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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1136 | supercontig | LSalAtl2s1136:213582..236559 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000816 >EMLSAP00000000816 ID=EMLSAP00000000816|Name=EMLSAP00000000816|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=184bp
MTGLINKKYRLRNASIEEIIIHSNFYIAEDFQISSDIALIKINNDFSYIG KIATVIGWGLQDPDNELSVSTDHLMQTNVQVISNYDKKCKHIATVGISGG YNSSKICAYDAKQDACRGDSGGPLMLKTKWPEIEINGTLIQIRYIILGVV SYGVECGNPIFAGXYTRXTGFAEWIYKHSKTGNC back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1136:213582..236559+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000816-696663 ID=EMLSAT00000000816-696663|Name=EMLSAT00000000816|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=22978bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1136:213582..236559+ (Lepeophtheirus salmonis) AAAAGGGTTAAATCTGAACTAAAAGTTATGATAACATACCACGTCTTCTT
CTCCTTTCTGCTCTTATTCATCTTCTTCAATGAAAATGAAGCTCAAACTT
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TTTTGATAACTTCATCAAAAAATGAAACTATGATGTCAAAGTGTTTAATA
TTCAACAAAGGATGAATATTTATTTTTCCTCAAAATTCTTTGTGCATTTA
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GTCAAGTACTATTAGAATTGAGTATGGAATGCCAAAGATTAAAAAAAAAA
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AGGAAAATTCTACCTCTTCAAAGATTGCCTCGAATTTTTATGCCAATTTG
CCTACCTATGAGGAAATCAAAGTAAAAATATGTGGTTTGAATTTATTTGA
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GTTTTTTTTACTTTGACCTTGATATCTCAAAATTTAATGGCCTCTTACTC
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CGACCAACCATTATTGTGTCCCTCCGTATCGGGCGCATGCCGAAGGAGAT
TATTGACTTTACAAAACTGCCCAAATAAACATTTACGAGATTCCCAAGAC
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TTTAGATTTAAAATTGGTCTTCCTCCATTTGAAGTCCTTTCTAATGCATT
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CAATATCTTTTGTTTCTGTTCTTTCCTCTTCTTTTCTATCAGATAAAGTC
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CCATATAAAAAAAATGACCTAGAAAGGACTTTAAGTAAAGGAAGGCCCAT
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TTTTTTGTTCCATAAGATAATTTAAACAACATTTTTAGTATTTATATCAC
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ATAGATTACTTCTTAGGACAATACAATTTAGCATAGGTAATTTTGATACC
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ACATTTTTTTTTAAATGTTCCTTTAATTGATCAAATGGACTTGCACTGAT
TAAGTATAAGTAAACATTATAGTATWACATTCACTCCATTTAACCTAGGA
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TTTAAATTAAAAAAAACAAAACAAAAATGGTATTTAATTAATTCTACTCT
ATATATTATTATATAATATATGTACAAATATTTAGTTTGAAGCTAATTCC
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TTTTTAATTTTTTAATTGAAGAGTCCTTCCTCAGGTTATAACAAAATATA
