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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s115 | supercontig | LSalAtl2s115:264718..282092 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000912 >EMLSAP00000000912 ID=EMLSAP00000000912|Name=EMLSAP00000000912|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=1021bp
MSNSRGLENVLQQIQESTQNQMHLESTQNQISSRLKTVRVDPLKELQQDE LDEVANLQSQLREIDKKIELENVNYEELMLELAMLKKTGQQSSFQTVLQP TQSNHQTVSVEIHQQDKDTRLNGKLDGYPSDLNLINDGNYGFITTSADEN SLVSTALNSPQIPKYLIDHHHPSQNYGTGSFNRFGTSNIISANHPTLPTT VSLHGLSQNLPANHFLDNYYDTEKLSLKSPHVVYNTTTTTNTTTSDFSAD KINADVLAMAYNTGISDPFMFQNFNAPQSISEPTVDMLEIPGKGRCYVYN ARYNYDPFQQSLNENPEHELYLFGGDYVLVWGDIDEDGFLEGELLDGRKG LVPSNFVEKLVGEDLLEFHESVILGLNDPTMEDVYETTVPQDLPLDFGGG NTTTSPEIDMSWQRPCKLLIVFVDNNTLIFFLTKMIVEEDNHLLNATYLS PEVEVNCHIDDFTMKGDIDVVTNESPTREENAGGTIPAPRQLTLERQLNK SILIGWTAPDCPNGVIEMYHVYVDGFLRTTVRAMDKTRALVEGVDSARPH RISVRSVTVNRRTSKDAACTMIIGKDAPLGPSCVKASNITSTSSVISWLP SNSNFQHTVCINSVEVRTVRPGVYKHTITGLTPNTTYRVTVRAKNIKASP YVDEKSLVRLLEKLSAHTEFRTLAKGLPDPPMDVRFITVRSKSRDLLSND STAVPIQQKTGKKGQRITDIRGGRYTQGGVRTMGRTGRGRFRGVRDATGQ LVIEHDEDNLSDKELYARNIPAIEITKDSASEFDQYSDEDYDRERRFHGR HHHGNMRRRRQHGHKESSRIFVALFDYDPPTMSPNPEACDEELPFREGQL IKIIGEKDADGFYWGECGNKSGYVPCNMVSEVQVDDEKVAQELLKDDMSR GRGGRYSNRDRWGDIYANTPVRKMIALYDYDPQELSPNVDSEVELSFYTG DVIYVYGEMDDDGFYLAELKGQRGLVPSNFLTDAPITEYDRGKRIGPGAS GPPPPPRGPTKKELHCLLELV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s115:264718..282092+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000912-696759 ID=EMLSAT00000000912-696759|Name=EMLSAT00000000912|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=17375bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s115:264718..282092+ (Lepeophtheirus salmonis) TATATATAATAAATTCAAAATTACGATTTATTTCGAAAAGAAATGTCCAA
TTCTCGTGGATTAGAAAATGTTTTACAAGTGAGTGATGCAGATTGGTCGG
GGAATCCGGAATAAGTACAATTATTCTTTATATAAAGAATGACCGGTTAT
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GAGATTCTAGCAATATGATAATTCTGAAAAAGTGGAAAAGCCATGGTTGC
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TATCCCTTTTCATAAAAATATAAGCCATTGGGTTGATATAAGGTTTTCGA
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TTCTTCTTTAGTATATATGTAAAGTCATTTATTATTTTATTGTATGTTCT
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TTTGCATCGTATTGTATGAGCCTTTCATCAATTAAATCCCCCTCAAAGAA
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TTTTGCTTACATTTTTTCTCTTTCTTTTCTTCGAAATGACTTTCAAACCA
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TGGTATCCACAGCCTTAAATAGCCCACAAATCCCTAAATATTTGATTGAT
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TACATCTAATATAATTTCAGCTAATCATCCAACCTTGCCTACAACTGTCT
