EMLSAT00000000759, EMLSAT00000000759-696606 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000759
Unique NameEMLSAT00000000759-696606
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1122supercontigLSalAtl2s1122:10916..48768 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000759 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000759EMLSAG00000000759-683525Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003338EMLSAE00000003338-712266Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003339EMLSAE00000003339-712267Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003340EMLSAE00000003340-712268Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003341EMLSAE00000003341-712269Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003342EMLSAE00000003342-712270Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003343EMLSAE00000003343-712271Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003344EMLSAE00000003344-712272Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003345EMLSAE00000003345-712273Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769027auto769027Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000759EMLSAP00000000759Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000759

>EMLSAP00000000759 ID=EMLSAP00000000759|Name=EMLSAP00000000759|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1288bp
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RRKDDEGPGRSRRGSCCPLLFERSSKTWWNPSFDSDILEDTFRRSTLTRT
TRLFQLGLIYVLISSTALAIYYSICQTPHYLVFAVPCGIIALMSIFTWLF
FSSSSSTGXYXKHHFXISSLLGALLIGLSLCSVPYLGTDLSQVGSFALYL
EVLLLLYGIIPLPLYVNVLLGIIHSVLYEILVNLYAPLPTQTRLIIVRIL
LHLCVHAIGXHILITTQVRMRDTFMKVGHSLVVKKQLVTEKGIKEQMIIS
VMPPKVADWLMKEGHAEDDCDSDDCDDDFSESGSMIRKISSPRSSNQGDI
RTIFRPFNMNAMENVSILFADIVGFTKMSSNKTASQLVGLLNDLFGRFDD
LCTATGCEKISTLGDCYYCVSGCPEPTPDHAKNCVEMGXAMIRAIREFDD
DRNESVNMRVGIHTGTVLCGIVGKKRFKFDVWSNDVTLANKMESSGKPGL
VHISEKTYSFLKEDYFVSEGESVKGITTYFITGRVHPEIDYLKKKRVHSI
SGEDGDTSNMPSNPKSTAKSLPSLALKNMAYKGSGDGKQSITTKLFSDRN
GATMDERKNMLKKSISESNGSNKKIVDVEDGLRKVETNSNNNFQKQISFS
ENGPPGFVPVDILGRRYSNSLPVLAGHKSIVSLGGSSSVVEGCNELLRGG
NEGSGAKTSLSDSSTSLSLNSQHRHSDIVMIQCVKEDPGHHSYFTRPPLG
NFTLCFKDWTTEIDYRRTAWQKSRVVGSVHHDTNKPPPTIASSNGLLDAI
VVFVFYVAVSLSLFISFPITSHWLIVFGLGTIYLVFLLGLYLSKNRSQDN
KSHTPRHHHHSVTHHVTQINRHHSIRKPNNHNNNVQEPWVNRVYAWCQSW
YPSHFIGSILLALPQMFIFANFACLQVHVEYLNLFFAALLHITNLSSLSS
LVKTIIALINGCTLVLLVALCPCKSVPMQLLSDSELNYYSNNTAAATTTM
TINDSQDWLFDSTNCVTIAELSLHVALLCFLICLLNREFEISYRLSFHCS
YLTKRDRKKVQNLKNQADWLLHNIIPRHVSESLKKSLRYSENHLAVGIIF
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STLMAASGLNPYIRKENIHKYQHIHQLMEFVFELQQSIYEFNQSLIEFDL
ILRVGFNFGDVTAGVIGTTKLFFDIWGDAVNIASRMESTGVEGRVQVSEK
