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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s109 | supercontig | LSalAtl2s109:370916..381227 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000596 >EMLSAP00000000596 ID=EMLSAP00000000596|Name=EMLSAP00000000596|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=189bp
MLIKLQKKDGTPLWVHAVIQVKENGDAHSNSPYVIFTNQVLSQRESDVMK
RNGWLYQYYTMQSRFHYSMNLEGSNGGAGSGDNASPDQPYYTTTQSPSNA
SSSRSMPEEHTTSPSPTSILLSNNYGGHFYGSSIPGGSAVPPRMMEEPTT
GLKYSAEMPLDFSTNSYQWSSFYKDTKHLTDIHHQIPSH back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s109:370916..381227+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000596-696443 ID=EMLSAT00000000596-696443|Name=EMLSAT00000000596|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10312bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s109:370916..381227+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATTTTGCAACAGGTTTCATAAGGATCTACTTTTATTGCCATATATA
TGTATATATGTCGAGCAAACATAACCCCAATTATATGGAAACGCTAGAGG
ATATATGAAATATTTATTTTTCATGTTTTTTCTATATAAAAAGACGTTTT
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ATTTGCTGTTCGTTTTGATTTCGTTAAGAAGTTTTACTTTTTGTTTTAAG
CTCCGTCCGCACGGCAACGTCTTTAAAACGTATTTATTTGGAATTTAAAA
GTTTCTGAGTTCACAAGAGGAAGAAATCTACTTAAATCGAGCCGGTTAAG
AACGTTGATGTATCCATTGAATAATCCGACATGCAGTTTAGTTGGTTTTC
CTTTCCCCTATGTAGGAATGGAGTAAAAAATGACTTTGATCTTTTTTTAT
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AAAATTCCATCATGTATCTAATGTAAATTAAAATACAAAATTCAATTCCA
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ATGGATTMTGTAGTAGTTGTTTGAAAGCCATGTCCCAAGAAGAAAAAAAA
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TGCGTATATTGAAACTTATTTAACTGAACCTTTACTCATAATAACTGCGT
TTGTTCCCTATTAAAGTAAAGTTTGTATTTTCTCTTTGTTCAGACTTAAT
TAGAATTAGAATTTTTTATTCATATGCAAATAGGAGGTTTATAACGATTT
GAAAACTATTTAATTTAAGTTCTACAGTCTGAGATCACGGTCAGGACCAA
AATATCCAAATTTACATAGATGTTCTCTCCTCAAGAATGAAAAAAGAAGA
ATAAGAGCTTGATAAAAAAATTAATATGGCGTTATGACCGATGAGGCAGG
GAGTACTTTAGTCTCTAGAGCGCTACTTGGCTGAGCCTTAGCTACACACG
TTCGATGCTACATGTTTTAGATCAACAATTTGTATATGATATAAATCAGG
GAGCATTGTATACAGTTCTCCCCTTGCACACGCTCAATGCTACATTCAAA
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ATCTTCTTCCTTTTTTTTCTTCTTCTTTTTTTCAAACAGAGACCCCGGGA
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GGGACATTATTTACTCATAGGGGTATGAATTAAATATAAATTTATTAATT
