EMLSAT00000000863, EMLSAT00000000863-696710 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000863
Unique NameEMLSAT00000000863-696710
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1149supercontigLSalAtl2s1149:7505..31613 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000863 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000863EMLSAG00000000863-683629Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003796EMLSAE00000003796-712724Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003797EMLSAE00000003797-712725Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003798EMLSAE00000003798-712726Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto768720auto768720Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000863EMLSAP00000000863Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000863

>EMLSAP00000000863 ID=EMLSAP00000000863|Name=EMLSAP00000000863|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=370bp
MLLSMLGAERSITVVLVGDTKIGKSALINRITKNAFSQEYTPTSFDKVAV
KRNVEGKWLEFALWDTSGCSAYDNVRSLPYEEAHVFLLCFKISDPASLSS
VRHKWMKELRRHRPEVPIILCGCQADLRHDPPTIASLSKMGRSPVAPEQA
LAVCCEIDAVSYVETSSKEGDSFYEVFEVCAHAAPPLSTTENTHRNNSSL
KNKRNGPNNVSFSGSECEIRDQQGQKVFSSPTKRAPLSYHPVHHPHHHHP
PILGCLRASQSQPTVQNDNEEELRDRRILFPPPGPSASSSLVSPCCSEPP
FMIPAPKPSNGLSRRTSFRSQRIIVPPPPPPKSSPPLLNTSSNHEYEVDS
FDPKSLPSSKIIPVKKLMNP
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1149:7505..31613+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000863-696710 ID=EMLSAT00000000863-696710|Name=EMLSAT00000000863|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=24109bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1149:7505..31613+ (Lepeophtheirus salmonis)
CTGGCGCACACAATTTAACGAAATCCCCCCTCATCCTTTTCAGTTGATTC ATAGACGTGTGTGTGTCGTGTTGTAGTACATCGTTCGTGTTGTTCATTTT TACTCTATAAGGTTTTGTGATAATATTTTACAAGTGTCTTGGAAATAGAA GAACATATACTAAATGAATTTAGTATAAGTTTTTTTCAAATTTTTTCTTG TCAAAAAGAAGGATTTATCGGGAGAAAAATATACTTGATATATGTTATTA AGTATGCTGGGAGCAGAGAGATCCATCACTGTTGTATTAGTCGGTGATAC GAAAATAGGAAAATCCGCTCTCATCAATCGAATAACCAAAAATGCATTTA GCCAGGTAATTATTTGCTAATCTACGATGTAAATGTTATTACTGTTTTAC CTGTTTGACCATTTATGTAATCCAGTCATGGAGGAGGGCCTCTTCCTGCC TATGAGCAATTAAATCATGGATGTAATTGTATATATTAACAAAATGGAGT