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Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s1157 | supercontig | LSalAtl2s1157:204108..231383 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000900 >EMLSAP00000000900 ID=EMLSAP00000000900|Name=EMLSAP00000000900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=164bp
MAPGAFGILGPLLRRKKKYEKLETEDPEKKKIKKQVMTKLKDLIIKLDDL EPALNPDEECIVCNKSKAVMEVAPCGHQCQCRICFIFKIQEAVESRDLPL SILKGISNISTSSKDSKKSMKSTSSWFSLGSLSSFQANGGCLLINKNVLS KSPRSQRQNMESNE back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1157:204108..231383+ Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000900-696747 ID=EMLSAT00000000900-696747|Name=EMLSAT00000000900|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=27276bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1157:204108..231383+ (Lepeophtheirus salmonis) ATGGCACCTGGAGCATTTGGAATTTTAGGTCCTTTATTGCGTCGTAAAAA
AAAATATGAAAAATTAGAAACGGAGGATCCAGAAAAAAAAAAAATCAAGA
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ATAACTCCAGCATTATGTACTGTTCTTGATTCCAACCATCCATTTTCAAT
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ACAGTTGATTTTCTTCTTGATCTGCACACTCTGCCAGAGACACAACTCCT
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GTCGAAAGCAGTGATGGAAGTAGCACCATGTGGTCATCAGTGCCAATGCC
GAATATGCTTCATTTTTAAAATTCAAGAAGCTGTTGAATCAAGAGATCTC
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GATAGTGAGTAGGAATGGAATCCTTGCCGTGGATATTGCTCATAGCATGT
GAAGTAAAAGTAAATCCGTCATTACTCTTTCACTGCTATCGTTTATTATT
ACTTTTTCTCCTTCTCAATAATTACATTATTCCTTTTTCTCTTTTTTTAC
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GTAATTCGAACCTATTATTATAAAAAGCTTGTTATTATATGGTTACATAG
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ATTAAGTATGTTAGCTCAGAGGAATCTTCCCTCCCTGGAATAGTAAGGAT
TTGTCCTTAACATGTGTATTTCCGTAATATCCAGGATCTATGTGGGCTTA
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GTAGGAAATGAATAAAAGCGACATGAGTTCCTTGCATCACAGTCTAATGA
TTGAGGGCAGCTCAAAGCTGTAAGGAGAGTGACCAACAGAGGTCCATGGA
AAGTTGAGATCCAATATTATTTTTATTAAAGAACTATGGAATCTAACGAA
CACTTTCTTTATTCTACATGATATATTACATGGGCAAGGTACTGAACATA
ATTTACTGGGCTCAGAAGATAAGGTAATATGGCCTGAATACAAGCAGTAT
GATTCTTATGAATGTAGCAAACTCCTTTAATTTTCTCTATCTTCCTTTGG
TCCAACCTCTTTAAGAGAACATAAAAGTCCACTTTTTCTGGTCTTAATGA
ATGAAAAAGGATCTTAGGTCTTGTTAATTGTGAAATAAACTGTTCATCAA
ACTTTGAAAATGTTAAACATTTTAGTATAAGGTTATAACTTATTACCTTA
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TAGTCAAATGGAGTTGCACTGATTAAGTATAAGTAAACATTATAGTATTA
CATTTACTCCATTTGACCTAGAAATCTTCTTTAAAGTCCATATACATAAT
GGATATTTCCTCCTCTAGGAATGTTCGTGTCGTGAACATATGCACATTGA
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ACACATATGAATTTAAATATAATTACAATATTGTTTTGAAGTAATACTAT
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ATATGTCACTCCTGCCTTCTCCTGGTACTCTTTTTTTTCCTTACAAAAAT
GTCAACTCTACTAATTTGTAATATACATATATTTATTTGATATTGCAAAT
CCAAATTTTTTTATATGAATGTGAATGGATCCCGTTGTAGCTTAAACCCT