AMHALSEWYNFEERGSIVVKGKDDMTTFLLIDKKLPPI
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1122:10916..48768-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000759-696606 ID=EMLSAT00000000759-696606|Name=EMLSAT00000000759|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=37853bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1122:10916..48768- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGGGAAGTCATCTGATGGCAATGGAGAAAAGGAAGAGGAATATCCTCC TGTCGAGCTTACATACCGTCCATCCAGCGGATCCATGATGACACGAGAGG ACGATGATGAAGAGGCGGCTCACTATGACGAAATAAGAAGGCGCCAAAAG CGAAGAAAAGATGATGAGGGTCCAGGACGATCACGTCGAGGAAGCTGCTG TCCTCTCCTTTTCGAAAGGTCCTCTAAAACCTGGTGGAATCCGTCCTTTG ACTCCGATATCCTTGAAGACACATTCAGGCGCTCAACACTGACTCGAACG ACTCGCCTTTTCCAACTAGGACTCATTTATGTCCTCATTTCCTCCACAGC TCTAGCAATCTACTACTCCATTTGTCAAACCCCACACTATTTAGTTTTTG CAGTTCCTTGTGGGATCATTGCTTTGATGTCTATATTTACTTGGTTATTT TTTTCTTCCTCCTCATCGACTGGCTGSTATTTNAAGCATCACTTTWAGAT CTCGTCACTACTGGGGGCCTTATTGATAGGRTTGTCTCTTTGTTCAGTCC CTTATCTGGGAACGGACTTAAGTCAAGTAGGGTCCTTTGCTCTCTATCTA GAGGTCCTCCTTCTCCTCTACGGTATTATACCACTCCCTCTCTATGTCAA CGTCCTTCTTGGAATCATTCATTCCGTGTTGTATGAAATTTTAGTCAACT TATACGCACCTCTACCAACGCAAACTCGTTTAATCATCGTTAGAATACTC TTACACCTCTGCGTACATGCTATTGGCTGKCACATTCTTATAACCACCCA GGTAAGAAAAATTTAATTTATCCTTTTTTTAACTCTACCCATAATATATA TATATATATATGTACATTATATATTATTCTTATTCAATGTAAGTATGTAC ATATCCCTCAATAGATTCAAGCTCTTTTAAAGAAAGCTCCTTCAAAATTT AATAACTCATTAGCGTTATGTAAATATGGTTGACCCTGAATTTACATCCA AGGTCATTATGCAGTCTTATGTAATACTACACAATTACTATTGAACTCAA GTCAAATGAATTTATGTAAATGAACATATTTATGTATGTAGTTCCCTTTA ATTTATGTAGAAAATGAACATCTCCTTCAATATGATTAATTAGTCGAGTA CATTTTCTATCAACTTTCAAAGAAGATGGATGAATTCATTATAATATGAA CTCCCCCTTTAAATGATTCTTCTGTCCTTGAAGATCATGAAGAAATAAGA AGGAGTTACCCCAAACATTCTTTGCGTGCATCATTATTCATTTGATTMCT CTTCTTGCAAGTCATMCAGCCAGTAGATTTAGTACCTAATCCTACTCCAC CATACCGCAGGGTTAATCTATTGATGTCTATTAAATCAATATAAAATACG TAGTTTTGAAGTTTACCTATTACTATTAATATAGTAGTGTATGCATGCAT GTGTYAGTWTACTCTTCTTGCCCCCCCCCCCCCTCCCCCTCCTCGGTCAA GTCTCAAATTATGCACTACTTATTTTTTATTAGAGACGGATTTTCAAATA TAAAAATCTACAGCATACATTTTACCTCATTTTAAAAATGTGTCTCTTCT GTTCTGTGATGCTTCGTGTATATATACATCCACGTAACTCTTGACTCTCT GCCAAAAAACCTTTAATTAGTTCCTTATTATCACGCGATTTATTTTACTT ACTCATTTCAATTAATTAGCGATAGAAGAAGGGAGAGTGAGGACGGCTGA GAAAATAATTTTATTTCTATTTACATATTGTAATAGCAGGCCACTCTTAT ATGCATACAGTATGAGCATGCATGCATGTATGTAGGACTGCCAGCTTCTT TAGAGTCATACATTATATGCAACATACTCTTTATTTTATGGAGTCCTGGG AATTACGTAATAATTGTATTAAAAATGGTAAAAGCTTAATTTGAATTAAG TTCTTCTTAATACATCAAATAACTTCATCTCATCCCACCTCATCCCACCT CAACCTACTCCCTAGAGACTTCTTGACATATTATGTAAATAAATGTAATA TCGATCTAATTTTGTCATCTCTCTTTATCTCCCCTTCCCTAGAACAGTCA AATAAGTGCATTGCATAGCTTTATTGATACAATCAGCAGAAAATACTCAG CAGGCTATTTATAGAATATATACTACATATTATTTCAACCTCCATTATGA