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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1119 | supercontig | LSalAtl2s1119:100358..134995 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000740 >EMLSAP00000000740 ID=EMLSAP00000000740|Name=EMLSAP00000000740|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=847bp
MPGIESSMEESPANRIYTMEHYRSSESLEDRHSNASSTESQRQVLDNYVR KDHEFIPTRMKTITASKPAANPGQFTKIPSNPLLLSAQSQMMKVEQNLNV WKDRRRKQSEDALLRVAEIKKSHPNISTHRSLSTSAMPNTPAVHPPPPPV STLPAAQYKEVREEPRRKMSPKRSRSTGVLMSSEEIKQTTEAAQLQSQPL RRKSSELSMTMKNRLEAFEIVQEDNNPPVSSSSVPKNNIIITNNNTNMSS STMKSSNPVPPDETFRQKLESFKEKEIEKEEAKYIPPKKSITDFLNPPDL QNSLGSSGGGVXSSGXSHNISSYSSQDVEDEDDVDKLLDDALEESYRSVL EDDSPYHQSSNHHNSPHNISSSSSTSAKSVYSFEDFSPSSGPPKEKPPPP PTEPPPGSNTPHSSSHNYSSSFHSTVKNRGNVDSPDYRQERIHEVVKDEM NNRAKMDEEEMDKQERDIIASLEVEEKEHLKYMESVSSMKNIXLNSNSHS IPITTITSSTTNISGPIQKSASSSHKQHSPLHNKHNPYEDSPKKKSQNSS ERNINNHWLIQEAEQRRITEMQQQPPSRNLANNATISQNKTSPSNHYGQS RNNGGGGGHNNNSHTYENSVEIRNNKANLHHQSPPQPQPQQPTIPNHNXX SSSXMHYSKQATTTTTVAQQQQQPIYNNYPPANNSYSYENTYANVQQPPP PSQQXQQHPPQQLQQQQINHSPPGHNNNNNYPTMSMRESINNSNNHTNSN VRVPGPQVPPRNMENPDRMLSVSGKKKCSHCREELGRGAAMIIESLRLYY HLRCFQCCVCQIQLGNGTAGTDVRVRNNKLHCQNCYSNDDGLKFSKV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1119:100358..134995+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000740-696587 ID=EMLSAT00000000740-696587|Name=EMLSAT00000000740|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=34638bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1119:100358..134995+ (Lepeophtheirus salmonis) GTGCGTGTAGGTCCGTATTTTGCGCCTGCGACCCTTAATAATTCTCACTG
TCTATATGTGAAGTAATTCAAAATAAGGAAAGAAAGAAAAGAATAAAAAA
TTATTCTATGGATGTATTCAGTTTTGCTCCCTCCGGGTCACGTAGCTGAC
TCGCTCGTCTCCGATATTGGTTTCATTTTTTAGTTTAGTTCTAACTGCAT
ACGAGACATTGTCAACTTGGTGTTGTTTTTTTGATAGACAAAATAAATTA
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AGCTACAGGTAAGAATACTCATTTTTTTTAAAAAATAACATTGGATTGTT
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CTCTCTAGTTAGTTCTTTATTGTTAGTCTTCCTTCTTTCATTTTCTCTTT
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TGTCAATAGTAGGCATTGCATTCACGTTTCTGGTAGGAGTTACAATGCTC
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TACCTCACATTGAATCCCTTATACTAATCAATAGCTGTAATAAAAGTCAC
CTCAGGAGATCCTTCTCCTGAGAAGTCTTGTTATAGTATATATACATGAC
