EMLSAT00000000624, EMLSAT00000000624-696471 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000624
Unique NameEMLSAT00000000624-696471
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s109supercontigLSalAtl2s109:73593..97815 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000624 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000624EMLSAG00000000624-683390Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000002714EMLSAE00000002714-711642Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002715EMLSAE00000002715-711643Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002716EMLSAE00000002716-711644Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002717EMLSAE00000002717-711645Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002718EMLSAE00000002718-711646Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002719EMLSAE00000002719-711647Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002720EMLSAE00000002720-711648Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002721EMLSAE00000002721-711649Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002722EMLSAE00000002722-711650Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002723EMLSAE00000002723-711651Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002724EMLSAE00000002724-711652Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002725EMLSAE00000002725-711653Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002726EMLSAE00000002726-711654Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002727EMLSAE00000002727-711655Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000002728EMLSAE00000002728-711656Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771405auto771405Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000624EMLSAP00000000624Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000624

>EMLSAP00000000624 ID=EMLSAP00000000624|Name=EMLSAP00000000624|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1699bp
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KTSNNNNQPIGTNSLKNVLKMEVCCVMDLYQPLHLNDRKAAFEDLKSSCS
SSSANLHHIQFERLDFGEVNVIDSFYNADVAVVDLSVLTQQRSLFYHLGV
RESFGMKQNILLCMDTDRETSSALKSFCSNYVLLLYHLVDGSIVVTDSCT
PSLSENVRIPLSAKMTYYLKEMEIQSKVHMKEKFLSDLRKCRETLSGNEL
RDSLQKMRRRLDDPNILSTDIVHNMLISFREIQDYDAMVQLVQDLGTLPN
RSSYTQNSAIIFLFAFALNRRHKEGDREKAYKLITKALEKKEYEVPDIIC
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NKAVSAAECMFGLKPPKWYLKSTIGNITLISRFRRKKCSSTDGGNENKLF
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TGTRIILGRGTYGVVYAALDLNTXVKIAVKEVPEKNLGDVQPLHEEIKLH
SQLRHRNIVQYLGSISEEGYFKIFMEQVPGGSLSSLLRDKWGPLKGNELT
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AGICPSTLTFTGTIQYMAPEXIDKGARGXGXPADIWSLGCTVVEMATGKP
PFIELGSPEAAMFKVGFYKMHPEIPGELSTKAQQFISRCFVPEAENRPKA
SDLLEDSFIIDASKKKIHNNMSLKRRRLKSDGLKLMIPDNHVSTRDWLLP
YQRPSNSHSSNSSSMHHHPAPALTKTKRWKFXASRKMAXISNKSTSCVSS
QNIFFSVYRPLSTAXSGLVQGLTPISPEDNISESFFELGSRRHSNTGILH
SPEVLDTSTAPRDDCIQQDGFYLLKKDSQRRATLVKVLQADRMRICSQWH
EALLKQSQLQIIVDGIRGYIPEQNISPLESALSKLKDELDYDGAKINQMQ
LALYIFQDAASPMFRLHNIQPHWVFALDNLIRNAVQXAILILSPELGQHL
MPSNIQSEGNELELQEQLQSFCIEPSSRNSIIVXPTTGAVSRTSXXXRXQ
XNPFPSXLPXTXXSTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXSTMSS
NALRRPDFSRQLEDIREENCKLWKDFLELNRCHQDLLKMNISDQRRQIQS
LRKTTAPSIDSSSCSASDTASTLSSGDPYLIDWLKTLNLNDESISKIDDD
SRKINVTHYHYVKVLEELQFFQGDGCFSICARGLLSFLHLIIIVIMYDVV
EKSTIPIDPTFEYQFRLILIGDSTVGKSSLLKYFTDGSFGEVSDPTVGID
FFAKLLPVKDGNVMKLLLWDTAGQERFRSITRSYYRNTVAALLIYDVCNR
DSFTHIPNWMHEAGKHMEPSKCVFILVGCKYDMAENNPGVREVPTEEART
