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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s10 | supercontig | LSalAtl2s10:179450..194483 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000643 >EMLSAP00000000643 ID=EMLSAP00000000643|Name=EMLSAP00000000643|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1008bp
MYSYLPYHPRNFQESQNLETIISPAAAQEQFTGKCETLIVFIIIELIPEK LSSGGVGPTPPGAASSADCRMSVGPLDNVMETQAAQLNLLLYQIYRPYFN ADPELVGGDTLTCGVCQKDFALADIVKFIQHKVLTCNKENYMSSSSVRSN GNESSSDEVTNXPLPTPIIPSPSHHHHHHNQQHLSHTPNNNHNSTNIINN NSSLNSGXNNTXSHSSEXRSLPLVLPPPPRSSSTPDTSKEETNNNNTTSS SDGKEVTEPLEKNSEDMMMLMDSSSTSSSSADERRIKQEAGSKKTARKTE VMDATTNTSNSEPFGFSCSTCRKRVDSAWSLLQHAQNIHGIRLXLDGLLP SSPERSILQHNMAALAAAAASRGSVRPGTVPHPPPPHHPVVPPPFHSPLD PHFNLLKMNAAAAHFPGGLNGFRPPVSLSTSSSSHDFRVDQLISMNPGGI GSGLPFATDRTPPLLSHPGLSPQTNLDFYSQRLKELAGSTSPRKLNSSGG SLTPPSFGSPTEPKLNPRRSHSSTPSSSSNPHEAKEHHGKDIIMNNEEGN PENNNNHHHKRSTSSSIVKHDDTNNNNNDGEKPTNLXSSILNNNNNADKQ SSGSVDEEMLDEGMECDDEESQRRRPGEEEAEDLTTKSPLNATPIAPSNA SSTPVSSTPPTTGSMIGDLMSKFGFSDIQEYQEAYRKALXESGXAIKSNN NNDVIRPKTPNQENGVDKLRLRDDITTASVKGTTDPNPFLPGQFDHKRLK MDRENSLFAGLWMPNAANNNQDVFRASFPSQRKKLDVDIPPLPPGVTLPP MEPSALKAIASKGRLSALFDPRARKEITGRSRNDTCEYCGKVFKNCSNLT VHRRSHTGEKPYKCELCNYACAQSSKLTRHMKTHGRLGKDIYKCRFCDMP FSVASTLEKHMRKCVVNANNKQQQQQVAAQAAQQAQQSQQQQQFDHHQQQ AAALXAVXSAFMSSLLQQQQHRRSPFTHSLPDSLSSGGGPASDLGPHPKE LQSTVSDS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s10:179450..194483- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000643-696490 ID=EMLSAT00000000643-696490|Name=EMLSAT00000000643|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=15034bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s10:179450..194483- (Lepeophtheirus salmonis) ATGTATAGTTATTTACCATATCATCCCAGAAACTTCCAAGAATCCCAAAA
TTTAGAAACAATAATTTCCCCTGCTGCTGCTCAAGAACAATTTACAGGGA
AGTGTGAAACCCTGATAGGTACAATTAAAAGGTTTCTTCTATTTATGTAT
AAAAACATATCCATTCAAAAAGTAAGGAAGGGTTGAGTGATTTTTCAGGC
ATAACATTATTGGATATTATATAAGAGKCAGCCAATGGTCAGTGGAGCTT
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ATAATAAGTGTGTGGAGAAGGGGGGAGGGGACCTCCCCCACAATATGAAT
GTATGTAAATATAAGGGGCAGATGTTGTTTTCTGCCCTGTTTAAATAATT
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TTCCGTCTTCTTACTCTAAAAAGTTATATAAAATATAAATGTATATTCTG
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TTGTTTATCTACAAACTATAGTCTTATCTTTTTTTCTTAACAGATTACTA
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GTTGGAGGAGATACTCTGACCTGCGGAGTCTGCCAAAAGGACTTTGCCCT
TGCAGACATAGTAAAATTCATACAACATAAAGTTCTCACCTGTAACAAGG
AGAACTACATGAGCAGTTCCTCAGTCCGTTCTAATGGAAATGAATCCTCT
TCGGATGAAGTGACTAACKCCCCTTTACCCACKCCCATCATCCCTTCTCC
CTCTCATCATCATCACCACCACAACCAACAACATCTCTCACACACCCCAA
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GTCACTGAACCACTTGAGAAGAATTCCGAGGATATGATGATGCTGATGGA
