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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1079 | supercontig | LSalAtl2s1079:39162..58579 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000502 >EMLSAP00000000502 ID=EMLSAP00000000502|Name=EMLSAP00000000502|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=336bp
MSRSSSKTSSRPPSAIENNLDYFREPVVKSPPEPTRVKSPELMVRSPDPI NWTVPLDTAKTFSVTQSVRDGESARQSPXXDYSSHFDSVSGTAINLGMMS RNERGAVPIHPPKISSLAKEAREPTPGFTKDSTMTRPSGGSAIPPRPLKE PLVPQLVSNTNGSVHEKKEGEEKTSCEPSRLNGSQKEEEEVKEGPKDQQK ESEQMSHPTSTANQPLSSTGLKCLDDPNFSFESTTNTPSSTETVAIPKPI PPQTKKPAYHVLEDPFESDLLQQAKPAPLPPASSASPYKVLEDPSMSSSI YDPSHSAVKRPIVVAAEVLEGARERFDKFWAKPGDK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1079:39162..58579+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000502-696349 ID=EMLSAT00000000502-696349|Name=EMLSAT00000000502|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19418bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1079:39162..58579+ (Lepeophtheirus salmonis) TGTTAAACAGGTTTATGTAAGATTAGGATAAATGTACCATATATATATAT
ATATACATTTATGTACATATTTTTCATTTATTTTTATATTTGAAGGCGAG
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GATGGGCGATTTATTCCTAGTCCAGGACCAAGTACTCCACCTTCTGACTC
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GAGAAGAATTATTCTGCCGTGTAAAAAATGGAAATTTTTTCCATTTTTAT
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AGAGAGATGAGAGGAAGAAATATTAGCAAGTTAATTTTCATCTCTAAATA
ATGGAGTTTTTAGATGCTTGTTCAATTAATTTTTATACAGCGTGCGTTAG
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ACCCGTTTTCCTTATTTAGTCTGCTTATTTTGGCCGACTCAGAAAGTAGT
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GTGTACTGTGCCCTCAGTGACACTCAACTTCCCTGAAACTTTTTGTATTG
ATCTTGTTGCGCTATCCTCGATGGCGTCCCCTAATTACACTAAATACTCT
TCAGTTCTTACTTTGTTCTGCTCTCTACTCCCCAGCTTTATCTCCAGCCT
TTCTCGTTTTTTTTTTCTTTTTTTGTAACTCGGTACAACTACTTTTCCAC
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TTATTATGCAATATTACAGTTAAATCCTTAGGCAAGGTTTTTCTTGTGCA
TTTAAATTGATATACAAGAAATTGTACCTTTGTAGAATTGTAATTGATTT
CCTCTTGAAATGAAAAATCTTAAAGCTCAAGAATGAATGTAAACTGAAAT
ATATATATATTACTTGGTCCATTATACTAATATATGACTACACTTGAACA
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CAAAACCTTTTTTAATCTAATTGCTAAGATTCCATTATAGATCTTATATT
ACATGTTAAGCATGGTTAAATTCTGAAGGTTCTCTATTGATTTTCGATTT
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GAAAAAATCGTTAGAACTACCTTCCTTGTAAACTTCTTCTAACAATGGAG
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AATGAATTATCATATTTCTTCACCAGCTATTTTTCTTCTAACGACTTCTT
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ATTTCATGCTGTCTCTGCACGTATACATTTCTTGTTAGTATTAAGTAACA
ATTTTGGTCACTTTCCTTAGGTTTGTCTCCATTCTGCCATTGACATCCAG
AAGTTGAGCCTATATTTAATTAAATGCCCTTGAGAATTACAACAAGAAGA
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ATACAATGTGACGGAGATTTTATCCTATTCATGCTTAATTTTTAAAGAAT
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCTTTGATA
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ACAAAGAAATAGTCAAGCCATGAACTCTCACTACATAATCTCCACTTTAA
AAAAAAAGAAATGGTCTGGTATTTTATTCAACTTTTTGGCCTCATCTTCC
AGATTTCTTTTACTTAATACATTTTTAAATTCTTTGTTTGCATTCTTATC
