EMLSAT00000000502, EMLSAT00000000502-696349 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000502
Unique NameEMLSAT00000000502-696349
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1079supercontigLSalAtl2s1079:39162..58579 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000502 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000502EMLSAG00000000502-683268Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002188EMLSAE00000002188-711116Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002189EMLSAE00000002189-711117Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002190EMLSAE00000002190-711118Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002191EMLSAE00000002191-711119Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002192EMLSAE00000002192-711120Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002193EMLSAE00000002193-711121Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002194EMLSAE00000002194-711122Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002195EMLSAE00000002195-711123Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002196EMLSAE00000002196-711124Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770881auto770881Lepeophtheirus salmonispolypeptide
polypeptide-auto770882auto770882Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000502EMLSAP00000000502Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000502

>EMLSAP00000000502 ID=EMLSAP00000000502|Name=EMLSAP00000000502|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=336bp
MSRSSSKTSSRPPSAIENNLDYFREPVVKSPPEPTRVKSPELMVRSPDPI
NWTVPLDTAKTFSVTQSVRDGESARQSPXXDYSSHFDSVSGTAINLGMMS
RNERGAVPIHPPKISSLAKEAREPTPGFTKDSTMTRPSGGSAIPPRPLKE
PLVPQLVSNTNGSVHEKKEGEEKTSCEPSRLNGSQKEEEEVKEGPKDQQK
ESEQMSHPTSTANQPLSSTGLKCLDDPNFSFESTTNTPSSTETVAIPKPI
PPQTKKPAYHVLEDPFESDLLQQAKPAPLPPASSASPYKVLEDPSMSSSI
YDPSHSAVKRPIVVAAEVLEGARERFDKFWAKPGDK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1079:39162..58579+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000502-696349 ID=EMLSAT00000000502-696349|Name=EMLSAT00000000502|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=19418bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1079:39162..58579+ (Lepeophtheirus salmonis)
TGTTAAACAGGTTTATGTAAGATTAGGATAAATGTACCATATATATATAT ATATACATTTATGTACATATTTTTCATTTATTTTTATATTTGAAGGCGAG GATTCTTTTAAAATCAATGGAAACATCAAAAGAAAAATCATCTTCAGACA TTGTTCCCAGAAGAAAGTAATCGACTATTTCAAATTCAAATAACATATAT TAATTCTTAATGTTTTTATCATTATAAAATTTGGCTTAGTCGTGAATACA GATCTGAGTATCGTCAGTGCTTCCGACCATTCTCTCAGTATGAATATTTG GATGGGCGATTTATTCCTAGTCCAGGACCAAGTACTCCACCTTCTGACTC TGAAGTAGATCGTCCTAATTCACGAAAACAATCTAAACAAGCTGCTTTGC ATGGAGAACCCTGGTATCGAGAGGTTGTGGAACTTAGAAAACAGGCTATG GACTATAAGGTGAGAGTTAATCTTTGTACATCTATTTTGTTAAAAGTATT