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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s110 | supercontig | LSalAtl2s110:706318..719403 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000706 >EMLSAP00000000706 ID=EMLSAP00000000706|Name=EMLSAP00000000706|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=259bp
MLPSYALTLTLTLVFVLMGRQSRVLGANMYTPTPRYGPTPVPHYSPTPSP AYGPHGYXTPBGYTPAPLYGHHVGANPVRETYGPPSCSKNSTNTWCLMDY EYPTYEIQHAVEYHYAAVAALYKDVIANTENSIDRLKDLRDETYLCPSST DYVMPLRAINSQGKWRIVVNNVKAHYETLSQTVRVEQCSKQGTPCPLVPE CYETKCVQKSLYHRFLTYDPFDYYFPFAIESFKLPASCACTSGTFAEQQS TPYYIPHHK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s110:706318..719403+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000706-696553 ID=EMLSAT00000000706-696553|Name=EMLSAT00000000706|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=13086bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s110:706318..719403+ (Lepeophtheirus salmonis) ATTTTTGAATAAAAGTACTTTATCTTAAGTGTAGACTTCAAATTCTGTGG
AATGCTTCCTTCATATGCACTCACGGTAAGAAGATTTTCATATAATATTT
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GTTTAGAACCTTTAATTGATGTAAGAAACTGATATTGGCCCCAATGTGGC
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GACGGGCTGTGTATATATGTATAACAGTTTGACAAAAATTTGATGGATAT
TGGGAAATTGAGTTTCTTGGATACATAAAAGGTGTTTAGTTTATAAAGGG
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ATGTATGTCCAAAAANTTTTCATTTTAATCGTAAAACTATCTGCAATGCT
GATGACAAATAACTTTTTTACTTCTTGTCCGATTCAAGTCTTGTATCAAA
GTTAAATCGCCAGTCTTCTCATTTATAGTAACCAAGACTCCAGCCTCACT
TTAATGCTCGGTTATACCAACTTGAAATAAATTTAAGGTAGGACTTATGA
CGCCACTAATTTTACTTTATTGGAGTTGATGGCACCGGGCTTTAGAGTGA
GATCCAAGTCCAGGGTTGTGAGTACTAATATAGTTTCCTATTCTAATTCA
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ATGACCATATTCGTGTTCTACGGCTTAAATAATAATAAAAAATGTAGGTT
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GGGGGAGTTCGAGAAGGAAATAAACAAGGACATTGCCAAGAACTACTNCG
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TTCTCCTCTGAGTCTAACAAGGAGAGAGAATCATAACTCGACAGCAAAGT
ATTTTATTTGCACACACAAATATTCTGTCAGGCTCTGAATTTAATCCAAT
TTATTAAAAAAGGAAGTAGACTCCTAAAGAATTGAATAATAAGACAACAG
CTCACGGTAAGAAAATTTACGCTTCAGTTTGCCAAATAAAAAAAACAAAG
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TTATAAGAATAAACTCCCTAACAAATTCTCCGTTTTACTCTCCATCATAC
ACGTAGATACTTTATACTTAGAGTCTGAATCTGTTTATAAAAAGATTGGA
