AGCGGTAGTKCCCGACATTGGCTGGYGMCATAAGGNACCGGCTAAAAGAC
CAATTTTTCTTGAAAGAAAAATAATAATAATTAGTGGAAATAAAATTAAT
GACTAATCGAAACTATCACAATTCGTTTTAACATACCAGCGTTTATATTT
TATTCAAATATTAAGATATATGCACATTAATTATGAATATGTTACGGCCA
ATGTGCAAAATGCCTGAACAATCTATAAAAATTTTAATTGCGTGGTCATT
TTACGTTCATCTACATTATCAGGTAAAATGATTATGGGTAATTTGATTGT
TAAACAATTCATTGCCAGCAATTTGAACATTAAATATTCGATTATGATAC
AATTTTATCGCAAGAATTTTGACAATCATTTGCACCTTAATTGAAATTTT
TATAGTGTATCAAACTATTGTTTGATAAGAAATTGTCATGAGAGACCCCG
TTTTATTTTGCAAAATATGTCTCTGCCAACAGGTTGTGCAGGTGAACAGC
TGGTCCCTAAGGGGGATCAAAACCTATCCCCCTACTATCTAGAGTATCAA
GGATCCATTCTATTATACTAAATGTAATATGGGTCATACAATTGAACCGC
TCGTCCCCAAGGTGGCTCATTACCCACCCCACTGCTTCCTTCAGTATTAA
GGACCCCTTCTTATATTCTGTAATACACCTCGACCCACTAGTTCTGCAAG
TGAACTACTGCTTCAACTAAGGCATCATGGACCCTCGTTATTCTACACAA
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CTATGTGGAACTTTGGTGGTGGTTTATGATCCTCATGTGGCTCCTCCGTA
ATTAAAGGGTTCATGTGTTTTACTACATGGTTGTGTATTTCATATAAATT
CTATTAGTTTCTTAAAAATAGACCAAAAAAAAAACTCCTTTTATGTTATA
TTCTTTAAAATCAAATGTAATAATTTCAAAAAATCTTTTGGAATGATCCC
TAGCAAGCCTAAAACGGATTTCTTACAGGGAGATGTTTTAAGACACCATT
TTTTGTCCCTAATCAATAATATCCACTCTCTTCTATATGGATCACAACAG
ACAAGATGTTGTGGGGATCTTTTATTCCACGGTGATTTCAGTGTTCTCTC
TAAGCTCTCCACTTCTGTTTTTTTGCTGCCCTATATTTCCACACATATCC
AATAAAACAAATAAAAACACAAGGAAGGGGTGGCATGGTTAATGCCCCGC
CTTGTTGACAAGTGGTTCACTTGCATAACCCATGGACTGGTGTATACTAG
AAGGGGTCCATGATACTCAAGATAGTAGTAGCGATAGGATTTAATCTCCC
TTAGGCACCAGTTTTCCTCCTGCAATCCATGTAGGCCGAGGTATATTTTG
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AATACTTAACTATAAAATAAATAAATTTATCATTTCCAACAAAATATGAT
TCCGACCTTATTCTATTTTATGAAATAACTACAGGAGTCTTCATTAATAT
TTAGAAAATCTGCACAAAATTCCCTTAAAGAATAAAATATCTTTCGACTA
AAAATAAAAACAAAAGTTCAAACTTCCTTCGCGAGCTATTATGAATAGTG
TTGAGACCCAGTGGTTGGGGAACACCTCTAACATTCCTGAGTATATCAAA
CCATCCCAAAATTTATTGAAATATACAAATTTATATATTAAATATTGAGG
CACTGATAATATAAAAATAAACTGCGAAAATTCTCTTTTTTTTTATTTTT
GTTCTTGTTTGCTTTTCTGGGGACGCAACACAAATATCTGAAGAATTTTT
AGAAATACTAATATTCTTAGATCAGTAGTACACGGATGATTGAACAGGGG
GGAAGTGGGGGGGATTTCTTATTACAAAATGAGAAATTAAAAAAAAAAAT
TAAAGCATATAATTTTTTTTTAAAAGAATCGCCGTAGCTCATGGACAACG
CGCTCAGGAGAAGTTATTCTCTTGAACTTAATGTGTGTACGTTCAATCCC
ACGTAATTCCTAAAGAAAAAACTTTATGTATATGGTTTCACTAAAAGATT
CCTAGGTTAGACAGAGTAAATGGAATACTATAATGTTTCGATATGCTATA
TCAGTGCAACTCTATCAAACCAATTAAAGGAACATTTTAAAACAATATAT
ATACTCCCCCCCCCCCCTCCCCCTCCCAATCGAGGAAATTTTGTCTTGAT
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AGGAAGAAGGGTTTATTTTAATCCAAATAAATTATTATATTTTTGAACAA
