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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s110 | supercontig | LSalAtl2s110:425431..436219 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000694 >EMLSAP00000000694 ID=EMLSAP00000000694|Name=EMLSAP00000000694|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=328bp
MTKDVISGENDLDKGGPFLIGDEAILGGRTLFAFTFCLRDLASRGQKRIY
SIFILLHDHFWLLQSINFIYGTFKQMSMRFQSKANELFDTQDSSKLKNLS
HLLGDENLYVRLHRQFIGILKIIGKNFQDTIHHGQPLEDIYVSNKEKEEL
GYCDFKEIFDLLEPQNQKLLIYRLLTNRGVVIYGENMNQLAKVLSLLSIF
LPHHSHAKLKSNSSGSLGILDGNEISIHLNTNMTFSELNSYLPSPLPVLV
LRIINILQKTSYLNGESIHKHILHLREEIFGLSKLYYIIQFTANKDKLKT
VLRAMNLSYSDKEVLEIWSQYLRSSFRS back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s110:425431..436219+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000694-696541 ID=EMLSAT00000000694-696541|Name=EMLSAT00000000694|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=10789bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s110:425431..436219+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTGCAAATTCTCAAAGAGGCAAAAATGTACGGGTAAAGTTGCCGGTAGCG
AAAATGTTCGTGGCAAAATTACCTAGAACAATTATAGTGATCAGAGTTTG
AATTTATTTACACACCTGCACATCACTAATTTTGAGGCTCCCTCTATACA
ACAAAACCTCTCATTAGCTCTTTTACTATCATAACAATCCCTACTCATTA
TTTATATACTGACAGTATTATTAATAATAATTGTACGTCATTTCTATACT
CTTGAACCATTCTGTGAAAATGTCTGAATATAGTATGGTCAACACCTCAA
GCCTCAAATTAAAGGGGGTCTCGGATAGCGGGAAAATGTAAGTTTAACTT
ATTATTTAAATATTCACACATTTGATATTACAATTATTAATAAATATATT
TTTTTTTCCAGAAAAAAGAAGAGTAAGGTAAGATTGGATATCCGTAAGGT
CCGTTTCTCATGTTATGCATGCCTCAAACCCTTTTGAATAAGGAAGTTAT
CATGGTGTCAATTTGGAATTGAATTTGACATAGTTTGTAGCAAATGATGC
AAAAGCAAGCCACATAGGTGGATTTTATTCAAAATAGATTTTAATCGGGT
ATGGTCTATCCTTTTGCCAGCACGTCTCTTTATATCGTAATTGGAGACAG
TTAAAGTTAAGAATCAATCATCGTGACCTGTATATAATTTAATAATAAGG
AAAGAACTTCGCTAAGCGAAGTGAATTATATATTATGACACTGAAAGAGA
CGGATTTGCACGCTACGACTCCCGTACGAAGTTCCTGAAAGTAATTATAT
TGTCAGCGTTCACGATAGATACAAAAAAAAGGAGTGATACTGAAAGAGTG
TTTTTATATATTATATTTGATATACTTTCCAAAACCAATCATAGAAGTAT
GTCAAATATGAAATGTAAAAACACTCTTTCATACATTAAATCAAAGAATT
