EMLSAT00000000769, EMLSAT00000000769-696616 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000769
Unique NameEMLSAT00000000769-696616
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1123supercontigLSalAtl2s1123:10711..27571 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000769 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000769EMLSAG00000000769-683535Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003387EMLSAE00000003387-712315Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003388EMLSAE00000003388-712316Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003389EMLSAE00000003389-712317Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003390EMLSAE00000003390-712318Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003391EMLSAE00000003391-712319Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003392EMLSAE00000003392-712320Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003393EMLSAE00000003393-712321Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768926auto768926Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000769EMLSAP00000000769Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000769

>EMLSAP00000000769 ID=EMLSAP00000000769|Name=EMLSAP00000000769|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=261bp
MTTISHSWQIVSHARPTFCNVCREALVGVTSHGLSCGVCKLKAHKTCAAD
VIISCKWTTIETVDTSCLSLENDSANIHHQWLEGNLPVSAKCVVCDKTCG
SVLRLQDWRCLWCRATVHSTCRAQYVPHCSLGPTRHATVPPTCLSHNPET
DEWKVMHPFPGSPLIIFVNSKSGNGHGDRFLIRFKQYLNPSQVYDLSSTG
PKKGLQIFRHLAPLRLLVCGGDGSISWVLKEIDVLQLKAERVCVSVLPLG
TGNDLARVCGW
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1123:10711..27571+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000769-696616 ID=EMLSAT00000000769-696616|Name=EMLSAT00000000769|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=16861bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1123:10711..27571+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATCTAATCTATTCAGTGTGAATAATAGTCAAGAGAATGACGACGATCTCT CACTCATGGCAAATTGTTTCCCATGCTAGACCTACTTTTTGTAATGTTTG TCGTGAGGCACTTGTTGGTAAGTGATTACATACATATCTACTAGTGTTGA GGTTCGGCCTGGAAATTCAAGACTGCGCTAAGAACGTTATAACTTTTTTT GGGGCCCAGTTAATTCAATCCTTTAAATAAGTGCAGTCTGTTCCGGTCAC AAAAGACAAATTATCTATGTATCCATTTCTTGGATGCCGTCAGGTGGGTT TCCAAAATGTGAACATCGTTACAATGATGTAATATGAATTTTAAAGTGTT ATATATTGGTACGCTTCTGTTAACCGGGAAGGGGGATAAAATCGGTACAG ACGGAGAGAGATTTAAAATCCGTCAAGGTCTGAGTCTCAACACTAATATC TATATATTATAAACTTTTGGGTAAATTTAAATTGTTAATATCTCCTTTTT TATTTTTCAGGAGTTACATCACATGGCCTAAGTTGTGGAGTATGTAAATT GAAAGCTCACAAAACATGTGCTGCAGATGTCATCATTAGTTGCAAATGGA CTACCATTGAGACAGTTGACACATCTTGTCTATCATTAGAGAATGTAAGT TTTGATAACAGTGGCAGAATGACTCGGCTTTGATAGCGAGATATACTATG TGTAAATGTTATCACTTTCATACTACAGATTTTTTTTAAAGCAGCCTAAA GAAAATTAGTTTTTTTTCGTGAGCCCAAAATTAGAATTATGGGGGCGTTT TACTATACAATAGTTTAMCCTTCCATAGACTACATATTAACAAAATTATC TTTCAACTTTTTTTACCCATAATTATTTACGTATCATATTTGATCCATGA GTTTTCGAATCTTTGATTTGAGTAGTTTGACAAGTTTTTTGCACAAAATC TCCATGGATGTAGTTGAAAGAAGATTATCAATATATCAAATCACAGGAGG NNNTTACTTATATCAAACGAAGAGAGTATTGAATAAATAGCGGTGAACAA