TGAAAATATTAATTTTAAAAAATCATATTTGGATGGATAGATTCTCACCT
AAGGAAGGAGTAGACTCTACTCTCGTATGAAGCTATCTTTGATTTTATTC
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ATTATAAGATAACATGGAAGTTTTTTTCCTCTTTAATTAACGAAAATCGA
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AAATTCTAGTAAGATCCTTTAGTTTTTGTTTTTAAGGGCAGAAATAAGGA
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ATGTCAGTGTACGTTGAGATATTAAGAAATAAGAAGAGAGCGTCTACTAA
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ATATAAATGCATAAAAAAAAGATCTAGTTGTAAATGCTATTAAAAGCAAG
ATTATAATAGACCTTAAGACGATTGATCGTTATTGTCCTACTTACATAGA
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CAAAACTATTTATTTTTTCAAGAAGGGGATTAAAGGGTTTAAATAATAGT
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TGTCAGAAGTGGTCGGATTACCTAAAAATTCTAGAACATGAAGTTCTTAA
TAAAATGCTTAAGGTCATAATACTAATGAACCAAAAAGCAATGATGATAA
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TAGATCAATAGTGTAAAGGTGAATTTTCAAAAACTAAAGGAGTCGAAACA
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GAACTTATATAATAGACCTTATATTTCAATTTAAAAAATTGCCCTTAAAA
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TTATATGTAAGAGGATTAAAACAAGTAGCATATATATATATATATTAGGC
ATATATTAACTTGTTTAATTCCCTTACACGTAAATCTCGTGGAGCACTTA
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TGAGACAACAATGGTCTTCATCACTGAAGATGGTTTTGCCGTTGAATGAT
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AAAGGAAGAAAATAAAGATGGCGTAATTTATTCCCTAATGGTAAAAAATT
TGAATCGCCTCTAATGAAAACCGCTTTAGAAGGGTTTCAAAACTGACAGA
AAAAATATATACCGAATTAGTGTTAAAAGTAGCCACCTATTTGTGTATTA
AGTTATAAACGTTAAACCTTGCAATATTTTAGAATAATGTGCAATTTTGG
AGTAAGGTATCATAAAAATTTAATAACACGCGGAAATATTAATGTATATC
TGGGATAAGAAAGTCTTAGCTAAATGAATCCTATCTAATAGGTTATAGAA
AAGTTGTTTACTTGCAAATTATGTACTAGCTCACTGGAAGTTTCACCTTG
TTTGGGTAATAACACACTCTGCCATTATGTGACACTGTAAAAGAAATGAA
TTGCCATATTATTGTTGGAATTTAATCTTGATCAAGTTGATCACTTCTTT
TTTTTCATATAATTATTATTATTACTTATATGGAATATACTTAGTAGATA
TTTCAACCTCAAATACTTTACATTGGTGACAAACGTGATTCGAAAAAAAC
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TCTGTTCTTTGGATGTTGAGAACTGGTTCCAGAGAACTGAACTAGATTTG
TGTTGAGGGGGACTTCTCATACCAAAGCTAAATACAGTCTTATGGCGTCA
GCATTGCCGNNNNNNNNNNNNNNNCACTAAGTTCTGTTCTTTGGATGTTG
AGAACTGGTTCCAGAGAACTGAACTAGATTTGTGTTGAGGGGGACTTCTC
ATACCAAAGCTAAATWCAGTCTTATGGCGTCAGCATTGCCGAGTGATGTT
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GAAATCCATATTATTCCGATTTTATGTATTATTTTCCTAAAGGAGAAAAA
GAATCGCCGACATTATGGTAGATAATGGACAAGGTGGCACCTTGTCCACC
ATCACCCTGTCCATGTTCAAGAGGATGAGGGAGGAGAGCCTCTCCTGGTT
CATGGTGGTCCTCATGTGGTTCTTGAGCCTTCTGAGACAGGAGAATGACC
GCTCCRCCTCACAGCTGCTGATGAGCATGGAGGCCAGGATAACGATCACC
TTGTATAGCTCCGGCATCAGGCAGAACACTCTCGAGCTTATTAACTCCGC
AGCAATTTGTGACTAAACCATGTCTTCTGTGTCAATATCTGCCTAGAGAA
ACATAAATTTTAAACATATAATGCAAAATGAAACATTATAATATTAACCT
TGAATTGGTGGAAGATTGCATGGTCTGACTGGASCTGCTCGAGTTCAAGT
CTGTAGTGCTTGGCGATACGCTCAATGACACAGGTCTCCACTTCACTGTC
ATTGACAATTGCAATGAGATCCATTGTGATGTTTGTATCGTCGGTGGCAA
