EMLSAT00000000706, EMLSAT00000000706-696553 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000706
Unique NameEMLSAT00000000706-696553
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s110supercontigLSalAtl2s110:706318..719403 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000706 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000706EMLSAG00000000706-683472Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003052EMLSAE00000003052-711980Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003053EMLSAE00000003053-711981Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto779408auto779408Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000706EMLSAP00000000706Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000706

>EMLSAP00000000706 ID=EMLSAP00000000706|Name=EMLSAP00000000706|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=259bp
MLPSYALTLTLTLVFVLMGRQSRVLGANMYTPTPRYGPTPVPHYSPTPSP
AYGPHGYXTPBGYTPAPLYGHHVGANPVRETYGPPSCSKNSTNTWCLMDY
EYPTYEIQHAVEYHYAAVAALYKDVIANTENSIDRLKDLRDETYLCPSST
DYVMPLRAINSQGKWRIVVNNVKAHYETLSQTVRVEQCSKQGTPCPLVPE
CYETKCVQKSLYHRFLTYDPFDYYFPFAIESFKLPASCACTSGTFAEQQS
TPYYIPHHK
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mRNA from alignment at LSalAtl2s110:706318..719403+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000706-696553 ID=EMLSAT00000000706-696553|Name=EMLSAT00000000706|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13086bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s110:706318..719403+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATTTTTGAATAAAAGTACTTTATCTTAAGTGTAGACTTCAAATTCTGTGG AATGCTTCCTTCATATGCACTCACGGTAAGAAGATTTTCATATAATATTT CCGTATAACTAAATGTATTATTATTTGATGGGGTTGTAACATATAAAAAC AATATTGAACAAAAATCTAGAATAGGGCTAAATCCCGATTAATTAGTAGG ATTAATATATCCCATTAATTCAAAGACATATTTGAGTGAATTATAGGTTT ATTATTCAACTTTCTGATATTAATTAAGGTACTCAATGATTATATATATA GTTTAGAACCTTTAATTGATGTAAGAAACTGATATTGGCCCCAATGTGGC TACTTTTAAATGAAATATATCAATTTTCTTATTATCTAATTACGACGATC GATTTTGACAACTTTAATTGCTATCTAATAAACACTTAAAGGGGTCTAAG AATGATTTGATAATAGAAATTGTCCAATTATTCTAGCTTACATTTGTGTT GACGGGCTGTGTATATATGTATAACAGTTTGACAAAAATTTGATGGATAT TGGGAAATTGAGTTTCTTGGATACATAAAAGGTGTTTAGTTTATAAAGGG AAATTTGTACTTGATTAATTATGGGAATTCAGNCAGACAGGAACCACAAA AAAGAATATATAGACAATAATTAGAAAATCCTTTTCTAATTGGTGATACC TTATTGCTGGAGCTTTATCACAAAAAGAAAAAAAAAGAATAATTTTCTCA ATGTATGTCCAAAAANTTTTCATTTTAATCGTAAAACTATCTGCAATGCT