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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1118 | supercontig | LSalAtl2s1118:23248..41219 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000738 >EMLSAP00000000738 ID=EMLSAP00000000738|Name=EMLSAP00000000738|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1080bp
MATSVEKSRLANYSKSIGIQHSVSFFIMFYYVLILFCLHSVESQTFPSAD TAKSWSLRIDEAFKKISSGDGDLTGAETFQKKFQDNIGESVIVSTDGKKI AETVSKEITRIFDYNIKALKNLVSNIEGLVKNYKYNDDLNPDILNGIEWS GALDDVLKDNYKKYPGVYWQSFGSQTGFLRVYPAARWQSSIEHPDLFDVR RRPWYIHGSVTPKDMIILLDTSGSMHGQSFDIMKLAAKMLINTLGEDDYF NVASFDRNVSWVTPCLDTLVQANSRNKRLIFDGIDQLEARYIASYTDGLN FAYDNFXQFERTKEEEEGAECHKLVMVFSDGGTIYPEKVINYYRNQTLTE NVRIFSYAVGPHPLPTVALKTMACRTGGAFTTITAMGAIRTKVQDSYLNV IARPQVLNKIHTLQFTSVYADALVIEEMSELPIALAXFGNVLNVQSGLGL ITTVTYPVFNTSDGSDNQTLAGVVGIDIPVNDLEALIPRRQLGALGYGFA LNQNGFLVFHPKLWSFMNYFEDPSHVDFADVVGESEPLRTVRKQMIDEIQ GSSTIEIDHEVLEFNYFHVPNSSFSVGIVNPENWSYIKPGAEDINIISDM LSLIENADIAPWIYCNENGIIKNQNLTWLIKQIKKGKCESKESLHHLSWD VKNALPVFKSLMAQNLSPHDFPSRFVQTEGGFTIHTGFDELSNDPYNSTI YKVITKYSRKNFDHPFLYLDKKQNQIKNRILPKYKIDHDEFIFNDAIEIV TLPELVKNNPVEDFEERAQLHLVKPFFVKQGNNQFMAGISGXELSYEXLA KIFSDATSEIKTDEYNCFNNTELRCEIIDISGSILHSNREDVALGDFLGS VDPNLMRHMVEKLEIFVDENPIINYQALCPDSFECTASGVKVLPFSLDQA VKVWYSFLGVFQALQIVITSFLTTIYSFSEGSFGLSQFNHKVQEGIHRCT TKTSVWTINPNLKKSEFHDRMTSTCRSETECKRDLHMFKLKNINGLFVVS NPECAHCNAPPFPKGPVEIMATENCLLPHRYRKRQSGCFAQSDMETSECS KGSINLPGLWKTLILMYLSLLSPIFLRKLL back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1118:23248..41219- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000738-696585 ID=EMLSAT00000000738-696585|Name=EMLSAT00000000738|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17972bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1118:23248..41219- (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCAACATCAGTAGAGAAAAGTAGGCTTGCTAATTACAGCAAAAGTAT
CGGGATACAACATTCCGTCTCATTCTTTATCATGTTTTACTATGTATTGA
TACTATTTTGTCTCCATTCCGTCGAATCTCAAACATTTCCAAGTGCTGAC
ACGTAAGTATCCCCTCCCTCACTTTTTTTCTTATTCAAAGTAATAGCCTA
GATGATAGATCCAATCAATAATAACTAACATTAACTTAGCTATTACATCT
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TCATTATGCGTTTGCGAAGTATAAATAACTTAATAGTAATAATAATAATA
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GATCTGGATGGTTTTTGGTGGAGGAGCGTCGTTGGACTTTTTATTTTCAA
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TGGGAGAATTCTTCCTCCCTTCGTTCAATCTCCTCATCTATAGGATTTTC
GRCCTCCTCGTCCGTCACTGTCGCCTCTTCTTCCTTCTCATCATCACCTA
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ATTACCTTTTCCTATATCTTTGGCTTCTTTCATCTTTTGGCCCGACTCAT
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GTATATTCAAACACTCATTTAATGAATTATTTTTATCCCTAAAGGCGGGT
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ATAGAGCTATAAATATATTTTTTGAATTTAAATAATCAATTTATAGACCT