TTTCCTTCCGATCCATTACAGTCTGTTGAAAACGAAATCTATGCTCAACC
ATCACATCTTAAAAAAGACTTTCCTAGCATTTGCCTTCGATCTGCATCTT
TTAGATGTTAGTCTACTAAAAAACCATTTAAAGTGGAATCAATTTCATCT
ACAAAAATTACACATCCATATATCTAATAATTATTGTATAGATAATTAGA
AATAATCATACAATGTTAATAATAATTAACCTAGGTATGTATTCAAAATC
ATTCTTTACATAAACAACAATGTTCTATTAATTAGAGACTCCATTTATGT
AATTTCAAGACATGAGGAAGAATTGATTCATATCAAGTTTGMCTCCTGCC
ATTGTTGCTGTTTGTTCATTAGTTAAGTATGAAATAAACAATTTACACTC
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TAAAAATAGAATACATAACTTTACTATCTGATCTGTTATTTATTTGTTAC
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TAAGGAATAAGACTTGTTCCTTATACGTATATCGATGTGTATATATGCAC
ATTCAGCCTGAACATATTTTGTAGATTCCTTTAGATGACGAGGCATTTTT
TACTATGAGTACGAGAGTACCTAAMCCTCCGTTACTTCACCCTTCAAATC
CTAATGTGAGTACTTCCCTGATGGGATGTATAACCACTCCAACATTCAAA
TGGATATATTTAGCAATATAAAACTTTCTGTTTTTATAAGTAGTTGATAC
ATATGTGGCGCATCAACGTAAAAATAATCTTACACAATTTCAAATAATTT
TGTACTTCATGTACAGGACGAAAAATATTTTTAAATTGCAGAATTAGTTA
TGTGAAATAAATATACTTTAATTTTCCGTATTTAGAATCCCCACCCTGTA
TACACACAACTCAAAATTTCTTGTACATATTTGAGTTAATTATATAGGCT
GTGTATTCAAATTGGTTGGATGACTTAATTTTTACTATTTTTTAGAATCT
TTATTTGATTTAGGAGTTATATATTGTGAACTTCCAAATAAAGTATGTCC
ATTCTTCATTCATGGCCGATTTTAGCTACTTCAAGTGCAATTTGCATCGC
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CTTCAACTGTTTTGTTGAAGGGCTACATAGATAGTTGGAGAGAGTAATAT
TGAGTTTCGATTCGCTGTAAATCATATATTATTTCTAATTTTTCATTTCC
ATTGTTGGGGACATGAACAATAAGAACACATAAACAACATTCTTCGAAAC
ATCGATAATTAATTTCATAATGTGTTAATAAATCAAAAACTAATGAAGTA
CCAAATCAAAAAAAAAAARGAMTCGATATAGGAAGTATATGATAAATTAT
GCATTATTTCCTTACTTGCGGTGGATAAACGAAACGGAGGGGTAATTATG
AGACATCAATGCTACTAAAGTTTTTTGGAGTCGTGAGTTCATACGAGTCT
CCCTCTATCTCTGAGTCAGTCACCAATTTAAATATTAAAATTCAACCTTC
AGATAAACAGTGCATAAATAATAATTGTAATTTGAATTAAATGATTAATG
TTTGGGACTCTCAAAGCTCGAATATCATATTCAAGGCTAAACTTTTTAAC
TTTGAGTACTCTGGATCAAGTCAAGAGTCGTTTACACTTCGAACACAACA
ATATGAGTGGAGTCTGATGTTGCAGTATACACTTTTCTTTGTGATATAAC
TCAAAGTTAATGAGACTTAGGTGTGATTCGAGTCCCAGATTGTTAGTTCA
AGTCCTCAGCTCGTATTTTATTTTGTATATGGTGCTAAAGTGTCACCTCA
TTGGTCATGAGTTGGAAGTGTCATCCAATAGGAATGCTCTTTTTGCTTAT
TCATCTCCTATATAAAGTCCATTGACGTCACTCCCATAAATTATACTCCA
TTATTCACGGTGTAACTTCACAAATATAAAAATTTACTCTGTGTTTGGTT
GTCAGCTTTCGATTTTTCTGCTTCTTTTCTCTCATCATCGTACTGAAGAT
TGATTGGTTGAATTGAAAGAGCACTTCGTAAGGCGCTATGAGCAATTACA
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TTTGCTGTTTTTGCTATTTCTTTAGAATGAATTTTCTTTTCCAAAGCTGT
