EMLSAT00000000928, EMLSAT00000000928-696775 (mRNA) Lepeophtheirus salmonis

Overview
NameEMLSAT00000000928
Unique NameEMLSAT00000000928-696775
TypemRNA
OrganismLepeophtheirus salmonis (salmon louse)
Associated RNAi Experiments

Nothing found

Alignments
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
LSalAtl2s1161supercontigLSalAtl2s1161:36952..70550 +
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis NameDate Performed
ensembl2013-09-26 .965016
Properties
Property NameValue
Logic nameensemblgenomes
Biotypeprotein_coding
EvidenceIEA
Cross References
External references for this mRNA
DatabaseAccession
Ensembl Metazoa (transcript)EMLSAT00000000928 (primary cross-reference)
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAG00000000928EMLSAG00000000928-683694Lepeophtheirus salmonisgene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
EMLSAE00000004064EMLSAE00000004064-712992Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004065EMLSAE00000004065-712993Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004066EMLSAE00000004066-712994Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004067EMLSAE00000004067-712995Lepeophtheirus salmonisexon
EMLSAE00000004068EMLSAE00000004068-712996Lepeophtheirus salmonisexon


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameSpeciesType
polypeptide-auto770169auto770169Lepeophtheirus salmonispolypeptide
EMLSAP00000000928EMLSAP00000000928Lepeophtheirus salmonispolypeptide


Sequences
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of EMLSAP00000000928

>EMLSAP00000000928 ID=EMLSAP00000000928|Name=EMLSAP00000000928|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=441bp
MEKLRRRNAPSLLEWSRSLRFTLSDPNFSVCPVSITWDNPGSSRNASSLL
YLKGLARKLGLKFMALRGGAVYLSTEAFYLEIKDNGEEILHILNPESIEI
LPRGGDLVAHLKGLMELKPSNWKGLSTLQDELKSILGDDLIPRVGGTPAQ
IRLFDNYTALSILPQNNHFVLRIRDPFPLAEEKLTELEKICGFNLFELVG
PRGGYLMDLIVPDSPLFMVDSLNEKGFQDVVCYPGANIKVCASNKLATNS
SQLGFSSCLESLSSRKNNLFDERILKPCVSITPVSNTSTILQVQNTKKIG
IEIIPLGSGVNSSITSKKLLNKTYRDIKRSLSEDDKRSRSLKKGKNVDIR
LHLPSINHPHLVQRIKIVHFLVLTQAKRLLNCKTNRLILSGKQSNIKVLI
KIYWLLETVLLSLYYVILLNFLRNATKIKKNKRRKTRLKGS
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mRNA from alignment at LSalAtl2s1161:36952..70550+

