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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1093 | supercontig | LSalAtl2s1093:158880..247124 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Description | Found several mismatches. Heidi |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000562 >EMLSAP00000000562 ID=EMLSAP00000000562|Name=EMLSAP00000000562|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=143bp
MSTHTNTSASLASNIDDGGCEELCELSNNDWCLNFRLGLKLLRCPDQKCV DNLCGIAQDCEERENFSENLGCPIVFDGWSCINTTLPGSNILFPCPNFEH LNFQPKNFASRQCNWDGKWYDNLTSKAFTRYDSCPDSESFLEY back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1093:158880..247124+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000562-696409 ID=EMLSAT00000000562-696409|Name=EMLSAT00000000562|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=88245bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1093:158880..247124+ (Lepeophtheirus salmonis) ACTTGGTCCATAGGTATATATTAATAGTAATACCATGGAACTGAATGGCA
TTTAAAGCCATTTGGTGTTTTAGAGCAAGGAAAAAATTGATATTGTATTA
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ACAATGATGAGCTGAGGAGGGAATCATTTCTAAGAAAATTAATAAAATAC
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CTGTTTTTTTTTCAAAGCTGTTATAGTTATTTTTCAATTCTTGATGGAAG
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GTACAAGTCATATTTATAACGACTCTAATAATCAGTGTACCAGGTGTATG
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GAGAAAAAGCCTAGAGGTGGTCGGTCATCCCCTAAAATAGTCATCATCTG
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GCTTTCAGCAGCCGACTACATCATCCAATTGAGGTCCAAGTTGATCCCAT
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TGTGAACCCGTTGGACTTTCCCTTCTGAACGTATGTGGAGGGCAAGGCTT
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ATGTCATTTTGAGTTTTAATAAACCTGAACTGTATGCAATGAAGGAACAA
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GTTAACTTATCGTTTTAAATAGTTAACATTAAGTTAATTCTTATTTTGGT
TTTTTTTAATCTAGTTGAATTAAAGTTAATTTCGATTTCTATGAAAAATA
ACTACTTCAGTTAAAGTTAATTTGGAGATTTTTTTTTTTACAAGTTAAGT
TCAAGTTAATTTACTTTAGAGTAATTTAAGATCCATCCACTCACCCAACC
TTGGTTAATTAAAAATTAATTTCGATATTAAAAAATAACTATTTCAGATA
GTCCGTTGGGAGATTTGTCAAGGCTTTATAATAAAGATTATTGGTCGGTC
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TTAGGTTTTTTGGCATTCTATCTAATTTTAAACCATTTATATAAAAATAT
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TTGATGGATTGGATGTGGAATGCCCCAGTTGAAAAGTTTGATAAAACAAA
TAGTGTCGATACGTTTACTTGAAGACAGTTTTTTAATATTTCAATCTAGA
