EMLSAT00000000861, EMLSAT00000000861-696708 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000861
Unique NameEMLSAT00000000861-696708
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1148supercontigLSalAtl2s1148:89797..110726 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000861 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000861EMLSAG00000000861-683627Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003773EMLSAE00000003773-712701Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003774EMLSAE00000003774-712702Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003775EMLSAE00000003775-712703Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003776EMLSAE00000003776-712704Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003777EMLSAE00000003777-712705Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003778EMLSAE00000003778-712706Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003779EMLSAE00000003779-712707Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003780EMLSAE00000003780-712708Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003781EMLSAE00000003781-712709Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003782EMLSAE00000003782-712710Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003783EMLSAE00000003783-712711Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003784EMLSAE00000003784-712712Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003785EMLSAE00000003785-712713Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003786EMLSAE00000003786-712714Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003787EMLSAE00000003787-712715Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003788EMLSAE00000003788-712716Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003789EMLSAE00000003789-712717Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003790EMLSAE00000003790-712718Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003791EMLSAE00000003791-712719Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003792EMLSAE00000003792-712720Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003793EMLSAE00000003793-712721Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto771859auto771859Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000861EMLSAP00000000861Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000861

>EMLSAP00000000861 ID=EMLSAP00000000861|Name=EMLSAP00000000861|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1778bp
MDHHHPKSKLESAWSATLGAGSRGMMRAAGGLTLRRGDSAASSGPSKLTS
ISVIGLSGSEKEKGSVGTGKSCLINRFIQPTADNYGVDHISCFSQSDFCG
RVVNNDHFLFWGDVLKLNDEGTEFHIQVVEQTEFIDDASFQTFRGSGKFE
SYVKRCTNTKLVSAEKIAYICKDQLGIEREYEQKFMPDGRFTVDGFLCVF