GTTAGTATTAATATCATTTAATGTATCCCTTTCCTGATCTAGAGCCCGAT
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AAAAACATAGAATCAATGAGCCTATTAAATGACAGATCATCCTTATTATG
CCCATAAATTAATAAAATTTTAATATTTCTACCCATCAAATTTATTGATA
GCACAGAGTAGTTACTGCCCACTTACTTGGACCATCTCGTAGGCTTTAAT
TCCCTTTTAATCATTAGAAAAATTCGCCTTGAAGGATTTTTAGCCACTTT
TTTAACTGCAGAGACCAGTAGAACATCATAGCCATCGGGAGAATACAATA
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AGCAATTATTCGTTAGATTTTTGTTGATAATTTAACTTATCTACCGTTTA
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TTTCTAGAATTTGTTAGAATTGTAAAGAATCTCCTTTTCCTCTTCATCCT
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AATCTGATCAAGAATCCTTACATTCATTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAGTT
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TAAAATTTATCCAAAAATAGATTGTCATTAATCTTTTTTTTTTTTTTGGT
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TGTCAGAGTATAACATATCAATATCTTGTATGTTGCACGCTACTTTTGCT
CTCTTATTATTATCACCAGTCTTTTTTTCTTTTTCTTTTCTCTCTTCCGA
TGACACCACATTTTTCATAATTATCATTTCTTACTTTTGAATCTCTGTGA
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TGGTTTCTATAAAAACGTTTGCCTCAAGTTATCTTATAAGATTCTCTAAA
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TTAAAAAAGGAACAGAAAAATAATTTTGTTCATTGATCTTCTTCTTCACC
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TCAACAATTTTTGCTTCTATTTCAAACATTTTTTGTTTTTTGATTTGATC
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GTTTCTGCAATTTGCTGATGCACGGTACAGATTTTTTTAATAAGGGAAAA
CTATTTGAAATTAAGTTTGCAGAGTGCAGAGGTCAAATCAGACCCTTTAT
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GTAGAGGKTAGCCACTAGTATTTCTAGTTCATTACTTTGTCTTATGAATA
GTCTATGTCATCAGTGTAAAGTGTATCATTGCAATGAGAGATTATGTATA
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GTTTGAAAATGAGCATATTACAATGATATCTCCATAAATTGTATCTCTTT
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TAGATCAAAGCTCAAATAATAAATTTCCACATTTGTGGAATAACTTGAGG
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AGTGATGCATCGGTTATTCCTAGTTCTGTTAAATCCATTGGGGATAATTT
GGAGTCGAGAGGAGCTGGAAAGTCACAATCTCCGAGTAGTAGTAAGTGAT
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CCCTCCCTCAACGCCCCTCCCAACAAATAAAATGAGAGGTTATTTCATTT
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TCTGGGGGAAATGTACCCAAAGGCTTAGTTACTTTAATGTTTATTTGAAT
GTCTTTACAGTTGATATCGAAGAAAACGTGCGTAGTTTTGAGATGCATGA
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TTTTATATATGGAACGAATACATTTTCTTACTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTTGACCAACTAAAGGTTATTTTCTATT
AATATAGATTAGTATAAAAGTTATTAAATGAAATATAAAATTTAATTAAA
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ATATCCATACAATATAGACTAACAAAATAAATAGTTTAATTCTTTTATAC
ATTCACTACATAATTGTTTTAATTCAATTCCCTCCTTCATTTATTAACTA
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GAAAATTGAATATATCAACATGTATATACGGATTAATAAATCCCGTTCTA
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CAAATTTGGTAGAAATGAAATACATAACTACTTACATAATACGTCCTTGG
GTATAGTGTTGTTTCAGTCCTTATTTAGGACTGAAGACTGCAGTCCAGTT
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TAAAATTCGGTCCTTGATGACATAACTTAACTTTATTTCTTCTTTTTTTA
ATCAATTCTAGTAGTGACAGTCAGAAGGACTTATATGACCAGTCCTAAGA