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AAGTTAAAATAACGCTGTTTAAATGATAAACAAGTTAAGTTAAAGTTAAA
ATAACGCTGTTTAAATGATCAACAAGTTAAGTTAAAAGTTAAATCACTTA
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ATCAAAGATACAATATTTTACTATTTAATTCAAAWAAATAGTTGTTGTTT
TTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGACAAATGGTCGACTTATGGCCTTAT
GAACTTATATTATGTCATTGTAGTAATGAATCAGTTGTTCCAGGCCATTT
GTAGCGGGTAGGCTTMAGCCTTCGCTTACATGTTTCTAGTATTATATGAT
TAAGTTAGGCATTCCGAATGGGAAAAAAAGTTTTGATACACCTGACAGGA
GTGTCCGCAGGGGATAGGCAGGAGGGGCTGTAACCCCTCCCAAATTAAGG
AATTTTTGCTTATTAAGATAATTAATTATATTTGTAGTTCGGGCAATTTA
TACAGCAGATTAAAAAATTTAATATTTAATAGTTTTTTGATTTTTTTTTT
TCCAAAAGATTACACTTTTTGTGAATAGTTTTGGGTTTGTGTATTTTTTT
GGGAATAGCTATGAAATTATCAATTTTTTTTTTCAATTTTCAGAAAACTC
CCATAAAAACTAAACCCCCTCCCACCCAAAAATATAATTCTGTGAACACC
CTTGCCCGTTAACTCCATAACTCTATGTATATGATCATAAAAATGGAAGA
AAAACAATTACGGTCTCTGAACATTTCTCAACATGAGTATTTGATTATTT
ATCAATGGTATGTGCCATGTACATAGATATACATGGATTTGTATAAATGT
CTTTCTTTCTTATGAGATGATGTTTATATATCTAGTTATATGTAAATATA
TATATATATTATATTACAGATACTAGTCTAACATATGTAGGTATATGTTC
TTTTTGAATGGCTAGGGGCTTCTWGTCTATTTTTATAATTTNTATCAAGT
TTTTATTATTATTTTGTAGTATATATTTATTTAGCCCTAATAGTAAATAA
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GATGTATGTGACTACTTGGATGATAAATACACATGACATACTGGGTAATT
ACATCATTTTCTTTGAAAAAAATATTCAAAAATCTACAGCTATTTACAAA
ATATTAATTMTTTTAAGAAAAAAAATRCAAAAATTKAKAGCTTTTGACAA
AATACTAAATTTTGTCAAAAAAGTCTGAAAAATTATATTCAATTTTAAAT
ATTCAATTTTTTGAAATTTAAAAAAATCGAACAAAATTTTGGAAAAAAAA
TATAATCTTTATGAAATAATTAATTTTTTTGTTAAAAAAAAATACTTGTA
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TTAATTTTTGTGGAAAAAATTTCAAAAAAATCAACTACTCTTAAAAAAAA
ATTGAAAAATTAATTTTTGAACTTTTTTTCAAAAAAATTAACTGCCCTTC
ACACAAAATTATTACCTTTGGGAAAAAAAGAATCTACTTCTCCTTACNAA
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GCTTTGATACTATAACAGCCAATCCTGTGCAATTTTGGTTTCATTCATTC
GTTTCCGAGAACTTTGATTTCAATACCGTCATCTCACTACTGTTTCGATT
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TTATTTTCATTATATTATTACCTATTATAAATTAACTTTGTGAAATAAAG
ATTAAAAAATAAATGTTTCCTTTGGATTTTCGAATTGAATAATTATTAAA
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AAAAATTCGCAAAAAGTAATCAATTTTTCTTTTTTTCTCATTGGATGCAT
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TTTCTTGTTCTTAGAACAAAAATATTTTTTGATACCTTTATTGAAGTAAA
AAAAAAAATCTTTAATTTTTCGTTTAATTTTCATGTTTAATACATATGAC
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TTATCGTACTCTCTGGCAATTTATTGTCCATTTTTATTAACAATTATTCT
