EMLSAT00000000541, EMLSAT00000000541-696388 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000541
Unique NameEMLSAT00000000541-696388
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1088supercontigLSalAtl2s1088:79520..96507 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000541 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000541EMLSAG00000000541-683307Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002336EMLSAE00000002336-711264Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002337EMLSAE00000002337-711265Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002338EMLSAE00000002338-711266Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002339EMLSAE00000002339-711267Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002340EMLSAE00000002340-711268Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771582auto771582Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000541EMLSAP00000000541Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000541

>EMLSAP00000000541 ID=EMLSAP00000000541|Name=EMLSAP00000000541|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=535bp
MVINNCPXGEEEGPPSWNTTTMYEEGTQLQSXAAAAAVALGGSVEAYFRT
HHNYXSPSSLLSASSLGGGLENTTSDCKYNTPSTNSLRAFGGSQNNQISE
SSSRVVNNSNEERRCSSTESLFYSPIWTTKCXPXSSNLSTPGGLCQSVYS
TSSTSSIDLKSNPPECLLGATNNFGTLSPDTFSPHDVLTSPSSGGGNTSP
YSSSSTFRRIPQEGNQFSNPSIGPFITPLNTNNQIEYSNYPYESSSSPGE
SCIPIESFDGFCASFLSSPQSNSTIIINNDNNTHMTNTSTLDGLLFIKSP
LHTSVVNNSHSNGNLLSPTTSNNSPGRTRVTKSKVTTEGRECVNCGATAT
PLWRRDRNGHYLCNACGLYYKMNGQNRPLIKPKKRLSSTKREGTICANCK
TTTTTLWRRNPNGEPVCNACGLYYKLHNKDGIQTRNRKLSTKTKVKKRNP
SGMSELFLNPFENRNFYPLPSMSRSSSGLYSSSHPSVPSYYGSSSPSSSN
FLSGSASSFLGATGGVDLPSTSPSMSSATISTLLS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1088:79520..96507-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000541-696388 ID=EMLSAT00000000541-696388|Name=EMLSAT00000000541|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16988bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1088:79520..96507- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGTGATTAACAACTGCCCAGAMGGTGAAGAAGAAGGTCCTCCCTCTTG GAATACGACGACAATGTATGAAGAAGGAACTCAACTACAAAGTKCAGCTG CAGCAGCAGCTGTTGCCCTTGGGGGCTCTGTGGAGGCCTATTTTCGAACT CACCATAATTATARATCTCCTTCTTCATTACTCAGTGCGTCCTCTCTGGG AGGAGGACTCGAGAATACAACTTCGGATTGCAAATATAATACACCTTCTA CAAATAGCCTTCGAGCCTTTGGTGGCTCTCAGAATAATCAAATATCAGGT AATGATTTTCACACTTTTTAACCTTATTTGTGGGGATTTGAAGGTNAGCC