ACCTTATATCTCAGAATTATCTCATTTTTCTCAAAGATATATAATGAAAA
TTATGAACAGCTGATATCAATGTTTAATTAATTCTAGAGAAGTGGGAACC
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ATTTTGTTTGAGTATTTTATTCATAATATTTTACACATTATTCTTATATT
TACATAAAATCTAATTTTGTAAGACTTTTTATTAATCATATAATATGTTC
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AATTAACTTACAAAGGCCATTAAATTGATTTATTATTTAAATCCTGATAA
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CTACATAGGAAGTTTTAACACTATGCAATAGTAGCCAAAGGGCACATTTA
TTATTGTTATTTAAGCCTTAGACAAAGAAAATTACCAATTATATCTTCAA
TCACAGCAGTTTGGCATCAGAAGTCTTATTTTAAATCATACTTTAGAGTA
TAATTTTGATTCAAAGCCGTATTTCAAAGTGAAATAACTCTATATGAACA
TTAAAAGCTATAATAATTGATAAAAATACATTTTAGCATTCAAAAGTTAA
ATTATTTATTTAGTTATTTTGAATAAAGTTCCTATAAAATGTGTTTAATC
TAAAAAAAAAAAAAAAAATTAGGTTCTCATTTGGAAAATAATATTTTTGT
ATATTTTTTCCATGGAGCATGAGCCTTGTTTAATTATATTAATTTGTAAA
AATAAAAAATAAAGTAGAGATGAGTGAGAAAAAAATTCAATTTCCTGAAT
AATAATAGTATTTAATTAAAAAATAACATAACGTATGATATTTATATAGA
AAGCGTCGTGAAAGTTCTACTGAGCATGCAACATTTTTTTAAAAACAAGC
TACAAAATGTCACAACACTTTGCCGATAATATTTTTTTTTAGTGTGCTCA
TGTCATAATACTTTATATTATAGCTAAAACTATAGCTAAGTATAAATCTA
CAGATTTGCTATAAAAAACAAATTCAATTTTGATTGATTCTTTCCGTTTA
ACTTTTAATATTCTTATAGAATATTTAATAAATAAGCAATGCAAGGTTGC
ATGAAAATGTTACGAAATTAAATATAACAAAATTCAATTATTTGACTAAT
TGTAATAAGTAATTCATTCTTTTGGGTAGTAAGATTGACCTTGATTTAAA
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TAATCAAGTCGACATATTAATACGTCAATTCAGGAACGTATCACACAACC
ATTTTTTGCTTATTTATGTAACAAAATTGGTCAGTTTATAAAATTTAATT
TTTTTCGTGCTGAATAAATGAAAACCAAATATATTAAGTAGATGGGATGG
GCTCAATTACATTCGTACAACAGTGGCCTCAACTTCTATAATTTAGTTGT
AATACTTTAGTACTCGTGAAACTAGAGTATACTATAAATTAAGTACTAGT
ACAGAGGGCTCCTGCAAAACGGGGTTTCAAACACTTCGGATTTTGTATCA
TGCAATATATTATATTTAATGTATTTGGAATTATTCTGACTCCCCTCATA
TTCTCTTTATATCAAGTTTTTGTATATTAGGATTATAAGTTATAAAAATG
ATATATTCAGTTAATCAATAATAATTGTATTTAATGGGTTGTATCTTACT
AAGCATATACATTCATATAATAGAAGTGTATAATTTTGCATAGGGTGAGT
GTCCTGTAAGTATTTGACTTGATACTTAGTGTTAAAACTTTTGGTTATAA
GTTATAGCTTATTTATAATACACACTTGGAAGGAAAAAGGTTGCTGAATA
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GATTAAAAATCAAGTAAATACCCCATCAATATTGAATTCTACAAGTTTCT
TGTTCGGCATACATATTTTAAATAATTTACGATGAATAAAATGTTATTAT
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GGAAAATAGTTTATACCATTTTACGGGTTTTGTAGAAGGCTAATTTTTCT
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GTGTTTTATCAAAATCTGTTTCTCTTTCCCAGCATTCGGTATGGTACATT
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GTTTTGTCAAAGTCTGCCTGTCTTGTTCAGCAGTCGGTACAATACATCAG
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AATCAACTTCAATCGAATAATATAACAAAATGAAATCCTCAGCTTAAGAT
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TTGCCAAGTTAGCTATCAATAATTTATTTACTAACTTATAAAACAGGATT