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GGAGAATAATTATATATATTTCATCAATATACAATAATTATCATAATTTA
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CTACCTATTTATTTTGTATGTTTGTTCTAGTTTTTGTTTGAGGATTATTC
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TAGGAAAAAAAGTATTTTGCATGCTAAACTCTCATTCATTAACAATATGA
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TGATTCCTTTAAATAATAATAATAAAAAATAACAAAAATAATAATTGTAC
GTAAGTGAATTCTTGGCAAGGTACAAAAAATTAAAGGTACAAAATTATGA
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TTTTTTTTATTTCTATGAAGCTTTTGGCCCCTGGTATGAAGAAAGGTCTC
TTTCCCCTTCCTCCCATATATATATATATATAAATTAGTGCTGGGGTACG
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TGGTCTAGTTCGATCTTGTAGTAAAANNNNNNNNNTTTGATACACGAAAA
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TTTTTTTTTMTAGAAAAAGTTWTTTGATGAAAAAATTAATATTTTTTTTT
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GAAAAATCCCTTTAGACTAAAAAACATTCGGTCTCGGACCCAGTCTCAGC
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ATCGATGACTACTTCTACTCGTGTGCTGTGTTTTATTTGACCAGATAATT
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TAAAATCCCCCCCCCCCTCTTCTCCTACTTACCATAAATCTCGATTAAAA
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AAACTAAATTTCAAATCTATGCAAATGAGCCCACTTCCCTCTTGTTTGGT
ATGTGTGTAGACGCAACAACATTTATCTATCTCTTAAACAGCAGCCCATA
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ATATACAATAGTATATATTTGCATCCATTCAAATAAGGGTAATACGTAAT
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TATTCTTTGATTGGAGAGTCCCATTTGAACGTATGTACTTCCGCTGAACT
TCCTTTTCTTAGAAAATGAGTAGTTATTATATATATATATGCTATATACG
AGTTGGAATTTTGTAGAAATTGTAATCAATAAAATAAAATGGGATGAAAG
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TCATATAAAACAATAAATGAATATTCATATCCGTAATTATATATATATAT
ATATATATATATTAAGGAAGTAACTATGAACTTTCTTATAGATGTATAAA
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GGAAAAGCGGGGTTTTTTTTCTAGTAGTATAAAACTATATTTTTTCTTAT
AAGATGTACAAATTGCATCTTTTATTGTCTGTTTGTACAAATTGTGCAGC
AACTTGTACGTAACATATATGACACTCTAAAGAGCATTTTTATATTTGAC
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GTAAAAGCGCTCGATGTACTATATAATAATAATAATAATCTATTCATCCC
TCACTAAAAATGATTAATCTCCATTTTTTATTCTATTTCTATAACACTAT
TATACTATATAGTATATTGTTTTTTTTTACATATATATATATGTACGCCA
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TGATTCCTATTGAGAAAGAGTCCTTCCTGGATACTTCCTTCCTTGCTGAC
TTGTTTGGTCGTTTCTCTACATATATATAATACATAAATATCAACCCATG
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AGATAATAAGTAAAAAAAAAGAAGAAGGAAATCGCACCCCCCCCCCCCTC
RCTATCAGACGTTCGATCAGACATATATACCTATATATACTATAAAATAC
TTTTTTTTGCACTTGTATACATATATGTACATATAGGGGATGAAAAAGAA
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AGACAGGTTGTAAGATAAATCTTAATTAATATTGTTATATATATTCTTAA
TTAGTAACTTGAATAACGACGCGGGGCTACGACAATAAATAACAGAATAC
ACACACATAGAAAAAGGGAAGGAACAAAATATAAAAACAGAGAAAGAGAG
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GAAAAAGGGGAGAGGGGGTAGCTTTGATAAATGATACTTTGTCTTATGTA