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GAATCGTGACAATAAAATAATGAGGAATTGATAGATTTTATTTGAAAGAG
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GGATCTTTTCCTTTTCTTGATTTTTTATTTAATTTTGTTTATGCTGTTGC
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ATGTACCATTGAAGTAACTAGTATCACACAATAATGTGCGAGAATCGTAA
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GTTGAATTTGAGTTATAATTTTTGAGTTCGAGTGATTAAATATAGAGGCA
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ATTTAGAAAATTAGGTTGAATATATATATTTTTTTTTTGAGGAATTAATC
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GAAAAAATGACAAAAATATTTGATTCCTTCCAACCCTGGACCATTCTACA
ATATATTATACTATTCTAATCTCGGGGCTGTAGCTTTTTTGATGTTCGAG
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GGGAGAATAACTTATTATAATAGGTATATGTAGAGTTGTATACTTTAATA
ATTTTATCGCGTTTAAGATTATTTCTAGTTGGTCATCAGTGCAGTATATT
TTATTTTCTAAATCTGGTCCCATTGTTTTTTAATTATAGGCTTTTGAACA
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TTTCCTTTTAGCTAGTTCCAGATAATCTAATGAAACGTCATGACCAGAGC
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ATTTAATGTGATTGATGGAGTTCCACCGATTAGGTATAAATAAACATTTC
ATTTAGAGGTTAAGTCGTTGTCTAAATCCTGTTGAGTGTAAATCAAAAAT
AAAAGTATATATTTGTAGCATTGAGAGACGAAACATCTAAATAAACTATT
GTGGTCCTTATTCAAATTTTCAAAATTCTTTAGACACGAGTAACTTAAGA
ATTTATTATGATGGAGTGTTATTAGTGTCATCTGATACCCAGTTATTCAA
GACTTCTAAATTGGAAATGTTGGTTTGGATAGGGTATTTGGAACCAACTC
TCTGACCATTTAATGAAGATTAAATACTTTCTTTATGAAGAAATGTGGTT
AGGATATTTTTTATTTTTTTCTATAAAATTCCATAAACCAAGCCCCATCC
AAAAAAAAATTTATATTTATATGGATAATCCTCCAGACGCCCCTGATATG
TTATTTTCTGTCATGCCTATCTATGTTGATCAGTCTTTTTGATGATGTTA
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AAGGACACAAATTGCCCAATTTGTGTACCTTCCAAAAAAATCCAAAAACA
ACACGAAAACAAATCATTATACGTTTTGCTACAATTATTGATTTCTTTGC
AGATAGGTAAATATGTAATCATCGGAGCAAAGAAAAAAATATATTTACGT
ATCCTATTTTTGAATTTTTATCAAAAACAACATATTTTCTCAATTTGGGG
GAAAATAATATCTCACTTTTCGAGAGATATTATAGAATTTTACCCTTTAT
CGTAACTTTCTAAAGATATTTAGGGAGTTTTATCACTGTATCAGCTCTGC
ATAGTATGTCCAATCAACTCAATCCCTCCCTCACTACACTCTTCACCAAT
GCGTTACAGTAGTGCGTCTTCAGGGGGGGGGGGGGGTTTGTAGATCCCTC
TCCATCCAATCGATAAAATTTAAAAAAATTGGGGCCCCAAATCTATTGAA
GGATTTATTTTCTAAAAAAGTCTTTTTAAGGATTTTGTTCTATCAAAAAT
ATCATTCGATTAAATTCGTGGGAAAAAAAACAACCCTCTCCCCCAACAAA
GAAAAAAATTATAATCAGACATATATTTTAATACAATTTATCTTCCAACA
ATCTACATTTTTTTTTTTTTCAAATGTATGTTTTCTATTTTTGGGGTTGT
TAACATGGTCTCGGCCATTATTGTGAACTCATCATTGAACATTGACATAC
CCGGTGCTCATTCTAATTTTTGCATTTAGCGTGGAGCTCGGCAATCTTTC
TAATCGCGATGAATGGATTAAACRTCTAAAAATAAATGAAAAGTTACTGA
