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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s112 | supercontig | LSalAtl2s112:287938..306450 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000787 >EMLSAP00000000787 ID=EMLSAP00000000787|Name=EMLSAP00000000787|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=81bp
MFLQKKKNIKKADIDQSKSVGEVYEDEVEKTVAIMQNLREYKTFDRFKNL
HKNIKSRQYESIYPLDDFVSLKKIRCGQHTK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s112:287938..306450+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000787-696634 ID=EMLSAT00000000787-696634|Name=EMLSAT00000000787|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18513bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s112:287938..306450+ (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTTTTTACAGAAAGTAGTTGTATGCAGATAAAAAATTAAGGGAAGATG
AGAACATAAGAAAAACTGCAATAACAGAACCAATAGTAATGTTTTGTTTC
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ATAGAAAGTTTATTTTGTTCCATAACGGAATTGTTACAAAAATAAAAACC
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ATTTACTTTTTAATCATTTTTTATATTTTTCGGAAGAAGTACTAAATTAG
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GAAGAACTAGACTGTCGGACCAGAATGACAGGTGGCTGGGTAAGGAGAGA
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CCTGGTTGTCATCTGCAGCACTGGTGAGGTGATGCCTCCTTTCTTCTTCA
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TTCTTCATCCCCTGGATGAAGGATACAGCGGCTGAGAGGGAGTTCATATT
CCAACAAGACTCAGTGCCCACACATATCGCCATGAGGACCACTAACCTCT
TCAACTCCGACGACATCACTTTCTCGGATCGCAACACCTGGCCCTCCAAC
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ATTGCTGTCGATTCCGCAGAAGTTATCAGGGCATGCAAATCCTTTAGGGA
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TTCCATTTTTATCAAGCAGGTTGAATTTTAAGAAAGTTCCAATTTATCGT
GGATACCCTGTACACTGTTGTATTTATTGCTCCCCAGATACTGAAATTTA
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GTGGCTATTTCAATATATGTTTTTGTATTATTCAATCATTTTATGAGAGA
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TGTTCAATAATATTTCTTATTTTTATATTTAATAAATTTTAAAATACGAA
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ATTGCAAGTTGTACTTCAGTCGTTTCACTTGCTTATGCAGTCTACAATAG
GACCATGCCTACACTATGTCCCAAAATTGATGGCGGKGTTAAAAATATCC
GTTTTATAATAATAAAAAAATATTTCTGGTTGGAATAATCAGAAATTGGC
TGATACAATCATTAGGCAATATTGAATTTTTCTGATTGAATAATTTTTGA
AGATTGCATCATACATCAGTATAAAAGGGCTCAGAATACACCACAGGAGG
TTTGTTGAAATTAAATGTGAGTACTCTTCGGAGACTATGGCGAAGGKTGT
TAGCATGATAGATGGKGAATCAAGCCAGAGAGACGTTGCTCAAAGGTTAC
AGTTTCCTCTCAGGACCATTGAGAATTGGTATAAGAAAAGAAAGGATGGA
TAAACCCTTAAAAATCAGAAGAGTCGATGAAGGAAGAAAAAAAGTAGCAA
TGTTCCCAAGCTGGTGATTTCAAAATTTTTGACCAAAAATACGCAATCAA
CAAGGCAAGTTCATCCAAGATCTACTTAAACGCGYTATCCAATATCCAAA
TCATTTGTCCACAACTACCTGAGGCACTCTTTGAATTCTTTGCCATACAA
ACCTCGTCTGCATCCCGAACTTTCAGATAACCAAAGAAAGGCCCGGCTTC