DVSDVPNRSVDKQVDVCASILTTVLRMKKPIILVATKCDEAHEIYVREIE
KLVNRKEFKGLVPVVECSAHENINVDQAFFALAQMIDRTRGRSRIISYYE
AAAMKRETLDHATDAFQRLLKLQITDYGSMWSTTSKKLSNHHEYMHYVDI
FGKDTAQRLFKRHIRKLKDDYLGAKVQRYLDLLPEVLHELFPDFDTMGEG
DWGLVKERIREHPDFDHWFIEYPEDTTWMEADLFDGGESTENRIPYDILE
MPEAENVYKNHLNQLHANQKRLEFRKDFKILLEEMGCVTPGKSINELRVL
FLGRECFENLSERDVQDIYDLHQREIIVKAKKNFQELLLERSDLFYQFRS
SPTGTITQDDIFDITELLQEDSRYKALDRMDADRKLLLYQHLGFVHCPIR
EHCPAFPNCFDSCVERIVSKKATRPNSFTRGGNRGSGPNNILENSHLNLL
VLGIEGLANDLANHIRNQCNDNDFEYQGHIFSLEFRTVTGDVSLPENAFR
TQDFLPHGCFCTFSNADSFEYIRVSLEKTLLSNLEHEDRLPFQGLPLVLV
FAPDSSLTEKDLAYLRKEGQSIADSFQCSFINVCVRSDLDNSFTISDNLI
EDAIRDLIDGISRRSGILNAYQSATSNNTEPDIRIIMCMLCGDPYNIEHV
LAPVLTHQNSSCINGERGVTIEMPLGDKIRRRIEIIISSYHGATEFRDEL
IHGFILVYSTNRKASLATLSAFSMDVPELPILVYGINDITIVSGGLSTLT
GIQNNTSSSANEQLRPLLISEGKNLSERLNAHFINSNTSQQKVTFYTEFF
QEVFDKKSEIESAFSMEDNNRLDDSGEGTLERPSRRIQPVPPPRMDSYRL
KRGPPSNASRSGSGSEIYERLPGLDSGSLVDDEPSFDDRLRLSPSDEDSD
IYSHVDSMDRQNGGPTEHLIKPSLIKNRRKQQDVSSDSSFISFPARPSFF
KSNRSSPTRDSSLPKYGVSRRHLPPAGGGITTAPPPPPPPPPPPLPSQRL
FKADSLNTDRTGYFENRGFEGFPSPDTPPEPAPPDPRDPRNNSSNRGGTG
WVDDSLFLRRKNDGLEDSEMWNSNGSSTNNIGGGAFTTGRRRPPPPVKPR
GQLPGRLNMNDFNKITAALTSMQLENKLSPRSSINAPLAISEDIDQGGYA
VPRDNLKGGGGSIESNENVKSKSSSSVSSSQQPNEYAQPISLDSSDLSSS
GTKNKLRHRERREQIAMQADGSGSDSESSSDDEASSRHGNNNRPPHKRQH
RKKKGVAIPVATPKVPPMPTQMPRVMAKDPTKSPTIEPDRALPNSDYSED
SDNCPSVPLLQQKQPPSSSSSYYPPPPXRLRYTQLKSSSSSGGGGSLGGT
PAPHHIPPPSSRVTSHNISSFSPLTFTTKLLVDPLASPRGDEFPSSSKFD
EKQRKKWDKENRQRLKDDERRKLKDEKRRLKEEKEKRDSEAKQRKKEGKS
KLKANSVQAQPTLDDFKAAPDKPVPVFLNKCITYIEKEGLDAEGLYRVPG
NRAHVELLFQKFDEDQNVDINTLDIAVNAVATAQSKIVYEFEDLGKFEAV
RPHMEEVVQTLIDQFRFLFCGQEEVMMV
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1148:89797..110726-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000861-696708 ID=EMLSAT00000000861-696708|Name=EMLSAT00000000861|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=20930bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1148:89797..110726- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGGATCATCATCATCCCAAGAGTAAGTTGGAGTCGGCATGGAGTGCCAC TCTGGGCGCGGGAAGCCGAGGCATGATGCGTGCAGCTGGAGGTAAGACTA TTCCTCCCTTAGCCCAACCCAACCCAACACAACCCATTCACACAAGTCTG CTATCAAGAAATGACGGAATAGAATCCCTTGAAATAATGAGTGAAGCTCC CAGAAGCTCAAAAGAACCTTTTCACACACGTTTTGGGGAGCTCTAAATTG ATATTTTTACTACATGAGATGCACCCATTTCTAATAAATCATAAGGAAAC TTTAAGAATAAAGAGTACATTGAGCACCACTTGATGCCAATGAGAAATAA TCCAAGTGAGATGTACTGAAAATCTAAATGAATGTCAACATTTTTTTGAT CGATTAGGTAGGAGTAAAGAAGTAGAATTAGAGACAAATATCCTATTTTT CCCCCCCATAGTAATTATCTACACTATAAAAAGTAAGATTGTATCACAAT GTAAAAACATATTTTAGGGTCTGATAAAAAATAATAACACTAGGGAATAA AGATATATGTTTTTGAATGATGCTAAGGTTTTTTTATTTCTTAGTCCCAT TTTGACATCTGATGGTTCACTAGTTTTCTGAACATGAATGGAAAGGGGGT