EMLSAT00000000779, EMLSAT00000000779-696626 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000779
Unique NameEMLSAT00000000779-696626
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1126supercontigLSalAtl2s1126:67605..89134 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000779 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000779EMLSAG00000000779-683545Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003429EMLSAE00000003429-712357Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003430EMLSAE00000003430-712358Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003431EMLSAE00000003431-712359Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771231auto771231Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000779EMLSAP00000000779Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000779

>EMLSAP00000000779 ID=EMLSAP00000000779|Name=EMLSAP00000000779|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=862bp
MNTCLISEIVIFEIRPEDNGFFYCSAANPAGVVRANFTLQVLSKSNIDPQ
GKTTKDVSLDVSSINSQTEEEENSETVVEMLKVEYILGFGAAAVVVLTIX
IIMILYLVLQCRSRRYKSRLSRALHCDSNSNSNSYIERSTVDFIVPGEME
LTXAVRSVSCSSVLSKCNGNKDGPNNNSNNPNISSSNHMTDDEEEDRDKD
EDEYGGRKRRTPRAVRHSSLSERSHYMDGPPSYKXPPPPAXRSEPLCRCC
GEPQWRHPSAGNMGFIPPRFVTPYQEAQHIRDCPRNQMHLSHSRGEWNCG
SYPPLSQNYNYFDTNNHAMYNMPNGDVMSQESPTKNMRYRSNSLRNPKKY
NNPYNSRPYVYPGMHNSNNNLHYVTMSRGMPGYPRTDLIRYATSQPHLNG
NYPQPRSINSMHPNHQNILTPMSLETSITLPRSSPNATISTPRYPYLPRQ
PPRYNMNNSYANQHKPNLPHHHQSNQMENGDVAQHSNIIYDRNEQKKRDD
YLFPDLPPPPDANLPIIKNGSRSSSLDDLSSDSRGHDNSQRPFYTLPNQP
GLSMNSSSSSSRRRNSYKNRNSSSMSNXSLNNNNNIAESAVRIDLSDSDR
AIRRPGSATDLTLANXAASPVXSVLRSNRQGTLECSASIDRRSIIINPST
KGTNKKVMFTGVSDEGEENSNSSAQDIMPVEEDPVWVLRTDKTEECSLKN
TDSRYLSTNLGNDVPITGIVIAQPNKYITAGYPPSVMPPKIIPNPLNLLS
VNAMSIQQISSHPHHSSSESSSGTVSNLPRPNIGRGSLTLGSSAGSSSSV
TSVATPPMMNPILQQXQPLLQHQQQMQGLRPGNPALQRPIQPHFHESPDE
GYHEEDGGSETL
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1126:67605..89134+

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000779-696626 ID=EMLSAT00000000779-696626|Name=EMLSAT00000000779|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21530bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1126:67605..89134+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGAATACGTGTGTACATCTTTTAACTTTAAAATGAAGATTAATATGGGA