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ATGTAGAAAAAAACTAAAATATAGTCTACCAGCGAATAATTAAACATCTA
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ATATATATATATATATATTTTCTTCAAATCGGCCGAAATCGGCACGACAC
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AACTATAAAAAACATTCTCGAGAGCAGTCTCAAGACAAAGACCGGTACCG
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ATAATACGATTAACGATCTAATATCACCATATGTCACTTGATTGCCGATC
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GTACACGCACGATAGACCTAGTCAGATACCTTTAATCGCATAATATTCAT
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TTCTTTTTATCCGGCTTTGAAACATTCTGAAGCATTGCTTAAAATGATTT
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CTTGATGCCATAACTAGCGGAAATGCCGGGTATTGCTCATAGTTATTAGG
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TACTTTGAGTCACATTGGGTATCACTTTCATAAAGAAGTATATCCTAGGA
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AAAAATCGGTAATATTATACATCCTAAGAGAAAATTAAACAGTTCTGCCT
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CGAAAATGATTGTTAAATCAAGCCTGTAGGACTTTCCTATTAGTTGATAT
GGCTACCTAAAGCCAGGCATTTATCGAAAAGTGTTAATTTTTTTATTACC
GTTTGTCATTTGAGACATATTTTTTAAACGGCCATTGTACAAAAAATATG
GCAGAAAAAAACTAAAGAGACAGTTTTCTTTTAAAGTTCTGGACCCTTTG
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AAATACAGGATTGAAACTTAAAAAAACCATAATCTACTGACATTTTAACC
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CCTCCCCTACTTTTGGGCTGTGAAACCGGGGTCAAATCTCCAACCATGTC
ATATATACTCCCAAATTCTTTTCTTTTTTAATGTGACACTCTAAACTTCA
TTAAAACACGGTCGTTGCTACATTGTTACTTCTTCCATCTTGTAGTCACC
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AAATTTAAAATTGATAATACTATACCATCCTATCAATTTATTTCACAAAT
AAGTCAATCATCAGTTGTAATTAATTATAACATTTAAAAAAAATATATAT
TAATTCCTGGGATTTAACTAAATACATTTCCTTGCTTACAGAATTTAGTC
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AAACAATCGGGAGTTCACATACCATTAGAAATCTATGAAGGATGTAAGTA
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TTTTTAAGATCCCTTACACTTTATTGTTTTTAAATTTAAAAAAATTGAAT
GTAGGAACATGTTTTAATTTTAAAATAGTTTTATGAAAATAAGATTTCTT
AAGACTTTCTAGCTAGGCTCGAAGGAAGCAATTTTTTGCTAGGGAGCGTG
AAATAAAAAAAACTACAACAATAATTGAAGGAGTTTGTTCTATACACTAT
GCTTTCTATTACATCAACTAGACCTATTGATACCAAAAGAAGCCTTTGAA
CTTATAGAAGATTAAATCGAAATATATTATAGGATGAGAGATAGTTGGAA
AAAATGCTTCATACTTATCAATACTCTAAAAAATTATGTGAAATGTCTTA
TTTAAGATATTACATTTGCGACTTATGTTGACATATCAATTTTGTAAAAA
AAAAAATCAAAAATAGATTTCTGATCATAAAACTACATATTTTTGGACAA
ATTCAAATGACACTTTTTATTTTCATAGCAAAATGTATTATAAGCAGGGA
TCGACAACAATGCTAGCCTGTGGTTTGTAAAAAACCGGTAGGCCTAGTGT
AGAGTTGTCTGTCTCTAGTCTGTTTGTCTAGATAATGCGGTACCTTAACC
ATTGTACCAATGGGCTGTTCACCACATCAGTATTCGAACTAGCTTAAACA
TTAAATATCTCCATGAATTTTTTTGTTGCTAGTGACACTCATGATGATCT
AGATCAGGATTGTCCAACCCGTGGCCAYCGGACTGCATTGCACCCTGCTT
AATGTTTAAGTGGGGTCCACTACTCATTCTCACTTGAATACGTATTTTTT
ATAGAAATTGTCAGAATATCATCAAAACGAGTAGAAAGCGCATTCATACG