AAATAATATTATGTATAGCCTGGTTTTTCTTTTACTTTTTTTTAAAGGAC TGCCATTGTAAAAGTCTTTCTTTAATGTCTAACGTCTCCTTTCACGACCT ACATAGTTAAAACTAATCAATAGAAGGAAGTACGAAAAAAGTAAGACTCA TTGATAAAAGCTAGTGTTTGGGTTTGGTCTGAAAGTCCTAAATCGGTCTG AGACAGTTATTATTTTTAGAAATAATTTTGGTATAGATCGGCCCGAGCGA AAAATTCGGTCTGGATTCATCTCATCTAAAATTCGATGAAAAGCGATTCT ATAGATGAATTGTTGATGACATCATATGTGTTTCAAAATTGTGAACATCG GAACCTTTAACGTCACATGAAGTTAAATGTGTTGCATAAATCACCGTGTC CGTTCATTTTAGCAACATTCACTTGAGCAATTACTTATTTTGGTGAGCTT TTTTTCAGTGCCGTTCATTTCAGCCACATTTTCATATGGTAAACGATACA AGATAAATGACGGCATTATTAAATTTCATCACTCACAAGAGCGCTGTTTA AAATCTAATGGAATAAATCTAGGTGGAGCAACTGAAGTTCTTCTCGGATT TCGTCTCGMCTCCGCAAGCTTCTGTGGAGGGATTATTTTACAAAACTAAA TGGATTTTGTTCTTTTTTGTTAAGAGCTGCAAGGGAGTATTGGATGCCCA TGTATCACTTTGTTAGTTCAATTTAATGAATAAATATTCAATATTCTTAC AGGACAAAATAAACTAACAAAGTACCTATAGTTACTCTTGGTTCACTATA TGAAAATGTCGCTGAAATGAATTAATCTGAAAAGAAGTGCACCCAAACAA ATACATCCTTGCTCAAATTAATGTTGCTAAGACGACACTTGCTGAAATTA ATGTTGCTCAAATGATTGCACGATATTGAGATACAAAGGTCTATAAAAAA ATCTCTTAAGACATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATCCCTCGTC GTTTATTTAATATATAAAACAAATACATCCTTGCTCAAATTAATGTTGCT AAGACGACACTTGCTGAAATTAATGTTGCTCAAATGATTGCACGATATTG AGATACAAAGGTCTATAAAAAAATCTCTTAAGACATTACATATTTCTTTG ATTTAATTCAAATCTCAGTGTTTATCCTAGTCATCAAGTACTATTTTATT GCAAGTATTGATACTTTTTTTATTCTTAAAGCCATTTCATAAAGTTTGAT CAAGATTTTCTTGAAAATTTGTTCATTTTATGGATTAAAAATATCAATTG TGAGCCCCAAAAATGGCGTTGCCTTTAATTATGATGTCAGTGAAAACGCT GTATATTATATAACTATATACAAATAAAATATGTTCTTATTATATTGCAA TATAATGAAAAAATGGTTATTTTTTTGCAAGATATGTGTAATGCTTTTAA TACATATATCTTATATGGCATCATGAACTGATGACGTTTTTGAGAATAAA TTAAGTGTCGACTATCCTAAGGACCGATAGTCCGAGTCTCAATCTATTAA 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GATGACATGCATGTATTCTATCTTCTTCTTTTTTTTTGTGCTAAGCTTAT TATTTTTCCAAATAAAGTTAAAATATACCTGAAGATGCTATATTTTGATT GCTTTCAGCTAATGTCAGGCCATAGATGTTGTGTTTTGATATTAACAAAA TATCCCATTTGGGATGGGAATAAATGAAAATATTTTAACACAACATACAG ACACTATGCTGAATTCCAAAGAAGTTAAAATTTCAAAAATGAAAATTTTG AAGATGCTGTGCTTTGCCAGCTTAGGGCAGTACAGATGGGTCAAATATCA AACGATCCTTACATAGGCCAGATGCATCTGTAGATGGGACAGATTGGTAG ACGAATGACTATAAATGTTGTACAATTTACTGGGGAAAAAAACCAATCTT CCACGTACTCCCTATTTCATATATTTCAATTATGACAATAACAGTTGTAA TTAATGTATAATTTTCTAAGAATTATAGTACAACTCGGTTAAGGTGTCAA GGGTTAATAAGGATTTTTGTATACAGTGTACATGTGGGGGTAGTTTGAAT ACCAAACAGAAAGATCGATAGATCGATCTGGCTAAAAGTTGGTGTCTGTT CCTCCAAGAGACTCTACTAACTAAACATAACCTCGATACGCGCTAGTATT GCCATCTCTCGGACTTTGCACATACTTTTCAAACGACATTTATAAAAAGC ACCAAATGATTTAATATGGAGATAAGATTAGGCAGATTTCTTTTAGAGTG AACAAATTATGTCGATCCTTTGAAATCTGGCATATTGTGTTTTTTTTACT TCTATTATACAATTCCCATTTTGAATTGGAAATGGTTTAGTGACATATGA TTATCGAATATGAGGTTTTTTTTTTCATGAAATCTGGAGTTTTATTATTT TGGGTTATTCTAAATAACTATTTTAGATAAATAGACAATCTTTCAAAATG 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