GATGACAAATAACTTTTTTACTTCTTGTCCGATTCAAGTCTTGTATCAAA GTTAAATCGCCAGTCTTCTCATTTATAGTAACCAAGACTCCAGCCTCACT TTAATGCTCGGTTATACCAACTTGAAATAAATTTAAGGTAGGACTTATGA CGCCACTAATTTTACTTTATTGGAGTTGATGGCACCGGGCTTTAGAGTGA GATCCAAGTCCAGGGTTGTGAGTACTAATATAGTTTCCTATTCTAATTCA CTGTAAAATAAGTTTGTGAGACTTCAACTGCCTAGAGTCTTATAATATGT ACAAGTTTGAATCTTTTAATTTGGAGTATGAAGCTTTTAACCTCCAACTA TAAGTCAAATTGGAAGATACAGAATGAAGTTCAACTTGCCTCTGAGGTCC CATCTCTGTGACTATTAGTGATTAAATTCTTAATTTACAGAAATGACTCC TTGGTAAATGGAATTAAGAATTAACAGATTTAGATGGATAAATTTTRTAA AGAYAAATGAAACTTAGGTACMTTTMMCCRCAGACCAWAAKTTGAKAAAA AAAAAAAAATATCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNTTCGGTCTAATATAAATCAAATAGATTGAAATACTCTTCTGCCACA AAAAACAAAAAAAAACAATGGTCTCCTTTTAGCCTTATGCTAATATCTAA ATGATCTTTCCAAAGATAAATGCTGGAGATCGATTGAGAAGTCTAAGGAA TTTACGGATTTAAGATAACTAGTCGTTTTAAAAATCATTTTTGTATTTGC AACTGGCTGTTTGAAACTATGGCTATAGGMATGACTGYTGGGATTTCAGT TTATATATAAATCGTCATTTTCTACATTGTATTATGGGATTTATCTATAC AAAACTATGTAAAAGTAGTTATAATTGATAATTTGACAAAATTTTACTTG AAAAAATAGAAGAAGGCAGTCATTTTTGGATTCCGACAATAAATTAATTA 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TCTGAGGAGAGCAGTTATGACGTTTCATTAGATCAGCTGTGACTAGGGGG GGGGGAGTTCGAGAAGGAAATAAACAAGGACATTGCCAAGAACTACTNCG TGTTCTACGGCTTAAATAATAATAAAAAATGWAGGTTTCAGCCTGCTGGC CAAAATGCTTTTGCATTGTGTTTTTTGAAGAATATTTCTGAGGAGAGCAG TTATGACGTTTCATTAGATCAGCTGTGACTAGGGGGGGGGGRGTTCGAGA AGGAAATAAACAAGGACATTGCCAAGAACTACTCCGTTGTCGATCCTCAA TTCTCCTCTGAGTCTAACAAGGAGAGAGAATCATAACTCGACAGCAAAGT ATTTTATTTGCACACACAAATATTCTGTCAGGCTCTGAATTTAATCCAAT TTATTAAAAAAGGAAGTAGACTCCTAAAGAATTGAATAATAAGACAACAG CTCACGGTAAGAAAATTTACGCTTCAGTTTGCCAAATAAAAAAAACAAAG CAAAAAAACAGGCAAGATAAAAAAAAAATATCCTCGATTTTCATGACTAC TTATAAGAATAAACTCCCTAACAAATTCTCCGTTTTACTCTCCATCATAC ACGTAGATACTTTATACTTAGAGTCTGAATCTGTTTATAAAAAGATTGGA TTTCCTTCCGATCCATTACAGTCTGTTGAAAACGAAATCTATGCTCAACC ATCACATCTTAAAAAAGACTTTCCTAGCATTTGCCTTCGATCTGCATCTT TTAGATGTTAGTCTACTAAAAAACCATTTAAAGTGGAATCAATTTCATCT ACAAAAATTACACATCCATATATCTAATAATTATTGTATAGATAATTAGA AATAATCATACAATGTTAATAATAATTAACCTAGGTATGTATTCAAAATC ATTCTTTACATAAACAACAATGTTCTATTAATTAGAGACTCCATTTATGT 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ACATAATATATAATAAGTTAATAGCTTGAATGAAATTGAATACTACACTA TCAATTGAATGAAAGATGACAGGTTGAGTGACTTTTGTTGTTGTTGTAAA TAATACCTAGGGTTGTATCTGTTCTTCATTTGAGACTTAAAATCGGTTTT GCCCAGTCGAGTCCAGTACCGTCTCTTTATTATAGCAGGATTATATATAT ATATATATTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGCTTGATTTTTCTTTTTTT TCTTTTTTTAAAATCCACAATTGTTAAAGAAAAATCAAATATTAAATTTT ATAAAAAANNNNNNNNNNNNACTAGCAAATCTATCCTCAAAAACTTACAT TTTTTTGAACTGTTTTATAAAAATCCACGACTGTAATACAAAAAATAAAC TTTTGGGAAAAAAGTTCAAAAAATTAAATTTTAAATATTTTATTTTTTTG GAGAAATTTTTAAAAAATCCATAGCTATGCATCGTAAATAAATAATAGAA AAATTAAATTTTTTGTAGAAAATTGTATGAAAAATAAAATAAACTGCAAA ATATTAAATTTTTGCAAAAGAAAAAAATTAGTTTTTCTAATTTACTAGTA AAAAACCAAAAATCCTTAATTTGGAGGGGGGGGGGGCTACATCCCCTCTA GTCCACCCCCTGCGGTCCTTGAAAAACGTCTCTAATTTTAAATTGCTTTC TACAAGGCATCATTTTTCACTAACATTATATAGTCTGTCTAAGCAAATCG TACCGCACCAATTAGAGCTCCATAATGCCATTATTGCACACCATCGATTT TGGGATATAAAAATTAATTGTTTCTAGGTTTATCTGCTTTCATACTCTGT ATTATTTTTATGATATGTCAAAAAAAACGACAACGTTAAAAAAAGACAAC GTATTGTAGATCTTTTCCGCACCCATCACTCTCCAGATCCTGGACGTTAT TGATTGCTCTGTTGATCGTGTTAGTAAAGTCAGGAGGTGCATAAACAGCG GCGAGACCCTCTCCAGAAAGACGAGAAGTAGAAGACACTTCGAAATTGTC ACTGAATACTTCTAGGAAGGTTTGACCTTTCACATTGAAGCAAGAGGGCG TTGGCATAGACTCAACGTCAGCGAGGGGACTATCAGTAATGCAACCAAGA AGCCATGGCCCTATTCTTGTGTCCGTAGATGGTGTAAGGCTATAGCAAGT CAAGCTTGTTTTGATGAAAACCTCAACAATATCTAGCCTCCAAATTATGC CCTAGCCTCGTCACTGTACTGCTTGCAACTGGGCTATGGAATATGGGCTT CGTAGAGAGCAAGGCCTTCAAAGTCTCTCACCCCAATCTTGATTCCCTGA GAGCATCCATTGAGAATGAGTGGGCTGATATGTCCAATAACTTAGTAATC AAGGTGCGCAAGGCCTTCAGGCTCAGGCCATAGTGGCCGMAGATTAAGGA CATTTTGCGAAATATTTGTTAATATTATAAGGATAATTATGATTAAAAAT ACTTCTGAGACTCTGTACATGTTGTTCTTTATACAGCAGATTAAAATTTT AATATCAACACACACACGGTAGCAAAGTATCTAAGTTTATCAATTAAAAT TAGTTTAGTGTAACTTTAAGTATGTAAAAAAATTATGAATTTTGATTTAT GATTACGTCACTGGTAGATGTGAGTACTTATGATAGCGTCATCTACATAC ATATTTATATATCATAAAGTGTGACGTCATATGATATATCTTTACTACAA CTCTCTAATAAATACATGAGAGGTACAGGCTATTTCTACTATTAAGATTG AAGCTAAAACAGTACTTTACATATTAAATAATAAGAAGAATAAGAGGAGG TGAAGAAGAACCTTTGCAGTTTCTAAACACACTAAAAGAGTCTTCTGGAA 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ACAAATTTTCGACAATTTTATACATGCCTACCAATAATATTACTCTCCTA AACTGCTTGACTGTTCTTCATTTAATGGTTTTGATTCTCAAGTGTTGTTT TTTTCAAAGAATAATCTTCAAAAAATGAATCTTAATACACATTATGCACT AAAAAAATGTAAGCACATAAATTATTACTTAAGAAGAAGGATCTTTGATT CAAATGCAAAAAAACAAACAAACATGGACGTGGGTAGTCTTCCATGTACA GGTGACNTTCGGGGTTAAATCATACTAATATAAAAGGTTGCGTGAACAAT ACACTATAACTTCCACCACAATTGTTTTGACAACAAACAATAGTCATCAT GGAACAAGCAAGGAGAGACGCCATCCTCGAATTGGCTCSCGMGGGATACA AGCCCTCRGCTATCTACAAGCTTCTTAACTACCCCAAGACCACAGTGTAC CAGGTCTTCGATCCCTGGGAGGTTGAGGGGAAGGTCTGCTGCAAGGCCCA CAACATGAGAAGTGACCGAATCCGCACTTCCAGCTTCCTTGAAGGCCTCC GGAAGTCCATCAAGGCTTCGCCGGGACTTCCTTGTCCAGGATGGCCAAGC