TACAAATATTGAAAAATATTCATTGATTGAATTAATTGAAAAAAGGTCAT
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AGGGTTGCCAGATAAGCCTTTTTTGAAGGCGTTTGGCCTTTAAAAATTAG
ATTTGGCCTTGTTTTATATTTGCCTTAAATATGTAATAAATATGCATTGA
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TTTTGGATATTTTTTCGAAAAAATAAATTTTTTTATAAAAGTTAAAATTT
TTGGATATTTTTTCGAAAAAATAAATTTTTTTGAGTTTTTAAAAATGCCA
AAAACCAAACCCCACCCTCCAGAAAAATATGTAATCCTGCGGACGCCCCC
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ATATAGCAAATTTATTCAAACCAATAAAATTTTGGATAAAAATAATTATA
AATTTTATATATTGATATGTAAGTACCTTATGGCTGSCGYCRTRTWCTTT
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TCTATGCGATAATGGAATGTTCTGGCAAGATCATTCATCCAATCTTGGTG
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AATAAACAAGGGCATTGGCAAGAATTACTCCGATGCCGATCCAATATTCT
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GTCAACAAGGGGTGGGCTGGAGGGGCTGTCTCCCTCCATATTAAGCAATT
TATACTTTTACTATAGATTTTTTTCGTCATTCGGTCAAATTATGCAGCCA
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ATTTAATTTTGGGATTTAAAAAAAAAAACAATCTCCCCCTCCCCTCAAAA
ATAAATAAATATATAATCCAGCGGACGCCCTGAATAATGACAACAGCTGA
GGAGTAGAAGATTCATACTTCAGTTGAACATTCTGAAAATGCGGGCCAGC
TAAAAAATACACACGATTTACATCACTAATTAAAATAACTCAACTGTTTG
GGTGGTACATGTTATTTAAATCTGAGATTCATAGATAGACTGATGAAAAG
TAATTGGGTTATATTATGTGATTTTATATATAGTATAATGGAATGCATTT
TAATATACTTTATTTTATGATTTAGATTTTTGCGTATGTGAAATGTCAAT
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TAACCACCAATCTACATATTAATGAATGAGGAAAGCCTCCTTGTGGACGG
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GATGACTGAAAATTCGTATTCGTTCAAATTGTGTAATTGTTGTATGCAGC
TGTTACTTTCTTAACGGCTGCTTCTGCGATTTTTTTCCCAAAATTCATCA
TCGACTCCKTTTAGTCATTAAGGGTCACAGAATTCAATTATTTTTCTATA
AGCTACTCACTCCTGCATCAACTTTCTCTACAGATAATTGATATCGTGAA
GGAGATAATAATCCTTGATTTATTAAGGAAATTGTTTGATGAATTGCGCG
GCTTAGCAAAATGTTGTTATTAGAGCATGCTAGTAAACTTTATTTATTTG
CTATAAGGGGCGTCCACAGGGGATCGGCTGGAGGGGCTGTAGCTCCCCAC
AAATTAAGGATTTTTTTCTTTTTACTATAATTTTTTCCCCCCCATTTTGG
CAAATGGCAGACTAAAATTTAATTTTTGAAATTTTTTTTCCAAAAATTTT
AATATTTGAAATTTAATTTTCAAAAATTTAANGTGAATAGCTGTGMATTT
TTGAYCTTTTTTGTWWATAASTTTGGATTTTTGAAATTTTTTCCAAAAAA
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GTTTCAATGATGCACAATGGATGAGTTATCATCAAAGCCTGATATATACG
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TGTTTAATATCCATGCACATTTACTTAATTGTGCTTCACATCTACCTACA
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GGCATTAACAATAAAAAAGCTATGAAATTACAACTTCCATGGTATTTTTT
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GCATTTATTTAACATTCCCTCATGGAACAAAACACATACATTTGTATAAT
ATGTACCATGTAAATAGTAGTTAGATCATCTTAATTAGTTTTTAAAGGAT
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CAATAGGGTCATTTGCCTTGTACAAAACGACCAAATAATTTAACGGAATA
AACTTGTTTTATGTATCCTTTTGTGGTTAGATAGTCGTAAATAGTGTTGT
GTCAGTCCTGATTAATTCGGTCCCATGCAGTCTTAGGAACGGTTCTATCA