TGTCATATTTATTTAACTCTTTTTTATAATTCATTCAATTATATTCAAAG
CCTTATAGAACAATCATGTGAGCTCATAAAAGACAGAGAGTAATATTGTT
GCAGATATATGATTGTAAGTCCTTGTTGGATATTCTACATCGGCGTAATT
CTTGCCAATTTCCTTGTTTATTTCCTTCTTCCCCTCCTCCTTTGTCTCAG
CTGATTGTAGCTGATCTAATGAAATGTCATGACAGCTAAGCTGTTCAAAT
TTTCAGGGTTACCATTTTAATATTCGATTTTTTCACATGTCCAAAATAAA
AGTGATTTTCATCATTTTTCACGACGTTTAAAGTGTCACCTTATGCAGGG
TTAGTCCAAAAGGAATTGTTTTCAGCATAGTCATCTACATAAAATCTATT
GACGTCATTTTTTTTATTAAAGCTCAATAACGTTACATTCACTAAACTAA
GGTACATATTATATATAAATGTCTTATTCCGGAATTTCATGGTTTATTCA
TTTAATAAGAAACAAGTATCCGCAGATGTTTACAAGGTTCTATTCAGAGA
TTTTAAATCCCTTATTCGACGTTTATGTATTAATATAATTTCTTGTGTTA
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TTTTTTTTCTTTTTTTGAATCAGTATTGTTAAAGCATTATAACTCTGGAT
ATTCACAAAAGACTAACCTTCAAAAATCCTTCAACACAATGGAAGGTTTC
TTTAAAGTAAAACAGAAAAGAAAAAAAAGTTATCTTCAACATCTGTGATT
TATTTTTTTACTGCTTTTAAATTTATGTAGGTATTTAATAATATAATTAT
ACATAATATATAATAAGTTAATAGCTTGAATGAAATTGAATACTACACTA
TCAATTGAATGAAAGATGACAGGTTGAGTGACTTTTGTTGTTGTTGTAAA
TAATACCTAGGGTTGTATCTGTTCTTCATTTGAGACTTAAAATCGGTTTT
GCCCAGTCGAGTCCAGTACCGTCTCTTTATTATAGCAGGATTATATATAT
ATATATATTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGCTTGATTTTTCTTTTTTT
TCTTTTTTTAAAATCCACAATTGTTAAAGAAAAATCAAATATTAAATTTT
ATAAAAAANNNNNNNNNNNNACTAGCAAATCTATCCTCAAAAACTTACAT
TTTTTTGAACTGTTTTATAAAAATCCACGACTGTAATACAAAAAATAAAC
TTTTGGGAAAAAAGTTCAAAAAATTAAATTTTAAATATTTTATTTTTTTG
GAGAAATTTTTAAAAAATCCATAGCTATGCATCGTAAATAAATAATAGAA
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ATATTAAATTTTTGCAAAAGAAAAAAATTAGTTTTTCTAATTTACTAGTA
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GTCCACCCCCTGCGGTCCTTGAAAAACGTCTCTAATTTTAAATTGCTTTC
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TACCGCACCAATTAGAGCTCCATAATGCCATTATTGCACACCATCGATTT
TGGGATATAAAAATTAATTGTTTCTAGGTTTATCTGCTTTCATACTCTGT
ATTATTTTTATGATATGTCAAAAAAAACGACAACGTTAAAAAAAGACAAC
GTATTGTAGATCTTTTCCGCACCCATCACTCTCCAGATCCTGGACGTTAT
TGATTGCTCTGTTGATCGTGTTAGTAAAGTCAGGAGGTGCATAAACAGCG
GCGAGACCCTCTCCAGAAAGACGAGAAGTAGAAGACACTTCGAAATTGTC
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AGCCATGGCCCTATTCTTGTGTCCGTAGATGGTGTAAGGCTATAGCAAGT
CAAGCTTGTTTTGATGAAAACCTCAACAATATCTAGCCTCCAAATTATGC
CCTAGCCTCGTCACTGTACTGCTTGCAACTGGGCTATGGAATATGGGCTT
CGTAGAGAGCAAGGCCTTCAAAGTCTCTCACCCCAATCTTGATTCCCTGA