AAATATATTAATAAAAAGTATATGTTAGTAAAAGCGAAATATGAATTCTC TTATCAATGATTCCCTCCAACTTAAATTTTTTTTAACGTATTAGCGAACT ACAAGGATTATATTATTAAGGTTTATCGTTAGTGATGTAAATAGTGTACA TTTTTTAGCTGGTATTCCGAAAAATGACTATCATTTTCCTTTGTTGTTGT CATTATAATTTAACTCCTAAGTAGTGAACTTACGTTTTATATTCAAAACC TGATTGAACATTCGTGTGTGCTCATAAAAGACAGAGAGTAACCTTGACGA TTTGTTGCATAATTATAATTGTAAGTCCATGATGGACTCAGAGTAGAGTT GAGGATCATCATAGGAATAATTCTTGCTATTGTCTTTGTTAAATCCTCCC TTGTCGTATCTGATTGTAAACGATTTTATGAAACTTCATGATAGCTAAAC TGCTCTCTTCCTAAACATTATTCAAATTGTCAGGGTTACGATCTCGGTTT CTTTTTTTAACATGCCCAAAAGGCCCATGATTTTCACTACTATTTATAGT GATATCTGTCAGCAAATGTGTTTNCTAGGTAACCCTACTTTGTTTGACAT TTCCACAGGCATAGGTTTCACCCTCACCACAACATCGAAATTTGTTTTTA TAAATGGGAGTCAATTATATACAGGTGACGTCATCGATTGGCCCACATAA TTTTTTTGGGGTATAGGGCTGTGACTAGAATTTTTTGGTGGGGACAAGGT CTTTTTGGACATGAAAGATAAGTTTTAAAAAAAATCGGAAATTTAAACAT TGGAATTTTTTTGGACAAGTCGTTAATTTTATATTACGGTAACTATAAAT 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TATTTCATTATTATATTAAATATATTTCTGATGCAACAATGGCACAATAC AAGTAAATTTATTTTATAAAATGCATAATATTACAGTTCATAGTTATATC TGTTAGCACACATTATGTAATATCTAAAAGTTACCAAATTTTTTATGACA TTCTCTCAGACGTGGTTTTTTCTACACTCGTAAGGATTTTGACAATTTTT CCATATCTTTAAAGTATATATCTTACTTAGAGCTGTAAAAAAAAATATCA AATAGTGCTTCACATAAAGTAAAATCAACAATTGGCAAGCTGTTTATTAT ATACGGATGTAATTATTTTACTTTTCTTATTTACTGTTTTTGTCCTGTCA TGTCTAGGAATGTAAATATTGGTTAAATTTAAGTAAGTGTAATCTAAAAA AAAAAAATATTTGCTGGTAAGAGGAAAATATGAATTTTCTTATGAATGAT TCCTGCTTATTTTAAAAATTATTATGTATCAGTTAGCAAGGAGCCGTATA TATAGTCTAGAGTAATTTCTGTCAGTAGATATGTCGTTCCACAAAGTTAA CATATGTTTTATAACATAATCTCATGCGTGGTTTCTCATCCCTAATCAAG ACTCAACTAACAACCCATCAGAAAGCAAAAATAACTTCATAGACAAACTT TTATGTTGTGAGATTGTGCCCTGTCGGTATGTCAAACAAAAAATAACACG AAATGGCATCATAAATAGAAATTTTTTGTTACATATTATGACCTTACTTC ACTTTTGTTTTTTCTGGCAGTGCGCTTATGATTTACAACTTTTGAGTAAT GCCAACTGGCAATAGAAGCTTTTATTCCTATTACCAAACTTTCTACATCC CTGCTTTAATAGTTCCGAAAAATGAACGATACAATGTTTTAATACCAGGT AGACAAAAGTCTAACGTGTCAGTAATTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGCATT 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GACAATTGAGAAAAAGCAGCACAGCTATCATAATGTTTTATTAGATTAGC TACAAGAAGCTATGAGACGAACGAAATAATCATAAACCTCACTCAAAAGT AACTAGTATGTATATCGGCAAAAATTATCCTTCATTCAACTCTACGTTCA ACAACTTACACTTATAACTCTCCAACAAATCCTCTTTACTACTTTCCATT TTTGATTGGTACACGCACAAGTAATTACTATATATTTATATGTCCTTACT TCAAGAATTAAAAAATAAGGATGATAGCTTTAGTAAAAAAAAAAAAAAAC MACTGCTACAACTATAAAAAACTTACACGCGTTAACGATCATATTTTCTA CAGCTCTAGCTATGGGGTTTTTTTTTTTAGTGTAGTACACTCAATTCTGA GCATTAACATTTTTATAGATTCCCTCTTCGCAGTAAATTATTTCATTTTC ATTAATTTTCTTCTGAAAGTCAATTACTAGCTTATATTCTTAAGTCCTTA GATTTTTTGAATTCATTAAAGAATTAAATTAAGTGACTTGATAATTATTC AATAAGATAAATATTATTTTTGAAGTCAAAGAGTAGTTACAAGTTGAGTT GTCGTAGTAACAGAAATAGAGAACAAAATAAATTGAATGGAAAGCCAAAT AGTCTTTCAATGGAAATTTAAAATTAGTGTAATCTTAAAAACGAATTTCT GACATTACTATAATTATGTTAATTATAATATATTTCATAAGTGTATTTTT AATTTATTACCTTCACGAAAAAAGTTGAGCGTATGTTTTCGAATCAGTTT GTTTGTGGTTCGTTCGTTTGTTTATAAGTAAGATTACATAAAAATTTACA AATCGATTTTGTTGAAACTCTGTAGGATTATCATATATGTAACAGTAAGA GGGCATTAAAATTGTATTACGTATAGTTAACCATATTCTTTAAACAAATT 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