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Associated RNAi Experiments
Alignments
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
LSalAtl2s116 | supercontig | LSalAtl2s116:441106..453265 + |
Analyses
This mRNA is derived from or has results from the following analyses
Analysis Name | Date Performed |
ensembl | 2013-09-26 .965016 |
Properties
Property Name | Value |
Logic name | ensemblgenomes |
Biotype | protein_coding |
Evidence | IEA |
Cross References
External references for this mRNA
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Sequences
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of EMLSAP00000001003 >EMLSAP00000001003 ID=EMLSAP00000001003|Name=EMLSAP00000001003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=polypeptide|length=660bp
MDVHEYRIRGKEMVEYIADYLENIRERRVFPDVKPGYMRALLPDXAPEGG EPWEHIFKDVDRVIMPGITHWQSPYMHAYFPALNSYPSMLGDMLADGINC LGFTWASSPACTELEMIVMDWLGKMIGLPDEFLHSKTNSHGGGVIQTTAS ESTFVCLLAGRTEAIKRHQEIYPEMEDADINSRLVAYCSDQAHSSVEKAG LIGLVKIRYIESDENLSLRGDKLQEAIKMDRDSGLVPFFLCVSLGTTGSC SFDNLSECGPICKEEKMWLHIDAAYAGSAFVCPEFRGWMKGIEVKNSRAL HRTFNVDPLYLKHENSGLAIDYMHWQIPLSKRFRSLKLWFVIRNYGVTGL QTMIRSNVKMAEYFESFVLSDSRFEIPAKRHLGMVVFRLTGDNDNTEKLL KKLNSSGKMHAVPASLKGQYVIRFTVTSPRTTKKDIARDWEYIRTFASDV LGQEPPRQRVPLKEIKQRNSSFGTSLLLANIGPNCAMSPKIVDGSYAALF DSSDVVNDFSKKLQGLSNNTHNSKSGWLKRWTRNGDEELSKSPHPQTVST WGPRIPLAIVPRHRVKGMLVLTGRQLSLDSNFEDRKDKFRKLMEEKMNEL KPRNEIINEDDGIYIPKKMIEELTEVFAKHKDENCTPSEVKLIHSLENVL HRAGILQTSV back to topmRNA from alignment at LSalAtl2s116:441106..453265+ Legend: exonpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >EMLSAT00000001003-696850 ID=EMLSAT00000001003-696850|Name=EMLSAT00000001003|organism=Lepeophtheirus salmonis|type=mRNA|length=12160bp|location=Sequence derived from alignment at LSalAtl2s116:441106..453265+ (Lepeophtheirus salmonis) GTTGGAGCAGACGAATTTCAAAGGATTGACCAATAACTAAATCAAAATGG
ATGTGCACGAGTATCGGATTCGAGGTTTGGTTTTTAATTTATATTCATTA
AAAATGAACGTTCAATGAGGATTTTATATTTTATTCTTCCTATAAATGTG
TAATTCATATGTATTAGTGGTAGGTTTCAGTCTGAAAATCTTTGACCGGT
CTGCAACTGTTACAAATTTAACTAATTCGGTTCAACCTAAGTATGGACTG
ATCTCATAGTATAAATATTTTCACAAAAACAAAAATTAGTCTGTATCCGA
ATTGAACCCAGATATTTTTTCTCTTTTTTTATGAAATGAAATTGTATTTA
TATACGATCTTTTTTTCTTAGAAAGGGAAATTTTTTAAAAATTTTAATTT
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AAAATCACTGTTGATCCCGTACAATTTTGATTTATTAGAGAGGAAAATGA
CGGTCTCTGATTTGAATTGTAGGACCACAGTCAGAATTCCGGTTTAAACC
AAAATATCGGTCAAAATAGGTCTAAAAAAAATCTCTTCAAACAGAACCGA
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ATCGTCACCCGTAAAATTACTGCGTACATTTTCGCCCCCGGTAATTTTAC
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ATTTGTTTTCTTTTGGAATTGGTATATAAATTTCCTTAGCAGTTGTTATT
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TACCCTCAGGATTTGTTGGGGAGTTATAAATGTCCTTGTTGGACTCAAAG
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ATCTTTTTCTCCTTCCTCCTTTGTCACAGCTAATTTTAGCAGATATAATG
AAACGTTATGAGCATTATTCTTATGCAAAAAATTCTTCAAATTGTCAGGG