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TAATTATTAATTATAATCCTTGCTAAAACAAAAACAAAAGTTGTAAATTT
ATATTCAAATAATTTTTTCTGTTATAATCTTTTGATTATGAAAAGAACAT
TAAAGGATTACGATTAGTTAATTCTTTGTATAAGGCATTATGTTAATTTT
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AAAAAATGATACCAAAAATGTGTTATTAAAGAATTTGCAGTACTTTGGAT
AATTAGTACTGCATTACTATGCACTATTTGGATATTCCATAGGTTGTCGA
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TGATAGTACATATGAGTTATAGTTGGTAATTCAAATGACTGATGTTGTAA
TTAAATAGAGTATCATTAAACGTAGAAATTGTAGCTTTTAGAAATTACTA
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GTTTTTACTGACGTCACAAATGAACAAACAGTGGTACCAAACAGGAGAGC
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TTTCCGTTTCGTTGTAGTCACATCAGGAAAATAAAACGCAATTATGATAA
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TGGAGACGTTCAAATGATTTTTGAACAAGGATTTTTAGGTGATTTGTTTC
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TTATTATAGTTAAATAATGAATAACTATTAATCAAAAACAATGCTAGTGC
ACATTTGATATTGTTCTTCAAAATGCTGAGCAGATATCCTGATCCTATAA
TTTCTTAGAATTAATTTTCCTTGACTTAAAAGACAATTTCTAGGGTCAGA
TGGAGTAATACTCTAATGTTTCGTTATAATTAGTTAGTCCATCTGACCAA
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AAAAAATAGGGATCGTAGATAGTTTATTCTAAAATACGATTAACGATTTT
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AGCTTAATAAGTAAAAGTAGTTCATTGTCTCCAGTTTTGGTGGTGCTGTT
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GGTTGTGACCGATCAGGAAAACAATTGCTATCCGATCAGAAATTCACTGT
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TGCGATCATATTCAAATATACAATTTCTTTAAACATATATTTGTATATTT
ATACATTTTTAATCTAAATAAAAGATTTAAACACCTTTTTCAAAAGTATT
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ATCTCTCTTCTAGCTCTTTATTTGACATTAACAGGAGCTGCTTCTCAAAG
TTGTCGTCTCTCAAATTCTCTCTGGTACTCCCCAGGATCGCCATTTTTTT
TCTTTTTCTTTTGTGATATAACGATATAAAGATCAGGGCCGATTGTGATA
CTGCGATCAGCCATATAATATCGCCATATCGCAATTAATCCCCGATCAGA
AAACACTCCAATCAACAGGCCTGCAAATAATTAGCTTGGTTGCACCAATA
TCAGTTTGGCGGTTTTGTCGTTTTTGCAGTTTTGGTTTTGAACCACTAGA
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TACTTATAGATCGCGATTCAATGAATTGAATGATAATTCATTTTAGGATG
CAACTTCTAATGTACATTGTATTATGATATATTAGCAATAGTGCAGGGTA
TTGTTAGGTATTACTCTACGTTTTTTATGAGCACACTCACACGTAGTTAC
TCAATGCTTTAATGTTCTCTCTTCAAGAATTAAAGAATAATAATAACAGC
TTGATAATTTTTATTGTCATAATGTAATGGGAGTACTTTAGTCTCTAGAG
TGCTGACTGACTGAGCTTTACCTACCCACCCTCGTTGCTAACCCTAATCT
AAAATCCCATTTATTATTTTATAAATGTACTTCCTTTTTTTTCTTTCTTT
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ATGACAAACTTTGCTTTATTAATATAGATAGTAGGTTCCTCTTACTTCAA
TGCATGCTGATTTGCAGTATATCTTGGTGGGAAAAAGTTTTTGTTTTGCT
GTTGTTAATTAAGCAATATGACGTCACAAAATTAGCTTCTTTAAAATGAG
AATTGATTTACTAGGAACATTTTCAATAGAATATGAATAATGTTTATGTA
TTAATATATTTTTCATAAGATAGTTTCATTAGTTATTTACTTAATATGAA
