EMLSAT00000000550, EMLSAT00000000550-696397 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000550
Unique NameEMLSAT00000000550-696397
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s108supercontigLSalAtl2s108:36082..56433 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000550 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000550EMLSAG00000000550-683316Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002371EMLSAE00000002371-711299Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002372EMLSAE00000002372-711300Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002373EMLSAE00000002373-711301Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002374EMLSAE00000002374-711302Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002375EMLSAE00000002375-711303Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002376EMLSAE00000002376-711304Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002377EMLSAE00000002377-711305Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002378EMLSAE00000002378-711306Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002379EMLSAE00000002379-711307Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770120auto770120Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000550EMLSAP00000000550Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000550

>EMLSAP00000000550 ID=EMLSAP00000000550|Name=EMLSAP00000000550|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=704bp
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PLCQECTALELSFYNPNCEECRMELRQXSTHISDVFXVLRQWVPQVQQNI
DFLVSEAFRMGAHPDDRDHLTDMTLLMYVCKAGATGVGDEQVAAKVAQDL
VTRGAQLDLRCRWTDMTAIHYATYFDSAKVLQVLLSTSKGQDADSRCHEF
DNGTALHIAAANLSLSAAKNLLKFGADLDVCDDLARKPVECIPDPDAYQE
IPESGELIRELTDILTSRSGSLAGGTLNGYSGPATYSASISISGKIALQA
LGLKVGDRVVLRGEDEKFGSLEYCGLTSFAPGVWVGVKLDELHGKNDGSV
QGVVYFKCQKNHGLFVPPGKISKMGRTYVSKGIKDPSITSQISNSPINKT
KVVNRGRVDVSKVSSKLTNAIEEIAERKEIKEGDRVREEKLISLCIKYSR
WYGVELDEALGKHDGTVRGVKYFPSKADHGVFVTEANLFKDLLIGNSNSN
SRSKSEVGLLRDHPRSLSSYSEREVSSSINSSVRRIPSVHKTTRPTNRSL
SLRHTIGRSESSNRPQSTTTKSSNMASTSTMNRSQSMRRNTPSANEWASV
GAVSYNKFRKSENRQKFLEVGTTAICVHNKEMGIVRFVGRVHFASGIWVG
LELRSPNGKHDGIVEEKRYFTAKTNHGVMLKPKRLSVHGINAEKLLKPEH
EYPF
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mRNA from alignment at LSalAtl2s108:36082..56433-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000550-696397 ID=EMLSAT00000000550-696397|Name=EMLSAT00000000550|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20352bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s108:36082..56433- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGCCCAGCTCCTTGGAACAARGATCCTCTTCCAGAAGAGTATCGAGA ACGTGAGAAGATAAGTCAAATCACAAAAGAAGAAAGAGAGAAGAGTTATG TCATAATTCCGAAACGAAAGGAGGCTGTTTCTCATCCGGCAACAAGTGCC CCGCTCTGTCAAGAGTGCACTGCACTTGAGCTTTCCTTTTATAACCCCAA TTGTGAGGAGTGTCGTATGGAGTTACGGCAGSCTAGTACTCATATATCCG ATGTCTTTMCTGTTCTWCGTCAATGGGTCCCTCAAGTGAGTCTATTATCC TCAATGACTTGTACAGTTGTACACAAGATGAAATTATAATTATTAATCAT GTGTATGTAGGTTCAGCAAAATATTGACTTTTTGGTATCAGAGGCCTTTA GAATGGGTGCACATCCTGATGACAGGGATCACTTGACTGACATGACGTTG CTCATGTACGTTTGCAAGGCMGGAGCCACTGGAGTTGGAGATGAACAAGT AGCGGCAAAAGTGAAATATAAACTAATGATTTTATATGCTCTTAATATAT TGAATTATTTATTTATACTTTAGGTAGCTCAAGATCTTGTAACGCGAGGT GCTCAGTTGGACCTTCGTTGTCGTTGGACAGACATGACTGCTATTCATTA TGCTACTTATTTTGACTCAGCCAAAGTTTTACAAGTTCTTTTATCGACAA