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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s1162 | supercontig | LSalAtl2s1162:109395..117096 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000930 >EMLSAP00000000930 ID=EMLSAP00000000930|Name=EMLSAP00000000930|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=535bp
MDKSDGKLMWGPLSRKSSNIGRLSTSDVPCSMWNSKICDRATYIPYPNIS
SQSISELKASKSYYQSISPSLIELQVTNLDQTIDQREMKIILTSMFRDHV
DVTQVSVFFQSDGNMAXCVKVPTLHDAQIAISRLHRKKVGYKRIVISYSS
YSHGHNLNVIKSKVVSLLSEVPTRKLQLFKFREMFEKRYHNSIGVSDLYK
MKDFIVVSDEDNGRMVSLINPGIEYKDCISSYIFSAFPQSNIPTSELDPA
FCSKHSSKVISKGWAEKENETQLPLINIRLSLLSKNMRVLLKSHGGSVPL
ASIVQCYNADYELEIDVDNGVPMEHLLSCIKEISIHYGVSGVKKVTLMKS
FNTEYSCSHLNNISYNGLTTPPAPLAGQLSLFSRELVDLLKISPGCRMPF
HKFIPTYHHHFGRQCRVADYGYTKLKDLFEALPNVVQILGEGSRAIITLS
HRSQVKRFISDILRILKNQTSKQFLVDEIKSLYEGEFGQLFKISNYGVCH
VEDLLGEIPDTSIVVTGSSKDKIISIPKGNKPLMK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s1162:109395..117096+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000930-696777 ID=EMLSAT00000000930-696777|Name=EMLSAT00000000930|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7702bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s1162:109395..117096+ (Lepeophtheirus salmonis)
TTTAGACTTACATTAAAATTATATTTCTTTACTTTACGTATATTTACCAG
TAAATGATTAAAAATTTGGAAAGGAAAGTTTTTGATCAGTACTTCAAGAT
GTTTAAAAAATAAATGCTCTTCATGCCAGTTTCTTTCTTTTGGTCTAGAG
GTGTATTTGCTTATATTTAAATTGTTTTCAAGTTTTGGTAAAATGGATAA
ATCTGATGGGGTATTAATATTTTATCCATGTTTTTTGTATTAATACTCTA
TGTTCAATTTTAGAAATTAATGTGGGGCCCTTTGTCAAGAAAATCTTCAA
ATATTGGAAGACTTTCTACTTCTGATGTTCCATGTTCTATGTGGAATAGT
AAAATTTGTGATCGTGCAACCTACATTCCTTATCCAAATATATCATCTCA
ATCAATTAGTGAGCTCAAGGCCTCAAAAAGCTATTACCAGAGTATTAGTC
CAAGTCTGATTGAATTGCAAGTGACAAATTTAGATCAAACAATAGATCAA
AGAGAGATGAAAATTATTCTTACTTCCATGTTCAGGTAATTTATGTAAAT
ACCTCTGTACCTACAGATTGATAGATTTAAGTTTAGTTTATAAACTTGTT
AAAAAAAAATTATTCTTATATATTAATTTCCTCATTTCTTTAATATTAAA
GTAATAAAATGTATGACTTATTGATTTATAAGAAATATATGGATGGTTCA
TTTTGTTTTTGTATTTATATATATAAAGATAAGTTTATTTTTATGATTAT
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TCTTTAGATTGTATCTGTTTATTTACGACTTGTCCTATTCGATTTGACTG
TTATCTTTTCTATTTCACAAATAATAATTATAAAATAATATTTTGGTACC
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ATATAATTTGATTTTAGGGACCATGTTGATGTCACTCAGGTGTCTGTCTT