Legend: exonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>EMLSAT00000000928-696775 ID=EMLSAT00000000928-696775|Name=EMLSAT00000000928|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=33599bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1161:36952..70550+ (Lepeophtheirus salmonis)
GAAAAATCCTAGAATAAAAGAATAACTTCTTTCCGCAGAGGAATTTGGGC GTATTAGGCGTGTCAGAGGTATTTCATCTCAATCATCTCTCTTTATTAGA GTCCAACCCACTACTACCCTCCTGAGAATATATCTTGTTAGTTTGCTGAT GGCTGTTTTGGCAAAGTAGAATTGCTTAAGAATACCAAAGTTAACAGCTG AAGGCACTGGAACAATATTTTACCTCGATATTTCTTTTTTTATACATTAA AATTTTCTTACTTAGTGATTTTCTGATCTACTCTCAAGTTTTAAATTATA AGTGAATTCCGAGGTTTCCTGAAATTGGATCAGCCTCCTATTTGTGAAGC CTAATATGGAGAAGCTCCGTCGTAGGAACGCCCCATCATTACTAGAATGG AGTAGAAGTCTTCGATTTACTTTAAGTGATCCGAATTTTAGCGTTTGTCC TGTTTCAATTACGTGGGATAATCCTGGATCATCTCGGAATGCCTCTTCGC TTCTATATCTTAAGGTAAACGATTATTAAATGCATTTCTGTACAGTGTGC AAACATGTCGTTAACAAGGTTTAGAGCTTTAACCTAGAACTGCTTTGGCT TGAATCCTCAGAGTTGCTCTCCGGACTACAAACTCATTACATCTCTTTTA CCCATTTTCATATAATTCAAATCATTTCACTATTAAATTTGAAAAGTAAT ACTACAAAATATAATTAAATACAGAGGCGTCGTTTTATTTTTTTGATATA TTTGAATACATTTTTTCGTATGTAAGCCATATAATTTTCTAATTTATATA TATAAATATTTTCAATTTATGTTTGATCGAAAATAATGGTAATTATACTA TTTTCAAATTTATATTCATCCTTTATTTAAATTTAAGTGAACTTTAGTGT ATACTTTTAATATAAACTTTAAATTGATTAATAAGAAAGATTCTTGCTTC TTCTAATTACTTTTTTATATAATTTTAAAAGGATATCTTATTACAGCATG TTTTGTCTCTCTCCATAAAGGTTAATCCCGATTGAGCTAATTATTTATCA AAAATTGAATATTTAATGAATTGATTTTGCGGTTTGTTCACTACAAGCCT CTGCCAATCAAGGCTAGGTTAAATAGTACAAGCAAGAGGTGTTTTAATAT AACAGGTCAGTAATCTCGGTTTTGTTAGGGATGGGCGGCTTGGATTGACT ATGTATCATTCACTATTAATATAACGATAAATACTATTACGAATATTTAT TGATGTCATAGTCAAGCCTAAATTTGTGTTAATTATTATAATCTTCTCAA AAGTGCGCAATAATATATTCCTTATTATTTTATGTACCAAAGGCTTCATG CATTAACTTAAATATAATTATATTAGTTAAATATAAAAATTGGACTAATA TATTTCTATCAATCTCCATCACTTTATCTGCATTTTCAAACAGATTCTCT GCAAGCATAGCATTAAAAAATATTAGCATATTAGCCCTCACCAACTATAT ACATATTTTGTTGAAAACTTGCTCAACAATATTGTAAGAAAATTTTGAAA TTGCACCTTAGGATAAATGCCGGGGCTTATTTCTTGCTTACAGTCACTTG CATATGGTCAGATCCTGTCTCTTTTACTTTTTTAAATCTTGGGGTTGTAA AGCTGAGATATATTAGAAGAAGCAAAAATCCCCTTCTACCCTATACTTTC ATTTATTTTGTCAGATTGTATTTTTATGTTTTTGAAATGGTTTTTATTTT AGGTATATATTGCAATTGCACTGTATAGATCAACCATAATTATTTATTAT TGAATAACTATATGTTAATAGTTTAGCATTTTCATAATTAATCAATTTTA TAATATTTGTTACACAGGATAATCTATTCTTATGATTCAAATAAAGGATT CATTGTCAAAAATTTGTGTTCACTTCATTAATCATATACCTTCTTCAGGA TATGTGTGTGTATTTGAATTTTATTTGTTTAACGCTATACTTCTAATACA AAAATGGGAAGAAATCCTCTTCGTGGAAATTTACAAATTTTAATTTGTTT CCTTTTTCTTAATTAGAGACAACAGCTTTTGTATGATTGGGAGGAGAGAG ATCTGGGCTCAAACAGAAATGTTTGTATGTTTAAACCTTTATATTTCAAC GTTCCTATTTCGGGACATGGTTTTCTAAGACGATAGATAAATCGAAAGAA TAAAACATATACATAATACTGCTTCTTGAATAGTGCCGTAGATAATGTTG AAAATAATGTTTTTGATGTTATCGATTATTTTTCTTTAATCGAGGAAATA TGTATTCTTGAAATATATGAAAAGGGGAAAGAAATTATATTTATTTTGTT AACTCAATAGGTAATTTCCATCCATTTATTTCTGTGACCTTGAAGAATAT