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TTCAGTGTTTGTGAACGAGCTGTACAAAAAGTATACAACATGAGCTTTGA
AGTGCGTTCTCCCTTAATCAAATCCAAGTCATAAAAAAATATGTACATTT
TGTTTGTTGTATTAAAAAAAAACCAATCATAGGGGGATTGGGTACCTAAG
ACTAGTATTCATCTTCATGTCTTTCTTTCATGTAGGATTTTTTCTGTGGT
TTTTCACTCCTATCCTTCCTGAAACAACTTTCAGTCTAACCTCAATAGGA
AAAAGACTTGAACTTTTCTGGAATGAAAAGTTCAAGCCAAGCATTATTTA
TGTATATACATTCATTTAGTTTAGTAGTAAATAAAGAAGAACTGAAATTA
TGGTTTTTGGTTTCCTACTCGCCCCCCCCCCCCCCACTTCTACCATGTAA
CATTGGAACATACATAGTTACATCTCTCAACATCTATGATTACGCATATT
CTACACTTATAACTCGTTCATGTGTGTTTGTGTATTTCTAAACTTCAAAC
AAGTGTATTATACTTATGGATATTTGATAAATTGACATAATATTGTGCTA
TAATCCTTATACATGACAAAACATCACGGTTTTAGCACCAACTGGACAAG
TATGTGTTATATATTTACTACATGCAGAGCTATGCCGTTAATAGGGCTAT
ATACTCATACTACACATCTTTTTCATGGAACTTTAGGGAAAAGTTATTAA
TGAAATTGTTGTCTTCAAAGAACTAGTAGAATATCCAAATAATGTATTCC
TCGAATTGGAGTAATTTTTTCCATCAAGCTAATGTAAGTCCAATTAATAA
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AAGAGAAAGCTGGAGCAAGACTTAGGGAATTACTCCCTTAAGAACTTTGT
TAACATCAGCTGCTTGTTATTTTATTTTGGGCCGATAAAAATGAATTACG
GCTATAAAAAGGAGAACGTTCTACATTTAAAATAGTATCAGTGATAGAGA
AATATTAAAATTATATTTGAATATATATATCACTAATTAAAGGCTACCTT
GCGTTGCTCAGGCTAAGAAGGGAGATGGAAATCACATTGAAAATAGTCAA
ACTAATTGAGGAAANTTAAAAAAATATTCCGAAAATACTTCTATATACTA
ATAATTATAATATGTATGAATGTTTCGTTGTTGTCTAAAAAGATCCTGAT
AATTCTAATTCTTATTCTTTTGGTTTCGTCACACTATATCAATCTGGTTA
AGTAAGGTAACTTACAAAGTCTTATTATTGCCTCATGTAATCTCAGTAGT
ATTATTATGAATATAAAAAAATATAATGTGTTACAAACTTCYWATAYCAT
ACCAWTATATATGCGTCCATAAAATTATCTAGATGAGAAGTCCATTGNAA
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ATTGAAAATACTTTAATAATGAAGTTAAAGCAGCATTTTTTTTTTATAAA
AAGCATCGTTTTGTGGTATTTTTTCTTAAAAAACTGAAAAGTGACGTTTG
ATGAAAAAATGAAAAAAAAAGAGGGAAAAAATCAAAAAATAATTCAGAAA
ATGGCAGGAAWGGCAATGCCTTATGTGGAATAGAATGCACAAGGAAAAAG
TTACAATCTGAGTCGGAATAAAGATAATATTAAAATTATAATTTAATTTA
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TCCCATTTCAATCCAGGACAATCCCTAATTGAAATGTAGGACACCCTCTA
ATAACAGTGGCCGAAGGTCAACCCTCCTTTTAATTACTGATTCATAATTA
GAATGTCGAATATTGAAGTACTAGAATTAGATATTTAATATTTAATTTTT
TTTTTTAACTTGTAATATTATACGTAGATTGTACTCGATTATTGCATAAA
CATTAAATTTATTAGATATATATTAGACCTTGATTCAATTTCCTAATTTA
TGTGGTTCAAAATGGTATTTTATACGAAATGTGAGATTCATTAATGATTA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATAAGTACCTCT
TTATTAATATATGATTGATTAATTATAGGAAATGATAGTTGCTTAGAGAT
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TTCCGGACATGATCCTCGTATCTTCTTCCTTTCTCACTTTTTGGCTGGAT
TGGAGAKGTTGTTTAAATGCAAGGATTGTACTCCTTGTAACAGTAACCCT
CAATTACTTTATTGCTCGTATGCCTGCCACCTCCAGTTCATTATCAAAAT