TAAATACTTATCATTTCAGTACATGGAGGAAACTATTTTCATTGATTCTC CATTTTCCATGTTGACCAGTATTTCGTTGTGAGTAAGAGTCCCTTTTTGA AGTGGAGTTTGAGGTCTTAATATGTGCATGCATTATACATATTTGGTGCC TCAGTACAAAAACAATCTAGATCAAAATCAAGAAAATGATACAAGGCCAA TTAATTTTTTTACTCCATACAAACCCATTATTTCAGACATATTTGGGTCA ATTATATACATTGTATTCAAATTTTTGGTATAAGTTGAGATACTTGAGAA TGTTAACTATAGTTTAAAACCTTTTATTTGGTTTATATGACTTGATTTTG AGCCGATATACCCTTTCAAATATAATTCATCAATTTCTAATTCTTTCATT GTGACGATGAATTTTTGCTACATTAAGTACAATTTGCGACGTATCTAAAT GACGAATCAGAATAATTTGTTATTATAAATTAACCACACTTTGTCGAAAT TTGTAATCCAGACTCAATTTTTAGAAAAATCATTCTATCTTTATTTTGTG TTGACGGGGTACATTTGTAGTAGCCCTTCTACGAAATTTAAGAATCATGT CGAGTAAAAGCATTAATCATTTCTCAACACATAATCGACAATTGGATTCA ATCAGTGAAAAATGTAACACTTGACAAAAATTACATGTTAGTGCCAACGT AATCATCTTCTAAGGAGCAAAGTCTAATTACTATGTTCATATATATATAT AAGTAATATCCACCAGTATTTACTGTGTATTTGAAAGGTTGTCAATTCCT TCTGTGTTATGTTTCCAAAGTCACTATACAAAAGAGGATAATAATAATTT ATAGTCCTACATATATATATATATAAAATGCTTTAAAGTGATTTAATAAG ACCTCCTTCATGTGATATTGATTTAATATGATACCTAGATATGTGTATAA TCAAGTAAACGGTGGTTAAAAACCAATTTAGCTCTGAAAAGGTGATTCAA TATACGTTTTTAGTTTCATTTCAATAAAAAAKATATAATAAAACCCACTT TTTTTTCCTACTCAAAATATAAATAGAGAGAGACACACAATACAAGAAAT TGACGAACCACCCATTGTGTGAAGAACCTATTCTTTATAAACATATGTAC ATTGTACATAAATGCTTTTTTATATCTTTTAAGAATAAAAATAAAATAAA ATCTTTTTTTATATATAAATCTTAAGGAGGTGTTTGCTTGCTCCTTCACT ATGGGGGCATTATTTTATTTCATTCCATATAAAGATGGCTATAAAAGTAC ATGGATATTAATAAAAAACATTTTGACAAGAATTTATTTGAATAAATGAG GATTTTCACGTCTTCCCATCAACTGAATAAGTAAAGGACTCACAAAATGA 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GGATGAATAACAAAAGCGAATATGACCATTTGGTTACGATTTCCGATATC AACAACAACCATAGAAGTGACACAAAATTGACTACTACTAGTGTTGTGTT GGTCTGGTCCTTATTTATTTGGTACAGTCCAGTCCAGTCTTAACTGTTTG TCTTTGGAATTTTATATAAAAGTATCGATGGATTATTAAGCCAAATAAGA TATATGAAATATGTATTAAGATTATTGCACATATCTTGCAAAAAATATGA TTATTTTCATTGAAATACGAAGACATTATTTTTTACTTAGTTCTCTATAA TTTATTCTTTTATATAACAGAATAATGAATAAAAAGGAAAATCACCCTCA TTGACATCACGAGGGATACCTTCTTTAAGGACCAATAAGTGGACCGGACT GGACTGCGGTCCTCGGTCCTAAATAAGGACCAACACAACACTAGCGACTA CTACTGGATTAGCTTGAGCAGAAAACTGCGTCAGGGCTATCATTGACTCC ACTGAGTACCATGAGACGACCGTCTACGATGTTCTAAAGCTTATGAACAG TTCGAGTGACGTCACCAGGAGGGCCCAAAAGAAATAAACATGTCATTCTG CCTGAAGAGATCAATAGAGGCAAATCCAACAAAGCCTATGTCAAATCTGG CCAAGAACCACTCTGTAAGCACGATAGTGGTGGATAGGGCCGTTAAAGAC TAGGGTTTCATCCCTTATATACCAGACCAGGTTTCTAGACCCTGGTCGAA