TACTATATTATTGTAGCGGAGGTCCTTTGATGCTCAAAACCAAGTGGCCT
GAGAGTAAGTCTTAATTTTTATTTTTCTACAATACTTTTATTCTTTACAT
AATATACGYAYTTATCTACGATTATGATATAGATTCCTTGATAAACTAGA
CCTTATTATACTGATTAATGTTATATTATACGTACATACTATTTTGAAAA
GGAACAAAATTWAAAAATATTCATAGNACCTAAATGAGTGCAAGTTATTG
CCTCGTACAAAAACATTCGAACTGTGAAAATATACATAAATTAGTTTGAT
AACTTTTTGTTAGTAACCATAGATGGGGATTTTCAGTCTGCAATTTTATT
TTTGGCACAAGTCTATATTTCTCCGTGATTAATAAGCGACAATAGAGTAA
CTGAGCTTATAGAAACATTGACCTTAAACATTTTTACTGAACAGAAATTT
TGCCAAAGGACCAGTTGGAATATTTAGCCGAAAAATGATGTTTAATGGAT
TGATGTATACGATTGTATTTTTTAATTCAGTTAAAAATGAAAATATAATT
AATAGCTATTATTCATATGGTATATATGTCATAAAATATGAATTAATGAG
TTTTCTTTTGTACAAAATATTTTTTTTTAATTATGTATATACATTGTTTA
TCATCATGATAATATGCATGTTCGTCCATCCAAGAGTATTTTCTAATATG
AATAATCCATCATATGGAATGCTGATTAATTGATAACAGTTAAGTGATTA
ACACTTTTTCCATTCAAATTGCTGTTGTGTTTGTTATTATTTAATTTATT
TAAAGTACAACATCGGTCAAGTTTCGAGCTTCATTCGAACCACACACTAC
TGTGTTGTGTTTATACAATGATAATTAATCGATAAAATAAATATTTTTCA
GTATTATAATCTTAATTAAAAGCCGGTATATGAACAATACTTATTCATCA
TTACTGTAACAGTATACTAATCCCACGGTTCGGTACCAACTGCAGTACGC
CATTTACGGTTCGGTTAGGCATAATTATAAAATATTTAAAAATAAATAGA
ATTAATGTAGTTTTTCAAGTTTTATCGTTGTTTAAATGCTGCAGGTATTG
AAAGTTGCCTTTTTGAGTCTTTGCAAATGAGTTTAAAAGTTTGATCTACT
TTCATTGGTATAATCTATTCCTATGAAGCAAAACTTATAGATGGCTATAC
TTTTGTTCACAACGTTTCCCCATTTTGTCATTCTTTAATAGTGGTTACCC
AAATATAGACATTTATGACGCAAAATACATGTTTGATTTTGTAAAAAATA
ATAACTAACACAATTGCTACGGTTTATTTATAATATATTAAACCTAATAA
AGGGTGAAAAAAAACAAATTTTATGATATCAAAATATTTAATATGTGATT
ATATATATACGTACTGTATCGAGAGTAAAAAAGTACCGTACCGCGAGATA
ACTAAAATATACAATTGTATATTTCAATAAATTCACTATCTTTGTCGTCC
AAATGTTGTTAATGGTCCTTCGGCGCAACGGGACGTATCTCACGTTCTCA
GAATCAAGAAAATCAGGTGTTTTTGTTTTGCTAGTGTGACAGGGTGCCTT
GTCTTSCTGCCATATCCAAAGTCTGTCTTTCATGATGCTGTGGATCCAGA
CGAAAACTTTGGTGCGCAGAACACGAATGTATATATTGGCGTTGACCTTC
AGGTCTTGCATAACGTGAACTTCGCTGCTAACAACGCCAAGAACCATAGC
ATTCTCTGAGTATTTGACCTTTATGATCCAAGGGACTCAGAAGTAGATTT
TTCCTCCTATCTATGGCTCGTCTTGTTGTACTTCTGGGTTTGAAATAAAT
TTTTCTTATCTMAGAGCGCTCAATTTTTGTAAGGGTATTTTGAAACAAAA
AAAAAGATTATGGAATAAAAAAGTGCCAAATCAAATGAATCTACATCGTA
AAGAAACTGAAACCTAATAAAGTATATTTAAAAACATCCTGTTTTCACTT
AACTGTAGGTACATTTGTAGTAAATTTTCAACACATTTTAGAGTAGAAAA
TATCCTTTCAGGATATTATGTATTCGGTAAATTATCTCATCCTAAAATAT
AATCAATTTAAATAGCAGTTTCAACACACTGGATCAACGACTACCATTAG
TAGTTAACTTAACAGATGGGGTGATAAGTCTTGGGCTTTCAAAACCCTCA
AAAGACAGCTGTCAAGATTCCATAACAATGGTTCTTTACTTTTTGAGTTA
TTGTGCATGTAATTATGCTACTTTATTATTTCAAAACAATGGAATAGAAC
AATTTAGTGTTAAATTTTACACTCTTTTATGATGGGAAAAAATACTGTTT
AAGCAAAGTAAGGGATTGAAAAGTGTTATTGGGGCTCCACTCCATAAAGT
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AATATATGGAAAATTACACAAGTTTTAATTATTTTATTATATTTTTACAT
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