EMLSAT00000000901, EMLSAT00000000901-696748 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000901
Unique NameEMLSAT00000000901-696748
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1157supercontigLSalAtl2s1157:23575..45454 -
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000901 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000901EMLSAG00000000901-683667Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000003954EMLSAE00000003954-712882Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003955EMLSAE00000003955-712883Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003956EMLSAE00000003956-712884Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003957EMLSAE00000003957-712885Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000003958EMLSAE00000003958-712886Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto769599auto769599Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000901EMLSAP00000000901Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000901

>EMLSAP00000000901 ID=EMLSAP00000000901|Name=EMLSAP00000000901|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=713bp
MCLIIGIYFLSMSKLNSQRNKRSSNLTNELSSPFTLKEIVEKEFTVSKWN
GSWHSDNEYLYRDRKNSIILYNILTKKKKVLVPGNIMNEYPKVYKFHVSP
DNKYVLLSYQPQKLFRHSFLALYEIYVVSNGQKKKLTPKVNLPTKEAQSR
INEKIVSPLAFVTWSPAGHALAYVFLNNIYYRSSPLSDDIQITISGIPGV
IYNGVADWVYEEEVLSDTRALWFSSDNKRLAWVEFNDSLVDNMPIDLYGP
PGSLNFQYPISSSIKYPKPGRNNPSVNVFVVEVTNNDNQSFTRVPLEPPT
YFIGKERILYAVTWATTTEISLTWENRNQNYSIVSICNVELSTCTDSLVM
TESRGWMELGDPPIFSFSGRKFVMTLSSEGYNHVNVINRDSNQRIPITTG
QMVVIKISHWDEVNKKIYFIGTRTGFPGERHLYSVNDFDAHQPGFVQCIT
CNLFNTKGGRCGYNSFGFSKKYSYYTISCMGPFVPQDYLFKKSPNQLLEV
LEDNEYLSSLLLQKILPKVSNLEIPIANGRYKAKVRLYLPPDFDENKKYP
LLVNVYAGPNSQQVSDRFKLDWGTYLTTNANIIYGLIDGRGSGFQGNNLL
FELYYNLGKVEVEDQLDVTEKLLNQYSFIDKHNIAIWGWSYGDAKINNIF
KCGIAVAPVTNWIYYDTIYTERYMGLPTPFDNLKSYQESDLSTKVANFQN
KKLLIVHGTAGIY
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1157:23575..45454-

Legend: polypeptideexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000901-696748 ID=EMLSAT00000000901-696748|Name=EMLSAT00000000901|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=21880bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1157:23575..45454- (Lepeophtheirus salmonis)
