EMLSAT00000000551, EMLSAT00000000551-696398 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000551
Unique NameEMLSAT00000000551-696398
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s108supercontigLSalAtl2s108:383112..401265 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000551 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000551EMLSAG00000000551-683317Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
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EMLSAE00000002381EMLSAE00000002381-711309Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002382EMLSAE00000002382-711310Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002383EMLSAE00000002383-711311Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002384EMLSAE00000002384-711312Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002385EMLSAE00000002385-711313Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002386EMLSAE00000002386-711314Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002387EMLSAE00000002387-711315Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002388EMLSAE00000002388-711316Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002389EMLSAE00000002389-711317Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002390EMLSAE00000002390-711318Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002391EMLSAE00000002391-711319Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002392EMLSAE00000002392-711320Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002393EMLSAE00000002393-711321Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002394EMLSAE00000002394-711322Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002395EMLSAE00000002395-711323Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002396EMLSAE00000002396-711324Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002397EMLSAE00000002397-711325Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002398EMLSAE00000002398-711326Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto777107auto777107Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000551EMLSAP00000000551Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000551

>EMLSAP00000000551 ID=EMLSAP00000000551|Name=EMLSAP00000000551|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1352bp
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KDVIANISTQNPTNNNGRQKSEEQCRSSLYGQRKMICKVGIQKDRVVQEN
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KLIRAIGTSLRADGPYDHILKEIKDTVPLSTLMEKTDNETIICKNVAFLQ
LRYLLRRIYETEMMKREKIHRSMELFLRNEFNVPKDAKSSKKDRFPMYGQ
DE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s108:383112..401265+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000551-696398 ID=EMLSAT00000000551-696398|Name=EMLSAT00000000551|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18154bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s108:383112..401265+ (Lepeophtheirus salmonis)
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