FAELHGLQFLETSARTGHNVDNAFRLLTQEIYDKLKNGKFELDPDWDGIK
KGYFPDSTRMFRNGASRTNISRGGNQRGGSSNGGSTRYLIGEPVSXKCC
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mRNA from alignment at LSalAtl2s109:73593..97815+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000624-696471 ID=EMLSAT00000000624-696471|Name=EMLSAT00000000624|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24223bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s109:73593..97815+ (Lepeophtheirus salmonis)
TAATAATGTTATGTAGTATCCTACACACACATATATAGGTTTCTGCATCA AAATGTCGACATTACAAAAATATACATAATACACAAATACACAGAGAGCA AGCAGTTGCTCCTGCGGTACCTACGCGATAATAAGTGCGTGTCTTTCTCC TGCTTCTTATTAGCTTAGAATCAGCACAGTCCTATGCTCTACTGTAATAA TAAACTTCATATTTATAGTAACTAACTAATAGTGCTGGAGAAGTCGTGCT CAAACATGTCCTTAATACTATACAAAAGAAATCATCATAATAAGTTATTA GTTGTTGATTGACTTCTCGATTCATGTTCTTAGTAGCTTTTGACGCCATT TCATCCAGATGGAAGAAAGTCACGGATCAGCAGCAACAACAACAAAAGTC ATCCACAATAAATATGGAACTCGAAAATAACTCTTCTTCTGAGGGACAAA CGGATAGTTACGGCAGCTCTGGAAAAACCTCAAATAATAACAATCAGCCC ATTGGAACAAATTCTCTTAAGTAAGTACTTTTTACTAGAGTAGAGCATTA GTACTATCATATGTACTCAGGTGTTTATGACAACAAAAGAATAGTAATCC ACTAGAAGGATGATGTCTCATCCGCGTTATTTATTCCATTATTGTAATTA CTCATCAATATAATGTTGGAAGAGTGAAGAGACATGGATTAACCATCTTT AATTAACTTATCTGCATTACTTGTGTAAAAATAAATAAATGGATTTATAC TCTTCTCACGTTCACGAACATAATAATATGTTGGGAAATCCATTTTTATA AAGTACTTATATTATTTATTACTATTAGGAATGTACTTAAGATGGAAGTC TGCTGTGTAATGGACCTTTATCAACCTCTTCATCTCAATGATCGAAAAGC CGCATTTGAGGACCTTAAATCCTCATGTTCTTCCTCCAGTGCAAATCTTC ATCATATACAATTTGAGCGATTGGATTTTGGGGAAGTGAACGTGATTGAC TCATTCTATAACGCGGATGTTGCTGTTGTGGACTTGAGTGTACTTACTCA ACAACGTTCCTTGTTTTATCATTTAGGGGTACGAGAAAGCTTTGGAATGA AACAAAATATTTTACTTTGTATGGACACGGATAGAGAAACGTCCTCTGCT CTCAAATCTTTTTGTTCGAATTATGTATTACTATTATATCACTTGGTTGA TGGAAGCATTGTTGTCACTGACTCATGTACTCCTAGTCTTTCTGAAAATG TACGGATACCTCTATCAGCCAAAATGACTTACTATCTCAAAGAAATGGAA ATACAATCAAAGTACGACGTCATTATGATTTTATTAGTGAGATAAGATTG ACCATTACTTTTTCAGAGTCCATATGAAAGAAAAGTTCCTATCAGACTTA AGAAAATGTAGAGAGACCTTGAGCGGGAATGAGCTCCGGGACTCTCTACA AAAAATGAGGCGACGACTTGACGATCCCAATATATTATCAACTGATATTG TGCATAACATGTTAATTTCATTTAGAGAGATTCAAGATTATGATGCAATG GTGCAACTAGTCCAGGATCTGGGGACTCTTCCCAACAGGTCTTCCTATAC ACAAAATAGTGCCATCATTTTTCTGTTTGCCTTTGCATTGAATAGGTATA CATTCCTATTGCATGCACGGTGCATTGGTGGATATATAAATGTCATCCTT TTAATCCTAGGCGTCATAAGGAAGGCGATAGGGAGAAAGCCTATAAACTT ATAACCAAGGCACTGGAAAAGAAAGAATACGAAGTACCTGATATTATATG TCTTTGTGGAAGGATTTGCAAGGACAAATTTGTGGAATCTGAATACACTG ACAAGGCCATGTTAGAAACAGCAATCCATTGGTACAGACGAGGATTTCAA GTACAGCCAAACGAGTATGCTGGAATCAACCTAGCTKCTCTCTTAGTCGT TAGTGGCCAAGACTTTGCTACATCTCCCGAACTTCAAAGGATAGGAATGG TCCTTAATAATCTTATTGGAAAGAAGGGAAGTCTTCAAAATTTGGAGGAT TATTGGGATGTCGCAACTTTTTTCGAAATATCTGTTCTTGCTGAAGACTA CAACAAAGCTGTCTCAGCAGCTGAGTGCATGTTTGGCTTGAAGCCTCCCA AATGGTACTTGAAGTCAACCATTGGAAATATAACACTCATCTCAAGATTT CGGCGGAAAAAATGCTCCTCCACGGATGGAGGGAATGAGAATAAACTGTT TGACTTTTGGCTAGAGMATTTTTCGTTTGCAATTGATGAAGAGTCCACTA ATTCTATCCGATTTCCTGTAAGTTAATTTTTATCCTTTGAAGTGTCATTC CGTACTTGATGCATAATTATCCATGCAGAATTTTATAAAATCTCCAATTA AGACTTTTTTCGTTTCATGCATCAATGTACATATTTTTCGTTAATTGACG AGCTGTCAATTATGTATATATACTGTAATATTCCTAATAAATACTAAATA GTCTTATTTTGTATTATGTAATGGAATTGTTTGAAATGTATCAATACTAT ATTAGGTAGACTTAAAAATGTCTATCTCTTCTAAATTAACGATTTCTAGG TTATTATATACATATATATACTTAATTTTGTATAATCCCTATCTACTAGA TTTTAATTTGGGAACCTACCAAAGTATATATGCCAAGTTTCGTCACAATC AATCTCGAAATTGAAGAAAAGTCTGTTCACATTACAAACATTTGCTCCAA ATGTATACATTCGGGATCTTTAGATTCAAAATGCCGACAGGTTCATGACT GGCTCCTCACAGCTCCTATGATCAAAACTGTAACGTAAGTCATGTATTTA 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