CGAATAAAATTTATAAAAATGATCAAATTGTAATATAAATTAGTTCAGAA
AAACTTTTGTTCAAAAGAGCCACCAGCATTTTGTCCTAATTTCATGGCGG
CGGMGACAAAGAWGCACTTGGGTAGAGGMAGTACGGATAGTTTTCTCAGG
GATATGGATCTATTCTTAGATGAGGACACGCCTCAGAGTGTCTTTGGTGG
GGTGGTACTTGGCACAATCCTTGTACACGTACTGGTTGATCTTTACACCC
TCCTCAACGAAAATAAGGGGCATCTTCTCTGCGTCTGACATAATAACGGT
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AAAAAAAAAGTATCAATATGCGCATGATGGCGCTGATGTTCCAATAAAGT
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TACTAACTTTTATATTGTAAACTATTTTACTATTCATTTTAAATTTGTTT
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ATACCTACAGTCTATAACTAGTAGACATTGTAAGAGACAGAGCCCTTTAT
GGTGGTGAAGAATCTTCTTCTTCCTTTTTTTTTCCATCTTCCTTATTTCA
AACAGAGTTGACATTTTAATCATATTTTAACAATTTTTATTTTCCTTTTA
TTCTTTTTTTCTAACTAGTTTTCAAAGTTCTCGGTAAAGGAAAATATCCC
CTGGAGTCCACGTGCTTCGGGTTCTCAAAGGTATGTACTACAACATAGAT
ATGTAAACAACAACATGATCTTGATGAATAATCACCTTTTTTATTTTGCA
TAGGCCATTAATGGTTTCCTCATGATGACAACGCAAACGGGGAAGTTACT
TTATATATCAGACAACGCAGCAGAGTATCTGGGACATTCCATGGTAAGTA
ATCAGTACTATTAACTAGTGTTGTGTTGTGTGGATTTACATAAGTCGAGC
TGACTTGCTAATAATAACCATCCATAAATTAGAGAAGAAAATAGAAGGAA
AAAAATAAGTAGCTACTGATCAAAACTAGAACTATAATTGATATTATTTT
CTAAAAATTTAAACATATACCCGAGACTGAGTAATTTATTTTTTTATTTA
AAGATCATAAAAATAGAACAACTATTGACCTTCTTTTTTTTTTTTTAAAG
TTGATTTTCAAAATAATCATTTCTAAAAAGATCAATTTAAAAAAACAACA
ACCTATTCCATCACACATTTATGTCTAACCCAAGCTTTGGTTACACTAAA
ACCAATCCTTCTGCTCACTGTTTAGTTTTTAGTGTTTTTTTTATTAGTTA
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GAGTCAAGTCTTCAGAACAAAGAAAATATGTTTTGATTGAAGTGATAAAA
TCAAAGCTCAACAATTCAGATAGTTTGACTAACTCAATAGTAAGGCAGTC
AAAAAAACTAGAAGGGGGCTATTGGAATAAAGAAAAATCRCCCGCCAATA
ATTGATCAAACAAAGAAATTCATAAAGTATTACACAATCTAAAAAATGTA
GAAAAATCTACTCTATATTATATTACTCGACTATACTCAAATACTTTGGG
AGTTGAGTTCGAGTAATTTTCCGTAAATTGTCGACATTCGTTCCAAAGTT
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TAAACTACTTCAGGATTGTTTGTACTTTTATAAAGAGATTGATGAATTCC
TGACCAAAACCATCGTATACTCATGCCTAGTCTCTCCCTTAGAAAATAGA
ATAACCTCATTCGAAATTGTAGTTGTTTAAAAAATCATTTAGGTTGGACA
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GAGAACGATGAGATTCTTAATATTATTATTATTTAAATGATGATCATTGT
CAATGATGAAAGTCACAAAATAATTCAATTACTCCAACTGTGTCGTTTAT
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AAAAAGACCACCCCGTTGTTGAAGATATCTACAATACATACATTACATAT
TTAAACTTCATTGAAAAGTGATTCATCATGCCTTTCATTGTTCAAACTGT