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TCTCTGGTGTAGGACTGAGCATGAAGCCTGTGTCATGTATCATTCGTCTA
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ACAAACTTAACACATAAAAATTACAATAAAAATAGCTGAGTGCTGTTAAG
AAAAGAAGGAGTTTGCTGCTCCATCTCTGACCTACTTTGGATCAAAAGTT
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TGTTTCATTAAGAAGTCTTATTTATGATTTCATTTACTCCTACCCCACCC
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CAATTATTGAAAGATAATGTCAGATAAAGACATTATCACTATTTATTAAG
TACATTCATTTGTATGTACTTTGATTACATAATTAAGTGGCCCTTTTAGA
TCCATTGCTTTTGATAAAGTAATTTTAGATATGCACCCTGTTAGATGTCT
TCGTCCTTAGGGTGGTACACATATATGTACGACCAAAATATGTCGGAAAG
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ATGGGACGAAGGGGATCCTACCCCCCTACATACCTATGGTGGTATACAAG
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TGAACTGATTCGAATCAACAACGAAATCCTTTTTTATTACCCATTGTTAA
CCATCTCTTAACAMCCCACCGACGTATCGACCAACCCCTTCTCTCTCTCC
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AGAAAATTGAATCAAAATCCTGACAAATTTTTATATTTATTAATTTCTTT
TGTTTTTTTTTCTCTCTCTCTGTTGGAGGGATAAATTCAGTTCCTTGTAT
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TGTTATTTGTACCTTATAATTTTATATAGTCTATAAATAATTATTAGTGA
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ATCTCGATCGGGTACCACGTCATTTTATAAGGGGAAAAAAATCCGACTAT
GATTTAAATTTCCCTCGATTTCGATCTGGACCGAATTATGGGTCTAGTAA
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ACAGAAATAAAGAGAAAATTCAAAGGATTTTGTTAACATTATAAAATAAA
TGAGGTCTATTTCTTTGAAATTTTTCAGCATCTCTGATTTGTATTTTTGC
ACAAAGATCAGCTCTTCTCTATGAAATGCCCGGGATAGAGTCAAGCATGG
AGGAGTCTCCTGCAAACCGCATATACACAATGGAACACTATCGCTCCTCT
GAGAGCCTCGAAGATAGACACTCTAATGCTTCTTCCACTGAGAGTCAAAG
ACAAGTTCTTGATAATTATGTGAGGAAGGTAAGAAGAGAATGATGTTGTT
TGCCTGTTTGCTTTGATGTTTTTTTGCACACCCCTTAGTCCCTTATTCTT
CTACTAGTTAGTAGTAGATACGTATAAATATACACATTTTTTGCAATGTA
ATCCTAGATAATATGAAGATAATATTAATATACTCCATGTATTACTAACA
GCATGTCTATCAATTTACAATTTAATTAAACAAAAATGAAATTATTTTTC
ACAAATTAGGTATTTTTCRCAAAATTTATTCTTCTTCCAAGTAGATTAAT
TCGTATTTTAGTCATGTAATAGCTACGATATACATATAATTTCTTATAGA
TATTAATTAGTATTGTCACGACATCAATATATTCCATCCTGTTTCAAAAT
GAGTAATCCGTATTTCGGTGCATTTCCTAATAAAAGCATAGCACAAAAGT
GTCCTCAAGGGTATTTCTCACCTAAATGATTTTTGTTTGAAGTAGGGTCA
GGGACTAGCTCGGAAGTTTGTGGACTTTTAATTGTATAAATAAAAATAAA
TTTAACTTCTTCCTTGTTTTATTATGACAATTTTGTTATGAGTGATTAGC
TCAGATATTTTGAGGTTACGTCATCGATAAGCCATTTTTTTTGTTTGACG
TAGTGGTGTTGGACGTATTGGTTATTTATTTAGTAGTAGTGTTGGATCTG
AAAATCCCAAACCCGTTTTGTAAGATGGAAATAATTTTGTGCAAGTTCCG