TTTTCAATCTGATGGAAATATGGCGGSATGCGTTAAGGTTCCAACTCTTC
ATGATGCTCAAATTGCAATTTCACGACTCCATCGAAAGAAAGTAGGATAT
AAAAGGATCGTTATTTCTTACAGGTTATTTGTTAATTATTATATTTGTTT
CAAACATTAATTTGTAAAATTATTATATATTTTTTAAACATAACCTCGTT
TTAGTAGTTACAGTCACGGACACAATCTTAATGTTATTAAATCTAAGGTT
GTGTCACTACTTTCTGAGGTCCCTACCAGGAAGTTGCAACTTTTTAAGTT
TAGAGAAATGTTTGAAAAAAGATACCATAATTCTATTGGTGTTTCGGATT
TGTACAAAATGAAAGACTTTATCGTTGTGAGCGACGAGGATAATGGAAGA
ATGGTATCACTCATTAATCCTGGCATTGAATATAAAGATTGTATATCTTC
ATACATATTCTCAGCATTTCCTCAGTCAAATATTCCAACATCTGAATTGG
ATCCTGCTTTTTGTTCAAAACATTCATCAAAAGTTATATCAAAAGGTTGG
GCTGAAAAAGAAAATGAAACCCAATTACCTCTAATTAATATAAGACTTAG
TTTACTTTCAAAAAATATGAGGGTTCTATTGAAGGTATTTTATTATTTGA
AGTACTTAAATGATTTGTTAATCGCGCGTTTTACCGCAGTCTCATGGGGG
TTCTGTGCCACTTGCTAGTATAGTACAGTGTTACAATGCAGATTATGAAT
TGGAAATTGACGTCGATAATGGAGTTCCAATGGAACATCTTCTATCGTGT
ATCAAAGAAATTTCCATACACTATGGGGTTTCCGGTGTCAAAAAAGTTAC
TTTAATGAAGAGTTTTAATACAGAATACTCGTGCAGCCATTTAAATAATA
TTTCGTATAATGGTTTAACTACACCTCCAGCTCCATTAGCTGGACAGCTA
TCTTTGTTTTCAAGGGAGCTGGTTGATCTCTTAAAAATCAGTCCAGGATG
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GACAATGTAGAGTTGCAGACTACGGATATACTAAACTCAAAGATCTTTTT
GAGGCTTTACCAAATGTTGTGCAGATTCTTGGTGAAGGAAGTAGAGCGAT
TATTACTTTGTCCCACCGATCTCAAGTAAAAAGATTTATATCTGATATTC
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AAATCTCTTTATGAAGGTGAATTTGGCCAATTGTTCAAAATTTCGAATTA
TGGAGTTTGTCATGTGGAGGATCTCTTAGGGGAAATCCCTGATACTTCTA
TAGTTGTTACTGGTAGTAGTAAGGACAAAATTATATCTATCCCAAAAGGG
AACAAACCTCTGATGAAATAGAACGAACTATTCAGTTTTCTATGGAATGT
GTGGAACTTTTAAGACATGCTCCTGATTGCTGTTTATTATTTAATAAATT
CATTCCTGCTTATCATCACCATTTTGGAAGACAATGCAGAGTTGCTGACT
ATGGATTTACAAAACTTATAGAGTTATTTGAAGCAATTCCACATATAGTA
GAAATTACTGAGGATTGTGATGGAGAGCGTCTTCTTCAATTGTCTGGTTC
TGAAAGACTAGCAGTTATTGGTGAGCAAATTGCTGAAATGATTCGATCTT
CTCATAAGCAATACTTGAGCTTAAATGAAATAAGTGAATCTTATATGATT
CAATATGGCTATCAATTGCGTCCTGAAAACTATGGAGAGAAAACTATAAG
AAATCTTCTTAATAAATTTGTGGACTTCTTGTGTGTTGAGGATACTGGAT
CTGAGTTAAAAATTTTTTTAAGCGATCGTAGTTATATTAGGACTATGGCG
GCACAAGTTGTGTCTATTTTAACAAATAAAGATGGGAAAATGCTTCTCAA
GGATTTTTTTAAGGAATACAAAGATATGTTAGTATGATTATATGTTTGAG
AACAAAACATTTAATTTTGTTGTTTCAGTTTTAATACTCATTTAAATTTT
GAAAATCTCAAGAATGACCTATCAAATTGGATTGAAGTTTGTGAAGAAAA
TAATGAGCAAAATTATATATGCCTCAAGTCTGANGCACTTGTGTTTAATT
AATGTGCAAAATCTACTTAAGGTAAGTGGTAGTTTATTAAAGTTCTAATA
TAGTTATTCCAATTAATTTCAGGAAAATAATGGAAGGGTTTTATTGTCGG
