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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1100 | supercontig | LSalAtl2s1100:82576..119003 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000652 >EMLSAP00000000652 ID=EMLSAP00000000652|Name=EMLSAP00000000652|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=206bp
IISTGSVKILNLNVPDLIEVGTSDIELDCQYNYEEDEKVQLDIKWYFEND
PSPFYQWVPGQMDRPQVIGDTFKDHLDLNHSVSDKDDFKRYRALLIKEPT
VNLSGVYTQFDDSNALVTLEDEGHYDIIVHRLVDHSDIPSKTTFGCILTI
PGIDYEVREESVYYHRDGRRYMSERRRSGGAGLGKYPTHILLVLSLASLF
SDMMIF back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1100:82576..119003- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000652-696499 ID=EMLSAT00000000652-696499|Name=EMLSAT00000000652|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=36428bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1100:82576..119003- (Lepeophtheirus salmonis)
ATAATTTCTACAGGATCTGTGAAAATCCTAAATTTGAATGTACCTGATCT
CATTGAAGTAGGAACAAGTGACATCGAACTTGACTGTCAATACAACTATG
AGGAAGATGAAAAAGTACAATTAGATATCAAATGGTACTTTGAAAATGAT
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GTATTATTTACTATATGAAAATGTTGCTGAAATGAACAACCATGAAGCGC
ACCAAAATGAATAATTGATGAAATAAATGTTGCTAAGACGACACTTACTG
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TTTGTGCTGCCGAGCCATTTATATCTATGTGTACATACCTGAGCTATAGT
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TAGAAAAATAGAMATTCATATCGTTTGTTCGTTGAAGATTTTTTTTTATA
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GGAGATAAAGTGTAAGTTAATACTTCGTTTATTTATCGAAAATAGTAAGT
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NNNNNATTGTGTGTGTAGATATCCTTTATACGTTCTCACACCATTGAACC
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GAGGAGGTCACATAAGGGGGCTTATGCTATACCCAAAATCCAAAAACCCT
TTTTTGCAGCTCAAGGATAATAGATAGGGGGTTGAGTTATTTATCAAATA
GTGATAGGCGTTTCGAATACAGCTATACGAATTACTACATTTTTCTAAAT
TTAATCGAAATCAAAAAAGTTATGGGCAAAAAACGAAATCGTTGAAAATT
TACTATTTACCTTCCTTAACTGGATTGATACAGTGTGAAGAATCCATGAG
AATAAGAATTATAATTATCGGTGTCTTTTTAGAAAACAACAAATATTCAA
ATAATAATTATTAGTATATTTAATTATTTTCTGAATATTTTTTTTGAATT
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AAGCAGCTTTGAGAGGAATGAAATAAACACAAATCCAACTCGTATCTAGG
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TGCCCGTGTTAGAGGGAGGGGGACGACGACGACGACAATTTTTTATCAAT
AAAAGTAATACTGGCAATTTATAAAAATGTTCTAAATGGTTCTGCATATT
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TGGCTTCATTTATTACCCCATACCCAAATTAGGATTTTAGTTCATTTTAC
ATAGGACACTCAAATATTTATGACCGTTCCTGATATTGATCCTAACTTCT
ACGTCAAGGACATTTACTTATAACTCCCCAAGCAATCCTTAGTGTTAATC
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TTTTGTACTCGAAAATTTAACAATAATAAAAATAGCCTTGGAAAAGGGAA