ACAAAATATTACTTGTAATGATTTTGCTCCAGKCCCTCGACATGATGAGT
ACAAGCCAATCATGTAGCGATCCACTCAACCTCCAGGCTCATTTCTCAGT
TCACGGGTCGACTCCGAGTTCCTCTCCCCTAATACACCATAAGAGACGAG
CTCATCTTCCTCCACATAATGAGATATTTCTAAGGTGCTAATTGTCCGAA
TAATTCGGAAGTGTCGAGATGCTTCTCCTCCTATACTCTAATATTATAAC
ATTTGCGTAGCTTCGCTTATGATTAAAAGGTTGCAATGATTTAATTTTAA
CTTTCCGCTTACGTTGTCTCCAATTTCGAGATATAAAGAGAACATATCGT
GGGGTGAGAGCCAAATTGTAGTAACTCAAAAAATTAATTTTGATAATTAA
GAATATAAAGTCCATACTTTCATTATGAAAAATGGTGTTTTCCAATTTTT
ACAATGAAATTCATTTCAACACTCTGAATTTCTCTGTTTTGAAGTATTCG
CATTAAATATTATACTTTAAGGATGACATATAGGCACGAGAACATTAAAT
TGCATTGTAATTGACGAAGACGCCTAAATAGGTATTTTTAATACATAAAA
TGAACAAATTTCTAATAAATCTTAATTAAACTCCAACAATTGGGTTTATA
AATAAAAAAAGACATAACTCTTGCATTGAATAATGTTTTATATCAATGAT
AAACAGTGATAATTAAATTAAATCAAAGTATTTTCTACTGATTATCCCTA
AAAATGTTTAGATTTGTAGTATGTTCTTTTTTTCTTATGAATTTGGACGA
GAAAAGTAGAATAGTTAATTATGCTCAATTAATCATCTTTTATTTTTATT
GATAAATTTATATCGGAGTATATTAAAGTAAAAATAAATCAAATGAAGCC
TTTCAGCTACAGCTAATGTTCTTTTTCATCTCATGTTCACTCCAGAAATT
GGAATATTAAGCAAATAATTGACCGAAATATGTCAATGAAATTGTATTAG
GTCCTTAAGTACAAAAAATAAGTTTGAAATATTTCACTCTTTGTTCACGA
TTGCTTTTGTATTGACGTATCACATTAATTTTTAAATCTTATTTTATTTA
TTTATTCTTTTAGAAGAAGAAAAAGTCCAAGGATCTGCAGCCTTCTTCCT
CCAAAGGCGACATAGAGCCTCAAGACCCTCAAGAAGGAGAGACTGACGAG
GTTCCATCAACATCATACTACAAAGGGAAAACCAAGTCGGAACTACAATT
TTTAAAAAAAAAAGAGAAGCTAGTAAGTAATTATAATTATGTCAATTATA
TTATTTCTCTAAAAGATGAGTATTGTACAAGTTTTCTTGCTCCTCTGACG
AAAATTTGGGGATGAAATTCACGCTCACAATGGAGTGAAATCCCTCTGTT
AGTTGAGGAGGCTCAAATTTATTAGTGTACTGATTAAATAGAATTTCGTT
GACCTTGGCGTGTTCCTCTCCGATGAGCTCTCGAAACAGGTTGTTATGTC
GAGCATGGGATGGATTCGTGTTCATAACAAAGCATCGAGCTCTAACATCA
TCATACTTTGCTATTATGTTGAGGTACTTGGCGCGGGTTGCGGCCTCTGG
ATGCGTGTTATCAACAATGACGCTCTTTCCGCTAGATAATGCATTCTGAA
GAATTTTGAGAGTCTTCTCCCTATTTCCAGAAACGTCATTGCTTGCGTAA
ACATAGTTTTTAAAATACTTTCGCGCAAAGAAACTTTTACCCGAGCCCTG
CATTCCAACCATCATGATGACTTCTTGGGTATTAACCACCTCTAGTTCTG
AATCATGAGGATCCAGTAAAGATGAAGGTTTCTTAAAATTATAGGGATCA
AAGCTTGGCATGGTGTAATTTTCTGTTGGACGTTCACCTAGGAAATGTTC
TTCCGGAGTGTGGAATTGAAATTCTATATTCAGAGCGAATAGACGATCAG