ATGTGCTTGATTATTGGAATTTATTTCTTAAGTATGTCTAAATTAAACAG TCAGCGGAATAAACGGTCATCCAATTTAACAAATGAACTTTCTTCCCCCT TTACACTCAAAGAAATAGTAGAAAAAGAATTTACAGTCTCAAAATGGAAC GGTTCTTGGCATTCAGATAATGAATATTTATACAGAGATAGGAAAAACTC AATCATACTTTATAATATTCTTACAAAGAAGAAGAAAGTTCTTGTTCCTG GAAATATTATGAATGAGTACCCAAAAGTTTATAAATTCCATGTTAGTCCT GATAATAAATATGTTCTTCTTTCCTAYCAGCCACAAAAACTATTTAGACA TAGTTTCTTGGCTCTTTATGAAATATATGTTGTCAGTAATGGTCAAAAAA AAAAATTGACTCCAAAAGTCAATCTTCCAACAAAAGAAGCTCAAAGTAGA ATAAACGAAAAAATTGTAAGTCCATTGGCATTTGTGACTTGGTCTCCGGC AGGTCATGCATTAGCATATGTATTTTTAAATAATATATATTATCGTTCAT CACCACTTTCAGATGATATTCAAATAACTATATCAGGTAAAACTGCTTTT TATGATTATAATAACGATATATGTGTTTAATTTATTATTAGTTATTTTAA CAAACATTTTTACTCAAAGAAATGTGTTTTAGGAATACCAGGAGTCATTT ATAATGGGGTTGCAGACTGGGTATATGAAGAAGAAGTTTTATCTGATACT CGTGCTCTATGGTTTAGTTCAGATAATAAGCGCTTAGCATGGGTCGAATT CAATGATTCTTTAGTAGACAACATGCCAATTGATTTATATGGTCCACCAG GTTCATTAAATTTTCAATATCCTATTTCTTCATCAATAAAGTAAGTAATG TTGTAATTGTTAATGATGTAATCGTTGATATAACGTTTAACTCGGATGAT ATTCAGATATCCGAAACCAGGAAGAAATAACCCTTCTGTGAATGTGTTTG TTGTTGAAGTAACAAATAACGATAATCAGTCTTTCACAAGAGTTCCATTG GAGCCACCAACTTACTTTATTGGCAAAGAACGTATTCTTTATGCTGTAAC CTGGGCAACAACGACTGAAATATCACTTACTTGGGAAAATCGAAATCAAA ATTATTCAATTGTGTCGATATGTAATGTAGAATTATCAACTTGTACAGAC TCCTTAGTAATGACAGAATCTCGAGGTTGGATGGAACTAGGAGATCCCCC AATATTTTCCTTTTCTGGAAGAAAGTTTGTAATGACACTCAGTTCGGAAG GTTATAATCATGTTAATGTAATAAATAGAGATTCGAATCAACGCATACCG ATAACAACAGGCCAAATGGTAGTCATTAAAATTTCACATTGGGATGAAGT GAATAAAAAAATATATTTTATTGGAACTAGAACTGGATTTCCGGGTGAAA GACATTTATATTCTGTTAACGATTTTGATGCCCATCAACCTGGATTCGTT CAATGTATTACATGTAATTTATTCAACACTAAAGGTGGAAGGTGTGGCTA CAATTCATTTGGTTTTTCTAAAAAATATAGTTATTACACTATTTCATGTA TGGGGCCTTTTGTACCTCAAGATTATTTATTTAAAAAAAGTCCAAATCAG TTGTTAGGTATGTTTAAAATTGACAAATTTAATGTATATTTTGATTGTTA TTTATTTTATTCTGGTAGAAGTATTAGAAGATAATGAATACCTTTCTTCT CTACTGTTACAAAAAATACTACCAAAAGTATCAAATTTGGAAATTCCGAT AGCTAATGGAAGGTATAAGGCTAAAGTACGTCTTTATTTGCCACCGGACT TTGATGAAAATAAAAAGTACCCACTTTTGGTTAATGTTTATGCAGGACCA AATTCCCAGCAAGTTAGCGATAGATTTAAACTAGACTGGGGGACCTATTT AACAACAAATGCTAATATAATATATGGATTGATTGATGGTCGTGGATCAG GTTTTCAAGGGAACAACTTATTATTTGAATTATATTATAACTTGGGTAAA GTGGAGGTCGAAGATCAACTAGACGTCACAGAAAAATTGTTAAATCAATA TTCCTTCATAGATAAGCACAATATTGCTATTTGGGGGTGGTCTTATGGAG GTAAGCTCATTAAGAAAATTTATAATATATGTATNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNTATTGTACCAATGTATTTTCGGTGGGAGAAATTGAAAACAAT AGTTCCAAATTTCTAGATCTCTTAAATCACTTTTAGTAAGGTTACTGGTT TAAAAATGAAAATGACATACTTTTTGGTTCAAAATTGATTAGATTTTTAT CCCATGGACTATGGTGATAGGTGGATTAAATTTCTCTAAGAAAGCAAAAA CCAAAATTGATCTCACTTTTTCACTACTGGTTAGGTTATTATTATTTTTT