CCCTCCATGGACTCTCTCAAAATTTACCAGCAAATCATTTTTTAGATAAT
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TGTATCTCAATTTGTTTAAAAAGATTTGGTCAATTTCGCACTTGACCTTG
ACCTCTTCAAATGTAATGGCCGACTGCGGTAGGCATATATAATCTTCCTA
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TCTTAGCAATGGCATACAATACTGGGATATCGGATCCTTTTATGTTTCAA
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ACATTGATGAAGATGGATTTTTAGAAGGAGAGCTACTTGATGGTCGAAAG
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AAAAGTATTTTAATTGGTTGGACAGCACCTGATTGTCCAAATGGAGTTAT
TGAGATGTATCATGTCTATGTTGATGGGTTTTTACGTACAACTGTTCGAG
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GGTGCAAATTTGGACCTTAATAATTAAAAGTTTATTTCTGATCAAATTTA
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GGTCTTGTGCCATCAAATTTCCTAACGGATGCTCCAATAACAGAGTACGA
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TTTGATTGCAATTATTAACACAGCAATTCCTTTTGCTTTAAGTACGTTGA
TGAAACTATAAAGATAGAAAGTCATCAATTGATTGGTGAATGGTGGTCTA
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TACTACGGCATAAAGGACTGTTCAAACGTTAAAAAATTATAGCGTACATA
CAAACATACATATATTGATTAAGACATCGGAGTATATTACTTAAACTTTT
TCCATACATTATTTGTTTGATTTTTTTGTTTCGTTTTTATTTCTAAACAA
CTACATGATTTGTTCTAGAATCCATACGTACTGCTTGGAATGCTGTGGGA
CGTTTTATGATGCTATCTGGAAAAACATAACGTGCGTAACTATGCTAAAA
GAGAATTGTATTTTCATTTTTGTCATCAGCAGTTCAAGATATGAAATTTA
GGCTAATACTTTCACCATGAAAATTTTGAAAAAAATTTAATAGTTGAAGA
TTCAATTATAGTTAAAGATATAGATTTTTGGAGTCCTTGAAGAATAAAAA
TAAGTATGAAAATGGGTAACAAATTAAAAACTTTGATAAATGGGTGACAT
TCATCTTATATTGATATTTTTAGGACCATTTTTTTTAGATTGGAGTTATT
CTTATTAAATTAAGTCGTCTTTATACTTGGGTATTAGGACCTTGCATTAT
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GAAAACAAAGGATTTTTTTATTTTCACAATGATAAGTACATTTTGCACTT
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ATGCTGGAACTTATATATTTTATAATATATCACAAGAATATACTTTTTAA
GGACTTACTATATTGTGATTATCTTCAACTTAAAGCTACAACATATTCCT
TTCTTTCAAAAATGGGAGTTTTCGTGATGACAAAAGTTTTGTTTTTTATA
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TGGGGCGGTTCGAATAATTTTATGGTTGATCCTTACTGTATTTTACATGT
AATTATATTTTTCTGTATGGAATTCTTCAGTTTTTATAAAATTATAGGAT
GATTCCATACCAGATCTGGAGTGATTGCAGTATAATTGATAAATAACTAT
ATTTTTGATTGTTTTTGTGTTCTTTTAATTGGTCGGATGGAGTTGCACTG
ATTAAGTATACTTCTTTGAAGTCCATATACATAATGTATATATTTAATGC
TCTAGGAGCAAACATAAGCACATTGATTTCAAGAGAATAATTTCTCGTTT
CATTTCATTGTTTTAGTCAACAAACTTTTGGCCTAAAAAAATATCACTTG
TTTTGATCAGTGTAAACTCTATGTAATTGATCTCTATGGTTGAAGTTCAG
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CATTATTTCGCTAAAAGTAAATCCGCTAATGGTTCGGCTGTTCTGCTAAT
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AATCCACTAATTAAATTATTCTATACAAAGGTCAGTAAAAATGAATCGCT
GATTACCGAGGAAACAGATCAGAGGTTCCCAACAAGGGAGGAATATTCAG
GGGGGAACATAGTTGTACCTTGTTAATGACCTAAGACTGTTAAATGGCTA