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GAATATATAGCTGACATATCAAAAAATACTCTATATCCTTGGTGGACATA
TGGAGACAAATTCAAATCCTTGGCAGTGATACACCTTTATTTGAAGTCTC
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TGCGGGTAATATATGATTATTTTTAATAATGATGCTTCGGGTACTACTCA
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AGAGAGCTAAAAGAAACCCAGCTTTGATTGTTAGCCATAACATGGCTAAG
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TGGTTGAAAAGACAGAACCATCCTCGTGATATAAAGTTATTAGGAGTAGA
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GTAACATGTATAAGCAGATAGTACACGAAGCAATTGCTATTCGTCTTAAT
TTTTTTTAAATTTAATTACACCAGGAGTTTGCTTAATAAACGCCAACTAT
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GAGCTATATGTACTACATATGTATAGACTAGTGATGTAACGGATCTTTAA
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TACTTCATTTTTTTTTTATAGTAAAAAGAGTAAAATCAATTTAATACCAG
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TTTAAGCATGCGAGGATACGATTGTACCAATCGTTAGTACAACTTACAAC
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ACATTTTCACATCTCAAATGATGACGATTTAGTAAAAATTCAGGAACCCT
TTTCATTGGTCAATAATCGCTACTTTTCTACGTATTAAAAAAAAAAAATT
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CCCTCTATCCGTGTCATCACTAATACATACACACAACAATGTATGATTGT
GGACTTATAAATTATCACCCTGTTTACATATAATGCGACTGAATGTGTTT
GCTGTTGTTTTTATTCTCTTATATATATGAACGACAACCATAAAAAGAAA
TTATATGTAATAATAACAGTGAGGATATTTTTTTATTTCTTACCTTCTAT
TAAATCAATCAAAGGTAAATAAATCCGCATTTCCTTGACCAGGCAGAACT
TGTTTCCTTTTCTTTCTTTTATTATTGTGTTGGTATTTATCCCTTGGTTT
TTTAAGAGCCATATATGTATATACTTTTATAAATACATATGAAATACAAT
TAAAGGGAAAGGCCATAGAGAAAGGGGGAAGGAATTATATATATATATAT
TTTACACCTGCAGTAAACTTTTATGTATTATTTTTTATAATTATTTTTCT
ATTAATAAGCTACTTTAGCTCGTAAATACTTTGATTTACCTTTTATATAT
ATTCTGTCTGAAAATATAGCAAGGAATAATTTTGATTTCTCTTCCTAGTT
TTTCACCAAGTTAAGGCTATTTTTTTTATTCATAGAGTTGAGTTTTTTAC
TGACGTACCAAATGAACACAGACAGCGCCTCCGAGGGTGAGGACATGTCA
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AAAAAAACCCGTACGGCTGTAATAATAGACAAATAAATGTACAAATATTA
GGAAAACTGCACTAATTAATTAAAACATCAATAAATATTACAGGATGAAA
TATTGAGACCTCTACTAAATCCTACAGGTAAATCCTAAAGGTATTCATAA
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ATAGTCCAAAAATAGCCTTAAGTTGGTTAAAAAAAAGAACGAGGGGGGGG
GGGAAAGAATATGCGTTACATACCTTTTTTTTGTATAAAGTTAGAAACAT
CTTGATTTTCCCCACCCTTTATGATCGGTAATGCAGAGTTTTAACCCTGT
TTTTTTTTTGTTGTTGTTGAAAAATCATTTTTTTTCTTATTAATAATCCC
ACACTTCTTTTTATGATTATTTCCCTTCTCCCTCTTACTGCGTCTTTTGA
CCTTTTTAATCAGAGTTGAATATCTTAACTAAGAAAGAAGAAAATGAATA
AATAAAGTCGTGAGTTAAAGGCCAAACAAACGACCCATGACTAAGATTAA
AATATTATCGTCTTTTTCACTATATTATATTGTATAGTGAGTGTTTGTGC
TTTGAAACCCCTGCAAGCAAAGCTTAAGCAGCATATTTCTTTGAAAAGGT
AAACGATGAGAGAATTATGTATGTATTATCGAATCCCAGTTAATTATTTT
ATCATGAAAAGATGGAAAGACGAGATAATTCTTTCAAAAAATAAAATAAA
AAAATATGTTCCGTTCTTCATATTTTACCTCCTTTGTTGTTTGGTCAACA
TGAAGTCATGCATATATGTATGACTATTGTTGTGGCGTAAACCCATTAGT
GTTGTCACGATACTAATATGATCGTTCCGGTTCCGGAGAGTATTAGAGGG
