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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| LSalAtl2s116 | supercontig | LSalAtl2s116:1618979..1626949 - |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
| Analysis Name | Date Performed |
|---|
| ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | ensemblgenomes |
| Biotype | protein_coding |
| Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000000977 >EMLSAP00000000977 ID=EMLSAP00000000977|Name=EMLSAP00000000977|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=316bp
VRLNFDEFSTQPPLLGDCVFDQFYSLDTLLCGLNSGHHLYLNTESVNQLD
FHFRLSNLEPKLYSCLDKFNLTNTLDNGTTLNRSRNKLRVKVEKLEELKK
FEPSKRRAWKIKVTKIPCSCTSEEQRIPSGCLSFYTSNSGDIKSFNYDHL
GCFSDDRLCSKTNINDCTFWAGYTGHLNNMKHSICIQPESGHCGIEYSSM
EEETGSFSLTNQTVIGTNDGSGAENGIKNCVADYIEIPNGMCLGENRNTI
SSDRFCGNSLGFQSRKENIISYTRPFYLRFITDFDEVSNSWDYMNRGVHL
KYEQIACNDHRHNINK back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s116:1618979..1626949- Legend: polypeptideexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000000977-696824 ID=EMLSAT00000000977-696824|Name=EMLSAT00000000977|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=7971bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:1618979..1626949- (Lepeophtheirus salmonis)
GTACGTTTGAATTTCGATGAATTTTCCACACAGCCACCATTGTTAGGAGA
TTGCGTTTTTGATCAATTTTATTCCTTGGACACTCTTCTTTGTGGACTCA
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NNNNNNACTAATTTCTTCTTTTTCATTTATACATTAATAAATAAGACTCT
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TGGAAAATTAAAGTCACCAAAATTCCATGTTCTTGTACAAGTGAAGAACA
AAGAATTCCATCCGGCTGTTTATCCTTTTATACCTCAAATTCTGGGGACA
TCAAGTCCTTCAACTATGATCATTTAGGCTGCTTTAGGTATTACTTTTAT
TTAACTGATTTAAATTTTGCAAAACTTCTTATTTCCATATGTTTCCGGGT
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AAAAAATAGTTAGACGGCGAAAATTTAAAAAAAAGTATTTGAATCCGATA
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TTGGGGACACAACTTGAATTGGGATTCTGAGTTTCTGGGGGAGCTGAAGA
AGAAGATCAAGGAGGACCCCCCCAAAATCAATGAATCGCCTCTCTAACGA
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AAGGAAAGGAGACGGCAGAGGTACAGGAAAGTTCGTGCAAATGGATCCAC
AGTAAAAAATTTCTTCGCAGAGAAGATTTTCMCCGTGGAACAGGTCTACA
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GTCCGACGACAAGAAGATACCTCCCTTCTTTTATAAGGTTAGGGAGAAAA
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TCAAGGCCAACTMCCCAGAGGACAACTATATATTGCCCCATTGTGATGCT
GCCGTACACAATTCGGCAAAACGCCAGAAGTTCTTTTCCGACAACATGGC
TGATTTTTGGCCCAAGGACATGGGGCCATCATCTTCGCCAGATTTAAAGC
TGTTGGACTTTTCTGTGTGGGGTACTTTGGAGAACGAGACTAACCAGCCA
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TGTGTATCATGAACATTTAAAAAAAGACGAAAATCAACTGGTAAGCGTGG
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GAAGGTAGGGCAAAACAAGGACATCAGCAAAAATGACTCCGATGTCGATA
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AAAGGTTACTCTACGTCTTTTATGAGAACACACACGTATTCAATTAGGTT
TTGAATATAATTGAGTCTATTTAGGAAAGGAGGTTCACTAGTCTGGAATT
AAATAATATTGACAACACTTAAAGAGAATGACATTCTTAATTGTATTATC
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GTATTTGATTGTTGACAGACACAATTACTATTCAAACATATTGTTAGTGA
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GAAAATCAGTTGAAGATTTTATGTATAAACTTACTAAAAGTAAAGTGAGA
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GTTTTTTTTTCTTCATAAATATACTTTTTACTTGATTTTAATACAAAAAT
AAATGATGTTTTATGTAAAACTCCGCGCTGAAAAAAATGTTTAATGTTAA
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TCATATCGCATTTTAAACTAAACATATTATTTATTGTATTGAATGAGTCA
ATATCAAAAGCTTTAAAGATTTTTTTCTTTGTGTTAGAAAACTGCAATTG
GGATGGATTTTTGTTAATATTTATAAATATTATGCTTCCCAAAAACATAT
AATCACTTAAATAAATTTAATGAAACTTACACGGCGTGATAGTTACAAGT