GATAATAAAATACCAACCCAACAACAAAGAAGTCATTTTTTCTAATTCCC ATTTTTTGCAGTGTTTTGTTTCTTCTACGAGAATAAACATACATAATCCT ATTTCGAATGAGATTGTCAAAATGAATAAAAATAAAGAAGTTTCTACATA TTATATACAACATGCATGAGACTTTACATTTGAGATGGCAAAAAAATGAA TCCCACAAGACCTAACTGGATTTCATTAATCATTCGAGATCTTTATTACA ACTTTTTAAGTAAATATTTTAGAATGAATGGTTTGTAAAGTCATTCTATA AGATTTGTGTGGTGGTACGCGGCATTGCCAAAGTTATTAGGTGTCGACGA AGATACAAACTTTTCAATATAAATATAGAAGGTAACTCCCAAAGAAAACA TCATTCTTCTTCTCCGATTTTCATGAATATGCTCAAACTTAGTTACTCAA TGGTATGATTTTCTGTTCTCAAAGCTCTCAAATCTATAGGTGTTCAGACT CGGTCTGAGGACTGAAATTTAATGTTTTTTTTCATAATGTGGACATTTTG ACAACTTTTATTTATTTAATAAGTAGTGCTAGTTCTTGTCTTTGACTGGA GAAATTAGGCATAGACAAACAGACGCACATTGTTTAAGTAAGAAAAAAGA TAACTCGAGCCCTCAGTATTGCTTTCCATTTTTTGTGGGTACAATCACAC ATAGTTACGCAATATTTGGATATGTTCTCCTCAAAAATAAAAGGATATTT ATAACAATTTTTTTTATTTCGGGGGTAAAAAATTATATGACATGATGAGT ACTTTAGTCTCTAGAGCGCCCTCTTGCTGAGATTTAACCACACACGCCCT TTTTTAATAATGAGTTCTCGACATGCATTAAAAAGGTTTAGTTGAGGGGT TTGGAATCAGGCCTGTCAGGGAGCCAAAATTGTCAAAAAAAAAGTTCAAA AGATTCTTGCAAGGGAGGGGATGGGTTTCTTTCATTGCTGGTATCAAAAA AGACCTCTCCCACCTCACAAGGGTATTTCTGCCATGTTTTTGATAGCCTT CTAGACAGTCTGTTGTGAAACTCCGAAATCTCTCGCTTGGGTTCTCACAA GCTGGAAGGAAATATGTCTGGGCTTTATTCCTTAGCTCGTACGGGTTCAG TTTGGCCTTCTTAAAGGAACTCTTCTTCCTCTCCAATTAACATTAAAAAC TCTGCAACAAATCCAAAAGGTTACTACTCTCTGTCTTTTATGAGCAAGCA TGAATGTACAATCAGGTTTTAAATATAATTGAATGAAGGAGAAAAGGAAG TTTACTACTCAGGAGTTAAATAAAAATGACAAGAGCTCATGGAAAAGAAA ATTTATTCTTTAGATTACCAATTCAAAAAAAAAACATACAGGTGAGCTTT AAAATACATCAGATTTTTTATGAATCCACTGTTCGGTGTTTTCAGTTTTT TTTTCCTTATCTAAAAGCAATGTTTAATCAACAAACAAAATCCATTTATT TCCATTCTCTTGAAATTACAAAACTGGGATGACAAAAAGTATTGTAACTT CTAAACTAACAGTGAGAATACAATGCAATTTTGACACAAATTTATGAAGA TTAGTAATAACGAGTAATTACGTTGGTCTGTCAACAACTAATAAAACAAT GAGTTATTATCATTTTGTTAAATAAATGAATCTCCTTTTGCAATAAATTC CAAACAAACATATTCGACCTTAAATCTCTTCAAATAGTCTACTAAATCGA ATAGTTTTTTTATAAAAGAATTATAATAGGGTACAAATGCGTATATAAAA ATCAAATGTACATGCATATATCAACACATTACTTTAAAAAATGCATATAA TATGCAAATGGAGTTGCATTACATTTTATGAAGGATTTTTATGTCTCATT CTTCAAAAATATCATACACTTTTATTTCATATTTTTATTTGTTTATAAAT ATACATACATACTTATTATTTAAAATGAAGCGATGTAGATTTCATTTATT TTGGAAAAACCATTAATTAATGTGTTATTGTTTTTTATATATATTTTCAG TTGATTTCCGAAATTGTCATATTCGAAATTCGTCCAGAGGACAACGGATT TTTTTATTGTTCGGCAGCAAATCCGGCTGGAGTTGTACGCGCAAATTTTA CTCTTCAAGTACTATCCAAATCTAATATTGATCCTCAAGGCAAGACAACA