TTCATTTCCTTGATCATTCCATTATCTCTTGCACTTTCTTGTTCAAACAA
TTTCTTAAATCATGTGGTAATGTGAGGTTTTAACAAGGATCCATCCTGTT
TAGTGTTAGTATTGCGGCACAGGCGCATTTAAAATATTGTTATACTAATT
GACTATAAAATTGTCTTGAATATATAAAAAAAAAAAACAAGAATAGAAAT
GCATTTTTATTTTTAAAACAAGTAATCAAGTTTATGAGCTAGTTCCAACA
AAAATTTGTTTATTTGAATTGTCCATAACGAACTTTTTGTTGATATTTTT
AGTCGAAAGAGTATCGAAATGTACCGAAATACCCATACCTATATTGCTAG
TTAAGTCCCTACAGAAATATTGGTATTGTCATGACACTAATCCTGTCATA
GAGCAAAATCTGAAATACGAAAAAAAACAAAAAAACTCTATTTCTTACGC
TCTTATGTGTGCAAAAGTTTTGAGACTAAAATGAACGAATTAAGCAATCA
GGTATAATTTTGTATACATTTAATATCCAATATAATTTATCATAATGGTA
TTAAGTATAATTAACATTGAACATGACCACCGTAGTAAGTAATAACAGCT
TCTAGGCGGGGCTGCAATTTGCTACAGGTGCTTTTGATGTAGGCTTCTGC
TATTGCAGCCCACTGCTCATTGACAGAGTCCTTTAAGGCCTTAACATTTG
GCTGTTGGATTATGTAGGCTTGGGYATCTACTTGCCATCAAATCTGATGT
TTGGGGAGGACAAGATTTTAACAAACAAAAACTGGAATTTAACTGATGGT
TTATTTTTTCACTGTCTCTTCTCTAAAAAGGTGTACTTTTTGGGTCTTAT
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TCCATTGTCATCAGAGTCACGAAGATATCTGACCACTCTTTGAAGGCTTT
TACTTGAACTTCAGTAGTCAATTTTCTTGGACAATCCCTTCTGGTTCCTT
CTCCAAGATCCTTATTCTTATACAAGGCATATTTCCTTTGAGCCATATTT
GAGCCCATTAAACCCTTTCGAAGACATTCCAGTGGCAAGTAAGGATGCAA
TATTTCAACTTTGTTGTTCTTGCAACATGATTATAGATTCTAATGATTTG
AATTTAACTTAAACTAAAATTCGAGGGAAAAAGAATCAAACCATTGTAGT
ATAAGTTGAGTTATTAACTTTTAAAAATTGTCTCAAAACTTTGGCACGAC
CTGGTCTGGTATCAATCGATTCAAGGCTAATTATGTCACTTTAAAAATAA
AAATTATATGTTGATAAAAATAAAACTAGCAATCCAAAAAATCAAAATTG
TACCTAAATCAAAAACAATAAAATCCAACCTAATCATCAATGATAGTTTA
AAGCACAATCAGAAACATTAAAGGATATTCAGCGTCATTTAAAAAAATAA
TAAATAAAACTGTTGAGGAAATGAGATTATCTCACTTCAATAGTGATAAA
TAATTTCAATTGTGAACATTCCTATTAAAGAATATTTGACGTCATTTCGG
TTTTTTTTCTTTTCATTTTTGACAAATTATCATTCTGAAAAATGAATTTG
TTATTAGAAAAAAAAGGAGTTCCTTTCCAAAAAAAAGGTCATTCCATGAA
AATAAAATTATGCATGCAACTGAGGAGCAAAAATTTAATTATGTAATTAA
TTTGTTTTATTCAGCCATTGTTATGGATTTTAATTAAATAGGCTCATTAA
AATATTTCAATTGGAAATGCAGCCCATCATAGTAAGAGGTTGGACACATC
TGGCCAAGAACGCTTTTCGAAAAAAGATTTTTTTTTTCAAAAAAATGTAT
TATTTGAAATATCATTTTTGAAATTTTTTTGCAAAAAAATTAATTTTCTG
TGAATAACTATAGATTTTTGAAATTTTTTTCCTTCAAAATTTAATATTTG
ATTTTTTTTCAAAGAAATTCCAAAAACCAAGCCAATATAATCAACCCTGT
GGCCGCTCCCGAATGTATTAGTTTCATTGATATCAAACCCTCTACCCCCT
AAAATACCCAAAACATACACTTATCCGGGCCACGTGTCCTCTTTTTTTTT
CTCTTTTTTTTGAAAATCAATATATCATTAATGAATGATTTATGTTTGAT
GCTTATTTAACTTGCTTCCATCAGTTTTATAACTGATTTAATGTTGAAAT