ACAGTGGAGTGAGCAAGCAGCTGGTCTCCAAGGATGTAAATGAAGACCTC GGGTACAGCTCATACCGAATGGCCAAACAACACATCTTCACGGCATCCAT GAAGTCCACCAGGCTCACTAACAGTAAGCGTCTCCTCAGTGACCTGAACA GCCATGGAGGAAGAATCATCTTCTTCTCCGACGAGAAGAACTGGACTGTC GATAGAAGCTACAACGTCCAGAATGACAAGTGGCTTGRCAKGGAGAGGGA AGAAGCCCCTGCGGTCTTCACCACAAAGTTCCCGGCCTCCGTGATGACCC TGGGTGTCATCTGCAGCATCGGTGAGGGGATGCCTCCTTTCTTCTTCAAT CCCAAGGAAAGGGTTAACGCGATAAGGTACTGCGAAGTCATGGGGGAGTT CGTCATCCCCTGGATGATGGATACGGCCACTGGGAGGGAGTTCATATTTC AACAAGACTCAGCGCCCGCACACATTGCCATGAGGACCACTAACCTCTTC AACTCCCTCGACATCACTTTCCAGGATCGCAACACCTGGCCCTGCAACTC ACCCGACCTCAATCAATGTGATTAATACTGGTAGGMAAAGCTGTAGAGGG AGGMGTGAAAGGMCAGCCACACGAGCATCGCGGCCCTGAAGGGCTCCATT ACGAGGGAATGGAATGCTGTCGATTCCGCGGAAGTCATCAGGGCATGCAA ATCCTTTAGGGGCAGGATGGAGAAGATGGTGGCTGCTGAGGGAGAACATG TTGAATAAATTTATTGTTTAATATCATGTCTAACTTTTTCATATTAACAA ATACACTCCAAATTCCATTTTTATCAAGCATGTTGAATTTTAAGATAGTT CCAATTGATCGTGGACACCCTGTATAGTGATAAAGATCGTGTGTATTTAT GGCATGTTAAAAAAAAAAGAAACCAAAAAATCAACATGATAATTCGGACA AGTTGAAGAATGTTTGGGAGGAAAGGGGNTTTAGCTGTCATGACGTTTCA TTAGACGAGCTACAATCAGCTGTGACGACGGGGAAAACATCGGCAAGAAT GACTCCAATGTCTATCTTCAATTCTATTCCGAGTCCAACAATGACTTACA ATTATAACTCCTCAACAAATCCTAAAAGCAACTCTCCGTCTTTTATGATC ACACGCGAATGTCTAATCAGGGTTTGAATAAATGGAAGTGAGAATGTATT TGGAAAATAAATTCACTTCTCGTTAACGACCCGATAAATATTAATGAGAA CCGCTAAAAAAAAAAAAACATTCTTCAAGTTACTGATTCCAAAAAAAGTC GCCAGCTAAAAAATACTTACGATTTACATTACTATCCATGTATCTATAAT TCCATGGCTAAGGCAAGAATAGTTAAAAGGGAAGAATTGACTATTTACTA GTTAATTCCAGGCCTTTCTTCTTCCTTGTGTGAGTCAATAAAGATTGTAT CTCTGTTTTATTAATGTTTTTTGTAGGAGGTGACAAAAGTTTAATTGCCG AGGCAATTGGGGCATGTATTTTGCATATCCTTGGCTTAATCTGCACATGA AATAATTTTGCTATGTTTTTTAAAATTAATTTAGACAATATGGCTAKCAT GTATGCATGTTCATACCTACAAATAGGAATGAAAAATTATGTTCAATTAT GAAAAGTAATACCAATTACATGCGTTTGTTGGAAGGTAAAAGTAAAGACA TTAATCATGTAGGATTTTATTGTTGTGTAGTGTTAATAAAATTATTATTG TTATTGCTTTTACTGCAATGGCTTTATTTTATGCCTGTAACCATACATAT ATTGAGCTTAATATACCTATGTTTATTATATTAATTTTTTCCCTTCTATA TTTCAGCTTACACTTACACTTGTCTTTGTTCTGATGGGGAGGCAGAGCAG AGTTTTAGGTGCAAACATGTACACCCCTACTCCAAGATATGGACCCACTC CCGTTCCACACTACTCCCCCACACCCAGCCCTGCATATGGCCCTCACGGC TACAYCACTCCCRACGGATACACCCCTGCTCCCCTCTACGGGCATCATGT AGGAGCAAATCCCGTACGAGAGACCTATGGACCTCCCAGCTGCTCCAAAA ACTCCACAAATACTTGGTGCCTCATGGACTACGAGTATCCTACATACGAA ATCCAACATGCCGTCGAGTACCACTATGCCGCAGTAGCTGCTCTCTATAA GGACGTTATTGCCAATACAGAGAACTCCATTGACCGACTCAAGGATCTCC 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