TCTGGATGGATCTCTGAGTAAAAGTCGAAAAGATAAACATCTTCTTTTTT
TCAGCAAAGGAAGTTGGTCTACGATTGAAATTTCAAACTGCAAAAAAAAA
AAATGGAATTGAATATCGTTCCAGATCTYTTAACCTTCATCCCCCCCCCC
CCCAAAAAAAAAACTCTGTCTCACTCAGAGTTTCAATTCTACTATTTGAT
ATAGTACTCGGCATTACACATCGTATTTTGTTTTTAGATGCCGGCGTTTC
TGCTTCTTTTCTCCGAATCAATTGTTTATTTACCCAAATAAGTTATATGA
TACCATTCCATATAACTTGCAAGAAATATTCATTTATTCATTATAATGCA
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TCAGTCCGATCCTCATAAAATTTGTCAGTCCTAGGACCCGCCCTAATAAG
TTTTATGGTAACTACAACAGCTGAAATGGTGTAGTSACTAACACCGTCAT
TTCAGCTGTTAAATTTTTATAATATACTCTCTACGAAAGGGAAAAGATAA
TTAGGAAGTCGGTCTTGAGATCGATACAACAGTGTATATATAACAGAGAT
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TGACCTTCTGTATGGACGGACAAGTAGGAAAGCACTGGACTGAGCCAAGG
TTCTGAATAAGTACCTACATCAAGGGCCTCCATAGGATTATATTTTTTTG
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TGGGAAAAATAATTTAAAAATCCATAGCTATTCACAAAAAATTTCAAAAA
TCTAGACCTGTTCACAAAAATGAAATTTATTGGGATGTAATAACCAGAAG
AAAAATGACTACTCATATTATTTAGGGCTCTGATATTTTATTCTCGAAAA
ATAAAAATGTATAATGAAGTTTTGCATTTAATTTGTATATAAGTAAGACT
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GAGGAAAATTTCCAAAAGCCATACATTTTCTCAAAAACTTAAATTTCCAA
GAATTGTTTTCAAAAATCCATAGCTTTTCACAAAAAATGTAAAAATTAAA
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GAAATATTTCAAAAGTCCGTATCTATTCACGGGCAATTAATTTTTTTAGA
AAAAAAATTGAAAAATTAAATTAAATTTCAAATATTAAATTTTCTAGTAA
GAGTCACTAATTCCTATTTTTTTATAACTAATTATAGTCTTTTCAAGTAG
TGCTCCATTAGGGAAGGAAATAATATCAATATATATGCAAATTAGGCCCT
GCCTCAATAGTTTTTTGTTTTTCTTCTTCATTATTAAACATTCTTTTTTT
TTTTTGGTGGAACAACTGTAATTTTTTATTTCTTTTACTCGATGTAGATG
ATAGCACCCAAATTTCTCTTCCACAAAGAACACACAAAAATAAATGATAA
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GGTAGATACTTATAAATACACCACATAGGTACGAGAATGAATGGAACATA
ATTAAAATTCCATGCCTAATGTCTGTGAAAACTAACTGCAATATATATGA
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TCCGCGGGGTCATTGAAGGAATTTTTGCTTTTTACTAGTAAATTTAATAT
AAGAACTTTTTTTTCNGAGTTTAATATTTAACATTTAATTTAAGGTTTTT
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GATTTCTGATTTTTTTTTCCAAAAAGCTAAATATTTTAAATTTTATTCAA
AATAATTTAATATTTTGAATTTTTTCCAAATAATTTAATTTTTTTGTGAA
TACCTGTGTAATTTTTAWATTTTTTTCGAAAAAATTTAGTATTTGAAGCT
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TGTAAAAAAAAAAAAAAATTTTTATTAATAGCTTATTTTGGAAATATTTT
TCGAAAAAATTTAATAAAAAAAAGTATATATATATTCCTGTGGACACCCC
TGATACCTATATAAAGAAAGCCATAAGATGTGTTGTTGAATCGGTCCTAG