AATTGGAAAAATCCTTTTTCTTCCCAGCTTTCCAGCCCTTGTCCCTCCCA
GCAGCATCCCCTACATAAAAAGAGGATGACTTATCAATTAARCCACCATT
GTACCGGGATACAAATATCTCCCATAAACCAGTGCGAGGCTTACGAAAGA
ACCCTCCAGATGATGTACAGACTAAGACGGCCACGGGGATACCAAGTCTT
TTAAGGAATATGTTTTCAATTTTAGTCACTATGTCAGTCAAAGACGTTTT
CCCTTTTGCCACACCGGCTTMATTRGTATAAATAAKTATTTTATATCCTT
CCTTCACCAAGGATTTAAGCTTTCCAGGAACTGTAGGATAAATGATTTGC
CAGTCATCAGTATTTTTGGGGAAAACATTTCCACTTTTAGTGGTTATGAT
TGTTCCATCCATGTCGTAGACTGCTAGCTTAGGATTAGGATCCCTGGCGT
TTGGMGTGATCATGATTTGTGCTTCATTTTTATTAACTTCGATCCACTCT
CGTTTATCATTGGACTGGAGAGTTTTGAAAGTAGGCTCCTTCATAAGTGA
ATCTAATTTCTGTTTTTTCATAGGAGGAGCTGAATCTGAAATTGTATGAT
ACTAATTAAAATATGTATTTTCTCATGTTAAACAGCATTTTCCCGTGACA
TCAGCATTGGTGATGTGGGCCATTTTGGGGGCCTAAACAACCAAGTTTTA
TAACAATAGAAATCCTTTTTTTCACGAATATAACTAATGAACTATTCGAT
ATTGAATTTTGAAATTTTTTTGCCAATAGCTATAGATTAAAAATTAGATT
TTGATTTTCTGAAATTTTTTTCATCAATATGGGACCAACAAATCAAAGGA
CTTAGTGTCTATTAAAAATTCATCACTCTATTGCCTAGTTTTATCACATA
TCAGACCCTAATACATGTTCAAAATATGTTATTACATAATTGTAAAATCT
TATTTCCATATTGAACACAATAAAATAATTATACAATGATATTGATATTT
TTCTCTCATATCCTAATTTTCCCGTCCCTAATCGATCAACAAAAATAAGT
CGTGCAAATTTATACATTTTTAGTACATATTACTTCAATTGAATTCAAAT
ATCACTCTTTATCGTAGGTAATAAGTAGTATTTTCTTATTCCTAAGCTCA
TTAGATGTAGTTTCATCAAGATTTATTGCAAGTTTTTTTCATTTTATGTA
GTAATCATATCAACTATGAGCCCCCAAAGGATGCTGCAATTATGACGTAC
GTGAAAACGCTTTATACTAACCTTGACCAGATTCGTCACTTTCTGGCGGC
GCTGGAGTAAAAAGACACATAAATTTATAGGAATGAGGTAGAAGTTTAAA
GGACTCTTTATGTTTTAAATAAGTAACTTCTCCGTTCCTAAGAAGAAAAC
CTCTGGCCTCACTGGGATTCCCTCCAACGACTTCCAAACGAATGGAATAG
TCCTCATAATTGGCAACCAGAGATATTTGCTCACGAGATAATTTGTGATC
CCTTATCTTTGTTAGGGGACCTCTTCCTAGGGTAACTCTCTCCAGATCGG
GGAGATGAATATCCGGGATGGTCTCGGATATATCACGAGCATAACAAGTC
AGGGCTTTACTCATTCTTCATACGTTAAATTCCCCTGTATTCGGGCATTT
TATTTACACCGCTTCAACTAACAGCTTGAAGGCAGCTTGTCTTCTTAATT
TCTTCAACGTTGCTCTATGACGTCATTTTATTTATATACTTGGGATGGCG
GCAAACGGGTAGGGGTACGTTCAAACTTAGGGAAAGATCGAGTTGGTCGC
CACCAGGATCGTAAATATGATTTTTTGGAGGGAGATGGTCGTAGAATTTA
TTTTTTTTGAAATTTTTTCGAAAGATATCCCATTTCTTAAGACTTTTTTT
TGGAAAATGGGACATTCATTTTTCCCCCTAAAAAATAATATTTTTTGAAA
AAAGTTGAACCTTTTTTGGGACCCTTCGCTAAATCTGTCAATTGAATCAC