AATTCTGTTGTGAGCGGAAACACTAGACTGCAGATGACTGGAAATGTATC
CTATACAGTAATGAAAGTCCATTTGAGCTATTTCATGCTCCAAATCGCCA
AACAGATCGGGTTTGCGMAAGACATAAAGGAGATGTGGAACCCACTCCTM
CTGTGAAATATCCTCTCAAAATTCAGGTCGAGACGTTATCAGCCACCAGG
CAGTTTCAGATCTTCACCTGATTCCACGAAACCAAACTGTGACGGCTGAG
TACTAAGTAACGGAGATCTTCTACAAGTCTCTGATGTAAGCTTTGTCTCA
TACTGAAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAACTCTCCAAAAA
GGCACCAAAGTGGTGTTCAGACAACTAGGATTCTTTCTGGGGCAAAGGCA
CATGGCCTGCCAACAGTCCTGATTTGTCTTCCATTTAAAATTTGTGAGCC
TTGGTCCACTGAGGACTCAATGAAAATGCGCCAGCAACCTCAGAGGATGA
ATTAAAAAAAAACTGGSCAAAAGGTTGGAAAAAATTTATGCAATTTACTT
TGAGTAATCTGTATGAAGGTCAAAACTCATAAAAAGGTGTATTAAGCTTA
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TACTGTAGTGTAGGAGTGCACAACGAGTCTCATTCTTCTTTTCTGAGCTT
GATACACTTCAACTTCGGCTTATTAAGCATAGGTTGTGTATGTTTCATAC
TTTGGTCTTTTTTATACACACCAATATTGATAGAAGAAGTCATGAATTAC
CTTCTTTATGTAGGTTGGAGGCGTCCTAATAGTAAACTGGTTTTGGTTTT
CAGTACACCTCTTTGCTAGTTGATCTGCAAATTCATTTCCCGTTATGTCA
AAGTGTCCCTTGCACCATTCTAGATGATTATTTTTCTTACTCATTCCTTT
ATTGATAGTTTCTTCATATTTTAAAAATCCTTTATTAGTAATAAGTGGAT
TAAAGATTGCAGCAATTGTTAATGGGGAGTCTGATCTAATTATTAAATAG
CTTCTACMCCTTGTGCTATAGAAAAATATTGAAATGCAGAAGCYTTTTTA
TTMAATRAAGCCATTAAATGACAGATTGATAAATCACTTTTGGTGATGTT
CCATCTAGCCCCAGTGTTTCCATCTTCGTCTTTAAACCCACCTGTAGAGA
TGATTGGTGGTCTAAGATCTACATGCCACCCTATTATTTCGACCTTGTTG
AATGCATGTTGATTCACAATTTTGATGTCGATGGTTGAACTGGCTAGTTG
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TCATAAATGATGTCTTCCAGAGTCTCCTCTTGTGTCAGTTTCTCTACTAC
CCCACCCTTGATAGTGGGCATTTGAGACCATAGCTAAGAGGAATAACTTT
TTTTCTTGTTCACAATGCTTAATGATACTTAACAATACTTCATTCTCAAT
AGATAATAACTGGTCAAGGTCAGCAACAGAGATATAAGTTACTAGTCCAT
CTATTTTGATACGTATCGTGCAGATGTCTCGGTCTGAAAGTTCTGGAACT
GACCATGCTTGCAAATGGTTAGCCGATCGTACACAAACCCTTGCATTTGG
AACTGGCTCAGTTATTCGGGATATTTGTGATGTTCTTTATTTGAGCCCCG
AGTTTGCTTCTTTCGAGTTATATATATAATATACGTATTAACTATAAATT
GTGACCCCAAATTTATTTGAACATGAATGACGAAGAGTAACGTTGAGGAG
TTATAAGTGTAATTCAATTTTAGACTCGGAAGATCGACATTTTTAAAAAT
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ATAGTAATTTTTTCGTTCACGGAGTCCTTGTAATATCTTGTGTGCTTCAT
ATTTTTGCTCAGTTTTATATATAAATTCTTCAAATTCATTTTTTTTTTTT
GTGAATGGTATTTCATTACTTTGGAGTTACTTACAAACTTTGGCATTCAT
CATCGATGTTTCTAAGAACTTTTTTTTTTTTGGAGTCTTTCTTATTTATC
TACAACCATAACGATGAGTATCATAAATGGAGATGTCGTATTCTGTATGA
AATATTTAAAATAGATATATAAATATTCTCTATAGTTTACAAAACTTAAT
AGTCTTCTTTCAGACTATCATTTAAATAATGAAGGTGCATTTGTAAGAAG
CTATACAAATTATTAATTCATGCTTATGGTGTAATATTGGAAAGCTACTA
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GGCAAAATACCTTAGAAGTTGAAGGAGTACAATAGAGAGATCACAATTAG
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TCCTTATAGGAAAACTTTACTAAAGTTTTTGGGTATTAGCCAAAACGAGA
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AATAAGCCGACATTTATTCTTATTATAACTCCATAATTATGCTCCCCAGC