TTTATTCTCATAAAACTGGATTGTTTATGCCTCCAAAATGGCTGACATCA TTCAGCTACCATGTTTTCGAATAAAAATGGAACTAACAAAAAATACATGG GATTTGAAAGATCCCACTTAAAGATATTTACGTCATTTTTTATGAAGAAA AAGCTGTATAATTTTTAACAACCATTATATTTCCTATGTCAAATGACATA GGAAAAGATTGTAACTTGAATAAGATCCAGTACTTTAGAGAATAATACTT TAAAAAAGACCACACAAACTAATTGAACAAATTATACATGTAACAACTTC CAATTTCTTTTTTCATATGCACATGTAGTATTACTAAAGATTATATTTTA CAATGACCTCCCTTTTTTATGCTCCTTTGTTTTAGTACAACGAAAAATGA TCTGGAAGTAATTACATTTATACATAAAATCATTTATCCATATCCTAATT ATCCTTGTTTTGAGAGTAATATTTCCCTAAATAATTGCATAAGGAACAAT TGAACGAATCACAAGACATTTCAAAGTAGATTACTTTTTTTGATTACATT TCAAAGTGTTTAATTTTTTTAATATCCATATCTGCCACAGGGTCTGAACA GATTTGAAAGCTATTCCATGAAATGGGGATGGGATGTAAATCTTATAATA ATGGTTGTTAAAACTTATGATGTTCTTTTCATGTATCTGATGTAAATCTT TCAATAATGGTTGTTGAAACTTATGTTATTCTTTTCATGTATCTATTGAC ACAAATATTCTTTTAACATTTACTTATGTTATATAAGCAAGAGCTTTTTA TTTTATTTTAAGTTTTACCGCATTAAAACTGTTTGGGGGAAACAAAAAGT ATGTAGTTACATAAATGCATCCTACATTTAAAGTCAGTAAGGTATTTATA GCCTTTTTAAATTTTACACTCATATACTTTAATATATGTAATCTTTTTCT ATAATTTGGGTATTTAAGGATTATTATTGTAAAAATACATTATAATTGTA TTTAGATGTTGGAAGATATGTCTTTATTTTTTTCTCGTATAGAATGATGT GTGTTTATCATAATAATGTCCAGCCTATTTCTCTCTATTATGATGATGAC TTTTATTGTTATTTATTGATTCTCACACTTTTATGAGTATAAAATAATTC ATAGATTTTTGAAGGAGAGGAGGTGCATCGTTCATAAAAATTGATATACT TAAATACATCTATCTTTATATATATATGTAAACATTTGATAGCAGACAAA TAAACAAATTTAATGAGAAGAGAGAATTATGTTTTTATTCTAATTTTAAT AATTTGACTTACTATTCATTTATCAATAATAAAATATCAATTTAGGACTA ACACTTCGACGAGGAGATTCAGCTGCATCCTCGGGTCCATCAAAACTAAC ATCCATATCAGTTATTGGTCTTTCTGGAAGCGAAAAAGAAAAAGGCTCAG TTGGCACTGGTAAATCCTGCCTTATCAACAGATTCATTCAGCCTACTGCG GATAATTACGGCGTAGACCACATCTCATGCTTTAGTCAAGTGAGTTGCTC AATGATATATAATATATATACCACCACCAAACCCTTTTTTTTTCAAGTCG GATTTCTGTGGAAGAGTTGTGAATAATGATCATTTTTTATTCTGGGGTGA TGTACTCAAACTGAATGATGAAGGAACAGAGTTTCATATTCAAGTTGTAG AACAGACAGAGTTTATTGATGACGCTTCCTTTCAAACTTTTAGAGGATCT GGTAAATTTGAGTCCTATGTAAAGAGATGTACAAATACCAAGCTTGTCTC TGCTGAAAAGATTGCTTACATCTGCAAGGATCAATTAGGTAAATTTAGAT TCTTCCTTTTTTAATTATTTTGAGTTATTATTAAGGATATTGTTAGTATT ATTAGTTGGATGGAAGCATGGGATGCTAAGGAAATTGGTGTTTTTGAAAT GATTTAAGTCCTTTATAGATTCCAGAAATTTATGAATGAAGGTCGATTAT AATTTTTTCATTTATATACTTAATACAAACATACACTCGTATATGTTTGT ATACATTCCCTTCTCTTTGTCTGTAAACCGTTAGAAAGTCGAGGAGATTT AAAAAAAATAATAACAACTTTCTTTTTCATGCGAACGATGGTTAGGCTTT TTAAAAATATTCATCAAATGAAGCATTCAAATGAATATAAACGCAAAGTA TATTCATACCAATAATAATAAAATATATGACTTGAGTTATAATAAGTTTT ACTTATTTTAAATGTACATACATGGAAATTTAAAATTCACATCACATAAA TTGCTAATATATGTATATATGAATGTATATACACACGTCTTAGCTGAAGT AAAAACAGCAAATAATCTCTTATTCATTCGCCTGTTCTATTTTGAATCCC TAAAATTTATTTATATTAACTTTTATTATTAGGTATTGAAAGAGAATACG AGCAAAAGTTCATGCCTGATGGGCGCTTCACTGTGGATGGTTTCCTCTGT GTTTTTGACGTGTCTGATGTGCCCAATCGTAGTGTTGATAAACAAGTGGA CGTCTGTGCCTCCATCCTAACGACCGTTCTTCGTATGAAGAAACCCATTA