YTCTTGAAGTACTGTATTCCGATAAATATAAGAAATCCTTAGATCCTGCC
ACGTATGGTTTTTCTAGTATTTATTCGTTACTACAAGCATTTGGAGACTC
TATTAGTCTTAGAGGCAAAGGCATGCGCAAAACGCTAGTATTAATCAATG
ATTTAAGCTTCAGTGATAGGTTTTACTCCGGCATAATTACAAATTCGAAG
TCATCTTGTTTTAATGAGGAGCCTCACCAACAATCGAAATCTGCCAAGAA
GGGAAAGTCTGAATATTTGCCTCCAAGTTCATTTCCGCCTCGGGAGAGTC
TTCAAATTTATAACTCATCTTTTGACTCTGAGCACTCAAATTTTAAAAAT
TGTTATTCATCTACAGAAAGACTTAAATACCAGGCTAAAAGTTATCAAAC
TTCATTACAATGTCAAAATTATGATTCTTTCAGTGAGTTTTCACCATTAG
ATATTTATCAAAGTAATCAATATAATCATACGGATTCTTCGAGTATTCGT
TCCTCTTCAATATTTGATATACATTCTCCAATTGGTAAACAACGTATATT
AATGAAATCAGTTTCATCATATAACGGAACATCTCCGAGAAGGTTTTCAA
ATGGAGATTCAAGTTATAACTGTGGATTTAATATTCAAAATTCGAGTGCA
TTGGGGCATAAGAAGTCACCTGGTTCATTATGTGAGTCGAATTCTCCGAC
TACTTCTAGCTTATACACAGATGAAGACAGTAGCCTGGCATCTCAATTTA
ATCAGTCATCCAAAGTAGGTTTTTTTTTTTAACAACTACATCGATATCTT
CTCTTTATACTTTTTTATATATGTAGCGTTTACTAAGTCCCGATGTTATA
CTTGGAGGACATCTTATTAAAAATAACTCTGCTCCTTCGATGTTAACTCT
TGCGTCGAAGTATCCGTCTTTTTCTCCTAGAAAATTTCCATACGGAGGAA
GTCCACTTTTCTCCACTTCACCGCCTACAATTTCTACTGGACATGTGGGA
CCATTGAGTCCAATAAGCCCCTTATCACCGGGAGTTAGCTTCAACCAATT
TCAGTTTCCTAACTCAACATGTTCCAATTCCATGATTGAACATGTTAATG
AGTCACAAGCTCTACAAAATAAAGGAAGTATTTCCTCTAATAAGTATATT
CTAGGATCTATATTTGAAGAAATGTCTAGTTATGACGAATGTAAGGTATC
CTCTGAATAAGGATTTTTTATGTCGCTGTTGTTGTTTTTTTACGACCATT
AAGAGTTTGGAAGTTTTTATCTTTTATTTCAACTAATCTTATAAAAGCTT
ATACCTTTGAGCCAACTTTGAGATGTTTTTTTTGCCAATATAGGTAGTAT
GAGGGAGTAAAGTAAGAAATATTTCATCGTTGGATTTGTCGTTTTCCTTT
TTTAATTTGGATTATGTATTCAATTTCTGATAATTATTTATGCATTAAAA
ATTTTAACATCACTCTATTTACGTAATATTTTTTTAAAAATATGGTATAC
TTTTTAATTTAAGTTTAAATATTTCCATTTAATAAAGTTTTTGTTCTCAT
AAAGTGACGAAATAGTATTTAGTCTATACATGAATCAATGGGAATAAGAT
ATGATTCATGACGTGAGTGTCAACAGGACTGTGCTTTCCAAATGGTGGCA
CACCTCTCAAGGGAGAACCACGAAGTACTACGGGATCAAAAGTGTAATTC
TTAGGGCGGGTTCAAAGAACGCTAGGCCCTAGATACTTATATATACAATT
TGAAAAAATATGACATAATTTACTCACATATTTATCTAGAGTTGTCATGA
ACTATTTGAGTATATTTGAATAATAGGAGAGTTGAATATTGTTTGCGCCT
TTGCCGATAAAGATATCTAGAAAATAGTAACACATAAAAATTAATGGTCC
AAGATCGTTTTCTACTTTTATCCAATGAAAGAGTCTTGCAAGTAATAATG
GAATCGGAAGTGAGGATGAAGTATATAGAATTACAGAAATAATACAACCT
TATAAATGGATTCTTAAATATGACTGTTTTGTTTTTTATGTGGATCAATG
ACACTAGAGGTCTTTAAACAATGAAATAGTTTTCTAAGAATATTAGGCGA
TGAAATAGAGTAGACATTGAAAGTAGTTTCAATAGAAGAGCTGAAGATGC
AGAATGATAAAATCACTTTATTCCTCACTTTACATTTCATTCCAGTGTTA