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AGTAGGACAAATGGAGAGTATTTTTCTTTCATTAGCTGTTGTTATTATTA
ATTAACTCCTGAGGAGTGAAATTCCTTATCTATTACATTCATTTATATTC
AAAACCTGAATGAATATTTGTGTGTGCCCATAACAGACGGAAAGTAACTT
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GTCACAATTGCTTGTGGCTGGKCTCTTGAAACTTCCTGAAAGCTAATTTG
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TCTCTTCCCGAAATTATTGGGTCATGCGTGTCAGTTGTGCTATAAAAGCA
AAATTTAATTAATTATACCAATATCAAGCAAATCATGCGTATTTTTGTCA
TTTTCTTAACTTATCTATTTAATTTTTATTAGTGTTTTTCAGTTATATTT
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AGAAATTTATCCAAAACTCTTTCAAGAATATAGAATATGATGATAGTTCA
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AATTAAGGGTGATGAGGCCTCTAAATGACTTCTTATTGATAATATATAAA
TTGTTTGTTCTCTGTACCATATATCAAAAAATAAAGTAGTCATTGAATAA
TATATATTATAACCTAAGTATAAAAAATGTTTCATTGATCTAAAGTGTGT
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AAAATGAAAGACATTTGTAATTGATATTAAAGTGCAATAAAATAATTGAT
GGAAAATTAAATAGATTTTAGAAAATAATTGGACTTTGCTCCCTTAATAA
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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AAAAATATAAAGGTTTGTTATAAATTTAATTTAATACAAATAAGGCAATG
ATAATAGACATTTAATTAAGTTTACTATTTTTTAGTTGAATTCCAGTTAT
TTAGTGCATGAAATCATATCAACTAATTCATATAATTATCTTTCAACGTA
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CTTTTCACGCTTGTGAAAAAAGTTGTAGCCTTAAATGTTCATCATAGTTG
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ATTTGTAACACAAAACAGCTGCGACCTCAAAAAACCTTGAGTCATAAAAT
GTACATACAAATTATTTAACCTTCCCTTTGTCATGTTTTTTTTAACACAC
AATTACTTAACTGAGAATAAAACACTTTTATTTACTAATTGAACACATTC
GAAAAATTATAATAATTCTGTCAATAATTTTTTTTTTACGATTCTATCCT
TTTTGCCGTCGTAAATATCAATTAGATTGCTGAAGTTACATGAAGGAATA
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AATATTCACCTTCTAATTTGCCCGGTACGCAACTTTCTGCCAATGCTGAT
ATTCTTTTATCGAATTTTTGGGATATTTTGATAAAAAGTGACATAAATAG
TCCCTTTCCCACTTGTTTCTTCAACAAAACGACATCAAAAAAATTTAATT
GGAAAAAAGAAAACGAATTAACAGATACTGTAACATTAGTTCCAAGTATA
AATTCGACTCTACCTAATGAGTTTTTTGAACTCTCTTTTGATAATGAATT
ACTTAGCCTGGTTATGAAAAAGTGCCGTCAAAGGCAAAAAATGGGGGTGG
AAAATATTACATGGATGCTCGATACAATTTTGGAAAATGCATGGCAATTG
TCAAAATATGATAATAAAAATCAACTTGAATTTTGACGACAAGTTGCAAG
TTGGTATTTACCCAATCTTGGCGTATCTCCAAAAAATGTTGAAAGAAAAA
CTATTTTACTAGAGTAGTCATATGACACTGTATGAATTTTGCGAAAAATT
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ATCAAATATTTTTCTAATTAGCATTAATTTAAAAATTTGAGAGAAAAAGG
CTTAAGAGTTGATTTCTTTATATTATTGAAAATACATAAATAATGATTTA
TCCCCACAGTGAAAGTGCTCAAATTGCACAGCTAACTAGACCTTCTGCCA
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TTTGCATCATGTCATTTTGAATAGTCACGATTTCAATTTCTACACATCAT
TATGTATAAACACCTTACTGTGCACTTAATATTTTTTATACGAAATTCTT
TAATTAGGGGNAGGGATACAGGAAAGAACATTAATATGAATGGAGCGTAC
TGGTGTTGGTGTTCGGTATATAAATCCTGGTCCGTTATGATTTTTAGTAG
CATATATGATCTGGTAAATTAACTAACTTTAGTCTATCTTTGATATCAAA