ATTTTTTTATAAAGAATATTTGTATGAACAACTTGTGTAGTCATAGTAAT
GGGGACATTCTGAGCTCTTTATTACTTCATATATTTTTAATGAGCATCCA
TGACCTTGCTTTGACCTGATATTTAATTAAGTTATAGTTCAAAAATTATT
TTTTCTTATAATTTAAGGTCTATTATTCTAAAATAATTGAACACTATGAA
AGATTTAGAACCAAAATATCGCTTATGTTGTTAGTACGATATAAACTCAT
CAATGCAAGTATGAAGCTGTCAATTACAAGATTACTTAAGGATTGAAAAT
TTAAAAATGATTTTTCCTTGTTTGCAAATCACATAAATGGAATTTGCCAC
AACACTTATTATGGATATTCTAAGTATTTATAGATATAACATCTATTTTA
AGGAATAAGTGCTAAAATAACCCCATTTCCCCAATATATAGCGCTTGCCC
CATATATCTACTTTTCAGATTTGTTAAATGTCTTCTTTTTTTTTAAATGT
ACTTACCTTATATGTGTAGGACATATAATCTTCTTTACTTATTATTATGT
TTGTAGGATTTTGGAAGGATTAAGAAGAAGGCAAGCGTTTCCCACAAGGA
AAGAGTCGAAAAATTTAACGAGTATCTCAACAATCTCTCTGAGCATTATG
AGCCAGCCAAAGTTTCATGGACAAAATAAGGATAATATACTTCGATCTTC
CATTCAAATAATTGTTTTTTTCCTTTCTGTAAAATAAAATTGTCAACTCC
ATGGGTCTGTTTTTGTATTTAGAAACAAAAATTGAAGGATTCTCAAATAT
ATAAATATTATATACGCAATTGACGCAGAGCTTTCTTGTATAATATTTTA
TGTACTTGAAATAATGACAGATATTATCTAATCAAGGCTGTCGGAATAGA
AGTGACATTTAACCTCCTTATGCTATGTTTACTACTTTAGAAAATATTTT
ATACATTAGTGTTGTGGTTAAGATCGATACCAAGACTTTAAGAGATCGAA
ACCAAGAGGAAACGAATGATTTTATATTTGTTTTGAGATTAGAAATTTTT
TAATCTAATTAATTTAGGTCTACTCAACTATTATGAATTATAAGCATAGG
TACAGTTAGACAAGTTCAAATCTATGCCTTGGTCAGAAATTTTTAATATT
TGAAATTATTAAAATGAAGCCACCATTTTGAGAACCCACGAGAGTAATGT
TTTGTCAGTCCTTATTTAGGACTGGAGACTGCAGTCACGTGTAGTTTAGT
CTCGACCCAGTCCAGTTTAGTCCTGCATATCATTCCTAAAACTTACAATG
TTCGGTCCTTGATATCGTCAATCAGCTTTATTTCTTCTGTTTTTATCGGT
TCACGTKCTGCCACTCCGACAGTCTTAAGGAGCGGTCCTTGGACTGTACT
GGACCGAATAATTAAGGATACAACGCTACATGATGGCACATATGATTATT
ATTAATTTCATATTCCTATTTAGTTTCATTAATTTGGGTCCAACTTCGAC
ACCATAGGAGGGCCACTTATTTTGCTCAAATATTTGGACATTTTTTAAAT
AAAATACCGAATATACAAAATTAATTTCCTGAATATTGCTAATATTGTCT
TAATGGCCGCCTCTTGGTCTACTCCGCCTAATTACATACAACACTCACAA
GCAAACGTGAATTTTGCAGTAAACATGCCCCCATTTCCCCCTTACCATTT
ATTATTTGAATATATATATTTTATATAATTACAATTAATATGAAATAAAA
AACTACAAATTTAAAACTCTGCCTATTAGAAGGTTCAGATTAGGGCCGCT
AGTTGCGTTGGTCTTGATTTTATGTAGACTTATACTTTTAAGGATTTGAA
AAAAATGGTGTTGAAATAATGATTAAACATTTTTAAATTACGAGATTCAT
TAGTAAATAATGAATCCTGTGAAATTGAAGTATTTCTTTAGATATTTCCA
AGATAAATAATCCATTTTAAGCCAGTCCTCAATTTTCATCATTAACACTA
