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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1108 | supercontig | LSalAtl2s1108:38291..50403 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000683 >EMLSAP00000000683 ID=EMLSAP00000000683|Name=EMLSAP00000000683|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=697bp
MCGIFAYLNYLTPKTRAEVLGFLIKGLRRQEYRGYDSAGVGIIGDDGSIE LIKKRGKVADLENEIASRASELGMGSILNVHVGIAHTRWATHGVPSCVNS HPHRSDDQNEFVVVHNGIITNYKDIKQFLMAXGHVFESEXDTEAIAKLVK HIYHQNPSDGFRQVVEKCAKQLEGAFALCFTSVHFPGEIVAARRGSPLLI GIKTSTILQSDSIPVQYSVEDEASRHNHSGSEVAKNLASPLSMRKPCHTR FRMDSASDTEEIAPADPHEAMEYFFASDASAIIEHTNRVIYLEDDDIAAV KDGILSIHRVNQMINEKTQRDITTLKMEIQEIMKGNFASFMQKEIFEQPE SIVNTMRGRINFETNTITLGGIKDYIPEIKRCRRLLMIACGTSYYSAIAT RQLLEELTELPVMIDLASDFIDRNTPIFRDDVCFFVSQSGETADTLQALR YCKKKGALIVGITNTVGSSISRESHCGVHINAGPEIGVASTKAYTSQIIS LVMFAIVMAQDRISLLGRCQTIIQGLKSLPQLIYKVLEQESKIKEIADML HEKKSLLIMAXGYNYATCLEGALKVKELTYMHSEGIQCGELKHGPLAMVD ANIPIICIALRDNVYTKCMNSIQQVTAREGRPILICTEGDKETQKFSETF IEIPETVDALQGILSVIPMQLLSLHIAVKKGCNVDCPRNLAKSVTVE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1108:38291..50403+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000683-696530 ID=EMLSAT00000000683-696530|Name=EMLSAT00000000683|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12113bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1108:38291..50403+ (Lepeophtheirus salmonis) TTAATTTATATTTACTACTACTTCTAAAGTTGTATATTACTATTACAACC
TTTTCCTCTTCTCTCTACTCAAGTGATTCACTTTTTTGTATACAGCCAAA
CTTTCTTCTACTTTCCAAGTCACGTAGCTAGGCATACGATTCGACAAACC
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GTTTGTTTATTCATTTATCTTTCATTTCTCAATAAATACATTTCTTAATC
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TCCGCGTTTCTTTACATTCATATATTGAGGTGTTTTTTTTTGGTGGATAT
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GTTATTGTTATTTGAAGAGTATCAGTTGTGGAAAAAATTAAAAATAGTCT
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CTCTATTCATAGAGTTAATCAAATGATTAACGAAAAAACACAAAGGTAAC
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AATATGAATTGTATATACATTATTTATGGTCCTGTGGTTTCTCATACTTG
ATATAATCATGATTAATTTTAATGATTATTAGAATATGAAATTGAAAAAT
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GAAAATGGAGATTCAAGAAATCATGAAAGGAAATTTTGCTTCCTTCATGC
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TATCCCTGAGATTAAGCGTTGTCGTCGTCTATTGATGATTGCTTGTGGAA
CGTCCTACTATTCTGCTATTGCAACTCGTCAATTGTTGGAAGAATTGACG
GAATTGCCCGTAATGATTGATTTAGCTTCTGATTTTATTGATCGAAACAC
TCCCATCTTTAGAGATGATGTTTGTTTCTTTGTGTCTCAGTCTGGAGAAA
CAGCAGATACTCTTCAAGCTCTTCGTTATTGCAAGAAGAAAGGTGCACTT
ATTGTTGGGATCACAAATACTGTTGGATCTAGCATTTCAAGAGAATCTCA
CTGTGGAGTTCATATCAATGCTGGACCAGAAATTGGTGTTGCATCTACAA
AGGCGTACACATCTCAAATCATTTCATTGGTTATGTTTGCAATTGTTATG
GCTCAGGATCGTATTTCCCTTCTTGGAAGATGTCAAACCATCATTCAAGG
ATTGAAAAGCCTTCCTCAACTCATCTACAAAGTCCTTGAACAGGAAAGCA
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ATGGCTARAGGCTACAACTACGCCACTTGTTTGGAAGGTGCTCTTAAAGT
TAAGGAACTTACATACATGCATTCTGAGGGCATTCAATGTGGAGAATTAA
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GCACTAAGAGATAATGTATACACAAAATGCATGAACTCCATTCAACAAGT
AACTGCACGAGAGGGCAGGCCTATTTTAATCTGCACAGAAGGAGATAAGG
AAACACAAAAATTCTCTGAGACTTTCATTGAGATCCCAGAAACAGTTGAT
GCTCTTCAAGGTATTCTAAGCGTTATTCCCATGCAATTGTTATCCCTTCA
TATTGCCGTTAAAAAGGGATGCAATGTGGACTGTCCAAGAAATTTAGCCA
AATCTGTCACGGTAGAGTAATTGGTTGAATTAACTTATTGTTATTTTTTC
AGTATCATTACCAATTTTATTATTTCTCTCTCTCATTCCTCCTCCAAGAT
TTGTAAAATAAATCTACATAATATATTACAAACGTTAATATACAATTCCA
TGTACATAATGCATATGATATTTAGTATTTGTACATTTTTGTAAATAATT
TGTATTAAAGCTTTTTATTTTTATAATTGTTTTACGTTTCCATTGTTACT
TTTTTATATTAATTTTTTTTTAAACCACTGAATGTCATTGTATGAAGTTC
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AGGTAAAAAGCCT back to top
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