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CTTAAAATTTACAACTCTGAATATTATTAATTGTATTTTTTTTACGTTTG
TTAATTACTTCTGAAGGGAATGAGGAACTAGGGTTTGTAAAGTTCTTATA
AGAAAAAAAAGACTCAAAATCAGTTGTTACATAGTCAAGCTTTTTCAAAC
GATGAAATTATTATTCAAATAGAGGTAGTACATGGCAGGMCCTGGAGCTA
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TCCCGAAGAAATCCTCTGTGTTACTCTCCGTTTTTCATGATCACACGCTA
GTGATTACTTTATACTTAAAGGCTCTCTTATCAAAATTAAATCATGATGA
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ACGCAAATCAATCCTTAGAATTTACAGCTTTAACTATACATTGTATGTTT
TTTATGTACATATGTTAATTTCTTGTAAATTGTATCTGCAACTATCGTTT
GCAGAGTTCTAAGAACTATTTCATATAATATCTTTCTTTGATTTCCATTG
TATTGCGGTAAAAACTAAGGCTCTTTTGTTGACACAATTTAACATGTTGG
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TGTCATATATTTGACATTCTGCTAAGTCATCGATAACCATATAAATAGTA
AAATAAAAATTGGATTGATTACAAAATGAATATATCGGAATCGGTAATGA
TATTAATTGTGAGAGATAATTGATTTATGACATTTTTTTACCCTTAAATG
CACAGGGTAGGTTTCTTTGATTCTGTACATAAGGAGTTTAAAATAATTTT
GTGCCGCTTATAAATATTTATTTACTTATATGTGGCGTGTTAACAAGCAA
ATAATCTTGAACAAAATCAAGAAAATGAGCGATTTGCAATAAATTAAAAT
CGTGTGTATTTGGGAATGTAAAAAAAAAAGAAAACGAAAATTTACCTGGT
AATCCGAATACTTTGAAGAACATCTTAAATGGGAGTAGCTAAGTTGTCAT
GACGTTTCATTAGATCAGCTACAAGGAGGGAGGAAAAGGAAATACTTGTA
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TTGATTCCAACAAGGACTACAATTATAAGTGAATGTTGTAGTAAAGGAGG
TTCAGAACTCAGAAGTTAAATAATAATGATAACATCTAAGAAAAATAATA
TTCATTCTTCAGATTACCAATTCAAAAAGACGGGCCTGCAGAAAAATACA
TACGATCTATATCAATATTCATATATACATTCGGCCCAATATATGAGTCA
ACTAGATGTTGTGTTTTCATATTTATGAAATAAGTTAGAATACCCAAGAG
TTTTAGTTATAGTTTATAACTTTTACTTGTTTTATGTGACTAAATTTGGT
CCTGATAAGGCCCCTTTCAAATAATTTTTTGATGATCAATTTTGCCTAAT
CTACATACAATTTGCATTGCCTTCAAACAGTTAATAATAGTAGTTGGTTA
TAGAAACTCACGATAATTCCCCAAAGAATACAAATATTATCCATTCTCAT
TTATTTAAAATAATAATTCTAGCTGGATTTTGTGTTGATGGGCAAAATAT
GTAATTTTGGACCTGTGAAAAAAATAACATTTTTTTAAGCWTTCTTATCC
ATCCGTATTTTCCCCCATGCTTTAAGGTGTCAAGAGCATTAATATTATTA
TTTTTTTTTTGGTATAGGTTTTTCAAAACTGCTCTGTAAATATAAAACTT
ACAATGTAATATTAAAGAAAACAGTTAAGGTGATGTGCKCTAAACGCAGG
ACCTATAATTTATCCGCTGATTTTTTTTTTTTTTGCTAAYAAGCTATTTT
GCAAATAAATATAAAATTTTTGGAAAAAATGATATTAATAAATAATCCAA
TTAAAGGGCATTTAAATAACGTTGACATGAAATCCTTCTTATGTATTTAA
ATATATTTTGTTTATATGCCGTCATTAAGTCATAAGTCACAACTTATATG
TACATACATTGTATTATGCAATATAATTTGCATTATATCCATTAAACTTT
CTAGAAATTTTGCAATAGTATGTAGAAAAAAATCAACTTGTGAAGTATAC
ATTGTCTGTCATTCCATGATTTCCAAAACCACAGATTTACTGACATAACT
TCTTGCTAAACCAATCATAAATAACATCAAATTATTATTATAATAATACT
ATTGTTATCATAATTTTGATATTTCATTTTGTATATATATATGTTAATGT
ATTTCAAATATTCCTTGCTTTTAATTTGAAAGACTCTCTTTTCCATCACA
TTTATGGAACAGGTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