ACACGCTACTCTTTTGTTTACATGTAAAAGTTTTATAATCTTGAAAGTTA
AGAGTGATAAATCAAAAACTGAGTCATTTGACACAATAAAACATATTTAT
GAATTTATTCAGTTAATTAAACAATTATTATTCAAAAGCAGTTTTAAGTC
CTCAATACTTAAGTATAATATGATTATACCTGGGTTTAAATCCGTTCACC
TTTTTTCAGTTCGTTCGTGAATTTGTTCTTTTTCTGAAAGTTATCTGTTC
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TCCAATATGTATACTGTAGAATATTGTTAATGTATAAGAAAATATTAATT
AAAAATATGTTTGGAGTGTGTAACCACAATAAGCGGCCACATCAAATTTT
CAAATTTAGTAGTGTTTCAAACTTTGAAATATAGTTTAAGAGGTCCCCTA
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TGACTCTATTTGGGTGCTAGGGCTTCTGCAGGTAAAACCTTAGATATAAT
GAAAAAAAAAAGTTCTTTCATGGACACGTTTTGATTTAAAAATCTGTAAA
ATATCCCAAACGATTTTTATATATTGTTCCTTTAACATTATTGAGTTGAA
TCTGGATAAAGGATGTTTATAAAAATAAATAAATATACTCTTTTGATAAC
ACCGTATGAGGCCCTTATATTTTGCTTTGTTTCTATATTTTTACAACGCG
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CTTCCAGAGTTCAATGATGCCAAATCAGAAAAACTTTTACATCGATTTAT
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TTAAGATTGACGACCATTTTTAAATCAATGTTAGGTAAAAAATGTATTCA
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GCATGTATACCTAAATTGGGTCGTTAGATACCACTAACGATTTTATCTAT
CCCTTTAGAATATTAGCAGAGCAAAGCAACTAAAAAATATTTATATTTGA
CCGTAACAAAATCGATTTATCAAAAACAGGCATATTTCTGAATATTTTTA
GAAATAGTCGCATTTAACAAAAATTTCAGTTGGAAAATTATACGCAAAAT
TGAATTAAACTTTTTATCTTAGCTCAATAAGTAATTAGATATGATATTTC
TATACTAGCTGCACTTGATGTTGATACAAACGTTTTAGTTGATTTTAAAA
TTATTATAACAGACAAAATAAAATACGAATTAATTAAAGAAATATTTACA
ATATATTGAAGAAAATCAAGAATTAACATAGGATTTATGTCTCCTTCTTG
ATCGTCGAATGATTGTAAAAATGCCACTTTATTTGATAATAAAGAACAAA
GATATTCTTTTAAGGAGAAATAAGAACAACTCACATTACCATTCGCAACA
AAAATATGGGCCATCTTTCTTCAGAAGGAAAAAATGATAAATAAATGGGT
TTTATATATTTTTATTCAGCTAACAATTAAAGAAATTAAATATTACACTA
TATTTGACGAGAATCAGAGGTTGTTCACGTCTTAAAATTTGTTAATAAGT
TCCAAAAATAGATACAACTTTCCCCTTTTGTTAAAAATCTTACAGTGCCG
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TTTATAAAATTTAAATAGGCATTGTTTCTAATCACGGCAATCATTGTTTA
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TACAGTTGAATGTTGAGGTAAATTTTATGTTTAACAAATCAACCCTACCA
ATGAAGGGAAAATAAATAAAATGACGTATTTAAAAAGAATTAAAAATACA
TTTTTGTAATTCAAAGTAGCATAGAGACATAACAGTATTTCTTATTTGGC
ATAAATGAACTTTGAATGCATATTTGATAATAATTTATTAGGAATTTTGA
ATTTAAAAAAAATGAGAGGTTAGTTCTAAAAATACAGAAATAAATTAAAA
TAAAGGCTCGTAATACGGTGTACCACAAAAGTATATTTATTTACTTCCAA
TATCTTCTAGACTAACATAGCCATAATGTGAAGCAAATAAAAGCAACGTT
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AAAAGAAAACAAAATCTTGTAATTAACTCGATAATTTTTAAGGAACAACA
CGATAAGTCATTTTTTTCTAATTTTTACAAATTTTCAATGCAAATCTTTT
CTGAAATGATTCCAGATTTTCATGCCAGGTTTAGTGATAAAAATATGAAA
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TAGAATGTAATCAATGTATTCAGTAATTAATAATTTCACACTCATATTCA
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GCGTGAAGGTCGTTCATTTTCCCGTTCTATCTATAAATTTGGGTGATATT
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CTATACTGGGCATTTGAATAATATGAAGCATTCAATATGTATTCAACCTG
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TCGTTTTCACTGACAAACCAAACAGTCATTGGTACAAATGATGGCTCAGG
GTAGGTCCTTTCGTTTAATTTAAGATAATTTGCGAGTTATGATGATTACT
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TACATTGAAATTCCTAACGGAATGTGTTTGGTAAGTATTTTATTATAATT
ATTTGGTTATGTATAATTATAACCTGATATAAAACAACTTCTTTCTCATT
GTAGCATTTATGCTTAGAACAAATTTATTTCATCTAAGCAAGGAATAAAT
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GAGAAAATCGAAACACAATTTCAAGCGATCGGTTTTGTGGTAATTCATTA
GGGTTTCAATCGCGGAAAGAGAACATTATATCTTATACACGCCCTTTTTA
TCTACGATTTATAACCGATTTCGATGAAGTTTCTAATAGTTGGGATTACA
TGAATAGAGGGGTTCACTTGAAATATGAACAAATTGCTTGCAATGATCAT
AGACACAACATAAATAAGTAG back to top
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