TTCATCTTTATTAAACGTATCCTCGGTCCTTATATAGAATGATTCCTTAC
AAAATCTAGTGACATATGTGTACTATTTGAACCAATGGATGATGAAATAA
CCTATGTTTGAGTTAAAGTACATCTACGCCATGAATGATATGAGATTACA
TCCACCGATTAACGCAAAATATTTGTTTTCGCCAAAAAGTCAAATTTTTA
GAAAATTATATCAGCTGACATACATAAGACTTGCAAAAATTTGATTCTTA
ATAAATTATTTTTCTACAAATACATTTTTTCATCTACAAATCAGTATATG
AAAAATTTGATTTTAAATAGATCTAATCAATAATATCTAAGCAAGAGAGA
ATACCAGATCTGCATCTCTTTGATTAAAACTCTTTCAAAGGTTCTTTCTA
TTTCGTCTACTAATATTCTTAGAAAACTGTTTCATTGATTAGAGTCCTTA
AATGTAATTGATGTACATAACAAACAACTCATATCTATAACTCAGAATCC
ATTTATAAGGCTAAATTATTTATGTAATTCCAGACACTTCATCCTTGCTT
CCGATTCCAATATTACTTGTGAGACTCTTCTTTCATTGGACAAAAGTAGA
AAACGATCTTGGACCATAAAATTTAATGTGGCACAATTTTCTAGATGTCT
TTATCAGCTAAGACGCAAACCATATTCAACTCTCCTATTACCCAAGGTTA
ATANNAAGTACAAGGTTATACATTAACGTGTTTACGACTGATGTGCGACT
TCCACCAAACTTTTAGTAGTGACGTCATAGTGTATAAGTAGTTGCATGTT
TTGTTTACATTTTCCATCATATAAAAAAGAAACAATCTACATTCTTGATT
CTGCAATTTGACAAGGTCTTCATTCTATTAAAAAACATTCAAACCCATTG
AGGATCTTCCACGTCGTAGTGAAGCATATGAAGCTAAGTTTCTACAGAAA
ATCACTTTGCCATAGTGGACTACAGCGAGGAACGAAGAAGATTGTCAGAT
TTCACTCAAATCCATTAAATAAAATTAAATTGAAGGCTTATTATTTATTT
TGTGTTGKCTCTTCACCCTTGTCATCATCAATTCTACCATTCAATCCAAG
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ATAAAATTAAATTGAAGGCTTATTATTTATTTTGTGTTGACTCTTCACCC
TTGTCATCATCAATTCTACCATTCAATCCAAGAACAATATATTCAAACCA
TACTACCTCTCAACTCCTAAAGCGTCGTCAAGGCAAACTCAAGCTGCAAC
CACGTCACATATGGCTCAAACGTTCAATGGCCTACAACAGCATCTGTAAT
TTTTAACTGGCAACCAGGTGACTCCCAGGAACTAGGTTCCAAGGGAGAGT
AATGCTCTCTACTTTGGTTTATTGGTATATTGGTTTTTCTTTCAACAAGA
TCAGCTGCACATCATACCAAGAGTTAATGGGCATCAGAGACACATCTCTG
GACTCAATAACCTTCGGTAGCCCAACCAATCAGCATGTATACCTAAAAGA
GTTCATCGACATATTGACCAGAGGGGGGTTGTCGACTACATCCGACCTTC
TCTACCTCTCTTGTCTTTATGCTCACTCCATGTTCTCTTACATCAAAGCT
ACTCCTGAAGAGAAAGACAGTTTACTGGGCACCCCAAATCCTAGAGCTTT
ATTTATTGCCACATTCATTGACAAGATGCTAGACATTATAAAATCTGACA
TTATCGCCGTTGTGAGAGTAAAGTGCGAGGAAGGACTCGCTTTGTTTAAT
GTCATGCATATAAATTAAATTAACATCCAATTTTGAACAAAAAAGAGAAT
AGCAGCTAAGAATTCAGAAGCTAATAGAAAAAAAAAAACTAAATTTCAAT
CAAAATCTTCTGACTTGTAGATTTGGATCAACTATTTACTTTTTGAATAC
ACTTTGTTTAATGTCCTGCATCATGCATACATGATTGTCTAACCTTGTAT
TTCTATTAACCTTGCTATTACCTAAATTAATGCATAAATAGTTTTTACGT
GATAAATGTGTTGATAAATTATCAGTGATCTTATAACTTCAGAAGTCACA
TTGGAAAATATGAATTTAGTTTAACAAATTTTGAAAATAGTGAGTCGGAA
GACATTTTCTCAACTACTAAATCAATTGTCATTATATTTTAATATAATTC
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