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TTTAGGGAAAATTTCGTTATAGATTTTTGAAAGATTTTCTTAAATAATTA
TATTTTAGATAATTTATTTTGATAATTAAGAATCTTTATAAGATTTTAAA
GAATTTTGTACTTTAATTTATTTTTTTTCTATTTTTTTCAATGGTAGAAA
AATTATAGAACACATCAAAATATAGTCCAACATTTATTATAAGTCAAGTA
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TCAGAATAATTCGGGAATAAAATATAACATTTTCTTTTTCATGAGATATC
GTGTATACATACAGCCTATTTGGTTTTTATAAACTTATTTTGGTTCATTT
TGAGCTTCATATTCCGAATTACTCTTTAATGTTTACAATATATAGTTTAA
AAATATCATTTGATCTAAAATWCTTWTTTTGGCCCGATATCCCCCCCCCC
CATCGTTTATAATTTATTATATCATTTTTGTTAACTATGACAGAAAGTTT
TTGCAAAAATTAATTGCAATTTGAGCTGCTTACAAAGGAATAATCAAAAT
ATATTTTATTAATCCATAAATATATGTAAATTATAATATAGTTTAAGACT
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TAGTGTTGACATGATTTTTTGATTATTGTTTTTTAAAAATATATTATATA
ATTTTTTTCCAGCTCCTGCTTCCTCTGTTATATTTGAACAAGATCGTTCG
CAGAACGGGCATCAAGTGAACATCACATGTCACGCAAATGGAATCTTTCC
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GATAAGAAAAGTACTTACCGGGTGATCCGTAAAATCTGAACACTTTGAAT
TAAAATCTTATAAACGTTAAAAATATAATTTATAATTTAACAAAATAATT
TCTACAAAATTAATAGGATAAATAGATACGAGTCTGAGTTATTTAATCAT
TAATGTAGATCCCCTTAGTAGCAATAATGGTTTCCAGGTTGCGGCAGAGG
GCCTGGCGCCCGCTGTGGATGKTGTCCTATATCATGATGTCCCAGTGCTG
GATAAAAGTGGCATTGAATGCCTTGGTGTTTGGATGACGAACACTGAAGG
CCTTTTCCTAGACAAGAAACCAAAGTATGTTGTCGAAGAGGTTGGAATCA
TGGCTATAGGGGGCCAAAAATGTCGAAAAAGAGTCTTGTAACGGAGGAGA
TGGGTTTCTAACATTGCTGGTGTCAAAGGTGGCTTCTCCATCCTCAAAAA
GTTATTTCCACACACTTTTTTGATAGATCTCTGGACATTTTGGAATAAAA
CCCTGAGATCTGTTGCATGTGTCCACATGGAATTGAGGGGATTGACCTGG
GCTGTTTTCTTTAACTCCTGCAGGTCCAGTTTGTCCTCTTTGGCCGATCC
CTTCTTCCTCTCCAACGTTTCGGACTTACTGCTGACGGCGTAGACGGTGG
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GTCAAGCGAAAGAAAATTTGTCGATCACGTTCAAGTGTCATTTTCTCAAC
TTGTACTTAGACTAGMGAACTTGGATTTTTTTGCAACTAATTGTATATGA
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GACCTCACATTCAATTTTTTCTTTCTCGTTTATTTTTTAGTTCAAAAAAT
AATAAGGCAATTATGTTATAACTGTTTCGACCAACTTAAGAAATATAATT
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TTTCAAAATTTAATAGCCAATTCGACGACAGCAATGCACTTGTGACTCTC
GAGGATGAAGGGCACTATGACATTATTGTTCACCGCCTTGTTGATCACTC
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AATGGAAATTCAAAGGTGGATACTGATTAGAAATGATTATTTTAGAAGGA
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TCGTTAGTACAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTATCTCTCAACCT
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TTCTTCTTCATAATATTCATCCTGGGTGGTGGTGACTAGTGAGTTAGGGT
ACAGAGTGATGCTTGAATAGATGTTGCCTCATCTTTTCATGTGATGATGA
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ATTTTTCTCAAATACTTTATGATCAATTTTGTTAACAAATATTGACTGGT
GTTAAGGATTATAGTGCTCTACAATAGAGGACATTGGTATTTGAATACTT