AAAGACGTGTCCCTGGATGTTTCATCCATAAACTCTCAGACAGAAGAAGA AGAAAACTCAGAGACAGTTGTTGAAATGTTAAAGGTATTGTGTGATCTAT GCATGTTCGTTATACATATATGTAAACCRTCAAAACAAAAAGAAATGTCT GRATTAATTTTGTATTCTTCCACCAATTACTCATTTTGTACAAATGAATT CAACCCAAAAAAGGAATTTATCGTTGAGCGATGAATCTAAAACTGATTTC AGTTTTTCTCTCAGTMTGAATTCTGAAATATCTGGGATTACAGTAATTCG GGACTRTTATCATCCAGGGGCATTTTTTACCTTYAAAAYAATACCCCAAA TTAAAAGAAGGATTAATGAATCTGCATCTTGTTCTGAAATCAATATATTT TCTTTTTTAAGCTGAAAAATCATGACAAACAACATTTTTCTTTAGACCCT TRTATCTTAATCATAAGATATGGAGATGATCATAGCTGATATTATAGAAA AATATTCAATGTATAATTTAAAAAATAGGCATATCCAATGATTTTTATCC ATTTTGATTTTTCTTAAATTCTCTACTCATCATGAACGGATTGCTTTATT GTTTCGATCCTGGTATATCATTCCCAAGGAAGGAGTTCACTCTACTCCCT TATGAGGTCCGGTAGTTTTCCTCCGATAAATTATCTACCCGTCGTCCTTT GTGGAATTCGGAATCCGAGTTCGAACCTCTCTTTAGATGGATGATCAAGT TAGAAGTATCTTCCTTCAACTCGTTGATCTTCCTTTGACGAGGCATTACG TCATGAAATTGGCATTTAAATCGGAAAAAATATTATAATAATGTTGACTC TTTGCTAGTAGACCCCATAAAAAGTGGAATCCTACCAGTTGGAACAAAAA TCTTTGTAGATGCATAGATTTACCCAATTGTTCCCCTGTGTATTGGTCAA TTTCTATCGACAAATGCAGTAAATCCAGWTAAAAGTAATTGTTATTTATT ARATKAAAAGTTGATTATRTCATTTTATATATGAGGCTGCGATAATATRC TGGTTTTWGATGTGCTCTAAACAAAACTCATCTTCAGAACATTAACACTT GACTACGAGYATGGTCAACAAAACAAATCSCTAATTCCCACATTCTATAC TCTATTTTGCGTTGATCATCGACTAAAACAAATATAATTCGTTATTTATG TGAGTATTTAACAATACATATGTTGACTTTTCACATTTACATAGTGAAAT ATAATTTTTTACATCTAAAATCAATATATTCTCGTAACCTCATACAAAAT GGGCCAAAATATTTGAAATGGTTATGGTATTTTTTAATAAATTGGAAACT TAATATACTACTTTGAAATCTAATGTCATATTTGAAGTTAAAAAATGTTC TCAAAAGTTTCAACATTTACATTATTAATTTGGCTTTTAATGTAATTGTA ACTCGGGCTTTGATTGACAATACTTGGCAGATATTTTAATTTCTATAACT CATTGTTTTTTTTAATTTTTTATCATTATTTCTTCTAAAGAGTAAAGATC CAAACTTCCATTTCATAGAAAAAAATATAAACTTATTCCGTTATTATTGT TTTTCTCATATCATTATATTCTCAATGAAATTATATTAATATAACTTTAT ATTTAAGACTTGGATATGAGTCTCTTGGGTAATCAGAAGAGTATTTGAKC AGATCTTCTACAATAAGAATAATGTCTAATGCTGTTCTAGGAATCAATCA ATGGGCCCCATGGAGATTCATCTCTCTTAATTATGTACCAACCTAAAATG AGTGATTATTTTTCCAAGTTGAGATAGATAATGTATATTATTTAAGTATA AAGAACAAAATAACACATTTTCGTTGAACTATAGAATGATGAATTTCTAA GGCTTTTGCTATCAACATTGTAAGTAGAATTTCAGAGTAAGAAGCCACTT TAAAAATACTATTTCAATAGGTGTTGTTAAGTTTGTTATCCGAAACCATC GCTTGNTTTTGTAAAAGTAGTTTGCAAAAATATCGATTGATATCGAAATA GGTGATATTTTGTAATAGGATTACGATCATTACAATATAATTGCCATTAA AACAGCAATATAAAATTATTGAGCCTAAGAGATCTCAATGAAGTCTCTTA ATTTATTTATTTCAAATATATCCAAGCGAACGTTCTGTTGGTATCTATCA