EMLSAT00000000816, EMLSAT00000000816-696663 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000816
Unique NameEMLSAT00000000816-696663
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1136supercontigLSalAtl2s1136:213582..236559 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000816 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000816EMLSAG00000000816-683582Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003555EMLSAE00000003555-712483Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003556EMLSAE00000003556-712484Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003557EMLSAE00000003557-712485Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003558EMLSAE00000003558-712486Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003559EMLSAE00000003559-712487Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003560EMLSAE00000003560-712488Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003561EMLSAE00000003561-712489Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774654auto774654Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000816EMLSAP00000000816Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000816

>EMLSAP00000000816 ID=EMLSAP00000000816|Name=EMLSAP00000000816|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=184bp
MTGLINKKYRLRNASIEEIIIHSNFYIAEDFQISSDIALIKINNDFSYIG
KIATVIGWGLQDPDNELSVSTDHLMQTNVQVISNYDKKCKHIATVGISGG
YNSSKICAYDAKQDACRGDSGGPLMLKTKWPEIEINGTLIQIRYIILGVV
SYGVECGNPIFAGXYTRXTGFAEWIYKHSKTGNC
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1136:213582..236559+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000816-696663 ID=EMLSAT00000000816-696663|Name=EMLSAT00000000816|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22978bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1136:213582..236559+ (Lepeophtheirus salmonis)
AAAAGGGTTAAATCTGAACTAAAAGTTATGATAACATACCACGTCTTCTT CTCCTTTCTGCTCTTATTCATCTTCTTCAATGAAAATGAAGCTCAAACTT ACCCAGGAGTAACGAAATGTGATTGTGGCAAAGAACTTCCATTATCCAGG ATCATCAAAGGAACTCAGTTATTCTTGTCAATCATTTAAATATACTCATA TTGCTCAGTTTATATCATTTCGATTTACATTTTGATAGATAAGTAGACCT TTCAATAATTTTCTTAAGGACCGTAATCATCGCAAGGGGGGGGGGGGGGA GGGTGCTCAATATTTTTTTCAGTAGAACTATTTTAACTAAGCACTKAAAT CAGACCATAACTGCCAGTACATGGGCTTTCCATTTACATATCCTCTTGGG CTTTAATTTAGAAAATGTATATAACCTGTGGGGGTTCGTAGTTATTAATC TAATGCAGAGCAATTACTATTTAATTTAATTTAATTATTTGATTCAAGCG TATGTACAGGCAGATACAGTCTATTGCTTTATATTACATACACGTTTGAA ATCTTTTAAAAGTGTATCTTTAAACCCATAACGGTGCATGCGGAATTTTC AAAACGTGAAAGGATGATAGAACCAAATAACTTTTACGATTTCTGCAGTA ACGCCTAACAGTATGTTTTTATAAATATTTGCACACTTTAAATAAAAAAA TAGAGTAGGTTTAGCTGGTGTTGCCCGAACATTAAGAATTCAAATTTAAA TTCTAAACTCTTCAGCTTCATATATACATATATTTATGATTATATTTTCA TGGCATATTGTTATGTACCTTTGTAAATTTAAAAAAAAAATAGATTAAGG AACATCAATTTCAAACAAAAATAAACAATTACTGACTATAAATCTCATTT ATTTATATATTAACGTGACATATCCTGAGGTAAAATAGTTCAAGCCGAAA GTACATAGCACCCTCTTTAGATAGAAAATGTATATATATCAAAATCTGAT GAAATAAATTTTATAAGAGCAATGTGCGTATTTAAGGTGTAAAGTCTCCT GCCAATTATCCATGGCTTATCCAAATCTACGTACACAACGTTTTTGCACC