TTCGAGCCTTTGGTGGCTCTCAGAATAATCAAATATCAGGTAATGATTTT CACACTTTTTAACCTTATTTGTGGGGATTTGAAMGTAGAGTAGAATGTCA AACTTCATCTTGATATGCGAAAAATATATTGCTAATGACATGTTTATTAT TCAAATGATTATTTTTAGTTCATTTGAAGGTCGTTGTTACTCATTAATAT TCAGCTTCTTTAAGACATTGGATCTCCTCCCTATTTGACTGAATGACCAT TATTTCATTGCGCAATGTTATAGAGGAGAGGAAAAAATCAGTATTCAAAT TGGGATTGGCACGTAATTAGTTGGAGCCTTTGATTGTTTGTTTCATACTT TGCGATGGACAGGATTATTTTTTCAATGAATTAGGTGTTGTTGACATACC TACTTATCTGCTGCTTATAACTTGTTTTTAATTAATGACTTTTTNGAAAA AAAAAAAAAAGAACTGGAAATTTGATAGCAAAATCTACTTAAAATAGACT TTGTCTATTCCTTCCTCTTAACCAAAGGCCTATTTCCTATTTCTTTTGTA ATTAAAGACGAGGACTCATCAACTCTTTTTATTTATGAGGTGAATGAAAC CGGTTTGTCTCTTCTTCTTCTCTCTCCCTAAAGGATCCGAATCATACTTA TTACAAAATGAAATTCTCATTAAACTCCTTGTATGCAGTCTAATTTGATT CTGTACCTTCTATGATGTACTATGTAAAAATACTTCCAGCACATACCTTG ACAACAACAAAGACCAATCTGAAAAAGCAATGCAATTTATTGATTGACAT CTACCTATCATTTACCTGAGTGCTATATATATATACGTATGTCCCTTATC AGAAGAGTAGTTGACTCAATAAAAGTCTATATAAACTACATACTGGGTGG TCCATTGATATCTGAACGCTTACTAATTCAATAATTAATTAAGGGAGAGG GATTGAAATTAATTCATATTTCGATATATAAAGGTAGGAACAATTTATTA CAAAACCAAACAAACCTGAACTCTCTGGCTTACGTACAAATCGAGAAAAT GGCGCTTGGACGTGATTGGCGTATTTACATTCGCAGACTCCAAGCACTTG GGCGTCTACAGGACCCCCATCTACGCCGTCAGCAAGTCCGAAACTATAGA GAGGAAGAAGGGATCTGTCAAAAACYCCAAAGTGGATCCGGGCGAGTTAA AGAAAACAGCCCAGGCCAATCCCCTCATGTCCCTGTTTCTCATGTATCAT ACCAGACTGTGAAAAGAGCTATCAAAAAGTGAGTGGGGAGAGCCTTTTGA GAGTGGAGAGACCACTTTTGAGACCCACGATGAAACACACGCATCTGCTT CCTTGCAAGAATCTTTTGAGAGTTTTTGGACCTATTTTTTGTACACTTTT ACCCCTCCATAAATGATATTTTCTTGAAGTTTAAAATTCAAAGTCTTTAG ATTTTAATGTACCACTCGGTATATAATATCCAAGGCAGCGATTCAAAATC TAGTTTTGTGTGTGTCTCTCTCTACATACACTCATAGATAATTTGCATTA GCACCATTGAGAAAAACCTTGATTCCTTCCTACAAACTTCAATCCTGATT GAAATGCAAATGTCGTCTAATCTGAAGTAGAAATGTCCTTTTAAAATTCG TTATTCCAATGTGTAGAAAATATTTATCTATACATGATTTTTAAAGACCT ATGACGTATGCCGGCAATACAATTACAGAGATAATATTATTATACGATAT AATGAAATTACGCAGAGAGGGGATCAAAATGAAGGAGTTGTTGTACATAT AAAAAAATAACAATTTAAATTTGTTAAAAGGTATTTTTTTTTTTAATTAT TAGAAAAAAAACCCTGAGATAGACATCAGCATTTTCTTCTTTATTCTTCT TGGAAGATTCGGATCTTCTTCTGAAGGGATTTTTATGTATGTATAAATGT TGTGTACAAGTTACGATTTCTGTACAAGCTGTAACTTGTATAAGCAGATT GTACAAGTTGCAATTTCTATGTTTGAGACTTCCTAATTGAACTCCATTGC CAGTTTCTTAATTTCCAATTATTAATTAAGGTTGTCATGTCATTTTGGTC TATAAAAATTTCGTACAATTAGTTATTATGTAATACATCTGCGGACAATT GAACTTTATAACGTGCCCCACATTACTTATATAAATAATTATCAAAAATT TATCAAGTCTTCACTCACAAACCCGTCCTTAAATATTTTCATGAAGTCCA GATTGAGTCCTCAAATATATTTTTAGTTCATTTCAAGTCCATAATTATNG CAGTGATGTCCAAAGTGTTAAAGTAATATGTAAACTAGTTTTCGAGTTAA