TAGAGGACGGAGATAGGCCCACACCTGCTATTTATTTGTGGCAAGCCATC
TCTGTTTTATTTATTTATGGGTCAGTCGTTGAATTTGTACTAGCAGGATA
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GTACGATTATAATTACTAAATAGGACTTCTTCTACTTTCAGGCCCATAGC
TACTTCTCACATCTGCCCAACCATCACTACCATTGTCGCAAACGACGTTA
TGGAGGAAATACTGCCATTGGGAGTGGAGTTCTTACCATTGATCCCGAAC
ATTTGGAGGAGGCAGATCAATCCTCCATTAATAGTTGCAATATAGATCAA
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CCTTGCAACTCCAGAGTCCAAAAATAGGAGTTGGTTGAAAAATGGAGCTT
CTTACATTTTTAGAAGCACCTTAAAATTTCACGTCATCCTGAGAAACCTG
GAAACAAATAACCCGCATACCTGTGTAGTAGATTAAGACCATAGGTCGAG
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ATCTATATTATATAACAAATATGTAAATAAAAATAAACTGGCCTCTCTTA
TTACAAATTTCAAACTCTTCCTCCGCTCTAGTAGTAATTTTTTTAGTGTA
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GTTCAAATGGTGTGATCCTGAATGTTTTTATCTCGAGCAACATGAAAAAT
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TTTTTTTTAAATAATTTAACATTAAGAAGCTATTTTTTATTATCAACCCT
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GTAAACATTATAGTATTACAATTACTCTATCTAAAGTAGGAATTGACTTT
GAAGTTCATGTACGAGTACATAAGGGATATTTCTGTGTGTAGGAAGGACT
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GAAAATCACACTAAATCATATTGATGTTGTAATTTAAAAAAATATAAATA
TGCAGATTTCCAGGGGTGTCAGCAGGATTATATTTGCAGGGGGGAGGGGG
AGCTTGGTTTTTGGAATTGAAAAAAAAAAAATCAAAATTAAATTTAAAAG
GACAATTTTTTAGGAAAAAAATTTCAAAATTAAATATTTTGAAAAAAAAA
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CTTCAAAAATCCACAGATGTTAAGAAAAAATTCAATTTTTTGAAAGTTTT
TTTCAATTATCAACTTTTTTTTGGAGAAAAATTTCAAAAATCCAAAGCTT
TTCAGAGAAAATTAAATTTATAGGTGGAAAAAAATTGAAAAATTAAAATT
TATTTTAATTTTTTTGAAAGAAAAAATCAAAAGTTAAATTTTCTAGTTAA
GCAGGATAAATCAGCCAATTTATTTGAATACAAGCCCTATAATTGGCTCA
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GGACAGGGAGGCAAGTACGAGTGAAGCAATGGACTGCATATGAATGCCAA
TGTTTTCCCTGCAACGAACCGTAGCAGTAGTATTCCGCGATTCCTTCCAA
ATACTTTGAAACTTACGTATTAAAGTTTGAACAATTGTGATTGGATGTGA
TTGGGATAAAATAAATGATGTATTCTAAAATATATTACGTGGCCCAGCAT
AATCATATGAAAGATGATGACCCTCCTCTCCATTTTTGTTGAATTCAATA
TAGAGCTGAATTTGATGCAGGGTAGAATAAGTGATCCTGGAGAAGGGAGT
GAGGGGCTGTGCAATTTGCTTATGTTTACGTAGTTTTGAATTGCGAAAAG
AAGAAAGGAAGAGAAAAGGAGATAACAAAATGGATTATTGTGGATTGGTG
AGTGAGAAGGTGTTGTGATAGAAAATAGACTATTACAAGCAAAGACTACT
GACAAAATCTACTTCTAAATTCCAAGGTATGAATAATTTCCTACATATGT
ATGATATGTAGGAAATCATTGAACTGAGACAAAAAATATGGACATTTTAC
CCCAAACCTGCTCTAAAGAAGGCCTATCCATATACATTATAATTGCATTA
TTATCAAACAACCCATAACGATGAATGATGACATCCCGGACACCTGTCAA
GGTGAACTAGCACAAGTAACTCCCTTAATGTGATGTTGGCACGAACGAAT