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CATCCCTGAATATAACCTCATAAAAAGGCGGCAAATATGTCAAGTGTTGA
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TTATTGGTGTCGTAGGAGAGGGGTTTTGACTTTTTCGATATATATTTGGA
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AGAAAAAGTTGTGAGTTTGCCTCCATTGAAGTATTCTGGGGGCAGGAAGT
TATTCGGAGTCGATCCGTGGATTAAGGGACGAGGTGGAGGAGATCACATC
TCATTAAGTAAAGTACTAAATCTTTTTCTTGCATCTACCACGAATCATTA
GAGTAACCATAATTACAGGATGAAGGAAGTATCATGAATAGAAACTTGCA
TGTCATCAAATCCATTAACTCCTGTAAGAGAAAATGACTATAAACATACA
TCTACAGTATAAAGTTATTTCCTTGTAATTAAAAGGTTGCAATAATTGAA
TTTCAACCATCCGCTTTCGCTGTATCCAATTTCGAGATAGAAGGAGAAAG
TATGATGTTTGGGCAACCTATACAATATACCCACATCCATTTCGAAACTA
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ATTTTTTTTGGGATATCTGGGCAATTAGCACCTTGGAGGATGATGAAAGT
ATGTTGATGGTCTCACTATTGTGATCAATTGAGTCGAGATTCCTCTCTCC
TACTCCAATAATATACTGTTTGCTTTGCAAAATGTTGCTTCACCACACTA
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TATCCGCTGCCAATATTTCATATTCTTTTAAAGAATTATGGAAAATTTGT
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CTATACAAAAATGATAAGATTGGTAGTTTCAATAATCAATAATTATCTTA
TTAGGTTTTTTCTTTCACAGCTTCAATGTTTCCTAGTCCAATACAAAAAT
TCCTTCATAGGGAGCTCCAGCTTGCAGACCCCCCCCCCCCTGATAATGKG
CTAGAACAAACAAAAGGCGGAAATGACACAAGTTTTGACGAGTTACAAGT
GAATACTCGCATTTTGCGTACACGAGTCCAGTTTTTGGTGTCTTTGTTTT
TTTTTTACCTCATAAAACTCGAGTATTGAGAAGATTTTTAATGGTGGCAC
ATCACTAAATTTTAATATGGCCTCTGTAGTCCTCTTGTATACTTTTTATC
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TAGGTAAAGAAATGGTCGAATACATCGCTGATTACTTGGAGAACATTCGA
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CCCAGATMCTGCTCCAGAAGGTGGGGAGCCATGGGAACATATATTTAAGG
ATGTGGATCGTGTGATTATGCCAGGAGTAAGGAAAGGATCCCTTTCCAGA
ATTGTACATCCCTATAATTCATTTTTTTGTAGATCACTCATTGGCAAAGC
CCCTATATGCATGCATATTTCCCTGCTCTGAATAGCTACCCCTCAATGCT
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CTAGTCCAGCATGTACTGAGTTAGAAATGATTGTGATGGACTGGCTAGGK
AAAATGATTGGACTTCCGGATGAGTTCCTTCACAGTAAAACCAATAGTCA
TGGAGGGGGKGTCATTCAAACGACAGCATCAGAGTCTACTTTTGTGTGTC
TCCTTGCTGGAAGGACAGAGGCCATTAAGCGTCATCAAGAAATATATCCA
GAAATGGAGGACGCTGATATTAATAGTCGACTTGTAGCCTACTGTTCAGA
TCAAGCTCATTCCTCTGTTGAAAAGGCGGGACTCATTGGTCTGGTTAAAA
TACGCTACATTGAGAGTGATGAAAACCTGAGTCTGCGTGGGGATAAACTT
CAAGAGGCTATCAAGATGGACCGAGATAGTGGACTAGTCCCATTCTTTGT
GAGTAATATACAATCCTTGTAACAAAAGACATTACTCATTCATTTATCTC
TTTAATACTAGCTCTGTGTCTCTTTGGGAACCACTGGTTCCTGCTCATTT
GATAATCTAAGCGAATGTGGCCCCATTTGTAAGTAAAATACATTAACTAA
ATAACATTAGACTATTTTTTAAACATACACAGGTAAAGAAGAAAAAATGT
GGCTCCATATTGATGCCGCCTATGCAGGATCTGCTTTTGTGTGTCCAGAG
TTTCGAGGATGGATGAAGGGGATTGAGTATGCAGATAGTCTGGCATTTAA
TCCATCAAAATGGCTCTTGGTGAATTTTGATTGTACAGCCATGTGGTAAG
CTAATGAATATTCATTTTTCAATAGAAAGGTTACATGTGACGTCAGCATT
GTTGATGCTGGCCATTTTGAGAGCTTCAACAACCAAGTAAAACCCCGTTT
TCACTAATATTGAGGAAATTGATAAATGATTGGATGTATAAATGGGACCA
AGAAATAAAATAACTTGAATCTATACCCTCTACCTAAATATACATTGACA
AGTTTTATTGTAAATATATCTGACACTAAAATTCACTAGAAATGTGATAT
AACATCGGTATACAATCTTACTACCTCCGCAGAGAAGTTGTCTCTGTTTG
TTTTATAGTCACCAGGATTACGACAAAAGTTGCATTTTGATTTTGATCAA
