EMLSAT00000000899, EMLSAT00000000899-696746 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000899
Unique NameEMLSAT00000000899-696746
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1157supercontigLSalAtl2s1157:181513..200366 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000899 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000899EMLSAG00000000899-683665Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003938EMLSAE00000003938-712866Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003939EMLSAE00000003939-712867Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003940EMLSAE00000003940-712868Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003941EMLSAE00000003941-712869Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003942EMLSAE00000003942-712870Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003943EMLSAE00000003943-712871Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003944EMLSAE00000003944-712872Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003945EMLSAE00000003945-712873Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003946EMLSAE00000003946-712874Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003947EMLSAE00000003947-712875Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003948EMLSAE00000003948-712876Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto774017auto774017Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000899EMLSAP00000000899Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000899

>EMLSAP00000000899 ID=EMLSAP00000000899|Name=EMLSAP00000000899|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=645bp
MYLLIKRFISSKMINGKYLRAEIVRKKGRNLVNDPVSNKGLAFPLSERDR
LNIRGLVPPAVLDINDQCKIIFEEYKTGWAARAEQEPEDEIIKSGVNPDN
IRKWKVLQSVQDRNETLFYKLILENFSEMSQIIYTPTVGWACSHFSHLYR
RPRGMFFSALDRNEMASMVYNWDQDDVDAIVITDGSRILGLGDLGIGGLS
ISVGKLDLYVAAGGFHPRRVLPVVLDVGTNNDKLINDPRYLGIKRARLEG
EQYYELMDELMAALRLRRPKALIQHEDFRSSYAVNLLKRYRSDYLMFNDD
IQGTAATVLAGLYGALKVQGKSPNDLKHQTFVICGAGSAASGVLLTIRNA
ITKRYRLSNDEVGNRFFIVDQEGLITKTRHNLREMEELFYDLSKPKLHIS
NKKKSPKDFQYFSKTIKGSVILDSTFAANEIEMEGFGLLEVVKRVKPTVL
IGLSACGGIFTDKVLKMMSDNCKDSLPIIFPLSNPTSRSECTAEQAQKYT
QGRAIFASGSPFSDIKYGKNVIASSQCNNRYIFPGLALGAALGQTSVITN
AMINKSAEALTELIENEDLERRATFPELVDIHEIAVHLATRVFEQAMDEN
LPIGNKIALEARIKGGEDGLKDYIRSKMWRPEYRPLVYLPPGKGE
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1157:181513..200366+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000899-696746 ID=EMLSAT00000000899-696746|Name=EMLSAT00000000899|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=18854bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1157:181513..200366+ (Lepeophtheirus salmonis)