TTTATATATCCATTAAGTGTCGAGGATGGGGTACGGATCCGAACAACAGC AAACGTGCAGAGTTGTATGAGCAAACCTGCAAACGTGAATCATTGTCAGC GTTATCCTTAGCAATTATCACTCCGAGGTAAATCGTTTACTTTTTAAATA TTTTAAGTTTTTTATACAATATACGAAAACAGTTATGCAATTTCTTAATG AAAATATTTTTCATAAATGTAAGCTATTTTATAAATTGATTAATTATTCT TTGAAAGCCGTGTTGCATTTACTTTTAACATTTTAAAAGAATTTTTTTAT AATTTAATACATTTTTGGTAACCATTGATTTTTTATATCAAATAAATTTT TAAATAATATATTCAAAGAGGAACAATTTTTTTCCCCCCACATGAATTAC TTGAAAGATTCATAAAAGTTTCTTCAAAGTTATTTTTATTCATGAAAATC TAAAAATGAATAAAAAATGATATATTTTAAAATAAAAGCTGTTATACTAC AAAAAAAACTTGAAGTTTGAAAAAGCAGAAGCAAGATATTAACCTTAAAA CCTTGTTAGCATAGATTTATTACAACAATAAACCAGTAGTAAAACTACAG CTTTTCACTATAAAAGTGTTTTTAAATGTTGATTTTACAATTTTCTTACA AGTTTTTGAATTTCGATCATTTATTTATGAATCTTAAAAGTATAGTTCTG ATTTGAATATAATTTTATATTAAATAAATTATGTTATGTTTAATTAAAAA CACTGATATCAAAATATAATATAGGATTGATAAATGATATTTATTATAAT TTTAAGATTTAATTAATATTGGTATGAAATAATTGAAAGGTCTTAATAGA TCTTGGATTGATATTTCAACATCGTAAGATAAAAGCTATCCTATCCTATT TTCCACCACTTTTATCAGTAGTGTATCTCTTCTTAATCATTAATACTTTA GTACCTTGAATTTTAGGTAAAGATACTTTTGATGATATATCATGTATACA AGATAATGTTCGGGGAGGATTTAAATGATTATTTTGAATTAGGAGGTGTA GTAAATATGATCACAAAGGAACATTGTTTTCAACATTGGACCTAAATCAA TACTGACAATATTTCGATCCTTTATGTTCACAATCTATGTATGAACATCA GTGAACAATATAAATATCTTAGTTGTCGGCTCCAATAAATGTGGCCACTC ATGTACAAAAACATATAGTGATGGGTTCTTATATATACAATGATAATTTT TAAATTTCGGAAATACGTTTCATCAAAAGACGTTTTTTCATTACTAAAGT GTTTTATACATGCAATAATCTATCAAATATAAGCCATATACCAGATGTGC ACAAAATACAACCTATCAAATATCTATATAAATTTGATTAGGGTGTAAGT TACACAAAACAAAATATATCTATAAGTATATATATATATAAATCCGCCCT TTAATATAAGTAATGCAGTTAGCAAAAATTCCGCTCAATCTACGGATGCC TCTAAGGGTTGTAGATAGCAGTGATAAATGATATTGGTTTTAATTATTAT GTATTGAGGTTATAAAACAATTATTTACCAAAAATATTGATTTTTAGGGT TTTGTTAAAGATAAAACTGTTCAAGTTTCATATTTTCAATTAATTTTTTA ACATGCAAATATTATTAGAAATACTTACGGAAAATTTATAATCTTATGTA AATAACATCTGAGACTAATTTTTTTGTGGGGCTAAAGACTAGTTTCTAAT TTTTTACTATTTTCATCACTATAAATTAAGGAACTTATTTTTATAAAGAG GGACCGGTATTATATTCTACAAAAACACTAGTAAGTAGATGTCAGAAAAC TACCTTCCAAAAGCTCGCAGCACTTTATTTATTTATTTAATGGGATAAGA TACATAATTGCGAATCTACCGGCTCTAATCAAATATTTTTTTATAAGTAC TAATACTAAATGAAAGCTGTATACATTAAAACAAACATAAATTCTTTTTT TTTAAATAAATTAATATAATAAATGGTTAACATTACAATATAAAAAAACT TTCATGTCTGGAGGTATTTTTCATACAAATGGGTTTTGTTCAATTTTGAA ATAATTATATTTATAAAAAAATTATGAATGACAGATGAAAAAATACCATG GTTAACTGTTTTTTTTTCAATAACTAGAGTTTTTCGCAAAATATGTTCTT ACTAATATTCAATAGCAATTATTTTTTGAAAGTTCCTTTAAACCTTGTCC CTTTTTAAAAGTTAACAAGGTCACTTTACAAAAAAATCTTCATAGTTTTC TTCTCAATTTTTTTTTAACATAACACCTTCGTAGAATCTCAAATGCAACA ATTTATTTTTGACAAACTGGACGCCCGACCTTTGTCGCATTAATTTGTAC TACATTGATTTCAAATATTATTTTATCACATTATTTAAAATATTGAAATG TTTGTTGTGAAAAATGATTTTTTTTTTTAATAATTTGAGAGGATATAAAT CTGTGTAATCACATTGAGTGAAACATATGTATATGTGTGTATAATATACA CTGTATATACATATGCTAAAAAGATTAATAAGTCCTTAATATATGCAAAT TTAATTTATTATGTTATGACAGATGGCAAAAATAAATTTAGCAGTATTAA AAAATACTTTTCACATTAAAAATATATGTGTACATTTATATATATAAAAT