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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1107 | supercontig | LSalAtl2s1107:82553..208941 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000681 >EMLSAP00000000681 ID=EMLSAP00000000681|Name=EMLSAP00000000681|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=460bp
MIQSSSGPRCCSIECRDCTVSMTAGRSISANSMSGVVLRGEKEKNRKSKA LSKVQKIKKRLSQSFGKLALSSKDVSSLSTSTSTTNEKPPTPSKLNKLRY AGYSAEFLDRVEPNGNIPHERFSGWERLHGSSEEGSCASRKNGSWXNPDH QNCTVTRQLSVSSDSKLLEDEINEEMKKNSVIIRPKKPPRPKSEVYLNQV ASSDKRKSKRYSAFGVEKLANDVKSRNCLEYQNDITEVMRGTVLRWLIAV NRQFDFTLETWCLSVNFLDRFLCQQALNRDCLQLAGLTAFFLAAKQEEVD PPEISELVTLCARSFERKHFRYMEYILLNHLHFDFLAPTPSYFLLYLVEM EKLSSTWPYWISRHVIERILCDYTLSRKLPSEISHAVFEVFSPISNSFVP ETGESKLDPRIHLNPLNTSYEGHEDLINDYYCKVVDKLIKQEGPEESTDK EDEIEKSSLL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1107:82553..208941+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000681-696528 ID=EMLSAT00000000681-696528|Name=EMLSAT00000000681|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=126389bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1107:82553..208941+ (Lepeophtheirus salmonis) GGGGAAACGAGATATACTCGCTCGCTCTTTACGTTGTTTTATTCTGTGTT
ATTTTACTTAGTATCGTTGTTGTTTGTGAACTATGATATGAAAAATATCC
AATTATTTTTTGTTAAATCATTGTATTTCAAAAATATATTCGGAAAATAA
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GGATTAAAGGGAAGCTAGAAAAGAAAAGAGAGATCCCTTTAAATTATTAT
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CTTTTTTTTTTATTCAAATGCTTTATATCATAGCTGAACTTATATTTAGA
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TTAGATGCCATGCTTCACTAATATATAATTATTCACACTAAGTCAATACT
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ATATATAAAGTATCTAATTATATTGACTCATAAGTAATTAAATTTTATGT
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AATCGACATTTTTTAAAGGCAATTTTCTTATTTTTTGCCCGAACCCATTT
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CAAATACTTTAAATTGCATATGATGTCAATATGCAGTTTTTTACAGTTTT
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GACCGAATTTTTCTATATCGCCAATCCATACCAAAGTTATGAATATGATA
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CTTAATAAACCATTGACATTTTTAGGAAAATTAAAGGATCGATAAGTGTA
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AAAAAAATATTAATTAGAAAGGCTTAGAAGTTTCTTAATCTCTTTGGATT
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AATATGTACTCGTATATATATAAATATATTTGTAAAAGTCAAGTGTTATT
AAGTCTTTTAGGGATAAAGAATTAGTATTGTGCACATAACATAACCCCAT
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ATACTTTTTGTTGTTGGCAACCTGAAGAACATAGGTGTTTTTTTACAAAG
TTTTTTTTGAAGATTAACATAGGAGTAATTCCTGCAAATCTCTGCTCGAT
ACGACGTCGTATTTGTGTTTATTATCTTCCTTTCATAGCTTTCGGATGTT
AGGCTTATAAAACATAAWAACAGCTAAGYTGTCCACTTTTCAAACATTAT
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TTTATAACACTTATTATTCTGTTAATAAATAATTACCATTAGAAATTCTT
GGTTTCGAGTGTTTTCATTTGTTGCCAGCATTGTTCATGTCCGCCATCTT
GGATGACTAAAAAACCAAAATGGTGAGCAGAGTTTCCCAAATTTTTGTGC
ACGACCCTCTTTTATCATAGAGAAACTTTACAAACCAGCATTTATTTAAT
TTATAATCATATTTTCTTCATAATTAAATGTATAATTGTAATTACAAATC
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ACCCTTAAGATGGCGTCACCTTCAATTATTATGTAATGTGTGACTTCAGT
AAAAACGATGTAAACTCTTATATACAAAATGTATGATATATATTATGTAT
GACTTGTCTTATGACATTAGAACTATATATGTGTGTCCAAGGCATAAGAA
ATTGATTGTTATGCTCTTTTTTGACCATATTTTTTCACTGCTCATTGCAC
ATAATATATACATGTCCCCATTTATGTAATCTTAATCATGTTTATATACA
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ATTATTTTTCCCCCTTTTCCTGCTGAAAACAATCAAAAACTTACTTTGTG
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GTTATAAAAAGGGATTTTGGGCCAAAAATTGACCATTTTTAGCACTTTTG
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GGATATCAATTTTGATACTGAAACCTGTACAAAAATATTGGTATCGTAAC
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TAAAATGTTCATATTATAATGTAAACAGGGATATTTTTTGCACGATATAT
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TTTTATATATGAATCATAATCATCATTATGCAAATTGAATTTACAGCATT
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TTACACGTAGTTACCTTATACATAGATATATATTCTATCCTCAAGAATAA
AATAATAATAATGACAGCTTGAGAAAAAAAATAGTATGAACAATCAGCCC
GACTATAGAGCGCTGCCTGATTGAGTCTAAGCTAAAGTCTACATTGTTAT
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CTCATTTGTTTTATTTACAATCATTCTTTGGCTTGTGATGATATCATTTG
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GACCTTGATGATGAAGGCTGTGCCCATGGCAAACCCTGCTGTCATAATGG
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TTATAGCTTTAGTGATACTCTGTTTAATTTTTTATCTTAATGTGTTTTTG
GTTTTTTTAACAATTGATATATATGGAATAGAGTAAAAGAGATGCCGTTA
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AGGGGTCATGTGGAAAAAAGCATTGATCAAACAGAAGGACATATTGAATT
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GGAAATTTCGGAAGGAATAAATGGAGAATCAATATTAATAAAGTCAAGTT
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GTAAAAATGAATTTACTCTCGCATGCTTATTGTAACTAGCATACGGGACA
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TGTTATTGGGGCGTAATTTTGTATAAAAATATATTCATGGATATAATTCT
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TATGTGAGTGATACTGACACGTGAGCATTATTTTGTAAAGTTCAAACCAT
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CCTCTCAGCTTTTTTTTTTTTTTATCTATGCAATCCTTTTTACCATTCAA
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AGATTCAGGATCGGTTGTACTCGCCGCTTTCTGTAGTTAATGCAACACTA
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TAGAAAATTAAGGTTTTCCCGGTTATCAACGCCCTCTACATACATGGTTT
CATTATCAATAATATTACATTCAAGTATATGAATCAGCTCAACATATATA
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TCATTATACTTAATTCAGCCTTAATTAAAATATTATCATTCTTATACCTA
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TTCACTGCTTCATATATATGATAAAGTAATTTATGACTATTAGGCGACTT
TTGCGTCCCATTAGGACGCGTACTTAAGGTTTAGTAAAGAGTGTCGATCT
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GAGAAAATTCCACAAAAAATTAGGAACTTCTTAAATTTATCTCAAATTGT
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AGATACCATTGGCATCCCCGTCTAGAATGCCTACAACATCAATAAGTCTT
TGACAGACCCATACAGCCATAAAGAACCGAAAGTTTTGCTGCAAAAATAT
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