GCAAAATTCGGTATGGATCCGTGTTTTTGATACATAATCGGTATGGATCT
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ATGTCATGTTTGTTTTAAAAATTGTAAACATTGGCCTATCATAACGTCAT
CTGTCATAAATCATATTTACACAATTTGTAAATTAGGCCGGGAAAGAAAA
TTGCTACATAGATTGAAACCGAAAAAAAAAGTTCCATAAATTGAGACAAA
AAAAAGTTATTGTATAGAGACCGAAAATATGTTCCACCATTAAAAAACGA
TAAAAAATACAAAAAAATCCCTTAACACCGACCCCAAAAAAATAATGCGG
TATTTTTTCGGGTGACAAATATATCAACTACTTTAATACGAAATAAATAT
TGCCTCCTGATGTCTGTAAAACTCCTCTTCTCAAATATCTCATTCTTTTT
ATGATATGTAAGAGAATGCAAAATTACATATGCATATATTCGAACATCAC
CAGGAGTTTTTTTGGTTTGAAGATGGTATATTTATGAGCTGTGAATCTAA
TATAGATATGGAACATATATTCTTATATCTTAAGTATTTTACTCATTTTA
ACCCATAAATACCAAGTGGGGGGATTCCTTGCAACATATTAAAAATTTTT
GGTCATGAAAATTAGAAATATATGTTGTGCTTTTTTTTTAATGTTTTGAT
AAGTTAATGAATATTCTCTTGATTATTTATACCTATTAATATCATTGTGA
AATTATTTTTATACAATACCAAATTCCTTTTGCTTGAAGAAAAAACTATG
GCGAACACATATAAACCAAAAAGTAAGTCATTTATGTTTTTTATTTAAAA
AAAATTTTTTTTTTGGAACTTACGTTAATTATTGCTCTGATTCGGTAAAC
ATTTTACTTTAAATTGGGCTCTATGAATAATGTAATAATTAGACGTAGGG
TGACATATTACATGAAAATTCGAAAGTCCATATATTGAGCAAAATATCAA
AATATCTGGATCGTATCTGTAATCTTACTCACATAACTAAACCAAGATTG
ATTTGATGAATCTGTACTTTTTTATAAAAATAATTTTGAGTTATCAAACT
ACTGTTACGAAAATTTACTAAGCACAATAAATTTTGTCATATGGTAATAA
ATTAATTTATATATATTATAATTCCTGAGAATTTATATATCTTCATCCAG
ATCTTGTTCCTAAAAAGGATATAAATAAATATTTAGTTTTGATTTTTTTA
AGGTATGAATGTATTGGAAAACGAAATAAACCAATTTTGACAAAACAAAA
AAAGGTCCTTTTAGGGTTAGAGGTACATCTACTCAACCGTAAAAATATGA
GATTTTATATATTTTTGATTATTATCACGTGGGAAAATATTTTGATATCA
GTCCATTTTTAATACAAATATGATATAATTGTCAAAAATTGCCAAAAAGT
AATTTCGGTTCATATTTACAATACTGTTTCAAAAAGGCAATTTAAATATG
TTTATTTGACGCTAGATACTTTTGCTTTAGAACATTTTGCCTTAAGCTAT
TTTACATCAAAGTATTTTTTACCTTGATATATTGAAAAAAGAGGTTAATA
CGCCCTTATTGTTTATTATTGTTTAAAAATGATTTTTTCTTTGAATTTTT
AAATTAAAATAACAAATGTTATTTCTAAAAACCACAACAAATACACGTTT
CTGATAAAAAAATTATGAAATTATTCCCCTAATTTTTAATGCATACATAT
ATTATTGAAATTATGTAATGAATTTGAACTATAGACCAATTAAGTAATAC
AATTAATTTTTATGACAACGATTTTAATGAAAGAAGTGCGAATTTCTTGT
CCGTTATCAAATTTCACCGGAAAAGATGAATTATTCATATGGGAGAATAC
TTATGAATTAATAAGTAAGTATAATATGAAGCAAAAGGGTTATTGCCATC
ATTATTTTAACCTAAAACCAATACTTAACGGATTTTTCAGAGATAAACAC
GACATATTTTTATTAAGAAATTCAAAGAAAACATCAATTATAACTAAAAA
TAGACAGTAAGGACGCATCAAACTGATTTATTCATAAATTAATGCCAAAT
GTCCTATGACAAAGTGGCAAAGAACCAATATAGTTTAAGACGAAAGTATA
TTTATATCAAATTTAAAAATACGGAATCATTTAGGAGTTATAATTAATGC
TGGGTAATTGATAGTATTAATGGGTTAAAGTACATATAACAACATTTCTT
TTTCTTCTGAAGTAAAATTAAATTAACTATCTTGTAAATTTCTGCATAAT
AGTACAACTACACTTTGTTGGGGCATTTATCACTCCAAAACAAAAAGTCA
TATTTCAATCATTGCATCATTGAATCTATATCAAAGCATATAATATTTAT
GTAATTAAAAAATTGGAACATTTCAGATTGTAAATCAATCTAATATGACC
ATTATATTTATATAATATGCTTATGTGTTTTTAGGAAAGCCATTAATATG
AATTAAGAAAAAAATCATGTCATTAATTTTTTTTTTTAATTATAAAAGTA
ATTTTTTGGAAATAAGAAAGGACAAAATTTTAGTTCATTTTATATATGTA
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