ATGGAGTTGCAAGTCTTTGATTGTGAGATGAAGACAAGTTGCAAGTCTGG AGTCCAAGTTCTACCTCTATCATTTTAGTAATTTCAATAACAATAGTCAG GTATTAAATCATTAATAGGTATTTCAATAGAATATTCAATTAAAACAGTA TTCTGATCAAAAGTCCTACTCCAAATTATTCATCTCATTTTTTGTACAAT TTGCTTTACAAATTGCAACTCATTTCACACAACCTATATCGATATATATA GGATCAGATAAATTAATTATACATCTATTTTTTTATTCTTGTATAATTCC TTCATAGTGATTAGAGAGAGACTTATTTATGAAGTATCTGATCAAATGAT GTCATTAAATTATATCAAAAATGCCATTAATTATAGACACTTATATCTGG TATGGCAATCAAGTGTATTTACTTTAAATTAATACATAAATTATTCGCGA AATACACTAAAGAATCGTCATTTAATTCATTTAAAAAGAGAGGCAAATAA TTAATTAAGAAAAAAGTGTTTTATAATGAATGAAAACATTTAAAAATCTA TCAAGATTCCCCGCATAAATATGTTATTTACAAAGAGGGCGCTTTAAAAA GTTAAAGTATAGTTATTTTTTTTACTCAACTTAAAATATTACAAATTAGA TTTATTTTTTTAATGAAATAAAATTGTGAAATTAATTTGATTGAAATCAC ATCCTTTACTATTGAAAATTAAAGTGGATAAGTAATTACTCATTACTTCT GATTGACGGAATATGCACTAATATCAATGAAATTTTCAATACATAAATAT TATTTTATATCTTAAGGCTTAAAGAAATTCAATTGAAGATTGACGGAGTT GTATTATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAAAGAC ACAAAGTTATATTATGCAATAAAGCGTTTTCACTTAAATCATAATTGAAA GAAACTCCATCTTGAGGGTTCAAAGTTGATATTTTTACTACATAAATGTA CAAATTTCTATATATCTTAATTASACTCCGTTAAATAGCTTTAAGAATAA ATAAAAACTAAATACCGGGTATCTTTATCAAGTTTGCCCGCACGTAATAG 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GTCCCATTAGGACATGCAACAATCATTCACTATTTTACAAAATATTTTAT GGAAAAAAAAAATGGATTTTATTGATTTAAAACTCGGTTGTTTTGGCCCT CAAAAAGGCCTACATCACCAATGCGTACGTCCTCTCATTTATTATNAAAC ATATAATAAAACTACAACGGTGCATTCAACATTAATAGAGATGAGAAAAA AGTCGAGGATTGCTCTCCAAAAAGTGACGATCGGTTTTATGTGATATCCT TTACAATCTATATTGGAGATACATATGTACATATTGTGACTATGAATAAT TAATTACGGATCTCTAATGAAACATTTTTAATTCCAAGTAACAGACAGAA CATATCTCTAATTGGGCAACAATGACAACAATACTATGACATCACTCGAC TTAAATTATTTCCTTCATTATATAGATTATTCATACGAAAAAATGCATTT AAAATATTTCATGTAGTTGTGATAAAGGAATTTAAAAATAAATAAAATAG GTCCTTACTTAATTGAATGCAACGACATTTATACTTATATATAGGAATGG CGGKTATCATTATTTTTTWTCAGGRTTTAATGGCCTCATTCCCCCCCCCC CTTCTATCTTCTCAGCTCTTATTTTGCAACCACCTACGAAATAAGGTAAC TTGCCAAAAGAGTGAATGTTTTAAGACACTAATGGGTAGATTGAGTTGGA CTATAATATGTACAAATAAAAATTAATGAAACTTTTTATTTAATTCGGGA AAGAGAAGTCACGTTATATTAAATATCAACAAATACCAAACTACTTTTTG ACTCTATTTGACAGATTAATTTTTGAAATTTAATTCTCCCGTAGGATTTT TTTTTTCTTGGACTTGATATAGTGAAACTAGTGAAATTGAGACTCGGTGA GAGRGCGAATTTCTATTCCGTTTCGGCCCAAAAGTGATTTTTTTTTCGAA 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GACCGATCTAGACCAAATTGTTTCCTTTGAACCAGTTTAGAACTAACTTT TCTATTCCACCGATCTAGAACTGTATTTTTCTATGAGACCAGTGTAGACC AACCTGATTTTTAGGACAGAATTAGTTCAGTCCTAAAAAATCATAACGGT ATCAGACCAGTCCAGGATTCCCATACTGAAACCCAACCCTTGTAAATTCC