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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1079 | supercontig | LSalAtl2s1079:93076..102853 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000505 >EMLSAP00000000505 ID=EMLSAP00000000505|Name=EMLSAP00000000505|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=454bp
MKLSHTILICLTIFFRLSVSQQKSPNEKYWDSFDVMKICNSGVKQSPINL
EDRSTVKGKGSPITFMNYDVAHNFSMKNTGKTAKLSLKDGSTNVPTITSS
HLSNDTYKFAQLHFHWGDMDKYGSEHIIDGFQYPIEAHLVHFNTKYGATI
EEALSVANKSDNLAVLGVFFDIIPCTITDLDPLISKLKDIQSEGTKVDVK
GLALEKLLPTDLNTFFSYEGSLTTPRCNEVVAWTVFKKKQMISEEQLGEF
RKLIGEGEPLVNNYRDIQKIKSVRNMQFRNEAITNQSSGELNRSGKSHEM
NEGKNIPTYAYFINQKPGRPITFKNYEVAHSFSMKNTGKTAKLTLKNCSI
NVPTITSSHLSNDTNKFAQLHFHWGDMDKYGSEHIIDGFQYPIEAHLVHF
NTKYGATIEEALSVANKSDNLAVLGVFFDIIPCTITDLDPLIYKLKNIQS
EGTK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1079:93076..102853- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000505-696352 ID=EMLSAT00000000505-696352|Name=EMLSAT00000000505|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=9778bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1079:93076..102853- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAAGCTGTCACATACTATTCTAATTTGCCTGACAATCTTTTTTAGACT
GTCAGTTTCTCAACAAAAGTCTCCGAATGAAAAATATTGGGACTCCTTTG
GTAAGATAAGATTGGTTTATTCATTTAATTTTAATATTCTAACCCAAATA
AAAATAATTTGAGCCGTAATACTCTCATGCAAAAATAATAATCTATAATA
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CAATAATTTTACTTTACAAAAGATTGGGAGGCTTTCCTTAAATAAATAAA
TTTGACATTAAAAATCAATTATTTCGACTAAAACTTAAGTTTTAACGTTT
TTTGACATACATTAAATATTATACATTTAGTATATATTATTGTAGTAATA
AAGACTTTTATTTAAAAATTAGATGTTATGAAAATATGTAATTCCGGAGT
TAAACAATCACCAATTAATCTAGAGGATAGATCAACCGTTAAAGTAAGAT
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GGAAGTCCAATTACATTTATGAACTATGATGTTGCACATAATTTTTCTAT
GAAAAACACTGGAAAAACAGCAAAACTTTCTCTCAAAGATGGTTCGACAA
ATGTACCGACAATAACAAGTTCTCATCTCTCAAACGATACTTATAAATTT
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CATAATAGACGGATTCCAATATCCTATTGAAGCACATTTGGTTCACTTTA
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TATAACTGATTTAGATCCATTAATCTCTAAGCTTAAAGATATACAATCTG
AAGGAACTAAAGTAGATGTCAAGGGTTTAGCTTTGGAAAAGTTATTACCT
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GTGAAGGGGAACCACTTGTTAATAACTATCGTGACATTCAAAAGTTAAAT
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AAATGTATGAAGGAGTCAAAATACATCTGTTAAAAGTCATAATTATAATA
CATTTTTGTCGGAATATATTAGCTCAGTAATTTTTTAATTATTCAAAAAC
ATGTACATTTTAAGTATATGTATTAAGGTTAAATCATAGTTTTTAAAATA
TTGTTCATTGTCTGTTTCTTCTCCTAAAAATTTATAATTTAAATTGTTGA
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TGTTTACGCGAGGTAACGACGTGACATATGACTTACTCACTAGAAACTTG
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AAAGTTACATAGTCCCTCCTAGAGCAGTGGCTCGTMACCAGTAGGAAATT
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CGTATATAAAAANNNTCAGAGGAAATACAATTTTTCTCTAAATTGAAAAA
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AAGTCGAGTTTCTGAGACATTGTATGAGAGACTTATATGAAAAGCAAATA
ATTTTTTATCTATATTGACCCCCCTCAAGAGAATATTAATTTTATCATAT
CAAAAATAGCGGGCATGCTTTAATTATTTAGAAGTACGACAACTCCCTAA
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TGCAGTTTCATGTTTAAAAAATATATAATATTGAAGTGTAAGAAGGAAGT
TTCATATTGTATAATTAAGGAAAGTTAAAGTAGAATGAAGTGGTACCTAG
TTACAAAAAAAAAAAGTATAAAAATATCTCATTTTAAAACTGAAAGCCTG
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TCAAAGTACTAACAACGGCATATTCCCTATGTAAAGTTTCAAAATACTGA
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ACCATTACACTCCTTAGATGAGTCATGGATATATTAATGAAATATTTAAT
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TTTTTAAGCTCACCGATAAAATTACGTAGTAAAATGCTGCCATTTCATAA