CCTACTATTCAGGGCTTCAAAATACTTTTGTTGGTTGGTTGTTTTTAGGA TTCAGGATTCAAATTCATATATTTCATACGTTAATTCAAGTGATGAGACT CGATACAAGATGGATTTTTTCCCCGGTTCGGTCTTAAGTGATTCTTTCTA GACTGATTTGGATCGATATTTATATTCCAATCGTTTTCAAATCGTAGATA AATTTTTTGGGTCTCAATCTATGGACCGATTTTCTTCCCTATCCTGATTT ATGAGTTGTACAAATATGATTAATGTAACACATTTAGCCATGTTTTATAT TATTCTGCAGATGTTCACAATTATGAAAAACAAATACATCCTCAACCATT TATCTATCGAATCCTTGTAGACCGAATTTTAAATAAGACGGATTTTTGTT TGGTGGGATGGATCTAAAACGAGCTTCTTTAAATGACCTAATTATTTTGC TTCACTAAAAACCATAACGTTCTTAGACTGAATAGGATTTTCAGACCGAA ACCTGATACTAGCAAATGCATTCATACATATAGTTATCTGTGGTAAATTT AGATGAATAAACAATCTTTCAAATGTTTGTTTGTTTAGAATTTTCCCACC AAATGATTTTTTCTTCTATTTTTTAATAGTAGAAAATTGCGGTGCACACT GAATGATGTCAAACCTTTTTGTCTGTCCAAAACTAACTATCAATACACGT TGAGGACATGCGTACTAACCTAACAAAAATTAATTTTGACAATCAAATCA GAGTTAAACTATTTAGGTGCGGCAATTTCTTTTGTTGGTCGTATGGATTC ATGATTTAAATGTATATTTTCATGTGTAAATACGTGTATACATAGGTAAA TATATCACGTCGTTACTTTTATTGTATCACGCAACCTTTTCTACGGAAAT GGACAGAAAAAAGGCTGGAAATCATCTTGTAGTTAGCCAAAAAAGTCGAT CATACTCACTGCTATTTATTTATTTTGTAATATTAAAATCCAACATAGTG TTTTATTCGATACTGTATTATAATATTGCTTATAAATATTCTATTGAAGG TTAGATATAAATTTGTATTTGTATATGATAGCCAAATTTATTCATATAAA TAATAAAATGGTCAATATGTATATTATATAAACGACAAGGGATCAATCGT TTTCCTCTTCTTTTGGAATCTGAGTATAACTTAGTTATCATAAATAATAT ATTATGAATTAGCCATGACGTATCAAGCAAGATGAATGAATCGACAGGTG ACAAAAATATATTGGGTATTTTTGTGTTTGTAAGCTAACGTCGTGATATC CGTGTGTATCTTATTACATAAAACATTTATTTTGGGAAGATAAGAGAAAT TTCTCGCATAAAGTCTCATACAAACATAAATAAAGTATTTATAAACTTCC TGGAACGTTTCCAGTTGATCACGGATTCATATACATACATATTGTACTCG GATACCTGCCTTTATGCATGCTGCTCCTTATTTTTCTTTCATTTAAATCC ACCCGTTCAAAAATGCATTTTGTGTATAAATCAAATCCGTCTAAAAGACC TTGTCCCAAATGTGACTGCCTTCAATCCTGTTTAGTTAGTAACAGTCTGT AGATTATGTGTGAAAATCTGTTGGTTATTTTTCAATTATCTTTTGCAATT AAGGATCATGTTATATTGATGTTTATGCTTATAAACCTTGTATACATTGA TGAAGTTTTTTTTTGTAGGGATTTAAAGTTTCCCATGAAAGTGGGCGATG TTCTTTTCCTCTCATGAAATGTTCATTGCGGTTTCGTAGCAAATAAATAG TTATTCTATAATTGATTAGTTTATGAGTTTTCTGTAATAAAAAGTGTATG TACATTTAGACACACATACATATGGATATCCGGTTCATGGACAGACATTC TTGCACATTAAAAAAAAAACAAAAAAAACATGAACTCCATTGAAGAAGGT CTTTGTTGTATTTTTCTTTCTCTAAAATGTCCTGGAGGAAGAAATTTAAT TGCTCATTTAAAAAGGGTAATATGCATACAGAATATGTACATATGTCAAC AATTTTAGGTATATTAATAAAGAAATATATGTTTAAACCTTTTTACATGA 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