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AGAGGTTAAGATGAAACAAAACGTATCAAATTCCTAATCAACCTTAACTT
TAGAACAAATTAAGATACATAACTCAATTTGATTTTAAGCTCTGGCTTTG
GGCTCTACGAAGTCCCCATATTAGTAAATCGAATTTAAATAATATATTTC
TCTCTATTTACCCACCTTTTCTGATCTCCAATCGATGAACAAAGATCATT
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ATTAAAATATTAGTGTATAACATTGGCCTCAATGAGTCAAATAGTCTTTT
TTTATTATTAGAGCCATTTGAGGTAGTTTCATCAAGATTTATTGGAAGTT
TGACCATTTTATGTTCCATACATAATATCAACTATGGCCCCCCAAGATGG
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AGTATTTACTAGAGCTTAGACTCTACAACATACCGTGTTTAAAATCTATT
CCTACTTATATTTTATTTCTTTGTGTTGTTTTTTTCGTAAGACGTACATA
TTATTAATAAGATTTCAAGAGGTTTTCTTGTTATTTGTATTATTATTGTT
ACATACAACTCCTATGATGAGGACGTCTTATTTGTTATGTTGCTTTGTAA
TTCAAAAACCATAATAGTCTTATAAACAAAAATATTCTTTTAAACATAAG
TGGAAAAGTGTGCAAGAGACGGATAAAAGAAATTGAGCTTTTCTAAGAGA
GTGAATTAATTTTATATGTCTATATATATTTTAACATATTCATTCATGTA
TATGTTGTAAACAAGTTGTTAACTTGTACAAGCAAATTGTACAAGTTGCA
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GGAGGATAATGCGATGATTGAATATTCCACGGATGATCCATATATGTATT
AATCGTGCCATTTTTGGAATATTTTAATGCAAATTACCCAATATAAGTAC
TCTGTGGCACTGAATAAAGTTCAAATGCTCACAGTTATATATGTACATCC
TAAATATACAATAACAATTTGATCTTAATAGATCAGAATATTAATCAATA
GTTGGTTATTAGAATGACGAATGTTGTAATGAAATAATTTATCTTAAGAC
GAAGAAAATGCAACATATACAGACATTCCAATTTGTACACAGCATACAAT
GAGAAAAATAAAGATTTGTATTCCTTGCGGATAGTGTAAGCTTACTCACT
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AAGTATTTGGTGCAAAAAAAAAATACTGAGTATAACCCCAAGAACACTAT
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AAGTGGGTCTTCCAGTACGACAATGACCCAAAACAACAAATGAGTATCTC
AAGAAGAAACAAATGGRGTGKGGAGTCATGGAKTAGCCAATCTCCAGGCC
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GGGATTAAATACTTATTTTTTCCTCTGTATAGAGTACACAAGCATGAAGG
GTGCCTTGATGGTTTAAGATCCCTTCAAGTTTCATTAGATGTAATACTAT
AACCATTTTTCACTCTTAGGGTCAAAAATAGCAGAGCGCTTCATCGAACA
TTTAACGTAGATCCCCTTTATTTGAAACATGAAAACTCTGGTCTAGCCAT
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ATTCCACTAAGTAAAAGATTTCGCTCTTTGAAATTATGGTTTGTTATTAG
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ATAACCTGGTTTGTCCTTATAATAATTCCCCTTCCTCCTTTCACTCCAGA
ATGTAAAGATGGCCGAGTATTTCGAATCCTTTGTCCTCTCTGACTCTCGT
TTTGAGATTCCTGCAAAGAGGCATTTGGGTATGGTTGTCTTCCGACTCAC
AGGAGACAATGACAACACTGAAAAGCTCTTGAAGAAACTGAACTCCTCAG
GAAAGATGCATGCTGTCCCTGCGTCTCTCAAGGGGCAGTATGTCATTCGT
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GGAATATATTCGTACATTTGCAAGTGATGTTTTGGGGCAAGAGCCCCCTC
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AAAGATAATCTATTTATTTACTACTTTGTTTAGAAATTAAGCAAAGGAAC
TCTAGCTTTGGAACAAGTTTACTCCTTGCAAACATTGGACCCAACTGTGC
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ACACATAATTCAAAATCAGGTAATTTTAAAATTTATGAAGCCATTGGGAG
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TGTTCTACAAACATGTACATATATAAGCTGATCCCCGTTATACACTTCCA
AATCAGCCATTCTAGCATGACCTTAAAAACTTTGTTAAAAAATGAGTATT
TTTTGAGTTTTGACGATGCATACTCAAACAGCCCCTTGTATTTTTTACTT
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TCCATTAATTAAGTTTCGCGTCCACACAAGGAAGAAATCTGCTTAATCCG