AGTGTTTTTTATACGTGCATGACCTTACCTTATTTCTAACGGGAAGATAA
GAAAAACTACCATATTCTATCTCCCACCCCATCAGTCATTCAGGATTTAA
AAAAAAAATAATCCGGTTTTCCATCAACGTAGAGAAGAATCAGATCTTAT
CCAACTGTGACGACTATCTTAAGACATGTGAGGTTCTTAGCGAATGATAT
TTTGCCTTTCTCATAAATGAACGAAAGTTTCTAGCTGCAGTCTCAATCCT
GAGCGAAACTTTTTACCTACTACAGAAAGGTTTCAGATTTTTCAGTAATA
CTCCACTCACCAGATATGAAAAAGTGAAGGCCTGGGATATCAATATCCTC
TCAAAAACGTTCCATTTGTTGAGATACGTTCCTTTTTTATAGATGATACG
TGAAGAGCATACATAAACTAATAGAAAATTTAAACATACGTTTCAGGGTC
GAGGATAAACGCCCCAAYAAATCGATGAGGTCTTGGTTCTACAGACATAG
AAGGTATGTGGAAGGCGCTGAGTCTCTCGTGGTTAAAATTACTCTGGAGC
TCTTGTGATTTTTGGGAAATTCAAATAAAAAAATCATAGAAAGGATTGGT
NNNNNATAATCCTGCTGACTCCCTACTTTATTATAAAGTTGCTAAACCAT
GTATATAATTTGTAACCAAATCCAATTTTTATTCACATAAGAGCGCTGAT
CCTTGGAAATCTAGATACCTAGAATCAGGGGCGTTGCTACCTTTGATCAT
YTGAGGGCTTTCCCCAAAAAAATTAATCAACACTGTTATATAATTACTTA
TATAAAAATGTTTCTTGTATATRTATRTATAATYTAGTAGATGGTTCCCG
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AGAGAGAGGGATGTAGGAAGAAATAAAGAAAAAGAGGGTTTTTTTTTGGT
CAAAATAGGCTCTTAATGACCTTGGAGGCCAAAAAAATATCATAAGAACA
TCCTTGGTTATTTTGTACGTCTACTTACTAAATTTCAGACTGATTTGTTT
AACCGTTTTGGATTCCATATGTGATAATACCAAAAGAAAAATTATAAATA
TATATATGATATGATATAAATAAAAATGGGTGTATGGGGCTTCATATACT
TTTAGGAGGGCTCAAACCAACAAAAGGTGTAAAACACCGCCACTGTCTGA
AATAAAGATGGTATTTCTCCTTTTCCCTAATCAGGCATTTTTTCTTATTC
AATAATTTATTAGAGTAAAATAAGGGCAAAATATTTTTTTTTACATTTTT
AAAATACAAAACTACAAATTTTAGCAAAGAAGAGTCTTCCATAAAATTTT
TATCATAACTTTAATCTTTACAATTATTTTTACAAAAATATTTCTTTTAA
TTTATTAATAAAAACACTACATTTATTTTCAAAGAATTGCCCATGATAAA
TCTATATAAATAAAAATAACGTACTTATAGTTACATGTGAAGAAAGTAAA
AATAAGATGAAGGATGTATGACTCAGGTGTGACGGGGGGAGGGGGGGAGG
GGAGAAAAATAAAATGACGTTTATAAAAAATAAAAATGGTTGTCCTGACA
ATTAGAAAAATATTTTGGAGAAGAGCAGGTTAACTGTACTGGCAGSTTTT
ATTATATAARTTGCAAGCAGCTGCATGAGAAAGAAAAWAAGCACAATTCC
ACTCCGGATATAGCTAAGAGATATATGCAGTAGTTACTCCAACGTTGATG
ATCAATTCTATTGTTTGGGTATGAACAGGATCCGAGATGAGCATTCTGAG
TACCCCCATTTGAGACTAAGTTGAGTCCTATGTCACAGGGTTAAACTGAA
GTAATTTGAAAAACGACTTATTTTAGGTCTGAAACTTCAGAGAATACTCA
TCTAGAAATTCTGAAAAGAGTTACTCCTATATATCACAAGCAAGCCCTCA
TTATTACGCTCTCTCTTTCATGAGCATACTCACTGGTTGTTACTTGATTC
TTAGAGGCTCTTTCTTCAAGAGTTCATACTAATGAAAAAAGCTTTAGAAA
ATGTAAACGCCTGTTGAGATTGCCAACTAGAAAAAGCCACTCCCGCTTTT
TAGGGTATATTTTGTTCACCTTAATGCATCAGTGAACTCACCTTTAGAAC
TGTTTTGAGTAGATCACTACATCAGTAGTGGTTTATAACGTATTATCTCC
CGGTATGTAAAAATAAAAACAAATATTGTGGAGGAAAACAGCTTATATGT
CATGAGGTTTTACTATAACAGCTGCAAGTATCCATGAGTGGAAGGGAATT
