EMLSAT00000000738, EMLSAT00000000738-696585 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000738
Unique NameEMLSAT00000000738-696585
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1118supercontigLSalAtl2s1118:23248..41219 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000738 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000738EMLSAG00000000738-683504Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003180EMLSAE00000003180-712108Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003181EMLSAE00000003181-712109Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003182EMLSAE00000003182-712110Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003183EMLSAE00000003183-712111Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003184EMLSAE00000003184-712112Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003185EMLSAE00000003185-712113Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003186EMLSAE00000003186-712114Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003187EMLSAE00000003187-712115Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003188EMLSAE00000003188-712116Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003189EMLSAE00000003189-712117Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003190EMLSAE00000003190-712118Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003191EMLSAE00000003191-712119Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003192EMLSAE00000003192-712120Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003193EMLSAE00000003193-712121Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003194EMLSAE00000003194-712122Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769580auto769580Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000738EMLSAP00000000738Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000738

>EMLSAP00000000738 ID=EMLSAP00000000738|Name=EMLSAP00000000738|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1080bp
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AETVSKEITRIFDYNIKALKNLVSNIEGLVKNYKYNDDLNPDILNGIEWS
GALDDVLKDNYKKYPGVYWQSFGSQTGFLRVYPAARWQSSIEHPDLFDVR
RRPWYIHGSVTPKDMIILLDTSGSMHGQSFDIMKLAAKMLINTLGEDDYF
NVASFDRNVSWVTPCLDTLVQANSRNKRLIFDGIDQLEARYIASYTDGLN
FAYDNFXQFERTKEEEEGAECHKLVMVFSDGGTIYPEKVINYYRNQTLTE
NVRIFSYAVGPHPLPTVALKTMACRTGGAFTTITAMGAIRTKVQDSYLNV
IARPQVLNKIHTLQFTSVYADALVIEEMSELPIALAXFGNVLNVQSGLGL
ITTVTYPVFNTSDGSDNQTLAGVVGIDIPVNDLEALIPRRQLGALGYGFA
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GSSTIEIDHEVLEFNYFHVPNSSFSVGIVNPENWSYIKPGAEDINIISDM
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VKNALPVFKSLMAQNLSPHDFPSRFVQTEGGFTIHTGFDELSNDPYNSTI
YKVITKYSRKNFDHPFLYLDKKQNQIKNRILPKYKIDHDEFIFNDAIEIV
TLPELVKNNPVEDFEERAQLHLVKPFFVKQGNNQFMAGISGXELSYEXLA
KIFSDATSEIKTDEYNCFNNTELRCEIIDISGSILHSNREDVALGDFLGS
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VKVWYSFLGVFQALQIVITSFLTTIYSFSEGSFGLSQFNHKVQEGIHRCT
TKTSVWTINPNLKKSEFHDRMTSTCRSETECKRDLHMFKLKNINGLFVVS
NPECAHCNAPPFPKGPVEIMATENCLLPHRYRKRQSGCFAQSDMETSECS
KGSINLPGLWKTLILMYLSLLSPIFLRKLL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1118:23248..41219-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000738-696585 ID=EMLSAT00000000738-696585|Name=EMLSAT00000000738|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17972bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1118:23248..41219- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGCAACATCAGTAGAGAAAAGTAGGCTTGCTAATTACAGCAAAAGTAT CGGGATACAACATTCCGTCTCATTCTTTATCATGTTTTACTATGTATTGA TACTATTTTGTCTCCATTCCGTCGAATCTCAAACATTTCCAAGTGCTGAC ACGTAAGTATCCCCTCCCTCACTTTTTTTCTTATTCAAAGTAATAGCCTA GATGATAGATCCAATCAATAATAACTAACATTAACTTAGCTATTACATCT TTACACCAAGTCTTTCGCAAATTATAATATGAATTGTCATTTAGAAAAAA AATATATTATTTATGGTCAAGTTATTAGTTAAAAATTCTTATGAAGTTAT GTCAATATACAACAATTGATGTCTATTCAATGTTGGAAAACTAATTATAT ATGTATAATAGATATTGTGAGACATAGGATAGTGCAATGATTGTATGAAG GAACATTAGACTGACTATGCTTTCTTCAAGGAGTTCTTCCTAAAATGTAA ACAACTAGTTAACTAACTTTATTATTTAAAAATAAAAAAATGAACGAAAA GACTCATAGAGTGTTTAAGCATAAAACTTTTAATATATAATATTTACATC TCATAATACTACTCGATATAACTTATAAATCCAGAAACGTCTTATGCACT CATTTCCAAAACACAACTCTTGTTTTTTTTTTGTATGAACTTGATTGAAT GACTTACTTAATATTGGTAGAATTTGCGTCTTACTACTATTAATTCTTTT CTAGGGCCAAGTCATGGAGCTTACGAATTGATGAAGCTTTCAAAAAGATA TCAAGTGGAGACGGAGACTTGACTGGAGCAGAGACTTTTCAAAAGGTAAA AACCATCAAGTGTTCTTTGAAACGGAAAATTCATATCTACAAATCTATGT TAATCATCCTATTATTATAGAAATTTCAAGATAATATCGGAGAAAGTGTA 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