ATGTATAACACTAAACAAATTATATATTTTAAGATTTGTAATATCAGCTG TATTTAAAAAAATCTTTGTTGAGAGAATTTGTGTCAAGATTTTGAACTCA AAATAAGTGGTAATACTTTACCTAAATTTAAATGATAATAAAGTTTTCAT GTAAAACAGCTTACAATTCTTACATATTGTGTTTAATTTTTAAATTATTA ATATGATATTTAAAATTCCATAATGTTATAATATTCTTTGTAGTGGCCAT TAGAAGTAAAACAATTTCTCATCTGACGGCTTTATTGTTTAACAAGTATA TGCTTATGTCTATGTCTAGATTCTAGCCCATACACAGAATGAGATGCTTC ACTTGTCATTTTGACTGCCCTTTCAACAGACTTAGAATGTGTGGCAGGMA CGGMAGTTTAAGTATTAAGAGAGCCTCTCTAATTTATTTWTCCGTCAAAC 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ATGTTGATACGATGGATTGGTATGTGGGAACAAATCGAGTAAGAATGCTT CTTAAAAATGGTGCTGACAAATATTTTCCTATTTGGTGTCATCGACAGGC AATAAAGCTTATCAATTAATGAAACTAAAATCAATAAAAATGATACCATA AATGAAATAATTAATTAAATGAATTTATAGAAATATTAGTCATCTATTAT TGCAAATGTAAAGGAACACCAAATTTGCAAGACAAACATCTACCATCAAA AAGACTGGCCTTTCCAGATTTGACAGAAAATATTACTAGATAGTCACACA CAGAAAGCAAAAGTTAGAAAAGAATGCAAAGGGAAAACTCCTTTTATTTG TGTTAAATATGAAGTTGGTCTGCATCAAAAATGCTTTAATAATATTAGAT TCAATAGAAAAATAAAATAAAAAACTTATATAAATTGGTTTTAATATTTG GTGTATTTAGTTTATGTATACATATATCTATATATGAAAGTGTAGTTTGT AATACACTACCGAAAGTTTAAGCATAAGGTAAGAAAATACATTTTTCACT TTAGTAGTGTGATTTTTTTATGTCTGTACGGCCGATTCGTAGATATATCT ACGTGCTAATATTTTGGGAAGTGATTCAATTTTGCTCAAAATTTAGCATA AAATATTTAGGAATATTAAAAAAAGTAGTCAAATTTTCGTTAATCTCGGA CCATTTTTTAACTTTCGCCCTTAGGTTAAGCAAGAGCCTTAAACTTTGGG CTCTCAAAAGTTTTTTCAATTCTATAATAGTCTAGCTCTTTTATGAATAA TTTAAAGTTGAGATCAATGGTTGTCTAAGTGAGCCTATTCTTCTCAAGAG AAGCTGTAGGCAAGGATGTTCCTAAGCACCTTTTTATTTTTTGCCGAAAT TGAATAATTATATAAGTCTGCGAAGGAGATAAAAGGGCTTTGGAATTTTC TTAAGTAATTCTAAACATTTACTTGATAGTTATGCGGATGATTCAACAAT ATTTGTCGAAGCTAACTCTGAACGTCAGTTGTAAGAAGAATAGAATTGAT TCTGAAGTCTTATAAAAAATATTCCCACACATCTGGAAAACTTTGGATTC AAACCGTACATAGCCAAAATTAGGAACCTTCAAAATATTCTGCCTTTAAT GAACTTCATTTTATCTCCTCTGATTATTAAATTTAATCTGAGGACATTTT TTGCCGTAAAGATCCTAACATAGTCCGAAAAATATTGATAAAAGATGTAA TTCCATCCCAATTTCGAAATCTTCTTCTTTATTACTATAAATCAATTCCA ACACTTAGATCCGTAGCTTATCTTTCTTCATCTCTGGTCCTTAAGCATAT ATATATATATATTTTTAAATTGCATTACGAGCTTTTAGATCATTCAAACA ATATATTCTTTATAATGACTTAACATGAAGCTGGATCGACCTCGTTTAGC CAAAGAAATAAATGAAAGTTTTAATGAAATGAATATTTTATAAGCTTACA TTTGTGGATGTAACTGAGATTTAGTATGAAAGTCGATTCTAAATTGTCGA TTCAAATTTGGTAAGGGATTTAACAATTTAGAGTACTTTTGCTCTTTAGT ATTTAAGATTTTTTTATTTTAGGTACAAATTTCACTTTATTTCACAAAAA ATTTTACATTTCACTGCCTATGAAATATTATTACCAACAATTATATTCAA AAGTCTTACGTATTACTGAATATACAATTCCTTATTGTGTTTTTTAATTT TATATTGAATGATTCAAATTTCATTGAAGATATTGATCATGCAAAAATAT CTTCAATTATCACAGTTAAAAATTAAATGTAAATTTGTTTACTTATGAAA GTGATTAAAAACGGGAGACGCTTTTCGATCAAATTGATAAGGGAGGACTT ACTTGTCCATCTGATGTGATATTTTTAATTTGCACTTTTACGTTTGAATA CTTTTGGAAATCAAAAAGAATAATTAAATTTTAAAAGACATCCTTCAAAA TATTGTAACAAAAATGTTATACATTTTTTTATGAAAATTATAGAAGACGT TATGTTTTTGACATTCTGGAATCATCCCTTTCACCATTAAATACCTGTTA TTAGAAGTAAAATATTTATTTGAATGGCCCAAAATTATAACCCAGAGGTT