GAGCATCCATTGAGAATGAGTGGGCTGATATGTCCAATAACTTAGTAATC
AAGGTGCGCAAGGCCTTCAGGCTCAGGCCATAGTGGCCGMAGATTAAGGA
CATTTTGCGAAATATTTGTTAATATTATAAGGATAATTATGATTAAAAAT
ACTTCTGAGACTCTGTACATGTTGTTCTTTATACAGCAGATTAAAATTTT
AATATCAACACACACACGGTAGCAAAGTATCTAAGTTTATCAATTAAAAT
TAGTTTAGTGTAACTTTAAGTATGTAAAAAAATTATGAATTTTGATTTAT
GATTACGTCACTGGTAGATGTGAGTACTTATGATAGCGTCATCTACATAC
ATATTTATATATCATAAAGTGTGACGTCATATGATATATCTTTACTACAA
CTCTCTAATAAATACATGAGAGGTACAGGCTATTTCTACTATTAAGATTG
AAGCTAAAACAGTACTTTACATATTAAATAATAAGAAGAATAAGAGGAGG
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TATCTGCAAATTGTTCTTGCAACGCTTCACACGATTTCGTTATTGGTCAA
GCGTGAGCAATCACGGCACCCACCATGTGGATACCTTTCTTTGTCATGTC
CAAATGTTGATGCTAGCAATCTCATTCACCTTCACTCTTTTGTCATCCAG
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GAACGTTCAGCGTCACTAATCCATATGCCCACTCTGAAAATTTTGAAACC
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AATATACAAGGAAATTCTTTTTCGTCCATTTTCCACTTTCACAATTCAAA
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GTTCTTACAAGAGAGATTACTAACTAAACTTAACCTCGATACGCCCCAGT
CGTGCCATTTTTCAGATTTTGCACTGACTTTTCAAACAACCCTCGTAAGT
GGTTTATAAGAAAGATTGTACTACTCATCAAAGAAACATATCCAAATTGG
ATAATAGATTATAAATATTTTTTGATGTATAAAATATAAGATTAAATATT
TCTTGTTAGTATTGTTTTTCCAGTTTTTTCAGTCATTTGTATTTAGTACA
AATCATCAACGACCCTATTACTAATATAATTTCTCAAAATGTTTTCAAAG
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TGACTCGGATTACTAAAATATAATTATCTTTTTTTCTCGCTATTACGTTT
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TTTTCAAAGAATAATCTTCAAAAAATGAATCTTAATACACATTATGCACT
AAAAAAATGTAAGCACATAAATTATTACTTAAGAAGAAGGATCTTTGATT
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GGTGACNTTCGGGGTTAAATCATACTAATATAAAAGGTTGCGTGAACAAT
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GAAGTCCACCAGGCTCACTAACAGTAAGCGTCTCCTCAGTGACCTGAACA
GCCATGGAGGAAGAATCATCTTCTTCTCCGACGAGAAGAACTGGACTGTC
GATAGAAGCTACAACGTCCAGAATGACAAGTGGCTTGRCAKGGAGAGGGA
AGAAGCCCCTGCGGTCTTCACCACAAAGTTCCCGGCCTCCGTGATGACCC
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AACTCCCTCGACATCACTTTCCAGGATCGCAACACCTGGCCCTGCAACTC
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AGGMGTGAAAGGMCAGCCACACGAGCATCGCGGCCCTGAAGGGCTCCATT
ACGAGGGAATGGAATGCTGTCGATTCCGCGGAAGTCATCAGGGCATGCAA
ATCCTTTAGGGGCAGGATGGAGAAGATGGTGGCTGCTGAGGGAGAACATG
TTGAATAAATTTATTGTTTAATATCATGTCTAACTTTTTCATATTAACAA