CTATGATCTTTATAGCTAGGATTGAATAATATKAAATATAAWAAAATATA
CAGKCCTGGTAMTAGCCGTAAACCGAATAATACTCGTGTGTACCTATATA
TTGAAAATTATATATTATATCCTTGCCATAGCATCCATCTCCTGGGGAGA
TGGAGCAACAGCTCTCTCTCTCTCACACACAGTCTGTGGTCCTCTACGCA
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TTTGTAAAGTGCACTTAAACGTCTTCATGTTCCCTCCTTTTCAAGGTCAT
GGATAGATCTCTGACCAGCTCCTTAAAAACATACATAACTTGGTATAAAG
AAATATTCATACATACATACATGTATGTTTAGAATGCTCTTCCCCAGTTG
CCACTCCTTTCCTCACATCGTCATGATTGCCACACACTCAATCCCAGTTT
TGTATATTTCTGATGATGATGATCTATGAGTCTATCTATTGATGATACAT
TGCTATATATTTATATAGATGCATACATATTATATTTATGCCCATTCGTG
ACCTTCTATATTAACGAATTTTTATTTATTTAATTTTTTAGAGCCTTTTG
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CTTCAACACGCCCAAAATATTCATGGTATTCGTCTTTKCCTCGATGGTCT
TCTCCCTTCCTCTCCAGAACGATCCATACTTCAACATAATATGGCGGCAC
TTGCKGCAGCTGCTGCTAGTCGTGGTTCCGTGAGACCTGGTACAGTTCCT
CATCCACCCCCTCCACATCATCCCGTTGTTCCACCTCCCTTTCACTCACC
CCTTGATCCACATTTCAATCTCTTAAAAATGAATGCTGCGGCTGCACATT
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TCTTCTAGTCACGACTTTCGCGTAGATCAATTAATTTCCATGAATCCTGG
TGGTATTGGTAGTGGACTCCCTTTCGCTACCGATAGAACTCCTCCTCTCT
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AGGTGGAAGCCTCACTCCACCTTCCTTTGGTTCTCCTACTGAGCCTAAAC
TTAATCCTAGAAGGTCTCACTCAAGTACTCCATCCTCATCATCTAATCCC
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AGGTAACCCTGAAAATAACAACAACCACCACCACAAAAGAAGTACCAGTA
GTAGTATTGTCAAGCACGACGATACAAATAACAACAATAATGATGGAGAA
AARCCAACCAATCTCKCCTCCAGCATCCTCAACAACAACAACAATGCTGA
CAAACAAAGCTCAGGATCTGTTGATGAGGAAATGTTGGATGAAGGAATGG
AATGTGATGATGAAGAATCTCAAAGACGGCGTCCTGGAGAAGAAGAGGCT
GAAGATTTGACCACTAAAAGCCCCTTGAATGCAACTCCAATTGCTCCCTC
CAATGCCTCTTCAACTCCAGTTTCTTCCACTCCACCGACCACAGGATCCA
TGATTGGAGATCTCATGAGTAAATTTGGTTTTAGTGACATTCAAGAGTAT
CAAGAAGCCTATAGGAAAGCCCTTKAAGAGTCTGGAKCCGCCATTAAGTC
GAACAATAATAATGACGTTATTCGCCCCAAGACTCCCAATCAAGAAAATG
GTGTTGATAAACTTCGACTTAGAGATGATATCACGACAGCCTCAGTCAAA
GGCACAACAGATCCCAATCCTTTTCTTCCTGGACAATTTGACCATAAAAG
GCTAAAAATGGATAGAGAAAATAGCCTATTTGCTGGACTCTGGATGCCCA
ACGCAGCAAACAACAACCAGGATGTCTTTAGAGCATCCTTTCCCAGTCAG
CGTAAGAAGTTAGACGTTGATATACCTCCTTTACCTCCAGGTGTAACCCT
CCCTCCGATGGAACCATCTGCTCTCAAAGCCATTGCTTCCAAGGGTCGTT
TATCAGCTTTATTTGACCCAAGGGCAAGAAAAGAGATCACTGGTCGAAGC
AGGAACGATACATGTGAGTATTGTGGAAAGGTCTTCAAAAACTGCTCTAA
CCTCACGGTTCATCGCCGATCTCATACTGGAGAAAAACCTTATAAATGTG
AATTATGCAACTATGCCTGTGCTCAAAGTTCCAAGCTCACCAGACACATG
AAGACCCATGGTCGTTTGGGAAAGGATATCTACAAATGTCGATTCTGTGA
CATGCCATTCAGTGTTGCTTCTACTTTGGAGAAGCACATGAGGAAATGCG
TTGTGAATGCCAACAACAAACAACAGCAACAGCAGGTAGCAGCTCAGGCT
GCTCAACAAGCCCAGCAATCACAACAACAACAACAATTTGATCATCATCA
GCAACAGGCTGCAGCTCTTSCTGCCGTCANCTCAGCTTTTATGAGCAGTC
TTCTCCAACAGCAACAGCATAGACGGAGTCCATTCACTCATTCCCTTCCT
GATTCATTAAGTAGTGGAGGTGGTCCAGCTAGTGACTTGGGCCCACACCC
CAAGGAACTCCAGTCCACTGTATCTGACTCATGA back to top
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