ATTGATAGAACTTTAATGCATAAATTACTCAAGATTTTCTACAGAATCAT
CGTATACTTATATGATAACTCATGAGTTCCATAAGAATAAAGAATAATCA
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TCCTTAATATAAATTCTCAAGTCAACTCTGCTTTGTCTCCTTTTCTAAAA
AACTATTTAATAAAAATAGAGTCTTTAGTTTTCCTTGATGAACATAACTC
ATATCAATTCCATTCCAAAGGTGAAATTTATGATGTACGGCTTATCTGGA
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TCATTACTTTTGTCATTGAAGAAAAAGTGGAAGATAATAATGTGTATATA
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TGAGTTATAAATCAAAAAGTTACTGGCGTCTTAAAAAGCAAATATACGAA
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AAGAAATCATGGAAATTGCAGTTTCGTTTTTTCCAGGTACAAAAAAATGA
ATTTTCAATGAAATATTGGATTCCTACATAAAGTGAAGTTTTTAAAAAAT
TGTCTGAAAATTCGTTTGCACATAAATAAAACACATAAAAATTGAGGTTT
AACAGAAATATCTGTCATTGTATGAATAATTTTTTAGATTTTTCTATCAA
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ATGAGCTTTAGAAGTTGTTTTATTTTAACAATAGTTAAATGTAACAGTAA
AATGATTTTTTTTATTCATTCCTTCGACTATTATTTTGAACATGCAAAGG
CTTTTTCAGTTAAAAGTTAAAACGTAATTAATAGTAGTCTACCGTATTAA
TAAAGTGAGTTATAATTTATTTCATATTCTTCAGAGCTTTTGCAAAAAAA
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AAATAAATATATATATATATTATGTCGTTACCAATGTTGTCTCATTCAAT
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CTGATAATTCTAATACATCCCATGAACGTTCAGAGCTCTGATTAAGAGAA
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ACAGATTGAGAAAGAAAAAAATGAAGAGCCAAGGAGTACTTTAGCTCAGA
ACCTCATCTAAAGTTCCATTCATTATCTCAAATTTTATATGAAGTACTTT
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CCTGCGATATTTCATTCATATTTTACAGTATTTTGTATATTATACTCCCT
TTTTTCCTTATATACTCGATGGTGATGAGAAAAGAAGAAAAAAAAAAAAC
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TTTGGTGTTATGAAATAGTTTTAAATTGGTACATTTTGTCTAAATCAAGT
AATTGAAACCTTATTTATCTATATATATATATATTGTATTGATTCATTCA
CTTAATAAAAAACATTAAGATGTATATTTATGTTGGTTAGTATTCATGAT
AAATAACAAAATAATAATATATGATTGAATATTTAATCTAATTTAAATTT
AAGTAATTTAATTATGACACCTATAAAGAACAATCATTGTAATATACTGT
AAACAAACATTTTGAGGAATAAATATAGAAACTATTAAAATTTTGTACAA
ATATGTATAATGCATATTCAATAATATAAATATATATTTTTAATTATGTA
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CTTTTATAATGCATAGTTAGAAAAAAATATCCTTCTTAGTTTGAGTTATG
TGAGATGGTAAAAAAATACTTTTTACAATCTTAGATAAATAAATTATAAG
ATCATATTACTTATTATAATATATTTTTATCAAAGAAATATCATTTTTTG
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TACTTGACCTTTTCTCTTTAAAATGTTTCTTAAATTTCAACTAACATGTT
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TGTCATAAATATATTTTTTTCTTGAAAATAGAGGAAACAGCTACTTGTTT
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AAAAATGATGCTATAAGTCATAGGTAATAAATATCAAAATGGAATATTCA
AATAGGTTTTTTTTCTTTCTAGGAGTCTTGGTTCTTTGTGCCTCAAGAGA
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ACATAAGTGACTCCTATCAATTCCATTTCTGAGGTGGAATTCGTGATTTA
CTTTATATAAGTTATTATATAACTTGTGCACTTCTTGCTTATTCCTGATT
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TTATAATATTTTCGATATTTTTATTTGCAAAGCATATTTCATTTTATTAT
TACTTAAAAATAGTTATAAAGGACTGTGAAGAAGGATCTCTTGGTTAAAC
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TGTCATCATAATATTCTTGTAAATATCTAAGATATCCTGACAAATAAATT
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TTATAAACCAGAAACCTGGACGTCCCATTACATTTAAAAACTATGAAGTT
GCACACAGTTTCTCTATGAAAAATACTGGCAAAACAGCAAAACTTACTCT
TAAAAATTGCTCTATAAATGTACCGACAATAACAAGTTCTCATCTCTCAA
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ACATTTGGTTCACTTTAACACAAAATATGGGGCCACAATTGAAGAAGCTT
TGAGTGTAGCAAACAAATCCGATAATTTAGCTGTTCTTGGAGTATTTTTT
GACATTATTCCCTGTACTATAACTGATTTAGATCCATTAATTTATAAGCT
TAAAAATATCCAATCTGAAGGAACTAAA back to top
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