AACTTCATTCTTTATCATTCTTTTTTCAAATCGGTCCCGTCTTTTTCACC
ATTCATCAGTTCTACAGTACAGCCATCTTTTTATTTTCTTCACTTCTAGT
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TGTAATACTTAAGTATTACACGTTCTAGGCATACACCTCCATCTTTAAAC
TTCAGGTATCTTGTCTCCTGGGAAGTGGTTATGATAAAACTTTTGAAATG
ACGTAGTTAGCAACTACGCCATTCACGCTGTTGTAGTTACTATATAAGAC
TGATAAGGACCGGTCCTAGAACTGACAAAATTAATTAGGATTGATAGACC
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AATGCACAAATTATAAATAACCCCAATATACAATTTAAAAGTGAAGGAGT
TTCATGCATGAGGTTCAGTGACTTGACTTCTTGGTTATTTCCATGGAGCA
GTGATTCCTACGTGGGGCTCCATAATACATAATCCAGTGTCTCTGAGGTA
ATCAATAAGTGTTTGTTTTTCTCTAATAAATGTATTTGAAAAATCATAGA
CCCAAATATTCGGGCAAAAATAGCTACCCCTACTCAAAAAATAATTACTT
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ATCAAACTGTCTTACAATGATGTATGTAGTTGATGTAAATTTTTATAAAA
TTTGTTTTCAATGTATATTTGACGAATGAGATGTTGACACAACCTAATAC
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GCATTACGTCGCCAAACGGGTTAGAAAAAGGGCACCCTGCACTAGTCTGA
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ATATAGTGTTTGGATTCGTTCTGGAAATTAAACACAAGGTAGTCTGAGAC
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TTTTTATATCTCATATTTACCTATTTTGGGTGATTTCCTGCATATTATTG
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GTGGGTGAGCTGATTTTCAAAATCGAAAAAATCTGAGTTTCCTTCATATT
TACATAGTGAAATAGACTTTGCAATTTTCATCACTAAGATAGATGATATA
GACATAACTGCAGTTTTCTAACGAATTATCTAATCCTTTCAGTTATTAAA
AAAATATTCGCTCCTAAATAGTGTTGTGACTGTCCCTATTTATTCGGTCA
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AACATGCTTGGTTATTTTATACGTTTAATTGGTAAATTTAAGACTGATCT
GTTTGACCGTTTTGAATACCATGTGTGATAATACCAAAGAATACTTAAAA
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TAATTTGTATGTTTCCTATCAGTTAAATATGACACATTTGCTGATAAAAT
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ATAACATTTTATAGCTATTTACAATTTATTCGCAATCTTTTATTTTTCTA
TGTAGGATCATGAGTTTATMCCTACTCGTATGAAAACGATAACGGCCTCC
AAACCCGCTGCCAATCCTGGGCAGTTTACTAAAATCCCCTCCAACCCACT
TTTACTCTCGGCTCAATCCCAAATGATGAAGGTGGAACAAGTGAAGAAAA
CCAAGGAAGTCGTTCGGAAAACAGAGGAGGAACCAGATTGGCAGTCTGTA
AGTAATGTAAATCTATTATTTTATTTTCAAAATCAGTACATTAGGACAGG
GTTTTTTCCCCAACTTTTTCAAATTTATATTACGGGAAAATTTGTCATGC
AGTAAAGAAATCCTCTATGCAAAATATTTATGTTCTACCATGCCATAACT
AGAGTTAACATGTTTGTACTAATAATAATAAAAAATGTTTAAAAATTAGA
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GGTATTCATTGTGATAACTTTTTCTTCTGCAGTAAGCATTCTCGTTTATC