AATTTTAATACACCTAAACATAAAAATGTCACAGATAAATTAAATTGAAG AAATAAAATAGGAAATAAACAATTGATGGTCTTATTAAAAAGTGAATTCT AACCCATTAATCAATAAAAAGTCTTAAAATAGGAAGGAAGTCATTGAGGA TAATGCTATTCGCTGACGACGTCTCTGCATTTATTGCTCGTTAACGGAAC GAAGTAAAAACTACTTTACGAGAAATAGAAAGTCCAATTCCGAAAGGAAT CTGGATTAAATGTCAACTTATGAAAGACTGAAGTACTTATATCTATGGAA AATGTACTTATCGAGGAGTTTCCTTCATATTCATACGTTGACTCTACATC ACTTTTGGGTATTATAGTTYCCTGCCATAGCGAGAAAGAAGCATTACACG AAACGGGGATAAAATGTTAACCCTAATTACCAAAGCAGTCGAGGGGTTAG TCCCATTTAGGATAAACAAACTTAATAAAATGTTCATATGGAACCAAAAA AAAATTACCAAAATTGTACATCTTTTGCGATTTTCCCCTTTCACAGAAAT CATTTGCAATATAACCACGACAAAGGAAGATAAGTTTCTATGGGAAGGTC GAAGGAAGTATATTTCCGAATCGAGGTGATTGCTTCAACCTCAAAGTGGG GCTTAGGACTTTTCAACCTGGTTTCCTTTTTTGTGGGGGAGGGGGGGGAC 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AAGCTGTGATTTTTATCGTCGTTTTTCTTCTGATTATTTTTTCATTAACT CATATCAGTTATATGTAAGGAGTGTGTTATATTCAATTAGAATATTTGTT TTTGTTTGTCGGAATTGTAAATGAAGGTATGCCTATTGGGCTTTAATAAA AGCAAAAAAATAAAAAAACATTTGAGGTTCAAAGGGTAGAATATTCTTCT TTTTTTTTTGTTATATCATATCGATCAATAATAAGAGGTAATAATAAAAT TTTATAAAAATATTATAGGAACCATTTATTAAAATCTGTGATCAAATTAT TTGTGTAGAATTCTTAAGTCTTGACAATGGTAACATTCCAATATGGTGAT AAACGATTAAGCAATCCAGACTCACTAAGTTTTGAATTTTGAATGACATT CATATTGTCGAATGACATGAATGACTCACAAGTAGTAAGGAACTAGAGAG TAATGCCTGAAGAGTCTAGGATGTATTGTAATAAATAGCACGTACACAAC GAATTCATAATCATAAATAAAATTGTAATCAGATGAGTGTGGTGGAGATA ATAAATTTGTTTGCCAAGGACACTAAAGAACGCGAATCAAATAAATATTC CTTATAATAACAGACGAAGTGGAATTGACTTAAGGAGGAATCACGTGGAG ATTTAATTAAGGAACTGTGGAGGGAGGATGGACCCGACTGGTGTTATTGA TAATTGTGATTGAGCACTTAGCTATGTTCTACGATGCAAAAAGTCGTCTC TACAATGAGTGTATCTTCCATAATTGGAGGTGAAATCCACCTAGAACGGC ATATGATCGTCTTCATCTCAGCTACTGCAAGATATGTTGCCTTCTCTTTG AGGGTTCTGGACGCCTCTGGATCAGGATTTAAATGTGGTTTCAAAAATAT TATTTTACTAAATTGATGTTTCTTAAGTTGTGTCAATGTAACTTTTTTTT TTTTCAAAATATGAAATGCCCCTAATTTCCTGAATAGAACCACTTTTTGG ATTGAAGGAAGTAAGAGTTGATGTTATTACAAATAAAACTGAGTGCAACT TCGAATTGTTCATAGAAATATATTAGTTTATAGAATTAAATATCGTAAAA GAAATTTACTTACTTTTATATTTTTATTTACAAATTAATGAAGTTAAAGC CAGATTATCTTTCTAAATTGGACTGAATGAATATATATATAGAATTGTAA TATTCATATTTTTTTGTAAATATCACTGTGCACAGTTGTAACAAATCAAG TTAAATATTCAAATTCCTTATATCATACTAGAAGAATACACTTTAAAATG ATAAAATAAATAAATAAAATTTTGATTCTAGTTAGATTACATAACAGTTT TGATGATATTTTTTGAGGAAAAGTCCATCTGTAAAAGCTTTCTTTCATTA CGCTTAACGGTGTGGTAACCCATAAAGGATACACAAAAACTGTATTATAA ATATACAAATGATAATCCTTATCACTATTAATGATGTATAAGCTGTAAGG GTTTAAAGAAAAGTGTCGTTTTTCATCATTTTTCAGTCTAAAAATGGAAA TATAACAAGTTCAAAATAAGGTACAGGATTAGTAGAAACATTTTTTTCAG TATAAAAATCCCTTTTATAGCAGTTTTGTTCGTCGTGCTTCAATGTGATG ATTATCTTAATGATGAAAAATGACTGAACGATAATAGTTCCGAATTACTA TAACCTCAAGATATTTCTGAAACCTGACGACCCAGATAAAATCTGGGATC AGTATTGGATTCTTTACTCGAAGAAAAGTTATATTCTTGGTTTCATTTTA TGCGTAGAAATTTTGGCCCTATAATAGTTCTCCTGTGTAAATGATTAAAA AGAATTCATGAGAACTTTTTCCGTTTTAATTGCTGGTGTGTTTGTTGACT 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