CTATTACTTTTTTAGAGACCACGGATCCAGTTTTTTAGAATTCCGGTACC
CAATTCGACCTGCATTAAAAATAATTAAATACTAATAGTATATGATGAAA
AAGCTAATTTACAATATTATAGAGTGTTACATAGTATTTTTATATTAATT
TATATAAATCAAGGACTTTGATTCAGTGTATATTGTGGAATATCGTTAGT
AACTTGCATTGTCCGAAGTTATTAGGCACTCACGGATAGACACACTGATT
TAATAATATAATATAACTCCCCAACAATGTTGCTCATGGGCACACTTACA
CGAATTGACTGTATACTTAGATATTCCCCCCTCAATATTTATAATTTAAA
AATAATTGAATGAAACTTATATTATGGAATAATTTACTGGAAAAATAAAT
ATTACTTTCCATTGGTTTAAAACCCCGAGAGAGAAATCCTAATCACAACT
ATTTGTACTCCCTTTGCGAAGTATTTAACCTCCGGAGTACTCTCTTTCTG
CTATATATATTCATTAACTTGAGACGCAAATGCGTCACGATACTTACTTA
GTATATAAAATACATGCACATGACTTGTTATTTGTGTGCTTTCAAATAAA
TAATATTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTAGAAGAGTCTTGTGATTTCAGAAC
ACACTATTACATGATATTATATTATGGAGTATAACTTATTGAGCAGCTAC
ATTTTGACATACAAATAATGAATAATGCTATTCTCGGTGTTGTACATTAC
TGTGAATTCCATGGACCTCAACCCATTTTTATAACAGAGTCTGTCCTTAC
TCCTCTCAGTTCCACCACCTGCAACACGACAGCTAAGCCTGGTGTAGTTG
AAAATGCCTGCATACTCTGTCAAACGATACCTAAAGAAACTGGATACTTT
GTTTCACAAGACAAACAACTTCCATCTCTTCATTTCCTATCCTCCACTCC
ATGGCCTGATGAAGAAAATGATTCATATAAACTTTTAAAACACGTTGCTA
TTCGAATAACGAGTATTGAAGGATTTAGGGTCAGCACTCACTTATTTCTA
CATCACTTTTCGTCTATTTTTTTTCTTCTTTTGAATAAGAAAGCTAATTA
ATTAATTATTCATAAAATAATAACTAATTGTAAAACAGATTGAAATAGTG
AGCGCTGTTCCATGACAAAGGATGTTATTAGTGGGGAAAATGATTTGGAT
AAAGGAGGTCCCTTCCTCATAGGAGACGAAGCAATTCTTGGAGGAAGGAC
TTTATTTGCATTTACTTTCTGTCTTAGAGACTTAGCCTCTAGAGGTCAAA
AAAGAATTTACTCTATTTTCATTCTTCTACATGATCATTTCTGGCTTCTT
CAGTCCATCAACTTCATTTATGGCACTTTTAAACAAATGTCAATGAGGTT
TCAGTCTAAAGCAAATGAACTTTTTGATACTCAAGACTCTTCAAAGTTAA
AGAATCTTTCTCATCTACTGGGGGATGAAAACTTGTATGTTCGACTCCAT
CGCCAATTTATAGGAATACTCAAAATCATTGGGAAGAACTTTCAGGACAC
CATTCACCATGGACAGCCTTTAGAAGACATCTATGTTTCTAATAAAGAGA
AGGAGGAACTAGGATATTGCGATTTTAAAGAGATTTTTGACCTCTTGGAA
CCCCAAAATCAAAAGCTACTCATATATAGACTTCTTACAAATAGAGGAGT
GGTCATTTATGGTGAGAATATGAATCAGTTAGCAAAGGTACTATCTCTTT
TGAGCATATTCTTACCCCATCACAGCCATGCAAAATTAAAAAGTAATTCT
TCGGGTAGCTTAGGCATTCTTGATGGAAACGAAATTTCTATTCATCTAAA
TACAAACATGACATTTTCAGAGCTCAACTCCTATCTCCCTTCACCATTGC
CAGTTCTAGTTCTTAGAATAATTAACATACTCCAAAAAACATCATATTTG