ATTTACTCATATAATAGGGTCAACTGAAATATAAGACTGAATGTGTATGT ATAAAAAAAAACTTTACCAATGCTCAGAAATTCTTATTTTGGTAACGTAT CTGTTTAGACATATGTAGAACATTCTCGAAGCATTACCTTTTATTTGATA GTATTATGATAATCAAACAGTAATTGAGTATTTATTCTNNNNNTTTTTTA TACTAAAAAAATGCCATTGGACCAGATCAAGACCAAATTTTAAAACGAAA TCGGTCCGTACCTAAGTTGGACCACATTAGCTAAAATTTTATCGGCCTTA GAAGTACTGGTTTAGGATTTCCAGAGCGAGCCCTAATAATCATGTTCTTT TTGAAACCATAATATTATTTTCTTATTATGTTCTTGATTCACTGAATTGA TAATTCTGATTTTTTACTCAAAAGGAGAAAGAGAGAGAGAGAGCTGATAA GGAGTTAATTGGGAAAATATGAAAAATAAAACTGCTAAACAACACCTTTC TTATTCGGCAAAAAAAAACAACTTAAAACTTTTTTGTAAAGATATTCATC AAAACCTTTTAAGAGTCCATTATTAATCCTCCATCAAATCATCATTCTTA TCGCGGATCTTTTAAATACAAAAGTAAGGTGTTTATTGACAGACAGACTC TTATACATGAACAGGTGTATGTATCTTCCTATTTATGAATGTTAGAAACT GCTTTCTTGATGGTTCCATAACCTTGCTTCCATTCTTAACATGTGTGCTG GAGAATTATTTTAACTATTATTGTTAATTTTTACATCCTAAATTAGTGAA GACACAAGATCTAGAATTTAGTAGAACAAAAATTTCTATATTTTAAGCTA ATTACTTATGTATTAATTTTCTATACGTCTTAGAAAGGTAATCAATACGG AGAATTGCTTTATTTACTTAGATGAATGACTCTTTAATAATAACTTTATT TCATTTTTAGATCAAATAAAACTATCGAGATAAGAGGCATTAAATTAACT AGTTAAAAAAATCCATTGTAAACCTGAAACATTTTATATTAGAAACAATA CATACATATTACAGATCATCAATTTTTACTCCAAAAATCTTTATTGTAAT ACTTAATTTTAACAAATGTGTGGTCAGATAATACAAAAACAGTCATGAAC TAAAATTTAGAAAATGAAAATATTTTTCAAACCCATCTATGCTATGTAAA CAACCCAATATTTCATAGACATGTTTCTGTCAATTATAGATTTCATAAAC ATATTTCTGGGATTAGTTGAGGTACATCAAAATATTAAATATATGTAGCT TGAACCCTCCTTTTGATTGATAAGCCTTAATTTGGCCTCGATACAGTCTT TCAAATTTAATATTTAATCAATTGATTATTCTTTATTTTTGAGAATGAAT TTTTGGTATTTTAAACATAATCTGCGGCGTCTTCCTAAGATTTTTAACCA GACTAATTTGTTTATAAAAATGTATGATAATTCATCAAACAATAGATATG ACCACTATCCATACTCAATCTTGAAAAAAATCCTTCTATATTACTTTTTT GTTGACGCGTCGCAAATGCTCATCGGATATAAATAATTAAATTTAACAAT ACTATTCAAAACTCCCCGTAAAAAATACAATATATTTAACGTTTGATTTT GTCATGAAAAAAAAGTGTTGTGCCAAAAAGGATATATATTTAATATGAGA TATAAAATAAGGCACAAGTTGACCTGAATTTTCAACGTACATTTAAAATT GTCGTTAGCGTTGTTTGCTGTTCATTTTATGCCTTATAAATCCTCCTATT TATTAAGTAAATTCTTAGTCTACTTTTTATTTTTCAAATGTTTTTAAGTC TACTTAAGTAATCAAATACATATTGCTACATAACATCGTGTTTGAAATTT AAGGTCTTTTATTTATTTTTTTATATTAAACTACGGCTTAAAATTAGTCA AGAATAGTTATAATCTGTGTATTTATATAGATTGAGATAATTTACATTTA TTTTCGTTCTAGAATATCTTGATTATTTCTCTATCGTTGCTACAAATTCC ATTACAAGCATCTTTGAAACTCAATTCCCGAGAATTATCCATGCAAAATC TTTCTAAATATCAGACATGTAAAAAACATAAATAACTAAAATGTGAATTA TATTAACTGAAGCGATCCCAAATAACTGCTTAAATCCAAAAAATATGTAA AAACAGTTTAGGCAAAACTTTTAGTTGCTTTGTGAGGTATCGAAAGTTTT AACTCGATTGTAAATACTCATAATTATAAATATAGATAAATCCGTGCGCA GAAAACTGCCTTGGAGAAAATTGCACGTGGAAGATTGCTCTGTAGAAAAT