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TGAGTGATGTTACCAAAGACCGAACTTAATAAGTTTTAGGACTGATGCAG
GACTTAATTAGACGGGACAGTCCTTCTGTCCTAAATAGTGTTAGATCGCT
CTAAAAAAACCCTAAAAAGACGTTAGTCCTATCGGTCCGGGTCTAATAAA
ATTTGTCAGTCCTAGGACCGGTCCTTATCGGTCTCTTTGAGATAGGTTAT
GAATTATAATGTAACTTTAGCGACTCAAATTACGTGATTAGTAGTAACCA
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TTAATGTATTTCTATTAACCTTGGTTACTACTAATCACGTAATTTGAGTT
GCTAAAGTTACATCATAATTCATAATCTATCTCAAAGAGACACGACACCT
GTAGGAGATGTGCGACTAGAACTTATTATTTTACGTTCTAGCACTCATTC
ATTTTTTTTTTAGTTTTTATATTCTTCAATCCTAGCTATGAGTCAAGAAT
ATAAAAAGATAGCTTGGACCGTATGAATGAAAAATCGATGTATAAGCTAC
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TGAAAGGGGTGGGAAAAAAAAAGACTGATCAGACAAGGCGATCAGTCCTA
GGGCTGATCCAACACTAGTCCTAAATATTTAGTCCAATACAATACTAACC
ACAACCCTTTTTGTAAAAACTGTAAAAAAATATGTAAGAAAGATTCCTGG
CCAACGATATTACCTTCTGTTTGGCCCTTTTGAAGAAAAAAAAGTGACCT
GTTATCTGTAAGAGTTCTTTATTTTTGCCATTTCAAATAACTATTTAAGG
GGTACAATTAGACTAACGATTTATTTATATAAATAAATGGNTAATTAGTC
GTCTTTGTAGAGGCTAAAATATAGCATAATGTATTCAAAACATTGCTAAT
GATATAGTTTCTCTTTTTTCTTTTGATATAGATCCAGACATATTAAATGG
AATAGAATGGTCAGGTGCATTAGATGATGTGCTTAAGGATAATTATAAAA
AATATCCAGGTGTGTATTGGCAAAGTTTTGGATCACAAACAGGATTTTTG
AGAGTATATCCGGCTGCAAGGTATTCATTAACTATCCAAATGAATGAATA
TAGTCTGATTTTATTTATATATAAAAGGTGGCAATCGAGTATTGAACACC
CGGATTTATTTGATGTTCGACGACGTCCCTGGTATATTCATGGCTCTGTT
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GCATGGTCAGTCCTTTGACATTATGAAATTGGCTGCCAAAATGCTGATCA
ATACTCTTGGGGAGGACGACTATTTCAATGTAGCATCTTTTGACCGAAAT
GTATCATGGGTGACGCCGTGTTTAGATACCTTAGTGCAGGCCAATTCCCG
TAATAAACGACTTATATTTGATGGAATTGATCAATTGGAGGCTCGATACA
TTGCCTCTTATACGGATGGTTTGAATTTTGCTTATGACAACTTTKAACAA
TTTGAAAGAACAAAAGAAGAGGAGGAAGGTGCAGAGTGTCATAAATTAGT
TATGGTTTTTAGTGATGGAGGTACTATTTACCCCGAAAAGGTTATTAATT
ATTATAGAAACCAAACCTTGACTGAAAATGTAAGGATATTTAGCTATGCA
GTTGGACCTCATCCCTTGCCCACAGTTGCTCTTAAAACCATGGCATGTCG
AACTGGAGGGGCTTTTACTACAATTACAGCAATGGGAGCTATTCGTACCA
AAGTTCAAGTATGTATCTAGGAGGCTTAAGGATTTTAAAAATGTGTCATA
CAATTTAGCCATAGCTCTTCATTTATCATAATTCCTCAAAAAATCCAGCT
ACACAAATATTGCAAATCAATAATTTCAATACAATTTTTTCCCCTTATAT
TCAATTAGTTACAATTTTCTACAAGATAAAAAAAAAGTGAATTTTGATTT
TTTCATTTTAGTAGGAAATGAAAACTATTTTAGTATTGATGTTCCAACAA
TAAAGTTGTTTGATATTTTTAGGATTCCTATTTAAATGTTATCGCAAGGC
CTCAAGTACTCAACAAGATCCATACTCTTCAATTTACATCGGTGTACGCC
GATGCCTTGGTAGTAATTTAAATTTTTTGAATTTCAATAAAAAAATAACT
GGGTTTGGTTACTTAATGAATATTGACTAATATTGGTGATGTTTTAAAAT
ATTCTTTTTATTCATAACATACCTATCAACCTTCTCTGTAGAAAATGTAC
TTTACAATCTTAAAAGATACTAAATATATATATATTTTTTAAAGTTAAAT
ACATTTTCTTCGGGCTTTTGAGGTTTTGGGTTCTTGAATGATAACTTTGC
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TTAATGTCTTTTTCTTCTTCTTTCTCTAATGCTAACACGTAAAGGATTAT
GCTCGTGTCCTGAGTAAGCCTCTTATTCTAACTAACAGCAAAACCTATTA
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