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AACGGATAAATATTTAACGTTTACGTTTGGATGAGGTCTTAGCCGTTAAT
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CGTATCATTAATTAATTTTTCTATACTATTTGAATTAAGTAGGAGATAAA
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TTATATCTGCTAGAATAACTTTAAAAAAAGATTGTTCAGGTTGCCAACCA
CAATAAAACGTATACTCTAAGCAATGCTTACGATTTACAACACGAATATA
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CAAACTTGTTCTTAAAAATGAGCCCTTCTCAGACGAAACAAACATGCAAA
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AATTTAACCACCATATATTAAGGATTTTGTTTGAAAAAGAATCACCCTCG
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AAGGGTTGTATTTACAAAAAAAATATTAAATACATATTATATTTATATTA
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TCAACCAATATTTTGCCGTGAGTAATTTTGTAGCCTACATTTTTGTCACT
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TTTATGTTTTTATATTATTGGTTCGAACTTTACAGTTGTATTATTAATTT
AATTTTTTTGACTGGTGTCATTAATTCAATTATTGTGATTATTTTCAACA
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TCCTATGAGTTTTGAATGGAATGAGAACGAAATTTATTCCATTTCGAAAA
CATTAATTATTTCTTTTATTTTACTTCAAAAATCAGTCTAGCTACAAAAT
ATATAAAGATAAACTCATCGCAATGCAGAAGCCAAAGATAAATAATTACA
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TTGTTTTTCTTACATCATATTCGGCCATTCCAACAAAATGCATTGTATTC
AACTCTATTTGGCCCTGATGGTGTAATAAAAAGTTAACCAATCAACTTAT
TTCCTTAAACTGATCTTGAAATTATAACTATGAAAATTAAGATGGTAATC
CGTAGAATTTGAAAAATAGTTTATAGTTGAAATTATCCGACTTTTGAAGA
AAATATAGGCGATTTTGATTCAACCCACATGGTAACACTATTCATTAATC
CCTCAAAAGTATTTCTTTCTTTATGGTAGAAACTCTTTAAAGAAAGTAGA
AAAAAACAAAACACAATTGATTTTGTTCAAGAATACCCCTCTTTTTATTT
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GACTGATGCTTGACTTCCACCAACCTCATATTAGTGACGTCATAGTGTAT
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AATTGAAAATTTCTAGCAATAGTAATAGACTATGAGTGGTTGTGTGTTTT
GTCAAAATCTACATATCTTGTCCTGGCAGTCGGTACGATACATCAAATTG
AAAATTATAGCAGACCCCTAACTTTGCATTTCTATTAATCTTACTCTACA
CAAGTTTTTTTTAATAAAAAAACTTTTTTTATTTCCATTCAAAAATATTG
TCTTCATGGAAGAGATATTAATTGAAGCGTGTGACTTCAAATAGATTCTC
TGATGCTTATGAAATAAAAATGAAGTAATATTCAACAAAGTCCATTTGAT
TTTTATCCCCACAAAATTTACATCCCCTACAAATAAGATGAGTGACTCAG
CCTCGTTTCACTTCAGATATTAGTCTAACTCAGTGGTAATACATTTATGT
ATGTATGTACTTAAATCAAGAGTTACATAAATATCCGGAACTTTTTGAAA
TATCACCCAACCTAAGATTGAAAATAAAAATTAGTTTGCCCATAACTTGT
ATTTTATTTTTAGAAGAAAAAATGAATGAACTCAAGCCAAGGAATGAAAT
TATCAATGAAGATGATGGCATTTATATACCAAAGAAAATGATAGAAGAGC
TTACAGAGGTATTTGCCAAACACAAGGATGAAAACTGCACTCCATCTGAG
GTGAAGCTTATTCATTCATTGGAGAATGTTTTACATCGTGCCGGTATTCT
TCAAACATCGGTCTAAACTTAGTTCACATCTATTTTCTCTATTGTATATT
CAGCATGATTCAAATATTTATCAATCCGTTTCATTGTATTATCCCATTTA
ACAAATTTACTTTTTGTTATTTAATTTTAAGGCAGCTTTTCCTCAAATGT
ATCGATATAAAGTTAAGATTATACAATTTGCCTTTATTTGTCATTAATGT
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AGGGAATGTTTTTGTTTCTATGTTTTTCGAATCTATAATTATATCAAAAT
TTGAACCTTCTCTACCTCCCTAACTTTTCTTTACAAAACAGAAAAAGAAA
TGCTTAAAATCAGTTGGTAGTTTGGAAATCATCCCTCACTTTTAACAAAA
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