TTTTGGAGATATATTGGATTATAGTAATTCGGAACTAAAATTGCACGGAT TCATTTTCCACCTCAAACAAAACCAGGAAATTAATAATTAGATGTTAAAG TGATTTCATCTTTTTTACAATACCTGTATCTTGTTCATAACTCAATATAT TCCTTTTTTAGGGTAAAAATGAGAAAAACAATGTTTTTTTTAGACGCTTA TTCATCATTTATAGTAATGAGAAATATCATAAATTATATAGCAAATAAAT ATTTCATCTTTTATTTAAAAAATKCCTATTTCATAAATACGCATCTTTTC TGTTTTTTTTTCGATTTTATATTATCATAWTAGCCAATAAAAACATTATA TTAATATCATTTACAATTTCAGTGTCTCATAATGACGTCACACCGTTGTA GTAAATAAATATAGTATACCACTTTATTTGAAATATATATTTTTGCATCT ACAATAATTCCATCCCTAACTTCTTTTTTAACATACAGACAGGGCAAATG ATTTATAACTCTAGTAATGTACCAGATTACACATTAATATTTTTACTTTC TTCATCGAAATAAATCTTATCTCGACAAATTGAACATATCGAAAGCGGGG CTTCATGAATGAGAGAGCGCTTATTGATTTAAAAAATGAGCAGGATGCAC ACACGTTTTGAAATCATTCTTTCATTCATTAAAATTGTAAGAAAGATGTC TTTTCTAAAAAAGAGGACGTTTTTGCGTCACTTACATTAATGAAATCGAT TGCCTTCTTAAGTATAAAACAATTGTATCCCTTGCCCTCTTATGACAAGA TTCAATCCGTAAGGTTGCCTTTTCCTGAGCTGGCTATAGACAGATTGTTG CAGATGGTATAGAGAGATAACAAACTTATTTTGTTTATACAAATGTAAAT GATTATTATTTCAGGGTATAAATAAGGGAGCAAAATAAGGAAGCTACAAT AATTTTAGTACTTTATCTGAAAGCAGCTTTGTTTGTCCTTTTTAAACACT TTGCTACGTTAATAAAGTTACATTCTCTTCAAAATTATTATTTGTTGTAT TTCATATTGTAAACATATTTTATAGATGTGTTCTTTTTGAGAATTAAGAA TGAATGATAATGGCTTTTAAAAAAAATTCCAAAATTAGTATAGCTTCCCA ACTGGCAAGATTTTGGAGTAATCAACTCACGCCAAGAGGCTATTTTTTAC ATCTTTATTCATATGAAACAGATGGAAACAAAAAATATTATCTTATTTTT TCTTTAACAGAAATATAGATTATATTATTGTAAAATGTGTGTTTGNTTGT ACCAGAGTAGCCACTAGTGCACCTCTAACGTGTCAAAACCTGACTTAAAG AATATCTGAATGTCATTGCAATTCTAAAATTTATTCAGTGGGGAATCTTC TTCTAAATAACTGAATTGGTTGACACTATATTAGAATATTACAGTAATAA AAATCTAGGATATCCACACAAATTAATTAATTACTTATAATAAATAAATG TTTCCATAATAGTTTATTAATATAAGCAGTTTAATTGATTAAAATTGTTA ATGTGTAACAAAATAATGATGCAATTGTTTCAGCATTGATTAAACAAATG ATTAATTAATAAATTATAGCATTAGACTCCTTATTTAGAAGTTATCCGTT ATCCTATTTTATTTTTGTCTTATGGATAACTTGGACTTTATTTTAAAAAG ATAGCTAATAAAAAAGTATCAATTCTGCTGCTAAAGGTGAAGGATATTTC AATGTGTGACACACTTCTATGGTTTTTATTGAGTCTCATTTTAACTCCAA TCCCTTATKCTCCTCTGTCCGATACGAGTTGGAATTTTACCGATTCCAAT TAATAATGTACCGAGCTAATGAAAAATCGATGTTTAAAAAAGTAGTATGA GGAGTAAATTGATTCTATATATTATATCCTTAATTTATAATATTACAGAG CAGATGGATTGGTAAAGGATTTGTAATTTTATTATTCATAAGGATGGGAA TAATGTCAACAGTTCAGTGAGCATAATTTAAACATATATAATTTCTTTTA TTTTAACATTCTAACGTATCACCAAACAAGGAGCAGAATAATTTATAGTG ATATTTGTCAGCAAATATGCATAAATATTTATTAGATAAAAAAATATTCT TTTACTGGACAGCTTTTAAATAAATTTTAATACAATCCATTAAGTTTTAC TTATAATATTCTACAAGGAATAAAATAATATATGCAAATAATAATTAATA AACGTATGAGAGTCTTCTTCCATAATTAATTTACTCTCATATTCATAATC AGGCTATATTGCAATTTATATTTATAAAAACATAGAAAAAGAAACGCAAA