AACTTTAAAATTCCTATTATTGGATTATGTTTCCCTCAATATATATATAC ATAGGGCGTTCGACATTAATTTATGGCATTTTTTTCTTTAATAATTTATA TGATTATTCTGGATATTATGTGAAAAAAGGCGTAGAATCAATTTGAATCA GAAAAAATTACATAAAATATAAATAAATCATGTAATTTTATAGATATTTC CGTAGTGTCAGTTTTTACTTTCTGAAAAGAAAAAAATGGAATATTAAAAT TTGTTAATCAATATGCATTTTTATTTTTGATGGGCTATTTCAAATCTAAA CATATTTTGGATAAATGACAATGCGCAATCAAAGTAATTCTATTAAAAAT ATTCGAAATAGTTTTTTTAGATTAAATTAAATAATTAAATATGCAATTAG TGGTATTTATTGTCTTTTATATTTATATCGTAGAAAGAAATCCATTTTAA GCAAAAATCAATTATCAAGTTATAAAAATATAAATTTTTGTTTATTTTAG CATTCAAATTGTACTTTCTATCATATATCTGCAAATTAATGGGAGATAAT CATCTTATTAGTCTTTTTGTTCAAAATATTCCCTTTCTAAAAAAGTAAGG 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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTAGTT CATAAAATTGAGTTTAAGATCATCAAATATTTTATTTTATTTTTTAGGGC GGGTCATAAATCCTCTAACTGTATTTCCTTTAGAATMCCTCCCATCCAAA TAAAATTTATCCAAAAATAGATTGTCATTAATCTTTTTTTTTTTTTTGGT TTYTYTTCCCTCTTTTATTGTTTCGAATAGTTTTTCACTACTTCTGGTCA TGTCAGAGTATAACATATCAATATCTTGTATGTTGCACGCTACTTTTGCT CTCTTATTATTATCACCAGTCTTTTTTTCTTTTTCTTTTCTCTCTTCCGA TGACACCACATTTTTCATAATTATCATTTCTTACTTTTGAATCTCTGTGA TTAGTGGGCTCTGAATGGCTTTCTGAGAAATTATTGAGATGACATTTCCT TGGTTTCTATAAAAACGTTTGCCTCAAGTTATCTTATAAGATTCTCTAAA AAATAACTTTAAACGCTTAGCACTTAGTCACACGTCAGCCAACCCTTTCA TTAAAAAAGGAACAGAAAAATAATTTTGTTCATTGATCTTCTTCTTCACC TCGTAATCAAGTACATTCCAGAAGGAATAATCTCACATATTCAGAGCAAG TCAACAATTTTTGCTTCTATTTCAAACATTTTTTGTTTTTTGATTTGATC AACTAAAATATCATTTGAATGCTGCAATTCTGAACTTTAACCCTCTTTTC TACAAAAAGCTAAAAATGTACTTTTTTTAATAGAAAAATGCTTTAAAGAT GTTTCTGCAATTTGCTGATGCACGGTACAGATTTTTTTAATAAGGGAAAA CTATTTGAAATTAAGTTTGCAGAGTGCAGAGGTCAAATCAGACCCTTTAT TAGTGGAGTTGGAGTTAGAGTCTGGAGTCGAAAAATTTGTACTGGTTCCG 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CGGACTTTTTATTATTATTATATACATTGTATTAATTACTTATAAAAAAC TCTTTCATGTAGCACAACAGCTTGCTATTTATAATTTCCATGTATTTTTG ACCCATCTATCATATTTCAATGCTGATATTCAGCATATTAATGCGCAAAA CTAATTTTTGATATGCATATACGAGTATATAACATATACTTATGAATATA TTAACCTTTGAAGTGCTCTCTGCCTCCTTAAGAGTTCTATATTTTTGTGG CATGAAGTATTTGAAATTTACTAATTTATTATATTGTATATTCATTCCTA TTTTAATTCAAGTAATACTTGTAGTAACTAGATGCACAAATGAGTTACAA AATGATAATAGACCAATATGAGTACATAAGTGCAGGTTTTAAAAGGATAA AGTTTCATAGTATGTTTAGCTTCTGATTGGAATTGTTATGGCAATATTTA TTTCAATGCGCCAAACGCATTGCAGTAACCTTAATGGGTACAATGTTTTA CTTAAATATACATAATTTGTGCTTTGTTTTTAAGGATATATAGATGACAG TGATGTTACTTATACTCATAATATGATACCTATAAACATGATATCATAAG ACCTTGCCCTAGTTTTAAAATGTAACCCTATTTTCAAACATTACAGAGCA ACGGAACCTTTGAAGAAAGAAACCCCAAAGTCTGCCACAAGTGGATCATC AGGCTCACCCACTAAGCATGGACGTCTCTCACGTCCTCGAACAGCTCCCT CAACAAGAGGATCAGCTAAATCAAGCCGAAGTGAGTCTGCTCACCCAGCA AGTGATGCATCGGTTATTCCTAGTTCTGTTAAATCCATTGGGGATAATTT GGAGTCGAGAGGAGCTGGAAAGTCACAATCTCCGAGTAGTAGTAAGTGAT TTGATGTTGTCATAGCCTTTACTTGTTCTATTCATGATATTTAAGTATTA 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