AGAACTCCCTATAATCTGAAAAAACTTTATATAAAGTGAGAAGAAAGATG TCCGATAACTTTCATTTGTAGTAAATTCTATCTTCTTACCTCACAGGCGC ATTCGTGGCAATATTTCATTCTGGGTAGCTCCAGAGAGCATTCGTTAGAC CTATTGCATCTCTTAGGTATATAGTAAATATATAATTTTATCTTAAAGAT TATCAATCAATTTAGCTTATATTGCAGTAAAGTCGTGTAATGTATTTGCT CATAAAGAGATTTATATCATCCAAGATGATTAATGGAAAGTATCTTCGTG CTGAAATTGTTCGTAAGAAGGGAAGAAATCTAGTGAATGATCCTGTTTCG AATAAAGGACTCGCTTTTCCTCTTTCTGAAAGAGATCGGCTAAATATACG AGGCTTAGTCCCTCCGGCAGTGTTAAGTTCTAATTAACTAACATCTAATT CAGTTTTTGTTTCCAAATATTTATTATTTTGCTGAATAGGTAGGTCCAGC ACCATAATTTCTCCATTACATTTTCTTAAGTCCCTGTAAAATTTAAAGAC TGTCAAGATATTACACTTAACATTAATTGATTATAATTTTGATTTAAAAA GATTATTACTTTATTTCACTTACTGAAGAGTTTTAAATAAGTTCTGAAGT TGAGTTCTGATGTGTAACCGACCATCATAATTATTAACGTAGATTTTGAA ATTATAGCTATGCTAAATATTCAAGATATTTATTAATAAAACTAAAAAAT AAGATATTATATAGTTTAATAAAGTGGATATTTTTTTATGCTACATAATA GCTAAGCTTGAAATATTTTATATTAGGTACTCATTTTTAATTCTGAATTA CAATTGGTCATTCCAAAAATTATATTTTCATGACGCAATCTTAAGTTACG CTCATGATAAATTTTCTATCGTGTGATATTCAAATTTAACTATTTGGTAA TTACTAAGTGTTTAGGTACAGTGAATTTTTTTGAACGTTTATGATACTTT ATACCTTTACTTCAACAGCCTACTTTTTTCCTTTTTTATTTACTATTTTA TTTTTCTATTCAGAACGTGTTTTTTCTCCATACCTATTAAACATAAATTA TTCTCTATTAATTTGTTTTTTCCTTAAAACTTATGAATAGTCAAATTTCA TAAAATATTATTTTCAGTCTAGATATAAATGATCAATGTAAAATCATTTT CGAAGAGTATAAGACAGGATGGGCTGCTAGGGCTGAGCAAGAACCAGAGG ACGAAATTATTAAATCTGGTGTGAATCCAGACAATATTCGTAAATGGAAA GTTCTTCAAAGTGTTCAAGATAGAAATGAGACTTTATTTTATAAGTAAGT TTTTTTAAAGTGAAAGGTTAAATCATTATTTATTAAATGTTCAGGTTGAT ATTAGAGAACTTTTCGGAGATGTCACAAATTATTTATACACCCACTGTAG GTTGGGCTTGCTCACACTTTTCTCATCTTTATCGGTAGGMAATTATTTCT TATTTATAACTTCATTTAAATCATTTAAAATTACGTAGGCGACCTCGAGG GATGTTTTTTTCAGCTCTTGACAGAAATGAGATGGCTTCTATGGTATATA ATTGGGATCAGGATGATGTAGATGCTATTGTCATTACTGATGGAAGTAGA ATACTGGGATTGGGAGACCTAGGAATCGGTGGGCTAAGTATATCGGTTGG AAAACTAGATTTGTACGTTGCTGCTGGTGGATTTCATCCTCGAAGAGTGT TGCCCGTAGTACTGGATGTTGGAACTAATAACGATAAATTAATCAATGAT CCTCGATATTTGGGTATCAAAAGAGCAAGATTGGAAGGTGAACAATATTA TGAGCTTATGGATGAGCTAATGGCAGCTCTTCGATTGAGGMGGCCAAAGG 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ACTAAGCAATATTATAATACAGTATCGAATAAAATAATTTGTAGATTTAA TAATAAGTAATTCATTTTCAAAATGGTGAAGAAATAATAGGGCAGTGATA GTGTGGGAGTATATAAGAGATAAATATCAATTGGTATAATTGACTTATTT GGCTAACTTCCAAATGACTTAGGGCCTTTTTTCTGCTTCTTTTTGCAAGA AAGGTTGAGTGATACATAAAGGTAACTACGCGCTTGATGTTTTTACGGCT AAAATATATTTAGTTTTCGAAAAATAATAATCAGTGATGTGTCACGAGTA CTTGATCATGTATAATGCTCCAATATTCCTTGAAAATGGTTGGACAAATT TGACTTGTTCTGAAAATAAAAGATATCGATTGTTAAAGCATTGCTACTCG AATCACAACTTTGACTTGTGACCCATCATTATTATTATTAATCTTGTGAA AATGTGGGTTTGTTTTATGGTTAGATGAGATAAAAGGAATAGTTTGCTCA AAAAAGCGTCGAATCTTGCAAAACTTTAAGCATTTTAAAGAATTATGAAT CCATATTTCCGCTAATAATGTGAAGGACATTCGTCTCTTGCAGTAAGATC TCATATAGCAACTATCAGTGCTCCTTTCTTTCAAAGAATTTGAGTACGGA CTCCCTCTCATCTGGGTCTGTCTCAACAATTTTTCATTCTTGGTTCTACA ATTTGACAAAATTCCATCGTTTATTAAATATCCCAGAACGTTAGACGATA TAGAGAATCTCCGACAGAGAGAAATAAAAGAACGGACTCAAATGAGGTAT AATTTTACAGTAAAATGGAAACCGAGGAAAAATTTATAGTTGCAGATGCA CTTTTGAGAAATCCATATTGGAAACCTGTTAGTGTTATGTATGTAGTATA ATAGATGTATGTCTTGTATTATTAAGATGTAGAGGTTGGGTAGAATCTCA 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