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TGTAAAAAAAATCCTTTTTAGAATTATAACAAAGAAGTTTTATTTCTTAC
AGAAACCATCCGATCTAACCCACAAGTGTAAGAGGTGAATTTCTGAAAAA
TTTGTGTTTTTTAAAAGGTTTATTCTTTTAATAGGCACATTTTGAGAACC
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TGCATACTAAGGTTTTTAAAAAAATTCTCCCGAAAAATTGTAATTGAGCG
GAATCCAGAATATAACCGCATCCCCTTAGTAAATGATAAATACTATGAAA
TTTAAGCATTACTTTTTTAGTGTAAAAAAGAAATAATATATTTTGAGGTA
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GCACGGGTCTGTTTTTTAGATCCCGCATTCTTTTTTTAATTCCCCAGCCT
AGTCCAACCCGCAAAAAAGTAAACTTAATAAGTAAACTATGAATTAACTA
ATGTTTAGCTGAGGGTGGGATCGTATTATTATCATCGTAAACCCTTTGTG
CAGGGGTTCGGTCCTTGGCCTTCCTAGAGAAGTAAATCTACTTAAATTAG
TGAAAATACATTTTTTCTACTTAATGTACATTTGTAGTGTCTTCAAAGTA
TTAATGATAAAAGGTTTTTTTATAGAAATCGACGATAATTCGTCAGAGAA
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TTGTGTTGATGTGCCTCAAATAGGAATTCTAACCTAGTTTTGATTTTTTT
AGAAAGATGAATTCATGTTTTATGGGAAAATTTAATTGTAATAACGTAAA
TATTTGGAGTAACGTAGCTCAATTGACAAGTACTTGGTAGAAATGCATAT
TTTTAATTAAAAATATAAACAAAGTTGTTTTTGAGTTCGATAATATTTAA
CGTTCTAATTCATAAACTATATTTATTAAATGACCTTATATTTTGAAATA
ATAAAATGCAAGATTTTCCGTGTTTGTAAAACCCTGACAAATCCCGGGAA
AACGGTATCCCAAGAGAGAAACCCTTTTTATATACTTTATGTACAAAACT
TCGACTCACAAGAAGAACGAAATCGACTCTAATGGAAATAATTAAAAGTA
ATTAGACTTCTATGTTTATTATTTATTTCCATGCATCGTCCACATATTTT
GCAGAGGGGTTAAATGAGTGAAAGATTAATTATATATAACTTTTTTTTGT
GAAAGTGGCTATACTCATTTAAATATGATTTGAGTAGTACGTGTACAGTT
TTTACTTCCATATTAAGGAAAGACATAGCTCAGTTATCCGAGTTTAAAGC
TTTAAAATAATGCGACGAAACGCGTCTGTCTGCATAAATAGATTTCTCAT
TATATTGATAAACTTTAAACCACGTAAAAATATTACTTTTTATTTGACTA
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CTGAAGTAACAAGTTCTAGTCATTTTTAGATAGCTTTAAACGGTTTTGTG
GCTAATTTTTAGTTCCTAAGCAATATAATAAGTGCCCACATGCCGTTTCC
ATTATTTATCGATACTTTCGKCATCCATATCACCAGAAAGGAACAATTAG
AATCACCACTTTGCTTTTGTATTTGATTCTATATTATGTCCATAAACAGC
ACAATTTTTTTGCCAGCCTGTTCCGTCTTTTCACCTTGGTCGTAGTGATA
CTGAAGAATGCATCGATTTTTCTCTTTATGTACTTCCATTTTGGAACACT
GTAACACACAACTGGCTTCCCCAAACACAAAACTGTAAATCAACTTTTTT
TAAGTGTACGTTTAACCTTTAAGCATAATTTCAGCTTTTTTTAATAGTGA
GGTCAGCTCACTAAAAACATTAAGAAAATTTAACTTATCCTTACATATAT
GATAAACATTTTCGGGACTTTAGGACTTTAGATTTTAGGGGCATCAAATY
CCATAAAAAGGGGTTAACAACGCCCTTTCTCTCCCTAGTATAACAAAAAT
CATCAACTTTTGAGCGTTTCAAATCCCTTCCACTTACCAATTATAATAAT
TTTAAGATCCAATGTATGTTTAAACTGAAACCTTAAACCTAAAATATTCT
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CTTTTAAAAAATAAATTATAAATATTAGAATAATGAATAATTTTCATATA
ATTATTATTTTCAATAATGTCTACATAAATACAATACGTATTGTGTTTGA
AACAAAAAGAAATTGCGTCGATAGTAAACTCATATATATATATGGTGAAG
AATATAGCAATATAATTCATGGGTTAACTTCGTCACTCTAAACATATTAT
AAATAAGAATCCCTATGACTTTCATCCTTCTTTCGTTTCCTGGGGTGTTT
ATTCATCTAAAGATTAAAATATTAGTTTAAAATCTAGTTGTATAATATTT