CTGGACTGGACCGAATAAAATAAAATCTGACACAAAACTACTTGCGTGTA
TCGTTACTCTTCCAAATATTTACTTTTGTTTTGTTTTATTCTGTTTTTTT
AATCTATCATTTCCTTATTATTTTTATCCCTTGTATAAAACAAAAATACA
TTTATATACATATTTAGGACAAAATGACTTTTACGTCATTATTTTTACAA
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ATTATCCAGTCTTGACCCTTTGATCGTTTTGTCGTACCCTTCTATCAGTA
AGCAGGGTTTTATTTTAATTCATTTTTTTCGTTCAAGCACACATTTTTTT
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ATCACTTTTTTCTAATCCAAAAAGAAAGGAAATAGAAAAAAAATATGCTA
AAAAAAGTTTTCATAATCAAAAGTACTCAATCCCTTTGATATTTTTGTTC
ATCCATTAATACACAAATTGAGTGCTTCTGAAAACATTTAATTATTAAAT
TCTTATTATTCATTTATATACGAACATATTTATGAATTTCATTTTTAAAT
TGATGGATCTTTTTTTTAGCGTTTGTATGCAAAAAAAATAAGAATCAAGC
GTTTACTTTTATTTCCTACTTTTTGGTTTCAAAATTATACTTTTTTTTTT
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ATTGATCTTTAGAAGTACCGCTTTTTATATTCTAGCTACATTAAAAACTA
ATTCGTGTATAGAAAAAAACCCAAGTAGCCTTGATCCTCCTTCAAAAACA
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CTACTCCAAAGGCTACAGAGAAACCTCCTCCGTTGAGAGGAGCCATAATT
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TACAAACCACCAAGTGTAAGTATCATTCCCATCTAGGAAGAAATAAATGA
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TCGTTCATTGATTGCACAATGGGCTGAGCTAGAGTGAAGTTCAGGAGCAA
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GTTGTCGTTGATCACTTACATACATAGGTCATGGCTGGYGCAGATTTTGG
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AATTAGCTTAAATATTTGTGCCCAAGAGCTTTTCATTTCCTGCTAATTTC
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TCGATAGTTACTACTAGAGTCCAATGACTCTTTAAGGAATATATATATAT
ATAGGCAGCGATATGTGGAAATAGTGTTTGTTTACCCAATGAATCACTAT
ACAATATACATATTATCCTCTAAGCAAGTAAGTTGATTGTAAGTACATAT
GGTACATACCTACTTTTGTGGATATGTGTTCCACATAAGTGTGCGTTTTT
AACATTATTTGGTCGTACCTATATACGAGGGTGGTCTGAAAAGTTTACGA
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ATCCTAGTCCCCTTGTTACTCAACAGACTTCTCCCAGTGATGATCCCATC
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TTTTATATATCTTCTATGGTTTGAACCTATTTAAAGTGGCACTTTCAAAA
ATAAATACTCAATGACAGTTCAATACTCGATTTTCTCCATTTTCACAAAA
AGACACAAATCAACTCMCTCAAACCACTATTGCATAACAACTGCCTTTCA
AAATCCCTGAAACTTTTGCGAGTTATAGTCAACAGATGCTAGATAGATGT
TGACTAGCTTTTATTTACAAGTCCTGTCACAATAACGTTGAGGTCGGAAA
CTTTTCAGAACACCCTTGTATCTATGTGCAATATTTATGTATCATCAAAT
ATATTTTCTTACAATGTTTTCTCGAGTTTTGACGTCCAGGACTCATTTAA
CATAGAGGGTATTAGATATAATAAAAATTTTAAAAAAATAATTACAAATA
CAGGGTTCAATTCGTCTTTAATCTGAAGCTTTCAAAGCATAATAAATAGA
TCCTTTTGACATAATTTTCAAACGTAAGTTGTTGCTCCTATTTTGATAAT
TAAATTAAATGTAATAAAAAAAATATGGAAGGAACCTTTCAATTAATTTA
TTTTTAAAATGTTCATATTTACTTTTTGTATTATTTTCAACATGATATCC
CCTATCTAATTCTTTAGAATTATAATAATCAATATAATTCATATAATAAT
TACTGAATTTCGTTTATTAATAGGATTACTTTACTAATTAATTTACCCTA
AACTAGTGGCATGATGTTTATTTTAACACTAGGAAGTATAAGTCCTTCTT
TATTACTTTGAAATAACACATATTTAGGGTAATTACCCCCTATTCCACGA
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TTCAAAAAATTATTAATTTTTCAATTGATTTTCACACTTCTAAAACAAAG
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CATCTGTTTTAAACGTGTTACTGCAATAASCAGCCATATCCTGTTTTCAA
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AAGTTGTTGCTATTTCAGATTTCCTTGCTTGACCACTTAATTCAGGTTTG
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