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GTTTATAAGCAAAAAAGTCCGATCTGCATCAAATAGCCTAATTACGGTAA
AACCGGAAACGCTATCACAAATTTGTATTTAAATTATCCAAAATTAGAAA
TTATTGCATCAGTGACCACAAATGTCTCAAGACGAGGTTGGAAGCTTCTG
CAAGCTCTGACAATTTCGACAGAATCAACGAAAACCCATTCACGGATAAT
GGAAGCTGTAGATGATCGTGGCCGGKCTTWGTGCCCTTCCTCTCAATGTT
GCCCTAAAAATAATAATCCAGTGGATTCAAATCTGTTGATGATGGTGGCT
TTTCTCTGAGGACTTTGTCAAAAGCAACCAGTTTATTCTTGTATTGTGAC
TATTTCATCTGGATATTTCCAAGCCTCCAAATTCGCTCAGAAATGTCGAC
TATCCCTGCTATTTCAGAAGGACGAATTTGTGTACAAAGTAAATCTACTA
CTCAATGCCTTTGGTATTCTCTCTTCGACATTTCTAGATCTAATGGTCTT
AAACCAAGGCCAACTTATGTATTTTTTAATTATGCATCCAATCTATTCAT
AAAAAGTATATTGGTATTAGGATACAATGTTGGTGGGAAGGAAACTGGAC
TTTTTTGCTTATAAACTCTTTATATAAATTGAATTATTATTATAGCATTT
TCCTTGCACCAACGCAATTTTAAATATAGAACGTTCTCCTCTTTATACAG
AAAGTCATTTTCTCCCTGCAAAATCATATAACAGGTAGCTGATATTAACA
TTGGTCTTAATTTAGGTTTACCATATGCCTGGCTCCAGCCTTCTCCTCGT
GCTCTTTTTCCCCTTACAAATGTGTCAACTCTAGTTATAACGTAGGAATA
TACATATTTTTTTTACATTTGTCAGTTAAGAAATTATAAATGTTCATAAT
TTCCTTTCGCTCTAAAGAATGATGACATATGAAAAAAATTAACAATTATT
TTTTTTGGGTTAGAGAAATGTCTATCTTAATTATCTTTTCATTTTAAAGT
ATCATGTTTAATTTTAATCTGTATTGACTAAATAAAGGTATGCTGCCTTT
ACAAAAAATGTAAAGGGTTTTTTTCTGCACAACATTTCTGCATTAGACAT
AATTAAAATTCGAGCAAAGTGGTGGAAAAAAAACTCCCCTAATATATACG
CTTAAACTATAAACCCTCTTTAATGTTCCCTTTTTCTCTCTCTGTGTAGA
ATTTGAATGTTTGGAAGGATCGTCGACGGAAACAGAGTGAGGATGCTCTT
CTACGAGTAGCGGAAATCAAAAAAGTGGATGATGATCCCTCCATGGACAC
TGGCCTAGAGAAAAGAAAGCTGTAAGTTTATGTTTACAGCTTGCACTTTA
TTTTTTAATAATTTAAGGGATATAAGATTTGCGAAACATTGATATGCGGT
GTTTTGTGGTTCCATATTTTGGAGTAAATACTGCAGTCCTGTTCAGTTCA
ATCTTTATATCAGTTCTAAAGCTTATAAAGTTTGGTCCTTAATGACGTCA
CTGAACTGTATTTCTACTGTTTTTAATCGGTTCTAATACTGACAAACCAA
AGTACCGATCTCAAGGACAGATAGGACTGGATCGAATAAATATGGACTGA
CACAACACTAATGATATGCAATTTTCCCTACTTTATCTAAGGCTCCTCCC
TTTTTGTTCAACAACTATCCCTTTATCTAGGGTTTTAATTTTCTTTGTTA
TGTTCAATAAAACAGAAAACCTATAAATCATTTGGTACAATTTAGAACAC
TTTAATTATTAAAGAAAAGTGCATAGTATTTCTTTAATAATGAACCAAGT
ACTAGTCATAATATAATTAGTACAATTGTTGACGCATAACATCTTATTTG
GAACGGTAAAGGAGGTTTTTGACCCCAAAAAAATCCTATTTTTTCATTTG
AAAATGGCCTATACCACCCCAAAAAAATGACTTGAGAGGCCTCAAACTTT
ACCAAAGTCCGTTTTTATTGTACCTAGACAAAAACATCTAAAATGAGAGC
AGTGGAGTCCTTCCTCTTTTTTTTTTTCATTTCTACGAACTCATGCCTAT
AGTTCAGGGTCGGTAACCTTTTGAAAGTAGGGGGCAAATAACTATGTTGT
GTCATGGCATAGGGCCAAACAACTATCGCTGCAAAGTCAGGGTGAATTAG
TATGCCTATATTAAGATGATTCTCCATGATAAGATTGCGGTCAAAATTCA
CTCACGGTCGGGTGGTTGTGGACCTCTGTCTATTTCTGTTTCTTTGTTAT