ATTAGAAGGAAGTTCTTTATGTGCTGGAAGTATCATTAACAAAAAATTCA TTCTGACTGCTGCACACTGCTTCGTTTTAAAGCCAAAAAACTCAAGTAAA TGTATGGAAAAATCACAAATCTGCTACGAAAAGCTTAATTATAATTTAAT TATCTATTTATTTTTATTAGTTTTTCAAGCTCCAAACAATGATGTTTCTT TATTCATCATCAATGCTGACACCAATTGGATGACTGGTTTAATAAATAAA AAATATAGACTTAGGAATGCTTCAATTGAAGAAATTATCATTCATTCTAA TTTCTACATTGCGGAAGATTTTCAGATTTCTAGTGACATAGCTCTCATCA AAATAAATAATGACTTTTCGTAAGTCATTTTAGTCATATTACAAGTCAGG GTCGTAATGATAGAAGGCAGGACAAAGGCTGGATCCCTTCAAGCTCACCC CCTGCAGACACACCTGCTAGGTTAATGATATATATCGTTAGTATTAATAG AGAGTCATCCATAGTCACTCCAATCAGCCCTTTTTCCATGTTACAGAACC TTGATTTTGACACATATATACAGTTAGTTGGTGGTGGGGGAACCACTTTT TAAGAAATTGATTAATGGCTCAGAATATTTCAATTCWAAAAAATATATTT TTTAGASCTGCCGACACTCCAATGGAATTTCCTATGGTTTAGTTTTGATC AAATTCTTACTTATATTATATATATACCTAAATACAAAAAGATTAGTTAT ATTTTTATAGGATATTGCTAATCATTTTCATAAGTAGATTCTTATGAAAT 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CTCCTTCTCATAAATTTCTATGAAGTTGATACTAAAAAAAGGAATAAAAA GTCATGCTTCTTTATGTTTTCTATGCAAAGTATTTCATGTAGTAAGGAAT GGTATTTGAGAGAATATCGACTAGTGACTGCGCCATATGATATATATGAG GAGTTGAACTTTATATATATCCTTGTTTTTACACGAGGAGAATCCAGGAT GACTCTCATATTAATATATTACTATACATACACTTGTCAGAGCTGATCGT ATCGGATCTCCTTCAAAATATTCCTCAAATTGTCAGGGTACCCCTGTTGA TATTTGTTTTTTCTAATATGCCCCCCGTTATATATAGGATTTTTATCACA AAAAATGTCTTTCCAGAGAGTTCTAACTCTATTCCTCCCTCATCTCCTCT TTTCTGCTGAGTGCTTCATACAAACAAGCGTCTAAAGATTTCGTGAATAA ATAGGGAAAGGTCAAGAGTGTCCTCAATCCATACTACGTTAGTGACGTAA TAAAGTTATACAATTAGGCCAAGGTCTCCAACAAAAATTAATAAATGCAA AGGGGAAATAGGATAAAAGGACACAGACTCGTCACTTTTTGTTCTTAAGT TTTTGATAACTTCATCAAAAAATGAAACTATGATGTCAAAGTGTTTAATA TTCAACAAAGGATGAATATTTATTTTTCCTCAAAATTCTTTGTGCATTTA CATAACAAATGTTAGAAATTGAATTTTTTTAACAAAAAAAAAAGTTGGAA ATATAGTATTTATTTTTTAAAAAACTTTAATTTTTGAATAAAACTATACA AAAGTTATTCAATTTTTTTTTTGCAAAAAGATATAATATTATCTCAATAC TCGAAAAATTATGAACTACTTTAAACTAATTACATATTAGAGATTAGTGG GTCAAGTACTATTAGAATTGAGTATGGAATGCCAAAGATTAAAAAAAAAA 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ATATATTATTATATAATATATGTACAAATATTTAGTTTGAAGCTAATTCC TTTGAATTTTTTATTACAAGATATATTGGCAAGATTGCAACAGTAATTGG ATGGGGACTTCAAGATCCCGATAATGAATTATCGGTTTCTACAGACCATT TAATGCAAACAAATGTTCAGGTAATAAGCAATTATGATAAAAAATGCAAG CACATTGCGACTGTTGGAATTTCCGGAGGATGTAAGTAGCCTATTAATAT TTTTTAATTTTTTAATTGAAGAGTCCTTCCTCAGGTTATAACAAAATATA ACCTTATATCTCAGAATTATCTCATTTTTCTCAAAGATATATAATGAAAA TTATGAACAGCTGATATCAATGTTTAATTAATTCTAGAGAAGTGGGAACC TAAAGTTTTCTTAAAAAAAAAATAAAAGTTAAATTTTTACAACAAAAGAC ATTTTGTTTGAGTATTTTATTCATAATATTTTACACATTATTCTTATATT TACATAAAATCTAATTTTGTAAGACTTTTTATTAATCATATAATATGTTC TATTAAACTTTGCCAACTTTAGACGCCAAAATATCTGAACTTGATGAACC AATTAACTTACAAAGGCCATTAAATTGATTTATTATTTAAATCCTGATAA AAACTGGCTATGTGTGATATATTTAAATATAAAATTGATCTCTTTCTGAT CTACATAGGAAGTTTTAACACTATGCAATAGTAGCCAAAGGGCACATTTA TTATTGTTATTTAAGCCTTAGACAAAGAAAATTACCAATTATATCTTCAA TCACAGCAGTTTGGCATCAGAAGTCTTATTTTAAATCATACTTTAGAGTA TAATTTTGATTCAAAGCCGTATTTCAAAGTGAAATAACTCTATATGAACA TTAAAAGCTATAATAATTGATAAAAATACATTTTAGCATTCAAAAGTTAA 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