TTGTTATACATTCCATGTGAATTCTTAATTTATCATTTACTTGACGCAAT
TCAAGCGATTATTCGTAGTATTACCAATAAATGAGGAACAAAATAGGCCC
TGTTTGCTTGAGTACAATCTCAGRGAATCTAATAAAATCCTATTTATAGT
AAAATAATGGAAATAATTGATTTTGAAGTTATTAAAATTCAAAATATTTA
CCCGAGAAGTCTTATCTCTTTTTTTTTTACTCATGGAATAAGGTTTCAAA
ATGCAGCGACGAAAACTGTACGGGGGATCAAAAATTTAACAAGGGTTTTT
TATGCCCTTAGGTATAAACGACTATACATAGTATATCACCAAAAATTAAT
ACCACAAATACAAGGCATTTTAATACAGCAGTCGTCAACTGATTGTTCAC
TAACCAGTTGTGATTTAAGGAGCTACCAAGGTCACCGACRTCGAATTCCA
TGCTTATAAATGAATACTCTGTACAAGCATAGACTAATGAATCATTTCTG
GCATATAACCCGAATAGAAACATTAAAAAAAGTATGTCTCTGCAAAAGTT
CAGTAACTCAGGAAGAAAAATTAATCAGGGTTCATAATAAAGGTGAATTT
TAATTGAACCATCCTCATAGGTAATGTAGAATATATAGTTGTATATTGCA
ATTTTGTTAATCAATTTTTTCTTCTTCTTAATTTGCATGTCAACATGTTA
TGCAAARATTTTCTTTTAATTAAAAATATGACTTATATGTCTTGTTTACT
AGTGTTGTTCCGTATACCGGTATATCAGAGTTYCCGGAATTGGCTATTGA
AGAGTGAGAGTCAAAACATGCTCCTAAATTATGAAAAAAGAAAACTCATA
ACTAATTAACCAATTTAAGTACTATATTAAGCTATATTTTAATTCAGTGC
GTCTTCCCTTCCAAGAAATATCAGTCTCGACACCCCGGCGAACAGATTGA
AATTTTTTCACTTTGAAGGCCGTGTCAATGGAGTACCACACTGCCATGAT
AATAAATCGAAACAAATCTAAATTTAGATAATTCAGAATTCTGCTCCAAG
ACACCCCTAACTTCAAAGACCAAGGAGTTGAGAGATCAGGGCTGAAGGAG
GATTARATAGAAACAGGCGGGAAGTCAGCCATATTGTTGCTCCAGAAGTT
TTAATTCTTCTTGGTTGTGTGGGACTGTATTATTTTTTTTGATTATGTAG
GAAGTCCGGATGAAGATGACAACGGTCTTTGCATCCTCCTTGGCACTTAC
ACTGGCACGGAGGATATAGCACACAAACTTTGCCTCTTATGCTYTTGGTC
CAACATTTTTACACTTAGAGACATGGGATAAAACAGAAAGTTTTTTTTTG
GTTCCATTTTTGGCATATATTTGCGCAGGGACCCAAAATTTGCAGTAGCA
TTTTATTAAAATATAACATTACGAAGTTTCACACAACTACAGCAAAAAAT
AAAATAAGCAAGTTTAGTTTTTATTCCATGTCTCTAAGCGTAAAAATTTC
GGAGCAACAACAATAGACAACGCGTGTATAGAATACTCTATTTGGACCGA
CTACGACAAAAAAAAAGTCTAGTACAGCCCATTCATCACAGAAGAACCAA
TAGTTTTACAGGAGCAATATGGCTAATTTTTGACCTACCACCATGTCGCC
CTTCTTCAGTCCTGGCCTCAACCCCCTAGTCTTTNGCGGGTTTGAAACGT
CTCAGGGGAAAATCTCTCCCACACTTATCATCAAAATGTGGATTCGCATC
CAGCTGCAACCATGACAGTTTAGTGCGCCATGGYAACAACATTCATTTTG
AAGAACCACCAATCAGTTTGTTGACTTGTTGAGGCAGGTTATTGTTTATT
CGAGGACACATYGAATAAAAAATATTGCTAAATTTAGTTTCCTGTAGGTG
TAAAACCCTAAGAAATTCTGGGATACCGAAGAAAAACCCCCCCAAAAAAA
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GTTTGAAAGGAGGTTGATTGGGTTCTTTTCAACACATTTTCAAATCTTTT
GCACAGAGTTCTTTTTTTAAAAATATATTAAATAAAGAAAAAAGTAAAAA
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CCCAATCAAACCCATTATTATTAAATATATTCTCTTCCCCCCTTTGAAAT
GGTTCCATCAAGAAGGTTTCTTCAGGTATATTGTACGTAGATAAACAATA
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ACTCAGTCCGAGGCCACTTTTATTCAGTTCAGTCTTAAATGATTTTCTTA
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CTTTGTGCACTATTTACAAATCTGTTAATAGTTTTTTCATTTCATATCTG
TTAATTGATAATTTTTGATATCATTTTTMGAATATTTTTAGTTTTATAAG
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