TAGTTATGTTTTTGGGGGAAAGATAAGAGTTTATCTTTAACTAACTAGTA
TCAAAATGCAAGAGAATAAGGATAGCATGGCATGTAACTACTAAATACTT
GGCTATTTACTAATTAAAAAATTATTTTACGCGNGAGATTGGGAAAAAGA
TGTAGCAAAGAACCTTCTTTTTTTTTTTCAATATACGTTGTTTCAGTATA
TTATTTGTCTGAAGTTCAAATGATTGTCTTTATAAATTGTTTCTTTCCGA
TTGTTCGATATTGGTCATCAATATTAAGTACATTGTACAATTATTTAAAA
TAAAGAATAAGGGAAACGAAAAAAATTTAGATTTAAGTATTGTAGAATAT
AATTTATTTTAAAGTGGTAATTCAGAAGACAAGAAAAAACAAATTCATAG
GTGAAGACTAAGAATAAGTATTATTATTTTTGGATTTTGTACAAGTTACA
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TTATCAACTATAATTGGTGTTATCATTGTCAATGTTTTGATCGTTTAAAA
TTACTACTTATTTATTATGTATCTTGGAGATAATCACCGTTGAGCTTTGC
ATAAGTTACATATAATTTCATGGAATAATAATTGAATCCAAATAACTTAA
AATATATTTTGCATCAGCATAAAAACAATCTTGAACAAAATTTAAGAAAT
TGTGGAAATCCCAATTTATTTTTTGACTTCATACATAAATAATATTTCAT
AGACATATTTGAGACAGGCATTGTATTTAAGTTTATGGTATAAGTTAAAA
TACTTTATAAATAAAAGAAGACTTAATATCTGCATTGAATATTACTTGAT
GTCAATGATAAGCGCAGATATTTGAATAAAAATAAATAATAGGTACTGAC
AATCCCATTAAATTTTATTCAAGGCATTCATATTGTTGATGATTAACTGT
TAATGATTGTAGATTGATAACTTATTAGATATAACATCAAGTCATAGTCC
AAGGAGTTACCTACACATTTTGGAATTTGTAGAGAATAAGTGGAATATCT
CGCAAAAATATCCCTCAAATCGTGCCTGCAAAATATTTCACCATCAGCTG
GCTTTGAAGCAATGAGATCTATGGCACTTAACAGAGCAAAACGCATTGCT
TGACTTCCTTGGGATGATTTTTCTGATGGAACACCCAATAAAATTATGGC
TTTAATTTCCTTAATTTTGTGCTCTGACATATCCATGTTTAATAACAAGA
ACTCTTGAAGTAATGCCACAAATGTCAATGGTTTATTAAATAATTTTTTG
GGGAAAAAATCTCAAATATTATAGTTTTTGCTCTGCTGCATAATTTGTCG
TTTTTAAAAATAAATTGTAGTATTAAGCAATGGTGGTTTTCATTGCTATA
CAACTTGGTTGTTTAGGCCCCCAAACCGGCCGACATCAACAATACAACAA
TGTCACTTGAAAACATGCTATGACTTTTTCAATCTACGTATTTATCCACT
TTTGTTTACAATTTTGATGCCTTTGAAAAAAAAATAGAAGGAAAAGAAGA
AAAAACCTTTGGCTATAAGTTACAATGTATCAAATGAAAAATATATAGAC
AATAGAAGTGTCTTGTAAATAGATTCATATAATAATTATATCTATGTACA
AAAAAACAAAAAATCATTTATTATTTCGAGGAAAGGAAGCAAATAAGGGA
TATGTGTACAATACTTACATACTCGTACAATAGTAATGATTGTTTGATGT
GTACACAAGACATTTGCATCTCATACAAATCAGGAATTGGATGTACTGAG
TACACGTACTCGATATTATTTAATCTATCTCTCATCTTATTATTATGTTA
ATATCATTCCTATTATTATTATCTGTTATATTTAGAGACATTATTACATA
TTCATTATTAACAATTATTTATTTATTAGTGTGCTGGACCTGAAGAGCCC
TTTCAACGGATCCATTCTCATAATCATCACTCCCACAGCCATCACCAACA
AGGTACTTCCACCACCTCCTTTCATCATGTACAAACATCTGCCTCGCAGA
ACCTTCCCATCATCAATTCCTCCTCATCAGGCAGTAAATTCAATTATATA
CAAGCAAGAAAACTTGATCGAATCTCTAGAATGATATTTCCTACGCTCTA
CGCTTTATTAATTTCCATTTATTTCTTCAAATATCTCTATAACTAATGCT
AATACAAAACATGGGTTTGGCATCCAATTATTCTACAATTTTGTGTTGCT
TATCATTAAAAATGTATAATGTAATTGTATATGTTATCTAATGTAGCAAA
TACAGAGTCTATGCAGAAATATTTTTCGTG back to top
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