GCAAAACCCCTAAGTGGATTTTCTGTATTCTTCATTATAATTTGTATGTA
AAGTCCTTCAGACTTCTTCCTCACTTGACCTCGTATAAGTGGCGCTAATA
GTCTGACATGACAGAGGCAACGGATTTATAAATCTATTTATTTGAAAGTT
GGGTTTATAGTGAGCCCATTAATGACGAGATTTTTTTTCGTTCAGATATC
GGTAAAATTTTTATCATATTAAAAATGGATTTAGATTATTTATTAAATTT
TTCCTCTTTTAATTATGTGAACTGGTTATCGAGAACCTCACCGTGTTCAT
ATGATCCCACTAGGCATTTTAAGGTACAAAAATTTATTCTTCATCTATTA
ATTCTTTTTAGTCATAGTGGTACAATAAAAATTTATTTTTGGTGAAATGG
AAGGAATCATTTTATACAAAGGCCCACATAACATTTTGAACATTCTGTTC
GGATTGTTTTTTTGTTTTTTAAAAAAAAATTGTCCTTTGATTCCTTGTCC
GACTAGTTCCTTGAAAAAGATGGCCAATATTGTCAAATCTAAAATCATTT
TATCTTGGTACAGATGTAAATTTTCTCCCATATCTTTTTGCATGACAATT
ATATCTTCTTAAGTAACTTATTGCAACAGATCTACAAAATTGGTCCTGTT
TTCCTTCCTATTATCTATGGATCTTTAATGAAGACGTCCATGATCCAAGT
GAAAGAACTCCATCACCATTTCTTTCATCTAACTCCACTTCTATAATTAT
TAACATTTTGATCCATTCTATCTATTTCTTGACTTGTTATACTCTTTGAT
TCCCGATAGCACCTCCATTTCCATAAATTTATTTTTCTGTTTTGACCATC
TCTTTCTTCACTTTAAGGTTAGCATACTAGCCAAAAGCAGTTGAAGCAAC
AGTTACGATAGAGTTATGCTTCCGATGACTAATTTTCACTTTCAAATCTT
TCGATATTCCTGCAGCACATTCCGAATACCCTCTTTCTTTATTTCCAAAT
AATTTTGTAGAGGATATTGGGCATTTTTGTCAATTCTTTGATATAATGAT
ACCAGTTCCACCATAGCTTCGTTTTTAAGCTCTTCCAATAAAGGAATTGT
TGTAAAAATGTTGTCGGCCAAGAGATAATTAGGTAGATTTTTTTCCATCT
GTGTAGGTATTTAAAAGTTGAAGAACGGTTCCAGCACATTTGGCTTATTT
ATTTTCAAAATCCCCATCTCCAGTGTCAGATTTTCCTTGGTAAGGATCAA
ATGCAATTAAATATCCAGGAACTGTGCTTTGTCACTAAACTTTGTACCCA
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ATATTCTAACACAGCCTCATCATGAGATATTAGATTTTCAGGAAGGAAAT
GTTCGATGGATATTTTCTTGAAGATGCTTGATAAGAGCCCGCAATTTATG
ATATTTTTCGTTCTTATTTGAATTTTGGGAGAATTAAAATGCAGGCTTCT
CATAATCTGTTCCTGCGCACAGAGTTGATTATGGCTTTATTTTGAACGTC
AGGGTCCTTGGAGCAATAAAACCTTTTACGATGTAACTCATTATATACAG
AAACAATTAAAATTCTAATAAAAAAACTCAATTCTTCTTTTGATGCTTTT
ACATCATTCCAATTTCTAAAAAGACAATATTTGCTGATTTCTCTGGAAAT
ATCCATTCCAGAATAGGTTCATCAATAAAAAGTTCGAAAAGCTCAGTATT
TGAAAATTTACTATAGCTAGAATAATCTCGTTGTAAAAGTTATTTTGGTA
AAATTTTCTCATAATTCATGGACCATTTAACTTAATTTGATTTACTTTTT
TCCTTGGTATCAAATCATTTTGGATTTTCTTTTCCGTAAGCGATATTAGT
CTAATAAAAAAGAAGTTGGTTTCTTTTGAGAAGCTTGAGGGACCCAATTC
CGTTCTTTCTTCCTCGTTTCCGAAATATTGTCTTCATCAGATGGTTCAAT
AAATATATCATATTGACCATCATGATCGTCTTGTTAAATTTCAAGAATTT
TCTTCACAGTAAGACTTGTATTCCTCCATAAATGAAATATATTTAATCAT
ATATGCCTAGTGTGTTCATATGAACACGCTAAATGGAAATAAAAAATTCA
AGAATAATTAATTAATTTTACTCAAGTGTTTAATTACATAATGAAGTACA
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ATTTGCAAATAGAATCAATTACCTTCCACAAGAATTCATGGGAAGTTTTT
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TAAAGTTTTATTAAGAATGATCTTGATAATACGAATTAATATTAATTTAA
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TCCAAAGACCAGTAATTCTCTAAGTAAGTAAGGAGTAATGATGGTATTAT
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