AGATTCATGCAAATAGAGAACAGCGTTATATGCTAGCCTTAATTTATCAT TAGTTTAAAAATAGTCCCTAAATATTTTTCATTTTATCTACTTAAACACT ATCTGAGTTTTTTACATATATATACTTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 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TATATATATTAGCCCAATAAAAAAATTATCTATAATTTATTTCTAATAAT TTTTTTAATGCATTTTCATTAATATTACAGATTAGATAATTAATCGAAAG CAGTGCTATTTTAGAAGTATATRTAGTTATAAATATCAGTGTTGAGACTC GCTCTGATAGCAATTGTTATCTCCTTTAATTCTTAAATTATTTTTCTATA CTGATTAAGACCGATCTTTCAGTCCTTCATGCCGTCTCAAAGCTTGAAAA AAACTTGACCGTTTTCAAATCGTGGACCTATTTTAAAGAACTCAGCCAAT GAATCGCTTTATATCCTTATGAAACACAGATGATAATGTCATGAATAATG TATTCTTAAAATTGGCTTTGATGTGTCTGTGATGAAAATTCAATCTAGGC TATTCTTTTTGKGACCAAAATAATTTATTTTTTGCATTCGAACCGATTAA AATTGTATTGTTTCAATGAGATCGGTCTTAAACGACCTTCTTTTAAGAGC TTMAATGATTTGGTCCAACAAAATTTATTACGGTTTCAGATCAGTTTAGG ATTTCCCGACCAAAACCAACACTAATAGACTAGAGTATCTTGACAAAAAT TATTGCAAATGTTCCTTTAAAAAAACTTTAAGTCAATTTCACCTTATATA AATAGAAAAATTTACAAACATAGTTGCTGTCGGGAAKAGGGAAAAATATG ATAAATGGTAGTAGGGTTGTATCGATCCTTATTGAGGAGTGAAGACTGCA GTCCAGTTCAGACTCGGTCCGGTCCAGTTTAGTGATGTACATCAGTCCTA CAACTTATAGAGATTTTTGTCCTTCATTATCTCACTCATACTTTATTTTT TCAGTTATAGTACTGACAGTCTGAAGGACTGATGTTCTTATGGACTTGTC CCATACACTGATAGSAACAGTCCTAAGCCTAAATTGGMCCAAAAAAATAA 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CTAGGATACCGGCTGAAGGCTGATAAGTACGTCAAAATTATGAGAATCAA GTTTATCTTCCCTTGGTTTTTCAAAAAGATGGAGCATTTGCCCACACCTG CAAAACAAAAACCAAGAGTTTCTCCAGACTAACATGGACTTATGGCAAGG TATGTCTGGMCGMCGCCGYGCCCKGACCTCAACCCCSTAGACTATACCAT CTAGACACACGTACAGTCCACGACCTGCAGAAGACGCCACAACAGCACCA ACCCCTTGAATACCTCTGTAAACTAGCCCTGGACATCCATGAGTGTCGAG TACATCCAGAGAGTCCGCAGCYGCTTCTTCTATCGCCTGGAACTCCCCAT CAATTATGAGGACAGATACATTGACTAAAACCTGTTGTTCGTGTTTCAAT TACTAGTTYATAAACCTGTATTCTGATTCGCCCAGGATTTTGCCWTGGAC TTCAATACATTGTGTGTTAAAATGAATGTATCATCATGGTTGGCACGGTA TGGCCCTTTGAAGTAAAATCTATCGACTTCTAATTCTTTTATTGCGATAA TGAATTTTGGGCTACTTTACGTGCAATTTGCAACAAGACCTGAGTAATTT ATTCCTATAAATTGACAGTAATTCGTCGAAAATACAAACATAATCCAGAC TCAACTTAAAGAAAAGTCCTTCTTTTGTGTTAACTAAAATATGGCTCAAA ATACACAAATACATATTTGTTTAATTGGCTTATGTTTTTCGCCAAATGTG AAACTATTACTTATCCCAGGGATTCTCAACATGCATCCCATTGGCCTGTG AATGCATTTCATAAGGCCGGCAAAAACTATGTAATAACAATAATAAAATT AAAATAAATGCATTTGATGCTGTTATAATTAGCCTAAATCAGTGGCGGSA TAAAWAGTTTGCACATCCTGTATATAATAATATGGGATTTCACGCTACAT 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