ATACACTCCAAATTCCATTTTTATCAAGCATGTTGAATTTTAAGATAGTT
CCAATTGATCGTGGACACCCTGTATAGTGATAAAGATCGTGTGTATTTAT
GGCATGTTAAAAAAAAAAGAAACCAAAAAATCAACATGATAATTCGGACA
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TTAGACGAGCTACAATCAGCTGTGACGACGGGGAAAACATCGGCAAGAAT
GACTCCAATGTCTATCTTCAATTCTATTCCGAGTCCAACAATGACTTACA
ATTATAACTCCTCAACAAATCCTAAAAGCAACTCTCCGTCTTTTATGATC
ACACGCGAATGTCTAATCAGGGTTTGAATAAATGGAAGTGAGAATGTATT
TGGAAAATAAATTCACTTCTCGTTAACGACCCGATAAATATTAATGAGAA
CCGCTAAAAAAAAAAAAACATTCTTCAAGTTACTGATTCCAAAAAAAGTC
GCCAGCTAAAAAATACTTACGATTTACATTACTATCCATGTATCTATAAT
TCCATGGCTAAGGCAAGAATAGTTAAAAGGGAAGAATTGACTATTTACTA
GTTAATTCCAGGCCTTTCTTCTTCCTTGTGTGAGTCAATAAAGATTGTAT
CTCTGTTTTATTAATGTTTTTTGTAGGAGGTGACAAAAGTTTAATTGCCG
AGGCAATTGGGGCATGTATTTTGCATATCCTTGGCTTAATCTGCACATGA
AATAATTTTGCTATGTTTTTTAAAATTAATTTAGACAATATGGCTAKCAT
GTATGCATGTTCATACCTACAAATAGGAATGAAAAATTATGTTCAATTAT
GAAAAGTAATACCAATTACATGCGTTTGTTGGAAGGTAAAAGTAAAGACA
TTAATCATGTAGGATTTTATTGTTGTGTAGTGTTAATAAAATTATTATTG
TTATTGCTTTTACTGCAATGGCTTTATTTTATGCCTGTAACCATACATAT
ATTGAGCTTAATATACCTATGTTTATTATATTAATTTTTTCCCTTCTATA
TTTCAGCTTACACTTACACTTGTCTTTGTTCTGATGGGGAGGCAGAGCAG
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CCGTTCCACACTACTCCCCCACACCCAGCCCTGCATATGGCCCTCACGGC
TACAYCACTCCCRACGGATACACCCCTGCTCCCCTCTACGGGCATCATGT
AGGAGCAAATCCCGTACGAGAGACCTATGGACCTCCCAGCTGCTCCAAAA
ACTCCACAAATACTTGGTGCCTCATGGACTACGAGTATCCTACATACGAA
ATCCAACATGCCGTCGAGTACCACTATGCCGCAGTAGCTGCTCTCTATAA
GGACGTTATTGCCAATACAGAGAACTCCATTGACCGACTCAAGGATCTCC
GAGATGAGACTTATCTCTGTCCCTCTAGCACAGACTATGTTATGCCTCTT
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GGCTCACTATGAGACTCTAAGTCAAACCGTTCGAGTTGAGCAATGTAGCA
AGCAGGGAACTCCCTGTCCCCTTGTTCCTGAATGCTATGAAACGAAATGT
GTTCAAAAATCGCTCTATCATCGATTCCTTACCTACGATCCCTTTGATTA
CTATTTCCCGTTCGCCATTGAGAGTTTCAAACTTCCAGCTTCATGTGCCT
GTACGTCCGGGACATTTGCTGAGCAACAAAGCACACCCTACTACATTCCT
CATCATAAATAAATAAGTAACAAAGGTCATCCTTTCTTGTCCTTGTTCAG
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TCCATCTTTTCAAATTAACAAATAAAACACAACATCAAATCGAAGAACCA
GACCTCGCAAGCAATCAACGAATACAAATGAACACACGATATGTTCTAGT
CAACCATTGTTATTATTATTTTCAACTCTTCTCTTTATAAATAGTTAATT
AACCATTATAGTTACTAATTACTATGTACTATTATTTATGATATTTCAAA
TTATTTATTACATAAAACAATTATTAATATTTATTTAAAGAATCTCTCAA
ATAGCTAAACATTATACCACAAAAATGGCAATAAAT back to top
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