TTCTAGTCGCAACTAAATGTGATGAAGCTCATGAGATTTACGTGCGTGAG ATTGAAAAATTAGTGAACCGTAAGGAGTTTAAGGGTCTCGTTCCTGTCGT GGAGTGCTCAGCTCATGAAAACATTAACGTAGATCAAGCATTTTTTGCTC TTGCTCAAATGATTGATCGCACTCGAGGCCGATCTCGTATAATATCTTAC TATGAGGCGGCTGCAATGAAAAGAGAGACATTAGATCATGCAACGGACGC CTTTCAAAGACTTCTTAAGCTACAAATTACTGATTATGGTTCCATGTGGT CCACCACATCTAAAAAACTTTCAAATCATCACGAATACATGCATTATGTG GACATTTTTGGTAAGGATACAGCACAAAGACTTTTTAAGCGTCATATTCG GAAACTAAAGGACGATTATCTTGGTGCAAAGGTTCAAAGATATTTGGACT TACTACCAGAAGTTCTCCACGAATTGTTTCCTGATTTCGATACAATGGGA GAAGGGTAAGACATGAAGCTCTTTACTTATTTTTTTTTATAAAATATACA 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ATTTTTCATTTTTACTAGAAAATTTAATATTTGAATTTTTTTTTCAAATT TTTTTATTTTTGTTGTTTAATTTTTGAAGTTTTTATCCAAAAAAATTATT TTTGTTGAATAGCTGTAGATTTTAGAAAGTTAAAAAAAAACAAATTTAAA ATTTGTTTTCAAAAAGTTCCAAAAACCCAAACCTCTTCAACCTCAACCCT GCGGACTCTCCTGGAAATAGTTATCTGAAGCCCTGTAGATACATATATTC ATGCAATGTTTTTATACTGTGTATGTATTTATTAGTGTTGGATTCAGTCT GGAAATCTTAGACCGGCCTCGTTGTAAAATCTAGAAAAAAAATTGGACTT TTTCAAACATGTGTCTTTTATCATCTTTTTTTAAGATTTAATTCGAGGGG AAAAGACGAGAGAAAAAAGAAAATTTGGTTTATGGTCTTGAAAAGATCAC TTAAGACCGAACCGACAAAAAAAATTTCTCGGGTTGAGTTTCAACCCTAG TACTTAAATACTATAAATAATACATATATATTATTTCTTTTTTCCACCCT CCCTTTCTCCCACTCAACTATTTGTATTTCAACTTATAAATACCAACATG AGTTAACTTTGAAGAGAGGGAAGTCATTTTGAGGGCATTCATTTTGATAC AACATCATTATTTATGATATATGTATTGCTTATTCATTGATATGTTTTAC AATTTCTAACCGCCTTCGGTTGATGAATTGTAAAATAATAATGTAATATC ATATACTTAAATTAAATTGAATGTATTCCTATTTATGGTAAACCATTCAT TGAAAGAATTTTATTGGTGCATATTTTTATGTGTATATTCAAAAAAAAAA AAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAGGAGAGAAACTAATTCAATGCATCTCCTC TAATCCTTGCTGCATTGATATTTGATACTGATTATATATTTAAAAAAAAA GAAGAAATTAAAATCATATATTACATTTTCACGGATGTCGAAGGCGACAC CATCTTGGGGGCTCATAAATTCCATCAAATAGCTTTAAAATTATCAAAAT ACTTAGCACCTGTATTGAATACTATTTCATATAAAAGGAAAGCAGTGATA TTTGAATTAAATCAAATTAATAGTCTGTTAGAAATTCCAATGACGGGAAA AAATCATGATAATTACTGTAAAATATTTTAATCCTTCCAAATGTTATAGA TAGATGACTGTCTTTACTATGTTAATGCCATATTTTTATTAAATATTAAA GTCTGGGATATAACAAAATCTTTATAGATCGATATATTTTTCATAGATAG TAAAGGTTTAAGTCCTTTCACTTTTCAGTCTCGATTTTGAAATATGGTTA CTATTTTCCTTAATTTAAATTGTTAAAAAAAGTTTTCATTCTTATAAAGC TTCTTGGTTGTTGAAGCCCCCAAGATGATTGGCATATGAAAAGTTTCTGT ATTATTGACTACTTATTATTATATTGAAGTATATTTTATATTTTAGCTAT ATAGATATGAAATAATAATTTATAAGTCCCTTTGATGGGAGTACAGATCA TTAAGTATTTATTAGAAAATATATTACTATCATTTTTATGTATGTTCATT TACGATAAAACTTTTGTATGAGAGATATCTTTATCATATGTATATCTTAT ATATGCACTGTACTCTCTTTTGTACACTAGTCAAAAAATTTGTTGTCGTG TATATAATAGATGATGATTCAAGTTTTGTTATTTTACTTCTTGTAGCTGT GATCATTTTATTTGTCATATGGAAGGCTTATCCTGTGATGGATGCGACCA TTTTTATTCCAAACATCTTTCTCATCGGCTTCCACTGCCATGGCAAGTAC ATATACTCACAGAGAGAGAGAGAGACAGATAAAGAGGAGAGACATACCTA 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