CTCACATTTTACTGTATATTTTCTTTTCTTTTTCTATTCAGGAGGATCTT
TTGATACATGGAGACTCCGTCTATGACATCATTGATAAACAAGATCACGC
CTCCATTCAATCAGAACTTCTAAATGGGTATTCCTCCACAGACAAACCCG
GAAATAAAATCTTTCTTTGTCGAATGAATGTATCTCGAAATACGCGACGG
CAAATGCGATTCGGTGATCAAAAAGTATGAGCTCCCCTTGTTTTCTTTGC
CTCTTTCATCTCGTGTATTTGTTCTATATTAGTTTATACCTTTTCTTGTA
TCACTTTTTTTTTTTAGATATTTWCTTCATGACTATTTTAGTCGTGACTT
CGATTTACTTCACGTATTTTTTTTTTTTTTTGAGTCACGATTATACCTAT
ATAATAATATAATATAATATATATTTTTTCTTTATTTCCTAACGCCAATA
CTGTATAGAAGATGATTATTTTCAAAGAAATTTCCTTTTTTGTTAAAGAA
TGAATTTCATCATACATACATATTTTTTGCAGATCGTTTTGATCGAAGGT
CATTACTCCGGGATTCTTCCATTGTGTACTCGTAGTGAACCAGTCTTCAT
TTCTTGGTGTACCCCAGTGGCCATGCCTGAAACAAGGGAGTGTATTGTTC
ATGGGGCAACCAATGTGTTCATAACGGTCCATACCATGGACTTTAAAATC
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GGATGGGATTTTTGTAGAGAAAAATAAAGCATTTTATTCTTCGCTTTCTA
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TATTTGGATTTTTAAGTAGAAGATATGTATTAGTGCAATCGTACCATAGT
AACAGCCCTGATTAGACAATCTCTAAGTTTTTCCATCGTACCGCCAATGC
TAGTGAGGTTTTTACAATCAATTTTTCCTCTAAGAATATTTAGTGTTTCT
ATTTTTATTTTCATTACCGAGATATTACTTCACTGGAAAACACTTAGCTT
TTATTGATTTTTATTTGCATATTTATGTCCATTTTTATACATTATTTGGA
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TCTTTTGCGGTTTTCAATCTAATTAAATGTATTACTACATTTTATCAATA
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AAAAGACGCCACCCTGTTTTTATGTACATAGGTTTTTTTAACAACTCTTT
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GGAATTAATGGGGGGAGAGGCTTTGAAAATGGGTAATTTTTATTTTATGA
TGAGTATCTTTATAACTATATTATTCAAAGGAAAGAACCTTTTGCAAAAT
AACCTCCAATTATGATACTTAGCATCACGCTTAAAAAGGAGAGAAAAAAA
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TTTAAAGCTTTAATTAGTGATCTCTGTCAACAGATATATCGTCTATCGAA
ATTTGCCCACAATTGCCTATATTTTACAGTCACGCAATTGGTGATAACTT
TCCCATCGATATTGATAAATTACTTATCCATGATGTTTCCATTAACTATC
TCTTTTCTTTATTATTTTAGCCAAAGAGAATCGGATGTGATGAAGCGAAA
TGGTTGGCTCTATCAGTACTACACAATGCAGAGTCGGTTTCACTACTCTA
TGAATTTAGAGGGAAGTAATGGAGGTGCTGGAAGTGGGGACAATGCAAGT
CCAGATCAACCCTATTACACAACGACCCAATCTCCCAGTAATGCCTCTTC
CTCTCGGAGCATGCCGGAAGAACACACAACTTCCCCTTCTCCAACGTCTA
TTCTCCTCTCCAACAACTATGGTGGACATTTCTACGGCTCCAGTATCCCT
GGAGGGAGCGCAGTTCCTCCTCGAATGATGGAAGAACCTACAACCGGTCT
CAAATATTCAGCTGAAATGCCTCTGGACTTTTCAACCAATTCCTACCAAT
GGAGCTCTTTTTATAAAGACACAAAACATCTCACGGATATTCATCATCAA
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