GTAAGGTATTGTTTATCTCTCATATTTCAAGATCATACAACTTATTTAAA TTATTTTTTTATTCTCTGAGTTCAGGGTCAAGACGCAGATTCAAGATGTC ATGAATTTGATAACGGTACTGCTCTGCATATTGCTGCAGCAAATTTAAGT CTATCTGCAGCTAAGAATCTACTTAAATTTGGCGCTGACCTAGATGTGTG TGATGATTTAGCTCGAAAACCTGTTGAGTGTATACCTGACCCCGATGCAT 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TTTAGTTTTTGGACGACAAGTGATCATTCAATTTTCAAAAACATCATTAA AAATTTGACAGTTTATTATGACTTCACTTATCTTAAAATAACTGGAGGTT TGTCACCATTCCCAAAGATTAACTAAAAGCGAAAAAATTTGAAAAATGAC TACACCTTCACAAGTTTATAGAGCTGCTTAAGTTAAAAAATGTTGATCTT GTTTTTGTTTAGAAAAACATTGGATCTTATTGTTTAGGAAAATAGAATAT GGGTAAACATCGTCAACTTCAGCCGGTTTTTAGTCTAAAGGATTTTATAT ATTTGCAAATGGCTGGAAAACGATATACAAAATACGTCGAACAGAAGGAA TTTTAATTTATCTATGTATATATAATATATATATTCTCTAAATAGAAATT TGGCTTCTTTTCTATATTTAAAATTTCTAATTGATATTTGAAAAATTAAA ACTTTAATATCACGTAGAGAACATTCAAATTATTATATAACTTATTACAG TGATTTTCACGTACATATGTATAATTATATAGAACGTATTATTTTCAAAT ATATACATTATACATATGTAATATGTACTTGAATAAGTATATCAGTGATA GTCACAGCCAGTTTTACTGTGAGTGGGACTTGACGCAWAGACAAACAGCG GGGCCCTTTTAGAGGGGTGACTTTTTGACGTTTATTTTGTAAATGTATTT AATATTTCCTTATAAAACATAGGTGATTATTAATTCATATACATCACACG GATTTATTATACCATCTTCATTAGTAACTTTAAGAGTTACTGGACTCCAG TTTTAATTACAAGGGAGAGACGAACCCTGAACAGCTTAGCTGGTAGAGCT AACCGCGACATGTATTTCCAATCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNAACATTTAGAACTTTGACAATTTTTTGACCAATGAATGAAAAGTTT GACAACAACCACTGTGAAGGCTAGGACTTGTACCCCCCACTGCCCTTTCC ATAAACCGACACTAATGATAGTTTATTTATCTACATTCACATAAAATATG ATTATATTCCATGATATTCTACAGTAATTTTCGTATTAAAGATGTATAAT CTATGTACTTATATTAATATATATAAAACAAAATATTATAATCAAGAAAG GGAGAAAATGTCCAATTTATTTTTATATCATGTACAACCCAATATTTCAT GAACCTATTTCAGTCAATTTTGGGTTTGTATTCAAATTTTTGGAATAATT TGAGATACCCACGAATGTTTACTATAGTCTAGAATCTTTATTTAATTTAT ATGGCTTAATTTGGCCCTGAGATAGCATTTCAAATTACTAAAAGGACAGT GCCGTAATCAGGATTTTGTTATTGGAGCCTGATTCGCTCTGGATGACTGA CAATTAATTGGGCCAATAAATATTACTACTGAAAAAATTATTGGGGACCG CCCACTTCCATGATTGGGACCTTTATATTTATTGTAAAAGGGGAATTCGA TTCCTCCTGTTTGGAAATTTAACACTAAAATTTTCTTGTGGATATCTTAT ATTTTGTCTTATCTTTAATATAAGTAATTATCTATGCCTTAATTAATAAT GAAACTAATTACACTTCTTCTTCCCACTCGCAAAGAAACGAGAGAGAGAG AGAGTGCCTAGTCTCAACCTTTTGAGTAATAATGACTTAGATCATCAATT TTTGAATCCAGATATCATAATATGTATATAATTAGGATATCTTCTTAGAT TTTTCTATTCTTTGGATAAGAAAATATGTATTTATATACATATTTAAGGC TCTTTATTATGGGGGGGGGGGGGGAAATACGGATTTAAACAAAATATCTG TCCTGGATCAAAGTACGTATGCTTTGAACTTTGAACCTCATTTTAATTTT TTTATCTTTCTTTTATTTTTACTTCGTAATGCATGATTAGAATCTCAAGA TGTTCACCTTCTCTAGATATATATTACTATTTTACTTATCATATTAATAT AAGTCAAAATTATACATTTGGCAAAATTTTGAAGACATGTGTTGTTTTTC TTGGGCATTGTCAAGGTTAATAGAAATACAAGGTTAGACAATCATGTAAT CGGGCTTTCTAGAATTTTCAATCTGATGTATACATATTTTTACAAAACAC GCAACCACTCATAGTCTATGACGTCACTATTTTTAGAATTTTCATTTGAT CTATAGTACCGACTGCTGGGCAAGAAAAACAGATTTTGACAAAACACGCA ACCATCATCCATTATCCCGTCAATATTAAAAGCTTGGTGGAAATCAAACA CTAGTTGTAAATGTGTTATGCTATAACTTTGTATTTCTATAACCTTGGGT CAGAGGAGGACTTTTGAGTGTGTGCACTCACGCTTGTCTAAAAAAATCAA ACAAAGATTACTTTTAAAACGAATTGGAATCACATTACACAAAATTCAAC AAGTTTCTACATAGTGTTGTTTGTGGGAAAACATAAATTATAAATTTCAT TTCACATAGAAGGGAAGTCAGTTTCTGCCTCTGAACAAAAAGAACCTATT TTCCACTGTAAACAAAGATAACTCGAGTTAAAAGTATAATGCAGATATTT TAAAACAGGTTTTAGAATTTTTTAACATTCAGCTTTAAAATATATTAACA TAATTTATCGCTATCTTCAATACCGTGGCATTAAAACAGCTTTGAATCTG AAAAATAGCCGAAAATAACAAAAAACGTTTGGCTATTTTCTGCGGGCCAT AAGGTTATGAGAGAAAAAATAAGACCATATTTGGAATCAAAGGATTAAAC TCTATTAAATAGAGCATATACTGTTTTTGTACCATTTTTGCTGTTGGACA 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