TGCCATGAAAAATATTACCCGGGATAAAATTGCCCATATTTTGATCAAAC TTTATGATGAATTATAACACATTATAAATTCGCTTAATATTATTTATGGC AAATATCTAAACATATTTGTTGATTCTATCCCCAAAGATAGTACCTTCAA GTTTGAGTAATATTATTGCAATATAATTTCCTTCCTTGCATTTTTAAAAA TCCAATCCAATCTTTTAGAAATTAATTGAGAGGATGGGGTAGGGGGGGGG GGGGGAATAAATAGCTTAGGACCTCTTAAAGTATAGTTGAATACCCTATG CCCTCCGATTGGCTCGGGAGMAGTGTTGAATTGCTAAAAACCACCCCCAA TTTTTTCCAATAKATTCAAAGAACCCCTTTAATACCAAAAAGTAGTTCCC AGCCCTCGGATTCAACCATATTTTAATGTGTTATTATTCATCATGAAGTT TAAAAAAAGTACGGGCAATATTCCTAACTGGCAATTTTCTTCCATGTCAA TTTTCTCCAGTGCAGTTTTCCATGTACAACATAAACTCATGTTCCCTATT TTATATTCCCAATAATTTATAAATTTACGTTCCCAGATTAAGGAATTTAT CTATGTATAGTTTATGAGGAAATTATCCATTGATTGCCATCTGTAAAAAA ATAAAATAATAGACGAATGGAAGTATGAATCTGGGGTTTTATACATATTT TTTAATAGAAGCAATCTGATCGATAGTGATCTCAGCTCACTAATTTTAAA ATTTTATTGAAAAATATTATTATTACTAAAAATATTACGGTACATTTTGT TAATGTATCCCATAGAAGATTGAAAAATTAAGTTGGAGAAGTATGTAGGT TTCTTATAAAAACAATCCAAAAATACAGATATATTTTTTAAGGGTTAAGT AGAACTGATTAAAAAGGGTATTATTTCATTTCCGATGCTAATGTAGGAAA TTCCCTTAAATCATCTTTTCTAAAAGTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN CTAGGATTTAAGGACAATAAAAATTGATCACCAGCTTAATTACAATGTGT CGTAGTAAAGAAAATCTGGTTTAAAGTAAATAAAGATCCGCGATAATTGC AAGACAATTTTTTTGGTCCAATTACTCTTATCTAGTTTTACTAAGGCCCG CCAAAAATTACCACAATAACATAACAAACWTATGTCAGTTATTGTTGGAA TGCATTTAAAGATTATACAAACAAGTAGTTTTTAAACTAATTACGTTTGA 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AAATTATGTTATACATACGATTGTATGTAAATTTTGTTTCAGTAGCTTTT TGATGTTAAAAAAAAGTTTATCGCAACCGTCCCTTGTTGCCACTCCCACT GGTCTCCAAACCAAAATTGATGCATCCCTTATTCATAAATAGATTCAAAA GACCAAAATCAATGGCGTTACTAGCCCCTTGAGTATTTTTTTCATGTTTC CACTTATGTAATCTAAAACAGTCGAACAGATCAGTATGAAACTTAGCAAA TAGACGTATAAAACAACCAAGCATGTTCTTATAATATTTTTTTGGGGCAC CAAGGTCATTAAGAGTCTATTTTTGACCAAAATAAAACCCTCCTTTTTGT TTATCTTTTTCTATATCTATCTCCTTCTCTCTGTCRCCCCCCCCCCTCTC TTCTCTTCTCCCTCTGTCTCTTTCTACATCCCTCTTTCTGTCTCATTTCT TCTACCTTCATTCTTTGTTTCTATACCCCTCTACTCAGACCTGCAACTAT ATATAAATAAAATAAACCTATTTATGTAAGTAATTATATTATAAGAGTGT TGATAATTTTGGGGCTAAGCTCCCCAAATGATGAAAGCTACAAAATAATC TCCAATATTTTGGGACAGTATATATAATATCAATGCAATGATTTAATTAA TAAACCTGGAACGAGGCGTAATTGGCATCTGAATGAAAGTCACATATAAT TAATAACTAGACCCAAGCCGATTATAATTAATATTTTGCATATACATAGT TAGCTTAACGAAAAATATGCCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACTCGTTTTGAAAGTATAT WCGTATAAKTTSGTAMWATGTAGGTATAGGAATCAAAGAACATTTTTATC GACATTATTATTAATGTGATTCTCTTAAGCCTTGCTTAATTGCTTATCAA 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