ATCTGTTCTCAAGCTCTAATACAATCTTATTGATTGCAACATCGATATGT
GTTTCACGGAAGTAGGATTCAGTTGTTCCTTTCCACTTTATTCTCCTTGG
AATCTTCRCCTCCTTGAATTTCAAATCAATTGAGTTCTCCTGGTCATACA
TATACTGATTTCATCTCAGACGACTTCAACTCAGCAAGTTTCCAGATTGA
TGCAAAGATTTTCTCATTCTTAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNAACCATCCCTAGAGATACAGCGTGTACAGCATC
GTAGCAGAGACTCCAGCGGGTAGCAGACTGGTTCTTCAGGGTCATCACCT
TGGCATGCTCCTCATCTTTACTTGTTATCTTCACCGACTTGTAGATTGCT
GACCTCTTTGGTGACCCTTCAATGAAGTTGTATAAAATTTATACTGTCCC
CATTGTATTTCTCAACAGGGTTATATCTGAGAGAAGATCCTTGACTACAA
GATTGAGGATATGGGCGTAGCAGTGCATGTAGACACACAGTGGGGCTGCT
TCCTTCCKCCTGGCGGCAAGACCCTTCTTGATGCCGGATATGTTGGAGGC
ACCGTCCGCGGCCGGAGAGACAGTGCGGGCAGGGTTAAGGCCTAGATCTT
TGACAGCCTCGTGAAGCTTCTCAAACAAATATTTGCTGTCAGTCTGGGTA
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ATATCCCAGTGACATACTGAACTGCTCCGTGTTTGACATATCTGATGTCT
CATCAACAATCACAGAGAACCAGTAGCCATCATTGCCAGCCCAAGTATTG
ACATCTTCAATTATATTTTCTGTCACTTTGGATGCTATAATCTCTATCAG
CTCATTTTGGATGTCAGGTGAAGTCCATTTGGCAAAACCTGCCCCAGCTG
AACCAAACTTTTGACTTCGGCCTCCAGTTTATCTTTGAGAATATGATTGT
CGTGTGAACACAAGGACAAAAGCTCCAAGAAGTTTCCTCCATTGTTTTCA
TTAGATTCTGTCAACTTTTCTCTTGTTTCGGAATCGCCCCTAAAAGCCAA
TCCTTGCTTTGCGAGGAGCCCAACAGTTTGGAAAAGATACCTCAAATAAG
CTCGCCACTTCACGACTTCCTCAGCATGTTGAGACTGAACATGGCCGAGA
ACCGAGGTATTCTCTTTGATGTGAGGAAATTGATCCACTTTTCCATCGAC
AGTTTGTGTTTTTTATTGTTAGAATGAACTTTCAACGAGGAACTANTTAT
GACTTAATTCATCTATATTTACATACCTATATGATTGGTGGACGGTTGAG
TAAGGTTGCTTTTTTTTGGTCCGCTGAAGCGGACAAAGCGCAATACGGAC
GTACGGCCCTGGTTATGTATACTGCAGCAAAGGAAGTCACACACACTTCC
ATTTCTACTGTCTAGGATCCCTCATCTTCTCCCKCRGTCTCAATCTTCGA
AGCCGTCAACATCTGCAATGTATAAAAAAGTCTCTATCACTTATTTCCAA
GGAAAGGGATTGACATTTTGAACTAATTAATAGTATTAGGGGAAGTTGTG
ATCGCTTTTCGCTTTATTTTGAAAATTACATAGTTAGTATTATCTGATTT
AGATCAAATATGTACGGTTTTATTAGATAACTTTTGTCATTTTGAATGGA
ATAAGTAATCACATGTTGATCCAATACAACGATTCCATTATTTTACCAAC
ATTTTCGATGATTGGCCTACCAATTCGTCTCATCTTCGKCGTCCATATTK
CCTGAACTGAATCGTTGGGACCACCACTTTGCTGTTGCATTCAATACTGT
ATTGGGTTCATAAACAGCAAAAAATTATTTGGTCACTTGCTCTGCCTTTT
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CTTCCATTTTGGAACACTGTAACACATAACTGGCTTCACCATCAAAGACA
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ATTTTTTTTTCAAAAAAATTCCAAAATCCAAGCTCCCTTCAAAAATCACC
CTGCGTACCCCCCTGTTATAGTCATGTAAACTGTAGTGTTCTTTATTCGT
TGATACGTAATTGTTTTCAAAATAGGCAGGAAAAATTTATATGTATAAGC
ATTCATATTCACTCTAACCAACATATACTTTATTTAAAAGCCACAACAAT
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ATATCCATAGATGAAAATAATATTATCTCCCGCTATGTTAAAAAAAGAAA
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TAAAAAAAAAATTCTAAAATCCAAAGCTATTCACAAAAAAATTGAGAAAT
TATGTTTCTGCAGCATAAATTGACCAGTTTTTTGGTAGGAAATAAATCTT
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GAAACAAACACAAAATCCAGTCTGTAATTGGCAATGATATAGACAGGAAT
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CTTACATTAGAAAATATTTTTCATCTTTGTTTCGATTTCTATTTACTTAG
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