AATGGTGAATCGATTCATAAACATATTTTGCATCTACGAGAAGAAATCTT
TGGACTGTCAAAACTGTATTATATTATACAATTTACGGCAAATAAAGACA
AACTAAAAACAGTACTCAGAGCAATGAATCTATCGTATTCCGATAAAGAA
GTTTTAGAAATATGGTCTCAATATCTCCGCTCGAGTTTTCGTAGCTAATG
TCAACTTTTAACTAGAAAAAGGACAATTATTTTAATTTAATGCTATAATT
ATGCTGTATTTAATAACATGACTGTTTTCAAGAACGATTGTACAAAATAT
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ATTTAAAGGCACCCTTATGCATAAGTAAGTTAATATCAGCAATGGAGTTG
ATGATCATACTCGAAATTGCCTTTTCTTCCAGATCAAAATTTAACAATAA
CATATTCAAATATTTCTTAGCGTCCTTAGACTTTAAAACAGTTCTGAGTT
TAACATTTTTATCACGAATCATCTCTAAAATAACAAGGGCTAATAATGTC
CACTCATGCATTGAAAAAACAATATTTGAAGACGTTAAATAAAATCCTTT
AATTAGGATTCGAACATCATCCGATATGTCAGGCATTTGAATCCCAAATA
AAGTCAATATTTCTGGTAGCACAGAGTCCAATTGATTCCATACAACTTGA
GTACGACTAATTACTTTTGGAACCATTCTCAAGTGCAATTCACTATTATC
CTCCTTCTCTTTTTCGTTGTCCATCCACATATCTGTTCTACCTTTAAGAA
AAGTCATTAGTTTCAAATTATCCATAGGATCCAATGAGAACTTCAGAGAT
TCGGTAACTTTATTATTGATTATARCAGCCGTAATCATTTCATTGAAGGC
AGTAGCAATGCCAGGGGATAAATTCGGATTTTCTCCAAGAACTTGAAATA
TCTTCTCGGGTCCATAGTTATTTTCTACAAGAGAATACCAAACAAAATCG
TCTCCTTTGAGATATCTAAGAGTATCTGTCGTACACCACTCTTTGAGTCG
TAATTTAATTAATTCAATCGGAGATGAGTTTGTCTTTTTGGGCTTAGGAG
GCAATGAGATTAGGGTTTGATTCCTAATAGGAGCATCTGAATTAATATTT
AATGACTGTATGAGTTCTTCAACGTCAGGTAGAGTCTCTAATTCTTTTTC
TAATTCATCCTCAATCTCTTCATGCGTTTTTGGATCGCAAAAGCTCTTTG
TATCCCCAATTTCAGGAGATTCTGCCTGTGATAGAGGAATTTCTTCACCT
GGATATTTCCCATAGTCTTTTCCAAGGATTTTAATCATTGGCCTCTCTGA
CCCTGGTTTATCATCTCTCATCCAGAGGGGCTCATTGTCAAGTTGCTCTA
AAATATAAGAGGATGCATTATAGCAGGAATTGGAGCAGAATTTTTTCCGT
TCCGTCAGGTCATAGACTTTTCGTTGTGAGGACACAATGTGATATTTTTG
ACGGGGAATGATTTTGGGTAGTGAATGAGTGCAAAGTGGATATCCACACA
ATTTGAGCAAACTCCTTTCATCTATAACGTCCTTATAAAACATTTGGTTC
AAGCTTGGAAGAGCTTCTTCTTCAAACCAGAGAAATTCAATCTCAGAATC
TAATAATTTTTCAACAATCTCTAAAGCAGTAGCCTCCGATTGCTTCTTTC
TAAGAAGACCTGTACGAATTTTTTCACGACGTTCCTCTTCAGATAACTTT
TTAAAGGGTTTTTTCTTCGAAGAGGAGGAGCTTGTAGAGGACTTACTCTT
CAAAGCCTCACGGGCAATTTCAAAAATTTCTTCCTCCGTCATTTCGCAGT
CAATTTGCGAATTTCCAATCATTTTATATAGTTCACAAC back to top
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