ACCACAAATCCCACTCCGTATCTTGCATTGTCATATAGGTGTAATTACTC
CAAGGTCAATCATCAATACTAAGTCCACCAATGAATTACACTTCTAACTA
GAGTTGTAAATTGTAAGGATTTTGGGCATGTAAAAATATAAGAAACCGAA
AATGAAGGGGATAGTCCTAGCAATTTGAATATTTTTAGGAAGAGAGTAGT
TTAGCTATCATGCCATTTAGTTAGAGTATATGCAAACAGCCAAGAAGGAA
ATAAACAAAATTCCATTCTGTATCTTGTAAGGATAAAGCCTGGAGTTACT
CTGACCTCGATACTCAACTCTACTTTGAATATAACAGGGGCATACACTTA
TGAATCCCACAGAGCTAACCCATCTTTCATGAGCACAAGCACTAAATAGT
ATTTTCATACTTTATACTTAGATGTTCTCTCTTGAAGAATTAAATAATAA
TGGTAACAGCCTTGAAAATTAAAAAAGCCTGCTTAGACATTCAYCCAGAA
GAAYCCGGCTGCCGCTTCATAGTACATATTTTAGGTATGAAAAGTACATC
TGTCTAAGAACAAGGCTCTTGTATAGTTCGTGTCCCTTCCTCCTTCACCT
CTCCCTTCTTGTTGTTAATTTTCTTTTCCTTAGCTCTTGTCATTATTATT
GAAGTCTTGAGGAGTGAACATTCTTTTCAACTATATACTTGATTTCACAT
TAGTATGTGCTCATAAAAGACGGAAAGTAACCTTGAGAATTTATTATGTA
CATAGAATCTGTAAGTCCTTGTTGGACTCAGAGTAGAATTGAGGATCAAC
ATTGGCGTAATTATTGGGACTGTATATGTTCATTTCCTTCTCCCTCCCCT
TCCTCTACACAGCTGATTGTAGCTGTTTCCTCCAAAATATTATTTAAATG
GTCAGGGTTTTTAACATGGACATTGAGCGCAGGATTTTCATCACTACACA
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AAGGATTTTATTTGATTATTTTTTATAACAAACGAAAAAATAGGGAGGAG
AGCGAGGATGCAAGAGTCATTTATTTAATGGAACAATTAAAATTAATATA
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GTTGTTTCAACATGTATTATATAATAGTTTGAAGACCCTATCTGAGATTT
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TATTTGGTTGACCAATTCTATTTTTTTTAATACCACAAAAGACTTGTGGC
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GTCTAAATAGTCATTTTGCATGACTTATTCATAGAACAAAAACCTAAAGA
CAGATTCCATCCTTGAAAATATATCTCACTGAATGTAGCCGCCTTTGGTT
TTAATAACACCCTTGATTTGGATCTTGAACCGCACACGTCCTAGAAAGTA
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CTTCGTCATAATATGTGACCTCTATTGACCTTGAACTCAAGATACCTTCA
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TGAAAGGGTCGTTTTGGACTTTCTCTCTGCCATCACAATATCCTTTCAGG
TGAGTATTATTCATAGGTAGAGAATTGAAAAGAGGTGATTTCCTTCCCTG
CGTAAATTTTAAACAAAAGTATATGTTAGTTACTTGCAAGCTAGTAAGGC
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TGTTAGCTTCAGTAGATTTTTTGGCTTGTTAAAGTAATTTGCTAGCGCAA
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AGTAAGCAATGATCTATTTCTTTTGTAGAATCCACATTGCTAATTAAATC
GGGCATGACCTAACTACAAAAAAATACATATTATCCATCAGGTGGTGTGA
CAGTTTGTAGCTCATAGTATTATAGCTTTGAATAATATTGAAAGCTTTTA
GCGAATAATAGTCTACCATGGACCACTACTGTTGACAAACATTGATGATA
TGGCCTTCTCTATTTTGAAAATGCAAATGTAGAACATGACCACTATTATA
CTTTTATATTATAAGGTATATTTTCATCTGGGGTTTTAAGGCTCACCGGG
ATTTTGACAATTTTCATATCTCCAACCCTACTTAATTCCTTTTTATATTA
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