TTGGAGTGTATTAATTAAGTCTAGTAATTTGGTATTGGGGAAAACTCTCA GATGAGTTCCAGCGAGAGGTTGCAAGCTCTGAGTTCCAGAGAAGTGAATG ATGTAAATATAGTAGAATAGTTATATTGTTGAAAACGAATTCTAAGATTC CTGAATTAGAGTTAAGAGTCGTCTGATTGACTATAATATTAAAGGAAAAT TACCTTTTAAATAGCTACAGAAAGACAAATAGTCGAATAAGATCATTTCC TTTCAAAGACTTCCCTCCATTAACGTCATAGATAATGCAGCACTGACTTC AAAAGAAGGGAAGGAGTATTTTATGAAACTTTATGCTTGTTAGTTGTACA AAATGTGCCTGGATATGATATTGCACTTTTTGTAAATAATGGGGAAGAAA ATAATCATCCTTACNTGCTCTACTGAGACGAGTGGGTGTGAACGAGTAAG CACAATTCTAAAAGCTAATATTACTCCGGGAGAAATATAAAAAATCATCG ATGATTTTTTTTTTTAATTWKCCAGGATGAGGCAATTTTAAAAACATTCA AAGTCTTCTATTTTTCCATTACACATAGTCGGTAAATTATAGACTCATTA CACATAAATGAATGAATAAGAACGGTATCAGTATTTGCATGCTGTGTGAG GAGAAAGAGGAAGAGGATATTCATTTATTCTGGAAGTATTCTTATTCACT AAATGGAAGAATGAGACTTACACAATATCTAAGAATTATTGAGGAGGGGA ATACAAACAACAAAAAGTTCACATGGTGCTTTCAAAGATGTCCTGACTAG AAATATTGACGGTTGCAAATTCTGGCTTGGAAAACGGGAGAGCCGTGAAC CATCCTGAGTATGAAACACTCAACTAAATAATGCAGATAATTCTTTATCA 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ATTAACTACTTCTTGTGCTCTTCTGGTTGTTGCCAAATCTTCATCAAGGC TGTTTAAATATTCTCTGAAGACGTCGAAGTGATAGTAGTAGTACTCCACT GCTTTTAACCAAGTTCTTTATCTTGTTATAATTGGTGATGGAGGGAGGGA AATTTCGTACGAAGCAGTTAATACTCTCTTTCTTCTTCCAGAATTCAAAA ACATCTTCTTCACATTGGAAATAAGTTCGTTCCTTAGAGGAAACTTTTGT TGAACCATATCTGGAACTCTATGTAATCTATGAGCAATACATGTAATGTG AATCAATTCCGAGATTATTTTTTTTCGAAGATCTTCTCCTGCTTTGAGAC AATACGAGGCGGCATCAGTTCTCCTAATAACTTATAAACTGAGCTTATGA CGATGTTCTTTACATTTTTTGCGTTTGCAATCTCAATCAACTCAATAAGG TAAGGTCTCACACAAAAAATGTCTGTCCAAAGGGCCAATCAAAATTGCCA TCATTGACCTCCCTTGATTATCTCTTGTCTCATGTAGTGCAACGAAAATA TATTTTTCTTCCACTTCTTCTTTTATTCTATTCAAAACTCCATGACATAC TTCCCCATGGAGTTGTTAACGACCCATTGACCTGGAGAAGCTTTTCCAGT ATATTTTTTCAATAAACTTGGAGAAATTGGGATGATCCAGAACATTTAAA GGGATGTTGCACGACACAAATAACTTTGCTACGTCAAAATTGAATGATGA ACCGCTTAATTCTCCTTCGTCTCCTTGAGTCTTGTGTTTTCTTGAATACT TTTAACTCGTTGATATGATGGGATGTTTTGGAGTGGCGGATTACTTGCCA TAAAGAACGAGATGGGCACAAGAAACCGCAAAAANNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NAATAAATCGGTCTTTCAGTCCTACTATCATAGCTATCTTTTTATTTAGT TACTGGTAACTACGTTATATCAGCTCTTTTAGTCTTCATAAAAGACCGAT AAGGACCAGTCTCCGGTCTGAGGAATTTTATTAGGATTGAACTTTTAGGA CTGCAATTTTTTTAGACCGATCCAACACAAACTACCATCCATTTTACTAA AAATATAATTTTTTTGGAATGTTTGCCCTTTTACATTGAAAAACGTTTTT TCAAATAAGTTCTAGTTTTATGCTATACGTAAAGCTTAAAACAAAGTTTC AAAATGAAGACCTCCTTGTTGTATGCAACATTTTTATTGTGCTAGACTTA GTTAAAGCTTTAAAGTATAGTGGCGAAACGAATACTATGCAATCAATAGT 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