TATAACGTTTGATTGTTTTCCAGCAAATGGCCGATGATAATTTATTCAGA
GTCGACACTTGAAAGAAGGATTGAATATATAAAATTTTACTCATTGCCCT
TTGCTCAGCCTGACCTCATACCTTTCTTCGTGGAGAGGAATGATATCATC
CATTAAAGAAAAAAATCCCGAGTTATCCGGACCACCCTGTATATTCAGTA
CATACAGGGTCTGAATTCTTTGTTGGCTCCAAGTTTTAATACAAATATTT
ATTCAATTGAAGCTTGCCTTTTTATTTAAATTATACTTGCATATGAAATT
AAGTGGCCCAGCCAGGCAATATTAGTACATGAAACTGTTTCAATTTTAAA
ATATTTTATAAAAAAGGATAGATTTATATGGTTTATCCTTAGAAAATGGT
TTCTTCATTTACTCTCCCTTTTCTCTTGTTAATATAGGCCTGAGTTTGTA
TACTTGCTATTTAAATTTCATTTCCTTTTCTCTAGTAATCCTTGACCTAT
TAAAAAAGTTATATGTCAAGAGAAGGAAAAAAAAAAAATMAAGCCAAAAT
CGTCTCTTTACCAAGTTTAATTTACGTATTAGTGTTACAATTCGATCAAT
GACTCCTTTTTTAAAAATGATCTAATTCGGTAAGTAGAACAATCCGGCAA
GCAAGCTTGAACCCGTTTAAAAAAAAAAAATATTATGGATATTCTCAAAC
TTATTTAGAAATGAGGAACGATGACATCATGCGACGAACTATAGTTAAAT
CAGTTTTCAATTTAACGTAATATTACGTTCTATATATTTTAAGAATATCT
TTTTGCAGTCTAATGCAGTCTTATTTACAAATTTTCGGGATACACTTTCT
CAGGACCAATGACATTAGAGTTGATTGTTTAAGTGCATTCAATTTTGTTC
CATGGTCTTTGACCAAAATGTAGATTTGCATCTGTATAGAAAAATCAATT
AAGACTATAATTGATCATTTCAAGTATATATTTCATTTTATAATCTCCAG
TTTGACTCTTGTTAAATGACTTGTAATTTATGAATGTCTTCTGGATTATG
GAATGGATGCTCCTTTTTCATGAATGATAGATTAAAAACATCTTTTAAGA
AGGAAATAATATATATATATATATATATTTGTGGCTTTGTGAATGAATGA
ATGAGTAATGGGAGTAAAAAGCAGAAAAAACCTATGAATCTCTCTCACTT
TGAAATATGCATGATAAATTACTTGCATATTTAGGTATATAGTACATTTA
CTTAAGTATGTAGGTATTTGGGTTCATCTCGGGGGATCTCGGGATTCTGT
TTTCCCGGGAGTCAACACTTGTATTCGTACTCGGTCCCTCTAGACAGTCT
GAAACCGTGGACTTAAATGTACCTATTATAATTTTTAATACGTAGGCTGC
TATATATATTTCTGGCCTAGGCTACACTAAGTGTTGCCAGGTGCAATTTG
ACATTTCCTTTCGTAAGTTTGACATTTTTGTAGCATAATCGTACTCAAAA
TGTTTTGACGTATGGCCATCATTTGTGTTGTTTACATTGAGTTGAAAAAA
TTAATTTGGCAAAAAAATGGAATTAGGTTGTGAACATTTTCGTGCGATCA
TTTTTCACAACTTACGGCGTGGATTATCATGACAAGAGTGTATTGACGAA
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AAGACTAGCTAGTATTATGAAGTAGTGTTGGATTCGAATATTACTCGAGC
CCGAAAAAAATCTCAGCTTTATTAAAGTGGTCAATTATCTAAAAACTACT
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GCATCATCATCACATAAACAGCACTCGCCCCTCCATAACAAGCATAATCC
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AGCAAATTAATCACTCTCCTCCTGGACACAATAATAATAATAATTATCCT
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ACTCATATGACTTTTATAAAGAAAATGCAGTTTAGGTTTGAGTGATATGG
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GAAGTAATGTTAAGAACATAGAGGGCGCTTCAATTATTTTTAGTATCCTT
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